4I7NA

T4 lysozyme l99a/m102h with 1-phenyl-2-propyn-1-ol bound
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
PTTENLYFQGSMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINHVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title The impact of introducing a histidine into an apolar cavity site on docking and ligand recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 65
structure length 175
sequence length 175
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4i7nA00
1SX2A 1L23A 1QTVA 2RAYX 3HDEA 137LA 1CV6A 1ZWNA 4EKRA 1C69A 4I7QA 3HU8A 4OO9A 1L49A 1OYUA 1SSWA 3NY9A 3SBAA 123LA 4YXAC 3SN6R 211LA 1QTBA 1PQIA 234LA 2RBQA 1LLHA 1P7SA 1TLAA 1L53A 120LA 220LA 1P2RA 1CU2A 111LA 2RH1A 2RBOA 1CU6A 254LA 201LA 3HTDA 4W56A 1L27A 1C6CA 1LYDA 109LA 2RBPA 1L88A 3DKEX 4I7NA 1L81A 1G0KA 160LA 4EPFA 1P6YA 206LA 1LYFA 1L50A 1C62A 3SB8A 2B73A 231LA 2NTHA 1QT8A 1SX7A 1L69A 3HH5A 1EPYA 1LYHA 225LA 235LA 1L44A 2O4WA 3L64A 1QUGA 1C6QA 4W58A 1LI3A 236LA 1DYEA 1OVKA 1L71A 1P56A 2B70A 151LA 2HUMA 1CX7A 2OEAX 1OV5A 1L45A 4ARJA 1L05A 3SB6A 1L48A 1C60A 1L08A 104LA 1C64A 147LA 1C6IA 3GUJA 3GUOA 4YX7C 1T8AA 2OU0X 4EKQA 1L41A 1L35A 1L64A 1L51A 4W55A 1ZYTA 141LA 3DNAA 4EKPA 1L73A 4I7LA 3CDRA 3HH4A 1L55A 3C83A 1L04A 199LA 253LA 3DMXA 126LA 1L72A 2IGCA 1L14A 1CUPA 1SSYA 1L70A 3RUNA 1L89A 3HUAA 1L92A 1QT5A 244LA 1QUDA 4LDEA 3OE0A 1DYDA 1PQKA 131LA 4I7MA 188LA 1L0KA 3RZEA 1QSQA 1QTDA 4YXCA 1LYJA 1C63A 1LYIA 2OTYX 4DAJA 197LA 1L24A 1L56A 224LA 2ANXA 1D3JA 1L18A 247LA 3HT8A 125LA 129LA 1P37A 119LA 181LA 216LA 260LA 1P5CA 2O79A 1C6FA 1LI6A 1JQUA 1DYBA 228LA 3DN3A 3FADA 168LA 169LA 1L61A 3DN2A 4W51A 4I7TA 2L78A 1JTMA 212LA 3HDFA 3SB9A 3JR6A 1KNIA 1KY0A 1PQJA 2O7AA 5LZMA 130LA 1L66A 3HH3A 213LA 1KY1A 1LGXA 223LA 3HTBA 162LA 3HH6A 3NY8A 2RB2X 2B6XA 1L13A 1L16A 164LA 1QS9A 170LA 166LA 2F32A 238LA 1L60A 243LA 1DYCA 128LA 1L94A 4W53A 1LGWA 3C7ZA 2RBRA 1L20A 1CV5A 250LA 3SB5A 112LA 2OU9A 1L96A 1L26A 1C6TA 1L34A 2B6ZA 1QUOA 3SBBC 4EPIA 2B6YA 2OE4X 3C81A 1L00A 1CX6A 159LA 1QTHA 3SB7A 1L12A 4GRVA 2LZMA 3HTGA 167LA 178LA 1L99A 1C6GA 140LA 1I6SA 2LCBA 1C6EA 3HT7A 3V2WA 1XEPA 4W54A 1D3FA 174LA 248LA 2OE7X 1L43A 1C6NA 1L63A 102LA 1L52A 127LA 1L77A 4I7PA 3VW7A 196LA 195LA 1C6JA 1CVKA 4EXMA 1L90A 2RAZX 144LA 1LWKA 1CV1A 1L02A 190LA 4ZPUA 1L76A 240LA 2RBNA 1LWGA 177LA 1QTCA 3DMVA 4GBRB 1XJTA 1CU0A 1QTZA 3HT6A 155LA 192LA 3GUKA 2OTZX 1LI2A 1L67A 122LA 3F9LA 221LA 3GUNA 1PQDA 3DN0A 171LA 256LA 4K5YA 1CU3A 2A4TA 4W52A 1C6LA 1L0JA 3C82A 1G0MA 1G06A 257LA 230LA 1L93A 3C80A 1L62A 1L28A 1C61A 1CUQA 176LA 219LA 1L65A 1DYAA 1L87A 3C7YA 1L33A 214LA 4I7OA 1P46A 4W57A 3HUKA 258LA 1L98A 1L91A 1XJUA 184LA 1SWZA 3DN4A 1L17A 3OE8A 1G0GA 4ARMB 3L2XA 1P3NA 246LA 1L22A 1L15A 1OV7A 3DN1A 157LA 1CV3A 4LDOA 4ARLA 182LA 1L06A 139LA 4LDLA 4ARQB 1KS3A 1C6DA 1WTHA 200LA 1LGUA 2B75A 1L59A 3GUIA 4E97A 1L32A 205LA 3GUPA 1QT7A 3OE6A 1C6KA 189LA 2CUUA 173LA 1PQMA 3FA0A 4EJ4A 1L42A 148LE 5I14A 3ODUA 261LA 183LA 1L58A 3GUMA 1C6PA 1SWYA 1L07A 4S0WA 3G3VA 259LA 1L38A 180LA 1C6BA 2HULA 1L03A 4I7KA 1LYEA 3CDOA 3HUQA 146LA 3LZMA 215LA 3DN6A 1G0LA 3EMLA 1QT3A 1L11A 4EKSA 1L79A 1D2YA 1L31A 1LW9A 3C8QA 150LA 1G1WA 1L82A 209LA 1L80A 3PDSA 172LA 156LA 1D3MA 3V2YA 1OWZA 3HU9A 2ANVA 3CDQA 233LA 1L36A 1OVJA 163LA 1NHBA 4I7RA 3C7WA 1L10A 3C8RA 6LZMA 1QT6A 1ZURA 115LA 3FI5A 2RBSA 1DYGA 2B6WA 3C8SA 1OWYA 1P64A 2B72A 2F47A 1CV0A 187LA 1L47A 1L40A 218LA 138LA 1L09A 2OE9X 3G3WA 1L75A 1PQOA 1G0QA 198LA 1C66A 165LA 1D2WA 1C6MA 1L19A 239LA 1L83A 3DN8A 2NTGA 1L85A 4I7JA 226LA 1L29A 1LPYA 2HUKA 3NYAA 1L39A 1QT4A 1L95A 2F2QA 3CDTA 1G07A 3GULA 114LA 1G0JA 4W59A 1L46A 142LA 110LA 1C67A 1QUHA 2QB0B 217LA 3D4SA 4ARPA 1CTWA 1P2LA 1T97A 1L74A 1T8FA 1C6AA 1CU5A 1C68A 2Z6BA 1LYGA 113LA 3UONA 1L21A 7LZMA 1L54A 191LA 107LA 149LA 1KW5A 1B6IA 2B6TA 186LA 1QSBA 229LA 4PK0A 1T6HA 1L97A 1L84A 3PBLA 3HTFA 1D3NA 1L57A 3F8VA 4IAPA 3HWLA 1DYFA 4DJHA 145LA 1L86A 3HT9A 2LC9A 1L01A 185LA 1JTNA 1D9WA 237LA 3CDVA 1C6HA 2RB0X 227LA 3K2RA 4LZMA 1T8GA 222LA 1L30A 245LA 2B74A 1G1VA 103LA 4DKLA 2RB1X 1L37A 161LA 1L68A 2QARC 4I7SA 118LA 1KW7A 262LA 1G0PA 1QS5A 1K28A 158LA 1C65A 1OVHA 1L25A 4AQNA 175LA 249LA 3G3XA 232LA 108LA 255LA 241LA 242LA 1P36A 3QAKA 2B7XA 252LA 4ARMA 2OU8A 4ARQA 152LA 251LA 210LA 2Q9EA 4PJZA 143LA 1CV4A 3DMZA 3OE9A 2Q9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L23A 132LA 2RAYX 133LA 137LA 3HDEA 1C69A 3LYOA 4KL7A 3HU8A 4OO9A 2BAAA 2D4KA 4DQ5A 2Z39A 3WU8A 4A7DA 1L53A 2FYCA 1KXYA 1W08A 1UA6Y 1P2RA 2RH1A 4I0CA 1LZAA 201LA 4NGYA 1B7LA 3TXEA 4W56A 3OJPA 4I7NA 1L88A 3DKEX 1L81A 4BS7A 1G0KA 1P6YA 3A92A 4II8A 3EXDA 5J7CA 2B73A 231LA 2NTHA 1SX7A 1GFRA 3HH5A 4M6DA 2O4WA 235LA 1P56A 2ZNWY 5KXTA 4IATA 3RW8A 4GLVA 4XJDA 4M4OA 1OV5A 1LTMA 1KIPC 1L48A 3WW5A 147LA 3GUOA 1UICA 4XENA 2OU0X 1L64A 1LSGA 4UWNA 1GF7A 1CNSA 1IO5A 4EKPA 1J1OY 5HLLA 2G4NA 3HH4A 1L55A 4NWHA 199LA 4BAPA 1CUPA 3WUNA 1MELL 1SSYA 4H9HA 4OWCA 4LDEA 3OE0A 1JIYA 1DYDA 1PQKA 4OOOA 4I7MA 1L0KA 1P2CC 4D9ZA 1QSQA 1QTDA 1C63A 2OTYX 4DAJA 4UWUA 1YAMA 1P5CA 1C6FA 2DQJY 1DYBA 228LA 3FADA 4W51A 3A3RX 3TMUA 1LHIA 2L78A 2XBSA 1IORA 3WVXA 1GAYA 212LA 4LZTA 3SB9A 1KY0A 3QE8A 4LT0A 1L66A 1JITA 4MCKA 5L9JA 2B6XA 2DBTA 7LYZA 2MECA 4YF2A 2LZTA 1L94A 4W53A 3J4GA 4LGKA 1LZNA 2ZIJA 5IELA 2ZQ4A 2OU9A 3IWRA 4WM4A 1LMNA 3CT5A 1IC5Y 4NGVA 3SBBC 159LA 4XJIA 4DC4A 2LZMA 167LA 1WQNA 4J0LA 1LZCA 1C6GA 5IHGA 1C6EA 4WM5A 4H9CA 4LT3A 1NF5A 1L43A 4HTNA 1C6NA 4NGOA 127LA 1L77A 196LA 1C6JA 5LA5A 3CT1A 4DQJA 5APDA 3N9CA 1GXXA 3W3EA 1LSZA 3TXGA 1QTCA 3SP3A 2H5ZA 192LA 2OTZX 4TSBA 3P64A 1GAZA 122LA 4NG8A 2H9KA 4H93A 3DN0A 4HTQA 256LA 1SLYA 3EO5A 1L93A 5D5FA 1L62A 3CQLA 1BGIA 1C61A 207LA 4NHIA 176LA 3HBEX 3C7YA 1IY3A 3HUKA 4MR1A 3T6UA 1JUGA 1XJUA 184LA 1SWZA 3DN4A 1L17A 3ZVQA 5HQ1A 3L2XA 4YOPA 1P3NA 2DQEY 4TUNA 4C3WA 1CV3A 3LZ2A 182LA 139LA 1KS3A 1WTHA 2HECA 1REXA 4E97A 1L32A 1VATA 2HEBA 3OE6A 1E8LA 4TSCA 1C6KA 4DD3A 1PQMA 3FA0A 4B1AA 1NKHA 3W6CA 261LA 3LZTA 183LA 1LMOA 3P68A 5JENB 2YVBA 2YSSC 1EL1A 1A4VA 3G3VA 259LA 4AGAA 2HULA 153LA 1JPOA 1D6QA 1JJ0A 2BLYA 3CDOA 3LYZA 146LA 3LZMA 4OWAA 2RSCA 1I1ZA 1L79A 2BQFA 1OUCA 1DQJC 4NHSA 1G1WA 1WTMA 3B6LA 4C5FA 1NHBA 3C7WA 3C8RA 4YEOA 1QT6A 2A7FA 1B5XA 2I26L 3C8SA 1P64A 2B72A 2Z12A 1IVMA 2LYOA 1L09A 1RI8B 4WO6A 2ZWBA 3QY4A 1B5YA 1G0QA 1PQOA 198LA 1D2WA 1C43A 5B59A 3DN8A 2NTGA 1L85A 4I7JA 1JWRA 1UIBA 1LKSA 1F6RA 5LYMA 1LYSA 3NYAA 1UIDA 4HP0A 3CDTA 1G07A 3GULA 5KXXA 1BHZA 1QUHA 217LA 2EPEA 1P2LA 1L74A 4LYTA 2HTXA 1C7PA 3A94A 7LZMA 1L54A 107LA 1TAYA 3BKVA 186LA 1IP2A 1L97A 1L84A 4GCBA 3HTFA 1L57A 3F8VA 1LSYA 2MEFA 5ILCA 1GFGA 1CKFA 1IR7A 2MEBA 4CGEA 2N5ZA 4NGJA 185LA 5KXOA 1WVUA 3CDVA 1GEVA 222LA 3WU9A 1G1VA 5I5QA 2RB1X 3B0KA 118LA 5LYZA 262LA 158LA 3P66A 1NBZC 1LSCA 1NMMA 3E3DA 1C10A 2IFFY 2LHMA 1P36A 1HMLA 4KXIA 4NHTA 1IWWA 4ET8A 1LJHA 4NGKA 5DL9A 4LFXA 5KXZA 1LZ4A 1GFUA 4ARQA 143LA 1LZSA 3OE9A 1GE1A 4L41A 1GBOA 4DD9A 1QDRA 1GFEA 1GFAA 1CV6A 1IOQA 5LXWA 1ZWNA 2DQCY 4I7QA 4N8ZA 1KIQC 1LJFA 1SSWA 1WVVA 1O23A 3SN6R 4YXAC 211LA 1FLQA 1UBZA 3WPJA 2RBQA 1LJNA 1TDYA 1P7SA 2CGIA 4LT2A 1T3PA 1IP1A 5KY1A 111LA 1REZA 2RBOA 1CU6A 1IOCA 254LA 3A93A 2HEDA 4GCDA 1FLYA 1L50A 4ZFPA 1LYHA 225LA 2MEIA 2D4JA 3L64A 1QUGA 1GD6A 1LI3A 3K3TA 1DYEA 4EOFA 1XGTC 1BWIA 1CX7A 1I56A 2OEAX 4DT3A 4ARJA 1L05A 3GXRA 3SB6A 1NQIA 1C60A 1JSFA 1AT6A 3GUJA 1OUBA 1QQYA 1N4FA 4EKQA 4CJ2A 1LSBA 1IY4A 141LA 4WM6A 4NSIA 4CFOA 3DMXA 2IGCA 1GE2A 4WG7A 4GCFA 1L70A 1QUDA 4NSHA 1GB3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L23 A;  132L A;  2RAY X;  133L A;  137L A;  3HDE A;  1C69 A;  3LYO A;  4KL7 A;  3HU8 A;  4OO9 A;  2BAA A;  2D4K A;  4DQ5 A;  2Z39 A;  3WU8 A;  4A7D A;  1L53 A;  2FYC A;  1KXY A;  1W08 A;  1UA6 Y;  1P2R A;  2RH1 A;  4I0C A;  1LZA A;  201L A;  4NGY A;  1B7L A;  3TXE A;  4W56 A;  3OJP A;  4I7N A;  1L88 A;  3DKE X;  1L81 A;  4BS7 A;  1G0K A;  1P6Y A;  3A92 A;  4II8 A;  3EXD A;  5J7C A;  2B73 A;  231L A;  2NTH A;  1SX7 A;  1GFR A;  3HH5 A;  4M6D A;  2O4W A;  235L A;  1P56 A;  2ZNW Y;  5KXT A;  4IAT A;  3RW8 A;  4GLV A;  4XJD A;  4M4O A;  1OV5 A;  1LTM A;  1KIP C;  1L48 A;  3WW5 A;  147L A;  3GUO A;  1UIC A;  4XEN A;  2OU0 X;  1L64 A;  1LSG A;  4UWN A;  1GF7 A;  1CNS A;  1IO5 A;  4EKP A;  1J1O Y;  5HLL A;  2G4N A;  3HH4 A;  1L55 A;  4NWH A;  199L A;  4BAP A;  1CUP A;  3WUN A;  1MEL L;  1SSY A;  4H9H A;  4OWC A;  4LDE A;  3OE0 A;  1JIY A;  1DYD A;  1PQK A;  4OOO A;  4I7M A;  1L0K A;  1P2C C;  4D9Z A;  1QSQ A;  1QTD A;  1C63 A;  2OTY X;  4DAJ A;  4UWU A;  1YAM A;  1P5C A;  1C6F A;  2DQJ Y;  1DYB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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