4TX7A

Crystal structure of chitinase (gh19) from vigna unguiculata
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
APSDLSALIPRATFDQMLKHRNDGACPARGFYTYDAFIAAARAFPSFGNTGDTATRKREIAAFLGQTSHETTGGWPSAPDGPYAWGYCFVREQNPSAYCSPTPQFPCASGQQYYGRGPIQISWNYNYGQCGNAIGVDLINNPDLVATDPVVSFKSAIWFWMTPQSPKPSSHDVITSQWTPSAADVAAGKLPGYGTVTNIINGGLECGRGQDSRVEDRIGFFKQYCDLFGVGYGNNLDCYSQAPFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Production in Pichia pastoris, antifungal activity and crystal structure of a class I chitinase from cowpea (Vigna unguiculata): Insights into sugar binding mode and hydrolytic action.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Class I chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis
total genus 83
structure length 245
sequence length 245
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4tx7A01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 4tx7A02
1GB0A 1GWDA 2EQLA 2MEFA 3A3QA 5FHWA 4GCCA 4NGWA 3A34A 4DD1A 1IO5A 5LINA 1RE2A 2ZIJA 2ZQ3A 2Z39A 3RW8A 1YAMA 5B06A 4KPMA 1VEDA 4WOAA 4B0DA 3WULA 4WLYA 2RSCA 2BQFA 4H8ZA 2YBMA 5IHGA 1LZGA 2LZTA 3AYQA 5KXPA 1IP7A 1JKAA 4BS7A 1T3PA 2G4QA 4P2EA 1IP6A 194LA 1G7IC 3ZEKA 4B4IA 5B1FA 1WQMA 3GXKA 4LT2A 1I20A 5E9RA 3TXJA 1D9UA 1BHZA 4OWCA 1O23A 4NG1A 4KXIA 4R6CA 5B1GA 1G7HC 1WVVA 1GF8A 4FDYA 1XEJA 1T6VL 2D91A 3B0OA 1IC4Y 4H1PA 3TXBA 2F30A 2PC2A 5APFA 3TXHA 5LVKA 4CHXA 1IR7A 1OUFA 1OUJA 3EXDA 4OWAA 5EBHA 5L3HA 4G9SA 3W6CA 1DZBX 1LMOA 3TXIA 2ZIKA 1LZ9A 5I4YA 3AZ6A 3A67Y 4RLNA 2D6BA 1UIGA 1IEEA 1HSXA 1JPOA 2LHMA 4GN5C 4NGOA 4H9EA 1LZTA 2ZWBA 4XADA 4DD9A 4DDCA 1YKZX 2CJLA 1GF5A 1BB3A 1UACY 2Z38A 1IP1A 1LSNA 2BQOA 3RT5X 4EOFA 4RLMA 2DBTA 2H9KA 5KXMA 1GB7A 4RDSA 2YBIA 4J1BA 3WW5A 1H6MA 5HQ1A 1HFYA 5A3EA 1YROA 4WLDA 4CFOA 1JTPL 1LPIA 1GFTA 3WVXA 1B7SA 1QDTA 6LYZA 4I8SA 1LZ8A 2A7DA 5HMVA 2BQDA 4G4BA 1DI5A 1LSAA 2LYMA 1J1OY 4XN6A 1ALCA 3LZTA 5LYMA 5II3A 2EIZC 1UIEA 4BADA 5KXKA 3ZVQB 4NWEA 5KXNA 1OUHA 1CNSA 1YANA 2CGIA 1QTKA 4LGKA 1BVXA 1BVKC 3TXFA 1GE4A 4YOPA 2MEAA 3WMKA 4H91A 3RU5A 4ZEEA 2XBSA 1LZNA 1OUGA 2D4KA 5LYTA 3CT5A 1B5XA 1AZFA 1BWJA 1LSMA 2BLXA 1QUTA 2Z19A 4DD7A 1LAAA 4NHPA 2H9JA 3T6UA 3A92A 4HJVA 4ETBA 2MECA 3A94A 3W6FA 1LZ5A 2H5ZA 4H9CA 1GB6A 2HEBA 4BAFA 4AXTA 1GF9A 1D0LA 1A4VA 1I56A 4H9IA 2Z2FA 4I0CA 4XJDA 5APEA 1VDQA 2BQGA 1JISA 1JEFA 3WL2A 2MEHA 3LZ2A 1F6RA 1TDYA 1IC5Y 193LA 1XGQC 3A96A 4HJZA 1DKJA 4NGYA 5I54A 1ZVYB 1GF7A 1YQVY 3HBDA 1A2YC 1C7PA 1LJJA 3J4GA 4WG7A 5AMYA 5LAGA 1LOZA 1GBXA 1CJ8A 1QSAA 2WARA 1OP9B 9LYZA 3RZ4A 1WTNA 1GE0A 1GFHA 3CT0A 4H94A 5DL9A 1YL0X 1Z55A 2MEDA 2Z12A 1AM7A 4XJIA 1IR8A 1LMQA 1LZDA 4NSHA 1HEWA 1OUBA 4DDBA 4TTDA 1GFVA 4WG1A 4N1CC 3TMWA 4J7VA 1GEZA 2MEGA 2ZNWY 4G49A 1REYA 1OUIA 3CSQA 3AGHA 1LJKA 1FKQA 1LMCA 4IJ4A 4HTKA 4LT3A 2HEDA 4HV1A 2YVBA 1F0WA 5LVJA 4XJFA 1HEPA 2I26L 5DLAA 5LAFA 1GFUA 1GBYA 4W96A 1LYSA 2BQKA 1IR9A 3A90A 3ATOA 1C08C 1JKDA 4EMNA 1GHLA 2FBDA 3FE0A 1LSDA 4N0JA 4LT1A 1LJFA 1NHEA 2W1LA 4LFPA 1G7MC 1N4FA 3LYMA 1IX0A 4Z98A 5FELA 4DD3A 4OOOA 1QUSA 1FLQA 5D5FA 5C6LA 5E4PA 1VAUA 4UWUA 4A7DA 1RFPA 1CJ9A 4PJ2C 4GCEA 4HV2A 1OUCA 1UCOA 2BQHA 1P2CC 1WTMA 1CJ7A 1HEOA 1RJCB 2IHLA 4WL6A 2BQAA 4WM6A 1LHMA 2HEFA 3A8ZA 1JITA 1EL1A 1GDWA 1LKSA 2DKVA 3M3UA 2Y8PA 1W6ZA 3AGIA 1GBWA 3CSRA 4J0LA 4QEQA 1YL1X 1GB3A 1FLYA 2EKSC 3TXGA 3J6KA 2C8PA 3HBHA 2DQCY 4W94A 3EMSA 1HHLA 5C6JA 5DN4A 1XEIA 1GAZA 1LZEA 134LA 2D4IA 3EBAB 1F10A 1SQ2L 1UIBA 2BLYA 4HTNA 5LYZA 2FYCA 1SLYA 1JKCA 5F9UA 1LMPA 4LFXA 4OW1A 4B1AA 2HU1A 1WQOA 4WLTA 1FLWA 4DT3A 4XYYA 1TEWA 1AT5A 5T3FA 1CKDA 1LSZA 1YKXX 4AGAA 5LVHA 5HNLA 1EQ5A 3WUMA 1E8LA 1HSWA 1BB7A 2DQAA 5K7OA 4G4HA 5DM9A 3P4ZA 4GN3A 1GFRA 1W08A 1B7NA 1QDRA 4H93A 4NHQA 1LZAA 1IP5A 5KXWA 1LHHA 4UWVA 5F9XA 1B5YA 1IWWA 5KJ9A 3WH1A 1GAYA 5JENB 1HENA 2ZNXY 3QE8A 1HMLA 2F2NA 1GF4A 4FJRA 4LYBA 2ZYCA 3AGGG 5B07A 1GE3A 3AZ4A 4UWNA 4WO6A 5LA8A 4DC4A 1IY3A 4ET8A 3N9AA 4YEOA 2DQJY 4OOTA 4LYTA 4DD2A 4DDAA 4GLVA 1IWUA 2G4PA 1NMMA 5F81A 4Z3MA 5LIOA 1D0KA 4QGZA 1UIHA 3A93A 4YEMA 1JWRA 1NQIA 5HNCA 2LZ2A 4MCKA 1IY4A 1GB2A 1CJ6A 1HC0A 1JHLA 1KXXA 1LZCA 4PRUA 4WM1A 4H90A 1LSGA 1GE1A 4LYMA 4X3BA 4ETAA 1HNLA 3TMUA 1GB9A 4NEBA 1QTEA 1UIAA 5L3IA 2BAAA 1VDPA 3EO5A 3G3AB 1HELA 1LYZA 1GFJA 1BWHA 1LSFA 2BQLA 5F16A 1LSEA 3BKVA 1LHIA 2FYDA 5KXZA 3WXUA 5FSTA 3B72A 1GXV2 2G4NA 2W1YA 4H9AA 1BQLY 4II8A 1LYYA 3A3RX 3AB6A 1JJ0A 5HMJA 1GFAA 3K3TA 3OK0A 4H9FA 1UUZC 4ETCA 1MLCE 1WVUA 5I4XA 1VDTA 4GCBA 4KT3A 4LYOA 4B4EA 5LXWA 1GB5A 1GFKA 4NGJA 1UC0A 3QY4A 1XEKA 1DKKA 3W6DA 4OWEA 3ZVQA 1LHKA 2LYZA 4DWXA 4H9HA 1IWYA 4E3UA 5C6IA 1KXYA 4YM8A 1GDXA 1JTTL 1XGUC 2DQGY 2W1XA 3A91A 1LJ3A 3WXTA 5KXTA 2BPUA 2LYOA 5DN5A 4IATA 4N1EI 4ANRA 2ZILA 1BB6A 1GF3A 3WUNA 4ML7A 4NGIA 1VATA 4PRQA 4B4JA 5HLLA 1UIDA 1B5WA 1IP3A 2MEIA 2B5ZA 1ZV5L 5IELA 1LJGA 3WPKA 4YENA 1YILA 4OWHA 1BWIA 4WO9A 4WL7A 4ZIXA 1LZ4A 1YIKA 2YDGA 3RNXA 5KKJA 4Z41A 1BB4A 1WQNA 4U3XB 1HERA 1NKHA 4NIJA 1B0DA 1XGPC 3B0KA 3D3DA 1GBZA 1BGIA 3HFMY 5KXOA 5L9JA 4NHTA 2ZQ4A 5A3ZA 1IWZA 1V7SA 1OUEA 1LZSA 4R0FA 1YAPA 1IWTA 3B6LA 1LHJA 4NGKA 5APDA 1IWXA 2X0AA 4WM2A 4WM5A 3D9AC 4NFVA 4RW1A 2A7FA 1LMNA 1F6SA 1DI3A 1LTMA 1ZVHL 4G4CA 5IDDA 5LVGA 1GPQC 4RW2A 1C45A 2HEEA 1INUA 2IFFY 4C3WA 2F4GA 5FEKA 4XJGA 5KY1A 1JIYA 1ZMYL 2BQIA 2D4JA 1B5ZA 5KXLA 3LYOA 5KXSA 3GXRA 2F4AA 3QNGA 1KIRC 3P65A 3P68A 2YBLA 1B7RA 1JTOL 1BB5A 3LN2A 4WM3A 4XJBA 2XBRA 4LYCA 3WU9A 3WW6A 3AW7A 1UBZA 2CWIA 4LYZA 1AT6A 1WQQA 2HU3A 2DQFC 1GBSA 1H87A 3A6BY 3LHMA 1FKVA 3P66A 1IORA 3AZ5A 1CKCA 2BQBA 1LMTA 1LJEA 1C10A 1GXXA 1OUDA 1RCMA 2BQJA 2HUBA 4TX7A 5I4WA 2BQNA 1J1PY 2GV0A 4HP0A 4TSCA 3T36A 4IASA 1YAOA 3B0IA 3IJVA 4C5FA 4H9BA 1IOCA 3AJNA 3ATNA 3WYHA 1JSFA 153LA 4ZFPA 4TWSA 1LSCA 4NSGA 5ILFA 1LSBA 1LJ4A 1UA6Y 5I5QA 4DYGA 1B7QA 4CFPA 5B59A 3TMXA 1LSPA 5KXXA 1DXJA 1LJIA 1XFPL 4D9ZA 1DQJC 1FN5A 2XTHA 4HPIA 1LZYA 2YBJA 1UIFA 2W1MA 4BAPA 4NGVA 5KXRA 3HBEX 2I25L 1JUGA 1WQRA 3WVYA 1YKYX 1LJHA 4WLXA 5KXYA 3WU7A 4QY9A 1TAYA 4WMGA 1LZ6A 1XGTC 1CKHA 2HEAA 4N8ZA 3OJPA 4TSBA 132LA 1HFZA 1NDMC 3AW6A 1RI8B 4NY5A 3W3EA 1QIOA 4MR1A 1G7LC 1B5VA 6LYTA 1LJNA 3SP3A 1B5UA 4N5RA 4ETEA 2CDSA 1LCNA 1LYOA 3WPJA 5ILCA 1FBIX 1HMKA 1IC7Y 2BQEA 3BKHA 4WM4A 4XJHA 1CKGA 4TUNA 1LZBA 4PHIA 3W6AA 3W6BA 2YSSC 1QQYA 207LA 4PPOA 8LYZA 2BQCA 4M4OA 1REMA 1KIPC 3IWRA 1B7OA 4QDNA 1DI4A 1YAQA 4NGZA 1I1ZA 3A95A 1LKRA 5APCA 4B49A 1OUAA 4GN4A 1WQPA 2C8OA 3ULRA 1KXWA 3P64A 2DQIY 1XGRC 3CQLA 3FI7A 1CKFA 1MELL 2DQHY 1LZ1A 2DQDY 4OWBA 1UICA 1HEMA 1B7PA 1FDLY 1GFGA 4NHIA 4XENA 1XSFA 3N9EA 1EQEA 2I6ZA 5LA5A 135LA 4HSFA 2XJWA 5KKIA 4HTQA 4CGEA 1IP4A 1HF4A 1NBYC 3E3DA 208LA 1AKIA 1PS5A 1JJ3A 2NWDX 3TXEA 2AUBA 5I53A 1LMAA 1IOQA 3KAMA 4M6DA 2HTXA 3W6EA 5B05A 1C43A 1GB8A 4H8XA 4PGJB 1GBOA 1GD6A 2YBHA 1IOSA 1NDGC 1IOTA 1REZA 3MGWA 1EQ4A 1QSWA 5F14A 2N5ZA 5LVIA 3LYTA 2Z2EA 3A6CY 1D0MA 1HFXA 1FLUA 4NG8A 1NWGA 3TXKA 4HPEA 3CB7A 3WUAA 1IP2A 3WU8A 2YBNA 2ZYPA 2VB1A 2FBBA 1GEVA 3N9CA 1NF5A 2Q0MX 3LYZA 4NGLA 1B9OA 1LHLA 1V7TA 2HECA 4N9RA 2Z18A 1B7MA 1GF6A 1TCYA 1J1XY 2MEBA 154LA 3G3BB 4L41A 1GFEA 1LZRA 3VWOA 4GLAA 1VFBC 4O34A 1REXA 4ETDA 4YF2A 4LT0A 133LA 1D6PA 1C46A 5D5CA 1VDSA 3CSZA 1PZYA 4LZTA 1B2KA 1JJ1A 4NHSA 1TBYA 4NSJA 4NWHA 2EPEA 1GF0A 1G7JC 1OQMA 3WPLA 4Z46A 1IIZA 2MEEA 3TMVA 1B7LA 1JKBA 4H8YA 5J7CA 3CT1A 1IVMA 3TXDA 4ET9A 5FCPA 4H92A 3M18B 4GCDA 4DD0A 1GE2A 4GCFA 1LSYA 1DPXA 1DPWA 1JSEA 2BQMA 4J1AA 5M1YA 4MSTA 2Z37A 1NBZC 1HEQA 4CJ2A 5FDJA 1KIQC 4KL7A 2DQEY 4NSIA 7LYZA 3F6ZA 4HJYA 1D6QA 1IWVA 3AZ7A 3IJUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A3QA 189LA 2OU8A 1KY0A 5FHWA 1P56A 3SB9A 2ZIJA 1L38A 1VEDA 3WULA 4WLYA 1L74A 2OTZX 1L40A 1QUOA 1CU0A 4P2EA 194LA 1WQMA 3DMZA 1D9UA 4NG1A 1C6EA 1CV3A 3EXDA 2ZIKA 4RLNA 1IEEA 4DD9A 1DYBA 1G0JA 1YKZX 4DKLA 1LSNA 1DYAA 1C6TA 2LCBA 1HFYA 1L36A 1D3MA 1B7SA 6LYZA 1LZ8A 1LSAA 1QT3A 201LA 1L43A 5KXKA 4NWEA 1L73A 1L77A 1L89A 3GUJA 4YOPA 1C6BA 1OUGA 3HH4A 1L03A 5LYTA 1B5XA 1CV5A 1LGXA 1LAAA 2CUUA 187LA 4HJVA 3GUIA 4ETBA 114LA 3A94A 3F9LA 2HEBA 1SSWA 4H9IA 4I0CA 4XJDA 1VDQA 2BQGA 1JEFA 1IC5Y 193LA 3A96A 4NGYA 1ZVYB 3HBDA 1C7PA 4WG7A 1WTNA 1GE0A 1GFHA 3CT0A 257LA 2MEDA 1Z55A 4EKQA 237LA 1LMQA 1LZDA 4TTDA 174LA 1GFVA 3TMWA 4J7VA 190LA 4G49A 1REYA 1L27A 1FKQA 1CU2A 4XJFA 2I26L 4W96A 1LYSA 1IR9A 3ATOA 1C08C 1P3NA 1LSDA 1G0QA 2W1LA 4LFPA 1G7MC 3LYMA 4OOOA 1QUSA 5D5FA 5E4PA 1C6HA 1CJ9A 2OE7X 4GCEA 2RBRA 1OUCA 1UCOA 2BQHA 2IHLA 1RJCB 3K2RA 3M3UA 2Y8PA 1W6ZA 2RAYX 1LGWA 1L50A 2DQCY 4W94A 1L79A 146LA 1G1VA 1L87A 1XEIA 2D4IA 1SQ2L 1C64A 1LMPA 4WLTA 1TEWA 1LSZA 4AGAA 5HNLA 1L84A 1BB7A 258LA 3OE6A 4G4HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GB0 A;  1GWD A;  2EQL A;  2MEF A;  3A3Q A;  5FHW A;  4GCC A;  4NGW A;  3A34 A;  4DD1 A;  1IO5 A;  5LIN A;  1RE2 A;  2ZIJ A;  2ZQ3 A;  2Z39 A;  3RW8 A;  1YAM A;  5B06 A;  4KPM A;  1VED A;  4WOA A;  4B0D A;  3WUL A;  4WLY A;  2RSC A;  2BQF A;  4H8Z A;  2YBM A;  5IHG A;  1LZG A;  2LZT A;  3AYQ A;  5KXP A;  1IP7 A;  1JKA A;  4BS7 A;  1T3P A;  2G4Q A;  4P2E A;  1IP6 A;  194L A;  1G7I C;  3ZEK A;  4B4I A;  5B1F A;  1WQM A;  3GXK A;  4LT2 A;  1I20 A;  5E9R A;  3TXJ A;  1D9U A;  1BHZ A;  4OWC A;  1O23 A;  4NG1 A;  4KXI A;  4R6C A;  5B1G A;  1G7H C;  1WVV A;  1GF8 A;  4FDY A;  1XEJ A;  1T6V L;  2D91 A;  3B0O A;  1IC4 Y;  4H1P A;  3TXB A;  2F30 A;  2PC2 A;  5APF A;  3TXH A;  5LVK A;  4CHX A;  1IR7 A;  1OUF A;  1OUJ A;  3EXD A;  4OWA A;  5EBH A;  5L3H A;  4G9S A;  3W6C A;  1DZB X;  1LMO A;  3TXI A;  2ZIK A;  1LZ9 A;  5I4Y A;  3AZ6 A;  3A67 Y;  4RLN A;  2D6B A;  1UIG A;  1IEE A;  1HSX A;  1JPO A;  2LHM A;  4GN5 C;  4NGO A;  4H9E A;  1LZT A;  2ZWB A;  4XAD A;  4DD9 A;  4DDC A;  1YKZ X;  2CJL A;  1GF5 A; 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 4HTQ A;  4CGE A;  1IP4 A;  1HF4 A;  1NBY C;  3E3D A;  208L A;  1AKI A;  1PS5 A;  1JJ3 A;  2NWD X;  3TXE A;  2AUB A;  5I53 A;  1LMA A;  1IOQ A;  3KAM A;  4M6D A;  2HTX A;  3W6E A;  5B05 A;  1C43 A;  1GB8 A;  4H8X A;  4PGJ B;  1GBO A;  1GD6 A;  2YBH A;  1IOS A;  1NDG C;  1IOT A;  1REZ A;  3MGW A;  1EQ4 A;  1QSW A;  5F14 A;  2N5Z A;  5LVI A;  3LYT A;  2Z2E A;  3A6C Y;  1D0M A;  1HFX A;  1FLU A;  4NG8 A;  1NWG A;  3TXK A;  4HPE A;  3CB7 A;  3WUA A;  1IP2 A;  3WU8 A;  2YBN A;  2ZYP A;  2VB1 A;  2FBB A;  1GEV A;  3N9C A;  1NF5 A;  2Q0M X;  3LYZ A;  4NGL A;  1B9O A;  1LHL A;  1V7T A;  2HEC A;  4N9R A;  2Z18 A;  1B7M A;  1GF6 A;  1TCY A;  1J1X Y;  2MEB A;  154L A;  3G3B B;  4L41 A;  1GFE A;  1LZR A;  3VWO A;  4GLA A;  1VFB C;  4O34 A;  1REX A;  4ETD A;  4YF2 A;  4LT0 A;  133L A;  1D6P A;  1C46 A;  5D5C A;  1VDS A;  3CSZ A;  1PZY A;  4LZT A;  1B2K A;  1JJ1 A;  4NHS A;  1TBY A;  4NSJ A;  4NWH A;  2EPE A;  1GF0 A;  1G7J C;  1OQM A;  3WPL A;  4Z46 A;  1IIZ A;  2MEE A;  3TMV A;  1B7L A;  1JKB A;  4H8Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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