4HJVA

Crystal structure of e. coli mlte with bound bulgecin and murodipeptide
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
HDYTNPPWNAKVPVQRAMQWMPISQKAGAAWGVDPQLITAIIAIESGGNPNAVSKSNAIGLMQLKASTSGRDVYRRMGWSGEPTTSELKNPERNISMGAAYLNILETGPLAGIEDPKVLQYALVVSYANGAGALLRTFSSDRKKAISKINDLDADEFLEHVARNHPAPQAPRYIYKLEQALDAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title On the Mechanism of Peptidoglycan Binding and Cleavage by the endo-Specific Lytic Transglycosylase MltE from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Escherichia coli
molecule keywords Endo-type membrane-bound lytic murein transglycosylase A
total genus 67
structure length 184
sequence length 184
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 4.2.2.n2: Peptidoglycan lytic endotransglycosylase.
pdb deposition date 2012-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4hjvA00
5B1GA 1GB9A 1B7PA 2G4QA 1UA6Y 4MSTA 1MLCE 4J7VA 4WG1A 3AGGG 1LSYA 1QSWA 4H9HA 1HNLA 3W6AA 1YQVY 2DQCY 3TXFA 3WPKA 3D3DA 4RLNA 3VWOA 1OUCA 5L3HA 1P2CC 3WXTA 4PRUA 3TXGA 1HFXA 1OUFA 1EQ4A 1AT6A 1BB3A 3TXKA 1KIPC 3A34A 1BWJA 1LZ1A 1JHLA 3K3TA 5APFA 5LVKA 3RNXA 2IFFY 1B7RA 1YKYX 4NG1A 3TXDA 2Z39A 4NHSA 1D6PA 1LSDA 5LA5A 5I4YA 1GAYA 3WYHA 5FCPA 2Z2EA 1BB7A 1GF5A 4L41A 1A4VA 1GE0A 5IHGA 1GB6A 5AMYA 1GBSA 3CSQA 4KPMA 1QQYA 5C6JA 1IR8A 4H91A 1NBYC 3EO5A 3LZTA 4BADA 1JEFA 1NQIA 1QTKA 4ETEA 3LYOA 4WM1A 3CSZA 4N8ZA 2BQGA 2F4GA 4LFXA 2B5ZA 1EQ5A 4I0CA 5F9XA 2YBLA 1XGRC 2ZILA 1QUSA 1VDSA 1DI3A 2G4NA 2XBRA 1LJFA 2YBNA 2ZYCA 1T3PA 3AGIA 4ZFPA 1FLQA 2LYZA 1TEWA 4PRQA 1IWVA 1GAZA 5HMJA 3A3RX 4NSGA 3CT5A 4NGKA 4XJHA 1LZRA 1GB5A 2MEIA 4EOFA 5HMVA 1AT5A 1JKDA 5KKIA 2I25L 4NHPA 1GBWA 5KXPA 1LSNA 5I53A 1IP4A 4NGLA 3WVYA 1B7MA 4WM5A 4C3WA 5LYTA 1GFUA 3BKHA 1FKVA 1LCNA 4G4BA 1LHKA 1B5ZA 4HSFA 1MELL 4NGYA 2HECA 2MEFA 4NY5A 1CKGA 4HJVA 4LGKA 4NIJA 4OWHA 2Z38A 1JSEA 1GB2A 1JUGA 4WO6A 207LA 4DD0A 4DT3A 1YAMA 3E3DA 1UIFA 4XYYA 3ULRA 1GB7A 2YBHA 4KT3A 1GE4A 4OW1A 1GF9A 4N0JA 1NKHA 3WUAA 1CKFA 3A6BY 5FSTA 4PGJB 3P65A 1QIOA 1UUZC 4M4OA 4J1AA 1WTNA 5II3A 1ALCA 5I54A 5K7OA 4LZTA 2HEAA 1LMAA 4GCBA 4X3BA 2BQLA 1D0KA 1HEPA 1LZ4A 1TAYA 2BLYA 2BQDA 2ZIJA 2NWDX 2ZIKA 4HJZA 4LYTA 1LZDA 3WW5A 3B72A 3WL2A 1YKZX 1UC0A 1LAAA 3AB6A 1B2KA 1HMKA 4XADA 4II8A 4N1CC 3WMKA 1DI4A 1NMMA 1LJEA 4NEBA 3WU9A 2Z19A 1QSAA 3HBDA 4Z3MA 2PC2A 1GE2A 1OUEA 1GWDA 1OUAA 1HEMA 1FLYA 1DXJA 4H8XA 1HC0A 2BQKA 3W6CA 1LZ9A 4WOAA 1B5XA 3ATNA 3ATOA 1ZMYL 2DQFC 2BQOA 3WVXA 5KXOA 3W6DA 5KKJA 3TMVA 1JSFA 2BQFA 3IWRA 5DN5A 1VFBC 3AZ4A 3N9EA 2I6ZA 1GFTA 1GEVA 4AXTA 2D4IA 1F0WA 1AKIA 1LYYA 2D91A 4LYMA 4WM2A 3LYTA 3QY4A 4WG7A 1C45A 4WMGA 1VDQA 5E4PA 1IOSA 4XJDA 1IR9A 4KL7A 1D0LA 4C5FA 1IP7A 5KY1A 1LHJA 1H87A 1IP2A 4UWUA 1G7MC 1IC5Y 1J1PY 5LYZA 4E3UA 1UBZA 4HP0A 2LZ2A 2HEEA 4OOOA 1GFGA 1G7LC 1NDMC 5APEA 4YM8A 3G3AB 1LYZA 5KXYA 9LYZA 2HUBA 1BVXA 3AZ7A 3LZ2A 1UIHA 5LVJA 1JITA 3ZVQB 1C08C 1W6ZA 5C6IA 3TMWA 1GF7A 1LYSA 1REMA 1VDTA 3WULA 4B4IA 1XGQC 2N5ZA 2ZQ4A 4HV1A 3WXUA 4WM6A 5D5CA 4DDAA 2IHLA 1FLUA 3G3BB 1DZBX 4AGAA 2W1LA 5F16A 2CGIA 2C8PA 4TUNA 1TDYA 3A92A 1LJIA 1VATA 1IY3A 1I20A 3T6UA 1BVKC 1Z55A 1IR7A 3CQLA 5EBHA 1LMNA 4IJ4A 2FYDA 1IC4Y 1BGIA 5LYMA 1CKHA 1DI5A 1HENA 1IWWA 3B0KA 2FYCA 3KAMA 4NSHA 4G9SA 4BAPA 4GN5C 4IASA 2BQJA 4DD1A 1HMLA 2G4PA 1C10A 5D5FA 2FBBA 2H9JA 1HF4A 1KIQC 4HTQA 5KXKA 4WM3A 1GDWA 1JJ0A 1IWZA 1BWHA 2EIZC 4U3XB 5A3ZA 4XJFA 2C8OA 3TXIA 1FDLY 1LSFA 1J1OY 1LJGA 3EBAB 1OUBA 3AJNA 3WPJA 4TWSA 1LSMA 2EQLA 1DQJC 4H9AA 1BHZA 1WVUA 4LYBA 7LYZA 1XEKA 1ZV5L 1T6VL 1B5YA 1RCMA 4D9ZA 5KXTA 1GF6A 1YAOA 2D6BA 3LN2A 1HFYA 1B7QA 5KXSA 1LZYA 4DD9A 2DQEY 3OJPA 5A3EA 4ETAA 1NF5A 4YEOA 1KXWA 1REZA 3TMUA 5LINA 3CT0A 3FI7A 3W6BA 4ETCA 1N4FA 1SLYA 2ZWBA 1LYOA 135LA 4LYZA 5ILCA 4WLXA 2AUBA 2MEGA 4OWCA 4LFPA 3WU8A 4BAFA 2MEDA 1JKAA 1LTMA 1YKXX 5L9JA 4OOTA 1HEWA 1LZNA 1FBIX 3AGHA 3QE8A 3WU7A 4ETDA 2Q0MX 1XGPC 5FEKA 2DQHY 1UIAA 3B0IA 1YAPA 4TX7A 5LVHA 3AZ6A 3P66A 1LSAA 1HHLA 4N5RA 1LHLA 5HNLA 3RW8A 1QDTA 1GBYA 5T3FA 1W08A 4DYGA 1LJKA 3EMSA 1NHEA 4GCEA 2ZQ3A 1DKJA 4CJ2A 4HTKA 5HNCA 5FDJA 1GF0A 4NFVA 4DDCA 1F6RA 1B5VA 193LA 1BB5A 3M18B 4NSIA 4DC4A 5ILFA 1OQMA 1JTPL 4W94A 1B0DA 1B7LA 2XTHA 3A8ZA 1LKRA 3AW6A 4H94A 4H9IA 4WM4A 133LA 5I5QA 4DDBA 1IVMA 3WPLA 4NHTA 1DPXA 1D0MA 1LMQA 4XJBA 4DD7A 1V7TA 3HBEX 4Z41A 3CT1A 4CHXA 1GB3A 1HELA 2H5ZA 1REYA 4NGOA 3B6LA 4O34A 2Z18A 4G49A 4GCCA 4QEQA 1QDRA 4YEMA 2WARA 1CJ8A 1LMPA 2Z2FA 3A96A 1LZBA 5DL9A 5KXXA 1I1ZA 4XJIA 5KXLA 1HFZA 1RFPA 2BQEA 4FJRA 5FELA 4UWVA 1AM7A 1GFRA 1JKBA 1GFAA 4ML7A 2Y8PA 2DQAA 4KXIA 4W96A 4H9EA 2FBDA 3AYQA 4PHIA 5F14A 1GPQC 2ZNXY 2W1XA 4WL6A 2A7DA 2LYOA 2CJLA 3OK0A 4HV2A 5LA8A 4Z46A 1IP6A 3WUNA 1WQOA 2BQHA 3A94A 1DKKA 3CSRA 1PS5A 1GB8A 3J6KA 2RSCA 1JJ1A 1GFKA 1IEEA 4P2EA 1B5WA 2BQBA 1IOCA 3J4GA 5I4XA 1IWTA 1YROA 4NHQA 1XSFA 1LMCA 3A6CY 3D9AC 2DBTA 4H1PA 2MECA 1LSEA 1RE2A 1EL1A 1NDGC 1O23A 1LPIA 3TXEA 4CFPA 2X0AA 1GD6A 2BAAA 1G7IC 2HEFA 3CB7A 3TXBA 1LHIA 1WVVA 5LAGA 2MEBA 1OUGA 3SP3A 1B5UA 2YDGA 4R0FA 153LA 4NSJA 2D4JA 5B07A 4OWBA 3W6EA 4B1AA 1SQ2L 1TCYA 1IWUA 1A2YC 1B7OA 4FDYA 1G7HC 1GF8A 3A95A 4CGEA 2VB1A 4ANRA 1JPOA 1IOTA 4QGZA 4R6CA 1LSPA 1LZ5A 4NGVA 1CJ7A 1YILA 1GFEA 1UIEA 5I4WA 1LMOA 4YF2A 5KXRA 1D9UA 1FN5A 4RW2A 3A90A 1TBYA 4LT3A 2YSSC 1OP9B 1UIDA 5B06A 194LA 1VAUA 1IX0A 3P4ZA 4QDNA 5APCA 1QTEA 3HBHA 4GCFA 5KXNA 5LVGA 1UACY 5B59A 4NWHA 2DQIY 2A7FA 4BS7A 1CKCA 2BQIA 4ETBA 5APDA 5KXMA 4TSCA 5LAFA 2DQDY 3GXKA 5LIOA 3N9CA 4WO9A 1GB0A 4NHIA 1IOQA 2BQNA 2ZYPA 3N9AA 2DQGY 1GFJA 4UWNA 4WL7A 4XJGA 4MCKA 4XN6A 1CNSA 3MGWA 4RDSA 4DWXA 4OWEA 1F6SA 2YVBA 1LJJA 1BB6A 1CKDA 2GV0A 4NWEA 2HU3A 5KJ9A 3LYMA 4B4EA 5IELA 4LT0A 5DM9A 5KXWA 1NWGA 2MEEA 4TTDA 1GF4A 1ZVYB 1WQPA 3QNGA 3P68A 4GCDA 1LOZA 4PJ2C 4XENA 3IJUA 4YOPA 5DN4A 1LJ4A 4H8YA 3A91A 1LZAA 2DQJY 5IDDA 4H9FA 1GEZA 1GFHA 1HSXA 2HEDA 1LZSA 5HQ1A 4M6DA 2BQMA 1JWRA 2LZTA 154LA 4I8SA 1GF3A 1JTOL 1LZ6A 4DD2A 5F81A 4HPIA 1C7PA 1EQEA 4HTNA 1OUJA 2XBSA 2HTXA 5LVIA 4OWAA 2D4KA 4DD3A 5J7CA 1ZVHL 2EKSC 4ZIXA 3A67Y 5C6LA 4GLVA 1AZFA 4J0LA 4G4HA 1IC7Y 1LHHA 4WLDA 1LKSA 3RZ4A 1JJ3A 5B05A 1LMTA 1CJ6A 3TXHA 1GBXA 2Z12A 1C43A 1IIZA 1RI8B 3HFMY 3W3EA 1BWIA 3GXRA 4NGJA 1NBZC 1UIGA 2BPUA 4B49A 6LYZA 134LA 1IP5A 1UIBA 1LZGA 4N1EI 1WQNA 1XFPL 4WLYA 2HEBA 5F9UA 1C46A 1YIKA 2Z37A 1WQMA 1D6QA 1KXXA 1CJ9A 4H93A 4NG8A 4B4JA 3BKVA 2MEAA 208LA 5LXWA 1LSCA 1GXV2 1JTTL 4GN3A 6LYTA 1REXA 3IJVA 8LYZA 2F30A 1JISA 5E9RA 2I26L 4HJYA 4ET9A 1BQLY 2HU1A 3A3QA 4LT2A 1LJ3A 1HEOA 4H92A 4ET8A 1GFVA 1IWXA 1XEJA 1YAQA 1JIYA 1JKCA 1HSWA 1LJHA 1LSBA 3P64A 4GN4A 4H9BA 1QUTA 1F10A 2BLXA 2LYMA 1LZEA 1LJNA 1UCOA 5JENB 3AW7A 2H9KA 1WTMA 1I56A 1UICA 2ZNWY 4LYCA 3W6FA 3WH1A 2BQCA 5HLLA 3WUMA 3EXDA 132LA 1B7SA 1VEDA 3RU5A 5FHWA 4EMNA 1VDPA 1LZCA 2CWIA 4PPOA 2YBMA 1HEQA 2LHMA 1GBOA 1GBZA 4IATA 2BQAA 1B9OA 1YANA 1GHLA 1IP3A 1INUA 1LSGA 5B1FA 1IWYA 1WQQA 4ZEEA 1GXXA 1IORA 1GDXA 1KIRC 1WQRA 1XGUC 4RLMA 1YL1X 4A7DA 1IP1A 2DKVA 1YL0X 3ZEKA 1V7SA 2W1MA 2YBJA 1KXYA 1H6MA 3LYZA 5KXZA 1OUIA 4NGZA 1LZ8A 5DLAA 4J1BA 1DPWA 4CFOA 1LSZA 1OUHA 3TXJA 1PZYA 1GE3A 1RJCB 1HERA 4H9CA 1BB4A 5M1YA 5L3IA 1OUDA 4GLAA 4NGWA 3T36A 1E8LA 3RT5X 3A93A 4G4CA 1XGTC 4NGIA 3M3UA 4RW1A 1IO5A 4LYOA 4LT1A 4WLTA 4YENA 4B0DA 1G7JC 3F6ZA 2W1YA 2MEHA 3WW6A 3FE0A 1IY4A 3AZ5A 4N9RA 3LHMA 4H90A 2YBIA 3B0OA 4MR1A 3ZVQA 4QY9A 1LHMA 1LZTA 2EPEA 1J1XY 2F2NA 1XEIA 4Z98A 4H8ZA 4TSBA 1FLWA 4HPEA 2F4AA 1FKQA 3TMXA 1B7NA 1GE1A 2XJWA 2CDSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G1VA 5B1GA 1L15A 1L58A 4WG1A 3AGGG 1PQIA 3W6AA 3TXFA 3WPKA 3D3DA 1G0KA 4ARPA 1P2CC 1HFXA 1OUFA 3TXKA 2RH1A 1KIPC 252LA 1BWJA 3A34A 3K3TA 2RB2X 5I4YA 1CTWA 1GAYA 3WYHA 5FCPA 1BB7A 104LA 1C6FA 1LYJA 5AMYA 3CSQA 2B6XA 1QQYA 1NBYC 1QSQA 1C6DA 3HTGA 255LA 1EQ5A 5F9XA 1B6IA 173LA 1LJFA 183LA 1GAZA 4NSGA 4XJHA 4NGKA 1LZRA 1AT5A 5KXPA 199LA 1IP4A 4NGLA 1L22A 5LYTA 1FKVA 1KY1A 1LCNA 1LHKA 2HUKA 1C6QA 4W55A 1B5ZA 1P64A 1CKGA 2F32A 4NIJA 1L08A 1C60A 1JSEA 3QAKA 3SB7A 207LA 1YAMA 1UIFA 1GE4A 4N0JA 1NKHA 4PGJB 1LYDA 3CDOA 1P46A 3DN4A 1QIOA 1ALCA 2HEAA 1LMAA 4X3BA 1D0KA 1HEPA 2BLYA 2BQDA 4LYTA 3WW5A 4HJZA 3L2XA 3WL2A 1UC0A 1SX2A 145LA 3AB6A 1HMKA 4XADA 4II8A 4LDOA 108LA 3HBDA 2PC2A 1HEMA 4H8XA 1L35A 185LA 3IWRA 1L61A 3AZ4A 3CDQA 1QTBA 1GEVA 4AXTA 2D4IA 160LA 4W52A 4WG7A 3OE0A 2OEAX 5E4PA 4XJDA 120LA 2OU8A 3PBLA 4UWUA 5LYZA 1G7MC 1IC5Y 4E3UA 1GFGA 9LYZA 3LZ2A 3OE9A 1C08C 1W6ZA 1VDTA 1REMA 1L17A 4W59A 4B4IA 191LA 2N5ZA 4HV1A 3G3VA 5D5CA 3G3BB 172LA 2C8PA 4TUNA 1IY3A 1D9WA 5EBHA 1BGIA 239LA 1DI5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5B1G A;  1GB9 A;  1B7P A;  2G4Q A;  1UA6 Y;  4MST A;  1MLC E;  4J7V A;  4WG1 A;  3AGG G;  1LSY A;  1QSW A;  4H9H A;  1HNL A;  3W6A A;  1YQV Y;  2DQC Y;  3TXF A;  3WPK A;  3D3D A;  4RLN A;  3VWO A;  1OUC A;  5L3H A;  1P2C C;  3WXT A;  4PRU A;  3TXG A;  1HFX A;  1OUF A;  1EQ4 A;  1AT6 A;  1BB3 A;  3TXK A;  1KIP C;  3A34 A;  1BWJ A;  1LZ1 A;  1JHL A;  3K3T A;  5APF A;  5LVK A;  3RNX A;  2IFF Y;  1B7R A;  1YKY X;  4NG1 A;  3TXD A;  2Z39 A;  4NHS A;  1D6P A;  1LSD A;  5LA5 A;  5I4Y A;  1GAY A;  3WYH A;  5FCP A;  2Z2E A;  1BB7 A;  1GF5 A;  4L41 A;  1A4V A;  1GE0 A;  5IHG A;  1GB6 A;  5AMY A;  1GBS A;  3CSQ A;  4KPM A;  1QQY A;  5C6J A;  1IR8 A;  4H91 A;  1NBY C;  3EO5 A;  3LZT A;  4BAD A;  1JEF A;  1NQI A;  1QTK A;  4ETE A;  3LYO A;  4WM1 A;  3CSZ A;  4N8Z A;  2BQG A;  2F4G A;  4LFX A;  2B5Z A;  1EQ5 A;  4I0C A;  5F9X A;  2YBL A;  1XGR C;  2ZIL A;  1QUS A;  1VDS A;  1DI3 A;  2G4N A;  2XBR A;  1LJF A;  2YBN A;  2ZYC A;  1T3P A;  3AGI A;  4ZFP A;  1FLQ A;  2LYZ A;  1TEW A;  4PRQ A;  1IWV A;  1GAZ A; 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 1XEJ A;  1YAQ A;  1JIY A;  1JKC A;  1HSW A;  1LJH A;  1LSB A;  3P64 A;  4GN4 A;  4H9B A;  1QUT A;  1F10 A;  2BLX A;  2LYM A;  1LZE A;  1LJN A;  1UCO A;  5JEN B;  3AW7 A;  2H9K A;  1WTM A;  1I56 A;  1UIC A;  2ZNW Y;  4LYC A;  3W6F A;  3WH1 A;  2BQC A;  5HLL A;  3WUM A;  3EXD A;  132L A;  1B7S A;  1VED A;  3RU5 A;  5FHW A;  4EMN A;  1VDP A;  1LZC A;  2CWI A;  4PPO A;  2YBM A;  1HEQ A;  2LHM A;  1GBO A;  1GBZ A;  4IAT A;  2BQA A;  1B9O A;  1YAN A;  1GHL A;  1IP3 A;  1INU A;  1LSG A;  5B1F A;  1IWY A;  1WQQ A;  4ZEE A;  1GXX A;  1IOR A;  1GDX A;  1KIR C;  1WQR A;  1XGU C;  4RLM A;  1YL1 X;  4A7D A;  1IP1 A;  2DKV A;  1YL0 X;  3ZEK A;  1V7S A;  2W1M A;  2YBJ A;  1KXY A;  1H6M A;  3LYZ A;  5KXZ A;  1OUI A;  4NGZ A;  1LZ8 A;  5DLA A;  4J1B A;  1DPW A;  4CFO A;  1LSZ A;  1OUH A;  3TXJ A;  1PZY A;  1GE3 A;  1RJC B;  1HER A;  4H9C A;  1BB4 A;  5M1Y A;  5L3I A;  1OUD A;  4GLA A;  4NGW A;  3T36 A;  1E8L A;  3RT5 X;  3A93 A;  4G4C A;  1XGT C;  4NGI A;  3M3U A;  4RW1 A;  1IO5 A;  4LYO A;  4LT1 A;  4WLT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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