4N9RA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentacholrocarbonyliridate(iii) (1 day)
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4n9rA00
4RW1A 2DBTA 2ZILA 1JJ1A 1D9UA 5A3ZA 1GXXA 5HMJA 4J1AA 1GFJA 1LZ6A 5E4PA 1AZFA 3CSQA 1CJ8A 1C45A 1MLCE 5F9UA 1AT6A 5KXMA 2MEIA 4NGOA 1GB2A 1AKIA 1QQYA 1LZ4A 1NQIA 5LAGA 2BQGA 2DQFC 5LA8A 4ANRA 1QUSA 1DPWA 4YM8A 5LXWA 4OW1A 1RFPA 4H8YA 3W6BA 4OWAA 1B2KA 1LJGA 1F6SA 2ZIKA 1RCMA 1LYSA 2Z19A 4KT3A 1YL1X 5FDJA 1I20A 3WW6A 4BAPA 1LMPA 3A3RX 2FBBA 3WPKA 4LYBA 1GFVA 1DI4A 1KIRC 1RI8B 1YAOA 3ZVQB 1IIZA 1WVVA 4LFPA 1Z55A 4XYYA 5LVIA 3AYQA 1QSWA 3WUMA 1VFBC 1LZGA 1DKJA 1OUDA 3T36A 3WL2A 5HNCA 2A7FA 4BAFA 1HERA 2DQEY 2GV0A 4ZIXA 3J6KA 5APEA 2FYDA 2H9JA 4UWVA 4DWXA 1VATA 4DD0A 3A8ZA 5F14A 1LSMA 5LA5A 4H9CA 1HELA 1BB7A 1HEWA 3TXGA 2LHMA 4NSJA 1C7PA 1LZBA 5FEKA 3VWOA 4Z3MA 3AGHA 1JITA 2IFFY 5I53A 3WPJA 1GDWA 1B9OA 5D5CA 2BQNA 1IO5A 1N4FA 1A4VA 5II3A 1LMTA 1XGRC 1EQ5A 5B1FA 4CHXA 4CGEA 1FKVA 4HTNA 5M1YA 1QSAA 1HENA 5I4XA 2HEDA 1NDGC 2CGIA 2LYMA 1W6ZA 1JEFA 3K3TA 4I0CA 4DDAA 3RZ4A 4H9AA 2MEEA 3B0KA 4NSGA 3W6FA 3B6LA 1HC0A 2DQGY 4B4EA 4HV2A 1IY3A 1G7IC 2Z2FA 2YBIA 1WTMA 1LHIA 4WLTA 1LKRA 1GAZA 3TXDA 4ET8A 1GFKA 3IJUA 1BVXA 2ZIJA 1DXJA 1LCNA 1NF5A 3G3BB 2FBDA 4PJ2C 1AM7A 2ZNXY 1LZAA 4H91A 1GB5A 1GB7A 4UWNA 2RSCA 2YBMA 1LZYA 1C46A 1GHLA 5F9XA 1TEWA 1IOTA 1YQVY 4TWSA 2YBLA 1JSFA 3W6CA 2DQJY 5LVJA 5LIOA 1C10A 3CT5A 1WQPA 1LSCA 1LSBA 1LPIA 1IOSA 3LYTA 1GB6A 1GF3A 1GXV2 1JKDA 1GE2A 1GB3A 2MEGA 3ZVQA 4A7DA 4TSCA 1B5VA 1LZRA 3WU8A 3TXJA 2Z12A 5KXYA 1LZTA 1HNLA 1CNSA 1SLYA 3WVYA 4NGKA 4AXTA 3AZ5A 3HBDA 5KXPA 1B5WA 1GFUA 1OP9B 4PRUA 5LVKA 5KXWA 4RLMA 4NG1A 1LZCA 5B59A 1IWUA 5KXRA 2HECA 2ZWBA 1B5ZA 4N8ZA 2G4NA 2HU1A 4M6DA 1NMMA 2BQOA 1GBOA 1YIKA 2D4JA 2EPEA 4E3UA 5DLAA 1ALCA 1QTKA 3F6ZA 4WLXA 3RU5A 1IP2A 1OQMA 1JKCA 1UA6Y 1XEJA 5HQ1A 2C8OA 1BHZA 1LSGA 4NSIA 4HTKA 1GE4A 1HEQA 1FDLY 2C8PA 5IHGA 1PS5A 4U3XB 5KXSA 1JIYA 1QTEA 2DQHY 3TXHA 1CKDA 1IY4A 2CDSA 2DQCY 3CT0A 4IASA 1C08C 1JTPL 1HEOA 1B7PA 4R0FA 1XGPC 3FI7A 1W08A 1LJIA 3HBEX 2Z37A 1LJNA 1OUEA 3CSRA 4KXIA 1IP5A 1LHJA 3TMXA 4NHSA 3W3EA 5LYZA 4NHTA 1IC5Y 2F30A 3D3DA 3RNXA 4HV1A 1GWDA 1GB0A 1UACY 3AZ4A 4H1PA 1UICA 3B0IA 3BKVA 2W1XA 1GE1A 4H9HA 208LA 4WOAA 4B1AA 4OOOA 1CKCA 1HFXA 3TMWA 3AGIA 4G49A 135LA 2CWIA 4WMGA 1B7MA 5KXNA 1GBSA 3WMKA 4PPOA 3TXEA 4H93A 1J1PY 2BQLA 2W1MA 4QDNA 3RW8A 1HHLA 1HMKA 4H8XA 2G4QA 3QE8A 4NHPA 1MELL 5L3IA 4GN3A 1WTNA 3AZ6A 3A6BY 6LYZA 1CJ7A 3FE0A 1VDTA 4LZTA 5ILCA 1IORA 1GF0A 3A94A 2BPUA 3LN2A 4HJZA 1D6PA 4PRQA 4XJDA 4NHQA 1LHHA 1LHLA 5AMYA 4Z46A 1INUA 2MEBA 4I8SA 4DD7A 3WULA 4UWUA 2HU3A 4GCBA 3AB6A 4HJYA 1CKGA 1JJ3A 3TMVA 4IJ4A 4DD1A 5J7CA 2EQLA 1P2CC 1YAMA 1CKHA 1GB8A 1LHKA 2F2NA 4B0DA 3GXKA 3AW6A 4R6CA 1JKAA 4FDYA 4N1CC 4YOPA 3TXBA 1OUAA 4ET9A 1LMQA 1JHLA 1C43A 4NHIA 1LSYA 3QNGA 2DQAA 4ETDA 1OUFA 3CQLA 4YEMA 1KXXA 1NHEA 5B1GA 1GBYA 4B4JA 1B7RA 1IWZA 5LVGA 1JWRA 1IR8A 3CT1A 1XEKA 1YL0X 1UIAA 1QDTA 1ZMYL 4NFVA 2BLXA 1BB6A 1HEMA 5KXLA 9LYZA 1EQEA 4LYMA 3A34A 1T6VL 1WQMA 5APFA 1OUGA 4LYOA 6LYTA 3M18B 1GBXA 1JUGA 4N9RA 3LZ2A 2IHLA 2MEDA 1LSPA 4NSHA 3A6CY 1GFHA 132LA 1FBIX 1LYOA 5B07A 1FKQA 3LYOA 2Q0MX 1BVKC 5I5QA 2H9KA 2Z39A 2DQDY 4W94A 2LYZA 1J1OY 4WLYA 1LZDA 1I56A 1QDRA 2BQKA 4XJFA 3W6AA 4GLVA 4QGZA 2F4GA 4XADA 1YANA 4NGZA 4DD3A 5B05A 1GBZA 4NGYA 5C6IA 1UIGA 1FN5A 4NEBA 1GFGA 3N9CA 4ETEA 1IEEA 1IC7Y 2I25L 1BWJA 5E9RA 1D0MA 4ML7A 3B72A 1GF7A 4H9BA 3WUNA 2YDGA 3D9AC 1IWTA 4NGVA 4OWCA 133LA 2BQJA 2D4KA 1LMNA 4FJRA 2BQBA 1NDMC 1GE0A 4TX7A 1GF8A 1LSZA 1CJ9A 5A3EA 3WVXA 1UIDA 2BQMA 4WG7A 1F6RA 153LA 1LJ4A 1IWXA 1LKSA 2WARA 2ZYPA 1VDPA 3HFMY 1LJ3A 1IP1A 1BB3A 1IOCA 1GBWA 1DI5A 5KXTA 1GEVA 1FLQA 1LYYA 2VB1A 2MECA 1XSFA 1SQ2L 4NGJA 1LMOA 1T3PA 3LHMA 1B0DA 1JSEA 3P66A 5DN4A 1YAPA 2F4AA 3A91A 2BQFA 1YKXX 4J0LA 1LJEA 1XGQC 1D0LA 5KJ9A 1ZVYB 5KKJA 1CKFA 4C5FA 3TXFA 1PZYA 4QY9A 154LA 4N1EI 2B5ZA 5IDDA 4IATA 1YILA 1G7JC 4XJHA 2Z38A 1OUJA 1LOZA 1GDXA 3LZTA 1BB4A 2HEEA 5F81A 5I54A 2HTXA 4N0JA 4X3BA 1UIFA 2AUBA 5FELA 3GXRA 1JKBA 1LSFA 1OUHA 1I1ZA 4RDSA 1GB9A 3ATOA 4B4IA 4MSTA 1GF6A 1G7MC 1EQ4A 4LYTA 4HTQA 1GF4A 2LYOA 4B49A 4KL7A 4H94A 5F16A 4ETBA 4CFPA 1IVMA 5I4WA 4P2EA 4CJ2A 1UCOA 4LT3A 2YBHA 1BGIA 4NGWA 4YEOA 1VDQA 1KXYA 1YAQA 3A90A 1BWHA 1TAYA 4DD2A 1WQOA 1REYA 5L9JA 1TCYA 2D4IA 3A95A 4DDCA 3W6EA 1GFEA 2FYCA 3WYHA 4WL6A 5LYTA 2D91A 4H92A 194LA 3AJNA 2YBJA 3N9AA 1F10A 1IWWA 4HPEA 3TXKA 1B7NA 4GLAA 4GCEA 3ULRA 4OOTA 1YKYX 3QY4A 4N5RA 1LZNA 4HSFA 2BQCA 1UBZA 1IWVA 1VAUA 2H5ZA 2MEFA 4LGKA 1DPXA 4LT0A 4NWEA 2BQAA 4WM6A 4XJGA 3RT5X 1B7OA 1LSEA 1HMLA 1IC4Y 5APCA 1WQRA 1JJ0A 1OUCA 3EBAB 5D5FA 4ZEEA 5DL9A 3P64A 1UUZC 2I26L 1B5UA 4H9EA 4YF2A 1IP4A 1GAYA 3ATNA 2HUBA 4NGIA 1GFAA 1LSDA 1LTMA 1BWIA 5T3FA 134LA 1LZ8A 1XGTC 4D9ZA 3G3AB 4GCDA 4H90A 4LT2A 1WVUA 193LA 4LFXA 4LYCA 1UC0A 3TMUA 2MEHA 1LHMA 4XN6A 4J1BA 3MGWA 3SP3A 1E8LA 2W1LA 4DD9A 5HMVA 1LYZA 3WPLA 4G4BA 1GPQC 2XBSA 1LSAA 3AW7A 4TTDA 1A2YC 4WO6A 1H87A 1O23A 3N9EA 1BB5A 3A67Y 1LZ9A 1XFPL 3WXUA 1ZV5L 2ZQ4A 1GEZA 1UIHA 4HJVA 4WG1A 5I4YA 1UIBA 1G7HC 1QIOA 1GF5A 3ZEKA 4G4HA 1REZA 1BQLY 4LYZA 4Z41A 2D6BA 2YSSC 1B5YA 4H9IA 4HP0A 5JENB 1REMA 2ZNWY 4NG8A 4G9SA 4XJIA 1B7QA 3J4GA 1WQQA 5FHWA 4MR1A 2N5ZA 2HEBA 2DQIY 1GF9A 5EBHA 5K7OA 4NY5A 5KXKA 1IWYA 1LAAA 5FSTA 5C6LA 2LZTA 3TXIA 1HSWA 2Z2EA 2A7DA 2HEAA 1B7LA 2I6ZA 4GN4A 5LVHA 4WO9A 5IELA 2EKSC 4LT1A 1FLUA 1KIPC 1HF4A 1AT5A 1TBYA 2BAAA 3EXDA 1LJHA 4WM2A 4OWHA 1WQNA 1NBYC 1LZSA 4XJBA 5ILFA 3WU9A 5L3HA 3OK0A 4J7VA 2YVBA 3LYMA 1G7LC 5APDA 4OWBA 5LYMA 3A3QA 1TDYA 1JPOA 3AGGG 4NWHA 4YENA 1IP6A 3WXTA 4L41A 4EOFA 207LA 3OJPA 1IP3A 1HEPA 1JTTL 3EO5A 4C3WA 1NWGA 4O34A 2MEAA 1B7SA 3IJVA 3A93A 3KAMA 2BQEA 5HLLA 1RJCB 4HPIA 5KXXA 4TSBA 4II8A 7LYZA 1IOQA 2Z18A 1GD6A 2XBRA 4WLDA 1LJKA 1LZ1A 1HSXA 2XTHA 3IWRA 4GCFA 3A92A 5DN5A 1D0KA 4DDBA 4RLNA 3WW5A 1F0WA 1IX0A 1B5XA 4GN5C 2W1YA 5C6JA 3P4ZA 2PC2A 4H8ZA 4WL7A 1JTOL 2X0AA 4XENA 4KPMA 5KXZA 4G4CA 5FCPA 1V7TA 1FLYA 4W96A 1GFRA 1NKHA 1HFZA 4WM4A 2BQIA 3M3UA 1OUBA 3WH1A 1DKKA 4DYGA 2BQDA 1LZ5A 2EIZC 3A96A 4BADA 1FLWA 4BS7A 1JISA 5HNLA 2ZYCA 3EMSA 2LZ2A 1VDSA 1H6MA 4ZFPA 5KKIA 4NIJA 8LYZA 4GCCA 2Y8PA 4WM1A 1DQJC 3CB7A 5LAFA 1LZEA 1OUIA 1LJJA 2DKVA 3HBHA 4Z98A 4ETAA 1YKZX 3P65A 3WU7A 2BQHA 4EMNA 2G4PA 4PGJB 4WM3A 1LJFA 5DM9A 1GFTA 1IP7A 3AZ7A 1LMCA 4QEQA 1RE2A 2YBNA 1EL1A 1YROA 1QUTA 3LYZA 1D6QA 1KXWA 2HEFA 1UIEA 2NWDX 3WUAA 4DT3A 4ETCA 4H9FA 1IR7A 5KY1A 1NBZC 3W6DA 2ZQ3A 2BLYA 4RW2A 3T6UA 4AGAA 1GE3A 1V7SA 1ZVHL 1LSNA 4PHIA 4OWEA 1REXA 5KXOA 4CFOA 5LINA 4M4OA 3CSZA 1VEDA 1J1XY 4TUNA 4NGLA 1CJ6A 4DC4A 1HFYA 1XEIA 3BKHA 3E3DA 4MCKA 1XGUC 1KIQC 4WM5A 2CJLA 5B06A 3P68A 2XJWA 1IR9A 1DZBX 1LMAA 1DI3A 3B0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW1A 2DBTA 3CDQA 3CSQA 1CJ8A 1AT6A 1GB2A 1QQYA 1LZ4A 1QTZA 1L13A 140LA 5LAGA 242LA 2BQGA 4ANRA 182LA 1DPWA 4YM8A 5LXWA 1RFPA 2ZIKA 4DQJA 2FBBA 4W51A 4W58A 1DI4A 1LZGA 3WL2A 2FYDA 4DWXA 1B6IA 3NYAA 1HELA 1BB7A 1HEWA 244LA 2LHMA 4NSJA 5FEKA 1JITA 1L88A 1L77A 1IO5A 1XGRC 4CHXA 1FKVA 223LA 230LA 5I4XA 3SB7A 1C6BA 1L71A 104LA 3W6FA 160LA 3B6LA 3F9LA 3HUKA 1WTMA 1LHIA 1LKRA 1GAZA 1KY1A 1NF5A 1AM7A 4W52A 152LA 1C46A 5F9XA 1IOTA 3VW7A 1JSFA 2DQJY 5LVJA 188LA 1L57A 1LPIA 1GB6A 1GF3A 2O4WA 3WU8A 1C6FA 1LZTA 1HNLA 4NGKA 3HBDA 1C68A 5KXWA 1L46A 126LA 1CU3A 3V2WA 3C8RA 1L91A 1L99A 259LA 1NMMA 1QUOA 2D4JA 5DLAA 1QTKA 3F6ZA 191LA 2RAYX 3HU8A 1IP2A 1XEJA 1JKCA 4HTKA 4IAPA 1JIYA 1OVJA 3HUQA 3SB8A 1IY4A 2DQCY 3GUPA 4IASA 1B7PA 2IGCA 2RBRA 1LJNA 3HT8A 4KXIA 1L32A 3W3EA 1IC5Y 1GWDA 1GB0A 180LA 234LA 2B6ZA 1UICA 201LA 3BKVA 2W1XA 2LC9A 256LA 224LA 4WOAA 4OOOA 3TMWA 3DN8A 3WMKA 3TXEA 4QDNA 3RW8A 4ARQA 2G4QA 3C82A 3A6BY 3FE0A 1L95A 1PQMA 1VDTA 4LZTA 5ILCA 1IORA 2B7XA 2BPUA 4HJZA 1L21A 175LA 4XJDA 1LHHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RW1 A;  2DBT A;  2ZIL A;  1JJ1 A;  1D9U A;  5A3Z A;  1GXX A;  5HMJ A;  4J1A A;  1GFJ A;  1LZ6 A;  5E4P A;  1AZF A;  3CSQ A;  1CJ8 A;  1C45 A;  1MLC E;  5F9U A;  1AT6 A;  5KXM A;  2MEI A;  4NGO A;  1GB2 A;  1AKI A;  1QQY A;  1LZ4 A;  1NQI A;  5LAG A;  2BQG A;  2DQF C;  5LA8 A;  4ANR A;  1QUS A;  1DPW A;  4YM8 A;  5LXW A;  4OW1 A;  1RFP A;  4H8Y A;  3W6B A;  4OWA A;  1B2K A;  1LJG A;  1F6S A;  2ZIK A;  1RCM A;  1LYS A;  2Z19 A;  4KT3 A;  1YL1 X;  5FDJ A;  1I20 A;  3WW6 A;  4BAP A;  1LMP A;  3A3R X;  2FBB A;  3WPK A;  4LYB A;  1GFV A;  1DI4 A;  1KIR C;  1RI8 B;  1YAO A;  3ZVQ B;  1IIZ A;  1WVV A;  4LFP A;  1Z55 A;  4XYY A;  5LVI A;  3AYQ A;  1QSW A;  3WUM A;  1VFB C;  1LZG A;  1DKJ A;  1OUD A;  3T36 A;  3WL2 A;  5HNC A;  2A7F A;  4BAF A;  1HER A;  2DQE Y;  2GV0 A;  4ZIX A;  3J6K A;  5APE A;  2FYD A;  2H9J A;  4UWV A;  4DWX A;  1VAT A;  4DD0 A;  3A8Z A;  5F14 A;  1LSM A;  5LA5 A;  4H9C A;  1HEL A;  1BB7 A;  1HEW A;  3TXG A;  2LHM A;  4NSJ A;  1C7P A;  1LZB A;  5FEK A;  3VWO A;  4Z3M A;  3AGH A; 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 4WLD A;  1LJK A;  1LZ1 A;  1HSX A;  2XTH A;  3IWR A;  4GCF A;  3A92 A;  5DN5 A;  1D0K A;  4DDB A;  4RLN A;  3WW5 A;  1F0W A;  1IX0 A;  1B5X A;  4GN5 C;  2W1Y A;  5C6J A;  3P4Z A;  2PC2 A;  4H8Z A;  4WL7 A;  1JTO L;  2X0A A;  4XEN A;  4KPM A;  5KXZ A;  4G4C A;  5FCP A;  1V7T A;  1FLY A;  4W96 A;  1GFR A;  1NKH A;  1HFZ A;  4WM4 A;  2BQI A;  3M3U A;  1OUB A;  3WH1 A;  1DKK A;  4DYG A;  2BQD A;  1LZ5 A;  2EIZ C;  3A96 A;  4BAD A;  1FLW A;  4BS7 A;  1JIS A;  5HNL A;  2ZYC A;  3EMS A;  2LZ2 A;  1VDS A;  1H6M A;  4ZFP A;  5KKI A;  4NIJ A;  8LYZ A;  4GCC A;  2Y8P A;  4WM1 A;  1DQJ C;  3CB7 A;  5LAF A;  1LZE A;  1OUI A;  1LJJ A;  2DKV A;  3HBH A;  4Z98 A;  4ETA A;  1YKZ X;  3P65 A;  3WU7 A;  2BQH A;  4EMN A;  2G4P A;  4PGJ B;  4WM3 A;  1LJF A;  5DM9 A;  1GFT A;  1IP7 A;  3AZ7 A;  1LMC A;  4QEQ A;  1RE2 A;  2YBN A;  1EL1 A;  1YRO A;  1QUT A;  3LYZ A;  1D6Q A;  1KXW A;  2HEF A;  1UIE A;  2NWD X;  3WUA A;  4DT3 A;  4ETC A;  4H9F A;  1IR7 A;  5KY1 A;  1NBZ C;  3W6D A;  2ZQ3 A;  2BLY A;  4RW2 A;  3T6U A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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