4OW1A

Crystal structure of resuscitation promoting factor c
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
GPSPNWDAVAQCESGGNWAANTGNGKYGGLQFKPATWAAFGGVGNPAAASREQQIAVANRVLAEQGLDAWPTCGAASGLPIALWSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The RpfC (Rv1884) atomic structure shows high structural conservation within the resuscitation-promoting factor catalytic domain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Resuscitation-promoting factor RpfC
total genus 24
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B, E, S, T, U, W, X
ec nomenclature ec 3.-.-.-:
pdb deposition date 2014-01-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ow1A00
1VEDA 1BGIA 4KT3A 3CSQA 2W1XA 1A4VA 4QGZA 3A94A 3AYQA 5LYMA 1GB8A 3G3AB 3A67Y 1UC0A 4PPOA 1I20A 1LSZA 1NKHA 2DKVA 4NG1A 1OUJA 1BWIA 2LZ2A 4LYBA 4LYMA 4QDNA 4NEBA 4ETEA 1LZ6A 1T6VL 1LTMA 4G4CA 1HMKA 3AZ7A 1FLUA 4O34A 2HEDA 1CJ9A 207LA 208LA 2DQCY 3WU9A 3A90A 3WPLA 1PS5A 4HTKA 4XN6A 2C8PA 1UCOA 1W6ZA 1IWXA 4H8YA 4CFOA 1GE0A 4H8XA 1C7PA 5KJ9A 1IY3A 5I53A 4BS7A 1O23A 1NHEA 1LSNA 1B0DA 2DQDY 1OUHA 4H94A 1LZ1A 1SQ2L 1DPWA 1IOQA 1CKCA 2ZQ4A 3AGIA 1GE4A 1HSXA 1IWYA 1QQYA 2F2NA 1LZ4A 1GF6A 1F0WA 1RI8B 4HP0A 1JKCA 2ZYCA 1KXYA 4NHTA 1DI4A 4U3XB 4NWEA 2MEAA 4XJFA 3TMVA 5J7CA 2HEBA 2HEFA 4PJ2C 1B5YA 5EBHA 4HJVA 4MCKA 4WM3A 2YBMA 1ZV5L 5LA8A 5LAGA 4C3WA 1HHLA 4TSCA 2CJLA 1IOCA 5HMJA 4WM4A 1GB5A 132LA 2MEBA 1LAAA 4NSHA 1IR7A 1IWUA 1GBWA 1HNLA 3TXIA 4H9EA 2B5ZA 1HSWA 3WH1A 4PHIA 2DQHY 2ZYPA 5C6JA 1IY4A 4ZFPA 4GLAA 1BB6A 1FN5A 1QUSA 4XJHA 1GB7A 2EKSC 1REXA 4NHPA 4NGZA 1ALCA 1FBIX 4LT2A 3SP3A 1PZYA 5L3IA 1LKSA 3G3BB 2ZNXY 9LYZA 2D4JA 1LMPA 1VAUA 4CJ2A 1A2YC 2LHMA 3WXTA 5FCPA 5IHGA 1H87A 3AW6A 4G4HA 1WQNA 2MECA 4DYGA 1LZBA 2LZTA 4XYYA 4H9AA 4DD0A 5KXLA 1IP6A 4ETBA 1BB7A 1JKBA 3KAMA 2ZQ3A 4B0DA 5HNLA 1IWWA 4L41A 5C6LA 2LYMA 4B1AA 5APFA 4ET9A 3LYOA 4W96A 1G7LC 1HEMA 3EXDA 4E3UA 5KXWA 1HC0A 5FDJA 1XEJA 4AGAA 1IP5A 2FBDA 2CWIA 1LPIA 5FHWA 4CFPA 1GFUA 3W6AA 4OWEA 4NSJA 1DZBX 1GBSA 3A3RX 4DC4A 1D0MA 4WL7A 1B7MA 4J1AA 1FDLY 1IIZA 1LJEA 1YIKA 1LZDA 2LYZA 3D3DA 4A7DA 1QTEA 5LVHA 1B7OA 1LMQA 4NHQA 4FDYA 4N1CC 2ZIJA 3ATNA 1GE1A 2MEGA 1HELA 1GXXA 1NBYC 1GB9A 1JPOA 1RJCB 2BQEA 4WLYA 5KXXA 1AZFA 2MEEA 3BKVA 1LHMA 3TXEA 193LA 2HUBA 1INUA 1LYYA 3ZVQB 4OWBA 1HMLA 1GB3A 1SLYA 154LA 3RW8A 1AM7A 3P66A 5IDDA 4N9RA 1AKIA 1GEVA 1NWGA 3AZ5A 5KXRA 1OUFA 3A92A 1AT6A 1QTKA 5K7OA 5KKJA 4B4EA 1B5UA 4H93A 1RFPA 1XSFA 3QE8A 1BB4A 3BKHA 3RT5X 3GXKA 2DBTA 2HECA 4HSFA 4OOTA 4ETCA 8LYZA 1GDWA 1GF5A 1HFYA 2YBIA 4UWUA 1YAQA 4YENA 3WUAA 3RNXA 4DD1A 4DT3A 1C45A 4DD3A 1F6RA 1GDXA 1GWDA 5FSTA 3LN2A 2D6BA 4ETAA 1FKVA 1UIBA 4H8ZA 3WVYA 1LJIA 194LA 1REYA 4BAFA 4QY9A 5KXTA 3CT0A 3ZEKA 3CB7A 1QSAA 1HENA 2N5ZA 4WL6A 3LYTA 4WM5A 2YBNA 5KKIA 2D4IA 4WMGA 1YAMA 2MEDA 4OW1A 1OQMA 5LINA 1C10A 1LJFA 1GBYA 5C6IA 3A96A 4HV1A 4IJ4A 3HBHA 2BQMA 1KIQC 4YEMA 1OUIA 4C5FA 2IFFY 1GFGA 4RW2A 5I4XA 1YKYX 2XBSA 4N0JA 3WPKA 1REZA 4CHXA 3B6LA 2HEEA 4GN4A 4NGJA 1RE2A 4AXTA 3QY4A 1LZAA 2I6ZA 4GCBA 4LFPA 3WULA 5A3ZA 1JISA 5KXYA 4DDCA 3B0OA 1EQEA 1JKAA 1QDRA 4HV2A 1KXWA 5LIOA 2ZIKA 5DL9A 3OK0A 5IELA 2BQHA 3AW7A 1XGQC 3LYMA 1FLWA 4N1EI 1IP3A 4UWVA 1TAYA 5ILFA 1CJ7A 3CSRA 1IWTA 1DKKA 4H92A 4H9CA 2BQJA 1UA6Y 135LA 1I1ZA 1D9UA 4N8ZA 1W08A 1VDSA 4YOPA 1GAYA 4KXIA 2DQAA 1IVMA 5FEKA 1B2KA 1LCNA 1VDTA 2F4GA 1VDPA 1JSEA 1LJNA 2VB1A 5I54A 3K3TA 1LJKA 1Z55A 3ULRA 3B0KA 1P2CC 3AB6A 4RLNA 2BAAA 2CGIA 4LFXA 4LYZA 2D91A 1DI5A 1YL1X 2BQOA 4H91A 2I26L 5KXSA 2G4NA 4I8SA 1LMAA 1OUBA 1LYSA 1NMMA 1YROA 2MEHA 1FKQA 2A7FA 2YBHA 3CT5A 3IJVA 3AGGG 1GFTA 4YEOA 3EBAB 4LT1A 2YSSC 3QNGA 1XFPL 4HTNA 4NWHA 1LSBA 1GFEA 4GLVA 4NHIA 1LJ3A 3ZVQA 1IP7A 4LZTA 2HTXA 4PRQA 5DM9A 1LHHA 3WVXA 4ANRA 3LYZA 3RZ4A 1LJ4A 1GBZA 4TSBA 1BVKC 1GFKA 2HU3A 4R0FA 4YM8A 1KXXA 1LHJA 1UIDA 1DKJA 4WLTA 1JJ1A 4XADA 1JJ0A 4MSTA 1B7PA 4IATA 4LYTA 1HEOA 1C08C 4NGOA 1JUGA 1LMTA 1TBYA 1LYZA 4J0LA 4B49A 3FE0A 2YBLA 1YL0X 1D0LA 3N9EA 4GCDA 2Z18A 1IWZA 134LA 1UIAA 3HBEX 4GCCA 4NSGA 5LVIA 2H9KA 4PGJB 4TUNA 4W94A 1BQLY 3TXGA 1GB6A 2G4QA 1LHLA 1IR8A 4QEQA 1LKRA 4HJYA 3A6CY 1NQIA 1B7QA 1B9OA 5F9UA 1UIEA 1H6MA 2I25L 2FYDA 1IP4A 2Z39A 1E8LA 1HF4A 4KPMA 1IP1A 3LHMA 4EOFA 1TEWA 1QDTA 1F10A 1LZEA 1IR9A 1ZVYB 1D0KA 1LSAA 2XJWA 2Z38A 4OWAA 5HQ1A 5M1YA 1YKZX 2Z37A 3FI7A 1LSCA 5D5FA 3A6BY 5B59A 1REMA 2WARA 1IWVA 4OOOA 1XEIA 4NHSA 5F14A 4WLDA 2Z2EA 1LSDA 5T3FA 1FLQA 5B05A 4TTDA 4FJRA 1D6QA 2BQDA 4WM6A 3MGWA 5LVKA 2F30A 1QIOA 1IC7Y 4NGIA 1LZ9A 4D9ZA 2H9JA 1LYOA 1LSMA 1NF5A 1G7MC 5KY1A 2BPUA 5APEA 1GXV2 5B1FA 1B5WA 4Z3MA 1GFJA 1B7RA 1D6PA 2BQCA 1YKXX 4J7VA 1DQJC 1UUZC 4MR1A 2BQAA 1J1OY 1LSPA 1JIYA 3A93A 5JENB 1HFXA 1GE2A 4M4OA 1EL1A 2W1LA 4LGKA 1GFVA 1GF3A 1VFBC 2H5ZA 3P4ZA 1UACY 3TMXA 1YAPA 3WUNA 1YILA 4H9HA 1XGPC 1B5XA 4LT0A 3LZ2A 1LZ8A 1LMCA 4NGVA 3CT1A 1JEFA 1NDMC 3WUMA 1GF4A 1WQMA 1YQVY 3A34A 3RU5A 4Z46A 1GEZA 1GF9A 1XGRC 1AT5A 1FLYA 1UIFA 1WQRA 4NGKA 5KXNA 1GFRA 3N9AA 1GFAA 4WM2A 3VWOA 4H9BA 3J6KA 1MELL 4DD9A 1JTTL 4II8A 4WO6A 1BWJA 1B5VA 1JTOL 3A95A 3TMWA 1GAZA 1JWRA 3J4GA 4DDAA 4EMNA 5ILCA 3B0IA 1LJJA 1LSYA 4J1BA 3AZ4A 5FELA 3OJPA 3M3UA 1LZGA 2NWDX 5A3EA 5F81A 1LZNA 1XEKA 3AGHA 5L9JA 5LYTA 3N9CA 4OWHA 4B4IA 1TCYA 4XENA 4RW1A 1V7TA 1CJ6A 2DQEY 2Q0MX 4H9IA 1IORA 1HEPA 1GFHA 3D9AC 4XJDA 3CSZA 5B1GA 1HFZA 1IC5Y 4NGLA 3WL2A 1B7SA 4ZIXA 2HU1A 1WVUA 3AZ6A 4H90A 4NY5A 4P2EA 2ZILA 2D4KA 4LYOA 1LHKA 4XJBA 1CKFA 5I5QA 4YF2A 1VDQA 4ET8A 5KXKA 1NDGC 1G7IC 1CKDA 1GF0A 3HBDA 3M18B 2XTHA 1B5ZA 4G9SA 1YANA 1JHLA 5F9XA 2FBBA 4GN3A 1HEWA 4NGWA 4WLXA 3WMKA 2EPEA 1EQ5A 1OUEA 1IO5A 1IC4Y 1XGUC 2FYCA 3F6ZA 4TX7A 5DLAA 1OUCA 3A91A 4DDBA 1GE3A 1LJGA 1WTMA 3TXKA 3WPJA 2BQIA 1JSFA 3B72A 1JITA 5DN4A 1JTPL 3T6UA 1CKGA 3TXDA 5LXWA 3P65A 4CGEA 1GB2A 5HNCA 4WO9A 5KXPA 2DQFC 3WYHA 2MEIA 2DQGY 4WOAA 4NGYA 3IJUA 1UIHA 2BQNA 1GHLA 4WG1A 1WQOA 1YAOA 1BHZA 1LOZA 2DQIY 3TXBA 5E9RA 1DXJA 1LSFA 1UBZA 3TMUA 4ETDA 2AUBA 1J1XY 1LSGA 2EIZC 2LYOA 4KL7A 4OWCA 4PRUA 1KIPC 1CKHA 5KXOA 1OUDA 4GCFA 1DI3A 4H9FA 1VATA 4Z98A 3IWRA 2Z19A 1LMOA 4BAPA 1RCMA 1OP9B 3ATOA 4HPEA 4NSIA 1LZRA 3W6CA 4TWSA 5E4PA 4LT3A 1BWHA 1J1PY 1IX0A 1IEEA 1ZVHL 1JKDA 2BQKA 1LZSA 1WTNA 1LZTA 3E3DA 1MLCE 1UIGA 4LYCA 2CDSA 4DD7A 1G7HC 4B4JA 1WQPA 4RDSA 3T36A 3W3EA 5KXMA 2YVBA 6LYZA 3A8ZA 5HLLA 2BQBA 2BQLA 2Z12A 2Z2FA 4G49A 5B07A 2BLXA 3W6EA 3WU8A 5LVJA 5II3A 5B06A 2C8OA 4NFVA 2HEAA 3W6DA 1LZ5A 1T3PA 5AMYA 5F16A 4BADA 2GV0A 4X3BA 3HFMY 5HMVA 2YDGA 4XJGA 5DN5A 2DQJY 1DPXA 5APDA 5KXZA 6LYTA 4DD2A 3A3QA 3EO5A 2PC2A 4HJZA 1LHIA 4DWXA 3P64A 1GD6A 4G4BA 2W1MA 2ZNWY 5LAFA 1B7LA 153LA 1BB3A 4NIJA 4UWNA 4Z41A 2RSCA 5LVGA 1GPQC 1QUTA 1GF7A 3GXRA 4HTQA 1HERA 4ZEEA 5D5CA 1G7JC 2BQFA 1KIRC 1GB0A 4NG8A 5I4YA 1IOTA 1IOSA 3WW6A 1IP2A 5APCA 1XGTC 4GCEA 1GF8A 3W6FA 4GN5C 2MEFA 2EQLA 3P68A 4WM1A 3W6BA 2YBJA 4I0CA 2XBRA 4N5RA 1LJHA 3TXJA 2G4PA 3TXHA 1LMNA 1CNSA 4H1PA 1QSWA 3CQLA 1TDYA 1V7SA 133LA 4RLMA 1LZYA 3EMSA 3WU7A 1BVXA 1GBOA 1B7NA 1C43A 1NBZC 1OUAA 2BLYA 5I4WA 3WXUA 2Y8PA 4HPIA 4WG7A 1JJ3A 1UICA 1ZMYL 2A7DA 2BQGA 7LYZA 2X0AA 1WQQA 1I56A 3LZTA 3TXFA 4IASA 1GBXA 1OUGA 5LA5A 1WVVA 5LYZA 4R6CA 1N4FA 1F6SA 2ZWBA 1BB5A 1CJ8A 2W1YA 3AJNA 1EQ4A 4ML7A 3WW5A 2IHLA 1C46A 1LSEA 1LZCA 5L3HA 2F4AA 4M6DA 1HEQA 4XJIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A67Y 4LZMA 2DKVA 4NG1A 1QUGA 2LZ2A 4QDNA 4LYMA 1QTVA 4NEBA 1LZ6A 1T6VL 4G4CA 1HMKA 1L77A 1PS5A 1OV7A 238LA 1C6GA 4H8YA 1L89A 1GE0A 5KJ9A 5I53A 1NHEA 1CKCA 1LZ4A 1GF6A 1RI8B 1PQJA 3GUIA 4NHTA 4U3XB 1DI4A 3C81A 3TMVA 2MEAA 1L21A 4PJ2C 4WM3A 1ZV5L 4C3WA 3SB8A 1ZWNA 177LA 1KW7A 1L94A 1GBWA 1L34A 3SBBC 3TXIA 3WH1A 5C6JA 4ZFPA 4GLAA 1REXA 4NHPA 1LYFA 1PQDA 1PZYA 123LA 2LHMA 5IHGA 4G4HA 4I7PA 1L22A 1QSBA 160LA 4I7NA 3KAMA 3SB5A 235LA 146LA 5APFA 3LYOA 1L54A 1OVHA 1D2YA 2CWIA 4OWEA 1GBSA 1L87A 4A7DA 1L05A 2LYZA 4DAJA 5LVHA 1WTHA 4NHQA 4WLYA 1JPOA 3C7ZA 3DKEX 1L03A 2RBSA 1L85A 4EKSA 1L12A 5IDDA 1NWGA 182LA 1OUFA 1AT6A 4B4EA 1P2LA 1RFPA 4H93A 3GXKA 4HSFA 1LYDA 8LYZA 1GF5A 1T8FA 4DT3A 5I14A 1F6RA 1GWDA 1DYFA 2D6BA 4ETAA 1FKVA 1G0LA 3F8VA 1LJIA 3WVYA 4QY9A 3CT0A 2B75A 118LA 1QSAA 3LYTA 2D4IA 3RZEA 5C6IA 1XEPA 3A96A 4IJ4A 2IFFY 1GFGA 4RW2A 5I4XA 4N0JA 1LWKA 3G3VA 2I6ZA 2RAZX 2HUMA 1QDRA 5IELA 3AW7A 1XGQC 1ZYTA 1TAYA 5ILFA 3PBLA 4W55A 1DKKA 1I1ZA 1W08A 2DQAA 5FEKA 1QS9A 1L44A 230LA 1L79A 1Z55A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VED A;  1BGI A;  4KT3 A;  3CSQ A;  2W1X A;  1A4V A;  4QGZ A;  3A94 A;  3AYQ A;  5LYM A;  1GB8 A;  3G3A B;  3A67 Y;  1UC0 A;  4PPO A;  1I20 A;  1LSZ A;  1NKH A;  2DKV A;  4NG1 A;  1OUJ A;  1BWI A;  2LZ2 A;  4LYB A;  4LYM A;  4QDN A;  4NEB A;  4ETE A;  1LZ6 A;  1T6V L;  1LTM A;  4G4C A;  1HMK A;  3AZ7 A;  1FLU A;  4O34 A;  2HED A;  1CJ9 A;  207L A;  208L A;  2DQC Y;  3WU9 A;  3A90 A;  3WPL A;  1PS5 A;  4HTK A;  4XN6 A;  2C8P A;  1UCO A;  1W6Z A;  1IWX A;  4H8Y A;  4CFO A;  1GE0 A;  4H8X A;  1C7P A;  5KJ9 A;  1IY3 A;  5I53 A;  4BS7 A;  1O23 A;  1NHE A;  1LSN A;  1B0D A;  2DQD Y;  1OUH A;  4H94 A;  1LZ1 A;  1SQ2 L;  1DPW A;  1IOQ A;  1CKC A;  2ZQ4 A;  3AGI A;  1GE4 A;  1HSX A;  1IWY A;  1QQY A;  2F2N A;  1LZ4 A;  1GF6 A;  1F0W A;  1RI8 B;  4HP0 A;  1JKC A;  2ZYC A;  1KXY A;  4NHT A;  1DI4 A;  4U3X B;  4NWE A;  2MEA A;  4XJF A;  3TMV A;  5J7C A;  2HEB A;  2HEF A;  4PJ2 C;  1B5Y A;  5EBH A;  4HJV A;  4MCK A;  4WM3 A;  2YBM A;  1ZV5 L;  5LA8 A;  5LAG A;  4C3W A;  1HHL A;  4TSC A;  2CJL A;  1IOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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