4DD7A

Eval processed hewl, carboplatin dmso glycerol
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd7A00
4R0FA 5I4XA 1IP3A 1CKHA 4PPOA 1BB6A 4HSFA 4L41A 1JITA 1UBZA 1GF5A 1UIHA 2PC2A 1LJEA 1REYA 1T6VL 134LA 1LZSA 2H9JA 3CT0A 4WLXA 1GFUA 3MGWA 1JTOL 1JKCA 1OUIA 4MCKA 1HC0A 3W6AA 2CJLA 1DI4A 1HFZA 1GBSA 1NDGC 1IP1A 3K3TA 5APEA 3W6BA 1UA6Y 1NF5A 1A4VA 1B5XA 3GXKA 1F6RA 1WQQA 3A3RX 2BAAA 1BB3A 1GDWA 1V7SA 2BQMA 2BQJA 3ZVQA 4NGIA 1BVXA 1HENA 1GBXA 5C6IA 1YIKA 2XTHA 4X3BA 1V7TA 5C6LA 1NBZC 3FE0A 2W1MA 1JSEA 4IATA 1Z55A 1IWYA 2HUBA 4DD2A 4C5FA 3A6CY 1BHZA 1LYZA 1GB5A 1OUAA 4DC4A 3B0KA 4OOTA 1QQYA 4LT2A 1BB4A 4NGWA 4NGKA 5LVJA 4DD7A 1B7SA 1LTMA 7LYZA 2MEBA 4A7DA 5HMVA 1HEWA 4NSHA 5B59A 1GXV2 1LJFA 1LZEA 1KIQC 4N1CC 1IWWA 1LZDA 1LHHA 1YAPA 5LIOA 4DDBA 4NG8A 1VATA 1OUBA 1GFGA 2FBDA 3EO5A 5DN5A 4Z3MA 3BKVA 1KIPC 1ZMYL 1FKQA 1JTTL 1LSMA 1B9OA 1BWIA 1MELL 1OP9B 2F2NA 2NWDX 2ZNWY 2XJWA 2BQCA 2LYZA 3N9EA 4G9SA 4LT0A 1TDYA 4ET9A 1YKXX 4D9ZA 2G4NA 1W08A 4TUNA 3CSRA 4MR1A 2DQEY 4CFPA 4ETBA 4NIJA 3WW6A 5A3EA 2X0AA 2CDSA 4B49A 4RW1A 1B5WA 4H93A 2Z19A 3IJVA 1OQMA 1YKZX 1XGPC 1E8LA 4GLAA 1LHJA 4GLVA 4BADA 2HU3A 2D4IA 4LFPA 4YENA 1FN5A 1HEQA 3N9CA 3WL2A 4LT1A 1IY3A 1CJ8A 1LZGA 2YBLA 4H92A 5IHGA 1XEKA 4YOPA 3WU7A 5F14A 2BQHA 4I0CA 1QUSA 5APDA 4CJ2A 1LSGA 1B5VA 4GN3A 1UIAA 2F30A 3CT5A 3RW8A 2ZIJA 1GAZA 1IWXA 1NQIA 4OWCA 5KXYA 5I4YA 4TTDA 1OUJA 5KXOA 3TXJA 1IO5A 133LA 2DQJY 194LA 3WULA 1INUA 2A7FA 5II3A 2YSSC 1XGTC 4NSGA 2MEEA 5D5FA 3WVXA 2Y8PA 3IJUA 5LYMA 1G7IC 4RDSA 4ML7A 207LA 4WMGA 5DN4A 1T3PA 1IOQA 1YAMA 1ZVYB 2ZNXY 3SP3A 1LSPA 1OUGA 3QY4A 4AGAA 1GF7A 4DD3A 1RCMA 4G4BA 1GFTA 3CQLA 3HBDA 2BQKA 2FYCA 1JJ3A 1I20A 1YROA 2IFFY 2Z18A 1GF4A 1IC5Y 1DI5A 1NHEA 4WM4A 3TXBA 2YDGA 1JPOA 3TXIA 4XJGA 1GB7A 4NHSA 1B7NA 5APCA 1CKGA 3WVYA 1A2YC 1B5ZA 4WLDA 1QUTA 4WLYA 4OWHA 3P65A 1IR8A 5HMJA 4XJBA 5M1YA 1AT5A 1UIEA 2FYDA 2MEFA 1NDMC 2I26L 3LYOA 3QNGA 1VFBC 2DQFC 2C8OA 1I1ZA 1VDSA 1GPQC 2LYOA 3EBAB 3HFMY 4NGZA 4I8SA 5KXXA 4WG1A 1C43A 1YAQA 4HTNA 5IDDA 1IORA 1GBWA 5I5QA 1CKFA 4OWAA 5KJ9A 3AW6A 4U3XB 4HV2A 1BB5A 1LHMA 1GFRA 1LPIA 1LYOA 1YAOA 3LYTA 1EQ4A 2CGIA 3CT1A 4H9EA 2G4PA 3LYZA 4ANRA 5LYZA 4FJRA 1LSYA 4C3WA 3LZTA 1HEOA 1HFYA 3AJNA 1D0MA 2YBJA 1LSCA 1ZV5L 2BQGA 2HECA 3B72A 3WXTA 1PS5A 4GN4A 1HEPA 3AZ5A 3KAMA 1JJ1A 1W6ZA 1D0LA 1LZBA 4XJDA 1IC4Y 4DYGA 1QTKA 4H8XA 1LZ9A 5JENB 1QTEA 5B06A 3RT5X 2F4GA 2HEBA 1B7PA 1GDXA 1JWRA 1LJ4A 1NBYC 1TAYA 1B5UA 2DQGY 1BGIA 4NFVA 4RLMA 3W6FA 4CFOA 3T36A 3AZ4A 3AZ7A 1LSDA 4LT3A 1AKIA 4DDAA 1LZ8A 2Z38A 4KT3A 5KXKA 3RU5A 1IWZA 2BQNA 1GF6A 2YBHA 1C08C 5D5CA 5A3ZA 3HBEX 2HEAA 1RI8B 1NWGA 1LOZA 4NHIA 1RFPA 1IP6A 3EMSA 9LYZA 4HJYA 5HQ1A 2BLXA 5LVKA 5ILCA 1LZ6A 4G4CA 6LYTA 1I56A 4OWBA 4W94A 5KXZA 1LHLA 1JJ0A 5KXNA 1LJHA 1IP5A 2D91A 4NHTA 1GE3A 1GFJA 1CJ9A 1B5YA 1QSAA 1WQOA 4NGYA 2VB1A 3TXDA 2BQFA 208LA 3ULRA 4BAFA 5AMYA 4Z41A 4TWSA 2BQAA 1VAUA 2A7DA 4CGEA 1EL1A 153LA 1UUZC 2LZTA 2MEGA 1LYYA 1O23A 3FI7A 5B07A 2EPEA 1JSFA 1SLYA 2BQEA 1WTMA 1BWHA 4H91A 2MEIA 5L3HA 1TEWA 2D4JA 1DQJC 2MEDA 1LJJA 5L3IA 1LMCA 5EBHA 3WUMA 2BQDA 1HFXA 3RZ4A 5HNLA 5B1FA 1YKYX 4LZTA 4J0LA 1GB9A 1J1OY 4NGOA 4H9FA 1H6MA 1WVVA 1IOSA 1GAYA 4GN5C 1D6PA 5KXMA 1CNSA 4NSJA 5KXPA 4UWUA 5FDJA 1D0KA 1VDPA 1BB7A 4G49A 2B5ZA 1LAAA 4UWNA 4NHQA 3ATOA 1JHLA 5L9JA 1IC7Y 3WH1A 1IR7A 1LZTA 4H9CA 1DI3A 1LZ5A 1REMA 1DKKA 4H9IA 5DL9A 1LYSA 3TXFA 5IELA 5KKIA 3TXGA 4YEMA 1WQMA 5B05A 2W1LA 5KKJA 1XGUC 2HEEA 1PZYA 1AM7A 2FBBA 1BWJA 1LZCA 5DLAA 3B0OA 4NWEA 1IIZA 4MSTA 5KXSA 2ZQ3A 4R6CA 1LMTA 4H9BA 154LA 4ET8A 4GCEA 4Z46A 1QDTA 1JKAA 1GFKA 2YBMA 5F81A 4J1BA 2D4KA 1REXA 1BQLY 5B1GA 1GF0A 1LZNA 4Z98A 4ETEA 3LZ2A 2DQDY 4WM5A 1WQNA 4HV1A 2EQLA 3LYMA 4DDCA 4EOFA 1GWDA 1LJNA 1SQ2L 2RSCA 3CSZA 2DBTA 1KIRC 1CKDA 1GBOA 2LYMA 2Z37A 1GFEA 4WOAA 4PRQA 3A96A 1KXXA 5LVHA 4HP0A 4LYOA 1KXYA 1LJKA 1DKJA 3W6DA 2EKSC 1LHIA 1JTPL 1FLQA 2EIZC 4DWXA 1LJGA 5FEKA 1IP7A 1GB6A 3A34A 4HJVA 4O34A 4HJZA 2BQIA 5F16A 1JISA 5FCPA 1GE2A 4B1AA 4HPEA 3TMXA 1GF8A 1LZ4A 1XEIA 2GV0A 3BKHA 3G3AB 4GCDA 4DD9A 4OOOA 4NGJA 4NGLA 1XFPL 3CB7A 3E3DA 3AYQA 3P4ZA 4RLNA 4W96A 4B4IA 1BVKC 3W6EA 5APFA 4LFXA 1FDLY 4WLTA 1JKDA 5F9UA 2DQCY 4LYMA 3WU9A 4YM8A 5E4PA 1XGQC 4H8YA 5LA5A 3F6ZA 4DT3A 1YQVY 4YEOA 1RJCB 2DQHY 5I54A 1LCNA 3WMKA 1GF3A 1XGRC 4QGZA 2W1XA 1C46A 4M4OA 1J1PY 1HNLA 1B7LA 1B7QA 4J7VA 1OUHA 4ETAA 3WU8A 1TCYA 1C45A 1GEZA 1YL0X 3AGIA 4PGJB 5K7OA 1XEJA 3N9AA 1HF4A 1IX0A 2DQIY 5KXWA 2ZILA 3WPJA 1GEVA 3A6BY 4WM3A 2H5ZA 2MEAA 3QE8A 4H94A 4QY9A 5KXTA 4WL6A 1UC0A 3RNXA 1GHLA 2WARA 2MEHA 4N8ZA 1FLUA 5LAFA 1QIOA 3P66A 1D6QA 2BQOA 2Z2EA 3J4GA 4ZFPA 4OWEA 3WXUA 4WG7A 4KXIA 1D9UA 1FLWA 2BQBA 2YBNA 2HEFA 1NMMA 1LSBA 2Z2FA 1LZ1A 4GCCA 4N9RA 4NEBA 4HPIA 2Z12A 4BS7A 3A67Y 1LZRA 1EQEA 1GFAA 2BPUA 1OUFA 3D9AC 5LAGA 4B4JA 1GE4A 2BLYA 4HTQA 3P68A 4N0JA 5LVGA 1G7JC 3A92A 4XADA 2HEDA 3P64A 1GB8A 5E9RA 3TXEA 3WUAA 4LYZA 5T3FA 1WVUA 4RW2A 1FLYA 2N5ZA 5C6JA 1F0WA 4TSBA 4WM2A 3WUNA 1HMLA 4XENA 5FHWA 2ZIKA 4XYYA 5ILFA 3IWRA 4IASA 4ZIXA 4XN6A 3A8ZA 1WQRA 1LZYA 1HHLA 1LMPA 1YILA 2ZQ4A 3A95A 3EXDA 4WO6A 1RE2A 5LVIA 4YF2A 1J1XY 4TSCA 5LYTA 1REZA 1LSFA 2W1YA 1VDTA 1EQ5A 3AZ6A 1OUEA 4PHIA 1IVMA 1UIFA 1UIGA 3GXRA 1JUGA 4G4HA 1UIDA 2H9KA 4LYTA 3ZVQB 132LA 1GBYA 2IHLA 1JEFA 1GF9A 3CSQA 1ALCA 1KXWA 1CJ6A 1FBIX 3HBHA 4N5RA 2HU1A 3G3BB 4M6DA 1G7LC 2XBSA 2C8PA 3TMWA 4NHPA 1DPXA 5LINA 1LMOA 2F4AA 1GB3A 3AW7A 1LKSA 1IR9A 2CWIA 4H8ZA 4EMNA 4LYCA 1AZFA 1LMQA 1FKVA 1G7MC 3OK0A 4NSIA 135LA 2LZ2A 4H90A 4OW1A 4NG1A 2G4QA 4J1AA 3ATNA 1LJ3A 4ETCA 2DKVA 3D3DA 1IWVA 1OUDA 2D6BA 4NGVA 2Q0MX 4GCBA 3B0IA 5J7CA 1P2CC 3M18B 4KL7A 4IJ4A 3TMVA 3AGGG 4QDNA 3W6CA 4CHXA 6LYZA 2Z39A 1VEDA 1IWTA 1UIBA 2I25L 4WO9A 1GE1A 4KPMA 1JIYA 1HSWA 1DZBX 2LHMA 5F9XA 1GFHA 1IY4A 3TXHA 1LJIA 1OUCA 1UACY 2MECA 1MLCE 5I53A 1LMAA 1N4FA 1NKHA 3A94A 1C10A 1JKBA 1ZVHL 4BAPA 1GBZA 2ZYPA 3B6LA 3LHMA 1HERA 1WQPA 1IWUA 3J6KA 4PRUA 5KY1A 1H87A 4N1EI 1G7HC 1IEEA 1GB0A 1LSZA 4AXTA 5KXLA 1AT6A 4XJIA 1GE0A 1B7OA 5FSTA 3TXKA 1GXXA 4ZEEA 1QSWA 3M3UA 5LA8A 4II8A 1F10A 5FELA 4QEQA 2HTXA 3ZEKA 1TBYA 4GCFA 4ETDA 2BQLA 4B4EA 1LSEA 1LHKA 5DM9A 1UCOA 1HELA 1WTNA 4H9AA 2XBRA 1LSNA 1UICA 1GFVA 1LSAA 2ZYCA 4XJHA 3LN2A 1GB2A 1QDRA 3A90A 4XJFA 5I4WA 2DQAA 3WYHA 4E3UA 4DD1A 3A91A 4LYBA 1GD6A 3W3EA 2AUBA 4H1PA 1LKRA 3A3QA 4WM6A 4B0DA 3WPKA 3OJPA 1B0DA 1CJ7A 1DXJA 1DPWA 1VDQA 4NWHA 4WL7A 1CKCA 1YANA 1XSFA 193LA 4TX7A 4FDYA 5HLLA 1C7PA 8LYZA 1B7MA 1B2KA 1LZAA 1IP4A 2YVBA 3WW5A 1HEMA 4PJ2C 4H9HA 1HMKA 1IOTA 4P2EA 3VWOA 4DD0A 1LMNA 4NY5A 2YBIA 4UWVA 5HNCA 1B7RA 3AB6A 3A93A 3AGHA 1HSXA 5LXWA 2I6ZA 5KXRA 4WM1A 1YL1X 4LGKA 1IOCA 2ZWBA 1IP2A 3TMUA 3T6UA 3WPLA 4HTKA 1F6SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP3A 1P5CA 3CDTA 1L0KA 2IGCA 3W6AA 1DI4A 1NDGC 1QS9A 1IP1A 2RBQA 1NF5A 1B5XA 3GXKA 2BAAA 1GDWA 2RB2X 5C6IA 2XTHA 1Z55A 1L50A 1QT3A 4DC4A 3B0KA 4NGWA 1LTMA 4A7DA 5HMVA 1LGWA 1LJFA 237LA 1CTWA 1L12A 5DN5A 1XJTA 215LA 187LA 1CX7A 1JTTL 1OP9B 1JTMA 2F2NA 2LYZA 4EKQA 3CDVA 4D9ZA 4TUNA 4NIJA 5A3EA 199LA 3SB8A 195LA 1E8LA 4GLAA 1LHJA 2O7AA 4BADA 2D4IA 1FN5A 1LI3A 1C6KA 4EJ4A 1XEKA 1C63A 5F14A 247LA 1L82A 2RBRA 5KXYA 7LZMA 5I4YA 155LA 229LA 2A7FA 1C64A 3SB9A 205LA 1G7IC 207LA 1IOQA 1LSPA 1OUGA 1C6NA 1GF7A 1RCMA 4I7LA 3CQLA 2QB0B 3HBDA 2BQKA 3TXIA 2OU8A 252LA 5APCA 1A2YC 1B5ZA 4WLDA 198LA 2B6WA 5M1YA 3LYOA 1VFBC 2DQFC 5KXXA 1QS5A 5IDDA 1YAQA 5KJ9A 2B7XA 3LYTA 1GFRA 1LYOA 1L67A 2CGIA 1C6DA 5LYZA 1CVKA 4I7KA 1PS5A 1W6ZA 2XQOA 4W53A 5JENB 2OTYX 1SSYA 3RT5X 2F4GA 1TAYA 2DQGY 4RLMA 4NFVA 4CFOA 3AZ7A 4KT3A 5KXKA 1GF6A 2YBHA 5D5CA 250LA 3PBLA 1L68A 120LA 5HQ1A 122LA 239LA 4W94A 1JJ0A 1LYFA 169LA 3RUNA 2D91A 1GFJA 1B5YA 1QSAA 3TXDA 3ULRA 2VB1A 4BAFA 5AMYA 4TWSA 119LA 1VAUA 1EL1A 1LYYA 1JSFA 4H91A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4R0F A;  5I4X A;  1IP3 A;  1CKH A;  4PPO A;  1BB6 A;  4HSF A;  4L41 A;  1JIT A;  1UBZ A;  1GF5 A;  1UIH A;  2PC2 A;  1LJE A;  1REY A;  1T6V L;  134L A;  1LZS A;  2H9J A;  3CT0 A;  4WLX A;  1GFU A;  3MGW A;  1JTO L;  1JKC A;  1OUI A;  4MCK A;  1HC0 A;  3W6A A;  2CJL A;  1DI4 A;  1HFZ A;  1GBS A;  1NDG C;  1IP1 A;  3K3T A;  5APE A;  3W6B A;  1UA6 Y;  1NF5 A;  1A4V A;  1B5X A;  3GXK A;  1F6R A;  1WQQ A;  3A3R X;  2BAA A;  1BB3 A;  1GDW A;  1V7S A;  2BQM A;  2BQJ A;  3ZVQ A;  4NGI A;  1BVX A;  1HEN A;  1GBX A;  5C6I A;  1YIK A;  2XTH A;  4X3B A;  1V7T A;  5C6L A;  1NBZ C;  3FE0 A;  2W1M A;  1JSE A;  4IAT A;  1Z55 A;  1IWY A;  2HUB A;  4DD2 A;  4C5F A;  3A6C Y;  1BHZ A;  1LYZ A;  1GB5 A;  1OUA A;  4DC4 A;  3B0K A;  4OOT A;  1QQY A;  4LT2 A;  1BB4 A;  4NGW A;  4NGK A;  5LVJ A;  4DD7 A;  1B7S A;  1LTM A;  7LYZ A;  2MEB A;  4A7D A;  5HMV A;  1HEW A;  4NSH A;  5B59 A;  1GXV 2;  1LJF A;  1LZE A;  1KIQ C;  4N1C C;  1IWW A;  1LZD A;  1LHH A;  1YAP A;  5LIO A;  4DDB A;  4NG8 A;  1VAT A;  1OUB A;  1GFG A; 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 5F9X A;  1GFH A;  1IY4 A;  3TXH A;  1LJI A;  1OUC A;  1UAC Y;  2MEC A;  1MLC E;  5I53 A;  1LMA A;  1N4F A;  1NKH A;  3A94 A;  1C10 A;  1JKB A;  1ZVH L;  4BAP A;  1GBZ A;  2ZYP A;  3B6L A;  3LHM A;  1HER A;  1WQP A;  1IWU A;  3J6K A;  4PRU A;  5KY1 A;  1H87 A;  4N1E I;  1G7H C;  1IEE A;  1GB0 A;  1LSZ A;  4AXT A;  5KXL A;  1AT6 A;  4XJI A;  1GE0 A;  1B7O A;  5FST A;  3TXK A;  1GXX A;  4ZEE A;  1QSW A;  3M3U A;  5LA8 A;  4II8 A;  1F10 A;  5FEL A;  4QEQ A;  2HTX A;  3ZEK A;  1TBY A;  4GCF A;  4ETD A;  2BQL A;  4B4E A;  1LSE A;  1LHK A;  5DM9 A;  1UCO A;  1HEL A;  1WTN A;  4H9A A;  2XBR A;  1LSN A;  1UIC A;  1GFV A;  1LSA A;  2ZYC A;  4XJH A;  3LN2 A;  1GB2 A;  1QDR A;  3A90 A;  4XJF A;  5I4W A;  2DQA A;  3WYH A;  4E3U A;  4DD1 A;  3A91 A;  4LYB A;  1GD6 A;  3W3E A;  2AUB A;  4H1P A;  1LKR A;  3A3Q A;  4WM6 A;  4B0D A;  3WPK A;  3OJP A;  1B0D A;  1CJ7 A;  1DXJ A;  1DPW A;  1VDQ A;  4NWH A;  4WL7 A;  1CKC A;  1YAN A;  1XSF A;  193L A;  4TX7 A;  4FDY A;  5HLL A;  1C7P A;  8LYZ A;  1B7M A;  1B2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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