4L41A

Human lactose synthase: a 2:1 complex between human alpha-lactalbumin and human beta1,4-galactosyltransferase
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
AKQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Human Lactose Synthase forms a Novel 1:2 Complex between beta1,4Galactosyltransferase 1 and alpha-Lactalbumin Proteins
rcsb
molecule tags Calcium binding protein/transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Alpha-lactalbumin
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4l41A00
3WXUA 4Z46A 1IWVA 1GEVA 5I4XA 1JTTL 1QSAA 1IC7Y 4P2EA 1H87A 1NHEA 3A93A 4PRUA 4WL6A 4IASA 2G4QA 3OJPA 2F2NA 2WARA 3WULA 1WTNA 4II8A 4C5FA 4NHTA 1CKGA 1LSAA 3TXBA 1GB5A 4HSFA 4LYCA 4N1CC 2Z37A 5LVGA 4AXTA 4ET8A 5LIOA 4NIJA 1GXXA 1C08C 2BQJA 2LZ2A 4DD9A 3ATNA 1WQNA 3TXFA 2D4KA 3TXIA 5HMVA 6LYZA 133LA 2LYMA 4ML7A 4UWUA 5ILCA 1NBYC 1IEEA 1JEFA 3WL2A 3WPJA 2Q0MX 1HEPA 3AW7A 5A3ZA 4TSCA 1WVUA 1BVKC 3WUAA 1INUA 1I1ZA 2D4JA 1LMOA 1D6PA 1B5ZA 1GF6A 1LHLA 1PS5A 2C8OA 1FLWA 3EMSA 5LAGA 1REZA 3P68A 4NSHA 1WQOA 1WVVA 1ZV5L 2XJWA 2MEEA 1YILA 1BGIA 1GE0A 1O23A 1IX0A 2EQLA 2LYZA 3M18B 4NGIA 4WO9A 4DD3A 4ETEA 5JENB 5KXXA 1OQMA 5I53A 2MEGA 1GB7A 5I54A 4XADA 3G3AB 5F16A 1J1XY 3TXGA 4GN4A 4E3UA 1HSXA 4NSJA 3EXDA 4WLYA 1CJ7A 4MR1A 132LA 4LYMA 5II3A 5LINA 1LHKA 1JKAA 2Z12A 2W1MA 4DDAA 1YROA 4YOPA 1LSPA 1MLCE 2CWIA 1LZTA 1OUIA 1IC5Y 5FDJA 1IORA 1BWHA 3IWRA 153LA 1TBYA 2MEDA 4G4BA 4OOTA 1HFZA 1XSFA 1AT6A 3ATOA 3N9CA 2XBSA 3M3UA 4HJZA 4H9CA 1QTKA 4Z98A 5M1YA 1GF7A 4OWCA 4UWVA 1ZMYL 5KXLA 1OUFA 1VAUA 1WQQA 2BQDA 2ZYPA 4LFPA 1NKHA 1OUBA 5C6JA 4B0DA 1LZ4A 1IWTA 2HEEA 1JTOL 2RSCA 2ZIKA 5KXNA 5L3IA 3TXEA 5C6LA 1GDXA 4H9HA 1RI8B 3B6LA 3HFMY 1IP6A 2H9KA 4X3BA 3FI7A 1IR9A 4J7VA 5T3FA 4CHXA 3AGGG 1GF5A 3G3BB 1FKQA 3LYTA 4RLNA 4BAFA 3W6FA 3WXTA 2ZNWY 2BQAA 1JJ3A 3D3DA 4NGKA 1IR8A 1B7RA 1LMPA 5B1GA 2PC2A 1FKVA 5K7OA 1DZBX 4GN5C 4I8SA 2EKSC 1D9UA 1LHHA 2DQEY 2FBBA 3ZEKA 3EBAB 3K3TA 1JIYA 1QUSA 5HNCA 1GFEA 4OOOA 1JITA 1XGRC 1IP2A 4UWNA 1LZ6A 1I20A 1AM7A 1SLYA 1IR7A 3A6BY 2HEFA 2I6ZA 1HHLA 1LPIA 4NWEA 1GE4A 1LZDA 3B0KA 4B4IA 5KXTA 3IJVA 1GPQC 1REYA 4N0JA 1GHLA 3A67Y 5LAFA 4G49A 2DKVA 5HMJA 1BB5A 2YDGA 1CKCA 1GB8A 1HNLA 1JJ1A 2CGIA 3LHMA 1IO5A 1REMA 3N9AA 5KY1A 3CT1A 3AZ7A 4ETBA 3P65A 4PHIA 3TMXA 1P2CC 4QGZA 5KXYA 5C6IA 154LA 1LJGA 2XTHA 4LYBA 4LGKA 4N5RA 5KXOA 5LA5A 1LHMA 2AUBA 3B72A 3P66A 1QDRA 3GXRA 4CJ2A 1EQ4A 1HELA 3N9EA 1CKHA 1LSFA 1C10A 2Z39A 5KXMA 1F6RA 1E8LA 4NHIA 1VDSA 1UIAA 4Z41A 1GFJA 2D4IA 2D6BA 4TX7A 5B05A 4DYGA 193LA 1HENA 1UIEA 1BB6A 1KIQC 1HEWA 1YKXX 4B4JA 2BQEA 1LJNA 1QIOA 4TUNA 5B07A 4D9ZA 3WVXA 5I4YA 5KKJA 1WQMA 4H9IA 2GV0A 1LJ4A 3WW5A 5LXWA 4XJDA 1B2KA 4NGZA 1LJJA 3TXKA 2YBNA 1GBXA 4R6CA 1VDQA 5DN4A 4NSIA 1T6VL 2A7FA 4H8XA 1KIPC 2ZIJA 5DM9A 5I4WA 1DI5A 3A92A 1F10A 1LJKA 2Z2EA 1VFBC 4RLMA 5DN5A 1JSFA 2DQFC 1BWIA 1CKDA 3RZ4A 7LYZA 1IOTA 1ALCA 1CJ9A 4QEQA 1IP7A 1B5VA 1WQRA 4H90A 1H6MA 3ULRA 1IVMA 1JJ0A 1XGTC 3AGHA 1CNSA 4WMGA 1F6SA 2G4PA 1LJEA 5ILFA 1LZYA 1UIDA 2BQKA 1QTEA 4GCFA 2DQAA 3D9AC 1GD6A 1HMKA 2MEBA 2BQOA 1LZSA 1GBYA 1JKBA 1YQVY 4A7DA 1D0KA 1JHLA 4XJBA 5APEA 1YKZX 5FEKA 4LYZA 4O34A 4BS7A 4NG1A 3LYZA 2F30A 2XBRA 5L9JA 1B7SA 4BAPA 1OUDA 5E9RA 1XFPL 1BB7A 5HQ1A 1TDYA 3WMKA 1G7HC 4GCCA 4HJYA 3B0OA 4FDYA 4NFVA 1RJCB 5KXWA 4WLTA 1LYOA 4KT3A 5HLLA 3LZTA 2BQHA 5KXPA 5A3EA 1IWXA 1GB6A 1GB2A 2VB1A 4I0CA 4N1EI 3AYQA 5F9XA 3A91A 2W1LA 3SP3A 2HU1A 3WPLA 4G4HA 2Z19A 3ZVQB 3QY4A 4C3WA 2HEDA 4OWAA 4J1BA 1B5YA 1B7LA 2I25L 1IOCA 1GF4A 1HEOA 4RW2A 1B7NA 1J1PY 1LMTA 3W6EA 4DD7A 1C43A 2ZNXY 5E4PA 1LMNA 2BQFA 1GEZA 1LMAA 4L41A 4WLXA 4NGWA 3WPKA 4ZFPA 3BKVA 1DXJA 2BAAA 4U3XB 3B0IA 1ZVHL 4WL7A 1LAAA 1LYZA 1QUTA 1FDLY 3A8ZA 2BQIA 4H8YA 1LZRA 2MEHA 3RW8A 4ETDA 2Z2FA 1JSEA 1A2YC 4LT1A 4HJVA 1GFHA 4NGVA 1B5XA 4XYYA 1LSMA 1UIFA 3AGIA 3CSRA 1GFVA 1IOQA 1B0DA 1GWDA 1GBOA 2DQIY 4CFOA 5IELA 1Z55A 1KXXA 2DQHY 1UIHA 1EQ5A 1HEQA 1LZ8A 4DD0A 2Z18A 1OUGA 2I26L 5LYTA 1NBZC 1YAPA 4FJRA 4NSGA 1LSEA 4OWHA 4WM1A 3WU9A 4DD1A 6LYTA 1IY3A 3LYMA 1D0MA 3AJNA 1LJHA 4WM4A 4ANRA 4HPIA 3CSQA 2C8PA 1JKDA 3HBEX 2HEBA 1GAZA 3IJUA 1AKIA 3AZ4A 1BWJA 1LSYA 1GAYA 4ZIXA 2BLYA 3CB7A 1GXV2 5KXSA 1V7SA 5IHGA 1GFTA 1CJ8A 1NWGA 1OUAA 1RFPA 4ZEEA 1IWWA 4GLAA 4HV1A 3LYOA 4CGEA 1JUGA 1LMQA 2YBIA 1YANA 4XJFA 1HFXA 3ZVQA 2BQMA 4HTQA 4Z3MA 3CT5A 1GB9A 1LMCA 2LHMA 2LYOA 4PRQA 4TTDA 1N4FA 5KKIA 3A3RX 1JISA 4DT3A 1EL1A 1KXYA 2H5ZA 4KXIA 4LFXA 1LJ3A 3HBHA 1LKRA 1F0WA 1LSGA 1GB0A 1A4VA 4H93A 1BQLY 5B06A 2DBTA 4ET9A 3KAMA 2G4NA 1AT5A 1IP5A 2BQBA 4NHSA 5F81A 1GFRA 3GXKA 3CSZA 2ZYCA 4H9EA 3WU7A 1LZAA 1LSDA 2ZQ3A 1G7LC 1GBZA 3A34A 1FLUA 1YL0X 4NG8A 4H91A 1C45A 4NGJA 2F4AA 1MELL 5LA8A 1HERA 1LZGA 1DKJA 3LZ2A 3W6AA 1G7MC 3WVYA 2H9JA 1D6QA 1FN5A 1LYSA 1VDPA 2EPEA 2LZTA 2YBMA 4H9BA 4IATA 4HV2A 4N9RA 1LTMA 4PJ2C 4AGAA 3A96A 1LCNA 1XEKA 3TMWA 1W6ZA 1DPWA 2A7DA 1OUCA 1NQIA 3MGWA 4XN6A 1TCYA 5LVIA 4OWEA 1IC4Y 1CJ6A 2NWDX 3QE8A 4NGLA 1REXA 4HPEA 1LZ1A 1UACY 1IWYA 1GBWA 2ZILA 4WG1A 5FSTA 1FBIX 3TXDA 4GN3A 5B59A 1B7QA 1CKFA 3A95A 4GCEA 1LJIA 1VDTA 4IJ4A 5FHWA 3AZ5A 5EBHA 1OP9B 1G7IC 4GCDA 3OK0A 4H9FA 3E3DA 1J1OY 3WUMA 1GE1A 1BB4A 4RW1A 2YVBA 3BKHA 1BHZA 4LYTA 2BQNA 1LZBA 1KXWA 1YAQA 3WUNA 208LA 2W1YA 1XGQC 3TXHA 2DQDY 1LSZA 2IHLA 4YEMA 1QDTA 1GF3A 4H1PA 5LVHA 1YL1X 1XEIA 207LA 2BQGA 4WM5A 5APFA 4LZTA 2FBDA 5DLAA 4R0FA 3VWOA 2BPUA 1LZEA 2CJLA 4WM6A 1OUHA 4PPOA 3FE0A 4HP0A 2D91A 2YSSC 4NHQA 5J7CA 1DI4A 4NGOA 1RE2A 1ZVYB 5KXZA 1DI3A 3W6CA 1IY4A 5KXKA 2HUBA 1LYYA 1D0LA 1GFAA 1LOZA 2DQJY 134LA 1LHIA 4W96A 4M6DA 1B7PA 3AW6A 1LZNA 1JPOA 1LHJA 1OUJA 1UICA 2CDSA 1YAOA 4NWHA 3RNXA 3T6UA 5APCA 1PZYA 4B49A 1I56A 4CFPA 1QSWA 3RT5X 4B1AA 4GLVA 2YBJA 1UUZC 5DL9A 1FLQA 4MCKA 1NDGC 2HU3A 4QDNA 4HTKA 4MSTA 194LA 1JWRA 1LSBA 1W08A 1B5UA 1LSCA 2N5ZA 4LT3A 4WM3A 4LYOA 4ETAA 4ETCA 1WTMA 2X0AA 1UC0A 1LJFA 2Z38A 4WM2A 1IIZA 1LSNA 1IWUA 3AB6A 4HTNA 1HSWA 1UIBA 2ZWBA 4H9AA 5AMYA 1T3PA 1XEJA 4W94A 4PGJB 3WU8A 4NY5A 5F9UA 4BADA 1NMMA 5FELA 1IP3A 3WYHA 4WO6A 4RDSA 4XJIA 4DD2A 3T36A 1G7JC 2DQGY 2IFFY 4TWSA 2B5ZA 4G4CA 5I5QA 1JTPL 1LZCA 1V7TA 5L3HA 4LT0A 3CQLA 4M4OA 4OW1A 5LVJA 1HEMA 1B9OA 2F4GA 2Y8PA 4N8ZA 1UCOA 3P4ZA 135LA 4KL7A 1GDWA 4XJHA 1B7MA 1FLYA 1VATA 3HBDA 5B1FA 4B4EA 4DC4A 2MEIA 1TEWA 5HNLA 1HC0A 2MEFA 4OWBA 3A90A 2BLXA 4WG7A 2BQLA 4YF2A 3J6KA 1GE3A 1SQ2L 2YBHA 3W6DA 3F6ZA 1HMLA 3WW6A 1XGPC 1YAMA 4H8ZA 4XJGA 2FYDA 2HEAA 3AZ6A 1NDMC 1KIRC 8LYZA 1C7PA 2HECA 1NF5A 1YKYX 1XGUC 1LZ9A 1IOSA 1BB3A 5APDA 1LKSA 2W1XA 4G9SA 4DDCA 1GF0A 5LYZA 2MEAA 3W3EA 3LN2A 1B7OA 4WOAA 5KJ9A 3TMUA 5LVKA 5FCPA 1DKKA 1OUEA 3TMVA 1GFGA 2FYCA 1GE2A 2ZQ4A 1GFUA 1B5WA 1DPXA 4J1AA 1UIGA 1QQYA 5D5CA 4YEOA 5KXRA 1DQJC 3EO5A 3A3QA 3A94A 1GF8A 9LYZA 1BVXA 2EIZC 3CT0A 3WH1A 5LYMA 3RU5A 1JKCA 5IDDA 1WQPA 1HF4A 1YIKA 2MECA 4GCBA 4TSBA 4YM8A 1RCMA 4XENA 1GB3A 5D5FA 3W6BA 4EOFA 1UA6Y 2HTXA 3P64A 4WLDA 4QY9A 1TAYA 5F14A 1GF9A 3A6CY 1IP1A 1IWZA 4H94A 4LT2A 4J0LA 4NHPA 4YENA 1GFKA 4DWXA 1C46A 3J4GA 1AZFA 4EMNA 1UBZA 1VEDA 2BQCA 1HFYA 2DQCY 3TXJA 4DDBA 2YBLA 1GBSA 4KPMA 4NGYA 1IP4A 4NEBA 1LZ5A 4H92A 3QNGA 1EQEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXUA 4Z46A 2B7XA 1JTTL 1H87A 1OWZA 3F8VA 2WARA 4NHTA 3TXBA 1L76A 4N1CC 4HSFA 4LYCA 4ARMA 1GXXA 1L38A 1C08C 4DD9A 3ATNA 1QT7A 1OVJA 5HMVA 2LYMA 4ML7A 224LA 4UWUA 5ILCA 1D3FA 1NBYC 1L51A 4I7OA 1IEEA 2Q0MX 1LGXA 3WUAA 1BVKC 1QUGA 1L96A 1GF6A 242LA 1FLWA 1L57A 2LCBA 1D3MA 1REZA 1WVVA 103LA 171LA 2MEEA 4NGIA 1IX0A 5JENB 5F16A 178LA 4GN4A 4E3UA 205LA 1PQJA 1L08A 4YOPA 2CWIA 1LZTA 1OUIA 5FDJA 2B6TA 1QUDA 1TBYA 4OOTA 1HFZA 1AT6A 3N9CA 1L87A 3EMLA 3DMZA 1WQQA 2ZYPA 1NKHA 1OUBA 1P37A 1LZ4A 2HEEA 2RSCA 190LA 4H9HA 1RI8B 2OTZX 1IR9A 1L60A 4J7VA 1C6CA 3AGGG 1NHBA 3WXTA 1DYCA 2B6WA 1B7RA 5K7OA 1DZBX 4I8SA 3ZEKA 1QUSA 3SB6A 3CDVA 1JITA 4OOOA 1XGRC 110LA 1HHLA 4NWEA 197LA 3IJVA 1GPQC 5LAFA 5HMJA 1OYUA 1JJ1A 3LHMA 3P65A 3TMXA 1SX7A 4LYBA 4W57A 3P66A 138LA 1CKHA 1LYDA 4NHIA 1GFJA 2D4IA 4DYGA 241LA 2RBPA 3WVXA 1WQMA 4H9IA 5LXWA 4XJDA 1C6DA 4H8XA 1L37A 196LA 2DQFC 1LYEA 1L91A 1CJ9A 3UONA 1H6MA 3ULRA 4GRVA 1F6SA 1JTMA 1UIDA 1QTEA 1I6SA 2BQOA 1LZSA 165LA 5APEA 1T8AA 4AQNA 2XBRA 1XFPL 2B72A 3GUPA 5HLLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WXU A;  4Z46 A;  1IWV A;  1GEV A;  5I4X A;  1JTT L;  1QSA A;  1IC7 Y;  4P2E A;  1H87 A;  1NHE A;  3A93 A;  4PRU A;  4WL6 A;  4IAS A;  2G4Q A;  3OJP A;  2F2N A;  2WAR A;  3WUL A;  1WTN A;  4II8 A;  4C5F A;  4NHT A;  1CKG A;  1LSA A;  3TXB A;  1GB5 A;  4HSF A;  4LYC A;  4N1C C;  2Z37 A;  5LVG A;  4AXT A;  4ET8 A;  5LIO A;  4NIJ A;  1GXX A;  1C08 C;  2BQJ A;  2LZ2 A;  4DD9 A;  3ATN A;  1WQN A;  3TXF A;  2D4K A;  3TXI A;  5HMV A;  6LYZ A;  133L A;  2LYM A;  4ML7 A;  4UWU A;  5ILC A;  1NBY C;  1IEE A;  1JEF A;  3WL2 A;  3WPJ A;  2Q0M X;  1HEP A;  3AW7 A;  5A3Z A;  4TSC A;  1WVU A;  1BVK C;  3WUA A;  1INU A;  1I1Z A;  2D4J A;  1LMO A;  1D6P A;  1B5Z A;  1GF6 A;  1LHL A;  1PS5 A;  2C8O A;  1FLW A;  3EMS A;  5LAG A;  1REZ A;  3P68 A;  4NSH A;  1WQO A;  1WVV A;  1ZV5 L;  2XJW A;  2MEE A;  1YIL A;  1BGI A;  1GE0 A;  1O23 A;  1IX0 A;  2EQL A;  2LYZ A;  3M18 B;  4NGI A;  4WO9 A;  4DD3 A;  4ETE A;  5JEN B;  5KXX A;  1OQM A;  5I53 A;  2MEG A;  1GB7 A;  5I54 A;  4XAD A;  3G3A B;  5F16 A;  1J1X Y;  3TXG A; 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 1UCO A;  3P4Z A;  135L A;  4KL7 A;  1GDW A;  4XJH A;  1B7M A;  1FLY A;  1VAT A;  3HBD A;  5B1F A;  4B4E A;  4DC4 A;  2MEI A;  1TEW A;  5HNL A;  1HC0 A;  2MEF A;  4OWB A;  3A90 A;  2BLX A;  4WG7 A;  2BQL A;  4YF2 A;  3J6K A;  1GE3 A;  1SQ2 L;  2YBH A;  3W6D A;  3F6Z A;  1HML A;  3WW6 A;  1XGP C;  1YAM A;  4H8Z A;  4XJG A;  2FYD A;  2HEA A;  3AZ6 A;  1NDM C;  1KIR C;  8LYZ A;  1C7P A;  2HEC A;  1NF5 A;  1YKY X;  1XGU C;  1LZ9 A;  1IOS A;  1BB3 A;  5APD A;  1LKS A;  2W1X A;  4G9S A;  4DDC A;  1GF0 A;  5LYZ A;  2MEA A;  3W3E A;  3LN2 A;  1B7O A;  4WOA A;  5KJ9 A;  3TMU A;  5LVK A;  5FCP A;  1DKK A;  1OUE A;  3TMV A;  1GFG A;  2FYC A;  1GE2 A;  2ZQ4 A;  1GFU A;  1B5W A;  1DPX A;  4J1A A;  1UIG A;  1QQY A;  5D5C A;  4YEO A;  5KXR A;  1DQJ C;  3EO5 A;  3A3Q A;  3A94 A;  1GF8 A;  9LYZ A;  1BVX A;  2EIZ C;  3CT0 A;  3WH1 A;  5LYM A;  3RU5 A;  1JKC A;  5IDD A;  1WQP A;  1HF4 A;  1YIK A;  2MEC A;  4GCB A;  4TSB A;  4YM8 A;  1RCM A;  4XEN A;  1GB3 A;  5D5F A;  3W6B A;  4EOF A;  1UA6 Y;  2HTX A;  3P64 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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