4NSHA

Carboplatin binding to hewl in 0.2m nh4so4, 0.1m naac in 25% peg 4000 at ph 4.6
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Carboplatin binding to histidine.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nshA00
4WO9A 1CKDA 1OUCA 4GCDA 1GXXA 5A3EA 1EL1A 154LA 1B7PA 4G4HA 1IWUA 3A96A 1IOQA 4W94A 2A7FA 4WM2A 3BKVA 1JISA 2CDSA 1JJ1A 1REYA 1LMAA 3D9AC 4XENA 2C8OA 4DD3A 1G7JC 2MEDA 4N1EI 4DDCA 2MEGA 1T3PA 2BQLA 4IASA 4RW2A 4WM5A 1GEZA 4NFVA 4XADA 1IOTA 1RE2A 1CJ8A 4WLXA 5LIOA 3CQLA 1HEMA 1FN5A 1LSDA 1WQNA 2HEDA 3WU9A 1LAAA 1GAZA 4LT1A 1LHKA 2AUBA 1LSBA 1DXJA 1LYSA 1NWGA 4L41A 1LSNA 3B0OA 5DL9A 5DN4A 3TXFA 2ZYPA 1B0DA 3D3DA 5E9RA 4DT3A 1HC0A 1E8LA 5C6IA 1T6VL 4NGVA 1LZRA 1LZ6A 1EQ4A 1YKZX 3WH1A 1AKIA 1I56A 1AM7A 5I4WA 2D6BA 4GCEA 4CFOA 3LN2A 2BQGA 3AGGG 1CNSA 1VDSA 4J7VA 1QTKA 1VFBC 3HBDA 1OP9B 1MLCE 4QDNA 2Z2FA 3WMKA 5II3A 2XBRA 1IR8A 4HP0A 2BAAA 2HEEA 3A67Y 4GLAA 2MEFA 2YSSC 2HU1A 4LZTA 4RLNA 1RFPA 5J7CA 3WVXA 1HEOA 4WO6A 2LYZA 1BGIA 1B7OA 1GF8A 1V7SA 2ZQ3A 2VB1A 5F9UA 153LA 4NG1A 1GPQC 4H8XA 1GE2A 1WQQA 3IJVA 3LYOA 1UACY 3WXTA 5KXNA 1QDTA 1LZ4A 3A93A 1BWJA 1JTPL 5KXSA 4WG1A 4Z41A 4ML7A 1VDTA 1QSAA 1F0WA 1BB7A 1LZTA 2HU3A 1YKXX 4H9HA 4DD1A 5HMVA 4WOAA 4MSTA 1B7MA 5D5CA 3W6FA 1LMPA 5E4PA 1LZ5A 3ATOA 4KL7A 1GEVA 1GBXA 2DQFC 4XJBA 3W6CA 3M3UA 2H5ZA 5KKIA 1IVMA 1NQIA 4OWHA 1B7LA 5FSTA 1YAPA 2A7DA 5KXOA 1ZMYL 1HEWA 4YEOA 4C3WA 2F2NA 1GB5A 3M18B 1IP2A 3B0KA 5I5QA 2MEIA 1YAOA 1H6MA 1OUIA 1IWXA 1GWDA 4CJ2A 1B5UA 1GFKA 4NHTA 4UWUA 4I0CA 4G49A 3ULRA 1LHLA 4BADA 133LA 4PGJB 1FBIX 1EQ5A 3WYHA 4WLDA 5LA8A 1CJ9A 1REXA 4CGEA 2DQHY 1OUAA 1JTOL 2XJWA 3WU7A 4C5FA 1YAQA 1LZYA 1BWIA 1ALCA 1IY4A 1HFXA 2IHLA 3B0IA 3EMSA 3IWRA 2NWDX 1CKCA 3A92A 3N9AA 1B5YA 4KPMA 1C10A 4M6DA 2ZYCA 4G4CA 4CFPA 3EO5A 3G3BB 2YBMA 3QNGA 4NGOA 1CKGA 2Z2EA 5AMYA 1C43A 2H9KA 4DC4A 1GAYA 4NSJA 2BQOA 1LJNA 5IHGA 1YANA 4H92A 4H94A 4M4OA 1GE4A 2B5ZA 3P65A 1G7IC 1JKAA 2DQEY 1B5WA 2MEBA 4R0FA 4TSCA 3W6EA 4D9ZA 1IP4A 1IWTA 5L3IA 5KJ9A 3FI7A 1J1PY 1LMNA 4NHPA 2FBBA 2G4QA 5LVGA 2BLXA 1GFGA 2CJLA 1INUA 1DI5A 1KIQC 4LT3A 2CGIA 1GFUA 4XJHA 2LYOA 5LINA 3CB7A 1JIYA 4AXTA 1GF6A 2D4JA 1B7NA 1LZEA 1UUZC 2DKVA 1GFEA 4H9BA 4Z98A 4H91A 1B7RA 1B5ZA 1XEJA 4WM3A 4BAPA 3RT5X 1IP7A 1OUBA 2Z37A 5B07A 2ZQ4A 3TXGA 5FCPA 4EOFA 3W6DA 3TXHA 3A3QA 2ZWBA 9LYZA 1WQRA 1IC4Y 5HNLA 2HEFA 3TMWA 2FYCA 3TMVA 4B4JA 1IOCA 5I53A 5IELA 5ILCA 4ETBA 3P66A 4FJRA 1GFJA 1BVKC 4UWVA 4NGJA 4TX7A 1WQMA 1OUGA 2GV0A 1B5XA 3N9EA 1G7HC 4YENA 6LYTA 7LYZA 5A3ZA 4LT2A 4U3XB 3TXIA 4DD9A 1FKQA 2HEAA 1IP5A 1VDQA 1GB8A 1TAYA 3A3RX 4IJ4A 1MELL 5LYZA 2YBIA 3WUAA 1HERA 1OQMA 4N0JA 2ZILA 1I20A 5LVHA 5EBHA 3A34A 4MR1A 4KXIA 1LHJA 1GB2A 3EXDA 2MEHA 1GB0A 2BQDA 1BB5A 5LVKA 3RU5A 1OUFA 3GXKA 5IDDA 1AZFA 1UIGA 3AJNA 1IY3A 4PJ2C 1LOZA 5LAFA 1QUTA 4AGAA 1F6RA 1RI8B 1DKKA 2YVBA 4NG8A 5FDJA 5C6LA 3TMXA 3B6LA 1ZVHL 5KXLA 3LZ2A 1GE1A 1IR9A 1VAUA 2BLYA 3AZ6A 4HPEA 4NGLA 4XJDA 4DD0A 4IATA 134LA 2G4PA 2ZNXY 1LYZA 3ZVQA 1ZVYB 1QQYA 4J1BA 4Z3MA 1NBZC 1NDMC 2CWIA 1GHLA 1DPXA 1GBSA 1JTTL 1TBYA 1YAMA 3LYMA 4H9IA 5B1GA 1TDYA 4NHIA 1FDLY 1GBZA 1IIZA 1HHLA 1JWRA 2Z38A 2D4KA 3E3DA 1W6ZA 1A4VA 193LA 1XGTC 1LZBA 2F4AA 4H90A 1LHIA 2DQJY 4B1AA 2X0AA 1SLYA 4NWHA 1LSPA 1IWZA 2BQHA 1XSFA 3WL2A 1LJGA 1WTMA 4LYCA 1IO5A 4WM4A 2I26L 4B4EA 1B9OA 1OUHA 1C7PA 1JEFA 1XGRC 4MCKA 1HMLA 4QEQA 5F9XA 3A90A 4A7DA 2DQIY 5APEA 1BQLY 1GDWA 1LZGA 4W96A 1XEIA 3WW6A 1NF5A 4PPOA 1HELA 1BVXA 4WLTA 4HTQA 1IR7A 2W1YA 4ZEEA 2I6ZA 4XYYA 4H93A 4DD2A 3KAMA 5KXYA 3QY4A 5M1YA 4NSHA 5APCA 1BB6A 2G4NA 5B05A 2XBSA 3LYZA 4H9CA 1GFRA 4DDAA 1LJKA 2DQGY 1UIEA 3A91A 5KXMA 3A6CY 1JKCA 3OJPA 4E3UA 4ETEA 3K3TA 4XJGA 3WXUA 2YBNA 5KXWA 5LVJA 4GCCA 2Z18A 1IC5Y 2HEBA 4NWEA 4OWAA 1IP6A 2BQBA 2W1XA 5KXPA 5T3FA 1IP3A 1GDXA 2HECA 2DQAA 2FBDA 4ETCA 3ATNA 1LKRA 4N8ZA 135LA 1YL0X 1NHEA 2EPEA 3A8ZA 4HJVA 5HLLA 5LYMA 3RW8A 5K7OA 1DI4A 1GE3A 1C08C 4EMNA 5I54A 1LSAA 4WM6A 3CSQA 4HPIA 3QE8A 1GFHA 1B5VA 1YQVY 3F6ZA 3T36A 3MGWA 1G7MC 1YROA 3A95A 1LZCA 3AZ4A 2LZ2A 1GBOA 1GE0A 1LJ4A 1REZA 2MEEA 1GFVA 2F30A 5KKJA 5D5FA 1LYOA 3IJUA 1GD6A 2BQCA 4LT0A 2D91A 1KXYA 4GLVA 4UWNA 3BKHA 1IP1A 1LSFA 1LSCA 4ETDA 1LZDA 1VEDA 3CT0A 1LJIA 3CT1A 3J4GA 1IWVA 4J1AA 4WL7A 2DBTA 1QTEA 1LMTA 2IFFY 1FLWA 3AW6A 4NGIA 1UIAA 4X3BA 4GN5C 4RW1A 3G3AB 3W6AA 2YBJA 3P68A 5ILFA 5KXXA 2LYMA 1NKHA 1LSEA 1J1OY 1DKJA 1UC0A 4DD7A 4PRQA 1UIFA 1AT6A 4H9AA 1BWHA 207LA 3WPKA 6LYZA 4HTNA 4DWXA 1VDPA 4NGKA 5L9JA 1HEPA 5L3HA 4NSIA 1FKVA 4KT3A 4CHXA 1F10A 4OOOA 4II8A 1UCOA 1XEKA 4XJFA 5LAGA 4H8YA 1JSEA 1WQPA 1I1ZA 1WTNA 4HJZA 5KXTA 1V7TA 3P64A 5APDA 3B72A 1D6PA 2XTHA 1FLQA 1OUDA 1UIDA 1DPWA 2Z12A 4TWSA 1KIRC 4QGZA 1LHMA 4B0DA 1ZV5L 4H9FA 5LYTA 1W08A 4LYTA 1IOSA 1D0LA 2Y8PA 4RLMA 4Z46A 4NSGA 1NDGC 1LJEA 2DQCY 1LSMA 1LJJA 4H8ZA 1GF5A 2C8PA 1B7QA 1LMCA 1GBWA 2HTXA 1IX0A 2RSCA 4P2EA 208LA 4H9EA 2Z39A 4BAFA 3TXBA 1GF9A 2Q0MX 4ET9A 1CKFA 5DLAA 1IWYA 1LZNA 1FLYA 1BHZA 4OW1A 3WUNA 4YEMA 2MECA 1GF7A 4LYBA 1GB3A 1GFAA 3CSRA 1FLUA 4YM8A 1JUGA 2PC2A 1LSGA 2LHMA 3VWOA 5KXRA 1XGQC 5LXWA 1GF3A 3TXDA 4FDYA 1JJ0A 1LJ3A 5JENB 1SQ2L 1NMMA 4GCBA 4LGKA 4ETAA 5HQ1A 1TCYA 1CKHA 2BQIA 2W1MA 1LKSA 5DN5A 5KXZA 1DQJC 1YIKA 132LA 4RDSA 3W3EA 4XN6A 1RCMA 1LZAA 4G9SA 2BQKA 1GB9A 1QDRA 1JKBA 3OK0A 1OUEA 1CJ7A 1IEEA 1LYYA 4TTDA 3WVYA 1LZ8A 5B59A 1Z55A 1A2YC 5B1FA 4XJIA 3RNXA 4NIJA 2YBLA 4LYZA 3AZ7A 1LCNA 1GF0A 2HUBA 2Z19A 4PRUA 3ZVQB 1DZBX 3AGIA 1C46A 1UIHA 2W1LA 4LFXA 3AGHA 3WPJA 2ZIKA 2BQFA 5B06A 3WW5A 2WARA 2ZIJA 2F4GA 1UBZA 1JJ3A 5KXKA 1XGUC 2BPUA 2I25L 4HJYA 4OWBA 4ZIXA 1WVUA 1OUJA 4OWCA 1JSFA 5KY1A 2BQNA 4NGYA 4BS7A 5FEKA 5I4XA 5I4YA 2BQJA 1F6SA 2YBHA 3WU8A 1JHLA 1IWWA 4HV1A 1TEWA 5APFA 4ANRA 1HSXA 2YDGA 1YL1X 4WMGA 1GFTA 4GCFA 3HBEX 1H87A 1PZYA 1D9UA 4HV2A 2FYDA 1C45A 1GXV2 1HENA 4ET8A 5F14A 1HFYA 1YILA 5HNCA 3AZ5A 1VATA 1HMKA 4LFPA 3W6BA 1LMQA 1WQOA 3P4ZA 4H1PA 4PHIA 1O23A 2DQDY 4GN4A 1D0MA 3LZTA 4TSBA 3EBAB 3LHMA 4N1CC 4OOTA 5LA5A 1CJ6A 4N9RA 2H9JA 2EIZC 1LPIA 3A94A 5FELA 3WUMA 1IC7Y 2EKSC 1KIPC 1GB7A 3CSZA 1LJHA 2LZTA 4GN3A 4DYGA 4HSFA 1UIBA 2BQMA 4R6CA 1G7LC 5FHWA 1WVVA 1D0KA 1LJFA 1GBYA 1UICA 1HFZA 4B4IA 3N9CA 1LMOA 1IORA 4NGZA 4TUNA 4WG7A 5F16A 3TXEA 1N4FA 2BQEA 1XFPL 5C6JA 1JKDA 1GF4A 5HMJA 1YKYX 3AW7A 1LSYA 1QSWA 1KXWA 4NY5A 4NGWA 4LYOA 3TXKA 1D6QA 4NHQA 1XGPC 4HTKA 5DM9A 1LZSA 2BQAA 4N5RA 4NHSA 3HFMY 1P2CC 1KXXA 4LYMA 4DDBA 1HF4A 3TMUA 3WPLA 3ZEKA 1QIOA 1BB3A 1JPOA 3GXRA 4O34A 4YOPA 4YF2A 1J1XY 4WL6A 4ZFPA 1BB4A 1EQEA 1NBYC 3T6UA 1B2KA 3CT5A 3WULA 3RZ4A 1HSWA 2ZNWY 4I8SA 4OWEA 1REMA 5F81A 1HEQA 3A6BY 194LA 2N5ZA 1DI3A 4WM1A 3AB6A 3HBHA 1LTMA 4G4BA 4J0LA 1LSZA 4WLYA 1RJCB 1GB6A 2D4IA 3TXJA 1LZ9A 1HNLA 3SP3A 1PS5A 5LVIA 1LZ1A 1AT5A 1QUSA 3AYQA 2EQLA 2MEAA 1UA6Y 1B7SA 3FE0A 1LHHA 4B49A 1JITA 3J6KA 3LYTA 8LYZA 4NEBA 4QY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GCDA 1OUCA 1B7PA 4G4HA 3A96A 1L65A 1IOQA 2A7FA 1JISA 1L0JA 4DD3A 3K2RA 4WM5A 2BQLA 1GEZA 1RE2A 1CJ8A 1P56A 5LIOA 1L61A 1FN5A 3WU9A 1L32A 1LAAA 2AUBA 1LSBA 107LA 1DYDA 1LYSA 1DYAA 1LSNA 4L41A 1LYJA 1B0DA 1DYCA 3GUNA 1LZ6A 3G3XA 3GUIA 1YKZX 1AM7A 2D6BA 1VDSA 1QTKA 2Z2FA 1C6LA 2BAAA 2HEEA 2IGCA 2YSSC 2HU1A 3C8SA 3WVXA 1HEOA 2VB1A 1GE2A 1NHBA 1UACY 158LA 3A93A 1QSAA 4H9HA 5HMVA 1YKXX 216LA 4MSTA 5D5CA 3W6FA 3V2YA 5E4PA 1L45A 3ATOA 1GBXA 3GUOA 3M3UA 4OWHA 1QUDA 2HULA 245LA 1GB5A 3M18B 3B0KA 1LW9A 2MEIA 1B5UA 1GFKA 4NHTA 1QS5A 1K28A 4I0CA 4G49A 4BADA 4PGJB 2DQHY 1L11A 1YAQA 3B0IA 3IWRA 2NWDX 4OO9A 4CFPA 1L07A 210LA 2YBMA 1PQOA 3C8QA 4NGOA 3QNGA 1T6HA 4EPFA 4DQ5A 1GAYA 4NSJA 1YANA 4H92A 4H94A 2B5ZA 3P65A 258LA 1P46A 4TSCA 5KJ9A 2G4QA 200LA 2LYOA 168LA 1JIYA 1GF6A 1LZEA 1UUZC 2DKVA 4H9BA 255LA 1XJUA 4H91A 1B5ZA 4WM3A 4BAPA 2Z37A 238LA 5FCPA 9LYZA 2HEFA 2FYCA 5ILCA 262LA 4FJRA 1BVKC 1L03A 2OEAX 1B5XA 1G7HC 4W59A 1L04A 5A3ZA 3TXIA 1L37A 4DQ7A 1CV1A 1TAYA 2RH1A 1HERA 1L88A 1OQMA 1L62A 1I20A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WO9 A;  1CKD A;  1OUC A;  4GCD A;  1GXX A;  5A3E A;  1EL1 A;  154L A;  1B7P A;  4G4H A;  1IWU A;  3A96 A;  1IOQ A;  4W94 A;  2A7F A;  4WM2 A;  3BKV A;  1JIS A;  2CDS A;  1JJ1 A;  1REY A;  1LMA A;  3D9A C;  4XEN A;  2C8O A;  4DD3 A;  1G7J C;  2MED A;  4N1E I;  4DDC A;  2MEG A;  1T3P A;  2BQL A;  4IAS A;  4RW2 A;  4WM5 A;  1GEZ A;  4NFV A;  4XAD A;  1IOT A;  1RE2 A;  1CJ8 A;  4WLX A;  5LIO A;  3CQL A;  1HEM A;  1FN5 A;  1LSD A;  1WQN A;  2HED A;  3WU9 A;  1LAA A;  1GAZ A;  4LT1 A;  1LHK A;  2AUB A;  1LSB A;  1DXJ A;  1LYS A;  1NWG A;  4L41 A;  1LSN A;  3B0O A;  5DL9 A;  5DN4 A;  3TXF A;  2ZYP A;  1B0D A;  3D3D A;  5E9R A;  4DT3 A;  1HC0 A;  1E8L A;  5C6I A;  1T6V L;  4NGV A;  1LZR A;  1LZ6 A;  1EQ4 A;  1YKZ X;  3WH1 A;  1AKI A;  1I56 A;  1AM7 A;  5I4W A;  2D6B A;  4GCE A;  4CFO A;  3LN2 A;  2BQG A;  3AGG G;  1CNS A;  1VDS A;  4J7V A;  1QTK A;  1VFB C;  3HBD A;  1OP9 B;  1MLC E;  4QDN A;  2Z2F A;  3WMK A;  5II3 A;  2XBR A;  1IR8 A;  4HP0 A;  2BAA A;  2HEE A;  3A67 Y;  4GLA A;  2MEF A;  2YSS C; 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 4H1P A;  4PHI A;  1O23 A;  2DQD Y;  4GN4 A;  1D0M A;  3LZT A;  4TSB A;  3EBA B;  3LHM A;  4N1C C;  4OOT A;  5LA5 A;  1CJ6 A;  4N9R A;  2H9J A;  2EIZ C;  1LPI A;  3A94 A;  5FEL A;  3WUM A;  1IC7 Y;  2EKS C;  1KIP C;  1GB7 A;  3CSZ A;  1LJH A;  2LZT A;  4GN3 A;  4DYG A;  4HSF A;  1UIB A;  2BQM A;  4R6C A;  1G7L C;  5FHW A;  1WVV A;  1D0K A;  1LJF A;  1GBY A;  1UIC A;  1HFZ A;  4B4I A;  3N9C A;  1LMO A;  1IOR A;  4NGZ A;  4TUN A;  4WG7 A;  5F16 A;  3TXE A;  1N4F A;  2BQE A;  1XFP L;  5C6J A;  1JKD A;  1GF4 A;  5HMJ A;  1YKY X;  3AW7 A;  1LSY A;  1QSW A;  1KXW A;  4NY5 A;  4NGW A;  4LYO A;  3TXK A;  1D6Q A;  4NHQ A;  1XGP C;  4HTK A;  5DM9 A;  1LZS A;  2BQA A;  4N5R A;  4NHS A;  3HFM Y;  1P2C C;  1KXX A;  4LYM A;  4DDB A;  1HF4 A;  3TMU A;  3WPL A;  3ZEK A;  1QIO A;  1BB3 A;  1JPO A;  3GXR A;  4O34 A;  4YOP A;  4YF2 A;  1J1X Y;  4WL6 A;  4ZFP A;  1BB4 A;  1EQE A;  1NBY C;  3T6U A;  1B2K A;  3CT5 A;  3WUL A;  3RZ4 A;  1HSW A;  2ZNW Y;  4I8S A;  4OWE A;  1REM A;  5F81 A;  1HEQ A;  3A6B Y;  194L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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