4MSTA

Crystal structure of a putative catalytic domain of a chitinase-like protein (hbclp1) from hevea brasiliensis
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIISRSTFEEMLKHRNDAACPAKGFYTYDAFISAAKAFPAFGTTGDVDTCKREIAAFFGQTSHATTGGWPTAPDGPYAWGYCYKEELNQASSYCSPSPAYPCAPGKKYYGRGPIQLSWNYNYGQCGQALGLDLLNNPDLVATDRVISFKAAIWFWMTPQFPKPSCHDVITGQWSPTGHDISAGRAPGYGVITNIINGGLECGRGWDARVEDRIGFYKRYCDMFAVGYGSNLDCYNQTPFGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative study of two GH19 chitinase-like proteins from Hevea brasiliensis, one exhibiting a novel carbohydrate-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Hevea brasiliensis
molecule keywords class I chitinase
total genus 91
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4mstA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 4mstA02
1ZMYL 2YVBA 1LJJA 194LA 2DQFC 3AYQA 4G4HA 4EMNA 1EQEA 1LPIA 5F14A 1J1XY 4HTQA 1NMMA 1D6QA 1XGTC 2BQFA 193LA 1JTOL 3WUNA 4HPIA 2ZNXY 3LHMA 5KY1A 1JKDA 5B1FA 1D0KA 1JPOA 3WUAA 5ILCA 5I4WA 1IC4Y 4HJZA 3W6CA 2ZIJA 4PRUA 1OUEA 1LMNA 1XGQC 3WPLA 1TAYA 5KXWA 1IWUA 1CJ6A 1DKJA 1UIDA 4IATA 4ETEA 1GPQC 3RT5X 4GLVA 1ZVYB 4TSCA 5B06A 4YEMA 1KXXA 2MEBA 2DBTA 4H91A 1WTNA 5F16A 1GE2A 5HNLA 1BWHA 1GF9A 1UA6Y 2CWIA 4LFXA 3B6LA 2Z39A 1B9OA 4QDNA 1GBOA 1GFRA 1LSFA 4KT3A 1QUSA 1CKGA 3EMSA 3AGIA 4NSIA 4MSTA 4OWCA 1I56A 1QUTA 1FLYA 5M1YA 4LT2A 5KXKA 4PGJB 3CB7A 3D3DA 3K3TA 5F9XA 3N9CA 5LA5A 2H5ZA 4XJFA 4C3WA 1VATA 2DQEY 5J7CA 2BQAA 3E3DA 4N5RA 5LA8A 4DD7A 1G7LC 3G3AB 3SP3A 1AKIA 4RLMA 1JKAA 207LA 1G7HC 1XFPL 1YROA 1OUGA 2W1MA 1IP3A 5AMYA 4B4JA 1IOSA 1LJ3A 3AW7A 4DYGA 1IWXA 1GB8A 4M4OA 5LAGA 1FLWA 2G4NA 3TXKA 1GAZA 1LYSA 1LZTA 1UIEA 3TXHA 4CHXA 4GCBA 5HMVA 4U3XB 2BQGA 2W1XA 2RSCA 1BB5A 1JSEA 1A4VA 1REZA 1NKHA 4KPMA 1IC5Y 4WOAA 1GWDA 5APFA 3TXDA 4RW2A 3AW6A 4WG7A 2DQHY 4NEBA 5HLLA 1E8LA 4RW1A 4QY9A 1ALCA 1OUHA 3W6FA 1LJIA 135LA 1JUGA 1F10A 4NGZA 4CGEA 1GFEA 1XEIA 2Z37A 3A6BY 3RU5A 1XEJA 4YEOA 4NWHA 3WL2A 1HEMA 4H8XA 2F4GA 4LYOA 4N8ZA 1LMOA 1GB9A 2IHLA 4ETAA 1B7NA 4WLDA 1KIPC 2BQCA 4NGYA 1H6MA 1LSAA 4DD1A 4RLNA 134LA 1JISA 4H9FA 1IOCA 3T36A 2YBMA 5FCPA 2MEGA 1GB0A 1B7OA 4TTDA 1T3PA 1LSDA 1HEOA 2DQDY 4J1AA 1UIFA 4TWSA 4W96A 3CT1A 4NG8A 4AGAA 1CKFA 153LA 1B5XA 3OK0A 3WPKA 5DL9A 2I6ZA 1LSZA 1ZV5L 1LHLA 2HEFA 1HEPA 3AZ5A 4GCCA 1B2KA 1LYYA 1VAUA 3AZ6A 1HEWA 1AT5A 1FDLY 1DKKA 3LYTA 1LZAA 4H93A 4HPEA 3A8ZA 4H9AA 1HNLA 1IO5A 2IFFY 3AGHA 2Z38A 2DQJY 3AZ7A 1IIZA 2HUBA 1HEQA 1WQMA 1YL1X 2W1LA 4G4BA 4QGZA 4W94A 1VDTA 4XADA 2EPEA 4GN5C 2B5ZA 4WM6A 1OUFA 4LZTA 1V7TA 2GV0A 4LYBA 3LYOA 1GF3A 4G4CA 5KXSA 2D4IA 1F0WA 1SLYA 4NHIA 4TSBA 2Z19A 4H1PA 1QIOA 4G9SA 6LYTA 1IY3A 1YAPA 2BQEA 5EBHA 1LMAA 4XYYA 5KXYA 1LSCA 1GBZA 4N9RA 1YKZX 2F2NA 1RCMA 2I26L 3GXRA 5I5QA 5KJ9A 4UWNA 4XJHA 5DN4A 1GE3A 1REMA 1MELL 1HFYA 2XBRA 1OUIA 3A90A 5LVGA 1GF6A 1GXV2 1UUZC 5FDJA 3WPJA 1QTEA 2Z12A 3EO5A 4H8YA 4ML7A 4WL7A 4P2EA 5F81A 2FBDA 3A34A 4H9IA 1JKBA 4B4EA 1UCOA 2CDSA 3HBHA 4DC4A 5L9JA 5LVJA 1IP1A 1B0DA 5KXZA 1UIHA 3M3UA 4N1EI 4NGIA 2HU3A 3CT5A 3IWRA 3MGWA 1IP2A 1GB5A 1XSFA 2EKSC 2LZTA 3FE0A 4LGKA 4NFVA 1HHLA 4XJDA 1UBZA 2XBSA 4MCKA 1REYA 3A95A 1NBZC 4G49A 4NGLA 1F6SA 4DDBA 2ZIKA 3TXGA 1I1ZA 1B5WA 4Z46A 4NSJA 1LKSA 4OOOA 5ILFA 2H9JA 3QE8A 2HECA 4H92A 5LYZA 4CJ2A 1DPWA 4BADA 3B0KA 1ZVHL 4Z98A 2A7DA 1OUDA 5K7OA 2F4AA 4NHSA 1DPXA 1FLQA 3LYMA 1AT6A 1JJ0A 4NGOA 4NSHA 4DDAA 1OUAA 1IVMA 2BQKA 1FN5A 2C8OA 3WMKA 4YOPA 5FSTA 1QTKA 2ZYPA 4R6CA 1IWVA 2BQDA 3P64A 3P68A 4WM3A 5A3EA 1B7LA 1GB7A 4OOTA 1V7SA 5LVHA 3WVXA 1LJNA 1GFAA 2VB1A 5F9UA 1IORA 1UC0A 1HF4A 1GF4A 3T6UA 3GXKA 4WM1A 4XJBA 3WUMA 5IHGA 1B5VA 1B5YA 1JKCA 1LHKA 1UICA 4WM5A 4X3BA 4EOFA 1G7IC 2D4JA 2D6BA 1D6PA 5APDA 1LSPA 5KXMA 4DD2A 4A7DA 1C08C 2CGIA 4AXTA 1LJEA 4XJIA 5C6IA 2MEHA 2AUBA 1LZEA 3WU8A 1LAAA 2LYOA 1LZ9A 3F6ZA 1IP6A 1GXXA 1LHHA 1IR7A 2BPUA 1QSWA 2DQCY 5B1GA 1GDXA 1IY4A 4WM4A 1IP7A 7LYZA 1A2YC 5LYTA 2EQLA 1C7PA 1VDPA 1DZBX 1LMPA 1TEWA 4NGVA 2BLXA 4WMGA 3TXEA 2HEBA 4DT3A 3TMVA 1F6RA 1BWIA 2MEEA 1RFPA 4FJRA 4PRQA 154LA 2BQLA 5A3ZA 4ZIXA 1FBIX 1GD6A 1OP9B 4GLAA 5E9RA 1LTMA 1IWYA 2A7FA 4HTNA 5I4YA 1BQLY 5KXTA 5APEA 1EQ5A 1OUCA 4H94A 1XGUC 2XTHA 1D0LA 1LZBA 1REXA 4NIJA 4WM2A 4BAPA 4QEQA 3W6DA 1WVVA 1LHMA 3W6BA 1FLUA 3N9AA 4NY5A 5LVKA 4ANRA 5LXWA 3TXIA 2BQNA 1GFKA 1LMQA 1LSMA 1RI8B 1WVUA 3P66A 4DD3A 4L41A 5D5CA 1WQNA 2BQOA 1GDWA 1GB2A 1QDTA 3WXUA 1JTPL 5APCA 4DD0A 4E3UA 5DN5A 1NDMC 1LZYA 3G3BB 1LZDA 4GCDA 4HSFA 3RNXA 3CSZA 2BAAA 4LYZA 2F30A 4UWUA 1PZYA 4YF2A 5T3FA 4BS7A 1TDYA 1LSGA 2W1YA 4ETBA 1YIKA 1CJ9A 4LFPA 1GE4A 1GEVA 2H9KA 2YBNA 3HFMY 4NHQA 3QNGA 3WW5A 1NF5A 2ZQ4A 4OWAA 2ZWBA 1UIGA 4D9ZA 2HEEA 5IDDA 1GFVA 3WW6A 3TMUA 1GF5A 3B0IA 2LYZA 1UIAA 4N1CC 4PJ2C 4DDCA 3QY4A 1GFHA 1P2CC 4LYCA 2MECA 6LYZA 4H9BA 2CJLA 4B4IA 2DKVA 1JSFA 1BGIA 2FYCA 1LZ8A 1B7SA 4H8ZA 1D9UA 1QSAA 1C43A 1LJFA 1DI4A 1BVKC 4N0JA 5LYMA 4OWEA 2HU1A 1YKYX 5C6JA 3A91A 4R0FA 4RDSA 3W3EA 3AZ4A 3TMXA 3ZEKA 2LYMA 1NHEA 4B1AA 2BQJA 1LZ5A 1GBXA 132LA 3LYZA 1UACY 2G4PA 2YDGA 3W6AA 1W08A 1IX0A 1H87A 4ETDA 1LHIA 4XN6A 4GCEA 5L3IA 5D5FA 3ATOA 1Z55A 1YAQA 2MEDA 1YQVY 1GB6A 3CT0A 2Z2FA 5FEKA 1HFXA 2DQAA 2Z2EA 3ATNA 2BQIA 3IJUA 4J0LA 1AM7A 5B05A 1FKQA 4WLYA 4I0CA 5DLAA 1WQOA 1B5ZA 1YAMA 1BWJA 1VFBC 1GHLA 2X0AA 1JTTL 1O23A 3WU7A 4MR1A 3M18B 5HNCA 3AB6A 1NDGC 5JENB 5KXXA 4H9HA 1EQ4A 4CFOA 1LYZA 1LSYA 3B0OA 4GN3A 4TX7A 3A94A 4C5FA 4ET8A 4KL7A 1LZNA 4NWEA 1B7PA 4GCFA 3LZ2A 5C6LA 4WO9A 1LSNA 3TMWA 2FYDA 1GBYA 1BHZA 4WO6A 3ULRA 4YM8A 1LSEA 4LT0A 4B49A 1GFTA 1JIYA 2EIZC 4ZEEA 2LHMA 5I53A 1I20A 2XJWA 4H9EA 2FBBA 1QQYA 4LYTA 3LN2A 4WLXA 4IASA 4YENA 4Z41A 4FDYA 1QDRA 3P4ZA 2WARA 1RJCB 1GEZA 2DQIY 1JJ1A 5KKIA 4WG1A 5KXNA 5I4XA 3FI7A 4HV2A 1LZ4A 2Y8PA 5FHWA 3OJPA 1LJKA 3EBAB 1J1PY 4Z3MA 5KKJA 3W6EA 2Q0MX 3D9AC 1LZSA 3HBDA 1IP5A 5LIOA 5I54A 1VEDA 3A96A 1XGPC 3B72A 1IR8A 1LHJA 4HTKA 133LA 1INUA 1YL0X 3WYHA 1HFZA 1B5UA 2BLYA 2YBLA 1GE0A 1JHLA 1LKRA 1GF7A 2C8PA 3HBEX 4WL6A 1GF0A 3WU9A 4GN4A 1OUBA 1JWRA 3RZ4A 1HERA 2N5ZA 2YBIA 3TXBA 1IWWA 1RE2A 1LZCA 1YILA 2BQBA 4NHTA 4H90A 3A92A 1GFUA 1AZFA 1GBSA 1WQPA 3ZVQA 1GAYA 2NWDX 4HP0A 5LAFA 3CSRA 1GF8A 1DXJA 1IR9A 3CQLA 4XENA 1FKVA 3BKVA 5FELA 1XEKA 4NHPA 1PS5A 4HJYA 3KAMA 4ET9A 1IEEA 2G4QA 2PC2A 1EL1A 3J6KA 1TBYA 3AGGG 2YBJA 1CJ7A 1HMKA 4HJVA 1BVXA 5E4PA 5LVIA 5KXRA 3TXFA 1DI3A 1WQQA 2D91A 1HSWA 3N9EA 1IP4A 1CNSA 4OWHA 1BB7A 4XJGA 1GFGA 2MEIA 4LT3A 3P65A 2MEAA 5KXOA 1W6ZA 4O34A 5L3HA 1DI5A 5LINA 4DD9A 1UIBA 2MEFA 2ZILA 4I8SA 1HSXA 1HELA 1YAOA 1JITA 4M6DA 1B7QA 2YSSC 1LJ4A 4NGJA 1B7RA 1MLCE 1OQMA 3LZTA 1J1OY 1LZ1A 1GE1A 2YBHA 3CSQA 4PPOA 1HMLA 3BKHA 1VDQA 1IWZA 1C45A 1DQJC 1KXWA 3RW8A 1VDSA 3WH1A 4UWVA 1LSBA 3A93A 1CKDA 4NG1A 1G7JC 1D0MA 3VWOA 1G7MC 4NGKA 1BB3A 208LA 2HEAA 5IELA 1OUJA 1YKXX 4CFPA 5KXPA 1KIQC 3ZVQB 3J4GA 4NGWA 1HENA 1GBWA 1LYOA 1N4FA 2BQHA 1CKCA 2DQGY 1XGRC 3A3QA 4BAFA 2I25L 4NSGA 1WQRA 4OWBA 1WTMA 1IC7Y 3A3RX 1C46A 4ZFPA 1GB3A 3WVYA 1IWTA 1NQIA 1KIRC 3TXJA 4LYMA 1BB6A 1NWGA 4LT1A 4IJ4A 4WLTA 4B0DA 1LMCA 1TCYA 3A67Y 3AJNA 4H9CA 1IOQA 1JEFA 1LZGA 3EXDA 4J1BA 1T6VL 5B07A 5HQ1A 3WULA 1C10A 2ZNWY 3A6CY 5DM9A 5II3A 3WXTA 1LJGA 4PHIA 2D4KA 4II8A 4KXIA 5KXLA 1LOZA 2Z18A 5B59A 4J7VA 1LJHA 1LMTA 1B7MA 1JJ3A 8LYZA 2HEDA 1LZ6A 9LYZA 1SQ2L 2HTXA 1IOTA 1BB4A 1CJ8A 1YANA 1LZRA 1LCNA 1GFJA 3IJVA 4TUNA 4ETCA 1HC0A 1KXYA 2ZYCA 1CKHA 2LZ2A 5HMJA 2BQMA 4OW1A 1NBYC 4DWXA 4HV1A 2ZQ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7TA 1L91A 4G4HA 1D6QA 5KY1A 1JKDA 223LA 1XGQC 1LMNA 5KXWA 182LA 5B06A 4DQJA 2DBTA 5F16A 1WTNA 238LA 150LA 1JTNA 2QB0B 1UA6Y 4ARQA 4QDNA 1GBOA 1LSFA 4KT3A 3EMSA 169LA 211LA 4EKSA 4XJFA 201LA 162LA 1L85A 5J7CA 5LA8A 1L95A 189LA 4RLMA 1JKAA 207LA 4I7PA 1YROA 4B4JA 1IOSA 3OE9A 1LZTA 1L90A 4GCBA 243LA 1REZA 4KPMA 1C60A 5APFA 3TXDA 1CUQA 4ARQB 1OUHA 1LJIA 135LA 1L22A 4CGEA 1GFEA 3L64A 1XEJA 144LA 113LA 4I7SA 4NWHA 1HEMA 1L73A 3C8RA 1T6HA 2HULA 2BQCA 3DN4A 4DD1A 134LA 4H9FA 2F32A 1CUPA 2YBMA 5FCPA 1B7OA 1L87A 1LSDA 1HEOA 1CV0A 3CT1A 4AGAA 153LA 3WPKA 5DL9A 1ZV5L 1L15A 1C6EA 1DKKA 2Z38A 2DQJY 4G4BA 2W1LA 1YL1X 4QGZA 4GN5C 2B5ZA 2GV0A 4G4CA 1F0WA 1SLYA 4TSBA 1L12A 2Z19A 4G9SA 3F8VA 1C6JA 1L57A 175LA 1GBZA 1LWGA 2I26L 1D2WA 5I5QA 4UWNA 1LYGA 1L53A 1HFYA 3A90A 1QTEA 4WL7A 4H8YA 4P2EA 1QT8A 2FBDA 2CDSA 4DC4A 1LYEA 1T8GA 3IWRA 2LZTA 4NFVA 1HHLA 2XBSA 1F6SA 1I1ZA 161LA 2H9JA 1DYEA 2HECA 4H92A 4CJ2A 1ZVHL 3HT9A 4GBRB 1PQJA 4NGOA 1FN5A 198LA 3WMKA 1QTKA 1GB7A 4OOTA 1V7SA 167LA 2VB1A 1LYFA 5F9UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ZMY L;  2YVB A;  1LJJ A;  194L A;  2DQF C;  3AYQ A;  4G4H A;  4EMN A;  1EQE A;  1LPI A;  5F14 A;  1J1X Y;  4HTQ A;  1NMM A;  1D6Q A;  1XGT C;  2BQF A;  193L A;  1JTO L;  3WUN A;  4HPI A;  2ZNX Y;  3LHM A;  5KY1 A;  1JKD A;  5B1F A;  1D0K A;  1JPO A;  3WUA A;  5ILC A;  5I4W A;  1IC4 Y;  4HJZ A;  3W6C A;  2ZIJ A;  4PRU A;  1OUE A;  1LMN A;  1XGQ C;  3WPL A;  1TAY A;  5KXW A;  1IWU A;  1CJ6 A;  1DKJ A;  1UID A;  4IAT A;  4ETE A;  1GPQ C;  3RT5 X;  4GLV A;  1ZVY B;  4TSC A;  5B06 A;  4YEM A;  1KXX A;  2MEB A;  2DBT A;  4H91 A;  1WTN A;  5F16 A;  1GE2 A;  5HNL A;  1BWH A;  1GF9 A;  1UA6 Y;  2CWI A;  4LFX A;  3B6L A;  2Z39 A;  1B9O A;  4QDN A;  1GBO A;  1GFR A;  1LSF A;  4KT3 A;  1QUS A;  1CKG A;  3EMS A;  3AGI A;  4NSI A;  4MST A;  4OWC A;  1I56 A;  1QUT A;  1FLY A;  5M1Y A;  4LT2 A;  5KXK A;  4PGJ B;  3CB7 A;  3D3D A;  3K3T A;  5F9X A;  3N9C A;  5LA5 A;  2H5Z A;  4XJF A;  4C3W A;  1VAT A;  2DQE Y;  5J7C A;  2BQA A;  3E3D A;  4N5R A;  5LA8 A;  4DD7 A;  1G7L C;  3G3A B;  3SP3 A;  1AKI A;  4RLM A; 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 2MEF A;  2ZIL A;  4I8S A;  1HSX A;  1HEL A;  1YAO A;  1JIT A;  4M6D A;  1B7Q A;  2YSS C;  1LJ4 A;  4NGJ A;  1B7R A;  1MLC E;  1OQM A;  3LZT A;  1J1O Y;  1LZ1 A;  1GE1 A;  2YBH A;  3CSQ A;  4PPO A;  1HML A;  3BKH A;  1VDQ A;  1IWZ A;  1C45 A;  1DQJ C;  1KXW A;  3RW8 A;  1VDS A;  3WH1 A;  4UWV A;  1LSB A;  3A93 A;  1CKD A;  4NG1 A;  1G7J C;  1D0M A;  3VWO A;  1G7M C;  4NGK A;  1BB3 A;  208L A;  2HEA A;  5IEL A;  1OUJ A;  1YKX X;  4CFP A;  5KXP A;  1KIQ C;  3ZVQ B;  3J4G A;  4NGW A;  1HEN A;  1GBW A;  1LYO A;  1N4F A;  2BQH A;  1CKC A;  2DQG Y;  1XGR C;  3A3Q A;  4BAF A;  2I25 L;  4NSG A;  1WQR A;  4OWB A;  1WTM A;  1IC7 Y;  3A3R X;  1C46 A;  4ZFP A;  1GB3 A;  3WVY A;  1IWT A;  1NQI A;  1KIR C;  3TXJ A;  4LYM A;  1BB6 A;  1NWG A;  4LT1 A;  4IJ4 A;  4WLT A;  4B0D A;  1LMC A;  1TCY A;  3A67 Y;  3AJN A;  4H9C A;  1IOQ A;  1JEF A;  1LZG A;  3EXD A;  4J1B A;  1T6V L;  5B07 A;  5HQ1 A;  3WUL A;  1C10 A;  2ZNW Y;  3A6C Y;  5DM9 A;  5II3 A;  3WXT A;  1LJG A;  4PHI A;  2D4K A;  4II8 A;  4KXI A;  5KXL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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