4DD2A

Eval processed hewl, carboplatin aqueous glycerol
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd2A00
3A95A 3WUMA 1WVVA 2DQEY 4B49A 3M3UA 5LVKA 5LA5A 4DD2A 2DQFC 5DM9A 4YF2A 1UUZC 4WMGA 2F4AA 3TMUA 1LJFA 1VAUA 5IHGA 3WXTA 1LZDA 1JTPL 3N9CA 3HBDA 1LHLA 2Z38A 1LMOA 1IO5A 1WTNA 5APCA 1LSEA 2Z12A 4R6CA 3AJNA 1B7QA 3LHMA 1GFTA 4KT3A 4HSFA 4LT0A 4RLNA 3WU7A 1LZ9A 1EQ5A 2YBIA 4YOPA 1B5WA 1DXJA 1HEQA 1ZVHL 4P2EA 1W6ZA 3WW6A 1C43A 1DKKA 5ILCA 1OUCA 4N5RA 4NGWA 2BQEA 3WULA 1GDWA 1GAYA 208LA 1IP1A 4LT2A 3A34A 1GXXA 1ZVYB 4CFPA 4ANRA 1B2KA 3EXDA 2LHMA 2W1LA 5ILFA 3AZ6A 2YBNA 5LVJA 1UACY 1IWYA 1GF7A 1LMNA 1OP9B 6LYZA 1VEDA 4LZTA 1FN5A 5LIOA 4WLXA 4XJFA 5HNLA 4NGLA 5B1GA 1BVXA 5D5FA 3B72A 4OOOA 4AXTA 3G3BB 1YKXX 3LYZA 4H9AA 5FCPA 1REZA 4H8XA 3CT5A 3AZ4A 4WM6A 1D6QA 1D0MA 2W1YA 5D5CA 1LSAA 1JHLA 4IATA 207LA 2AUBA 1G7LC 1Z55A 2H5ZA 1B0DA 4NGOA 1G7IC 1HSWA 5A3ZA 1AKIA 4D9ZA 1I20A 1UIFA 4NHSA 3FE0A 3ZVQA 1QTKA 4ZIXA 2CWIA 5L9JA 2H9JA 4LFXA 4W96A 1UBZA 2DBTA 4H90A 4PHIA 5KXKA 2MEGA 4LFPA 1B7LA 7LYZA 3A67Y 4GCEA 5KXLA 1D0KA 1LZYA 1AZFA 5LVGA 5KXSA 1LZ5A 3TMVA 4G4CA 5LXWA 2HEEA 4HJVA 3WYHA 1RCMA 4KL7A 1HF4A 1I56A 2N5ZA 1QSWA 135LA 3IJUA 3WUAA 3HBEX 2LYOA 4BAPA 3D9AC 1JJ0A 1PS5A 5AMYA 4UWVA 1HC0A 2YBJA 3GXKA 1IIZA 4WOAA 5I4YA 1GD6A 1WVUA 2Z39A 5T3FA 2YDGA 4ET9A 1XEJA 2D91A 1GHLA 5KXPA 1IWTA 2I26L 3TXIA 2YBHA 2G4QA 4WO9A 1DPWA 1CJ7A 4C5FA 2LZ2A 1TCYA 2XBSA 3RW8A 1LJNA 5LVIA 1GE0A 1GXV2 1OUDA 3CSQA 1IP2A 6LYTA 5JENB 1YL1X 3IJVA 1GB8A 2MEDA 3WW5A 1PZYA 5B59A 1I1ZA 5F14A 1A4VA 4WO6A 4DDCA 4GLAA 3WL2A 4OOTA 1VDTA 1CKCA 3M18B 1IC7Y 2BLXA 2NWDX 4TSBA 4DD0A 1NKHA 9LYZA 3A93A 4J1BA 1IP6A 2Q0MX 5FEKA 3AZ7A 1GB9A 1ZV5L 4AGAA 4H91A 5KXNA 1GBYA 2BQJA 4HTQA 3TXKA 1B7RA 3WVXA 2YBLA 4E3UA 1JKCA 1ZMYL 3QNGA 3WMKA 3ATOA 5E4PA 1HEOA 4TWSA 1H87A 4PJ2C 1JKBA 4UWNA 1F6SA 4II8A 2MEIA 3WVYA 1KXXA 1QQYA 2MEAA 3W6FA 1FKQA 4HTNA 1WQOA 5II3A 4WL6A 1LMTA 2HECA 1JIYA 1GF3A 1GFUA 4XJGA 1FLUA 2BQNA 3TMWA 1LAAA 1LYOA 1IC4Y 3AZ5A 2I6ZA 4CFOA 1LKRA 1B5YA 3WH1A 1LMPA 4BS7A 1C08C 4GCBA 1OUJA 2BQGA 5FDJA 1N4FA 4BAFA 3RU5A 2BLYA 3EO5A 4TX7A 1AT6A 1IP4A 1QIOA 1SQ2L 1VDSA 1WQMA 4PPOA 5HNCA 1GBXA 1BWHA 5LVHA 4NGZA 4W94A 4WG1A 4LYZA 1GFHA 4NWEA 2F2NA 2Z37A 4KXIA 3A90A 2F4GA 1C7PA 4NG1A 2Y8PA 1B7NA 1HHLA 1KIRC 2XTHA 4CJ2A 1LHIA 4RLMA 5KXRA 4N0JA 1LHMA 4NFVA 3LZ2A 1LZBA 1GEVA 3J4GA 4WLTA 4WM4A 5DL9A 3ULRA 2HEAA 1LSNA 4XN6A 2Z18A 1LMQA 4IASA 5HLLA 4X3BA 3D3DA 1B5XA 4NWHA 1QTEA 1HSXA 5KY1A 1YAMA 2CGIA 1GE4A 2ZYPA 1XGRC 1B7OA 2LZTA 5E9RA 1KIPC 4I8SA 2YVBA 4YM8A 2BQHA 4DDAA 3OK0A 3G3AB 1LZGA 1GDXA 4G49A 4KPMA 2D4JA 3A92A 1IOQA 3WU8A 1UC0A 5I5QA 1DI5A 4ET8A 3A3RX 4NHPA 3ATNA 4WL7A 4NGIA 4TTDA 5B06A 1JSEA 5APDA 4ETCA 4GLVA 5KKIA 3P64A 4ZFPA 4N9RA 3VWOA 5KJ9A 2ZIKA 3FI7A 1JUGA 1GB2A 3A94A 4UWUA 1DQJC 2BPUA 4B4IA 1LJHA 3CSZA 4H9EA 5HQ1A 1VATA 1NDMC 1LYYA 154LA 193LA 1LMAA 4WM3A 5A3EA 4LYOA 4YEOA 4PRQA 1IVMA 3HFMY 1HEWA 3TXBA 4NG8A 134LA 2Z2EA 1NBZC 4DYGA 1LZTA 4HPIA 4ETDA 4LYCA 1GF8A 1BWIA 2PC2A 2D6BA 1IY4A 1LJ4A 1RFPA 1OUEA 2FBBA 3BKVA 3B6LA 4GN4A 2A7DA 2DKVA 3WPJA 1T6VL 1CKDA 1IWXA 1CKHA 1LPIA 4WM5A 1DZBX 3RZ4A 4QEQA 4N1EI 2IHLA 4DD9A 1IP7A 1LJGA 4B4JA 4DD3A 1HFXA 4ETAA 5LYMA 1UA6Y 1GFRA 4NGJA 3ZVQB 4XJIA 1QUTA 1JTTL 4HJZA 2BQOA 2W1XA 1UIBA 1J1OY 2BQAA 5DN4A 1LHKA 1IEEA 4H94A 1LSZA 4NSGA 1JJ3A 5F9XA 1FDLY 1TAYA 4GCCA 4QDNA 5LAGA 1XSFA 5L3HA 1YIKA 1GB0A 4NHIA 3W6AA 2ZIJA 3CB7A 2XJWA 1CKFA 1MELL 2YBMA 2ZYCA 3TXHA 2BQIA 1YROA 4H93A 1HMKA 4LYTA 3MGWA 3W6EA 2CDSA 4B4EA 1LSPA 1DI4A 1GFKA 2BQFA 1IWWA 5B1FA 1XEIA 5C6JA 4HTKA 1HEPA 3ZEKA 1GF0A 1LZ4A 1LSYA 3QE8A 3RT5X 3TXGA 3A6BY 2Z19A 2MEBA 4YEMA 1LTMA 1REXA 3OJPA 4C3WA 1LZCA 2C8PA 1CJ8A 2HU3A 4ZEEA 1O23A 1NQIA 1T3PA 5FELA 1TBYA 5HMJA 5LYTA 3TXJA 1WQQA 5KKJA 1GFAA 4WLYA 1GE3A 4XJDA 1AM7A 1IOTA 2DQHY 3P66A 1YKYX 1C10A 2DQIY 1EL1A 4OWCA 1JPOA 1V7SA 4Z46A 1HFZA 4XJHA 1OUGA 4NSHA 2ZNXY 1JJ1A 4XENA 4LGKA 1LYZA 1IOSA 1CJ6A 1WTMA 2ZWBA 1GWDA 1LSFA 3HBHA 3SP3A 5KXXA 3WUNA 4DD7A 132LA 1UCOA 1B5UA 4OW1A 1UIEA 4DWXA 2D4KA 2CJLA 4EOFA 1IR9A 1FBIX 1KXYA 5APEA 4HV2A 4H9HA 3A96A 1LJ3A 1P2CC 3EMSA 1LOZA 4N1CC 1BQLY 1GB7A 2B5ZA 4H92A 1YL0X 1HENA 1IR8A 1LSGA 3LYMA 1IC5Y 1LZEA 1IP5A 2BQDA 3KAMA 3LYOA 4LYMA 1VFBC 4H8ZA 5KXZA 1LZ1A 1VDQA 2G4PA 4GCFA 2D4IA 1HERA 2G4NA 5IDDA 4J1AA 1FLWA 3LZTA 1LSCA 5LINA 5HMVA 2WARA 4I0CA 1GE2A 2F30A 3TMXA 1GEZA 1LZ6A 1B5VA 1LYSA 1NWGA 4GN3A 4H1PA 1HELA 4NIJA 1UIDA 1GB5A 4NSIA 4LT3A 4DDBA 1LZAA 4M4OA 4H8YA 1B7MA 2C8OA 5LA8A 1HMLA 4CHXA 4GN5C 1J1PY 4OWHA 2ZQ4A 1KIQC 1J1XY 1WQNA 2MEEA 2BQCA 1G7MC 4Z3MA 1GF9A 1JKDA 4J0LA 4XADA 1NHEA 1V7TA 4MSTA 153LA 1YQVY 1LSMA 1QSAA 4ETBA 5C6LA 3AB6A 1LJIA 1YKZX 3AGHA 2BAAA 5KXYA 4NGKA 1B5ZA 1BB5A 1LCNA 2VB1A 4XYYA 1XFPL 4NGVA 4DC4A 1TEWA 1YAQA 1GF4A 4H9BA 5DLAA 3CQLA 2HEDA 1LSBA 1GFEA 1B7PA 1HNLA 1UICA 5KXOA 1RI8B 2MEHA 4J7VA 4DT3A 4BADA 1LZRA 3T6UA 3QY4A 1EQEA 1JSFA 2FYCA 3A91A 3AYQA 4B0DA 1OUBA 3B0KA 5F9UA 1KXWA 2BQKA 5DN5A 4XJBA 5M1YA 2BQLA 3J6KA 1ALCA 1GBWA 1D6PA 4TUNA 5L3IA 1FKVA 4YENA 2HTXA 4QGZA 3WXUA 1OUAA 1REYA 1LMCA 2I25L 5FSTA 1BVKC 4IJ4A 1BB7A 1LHHA 2FBDA 1RE2A 4H9CA 5B05A 1LJJA 3K3TA 1BB3A 1IORA 1OUIA 4G9SA 2A7FA 194LA 3CSRA 4MR1A 1IY3A 5KXTA 1QUSA 2W1MA 1VDPA 2LYMA 3E3DA 3AGIA 1GB6A 2RSCA 3AGGG 3N9AA 4LT1A 4NHQA 5B07A 1GFGA 4RW1A 1LJEA 4ML7A 1G7HC 1GE1A 4FDYA 1FLYA 1A2YC 4MCKA 4NHTA 4WM2A 1UIAA 1WQRA 4O34A 3LYTA 5K7OA 3W3EA 1JEFA 2DQAA 1GAZA 4PGJB 3BKHA 1GFJA 2MECA 4G4HA 1C45A 1QDTA 4FJRA 4L41A 4H9IA 4NY5A 3TXFA 1CJ9A 1JISA 3EBAB 5KXMA 1BHZA 3LN2A 4Z41A 1IR7A 2ZNWY 2DQJY 1LZSA 2HEBA 4B1AA 3IWRA 1XEKA 3B0OA 3A3QA 4CGEA 5APFA 3WPKA 1LKSA 3T36A 5I4WA 4N8ZA 1BGIA 1OUHA 3AW7A 2HUBA 1INUA 2H9KA 4WM1A 1NBYC 4U3XB 5I53A 4HP0A 4HPEA 4HJYA 4R0FA 1TDYA 2XBRA 3F6ZA 1BWJA 4OWEA 3P4ZA 4Z98A 2DQGY 5LAFA 1IWVA 1OQMA 2Z2FA 1JTOL 1BB4A 1GB3A 133LA 4RDSA 1CNSA 1W08A 1UIGA 3A8ZA 2BQMA 4NSJA 1UIHA 2GV0A 3CT1A 5FHWA 4NEBA 1IWUA 3CT0A 2DQCY 1YILA 3P65A 1H6MA 4G4BA 5KXWA 1NMMA 5J7CA 4A7DA 4EMNA 4HV1A 1SLYA 2EQLA 1LZ8A 1LSDA 3W6BA 1D9UA 1EQ4A 2DQDY 1HEMA 4NGYA 1IWZA 1F0WA 3B0IA 3N9EA 4WG7A 1F6RA 1B7SA 4M6DA 2X0AA 1GBSA 5I4XA 4OWAA 5EBHA 2ZQ3A 1AT5A 3AW6A 5I54A 1JITA 1G7JC 1IOCA 1DPXA 1GF5A 1YAPA 1CKGA 1E8LA 2LYZA 1OUFA 1LZNA 1XGPC 1JWRA 3W6CA 5LYZA 4OWBA 1HFYA 2FYDA 1FLQA 2YSSC 3P68A 5F16A 4WLDA 4H9FA 1WQPA 2ZILA 1JKAA 1GBOA 3TXDA 1LJKA 1NDGC 1XGQC 3GXRA 1GFVA 1BB6A 1LHJA 1GBZA 1NF5A 4LYBA 4PRUA 1F10A 5C6IA 5IELA 2IFFY 1D0LA 1GF6A 1B9OA 3A6CY 2HU1A 3TXEA 4DD1A 1IX0A 1RJCB 1YAOA 1YANA 2EIZC 3RNXA 2BQBA 1DI3A 2EKSC 2HEFA 4RW2A 3WU9A 4QY9A 1MLCE 4ETEA 1C46A 1IP3A 1REMA 1GPQC 4GCDA 2EPEA 1QDRA 5F81A 2MEFA 4TSCA 8LYZA 3W6DA 1XGTC 1DKJA 1XGUC 3WPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A95A 1L11A 2DQEY 3M3UA 5DM9A 4WMGA 171LA 225LA 5IHGA 3WXTA 1L53A 1L16A 1JTNA 1LSEA 2Z12A 4R6CA 3UONA 1L44A 4KT3A 3DMXA 4HSFA 217LA 1XEPA 1DXJA 1HEQA 1OUCA 1OV7A 3CDOA 208LA 1IP1A 1ZVYB 239LA 4LZMA 3AZ6A 1UACY 1OP9B 1D2WA 1VEDA 1FN5A 5LIOA 4XJFA 232LA 1BVXA 4AXTA 3LYZA 4H8XA 223LA 247LA 2AUBA 1G7LC 1Z55A 1L69A 3DN3A 1G7IC 4I7TA 1CX6A 4NHSA 3FE0A 3ZVQA 1QTKA 4I7OA 2CWIA 4ZIXA 1L82A 1L38A 2H9JA 164LA 1C6AA 1PQOA 1L72A 115LA 1B7LA 3A67Y 5KXLA 1D0KA 5KXSA 3TMVA 4G4CA 125LA 1T8GA 5LXWA 1RCMA 1HF4A 1I56A 2ANVA 3HTGA 3IJUA 1P56A 1QTDA 1C63A 4DAJA 1G06A 1CV6A 1C6LA 3GXKA 1B6IA 1IIZA 1GD6A 1WVUA 1L19A 2D91A 3TXIA 220LA 3HU9A 1QTCA 1TCYA 3HH4A 3RW8A 1LJNA 1GE0A 1GXV2 6LZMA 3FA0A 1GB8A 2MEDA 3WW5A 1L56A 5F14A 1QT6A 7LZMA 1A4VA 4WO6A 3WL2A 9LYZA 2BLXA 1NKHA 140LA 1GB9A 1GBYA 4EPIA 3CDRA 1JKCA 211LA 1JKBA 1F6SA 2MEIA 3WVYA 1QQYA 2MEAA 3W6FA 5II3A 1LGUA 159LA 3GUKA 1LAAA 165LA 1B5YA 1LMPA 1L32A 1OWZA 2BLYA 3EO5A 1AT6A 1IP4A 1QIOA 1SQ2L 1C65A 4PPOA 5HNCA 1GBXA 1BWHA 1L46A 1GFHA 4NWEA 2Z37A 3A90A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A95 A;  3WUM A;  1WVV A;  2DQE Y;  4B49 A;  3M3U A;  5LVK A;  5LA5 A;  4DD2 A;  2DQF C;  5DM9 A;  4YF2 A;  1UUZ C;  4WMG A;  2F4A A;  3TMU A;  1LJF A;  1VAU A;  5IHG A;  3WXT A;  1LZD A;  1JTP L;  3N9C A;  3HBD A;  1LHL A;  2Z38 A;  1LMO A;  1IO5 A;  1WTN A;  5APC A;  1LSE A;  2Z12 A;  4R6C A;  3AJN A;  1B7Q A;  3LHM A;  1GFT A;  4KT3 A;  4HSF A;  4LT0 A;  4RLN A;  3WU7 A;  1LZ9 A;  1EQ5 A;  2YBI A;  4YOP A;  1B5W A;  1DXJ A;  1HEQ A;  1ZVH L;  4P2E A;  1W6Z A;  3WW6 A;  1C43 A;  1DKK A;  5ILC A;  1OUC A;  4N5R A;  4NGW A;  2BQE A;  3WUL A;  1GDW A;  1GAY A;  208L A;  1IP1 A;  4LT2 A;  3A34 A;  1GXX A;  1ZVY B;  4CFP A;  4ANR A;  1B2K A;  3EXD A;  2LHM A;  2W1L A;  5ILF A;  3AZ6 A;  2YBN A;  5LVJ A;  1UAC Y;  1IWY A;  1GF7 A;  1LMN A;  1OP9 B;  6LYZ A;  1VED A;  4LZT A;  1FN5 A;  5LIO A;  4WLX A;  4XJF A;  5HNL A;  4NGL A;  5B1G A;  1BVX A;  5D5F A;  3B72 A;  4OOO A;  4AXT A;  3G3B B;  1YKX X;  3LYZ A;  4H9A A;  5FCP A;  1REZ A;  4H8X A;  3CT5 A;  3AZ4 A;  4WM6 A;  1D6Q A;  1D0M A;  2W1Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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