4DWXA

Crystal structure of a family gh-19 chitinase from rye seeds
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SVSSIISHAQFDRMLLHRNDGACQAKGFYTYDAFVAAANAFPGFGATGSTDARKRDVAAFLAQTSHETTGGWATAPDGAFAWGYCFKQERGAAADYCTPSAQWPCAPGKRYYGRGPIQLSHNYNYGPAGRAIGVDLLRNPDLVATDPTVSFKTALWFWMTAQAPKPSSHAVITGKWSPSGADRAAGRAPGFGVITNIINGGLECGHGQDSRVADRIGFYKRYCDILGVGYGDNLDCYNQRPF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure and chitin oligosaccharide-binding mode of a 'loopful' family GH19 chitinase from rye, Secale cereale, seeds
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Secale cereale
molecule keywords Basic endochitinase C
total genus 91
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dwxA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 4dwxA02
4N8ZA 4II8A 9LYZA 4H9IA 3LHMA 1GE2A 4EMNA 1GFAA 1JITA 1LSFA 1LJ4A 1I56A 4YENA 5KKIA 2DQIY 1IWUA 1GE4A 1GFUA 3LYTA 1INUA 2YBNA 2BQMA 4LYCA 1WQPA 5KY1A 1D6PA 2IHLA 2LYZA 5LXWA 1FLQA 2AUBA 3WUAA 1GB9A 5FELA 2BQBA 1SQ2L 4WL6A 2VB1A 3ZEKA 1CJ9A 1TAYA 1YROA 1NBZC 1IP7A 4WG1A 2C8PA 5KXPA 1OQMA 1JKBA 4NFVA 1UCOA 1JKDA 1TDYA 1LHMA 3P65A 5FSTA 5I53A 4BADA 1NDMC 1B5YA 4YOPA 1GE1A 1HMLA 2ZYPA 4R0FA 2YBHA 4IJ4A 3W6CA 1LZAA 4NHTA 3RW8A 3WH1A 3OJPA 1C43A 5FDJA 5LAFA 4AGAA 1GF6A 2LYMA 3B0KA 4WO6A 2XBSA 1C08C 1B7OA 1JJ1A 1QQYA 3M3UA 3CT1A 4HV1A 4TSBA 2LZ2A 4HSFA 5B59A 3TXIA 3WPLA 4GCBA 5KXMA 5KXSA 2I25L 1IWXA 1LHKA 2GV0A 193LA 1UACY 4PRUA 3TXFA 2LYOA 1HEMA 1QSAA 4G4CA 5F9UA 2I6ZA 3LYMA 1VDTA 1VAUA 2IFFY 1RJCB 4NSJA 1YANA 4GN5C 3P68A 1YKYX 4QGZA 3TXHA 1DI5A 1HEQA 1IR8A 1XEIA 4OW1A 4B4IA 3MGWA 2Z12A 4H94A 1J1PY 1IOSA 4TWSA 5L9JA 4J1AA 1JEFA 1QIOA 1WQRA 1HEOA 4Z46A 1J1XY 4A7DA 2C8OA 5KXOA 1F10A 3A67Y 3HFMY 4KL7A 1GDWA 4PRQA 5II3A 5LVHA 1HSXA 1XEKA 3AW6A 5HNCA 1QTEA 3FI7A 1AT5A 5E4PA 4ET8A 4G4BA 3F6ZA 1IX0A 1UIAA 3AZ5A 3TXDA 2BQJA 1BGIA 5KXYA 4H92A 2ZIJA 1IWZA 1VFBC 194LA 1PZYA 4H8YA 1W6ZA 1GBWA 2FBBA 3A92A 4B49A 4DD1A 4CGEA 2EIZC 1AZFA 1LSNA 4XJBA 4ANRA 4YEMA 3ATNA 4LFXA 4WOAA 3RU5A 4ETBA 2Y8PA 1LZTA 4DD3A 4XJHA 1AM7A 4H8ZA 3N9AA 4HTKA 4BS7A 4LT3A 5J7CA 1ZMYL 4NSIA 5AMYA 2G4NA 1LJJA 3J6KA 3EXDA 1LZBA 1FLUA 4NHIA 5I4WA 1B7SA 1J1OY 3CB7A 1BB7A 3WMKA 1IP1A 1LZEA 4ZEEA 1Z55A 1JHLA 2F2NA 4J1BA 1QTKA 5APEA 1G7HC 2BQLA 4E3UA 4GN4A 1JSFA 1NWGA 2YDGA 1F6RA 3HBDA 3W6AA 4NEBA 1EQ4A 1WQMA 4ETEA 4BAPA 4H9EA 1IOQA 4XADA 1B7LA 1GEZA 1CJ8A 1CJ6A 1IWTA 1QSWA 1OUAA 3KAMA 4NG8A 1AT6A 1B0DA 3T36A 2YBLA 4HPEA 4N1CC 4NSGA 2YBIA 2FYCA 1D9UA 1LJFA 1RE2A 1GB2A 2HTXA 2DQGY 5KXZA 5LVJA 1C46A 3B0IA 2ZQ3A 4WLDA 4B0DA 2FBDA 4R6CA 3WVXA 1E8LA 1QDRA 1GWDA 4XENA 5F14A 1GXXA 1IP5A 5I4XA 4DD2A 2Z37A 1GFKA 3VWOA 4ZIXA 3FE0A 3A91A 5DN4A 1LMQA 5T3FA 5HMVA 4UWNA 1LZRA 5FEKA 1OUEA 1HFXA 4DD9A 5LINA 1LSMA 1BWHA 1P2CC 1DI4A 1GB8A 5KXLA 3EBAB 4RW1A 5C6IA 1BB4A 1AKIA 1HFYA 1NF5A 3A95A 1B5XA 1HSWA 3TXEA 3IWRA 4XN6A 2FYDA 1LSEA 1BHZA 3AB6A 4LT1A 4WLYA 1BVXA 4LFPA 2MEBA 1LKSA 1LCNA 5F16A 1XGPC 2HECA 1XGUC 4OOTA 5LYMA 1VDSA 1KIRC 2HUBA 1LSZA 4DWXA 5D5FA 4ETCA 4MCKA 135LA 1RI8B 1OUHA 4HJYA 3BKHA 1D0KA 1LZYA 2BPUA 1T6VL 4CHXA 1LSDA 1OUGA 1IP3A 3LZTA 1NDGC 4NHSA 3T6UA 1WVUA 1WQOA 1FKVA 1NBYC 1GXV2 4QY9A 2HEAA 2BQGA 2HU1A 1H87A 1KXXA 4H8XA 5C6JA 1LZGA 1FLYA 1TCYA 1LSGA 4NHPA 1UA6Y 1REYA 4XJFA 4PPOA 1UUZC 1IP4A 5F9XA 1YKXX 1LZ9A 2A7DA 4UWUA 2MEGA 1LPIA 5DLAA 2W1YA 4YM8A 1LSYA 1IR7A 4KPMA 3CSZA 4Z3MA 4PGJB 4WG7A 5HLLA 1LZDA 3QNGA 1BWJA 1C10A 5HNLA 3RT5X 2ZIKA 1W08A 5B06A 1XGQC 2BLXA 1B7NA 2HEBA 1B7RA 3A96A 1B5WA 1TEWA 1GFGA 2ZWBA 1N4FA 4WL7A 1HENA 1GF7A 2BQKA 4MR1A 4X3BA 4N9RA 1NHEA 2XBRA 4WO9A 3AZ6A 4G9SA 1D0LA 3TMXA 1A2YC 4NHQA 1LZ8A 4W94A 1UIFA 3AGHA 1I20A 1V7SA 3LYZA 4GLVA 4H91A 3CT5A 4XJGA 6LYTA 1LMAA 1BB5A 3AGGG 1GF0A 3RNXA 2XJWA 2H5ZA 1GAZA 1GE3A 2F4GA 4TTDA 4WM6A 4NY5A 5D5CA 1NMMA 2G4PA 4EOFA 1B5VA 3ZVQA 4J0LA 2BQDA 3OK0A 3B6LA 3A6BY 3G3AB 4HTNA 1XEJA 4W96A 3TMVA 4LYMA 1CKGA 4U3XB 4ZFPA 1GB3A 1GPQC 2W1MA 3B0OA 2BLYA 1OUCA 2DKVA 3EO5A 5ILCA 1BQLY 1LYOA 2ZYCA 3WU7A 4DC4A 1FN5A 2BQFA 4WM3A 1GB0A 1GAYA 1LSPA 3WUNA 5LYTA 1G7MC 1LSAA 1UIDA 1YIKA 4XJIA 1REMA 1GDXA 4RLMA 1LJ3A 2BQEA 3IJVA 133LA 1HEPA 2MEHA 3G3BB 3WYHA 1HNLA 5LYZA 2BQHA 3HBHA 4I8SA 1O23A 4N5RA 1ZVHL 4TX7A 2YVBA 4H90A 1D0MA 1HERA 1LSBA 1NQIA 4IASA 4H1PA 1LMCA 1OUFA 5C6LA 1OP9B 2F4AA 3ZVQB 1CKDA 1KIQC 3GXKA 1REZA 4DDBA 1IOTA 4Z41A 1VDPA 4OWAA 1DZBX 1IY3A 4QDNA 1JJ0A 2HEEA 132LA 1GB5A 3D3DA 2CDSA 1YQVY 5EBHA 1GBXA 1MELL 4LZTA 1CKHA 1JKAA 2DBTA 8LYZA 5JENB 4KT3A 4AXTA 4WM2A 5LVIA 5F81A 4OWCA 1LYYA 1V7TA 4QEQA 4XYYA 3WU9A 4NG1A 4LYZA 1GBYA 4P2EA 3W6BA 1UIBA 2MECA 1LZ4A 4LT0A 1EL1A 3AW7A 4MSTA 3TXBA 1DPXA 1B9OA 2BQCA 2Z19A 1UC0A 2XTHA 4HV2A 5L3HA 1IP2A 3IJUA 5FHWA 1YAMA 3W3EA 153LA 1GF4A 1C7PA 5K7OA 4GCDA 1F0WA 3SP3A 4ETAA 2MEIA 1XFPL 1LHLA 2ZILA 3LN2A 3RZ4A 4TSCA 4NGKA 2X0AA 3QY4A 4H9BA 1JWRA 1GD6A 1JTTL 1WQQA 4DDAA 1HELA 1LSCA 4LYBA 4WMGA 5B05A 4NGJA 3ULRA 2BQAA 5KXTA 2ZNXY 1LHJA 4LYTA 4B1AA 1IO5A 1IWYA 1IC7Y 4OOOA 1GF5A 3TXGA 1REXA 4PHIA 2F30A 1JISA 5KXWA 4NWHA 1DPWA 4GCFA 4H93A 2LZTA 2RSCA 3WW6A 1HFZA 3WW5A 1JUGA 2Z38A 1GF3A 1OUBA 4WM5A 3WPKA 4BAFA 3P66A 3WVYA 1MLCE 2D6BA 1LYZA 1XGRC 2H9KA 2DQDY 4ML7A 4FDYA 1LJNA 4CJ2A 4HTQA 3W6DA 2H9JA 5IDDA 3TMWA 4CFOA 1IVMA 1ZV5L 1XGTC 1GB7A 2BQNA 3CSRA 1DQJC 2EPEA 154LA 4RDSA 1HEWA 4PJ2C 1GB6A 2I26L 4GCEA 1C45A 1YL1X 1ZVYB 1IOCA 1UBZA 1LKRA 1WQNA 2D91A 1FKQA 3B72A 1D6QA 4GN3A 3AZ4A 4OWHA 3CSQA 1QDTA 2D4IA 5APFA 1B2KA 2LHMA 1GFHA 1WTMA 3EMSA 3N9CA 4UWVA 2HEDA 3WUMA 1IWWA 5E9RA 2DQCY 1I1ZA 1WVVA 1LMTA 4H9FA 4YEOA 4B4EA 4D9ZA 4GLAA 1JTPL 2B5ZA 3J4GA 3AZ7A 3GXRA 2EKSC 5I5QA 2YBMA 3E3DA 1LZ1A 3WPJA 4CFPA 4M4OA 1RFPA 2ZNWY 4Z98A 1CNSA 2N5ZA 3A94A 4NGYA 5LAGA 1HC0A 4I0CA 1BB3A 2DQJY 1FDLY 1GBZA 1LJHA 4H9CA 2DQAA 4RW2A 4C3WA 3ATOA 5KKJA 2WARA 1IC5Y 1GFRA 3A90A 2A7FA 4HJVA 3BKVA 4WLXA 2HU3A 1LJKA 1DXJA 4HP0A 7LYZA 1IORA 2Z39A 1KXWA 1B5UA 4HPIA 2BAAA 4NGZA 3LZ2A 1UIHA 1CKFA 1LZ6A 3A6CY 1YILA 1FBIX 1H6MA 1OUDA 3AGIA 1UICA 4GCCA 4H9AA 4NGLA 3WL2A 3A3QA 4IATA 4NWEA 5B1GA 2BQIA 5LA8A 1G7JC 1IWVA 1VEDA 5HQ1A 2D4KA 1ALCA 3CQLA 5LVGA 3TXKA 1IY4A 4L41A 1GFVA 3TMUA 1XSFA 4O34A 4B4JA 2Z2FA 5FCPA 1IR9A 3A3RX 1RCMA 1YAQA 1OUJA 4WM4A 4ETDA 5KXRA 3WU8A 3TXJA 2MEDA 2CGIA 2ZQ4A 4DDCA 1QUSA 1LHIA 4N0JA 2HEFA 1JTOL 1LZCA 1GE0A 5APDA 1YAOA 5B1FA 4KXIA 4TUNA 5APCA 5IHGA 5I54A 5DN5A 2Z2EA 2EQLA 4NIJA 4OWBA 1LHHA 5IELA 1CJ7A 5A3ZA 1JSEA 2W1XA 3M18B 1LJEA 4M6DA 2BQOA 5DL9A 1UIGA 3K3TA 1T3PA 1QUTA 5LVKA 4DYGA 1IEEA 2MEEA 3AJNA 1UIEA 3WULA 5DM9A 1JPOA 2Q0MX 3HBEX 2DQFC 5B07A 4DT3A 1LMNA 5KJ9A 4H9HA 1BWIA 3A93A 4G4HA 4OWEA 3P4ZA 5KXNA 2DQHY 1IC4Y 3WXUA 4WM1A 1BVKC 3W6EA 1IIZA 1B7QA 1OUIA 5LA5A 4N1EI 1KXYA 1B7MA 3A34A 1GFTA 1LAAA 1LZSA 2YBJA 1YAPA 2PC2A 4DD7A 4NGVA 1GFJA 4HJZA 4ET9A 1BB6A 3P64A 4G49A 1LOZA 1F6SA 5I4YA 1LTMA 2NWDX 4LYOA 5M1YA 4WLTA 2W1LA 1VATA 1HHLA 2MEFA 5LIOA 1TBYA 4FJRA 3QE8A 5KXKA 1LYSA 3LYOA 1G7LC 134LA 1GF9A 3WXTA 3W6FA 6LYZA 1VDQA 1YKZX 2Z18A 1LZ5A 4C5FA 5HMJA 5ILFA 1HMKA 1IP6A 1KIPC 4NGWA 1B5ZA 1GBSA 1SLYA 4NSHA 1LMPA 1WTNA 1GEVA 1GHLA 2MEAA 2DQEY 4YF2A 2D4JA 1DI3A 1EQ5A 1JIYA 1G7IC 4NGIA 4XJDA 1B7PA 5L3IA 3N9EA 1GFEA 1LZNA 1PS5A 1CKCA 207LA 1A4VA 1HF4A 208LA 2CWIA 3D9AC 5A3EA 1JJ3A 3A8ZA 4LT2A 1DKKA 1GBOA 1LMOA 2G4QA 4LGKA 3CT0A 1GF8A 2YSSC 1LJGA 1FLWA 2CJLA 4NGOA 4DD0A 4J7VA 1LJIA 1DKJA 3AYQA 1EQEA 5KXXA 1YL0X 4RLNA 1NKHA 1JKCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N8ZA 9LYZA 1GE2A 1LSFA 4YENA 3LYTA 2YBNA 2B73A 1OVKA 4LDOA 1L95A 2VB1A 3SB9A 1NBZC 221LA 1UCOA 1JKDA 3FADA 1LHMA 3P65A 4BADA 1LGXA 1B5YA 4YOPA 1KW5A 3W6CA 1QTBA 3WH1A 164LA 2LYMA 4LZMA 1JJ1A 3M3UA 3CT1A 122LA 4HV1A 3TXIA 1C6BA 2L78A 142LA 2OU9A 2QB0B 112LA 1VDTA 1RJCB 1YANA 199LA 4GN5C 4PJZA 4QGZA 3TXHA 1G1VA 185LA 1IOSA 1WQRA 2RAZX 4A7DA 2C8OA 1F10A 4KL7A 1GDWA 1XEKA 1LI6A 3AW6A 5E4PA 3F6ZA 1BGIA 1PZYA 2FBBA 197LA 1AZFA 1PQDA 3ATNA 4WOAA 4ETBA 1LYIA 242LA 3RUNA 1L28A 4BS7A 1L61A 3HDFA 4NSIA 1LJJA 5I4WA 1L67A 1BB7A 3WMKA 1LZEA 2F2NA 5APEA 1G7HC 2BQLA 4I7PA 4GN4A 1JSFA 3HBDA 3W6AA 4S0WA 1IOQA 1B7LA 1GEZA 1CJ8A 129LA 1CJ6A 1QSWA 1OUAA 1C6NA 1PQIA 1L98A 113LA 4WLDA 1D2WA 4B0DA 3WVXA 1QDRA 1LPYA 5F14A 1GXXA 5I4XA 4DD2A 2Z37A 4EJ4A 1GFKA 4ZIXA 1QT5A 5DN4A 1LZRA 5FEKA 1L34A 1LSMA 3EBAB 1AKIA 3A95A 111LA 3L64A 4LT1A 1BHZA 1BVXA 1ZWNA 2MEBA 1LCNA 3CDTA 5LYMA 1VDSA 1LSZA 4DWXA 5D5FA 1C6TA 135LA 1RI8B 1T6VL 4CHXA 1LSDA 4OO9A 1WQOA 1NBYC 1GXV2 4QY9A 2BQGA 1KXXA 1FLYA 1TCYA 1C6KA 4NHPA 186LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4N8Z A;  4II8 A;  9LYZ A;  4H9I A;  3LHM A;  1GE2 A;  4EMN A;  1GFA A;  1JIT A;  1LSF A;  1LJ4 A;  1I56 A;  4YEN A;  5KKI A;  2DQI Y;  1IWU A;  1GE4 A;  1GFU A;  3LYT A;  1INU A;  2YBN A;  2BQM A;  4LYC A;  1WQP A;  5KY1 A;  1D6P A;  2IHL A;  2LYZ A;  5LXW A;  1FLQ A;  2AUB A;  3WUA A;  1GB9 A;  5FEL A;  2BQB A;  1SQ2 L;  4WL6 A;  2VB1 A;  3ZEK A;  1CJ9 A;  1TAY A;  1YRO A;  1NBZ C;  1IP7 A;  4WG1 A;  2C8P A;  5KXP A;  1OQM A;  1JKB A;  4NFV A;  1UCO A;  1JKD A;  1TDY A;  1LHM A;  3P65 A;  5FST A;  5I53 A;  4BAD A;  1NDM C;  1B5Y A;  4YOP A;  1GE1 A;  1HML A;  2ZYP A;  4R0F A;  2YBH A;  4IJ4 A;  3W6C A;  1LZA A;  4NHT A;  3RW8 A;  3WH1 A;  3OJP A;  1C43 A;  5FDJ A;  5LAF A;  4AGA A;  1GF6 A;  2LYM A;  3B0K A;  4WO6 A;  2XBS A;  1C08 C;  1B7O A;  1JJ1 A;  1QQY A;  3M3U A;  3CT1 A;  4HV1 A;  4TSB A;  2LZ2 A;  4HSF A;  5B59 A;  3TXI A;  3WPL A;  4GCB A;  5KXM A;  5KXS A;  2I25 L;  1IWX A;  1LHK A;  2GV0 A;  193L A;  1UAC Y;  4PRU A;  3TXF A;  2LYO A;  1HEM A;  1QSA A;  4G4C A;  5F9U A;  2I6Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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