4OWAA

Carboplatin binding to hewl under sodium iodide crystallisation conditions
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Chemical conversion of cisplatin and carboplatin with histidine in a model protein crystallized under sodium iodide conditions.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4owaA00
5B59A 1J1PY 1HFYA 1IOTA 1BWJA 4NWEA 4H9HA 2G4QA 5LIOA 1IWZA 1LSBA 4WLYA 2BQKA 1IO5A 1GE1A 1LOZA 5E4PA 1CJ8A 3HBDA 4TWSA 5HMVA 4NGLA 1WTMA 1GBOA 1GEZA 1HMLA 1B7RA 1UIBA 3ATOA 3RT5X 4CFOA 3IWRA 3A90A 1IR8A 1JITA 3BKVA 1IP7A 7LYZA 4NSGA 1JHLA 1LZTA 2YSSC 2I6ZA 4NWHA 4OWAA 5T3FA 5KXOA 1LSGA 4NHPA 4QGZA 4GLVA 1GFHA 1HEWA 4LYZA 1IP3A 1GFKA 1IWVA 2HECA 1PZYA 1B2KA 1FKQA 1GFGA 1REYA 4U3XB 4H9CA 1BWIA 1OUEA 1LHLA 3A96A 4BADA 1GDWA 4HV2A 1LSAA 2MEEA 1IWXA 1LSEA 1T6VL 4PJ2C 5LXWA 2BQBA 1HERA 1QDRA 4YEOA 4OWHA 1CNSA 2EIZC 3CSRA 3HBHA 4TSCA 5IHGA 4UWVA 4NIJA 1IVMA 1IORA 1B0DA 1D0KA 2I25L 1CKHA 3A95A 4GCDA 2A7FA 4H90A 4XJBA 5KJ9A 1HENA 1REMA 4H93A 3LZTA 3W6EA 3TMUA 4PPOA 1IC5Y 2YBIA 3W6CA 4DD2A 1LPIA 2CDSA 1UICA 1B5XA 5LVJA 1OUIA 4GCFA 1UUZC 1WQRA 1WVVA 1YILA 3E3DA 5APEA 1UCOA 1V7TA 4B49A 4HV1A 1AT5A 5HLLA 1GB8A 3P68A 4GN4A 4NGVA 4WM6A 5DN5A 4WO9A 5KXLA 5KXKA 3T36A 1GFTA 1UIGA 2N5ZA 1GBSA 4LYBA 1DKJA 3AW7A 4O34A 4ET8A 5FCPA 1GFUA 3P65A 4W96A 1O23A 4HTKA 4Z98A 1GWDA 4A7DA 1DI3A 1IOSA 1HNLA 1P2CC 1GB9A 1LHIA 5C6JA 4EMNA 1GE0A 2DQCY 4LYCA 1RCMA 2DQJY 1E8LA 1H6MA 1LJNA 1GB7A 2XBSA 5F14A 1JTTL 4DD9A 1J1OY 1YAQA 5LAFA 1A2YC 3A67Y 4WG1A 3HFMY 1LJHA 1NBYC 2BQLA 1C10A 4WM2A 3LYZA 2EKSC 3WUAA 3HBEX 4YEMA 1IC7Y 2HEEA 5ILFA 4D9ZA 5KXMA 3J6KA 3B0OA 1B7LA 1LSDA 2ZIJA 6LYZA 3BKHA 5I4WA 1RFPA 4OWBA 1LZCA 4AXTA 1GF3A 1JUGA 2LYZA 5LVGA 1SLYA 1NQIA 2VB1A 2MEHA 5A3ZA 4LT3A 1BWHA 2LZTA 1LZ4A 5D5FA 3ZVQA 3TXEA 3G3AB 2BQGA 5LVIA 3QNGA 1NF5A 2W1XA 1FBIX 5LAGA 4H8ZA 1LZSA 4N9RA 4RLMA 1F6SA 2Z37A 2W1LA 4ETCA 3EXDA 1D9UA 2BQNA 4RLNA 2EPEA 3W6FA 1I1ZA 4ETAA 5KXTA 1IOQA 4G4CA 1LMCA 1IX0A 4NGIA 2IHLA 4LGKA 1OUDA 3AZ7A 1B5UA 1GHLA 1DKKA 4H91A 4LT0A 1LZ6A 2HEFA 4H9BA 2CWIA 4KL7A 4NFVA 3WVYA 4FDYA 1KIPC 1LHKA 2IFFY 4DD7A 4LFPA 4DC4A 3FI7A 2F2NA 1HFXA 2CGIA 1GAYA 5B06A 4N1EI 1GBXA 2HU3A 4BAFA 1LYSA 3TMWA 1HC0A 208LA 4NGKA 1XGPC 1LZAA 3WW5A 1LSNA 4Z3MA 3W6AA 2BQDA 2ZYPA 4H1PA 2YDGA 1GB2A 4NGJA 3FE0A 1C43A 1IY3A 4CJ2A 1B5WA 4N5RA 4AGAA 4N0JA 3A93A 5HNLA 1HEOA 4J0LA 3WYHA 5KKJA 3F6ZA 1LZ5A 1IWTA 1LMNA 2HTXA 2BQIA 2H5ZA 4NSIA 2Z19A 153LA 1MLCE 3WU8A 3LYMA 3RW8A 1FKVA 2LYOA 1IWWA 1LZNA 1JKAA 1HHLA 2C8PA 2FBDA 3CB7A 1GDXA 3OK0A 5IDDA 1ZVYB 4H92A 1ZMYL 4IASA 3TXKA 1Z55A 4WM1A 1LMOA 1CJ9A 2MEBA 3P64A 2HEDA 1W6ZA 4OW1A 1VEDA 5FEKA 3EO5A 1BB4A 4ETBA 3IJVA 1B7NA 1WQNA 1IP4A 4H9FA 1TCYA 1REXA 1NWGA 4XN6A 4M6DA 1T3PA 4XADA 2ZNXY 1MELL 4NGYA 1HEQA 5L3HA 3ZVQB 1REZA 4Z46A 2MEFA 5KXZA 2BQCA 1LKRA 4LYTA 1JKCA 1JISA 1LTMA 1VFBC 2G4PA 4H9AA 4OWCA 1LJGA 2D4IA 4HPEA 5APFA 5B1GA 1IP5A 1TEWA 4DT3A 1NBZC 1NDGC 1HF4A 2DQEY 4KXIA 1GBZA 3AZ4A 5APCA 1D0MA 3EBAB 1FLYA 4II8A 1UBZA 2ZNWY 5KXWA 3AB6A 4DYGA 5AMYA 1VDQA 5I4XA 1ZVHL 2DBTA 4KT3A 1DI5A 1GF0A 2ZYCA 1LZ9A 1DPXA 3TXFA 2HEBA 3A6CY 1CJ7A 5FHWA 1LYYA 2ZQ3A 1XGRC 2F4GA 4P2EA 1LCNA 3P66A 1DQJC 4LYMA 1WQPA 3KAMA 4PRQA 5DN4A 1VATA 1UA6Y 3EMSA 2YVBA 1DI4A 3B6LA 3CSQA 5LVKA 3B0IA 5LA5A 1BB7A 1I20A 3WPLA 1BVKC 1GF4A 2HEAA 4DD0A 1H87A 4H9EA 1TAYA 5I54A 3W3EA 1UIAA 5IELA 1QTEA 3TXBA 3TXIA 2BLXA 4B1AA 1IY4A 4OOTA 1XGQC 1YAPA 194LA 3CQLA 4NEBA 5L9JA 5HQ1A 4RDSA 1JTPL 3A94A 3ULRA 1JJ0A 1B9OA 3WXTA 1AT6A 2BQHA 4HP0A 3TXHA 4UWNA 3W6BA 4R6CA 1D0LA 1C08C 4WO6A 3TXJA 3LYOA 193LA 2YBJA 5KXYA 1BB6A 2D4KA 2ZWBA 1G7IC 1HEPA 3G3BB 2EQLA 4GCEA 1VDTA 2WARA 1IP1A 5APDA 4HTNA 2DQGY 3WH1A 2MEAA 5LYMA 2LHMA 1IP6A 3M18B 3TXGA 135LA 1OUBA 133LA 1KXXA 5HNCA 1QQYA 3WPKA 1LZYA 2Q0MX 2Z38A 1JJ1A 132LA 3CSZA 1GBWA 1GPQC 1C46A 4C5FA 1LAAA 2F30A 4J1AA 4QY9A 1OP9B 4YOPA 1V7SA 1XEJA 4WL7A 4I0CA 4XJFA 1LZGA 3AGIA 1B7PA 3AYQA 4CFPA 1GE2A 2FBBA 1BB5A 1HELA 3T6UA 3OJPA 3D3DA 4OOOA 1LMAA 4H9IA 1GBYA 4LYOA 4XENA 4MR1A 1FLUA 2BQMA 3WPJA 9LYZA 4NGWA 2DKVA 1EQ4A 1FLQA 2D91A 4NGOA 4NSJA 1LSMA 1OUAA 2LYMA 1BHZA 3B72A 2PC2A 1BVXA 1LZBA 2G4NA 2HUBA 3LZ2A 3K3TA 207LA 4WMGA 4BAPA 5D5CA 5KXSA 4YF2A 4HPIA 1HSWA 2XBRA 4H8XA 3A34A 1G7HC 1GF6A 3A6BY 2YBLA 3WMKA 2B5ZA 1LZ8A 4WOAA 1VDPA 1LJ4A 1LMTA 2DQFC 1QUTA 1JEFA 4XJIA 1EL1A 4HJZA 3AW6A 4R0FA 4PGJB 2Y8PA 4QEQA 4ZFPA 134LA 1B7QA 2DQDY 4WM3A 1IIZA 4UWUA 3AJNA 4X3BA 4LZTA 1TBYA 3WU7A 3AGGG 5EBHA 3AGHA 1DPWA 2X0AA 2BQFA 1LYZA 4W94A 4ZEEA 1XEKA 1LJ3A 1LJFA 1LHMA 4NG1A 4WM4A 2LZ2A 1LJJA 3AZ6A 1IEEA 2AUBA 2BQOA 1LZRA 1UC0A 3WU9A 1HEMA 1RE2A 3A8ZA 1YL0X 1B7SA 4HJYA 4B4JA 3WXUA 1B5YA 1HMKA 1QUSA 1YKYX 3CT0A 3LYTA 3N9EA 3GXRA 8LYZA 2BQJA 1LJIA 1LHHA 1KIQC 1UIDA 1NDMC 4G4BA 3CT1A 3QE8A 1LZEA 4GLAA 4NGZA 5DLAA 5DM9A 3TMVA 1JSFA 5LYTA 1JPOA 4C3WA 1BQLY 5LVHA 3RZ4A 4GCBA 1JIYA 4CGEA 1CKCA 1B7OA 4QDNA 2W1MA 1OUGA 4LT2A 2GV0A 1GB0A 1SQ2L 3VWOA 1CKDA 4J7VA 1OQMA 5B1FA 2CJLA 1IR9A 4PHIA 1LMQA 1LSCA 1OUJA 4WLTA 5B07A 1LSZA 2F4AA 1YL1X 5F9XA 3QY4A 3WVXA 1A4VA 4NHSA 2BLYA 3AZ5A 1XGUC 4GCCA 2ZQ4A 1J1XY 1UIFA 1WTNA 3N9CA 4Z41A 4NHQA 1B5ZA 1AZFA 5M1YA 1OUFA 1RJCB 4WLXA 4E3UA 1INUA 1CJ6A 1C45A 1VAUA 4RW1A 3WUNA 4H94A 2YBHA 4DD3A 4EOFA 4B0DA 1N4FA 4XJDA 1I56A 1LHJA 3GXKA 5LINA 5J7CA 1LJEA 4HTQA 1IR7A 1GF8A 4YM8A 5HMJA 1GD6A 1LJKA 1OUCA 5JENB 1F0WA 4B4IA 1EQ5A 2FYDA 4RW2A 5FELA 4NHTA 5I53A 5FDJA 4DDAA 1YIKA 4YENA 4HJVA 5II3A 1IWUA 2H9JA 2MEDA 1G7JC 1YKXX 1B7MA 6LYTA 1GXV2 5KKIA 1YKZX 1YANA 1GXXA 5KY1A 1NHEA 1YAOA 1GF9A 2A7DA 1GF5A 4OWEA 5KXRA 2BAAA 2D4JA 2XTHA 4WLDA 2H9KA 1JKBA 2MEGA 4XJGA 3J4GA 3RNXA 4NY5A 1XFPL 2BPUA 3B0KA 3LN2A 4XYYA 1JWRA 1GB5A 1GE4A 1IC4Y 1LZ1A 3A3RX 4LT1A 1UIEA 1OUHA 2FYCA 3MGWA 4HSFA 1G7LC 1YAMA 1TDYA 1CKFA 2Z2FA 5KXNA 1RI8B 1QSAA 1LZDA 1AKIA 1JKDA 1GAZA 1QDTA 1KXYA 2BQAA 4ANRA 1LSYA 4DD1A 4NSHA 4CHXA 1GFJA 2NWDX 1GB3A 2ZILA 4B4EA 1FN5A 2DQAA 4TSBA 1BGIA 1B5VA 5I4YA 3M3UA 4NG8A 3TXDA 1LSPA 4MSTA 4ETEA 1LYOA 2D6BA 1D6QA 1VDSA 2C8OA 4WM5A 4XJHA 3RU5A 2HU1A 1CKGA 2DQHY 1C7PA 2Z18A 3ZEKA 4ZIXA 1PS5A 3A92A 2W1YA 4DDCA 5DL9A 3P4ZA 1QTKA 4DWXA 2RSCA 4N1CC 4GN3A 4M4OA 1XGTC 1FLWA 4G9SA 1BB3A 1KXWA 5A3EA 4L41A 1ZV5L 5E9RA 3WL2A 1JSEA 2DQIY 1GF7A 1JTOL 1NMMA 1YQVY 4GN5C 1IOCA 5KXXA 1EQEA 1D6PA 2XJWA 4TTDA 5LYZA 4ET9A 4IJ4A 1WVUA 5KXPA 1WQQA 1LMPA 1KIRC 3A3QA 2YBMA 1GFEA 1UACY 2Z12A 3N9AA 1HSXA 1UIHA 4TUNA 1W08A 5F81A 5FSTA 5ILCA 4I8SA 1IP2A 4G49A 3W6DA 1GFAA 3WULA 2YBNA 1LKSA 4NHIA 4BS7A 1JJ3A 2Z39A 1AM7A 4G4HA 1G7MC 3IJUA 4TX7A 3WUMA 4WG7A 3ATNA 1XSFA 2Z2EA 4DDBA 4MCKA 4ETDA 5L3IA 5F16A 1F10A 5LA8A 3TMXA 3SP3A 1DXJA 4IATA 1ALCA 1GFRA 1WQMA 1XEIA 1IWYA 2ZIKA 2MEIA 2MECA 1NKHA 4FJRA 4ML7A 5I5QA 3LHMA 5K7OA 5C6IA 1LSFA 154LA 4H8YA 1F6RA 1HFZA 1QIOA 1DZBX 5F9UA 1GB6A 5C6LA 1FDLY 3A91A 1GE3A 2I26L 1GFVA 1WQOA 3D9AC 4J1BA 4LFXA 4PRUA 4N8ZA 1YROA 1QSWA 5B05A 4WL6A 2BQEA 3CT5A 4KPMA 3WW6A 1GEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2A4TA 1IWZA 1CU0A 1IO5A 1G07A 3HBDA 1C6KA 1HMLA 1UIBA 3ATOA 3RT5X 3CDOA 3IWRA 5T3FA 1LSGA 1CTWA 1GFHA 1HEWA 4LYZA 1IWVA 1GFGA 4H9CA 1OUEA 209LA 3A96A 1LSAA 1IWXA 3D4SA 1L28A 1HERA 4UWVA 1IORA 1CKHA 184LA 1L12A 1LPIA 118LA 5LVJA 4YXCA 1LGWA 1UUZC 2OE9X 240LA 1WVVA 3C8QA 1UCOA 4B49A 1AT5A 3P68A 4NGVA 4WM6A 5KXKA 200LA 247LA 1GFTA 201LA 2B7XA 4K5YA 1IOSA 1HNLA 1P2CC 2B73A 1SX7A 1C6HA 3HT7A 1JTTL 5LAFA 2BQLA 1CUQA 126LA 3DN3A 225LA 1IC7Y 5KXMA 4D9ZA 3B0OA 1L38A 4AXTA 1GF3A 5LVGA 139LA 2MEHA 4LT3A 1BWHA 1G0LA 1C6JA 3TXEA 173LA 3QNGA 140LA 4H8ZA 1LZSA 1JTMA 3HH5A 1F6SA 2W1LA 4LDEA 4ETCA 1G0PA 2BQNA 4S0WA 2EPEA 4NGIA 2IHLA 1OUDA 4LT0A 1LZ6A 4H9BA 4NFVA 4DD7A 4DC4A 4EPFA 2CGIA 1GAYA 109LA 1C6PA 1G1WA 1HC0A 208LA 2O7AA 1XGPC 1G0JA 259LA 3FE0A 1B5WA 4N5RA 1HEOA 5KKJA 3F6ZA 1IWTA 2OU0X 159LA 3CB7A 1HHLA 2HEDA 1W6ZA 4OW1A 1PQKA 4EKPA 5FEKA 1OV5A 1B7NA 1IP4A 1L96A 1TCYA 1T3PA 1QTZA 1L35A 1P64A 5L3HA 1REZA 4Z46A 156LA 1LKRA 1G0QA 3HU9A 4OWCA 5B1GA 249LA 1LJGA 5APFA 1TEWA 4DT3A 4KXIA 1L46A 3AZ4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5B59 A;  1J1P Y;  1HFY A;  1IOT A;  1BWJ A;  4NWE A;  4H9H A;  2G4Q A;  5LIO A;  1IWZ A;  1LSB A;  4WLY A;  2BQK A;  1IO5 A;  1GE1 A;  1LOZ A;  5E4P A;  1CJ8 A;  3HBD A;  4TWS A;  5HMV A;  4NGL A;  1WTM A;  1GBO A;  1GEZ A;  1HML A;  1B7R A;  1UIB A;  3ATO A;  3RT5 X;  4CFO A;  3IWR A;  3A90 A;  1IR8 A;  1JIT A;  3BKV A;  1IP7 A;  7LYZ A;  4NSG A;  1JHL A;  1LZT A;  2YSS C;  2I6Z A;  4NWH A;  4OWA A;  5T3F A;  5KXO A;  1LSG A;  4NHP A;  4QGZ A;  4GLV A;  1GFH A;  1HEW A;  4LYZ A;  1IP3 A;  1GFK A;  1IWV A;  2HEC A;  1PZY A;  1B2K A;  1FKQ A;  1GFG A;  1REY A;  4U3X B;  4H9C A;  1BWI A;  1OUE A;  1LHL A;  3A96 A;  4BAD A;  1GDW A;  4HV2 A;  1LSA A;  2MEE A;  1IWX A;  1LSE A;  1T6V L;  4PJ2 C;  5LXW A;  2BQB A;  1HER A;  1QDR A;  4YEO A;  4OWH A;  1CNS A;  2EIZ C;  3CSR A;  3HBH A;  4TSC A;  5IHG A;  4UWV A;  4NIJ A;  1IVM A;  1IOR A;  1B0D A;  1D0K A;  2I25 L;  1CKH A;  3A95 A;  4GCD A;  2A7F A;  4H90 A;  4XJB A;  5KJ9 A;  1HEN A;  1REM A;  4H93 A;  3LZT A;  3W6E A;  3TMU A;  4PPO A;  1IC5 Y; 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 2D6B A;  1D6Q A;  1VDS A;  2C8O A;  4WM5 A;  4XJH A;  3RU5 A;  2HU1 A;  1CKG A;  2DQH Y;  1C7P A;  2Z18 A;  3ZEK A;  4ZIX A;  1PS5 A;  3A92 A;  2W1Y A;  4DDC A;  5DL9 A;  3P4Z A;  1QTK A;  4DWX A;  2RSC A;  4N1C C;  4GN3 A;  4M4O A;  1XGT C;  1FLW A;  4G9S A;  1BB3 A;  1KXW A;  5A3E A;  4L41 A;  1ZV5 L;  5E9R A;  3WL2 A;  1JSE A;  2DQI Y;  1GF7 A;  1JTO L;  1NMM A;  1YQV Y;  4GN5 C;  1IOC A;  5KXX A;  1EQE A;  1D6P A;  2XJW A;  4TTD A;  5LYZ A;  4ET9 A;  4IJ4 A;  1WVU A;  5KXP A;  1WQQ A;  1LMP A;  1KIR C;  3A3Q A;  2YBM A;  1GFE A;  1UAC Y;  2Z12 A;  3N9A A;  1HSX A;  1UIH A;  4TUN A;  1W08 A;  5F81 A;  5FST A;  5ILC A;  4I8S A;  1IP2 A;  4G49 A;  3W6D A;  1GFA A;  3WUL A;  2YBN A;  1LKS A;  4NHI A;  4BS7 A;  1JJ3 A;  2Z39 A;  1AM7 A;  4G4H A;  1G7M C;  3IJU A;  4TX7 A;  3WUM A;  4WG7 A;  3ATN A;  1XSF A;  2Z2E A;  4DDB A;  4MCK A;  4ETD A;  5L3I A;  5F16 A;  1F10 A;  5LA8 A;  3TMX A;  3SP3 A;  1DXJ A;  4IAT A;  1ALC A;  1GFR A;  1WQM A;  1XEI A;  1IWY A;  2ZIK A;  2MEI A;  2MEC A;  1NKH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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