4DD7A

Eval processed hewl, carboplatin dmso glycerol
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd7A00
4IASA 3W6AA 1REMA 4Z3MA 5E9RA 1FN5A 3W6FA 1LHMA 4NGOA 3WVXA 3A3RX 1GDWA 1IIZA 3VWOA 1PS5A 1DKJA 2D6BA 4ET9A 3HBDA 1O23A 4O34A 4DD0A 1HENA 1YQVY 3J4GA 5I5QA 1LZYA 2XTHA 3LZ2A 4EOFA 3B0KA 4HTNA 1DXJA 1RI8B 4OOOA 5F9XA 4E3UA 3CSQA 3RT5X 1T3PA 1LZAA 4WM1A 1J1PY 3N9EA 2IHLA 4WLDA 3N9CA 1GBWA 3AZ7A 2MEBA 3CQLA 1NMMA 3F6ZA 1BWJA 1NDGC 2HUBA 1GXV2 2BQHA 4J1BA 4DDAA 3GXRA 1IC5Y 3G3AB 4XJDA 5L3HA 3WMKA 2CDSA 1FLWA 1EL1A 4KL7A 5LAGA 3ZEKA 4ANRA 2BQOA 4C5FA 4RLMA 2BPUA 1W08A 1IX0A 4WLTA 3GXKA 1YKXX 1LSZA 1UCOA 1SQ2L 1LYOA 5AMYA 4H9AA 2Z2EA 1RE2A 1JISA 1UICA 5LXWA 2I25L 1OUJA 3BKHA 3MGWA 4NFVA 4QEQA 4HJVA 1TEWA 4B49A 4NY5A 1NDMC 2G4NA 4GLAA 2YBNA 3AYQA 4I8SA 4WM3A 1BB3A 1DQJC 2DKVA 2Q0MX 2ZQ4A 5II3A 4B4EA 2MEEA 2CGIA 1IY4A 1TCYA 4NSHA 1GF8A 5LVKA 1YKYX 1OUFA 4NHTA 5FDJA 1UIHA 5F9UA 3A96A 3M18B 1GBOA 1LZDA 3P65A 1LSNA 1XFPL 4FDYA 4NGIA 1D0LA 3WYHA 5HNCA 4HSFA 1GDXA 1JUGA 3BKVA 2I6ZA 1VDQA 3CT5A 1CKFA 5JENB 2BQAA 4FJRA 1HSWA 4HTQA 5DM9A 4CFOA 1C7PA 4NSJA 1LZ8A 1YL0X 2DQFC 4UWNA 3LYOA 3TXJA 1LOZA 1UA6Y 1RJCB 1LJGA 4BS7A 4B4JA 3WUAA 5KXMA 1GFVA 3G3BB 1YANA 4DDBA 4XJIA 1B0DA 1WQOA 4U3XB 1AKIA 1B5UA 2ZYPA 3ULRA 3WW6A 4DYGA 1J1XY 1GF0A 1LSBA 3AGIA 1QUTA 1GXXA 1IWYA 4QGZA 3A91A 3WU8A 1JEFA 1LZGA 1T6VL 1QTEA 4CFPA 4XYYA 5LVGA 2Z39A 3ZVQA 3ATNA 5A3ZA 1JKAA 4DDCA 2DQGY 1XGQC 1LSAA 4J7VA 1AT5A 1IP3A 1BQLY 1BB6A 1YL1X 2BQEA 2G4QA 3TXHA 2F30A 3WPJA 5J7CA 4R0FA 4NSIA 5D5FA 4HJZA 1V7TA 5I4XA 1JKCA 3ZVQB 1CKGA 2Z18A 3IWRA 5KJ9A 2MEDA 1LZ6A 3WUMA 4G4HA 2N5ZA 4DD2A 4PJ2C 4WM4A 1BVXA 4BAFA 5A3EA 1D0MA 3WH1A 1KIPC 1D0KA 1KXWA 4PHIA 4EMNA 1B5XA 1QDTA 4MSTA 2F2NA 1GHLA 4XJGA 6LYTA 7LYZA 3FI7A 1IOCA 4AXTA 2ZIJA 1UIDA 2DQDY 5HMVA 1QSWA 4RLNA 1JJ0A 4R6CA 1GBXA 4NGJA 1UIAA 4NWHA 5KXPA 3TXDA 4X3BA 3W6EA 2BAAA 1ALCA 1NF5A 4Z46A 4M6DA 1UUZC 2GV0A 1C46A 2ZIKA 1B7MA 3WVYA 4NWEA 1TBYA 1WVUA 3FE0A 3EO5A 4G4BA 1JTOL 4XJBA 4YF2A 3WPLA 1F6RA 5KXWA 1LHHA 2BQDA 5KXRA 3D9AC 5B06A 1DPXA 1IWZA 2H9JA 3LZTA 1SLYA 1KXYA 1GFEA 5D5CA 1W6ZA 3A93A 2DQHY 1LSCA 3HBEX 1I1ZA 3HBHA 5FELA 3LN2A 1GF9A 1HMKA 1FLYA 1VATA 4GCFA 4GN3A 1IC4Y 1BWIA 2HU1A 4H91A 2HEEA 3TXBA 1LMAA 1YAMA 1FBIX 3B6LA 5FHWA 4IJ4A 4OWAA 5KY1A 4H9IA 1LKRA 1LJHA 1CKDA 1HEMA 3M3UA 3W6BA 1G7MC 1C10A 1KIRC 2DQIY 4NGYA 4ETBA 2YBMA 3AZ4A 4G49A 3WU7A 1YROA 4NHIA 1BGIA 3J6KA 1D6PA 5B1FA 2HECA 1GB2A 2YSSC 4DD3A 1LZSA 1LMCA 3A3QA 1B5YA 1HMLA 3LYTA 1LYYA 5I53A 5KXYA 1BHZA 1LHKA 2FYCA 3A95A 5DL9A 5APDA 1DI4A 5LAFA 2YBLA 1EQ5A 1JWRA 1GAZA 1GFJA 1VAUA 3B0IA 4LYZA 4MR1A 4WO9A 2A7DA 5C6IA 1OP9B 1A2YC 3IJUA 1GFAA 3RZ4A 1BB4A 1YKZX 1LPIA 4H8YA 1YILA 4DWXA 1CKCA 1J1OY 4ETDA 1XEJA 1IVMA 5IELA 1BWHA 3WPKA 1GPQC 1BB5A 1LMQA 1D6QA 2C8OA 4PGJB 2F4AA 4RDSA 3T6UA 3TMVA 5F16A 1LYSA 5APFA 4NHSA 4NHQA 2D91A 1XGPC 4J1AA 1LZRA 4GCCA 2W1XA 5DLAA 4WM2A 5FSTA 2PC2A 1LHJA 2EPEA 1TAYA 4H9EA 3AW7A 3RNXA 2ZWBA 4Z41A 1JTPL 4NGWA 5KXNA 4WLXA 5T3FA 3A8ZA 1UACY 2MEHA 4OOTA 2FBBA 4DD9A 4DT3A 5KXTA 4OWBA 1GFTA 1OUAA 2ZYCA 1LHIA 5KXXA 1GWDA 2A7FA 2HU3A 2BQMA 4RW1A 5EBHA 2RSCA 194LA 1HELA 1HEPA 3AZ6A 4WO6A 1LZ1A 3CT0A 4GCDA 1IP4A 1QTKA 1IWTA 2DQAA 4WMGA 4IATA 5IHGA 1LZEA 4NGKA 5LVIA 1OUGA 4WOAA 1B7RA 1GF7A 1JKDA 1WQQA 5E4PA 1WQMA 2LYOA 1GD6A 1LMPA 2FYDA 4QDNA 4N9RA 1Z55A 1LZTA 1LMNA 4NEBA 5HLLA 1LSFA 1NKHA 2WARA 2VB1A 3A6BY 1LSMA 134LA 1HSXA 1LHLA 4LYBA 4N0JA 5F14A 4YM8A 2YBJA 1LKSA 4N1EI 5KXLA 4HPEA 4XJFA 3LYZA 4QY9A 1H87A 2EQLA 1I56A 1DPWA 4NGLA 1IY3A 3TXKA 1HFYA 1HEWA 4DC4A 1OUEA 1LJIA 1IP7A 1GB5A 4ML7A 1LZ9A 2HEBA 1LCNA 4H93A 4NSGA 3RW8A 9LYZA 1TDYA 4NG1A 1VDSA 2H5ZA 2EKSC 2LZTA 1OUHA 4LT0A 4CGEA 1QSAA 1GE3A 2BQGA 5LIOA 1FLUA 4NGZA 3W6DA 4WL7A 5F81A 4OW1A 5KXOA 1LJNA 4PRQA 3T36A 1GE0A 1ZVYB 1GB7A 1GEZA 1DI5A 1GEVA 4NG8A 4ZIXA 4LT1A 3N9AA 1HEQA 3CT1A 5B59A 1P2CC 2ZILA 1XSFA 1GF5A 2MEFA 1WTNA 4HP0A 1UIFA 4OWEA 4BADA 1REXA 1IR8A 8LYZA 5HNLA 1CJ6A 4WG7A 4ZFPA 1HERA 3K3TA 1B5WA 2LYMA 4TTDA 4KPMA 4ETAA 1HC0A 2HEFA 1G7LC 2YBHA 3ATOA 1QDRA 1GB0A 4LFXA 4LT3A 2BQJA 4H94A 1IC7Y 1GE2A 4LYMA 3A92A 3P64A 4NHPA 2DQEY 2I26L 2ZQ3A 193LA 1IOSA 1QUSA 4H92A 4H9BA 1LZNA 4CHXA 1IWUA 3AJNA 208LA 1JSEA 3LHMA 1B7NA 4OWHA 1IO5A 1YAOA 1LSPA 2CJLA 1NBYC 2W1LA 3WU9A 2HEDA 1C43A 4M4OA 2BQKA 1VDPA 1RCMA 3WXUA 1JPOA 2LHMA 1OUCA 1FKQA 4KXIA 1GFKA 207LA 2ZNWY 4H9FA 133LA 1B7SA 1UIBA 5I54A 1GF4A 1IR7A 4XN6A 153LA 1OQMA 1B5ZA 2D4KA 1HF4A 1CNSA 1MELL 1EQEA 5KXSA 1VDTA 3B0OA 1XGUC 3RU5A 1JSFA 1WQRA 5APEA 1E8LA 1B7OA 1V7SA 4W94A 3SP3A 1C45A 1LJ4A 1ZV5L 4ET8A 2AUBA 3LYMA 4HTKA 2BLYA 1OUDA 3TXGA 1GFUA 1JJ1A 5IDDA 1INUA 5FCPA 1LMOA 1IWWA 3QNGA 1BVKC 4H1PA 1WQNA 1IOQA 1WTMA 2BQLA 1IP2A 1GF6A 2MECA 1JKBA 4H9HA 3A94A 4TSBA 4GLVA 3WULA 4DD1A 132LA 2XBSA 1GF3A 1JTTL 2YVBA 3WL2A 1LZ4A 1EQ4A 5C6JA 1NHEA 2Z2FA 1CJ8A 1HNLA 4LYTA 4TWSA 4HV1A 3WXTA 6LYZA 1YIKA 4H8XA 1UIGA 2Y8PA 1AZFA 1GFRA 4DD7A 2XJWA 4XJHA 2BQIA 2F4GA 2YBIA 4WL6A 1FLQA 2NWDX 1D9UA 4HV2A 4TUNA 3A90A 5DN5A 5LVJA 1JITA 4B1AA 4H90A 1PZYA 4A7DA 4YENA 3TMUA 1CJ9A 2HEAA 1IWXA 4WM6A 1WQPA 5L9JA 1NBZC 4L41A 3CB7A 1MLCE 2FBDA 1B5VA 4TSCA 5LYMA 3TXEA 5DN4A 1IP6A 5APCA 4TX7A 1LJKA 1LSEA 4HJYA 5ILCA 1GBSA 3E3DA 4N8ZA 2D4JA 2MEAA 3CSZA 1G7HC 1YAQA 4GCBA 5LA8A 5L3IA 1N4FA 3W6CA 1B2KA 2X0AA 3A6CY 1G7JC 2HTXA 4H8ZA 4LFPA 4N5RA 1WVVA 3D3DA 3QY4A 1GBYA 1C08C 1LZ5A 1HFZA 2Z38A 2MEIA 1REZA 1KXXA 1XEIA 4NIJA 3AGGG 3A67Y 4G4CA 4J0LA 1LTMA 1QQYA 1B7QA 3P4ZA 4LT2A 4D9ZA 5KKIA 1FKVA 2BQCA 2W1MA 4N1CC 4YEOA 2DQJY 3AW6A 1LZBA 3TMWA 1IORA 2DBTA 5I4YA 1IR9A 3AB6A 5LYTA 3WUNA 4P2EA 5HMJA 4ETCA 4GCEA 2BQBA 1XEKA 1VEDA 3IJVA 4UWUA 1ZVHL 3P68A 5I4WA 5M1YA 1ZMYL 4CJ2A 4WM5A 1XGRC 4XADA 1F0WA 4OWCA 4AGAA 5KXKA 5B1GA 5K7OA 4W96A 3W3EA 2DQCY 1IOTA 1NWGA 2H9KA 1JIYA 4LYOA 1H6MA 1UBZA 4WG1A 3TXFA 1UIEA 3TXIA 4WLYA 2EIZC 1IP1A 1GB9A 4Z98A 1IWVA 4RW2A 1A4VA 1GB8A 2LYZA 3EMSA 1NQIA 4C3WA 1KIQC 1LSYA 5LA5A 1GAYA 4LYCA 1B9OA 1LJ3A 1CKHA 2LZ2A 4XENA 4YOPA 1B7LA 5HQ1A 1DZBX 5FEKA 1LSDA 1DI3A 4B4IA 2C8PA 5ILFA 2XBRA 5LINA 3TMXA 1LJFA 1HEOA 1GBZA 1REYA 3QE8A 4G9SA 1IP5A 1JJ3A 3A34A 1LAAA 1HHLA 1LYZA 2MEGA 3OJPA 3P66A 4NGVA 2B5ZA 3AGHA 1GE4A 1IEEA 1I20A 1BB7A 1LMTA 1GFGA 2YDGA 1OUBA 4YEMA 1OUIA 1XGTC 2BLXA 1GB6A 1LZCA 4H9CA 1UC0A 1GE1A 4MCKA 5B07A 4ETEA 2Z12A 2G4PA 4B0DA 1LJJA 2IFFY 5B05A 1B7PA 4GN4A 4I0CA 2D4IA 5LVHA 1AM7A 1QIOA 3OK0A 4UWVA 1AT6A 3CSRA 1FDLY 3HFMY 3WW5A 4II8A 5KKJA 4PRUA 1LJEA 1RFPA 1JHLA 1F6SA 1YAPA 154LA 1DKKA 2BQFA 3EBAB 135LA 1LSGA 1GFHA 2W1YA 4PPOA 2BQNA 4BAPA 3B72A 5LYZA 5C6LA 2ZNXY 4HPIA 4LGKA 4LZTA 2Z19A 4ZEEA 3KAMA 1HFXA 3EXDA 4KT3A 1CJ7A 1F10A 1GB3A 2Z37A 1G7IC 3AZ5A 2CWIA 1VFBC 5KXZA 4GN5C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W6AA 3A3RX 156LA 5LZMA 1PS5A 1DKJA 3HBDA 4DD0A 1YQVY 5I5QA 2XTHA 2RAYX 1RI8B 2RB0X 1NDGC 2HUBA 3DN2A 3G3AB 5L3HA 1OWZA 1FLWA 4KL7A 5LAGA 4ANRA 4C5FA 1LW9A 1YKXX 1I6SA 4I7KA 1L18A 2Z2EA 2I25L 3BKHA 4NY5A 186LA 4WM3A 1DQJC 2DKVA 4LZMA 261LA 2Z6BA 1T97A 4NSHA 1G0LA 1YKYX 4NHTA 196LA 3A96A 1LZDA 1LSNA 1G06A 1C6GA 4DKLA 1LGUA 5JENB 2BQAA 5DM9A 1C7PA 1LZ8A 4UWNA 161LA 1UA6Y 235LA 1C6QA 1L63A 3ULRA 1L60A 3WW6A 3AGIA 1PQDA 1GXXA 3WU8A 1JEFA 4XYYA 5LVGA 3ZVQA 3ATNA 1LSAA 224LA 1IP3A 1JKCA 1LYFA 1CKGA 3C81A 4WM4A 3DN8A 1D0KA 1KXWA 4PHIA 1B5XA 4MSTA 6LYTA 1PQKA 4E97A 1QSWA 1JJ0A 1GBXA 4Z46A 3W6EA 1ALCA 2ZIKA 4G4BA 5KXWA 1JTOL 2BQDA 3D9AC 4YXCA 3HDEA 2RB2X 3LZTA 1GFEA 1LSCA 1L09A 1GF9A 1BWIA 1LMAA 1FBIX 5FHWA 1L21A 1CKDA 3DN0A 4I7LA 2YBMA 4W52A 2YSSC 1LMCA 1P37A 5KXYA 2FYCA 3A95A 5DL9A 1JWRA 1GFJA 1P36A 3B0IA 2LZMA 4MR1A 1OWYA 2A7DA 5C6IA 3DMVA 3IJUA 1C6LA 1YILA 4DWXA 1J1OY 4ARMA 1XEJA 1BWHA 1GPQC 2ANVA 4EPIA 1LYSA 1LZRA 2W1XA 115LA 1LYIA 4WM2A 1LHJA 3RNXA 1T8GA 1UACY 5KXTA 3DMXA 1CUPA 1D3FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4IAS A;  3W6A A;  1REM A;  4Z3M A;  5E9R A;  1FN5 A;  3W6F A;  1LHM A;  4NGO A;  3WVX A;  3A3R X;  1GDW A;  1IIZ A;  3VWO A;  1PS5 A;  1DKJ A;  2D6B A;  4ET9 A;  3HBD A;  1O23 A;  4O34 A;  4DD0 A;  1HEN A;  1YQV Y;  3J4G A;  5I5Q A;  1LZY A;  2XTH A;  3LZ2 A;  4EOF A;  3B0K A;  4HTN A;  1DXJ A;  1RI8 B;  4OOO A;  5F9X A;  4E3U A;  3CSQ A;  3RT5 X;  1T3P A;  1LZA A;  4WM1 A;  1J1P Y;  3N9E A;  2IHL A;  4WLD A;  3N9C A;  1GBW A;  3AZ7 A;  2MEB A;  3CQL A;  1NMM A;  3F6Z A;  1BWJ A;  1NDG C;  2HUB A;  1GXV 2;  2BQH A;  4J1B A;  4DDA A;  3GXR A;  1IC5 Y;  3G3A B;  4XJD A;  5L3H A;  3WMK A;  2CDS A;  1FLW A;  1EL1 A;  4KL7 A;  5LAG A;  3ZEK A;  4ANR A;  2BQO A;  4C5F A;  4RLM A;  2BPU A;  1W08 A;  1IX0 A;  4WLT A;  3GXK A;  1YKX X;  1LSZ A;  1UCO A;  1SQ2 L;  1LYO A;  5AMY A;  4H9A A;  2Z2E A;  1RE2 A;  1JIS A;  1UIC A;  5LXW A;  2I25 L;  1OUJ A;  3BKH A;  3MGW A;  4NFV A;  4QEQ A;  4HJV A;  1TEW A;  4B49 A;  4NY5 A;  1NDM C;  2G4N A;  4GLA A;  2YBN A;  3AYQ A;  4I8S A;  4WM3 A;  1BB3 A;  1DQJ C; 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 2DQC Y;  1IOT A;  1NWG A;  2H9K A;  1JIY A;  4LYO A;  1H6M A;  1UBZ A;  4WG1 A;  3TXF A;  1UIE A;  3TXI A;  4WLY A;  2EIZ C;  1IP1 A;  1GB9 A;  4Z98 A;  1IWV A;  4RW2 A;  1A4V A;  1GB8 A;  2LYZ A;  3EMS A;  1NQI A;  4C3W A;  1KIQ C;  1LSY A;  5LA5 A;  1GAY A;  4LYC A;  1B9O A;  1LJ3 A;  1CKH A;  2LZ2 A;  4XEN A;  4YOP A;  1B7L A;  5HQ1 A;  1DZB X;  5FEK A;  1LSD A;  1DI3 A;  4B4I A;  2C8P A;  5ILF A;  2XBR A;  5LIN A;  3TMX A;  1LJF A;  1HEO A;  1GBZ A;  1REY A;  3QE8 A;  4G9S A;  1IP5 A;  1JJ3 A;  3A34 A;  1LAA A;  1HHL A;  1LYZ A;  2MEG A;  3OJP A;  3P66 A;  4NGV A;  2B5Z A;  3AGH A;  1GE4 A;  1IEE A;  1I20 A;  1BB7 A;  1LMT A;  1GFG A;  2YDG A;  1OUB A;  4YEM A;  1OUI A;  1XGT C;  2BLX A;  1GB6 A;  1LZC A;  4H9C A;  1UC0 A;  1GE1 A;  4MCK A;  5B07 A;  4ETE A;  2Z12 A;  2G4P A;  4B0D A;  1LJJ A;  2IFF Y;  5B05 A;  1B7P A;  4GN4 A;  4I0C A;  2D4I A;  5LVH A;  1AM7 A;  1QIO A;  3OK0 A;  4UWV A;  1AT6 A;  3CSR A;  1FDL Y;  3HFM Y;  3WW5 A;  4II8 A;  5KKJ A;  4PRU A;  1LJE A;  1RFP A;  1JHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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