4NHPA

X-ray structure of the complex between the hen egg white lysozyme and pentachlorocarbonyliridate (iii) (4 days)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nhpA00
4N1EI 3WU9A 1HF4A 4N9RA 1GD6A 4B4IA 1GF0A 1QUTA 1NBZC 3CSRA 3TXGA 4WO6A 1LZGA 5LXWA 1LPIA 1D0KA 1LOZA 4WMGA 1CKFA 4NSJA 1LKRA 4YM8A 154LA 1REXA 4I0CA 4J0LA 1REZA 5APDA 3RT5X 1IWVA 1B9OA 1YKXX 5KJ9A 3QNGA 2BAAA 1DI5A 3A95A 4WM5A 5APCA 2XBRA 5I53A 3WXTA 4QY9A 1DI3A 1ZVYB 5B05A 5APFA 1IOCA 4XN6A 4DD7A 1E8LA 1GB9A 2D6BA 1IC5Y 1XSFA 5D5CA 2G4NA 3FE0A 1W08A 5HLLA 1LZ4A 1GXXA 3P4ZA 1J1OY 1XGRC 4HTKA 1GWDA 5J7CA 1PZYA 4HJYA 1WVUA 1XGUC 1IWUA 1GBSA 4N5RA 3AGHA 2Z2EA 1HFZA 1LMOA 4NY5A 1GFJA 4G9SA 1GE0A 1VFBC 2ZIKA 1GE1A 1B7PA 1LSBA 4WLTA 3T36A 4ETAA 1HC0A 1FKQA 5F9XA 3W6EA 1AT5A 3LN2A 1IC7Y 1GF8A 2PC2A 1B7QA 5E4PA 1YAQA 4X3BA 5LYZA 1B5VA 1GEVA 1UIDA 3W6BA 4J7VA 5KXXA 1B7MA 4WM2A 1IVMA 1LZAA 4WLYA 4H8ZA 4NGYA 1B2KA 1LHIA 4IASA 2F4GA 3P68A 4N0JA 2YBLA 4RDSA 1OQMA 1OUDA 4GCEA 1GF6A 4UWUA 1WQRA 2I25L 5I4XA 3W6CA 2MEFA 3LYOA 1F10A 4HTQA 1KIQC 2BQLA 1VDTA 1IOTA 2DQDY 4J1AA 4WM1A 1YL1X 5B1FA 2D4KA 1IP1A 1QSWA 2G4PA 1IORA 3HFMY 1LZTA 1QUSA 4ETBA 3ZVQB 5KXLA 4RLNA 4LYZA 2YBNA 1HFYA 1ZVHL 1WQNA 3WL2A 2MEHA 5C6JA 4PHIA 135LA 1FLWA 4QDNA 1HEPA 2RSCA 3WW6A 2ZYPA 3RZ4A 5B06A 5KKJA 2NWDX 2CGIA 3LZTA 4XYYA 2XBSA 1LZBA 1IWWA 1BGIA 4KXIA 5D5FA 4WM4A 1YQVY 1LJEA 5FELA 153LA 3TMXA 4G4BA 4DDAA 4Z3MA 2A7FA 2YBHA 2MEEA 3LZ2A 5KXMA 1EQEA 2ZNXY 4B49A 2F2NA 4DD2A 1FLQA 4XJDA 1FKVA 1JJ3A 1UIGA 1VATA 4XJHA 1LSZA 1TDYA 1WQQA 1V7TA 2BQOA 3B0KA 3TXHA 5II3A 1G7JC 1HEOA 1BWIA 2MEAA 1LKSA 2HECA 1FBIX 4L41A 3CT1A 3WVYA 1B7RA 1YAMA 4NFVA 1GB7A 4H8YA 3AW6A 3W3EA 5KXRA 1GDWA 5LAFA 4TUNA 1LJ3A 4PRQA 4XJGA 1DKJA 3A91A 1B7LA 2VB1A 5LVIA 4R6CA 1IWXA 3TMVA 1QTKA 1LSFA 2BQKA 4R0FA 1HELA 1AT6A 1GFGA 4LZTA 1FLUA 1BWJA 2H5ZA 4YEOA 2DQJY 1REYA 2HEAA 4A7DA 1EQ4A 1LMAA 1GDXA 4WG1A 4AXTA 5LYMA 1LHLA 3E3DA 4DYGA 1B5WA 1HSXA 4LFPA 5E9RA 1YILA 4CJ2A 1I1ZA 5ILFA 4NGLA 1IO5A 4U3XB 5F81A 1QDRA 4LYTA 193LA 1BVXA 5ILCA 1I56A 3WW5A 1GFAA 1NDMC 4CFOA 4H92A 4NHPA 4NHQA 3QY4A 4NGVA 4N1CC 5DLAA 3G3AB 1LAAA 4NHIA 1CKGA 1JUGA 1IX0A 1CJ8A 1F0WA 5B1GA 2HU1A 1LZ5A 1FN5A 2EQLA 2ZILA 1LZ9A 4H91A 5LYTA 2Z38A 1C7PA 3T6UA 2LYOA 1NMMA 4Z41A 3W6FA 1YIKA 1UA6Y 3TXKA 1GF3A 1OUJA 1IP2A 1HMLA 3B0OA 4TSBA 4B0DA 4ETEA 3QE8A 3AGIA 3MGWA 4XJFA 2HU3A 4OWHA 1MELL 2F30A 2FYDA 4G4HA 4TX7A 4WOAA 1KXXA 1LSYA 1LSCA 5KXPA 3N9AA 1LYZA 4OW1A 3RW8A 1MLCE 1RE2A 1SQ2L 4LYBA 4QGZA 3TMUA 4CGEA 5L3HA 1RFPA 4N8ZA 3IJVA 3A96A 5KXTA 1XEIA 3D9AC 2W1XA 2Z39A 3A34A 1YKZX 2BLYA 1HEMA 1TAYA 4NSIA 3TXEA 1ZV5L 3HBEX 2IHLA 2G4QA 1KIPC 1HERA 1G7LC 1LMQA 2YBJA 1LMCA 2FYCA 4B4EA 2BQMA 1YKYX 4C3WA 3CQLA 3TXFA 1WTNA 1UIHA 3K3TA 1CNSA 1QTEA 2C8OA 5HNLA 4MSTA 3WPJA 1JTTL 5HQ1A 3WU8A 1JJ1A 1CKHA 208LA 2YVBA 4MR1A 1B0DA 1GF9A 1WQOA 2HEFA 3FI7A 3IWRA 4H9AA 3W6AA 2BQFA 1LSDA 2D91A 5I4WA 1D9UA 2F4AA 1LYYA 4H9EA 5KXNA 4ETCA 2BLXA 5KY1A 2BQDA 1J1PY 3A92A 2BPUA 3AZ6A 1IR8A 1DQJC 4IJ4A 194LA 2H9KA 4HP0A 5IHGA 4RW1A 4CHXA 3CB7A 1F6RA 5KXOA 2I26L 2LYZA 1JHLA 4YOPA 3EBAB 1B7NA 3B0IA 4LGKA 4GN4A 1IOSA 1H6MA 1G7IC 4IATA 5C6LA 5LVHA 1GFKA 1DPXA 5LINA 5JENB 1LHKA 3WYHA 1T3PA 1JJ0A 1HMKA 2FBBA 1LYSA 1NHEA 1B7SA 1PS5A 4LT3A 4GN5C 4H8XA 2Z12A 1GE3A 3LYZA 1UICA 4BS7A 2H9JA 1LZEA 1IWZA 1GB8A 1LSNA 1NBYC 1NF5A 2XTHA 1TEWA 1UIAA 1OUFA 2GV0A 1GF7A 4H1PA 4LFXA 1GFHA 5DN5A 9LYZA 1ZMYL 3WUAA 5KXWA 2ZYCA 1D6PA 4D9ZA 3B72A 5DL9A 2Z2FA 1WTMA 3AW7A 4NHTA 1B5ZA 3TXJA 4HPIA 2YBMA 1C10A 1EQ5A 1B7OA 1HFXA 2HTXA 4RW2A 1XEJA 1IWTA 2DQGY 4H9FA 1GFRA 1IIZA 1GHLA 1LZRA 1LJIA 1JITA 1JKDA 1OUBA 1LJNA 1YANA 2DKVA 4GLAA 3J6KA 8LYZA 1LJJA 3CT5A 1GE4A 1GFTA 1DZBX 4H9HA 5FEKA 2MEIA 1DPWA 1I20A 1UBZA 1IP4A 1NKHA 1LSEA 4YENA 4FJRA 3WPKA 4Z46A 3SP3A 1LZCA 3A90A 3ATNA 3AB6A 1C45A 1OUHA 1LZ1A 3WULA 3TXDA 1LMTA 3LYTA 1GB3A 4HJZA 1IEEA 3WH1A 3ZVQA 1NWGA 3N9CA 1LSAA 1WQPA 3D3DA 5A3ZA 4LYCA 5IELA 3N9EA 5B59A 1XEKA 4ANRA 4NGJA 1JTPL 3TMWA 3WU7A 1IR7A 1GB6A 1GB2A 1LJ4A 1LZYA 3CSQA 1JKAA 1GEZA 1VAUA 1VDPA 2DQCY 4II8A 1H87A 1JTOL 1D0LA 5IDDA 1V7SA 4ET9A 1HSWA 7LYZA 5HMVA 5FHWA 1JEFA 3ULRA 3P64A 3J4GA 1JPOA 2BQEA 1HNLA 3G3BB 1DXJA 1GB0A 1QQYA 2N5ZA 3A94A 4LYMA 1OP9B 4OWCA 1LJFA 4NG1A 2IFFY 1OUGA 4PPOA 207LA 1GFEA 5APEA 2LHMA 4WO9A 4XENA 2HEBA 1INUA 2BQIA 3ATOA 1DI4A 5HNCA 1HEQA 3GXKA 4PRUA 1VEDA 1LHHA 5T3FA 2HUBA 3WUNA 4DD0A 3P66A 5K7OA 1LHMA 4QEQA 4DDBA 5A3EA 1GFUA 4DDCA 2Z18A 4MCKA 4TTDA 4BAFA 1GAZA 5I5QA 1XGQC 2Y8PA 4UWNA 3AJNA 4KL7A 4DD3A 4EOFA 4HV2A 1UIFA 1QIOA 3KAMA 1UIEA 4H9BA 2MEBA 2B5ZA 2MEDA 6LYZA 1YAOA 2HEEA 2BQAA 4OOOA 4G4CA 1O23A 3A6BY 5B07A 1BB6A 1CKDA 4BADA 1BQLY 1VDSA 3M18B 4ML7A 2ZQ3A 1ALCA 4LYOA 1KXWA 1RCMA 1BWHA 2BQHA 2EIZC 1IP5A 1CJ6A 1IP3A 2EKSC 4W96A 3TXBA 4XJBA 1LJKA 2BQBA 1LMPA 2YBIA 5LVJA 3WXUA 1A4VA 1GBXA 2W1MA 1LHJA 4DWXA 5I4YA 1C46A 2CDSA 2DQEY 2XJWA 3CT0A 5F14A 132LA 1GBWA 1LZSA 3A67Y 3CSZA 4PJ2C 1Z55A 4HPEA 5EBHA 1GBZA 1OUEA 2Z19A 1JISA 4AGAA 1GB5A 1AZFA 1IR9A 3LHMA 4LT0A 2LZTA 4OWAA 3A3QA 1SLYA 1UACY 4GLVA 1WVVA 1JIYA 2EPEA 3HBDA 4GCCA 4WLDA 3BKVA 1AM7A 1GPQC 1QSAA 1XGTC 3LYMA 1WQMA 4DC4A 1UC0A 4ZFPA 5FSTA 1IC4Y 4NG8A 4OOTA 5DN4A 1FLYA 1LTMA 1NDGC 4GCFA 4ET8A 4YEMA 1XFPL 1IWYA 1IOQA 1JSFA 2CJLA 1OUAA 1JKBA 1W6ZA 5HMJA 2DQAA 4H93A 1XGPC 4RLMA 2YDGA 4TSCA 2HEDA 4G49A 3TXIA 134LA 1IY3A 2C8PA 1IY4A 2FBDA 2Q0MX 2W1YA 5F9UA 2A7DA 1JWRA 3RNXA 2DQHY 4B1AA 1UUZC 2BQNA 4NHSA 2AUBA 1BHZA 4KPMA 4Z98A 1LJHA 1N4FA 3OK0A 1A2YC 3OJPA 4H90A 4NGKA 2BQGA 5LIOA 4CFPA 3A6CY 5L3IA 3EXDA 3B6LA 1GBYA 1JKCA 1HHLA 4NSGA 4WL6A 1GBOA 4NEBA 4ETDA 4NWEA 2ZQ4A 1FDLY 1DKKA 4NGWA 1LZ6A 4W94A 5LVKA 5KXZA 1GF5A 4YF2A 1BB7A 5LA5A 2BQCA 4H9IA 1CJ9A 3GXRA 5M1YA 1LZNA 4DD9A 5F16A 5LA8A 1AKIA 2DQIY 3A93A 6LYTA 5LVGA 1T6VL 1LYOA 4NGZA 5AMYA 1LSGA 3IJUA 1GAYA 4OWEA 4E3UA 1B5XA 5FDJA 2LZ2A 3F6ZA 3WMKA 2Z37A 3ZEKA 1CKCA 4J1BA 1LJGA 4WM3A 1J1XY 1EL1A 1HENA 4FDYA 4WM6A 4WL7A 2ZIJA 4HJVA 2LYMA 1P2CC 4HV1A 5C6IA 1G7HC 1D0MA 4EMNA 1IP6A 1RI8B 1HEWA 1LSPA 1YAPA 1F6SA 1KIRC 3P65A 1G7MC 3HBHA 5KXYA 3WUMA 4M4OA 1UCOA 2DBTA 3EMSA 1GFVA 4WG7A 4BAPA 1RJCB 2ZWBA 4LT1A 2MECA 2DQFC 4H94A 5KXKA 4GCDA 4M6DA 1C08C 4PGJB 1REMA 3AZ4A 4NGIA 1LZ8A 4TWSA 2W1LA 1OUIA 2BQJA 1LZDA 1KXYA 2WARA 1LSMA 4LT2A 4DD1A 4ZIXA 1B5UA 3WVXA 1TBYA 4NSHA 1YL0X 3AGGG 4GCBA 4KT3A 4O34A 4OWBA 1VDQA 3RU5A 4ZEEA 1GF4A 2MEGA 1LMNA 1C43A 4NGOA 3VWOA 4UWVA 5LAGA 2ZNWY 4DT3A 4P2EA 1BVKC 1UIBA 5L9JA 1IP7A 4XADA 2YSSC 4NWHA 4B4JA 1BB4A 2X0AA 5DM9A 1TCYA 5KXSA 3AZ5A 1JSEA 2CWIA 3WPLA 1GXV2 2I6ZA 1NQIA 3A8ZA 3AYQA 1BB3A 1CJ7A 1D6QA 1GE2A 2D4JA 4WLXA 5I54A 3M3UA 5KKIA 1OUCA 3W6DA 4HTNA 3EO5A 4XJIA 1YROA 3AZ7A 4I8SA 1LCNA 2D4IA 4GN3A 4HSFA 3BKHA 1B5YA 133LA 1BB5A 4NIJA 4C5FA 5FCPA 1QDTA 3A3RX 4H9CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N1EI 4W52A 4N9RA 1GD6A 1NBZC 1LZGA 1QUHA 1QTDA 1REXA 4I0CA 3RT5X 1IWVA 1B9OA 2RBSA 1WTHA 4DQJA 5APCA 131LA 4XN6A 4DD7A 1E8LA 3ODUA 2D6BA 1G0PA 1L00A 1LLHA 4PJZA 1WVUA 1IWUA 3AGHA 2Z2EA 1C6FA 4G9SA 1GE1A 1LSBA 1HC0A 3OE0A 5F9XA 239LA 1IC7Y 1B7QA 1B7MA 4DJHA 1L45A 1L51A 2F4GA 3P68A 4N0JA 1OQMA 129LA 3DNAA 2I25L 145LA 4HTQA 4W57A 196LA 4WM1A 2D4KA 2G4PA 3HFMY 4I7QA 5KXLA 1G0KA 168LA 2YBNA 4LYZA 1HFYA 1WQNA 2MEHA 135LA 1HEPA 5KKJA 2NWDX 2CGIA 3LZTA 201LA 1L18A 3TMXA 4G4BA 3C7WA 4I7OA 4GBRB 3LZ2A 2ZNXY 250LA 1FKVA 1UIGA 4XJHA 1LSZA 163LA 1TDYA 1V7TA 1WQQA 5II3A 1G7JC 2MEAA 1LKSA 215LA 1FBIX 1YAMA 4PRQA 4XJGA 1DKJA 3A91A 258LA 5LVIA 3TMVA 1AT6A 4LZTA 1KNIA 104LA 1FLUA 248LA 2HEAA 4WG1A 4AXTA 1HSXA 5E9RA 5ILFA 1CUPA 1I56A 3WW5A 3OE6A 4NHPA 3QY4A 4N1CC 3G3AB 4NHIA 1JUGA 1IX0A 1CJ8A 1F0WA 4I7TA 2HU1A 1FN5A 1LZ9A 3T6UA 3TXKA 1OUJA 3QE8A 3MGWA 161LA 1L97A 4TX7A 4G4HA 3CDVA 1CU3A 1L75A 5KXPA 3RW8A 3N9AA 1LYZA 1P6YA 1SWYA 1RE2A 4W55A 5L3HA 4N8ZA 1EPYA 5KXTA 209LA 2Z39A 2BLYA 3CDTA 185LA 1KIPC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4N1E I;  3WU9 A;  1HF4 A;  4N9R A;  1GD6 A;  4B4I A;  1GF0 A;  1QUT A;  1NBZ C;  3CSR A;  3TXG A;  4WO6 A;  1LZG A;  5LXW A;  1LPI A;  1D0K A;  1LOZ A;  4WMG A;  1CKF A;  4NSJ A;  1LKR A;  4YM8 A;  154L A;  1REX A;  4I0C A;  4J0L A;  1REZ A;  5APD A;  3RT5 X;  1IWV A;  1B9O A;  1YKX X;  5KJ9 A;  3QNG A;  2BAA A;  1DI5 A;  3A95 A;  4WM5 A;  5APC A;  2XBR A;  5I53 A;  3WXT A;  4QY9 A;  1DI3 A;  1ZVY B;  5B05 A;  5APF A;  1IOC A;  4XN6 A;  4DD7 A;  1E8L A;  1GB9 A;  2D6B A;  1IC5 Y;  1XSF A;  5D5C A;  2G4N A;  3FE0 A;  1W08 A;  5HLL A;  1LZ4 A;  1GXX A;  3P4Z A;  1J1O Y;  1XGR C;  4HTK A;  1GWD A;  5J7C A;  1PZY A;  4HJY A;  1WVU A;  1XGU C;  1IWU A;  1GBS A;  4N5R A;  3AGH A;  2Z2E A;  1HFZ A;  1LMO A;  4NY5 A;  1GFJ A;  4G9S A;  1GE0 A;  1VFB C;  2ZIK A;  1GE1 A;  1B7P A;  1LSB A;  4WLT A;  3T36 A;  4ETA A;  1HC0 A;  1FKQ A;  5F9X A;  3W6E A;  1AT5 A;  3LN2 A;  1IC7 Y;  1GF8 A;  2PC2 A;  1B7Q A;  5E4P A;  1YAQ A;  4X3B A;  5LYZ A;  1B5V A;  1GEV A;  1UID A;  3W6B A;  4J7V A;  5KXX A;  1B7M A; 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 1B5X A;  5FDJ A;  2LZ2 A;  3F6Z A;  3WMK A;  2Z37 A;  3ZEK A;  1CKC A;  4J1B A;  1LJG A;  4WM3 A;  1J1X Y;  1EL1 A;  1HEN A;  4FDY A;  4WM6 A;  4WL7 A;  2ZIJ A;  4HJV A;  2LYM A;  1P2C C;  4HV1 A;  5C6I A;  1G7H C;  1D0M A;  4EMN A;  1IP6 A;  1RI8 B;  1HEW A;  1LSP A;  1YAP A;  1F6S A;  1KIR C;  3P65 A;  1G7M C;  3HBH A;  5KXY A;  3WUM A;  4M4O A;  1UCO A;  2DBT A;  3EMS A;  1GFV A;  4WG7 A;  4BAP A;  1RJC B;  2ZWB A;  4LT1 A;  2MEC A;  2DQF C;  4H94 A;  5KXK A;  4GCD A;  4M6D A;  1C08 C;  4PGJ B;  1REM A;  3AZ4 A;  4NGI A;  1LZ8 A;  4TWS A;  2W1L A;  1OUI A;  2BQJ A;  1LZD A;  1KXY A;  2WAR A;  1LSM A;  4LT2 A;  4DD1 A;  4ZIX A;  1B5U A;  3WVX A;  1TBY A;  4NSH A;  1YL0 X;  3AGG G;  4GCB A;  4KT3 A;  4O34 A;  4OWB A;  1VDQ A;  3RU5 A;  4ZEE A;  1GF4 A;  2MEG A;  1LMN A;  1C43 A;  4NGO A;  3VWO A;  4UWV A;  5LAG A;  2ZNW Y;  4DT3 A;  4P2E A;  1BVK C;  1UIB A;  5L9J A;  1IP7 A;  4XAD A;  2YSS C;  4NWH A;  4B4J A;  1BB4 A;  2X0A A;  5DM9 A;  1TCY A;  5KXS A;  3AZ5 A;  1JSE A;  2CWI A;  3WPL A;  1GXV 2;  2I6Z A;  1NQI A;  3A8Z A;  3AYQ A;  1BB3 A;  1CJ7 A;  1D6Q A;  1GE2 A;  2D4J A;  4WLX A;  5I54 A;  3M3U A;  5KKI A;  1OUC A;  3W6D A;  4HTN A;  3EO5 A;  4XJI A;  1YRO A;  3AZ7 A;  4I8S A;  1LCN A;  2D4I A;  4GN3 A;  4HSF A;  3BKH A;  1B5Y A;  133L A;  1BB5 A;  4NIJ A;  4C5F A;  5FCP A;  1QDT A;  3A3R X;  4H9C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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