4TSBA

Structure of a lysozyme antibody complex
Total Genus 52

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (39-42)TI'1 (36-39)3H3 (120-124)AH1 (5-15)TII4 (124-127)O2 (6-127)AH2 (25-36)TII1 (17-20)3H1 (20-22)TII'1 (103-106)TI3 (54-57)S1 (43-45)TI2 (46-49)S2 (51-53)TI4 (59-62)TIV1 (66-69)TIV2 (105-108)S3 (58-59)TI5 (60-63)TI6 (74-77)AH3 (88-99)3H2 (80-83)TVIII1 (85-88)TI7 (101-104)TII3 (115-118)O1 (118-120)AH4 (109-115)TII2 (69-72)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Immune system/hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of a lysozyme antibody complex
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4tsbA00
4FJRA 1JKAA 1EQEA 1JTTL 1LZBA 1B7PA 1YANA 3OJPA 1NBZC 3M18B 1CJ6A 1CJ7A 4RLMA 5K7OA 1QSWA 1YQVY 1IR8A 4CFOA 2NWDX 2ZYPA 5APEA 2ZIKA 4NSGA 1LSFA 3P66A 2YDGA 1JTPL 1D0MA 4NGIA 3T36A 4NSIA 1BQLY 4WM6A 3RU5A 4MR1A 5L3HA 1IP3A 1JTOL 1LSCA 4HPIA 4DDBA 1C45A 1LZ4A 4YF2A 1I20A 4KT3A 3CSZA 1LYSA 5B1GA 2ZNXY 2YBHA 1XFPL 5LA5A 1IVMA 2ZWBA 4HTKA 1QUTA 3WVXA 1LZCA 1O23A 4I0CA 1GBSA 1JWRA 1XGPC 1TDYA 4QEQA 1IOQA 1LOZA 1D0LA 5C6JA 1DI4A 2BQDA 3TXEA 4B4EA 1IOSA 4G49A 1GE1A 4W94A 1DKJA 2WARA 1XGQC 5C6LA 1LSYA 1C08C 1QTEA 2MEIA 153LA 1D6QA 1VFBC 3A90A 4HJVA 5LVHA 5KXLA 3HBEX 193LA 1HNLA 1OUFA 2G4QA 3B0OA 3P64A 4A7DA 1LPIA 3A3RX 1PZYA 4KL7A 5APCA 5F14A 5HQ1A 5FCPA 1JKCA 3CSRA 5I4WA 1REMA 1GFGA 1B9OA 4WL6A 1LZTA 2BQLA 4ETBA 1B5UA 1C43A 4H90A 4NHQA 1LSNA 2HEEA 4DD1A 1LZAA 5FSTA 1UIGA 3LYTA 1GBZA 2MEGA 5D5FA 4HTQA 3RZ4A 2ZNWY 1IWZA 1W6ZA 3TXHA 1HENA 1FLUA 4ML7A 2DQCY 1LHHA 2FYDA 1CNSA 2ZQ4A 5LVJA 1BVKC 1KIRC 2Z18A 5J7CA 1WQNA 5FDJA 1GE2A 4ET8A 1AZFA 1XGRC 2H9KA 1IP5A 1NKHA 3LN2A 4J7VA 3WL2A 1LHIA 1HSWA 1DXJA 5LYMA 4M4OA 4OWHA 1IY4A 2MEHA 4LZTA 2GV0A 1F10A 1IO5A 133LA 1KIPC 5B06A 4LYZA 1LZSA 4LYCA 5HNLA 4N5RA 3WYHA 1GFUA 1BWIA 1JJ1A 1GPQC 2BLYA 1JIYA 1GB0A 1EL1A 5F81A 1FKQA 1EQ4A 1I1ZA 1IP1A 1LJKA 1QDRA 1LTMA 3CQLA 1T3PA 5APDA 4ETEA 1IR7A 1LKSA 3TMXA 4PJ2C 3WPJA 4R6CA 4DYGA 4GN5C 2C8PA 1IWYA 4LT3A 4GCBA 4DWXA 1GFRA 4B49A 4BAFA 1HMKA 1OUEA 4R0FA 4LFPA 5KXPA 1LCNA 5KKIA 1KIQC 1IP2A 1OUJA 5HNCA 1LJIA 1VDTA 1WTMA 2XBRA 1JKDA 1GF0A 1BVXA 1GWDA 4KPMA 1JPOA 3RW8A 3AZ6A 3WUNA 1BWJA 4NIJA 5FHWA 1HFYA 3TXKA 5B07A 1GAYA 3AZ4A 2XJWA 3AW6A 5KXWA 1DI3A 1UIDA 1CKHA 2Q0MX 2G4PA 5T3FA 1QUSA 1LYZA 1REXA 1YL0X 194LA 5LIOA 3WVYA 3B0KA 3BKVA 4NWEA 2Z12A 1J1XY 4N8ZA 1IC5Y 1VDPA 4DC4A 1GF7A 5EBHA 2Z37A 2ZQ3A 4ZIXA 4XJHA 1HC0A 4ETCA 1G7LC 2BQKA 4H93A 5KXKA 1JKBA 2LZ2A 5B59A 3A95A 5LYZA 3WMKA 5HLLA 1JJ0A 1SLYA 4ZFPA 5I4XA 4HP0A 1TAYA 1B5VA 1BB5A 1XEJA 4GCEA 1HMLA 1LYOA 1FLWA 4L41A 4NY5A 4QGZA 3QY4A 4WG7A 154LA 1NDGC 1LZ1A 1JITA 1GFKA 1IC4Y 4B0DA 1GB2A 1Z55A 5JENB 3QNGA 4H9FA 1GFTA 5F9UA 3MGWA 5I5QA 1YAOA 4HJZA 1RCMA 1F6RA 1GB5A 1IWTA 1YIKA 1AKIA 207LA 1B5YA 1LMOA 3EMSA 4QDNA 2YBJA 4NG1A 3A96A 1LSEA 4DD0A 1WQRA 3A34A 1RI8B 3A8ZA 5I54A 4YENA 4ZEEA 4OWBA 1OUHA 5KXZA 2MEAA 4HJYA 3B72A 4OW1A 4H92A 2BQBA 2HU3A 1HEQA 1LMPA 2W1MA 3FI7A 3IJVA 3TXFA 2EPEA 4LFXA 4OWCA 1QSAA 3HBHA 4OOOA 5KXTA 1DPXA 1GD6A 1FDLY 4XJGA 4BADA 4XJBA 1GB7A 1BB3A 4B4JA 2RSCA 4NSHA 3WU9A 3W6AA 2MEBA 2LYZA 208LA 4XJFA 5LAGA 4J0LA 1OUBA 4TWSA 5KXRA 1GF3A 4NGKA 1DQJC 1IORA 1FN5A 1GXXA 1ZVHL 2A7DA 1CKCA 4OOTA 3EBAB 6LYTA 2FYCA 1D0KA 3AZ5A 2XTHA 1UIFA 4WLXA 4G9SA 1LJGA 1WQQA 3LYZA 1LMCA 2EQLA 4NHSA 1VATA 4I8SA 2LZTA 1IR9A 2LYMA 3HFMY 1LZDA 2W1LA 1BB6A 1IWXA 5E9RA 4IASA 1LSZA 1YAPA 2BQFA 4MCKA 4WM2A 4LT1A 3RT5X 2LHMA 4YOPA 4LT2A 1VDSA 1EQ5A 4UWNA 2YBIA 3K3TA 1G7MC 2HECA 2DQEY 4RW1A 1PS5A 4H91A 1HHLA 2IHLA 4XADA 3J4GA 4G4CA 1HEPA 4XENA 5IDDA 1QQYA 1HERA 1TEWA 4YM8A 2W1YA 2AUBA 2G4NA 3AGGG 4UWVA 4BS7A 2DQIY 2CWIA 1GB8A 5ILFA 4ET9A 4WO9A 1LJNA 1JSEA 4LT0A 5F9XA 5C6IA 5KXSA 2D4KA 1GB9A 2HEFA 4GN3A 2FBDA 1J1OY 3WU8A 4J1BA 1G7HC 4NGLA 1B7RA 4NHPA 4Z41A 4H8YA 3LYMA 3A3QA 4GCDA 2VB1A 1GF4A 3ATOA 4IJ4A 3D3DA 1B7OA 1YAMA 3G3AB 1GAZA 1V7TA 3HBDA 4RDSA 3TMWA 5LVIA 2CDSA 1BWHA 5A3ZA 1FBIX 4X3BA 2F30A 1A2YC 1UBZA 1TCYA 3B0IA 4NWHA 3A91A 1XGUC 1IP6A 4G4HA 4TSCA 4TUNA 4NGZA 4O34A 4CFPA 5II3A 2ZIJA 4H8ZA 4LYBA 4Z3MA 1DZBX 4PGJB 3WPLA 4LYOA 1QTKA 1NQIA 3CB7A 1OP9B 1LSBA 1ZV5L 2Z2FA 5I53A 1LJ3A 2Z38A 1B7MA 1UC0A 4P2EA 1LSPA 3GXKA 1VDQA 1DPWA 5E4PA 3ZVQB 1DI5A 1GF9A 3WW6A 1UIEA 1C46A 1GBWA 1NHEA 2BQGA 4C3WA 1LSAA 3A6BY 1HEOA 1FLQA 1IEEA 5IELA 2YSSC 4HPEA 4WO6A 1LMNA 5KY1A 2Y8PA 1JEFA 1FKVA 1WVVA 3LYOA 1JJ3A 1FLYA 1IC7Y 4GCCA 3BKHA 4H1PA 1UA6Y 1AT6A 4KXIA 4WMGA 5LVKA 1B7SA 1GE3A 1BGIA 3W6BA 1F6SA 1NMMA 2DQDY 2Z39A 3AZ7A 1P2CC 4TTDA 1LYYA 5KXNA 4NHTA 1LZEA 1IY3A 8LYZA 2X0AA 1LHMA 4CHXA 2BPUA 4H94A 7LYZA 1ZVYB 5APFA 1WVUA 3B6LA 2BQIA 3AB6A 1HFZA 3AJNA 1HF4A 1OUGA 3P4ZA 4LYTA 4WM4A 1LJJA 3A94A 5I4YA 1AM7A 1B7NA 1NDMC 2CGIA 4WL7A 2YBMA 132LA 3WH1A 5LINA 1GHLA 1IOTA 1BHZA 4H9HA 4QY9A 1HEWA 1LSDA 3ZEKA 1ALCA 1B2KA 3W6EA 1JISA 1UIHA 1GBYA 1QDTA 2MEFA 1XGTC 4HSFA 3ULRA 3WXUA 3TXIA 3TXGA 1T6VL 1BB7A 1RE2A 3CT1A 1REYA 2MECA 1CKGA 3LZ2A 4HV2A 4PHIA 3EO5A 3TXDA 1KXXA 1LHLA 4J1AA 4WM3A 1IWWA 3TMVA 1OUDA 3KAMA 3AGIA 4UWUA 2DBTA 4MSTA 5DN5A 1YL1X 1HEMA 3G3BB 2C8OA 2HTXA 1HFXA 2H5ZA 4NGOA 4WLDA 1KXWA 4BAPA 3N9CA 3GXRA 5F16A 2B5ZA 5A3EA 2BQAA 3A92A 2ZILA 4AGAA 6LYZA 4PRQA 3N9AA 1LMQA 1YAQA 4OWAA 4H9CA 1G7IC 3TXBA 2DQJY 4EMNA 4WM1A 4H8XA 2YBNA 1WQOA 4N9RA 1GFHA 1UACY 3AW7A 1G7JC 3WW5A 1LKRA 4DT3A 4E3UA 4G4BA 1A4VA 4TSBA 4CGEA 4CJ2A 1C10A 1B5XA 5DN4A 1YKXX 1BB4A 4DD7A 3J6KA 2F4GA 1GXV2 4IATA 4WLYA 4ETAA 5DLAA 2EKSC 2Z2EA 4NHIA 2YBLA 1GDXA 2BLXA 3AYQA 5HMJA 1LMTA 1VAUA 1GEZA 4NG8A 4TX7A 5DM9A 1GF5A 1C7PA 2D6BA 1GFVA 2HEAA 1H6MA 1RFPA 2D91A 1GB3A 3IWRA 4DDAA 5IHGA 5LYTA 4PPOA 4YEMA 1B0DA 4M6DA 2BQJA 4XYYA 1W08A 1XEKA 2HU1A 2F2NA 4NSJA 1LHJA 4W96A 1JUGA 2MEEA 1LSMA 1B5ZA 1LZGA 2DKVA 4N1EI 1OQMA 1V7SA 9LYZA 1UIBA 4WLTA 4B1AA 1LHKA 4XN6A 2I25L 5M1YA 1GBOA 1UICA 4NFVA 1MLCE 3IJUA 4WM5A 2BAAA 1GF6A 3AGHA 3CSQA 4LYMA 1YKZX 4NGYA 1VEDA 5D5CA 1KXYA 1GE4A 1GFEA 1JHLA 1D6PA 1HELA 5KKJA 5KXMA 1CKDA 4N1CC 4NGWA 2BQNA 1GEVA 1N4FA 1DKKA 1JSFA 1OUIA 5AMYA 1NF5A 1IWUA 4RW2A 2HEDA 4YEOA 1LJFA 3P68A 1ZMYL 3D9AC 4NEBA 4NGVA 2F4AA 5FELA 4FDYA 3P65A 1WQMA 3EXDA 4WOAA 4AXTA 2IFFY 1LZ6A 1YILA 4GN4A 1E8LA 3RNXA 1I56A 1CJ8A 3A6CY 3CT0A 1REZA 4II8A 3TMUA 1TBYA 5KJ9A 4DD3A 2W1XA 1IP7A 4DD2A 2BQOA 3TXJA 1CJ9A 4XJIA 5L3IA 134LA 3W6DA 4OWEA 2DQHY 1RJCB 3WUAA 5B05A 1LAAA 4RLNA 1LZ5A 5LA8A 1J1PY 4PRUA 3OK0A 4HV1A 4DD9A 1IWVA 2ZYCA 3ATNA 3LHMA 4GLAA 1B5WA 4H9IA 3A67Y 4H9EA 1GDWA 3M3UA 1B7LA 1NBYC 4WG1A 4D9ZA 1LZ9A 1GB6A 1GF8A 3FE0A 2XBSA 1XSFA 5FEKA 4B4IA 1UUZC 1IX0A 1H87A 3CT5A 3WUMA 1YROA 2DQFC 2BQCA 1OUCA 1IIZA 5L9JA 3E3DA 1LZNA 2H9JA 3A93A 1D9UA 1LZRA 5KXOA 3WU7A 3ZVQA 1UIAA 2DQAA 1LJHA 5LXWA 1AT5A 4H9BA 3F6ZA 1WQPA 1YKYX 5DL9A 2DQGY 4ANRA 1GFJA 1IP4A 4ETDA 3W3EA 2MEDA 3T6UA 3WPKA 4EOFA 2I6ZA 4XJDA 3WULA 1UCOA 3N9EA 4LGKA 5HMVA 4H9AA 5LAFA 1NWGA 1IOCA 4N0JA 2BQHA 3W6FA 1LJ4A 2YVBA 1WTNA 135LA 1SQ2L 2PC2A 1B7QA 4DDCA 4U3XB 1HSXA 1QIOA 2CJLA 3SP3A 1INUA 4GLVA 2BQEA 2LYOA 2N5ZA 5ILCA 3WXTA 1OUAA 1CKFA 1LZYA 1GFAA 1MELL 2D4IA 2EIZC 4HTNA 1LMAA 1XEIA 2D4JA 2HEBA 3LZTA 1F0WA 1LZ8A 2BQMA 3QE8A 3VWOA 1GE0A 1LJEA 4C5FA 2A7FA 4GCFA 3W6CA 5KXXA 4Z46A 4Z98A 5B1FA 5LVGA 2FBBA 1GBXA 4NGJA 2I26L 1LSGA 2Z19A 5KXYA 2HUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EJ4A 1L85A 192LA 1NBZC 4RLMA 5K7OA 1T97A 1IR8A 4CFOA 2NWDX 4ARPA 2ZIKA 1LSFA 4LDLA 1CX6A 3HU9A 4MR1A 1IP3A 3G3VA 1L15A 4YF2A 1I20A 1LYSA 4ZPUA 2B6WA 1QUTA 3WVXA 4I0CA 2BQDA 3TXEA 2WARA 1LSYA 2XQOA 2MEIA 3A90A 4HJVA 4ARQB 5KXLA 1L52A 114LA 193LA 3B0OA 4A7DA 113LA 3OE6A 4PJZA 5I4WA 2O4WA 4WL6A 2BQLA 1CV1A 4ETBA 1LZAA 1XJUA 1UIGA 5FSTA 228LA 1GBZA 1L89A 2DQCY 1LHHA 1BVKC 171LA 1LHIA 4OWHA 2MEHA 1L18A 1IO5A 133LA 1KIPC 2RAYX 4LYZA 215LA 4N5RA 1BWIA 1JJ1A 1EL1A 1FKQA 3HT8A 1I1ZA 5APDA 1T3PA 1IR7A 3TMXA 3WPJA 2A4TA 4GN5C 4DYGA 3C8QA 1IWYA 1GFRA 206LA 1LPYA 5KKIA 1VDTA 1WTMA 1JPOA 1L24A 3WUNA 5FHWA 1JQUA 3AW6A 1DI3A 2OE4X 1C6LA 5T3FA 1C6TA 1REXA 1YL0X 194LA 1L17A 4I7LA 1XJTA 5LIOA 3WVYA 3HH4A 168LA 3BKVA 3F9LA 1GF7A 4H93A 1JKBA 3WMKA 5I4XA 1TAYA 1L55A 160LA 4NY5A 1QSBA 3QY4A 1NDGC 1JITA 1IC4Y 4ARMA 2OU9A 5JENB 3GUJA 5I5QA 1L32A 1IWTA 260LA 1OVJA 2YBJA 3A96A 4W58A 1I6SA 1L59A 4HJYA 1L26A 3B72A 3IJVA 3TXFA 1QSAA 3HBHA 216LA 102LA 2OU0X 242LA 1CV0A 4XJGA 4XJFA 4W59A 5LAGA 4J0LA 1OUBA 1IORA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4FJR A;  1JKA A;  1EQE A;  1JTT L;  1LZB A;  1B7P A;  1YAN A;  3OJP A;  1NBZ C;  3M18 B;  1CJ6 A;  1CJ7 A;  4RLM A;  5K7O A;  1QSW A;  1YQV Y;  1IR8 A;  4CFO A;  2NWD X;  2ZYP A;  5APE A;  2ZIK A;  4NSG A;  1LSF A;  3P66 A;  2YDG A;  1JTP L;  1D0M A;  4NGI A;  3T36 A;  4NSI A;  1BQL Y;  4WM6 A;  3RU5 A;  4MR1 A;  5L3H A;  1IP3 A;  1JTO L;  1LSC A;  4HPI A;  4DDB A;  1C45 A;  1LZ4 A;  4YF2 A;  1I20 A;  4KT3 A;  3CSZ A;  1LYS A;  5B1G A;  2ZNX Y;  2YBH A;  1XFP L;  5LA5 A;  1IVM A;  2ZWB A;  4HTK A;  1QUT A;  3WVX A;  1LZC A;  1O23 A;  4I0C A;  1GBS A;  1JWR A;  1XGP C;  1TDY A;  4QEQ A;  1IOQ A;  1LOZ A;  1D0L A;  5C6J A;  1DI4 A;  2BQD A;  3TXE A;  4B4E A;  1IOS A;  4G49 A;  1GE1 A;  4W94 A;  1DKJ A;  2WAR A;  1XGQ C;  5C6L A;  1LSY A;  1C08 C;  1QTE A;  2MEI A;  153L A;  1D6Q A;  1VFB C;  3A90 A;  4HJV A;  5LVH A;  5KXL A;  3HBE X;  193L A;  1HNL A;  1OUF A;  2G4Q A;  3B0O A;  3P64 A;  4A7D A;  1LPI A;  3A3R X;  1PZY A;  4KL7 A;  5APC A;  5F14 A;  5HQ1 A;  5FCP A;  1JKC A;  3CSR A;  5I4W A; 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 4OWE A;  2DQH Y;  1RJC B;  3WUA A;  5B05 A;  1LAA A;  4RLN A;  1LZ5 A;  5LA8 A;  1J1P Y;  4PRU A;  3OK0 A;  4HV1 A;  4DD9 A;  1IWV A;  2ZYC A;  3ATN A;  3LHM A;  4GLA A;  1B5W A;  4H9I A;  3A67 Y;  4H9E A;  1GDW A;  3M3U A;  1B7L A;  1NBY C;  4WG1 A;  4D9Z A;  1LZ9 A;  1GB6 A;  1GF8 A;  3FE0 A;  2XBS A;  1XSF A;  5FEK A;  4B4I A;  1UUZ C;  1IX0 A;  1H87 A;  3CT5 A;  3WUM A;  1YRO A;  2DQF C;  2BQC A;  1OUC A;  1IIZ A;  5L9J A;  3E3D A;  1LZN A;  2H9J A;  3A93 A;  1D9U A;  1LZR A;  5KXO A;  3WU7 A;  3ZVQ A;  1UIA A;  2DQA A;  1LJH A;  5LXW A;  1AT5 A;  4H9B A;  3F6Z A;  1WQP A;  1YKY X;  5DL9 A;  2DQG Y;  4ANR A;  1GFJ A;  1IP4 A;  4ETD A;  3W3E A;  2MED A;  3T6U A;  3WPK A;  4EOF A;  2I6Z A;  4XJD A;  3WUL A;  1UCO A;  3N9E A;  4LGK A;  5HMV A;  4H9A A;  5LAF A;  1NWG A;  1IOC A;  4N0J A;  2BQH A;  3W6F A;  1LJ4 A;  2YVB A;  1WTN A;  135L A;  1SQ2 L;  2PC2 A;  1B7Q A;  4DDC A;  4U3X B;  1HSX A;  1QIO A;  2CJL A;  3SP3 A;  1INU A;  4GLV A;  2BQE A;  2LYO A;  2N5Z A;  5ILC A;  3WXT A;  1OUA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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