4W51A

T4 lysozyme l99a with no ligand bound
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Homologous ligands accommodated by discrete conformations of a buried cavity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords Endolysin
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4w51A00
1L80A 1L32A 1CU3A 1L19A 141LA 3C7ZA 2Q9EA 1C6TA 191LA 1LLHA 1LGXA 1L24A 1OWYA 1CTWA 196LA 1G0LA 3QAKA 177LA 1L77A 246LA 163LA 218LA 228LA 1DYAA 3DNAA 1L05A 1SX7A 4EPFA 2RBOA 3NY8A 219LA 213LA 160LA 1L50A 1L43A 1QSBA 2B72A 3C7WA 4ARMB 4PJZA 3OE8A 1C6GA 1L29A 1JTMA 161LA 3HU8A 1L26A 1L48A 3HH6A 3HH5A 2OEAX 4DKLA 3CDVA 1QTCA 3CDTA 3CDOA 1G0QA 3C83A 3DN3A 1KW5A 4ARJA 4S0WA 1L30A 122LA 3HDFA 1SWZA 1C66A 1C6QA 224LA 1L03A 3VW7A 3DN4A 107LA 261LA 244LA 3RZEA 178LA 1LPYA 1L54A 112LA 1D3NA 1C68A 3PBLA 1LYEA 1L13A 1L55A 1L00A 1DYDA 2OTZX 3C82A 223LA 104LA 2RAYX 1C6LA 1L97A 1L51A 3NYAA 1C6CA 1LW9A 1CX7A 3HDEA 1C63A 1L35A 3C81A 4YX7C 2NTHA 4PK0A 1WTHA 1KS3A 4W51A 1CVKA 1DYEA 1ZURA 1K28A 1C6DA 1L57A 3F8VA 145LA 226LA 3GUIA 1CV6A 1L79A 1SSWA 113LA 254LA 7LZMA 181LA 1D3JA 1L14A 4I7KA 183LA 236LA 4E97A 1CV0A 2RBSA 1QTHA 1L81A 1L44A 217LA 3OE6A 3GUPA 215LA 1QUHA 4W59A 3DN1A 1L12A 176LA 158LA 1L86A 3DN6A 1QTZA 1C6JA 144LA 4EKRA 1LI3A 1C69A 1OV7A 243LA 1TLAA 3ODUA 1QTDA 123LA 3HT9A 1C64A 147LA 251LA 175LA 257LA 1L59A 4I7NA 1XJTA 166LA 2RBRA 214LA 3SB6A 1L83A 209LA 2LCBA 1G06A 197LA 1L04A 1CUPA 1PQIA 1L65A 3SBBC 3SB7A 103LA 173LA 1SWYA 225LA 4EPIA 1L52A 3C8SA 2B73A 2F32A 2O4WA 2B7XA 3RUNA 3DMZA 1OYUA 1L42A 4GRVA 2QARC 4LDOA 157LA 1CV3A 1L70A 1L36A 169LA 1L95A 165LA 2OE7X 4I7QA 3NY9A 3SN6R 3DN8A 1L68A 2B6XA 1L22A 149LA 1L0KA 1PQOA 155LA 1L41A 1L63A 2RH1A 4LDLA 3OE9A 3GUMA 1KY0A 1C6KA 189LA 231LA 232LA 2LC9A 200LA 3DMXA 3L2XA 1L67A 1T6HA 115LA 222LA 1CV4A 120LA 2ANVA 260LA 2NTGA 1L28A 1L46A 1L87A 1L27A 180LA 1L66A 3FADA 1OVHA 1T8AA 2RB2X 4IAPA 1L84A 4W58A 4K5YA 1L38A 206LA 1LGWA 199LA 3FA0A 233LA 2OU8A 2RB0X 3GUKA 1P56A 5I14A 1C6PA 1DYFA 168LA 2RAZX 1KY1A 2HUMA 1QT7A 1P36A 1ZYTA 242LA 110LA 221LA 4OO9A 142LA 150LA 4EKQA 1QTBA 4YXAC 4I7MA 1XJUA 1CU5A 3HH4A 3HH3A 249LA 2OE9X 1L33A 198LA 1D3MA 1PQJA 1C6EA 4I7RA 1G1VA 1P2LA 234LA 2L78A 3K2RA 1LYHA 3GUNA 182LA 1L0JA 119LA 3HUQA 190LA 4DJHA 1C6NA 1QUDA 1L53A 1L75A 201LA 3V2YA 1L07A 1G0MA 5LZMA 139LA 1QT8A 1P7SA 1L99A 2LZMA 2OE4X 3SB5A 2RBPA 131LA 1CU2A 1T97A 4AQNA 1CU6A 1L31A 186LA 118LA 2B70A 1L39A 1L18A 3HWLA 1P2RA 2OTYX 2B74A 1L82A 1C65A 1L73A 151LA 1CU0A 255LA 1DYGA 1L71A 143LA 1QUOA 3GUJA 229LA 1QT3A 4YXCA 1L91A 3HTBA 146LA 4ZPUA 4EKPA 1P3NA 164LA 4EJ4A 4LDEA 1C62A 1L89A 1L16A 1L69A 3LZMA 3HUAA 1C6MA 1D2YA 3EMLA 1LI2A 1DYBA 4EXMA 2A4TA 127LA 1G0PA 1L96A 3HT8A 1JTNA 1L45A 3SB8A 3G3WA 1SX2A 187LA 238LA 237LA 3HTFA 1L93A 258LA 1P64A 3CDQA 1P5CA 252LA 241LA 230LA 3DN2A 1ZWNA 2CUUA 3G3VA 2B6WA 2Z6BA 212LA 1QSQA 2OU0X 3HT7A 1QT6A 1L92A 248LA 1D9WA 1G07A 4ARQA 4ARMA 167LA 2O7AA 1L74A 4W56A 1L17A 1C6FA 4DAJA 192LA 3HU9A 2RBNA 1QTVA 3SBAA 4EKSA 1L15A 2B6TA 188LA 2IGCA 3CDRA 159LA 1L21A 140LA 3C7YA 1SSYA 4W57A 1L40A 1C61A 1LYGA 138LA 1C6BA 4GBRB 2RB1X 3HUKA 240LA 3PDSA 1I6SA 1JQUA 125LA 129LA 1L10A 2Q9DA 4ARQB 2B75A 174LA 1DYCA 1LYJA 1CX6A 3C80A 235LA 172LA 3C8QA 4I7TA 4W52A 1L60A 2RBQA 184LA 1QT5A 1KW7A 1OVJA 1L49A 2HUKA 1L34A 1G0GA 4I7JA 1B6IA 2QB0B 227LA 4I7OA 4ARLA 253LA 1D2WA 170LA 1L61A 1L58A 3DKEX 2B6ZA 1L72A 3JR6A 3DMVA 1L85A 109LA 3D4SA 130LA 1L47A 1P6YA 195LA 1C6AA 1LYDA 3HTGA 162LA 108LA 205LA 137LA 256LA 1OWZA 128LA 4I7LA 1QS5A 2B6YA 1LWKA 211LA 1QT4A 1T8GA 102LA 1G1WA 2ANXA 3UONA 259LA 3V2WA 1PQMA 3OE0A 126LA 1PQKA 3SB9A 2F47A 4I7PA 1LYFA 3HTDA 1PQDA 1CUQA 6LZMA 1OV5A 1G0JA 1P46A 1L98A 2F2QA 1L88A 3G3XA 3DN0A 1L02A 3GULA 1XEPA 1T8FA 1L56A 1LWGA 148LE 262LA 3HT6A 4ARPA 216LA 1L09A 1CV1A 1EPYA 250LA 1C6HA 1LYIA 1OVKA 1L01A 1L90A 1QUGA 245LA 2O79A 3FI5A 3L64A 1G0KA 1L23A 1L62A 152LA 185LA 1L37A 2HULA 4W54A 1C60A 1C67A 1D3FA 1L25A 220LA 3F9LA 1P37A 1L64A 4LZMA 4W53A 1L08A 239LA 1KNIA 1L94A 1LGUA 1CV5A 210LA 1L06A 247LA 2OU9A 156LA 1L20A 3GUOA 3C8RA 1L11A 4W55A 171LA 1QS9A 1C6IA 114LA 1L76A 1NHBA 4I7SA 1LI6A 111LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L80A 1L32A 141LA 1B7MA 2H9KA 1GBYA 1LJGA 1LMOA 2C8OA 1C6TA 1UUZC 1UIHA 3WULA 1WVVA 1OWYA 1CKCA 4QY9A 4ML7A 1CKDA 196LA 1IR7A 1LSCA 177LA 1L77A 4U3XB 228LA 2LZTA 5KJ9A 2Y8PA 1SX7A 3NY8A 1IVMA 213LA 2B5ZA 4ARMB 1C6GA 3HU8A 161LA 3AYQA 4MR1A 1QUTA 5KXTA 3CQLA 3CDOA 3C83A 1LZ8A 4W94A 224LA 3EO5A 2FBBA 3DN4A 1LPIA 2D4JA 244LA 1REYA 1L54A 112LA 4TSCA 3A3QA 1LYEA 154LA 1L55A 3LZTA 1FN5A 1QSAA 1AZFA 104LA 1RFPA 1BB3A 1IC5Y 1QSWA 4H90A 1ZVHL 2MEAA 1L51A 1WQMA 3WW6A 3HDEA 3E3DA 1V7TA 1C63A 4YX7C 2XBRA 2NTHA 1VATA 1EQEA 2PC2A 1K28A 1C6DA 3F8VA 3GUIA 1SSWA 254LA 4WO6A 4AXTA 1LMPA 3KAMA 2EPEA 1L14A 1WQRA 1BVKC 4E97A 3WPKA 1QTHA 3GUPA 3ZEKA 1QUHA 1L12A 5KXXA 3DN6A 1C6JA 1F0WA 144LA 1JPOA 1GF9A 1OP9B 1C69A 4KXIA 1TLAA 4DQ5A 3HT9A 3SP3A 3RU5A 3TMWA 4YENA 209LA 1GB0A 1IP5A 1CUPA 1SWYA 1LCNA 1YQVY 4CHXA 2ZQ4A 1UIGA 1E8LA 225LA 1LJEA 1YKYX 2MEHA 5HMJA 1OYUA 1J1PY 2QARC 2BQHA 4AGAA 169LA 1L95A 2HU3A 4I7QA 1C10A 2B6XA 4NHPA 1PQOA 1IWUA 1JJ1A 1IR9A 2RH1A 2Z18A 4NWEA 5D5FA 3GUMA 1DKJA 1KY0A 4DDBA 5IHGA 2LZ2A 1LZAA 1GB9A 231LA 2ZILA 1RE2A 4CJ2A 1LHJA 222LA 1NKHA 1LJ3A 1IWXA 4TWSA 1L46A 1L87A 1GB3A 1OUDA 1CJ6A 1VDQA 1B7SA 1YROA 4UWNA 3P4ZA 4W58A 1L38A 206LA 5B1GA 233LA 2OU8A 3GUKA 1P56A 4NHIA 3AGHA 5KXRA 1RI8B 4UWUA 1JKCA 142LA 150LA 4YXAC 3HH3A 3HH4A 3OK0A 1IWYA 1KIRC 3TMVA 1PQJA 4LT2A 1C6EA 4LT3A 4I7RA 4NHSA 1LYHA 4LYZA 3GUNA 182LA 190LA 1IP4A 1HEQA 201LA 4BAFA 2A7FA 2Z12A 4CGEA 1AKIA 1G0MA 5LZMA 2GV0A 5B06A 3WH1A 2RBPA 4RLMA 1IWTA 1CU6A 2B70A 3B0KA 1H6MA 3HWLA 1I20A 1BGIA 2B74A 2YBHA 1ALCA 3AZ7A 4OWEA 1L71A 1TEWA 2I6ZA 1HFXA 2CJLA 1BVXA 2XTHA 1B9OA 1GF6A 1VFBC 2W1MA 1L69A 5HLLA 3HUAA 1C6MA 4ETAA 1YL0X 4ET9A 3TXHA 1LZYA 4EOFA 1UIFA 4WOAA 1L45A 3G3WA 1MLCE 1SX2A 3HTFA 187LA 252LA 4HV1A 212LA 5K7OA 3HT7A 1T6VL 1BHZA 1QT6A 1C08C 5C6IA 1G07A 4ARQA 4ARMA 2BLYA 1YANA 1C6FA 192LA 3HU9A 2XJWA 1QTVA 1LSGA 1L15A 2XBSA 4P2EA 4QDNA 5HQ1A 1HHLA 1L21A 1LZTA 140LA 1XGPC 1GE3A 1CJ7A 3MGWA 1BQLY 4GBRB 3HUKA 2BQLA 1I6SA 2Q9DA 4DYGA 3EXDA 4NGKA 1G7HC 235LA 2ZNWY 5ILCA 3CB7A 1GPQC 2F4GA 2RBQA 4H9AA 4WM5A 1IP1A 2MEGA 1QT5A 1KXWA 4LYCA 4HTQA 5FSTA 1G0GA 4I7JA 1B6IA 2LYOA 5LIOA 4ARLA 3TXDA 1G7LC 1IP3A 1DI5A 1L72A 4RDSA 2H5ZA 4ETDA 1T3PA 3GXKA 4YM8A 3D4SA 130LA 3WW5A 1P6YA 4H8XA 4DD3A 1LYDA 1LHHA 137LA 4WLYA 1LZSA 3EBAB 4OWHA 4NHQA 5KXKA 2ANXA 4Z98A 4WLTA 3OE0A 1CUQA 3AW6A 1BB4A 2BQFA 1G0JA 3DN0A 1XEPA 1LJNA 4I8SA 1DQJC 4WM3A 262LA 2Z37A 2HUBA 1L09A 1CV1A 4KL7A 4ZFPA 3CT0A 5A3EA 1OVKA 1D6PA 2A7DA 2O79A 4DC4A 1GFAA 1L23A 152LA 3A96A 1HERA 4Z46A 4TTDA 1C60A 1L25A 1XGQC 1JKAA 2LYZA 5LA5A 239LA 1L94A 2Z19A 3LYZA 4O34A 1QDTA 1HENA 3C8RA 5LYMA 4W55A 171LA 1C6IA 1L76A 1QS9A 3ATNA 4ETEA 3WXUA 4TSBA 2DKVA 2YBLA 3C7ZA 3WPLA 2Q9EA 1FLWA 2G4PA 2N5ZA 191LA 1NF5A 3W6EA 1L24A 1CTWA 4FDYA 4DD2A 2YVBA 1DYAA 4GCFA 3DNAA 4GCEA 3A6CY 1LHKA 1ZV5L 2RBOA 2YBJA 1L50A 1IOQA 1RCMA 1GB6A 4WM6A 2ZNXY 1XFPL 3HH6A 5LVGA 1AM7A 1QTCA 194LA 3DN3A 1KW5A 4S0WA 1L30A 1GF0A 5M1YA 1SWZA 1TAYA 4ET8A 1GBOA 2BQBA 4J1BA 1LMTA 3WYHA 1L00A 4OOOA 3IJVA 2DQHY 3IJUA 4IASA 1C6LA 4PGJB 1C6CA 1QUSA 1HEWA 1DI4A 1SQ2L 5F9UA 4NGIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L80 A;  1L32 A;  141L A;  1B7M A;  2H9K A;  1GBY A;  1LJG A;  1LMO A;  2C8O A;  1C6T A;  1UUZ C;  1UIH A;  3WUL A;  1WVV A;  1OWY A;  1CKC A;  4QY9 A;  4ML7 A;  1CKD A;  196L A;  1IR7 A;  1LSC A;  177L A;  1L77 A;  4U3X B;  228L A;  2LZT A;  5KJ9 A;  2Y8P A;  1SX7 A;  3NY8 A;  1IVM A;  213L A;  2B5Z A;  4ARM B;  1C6G A;  3HU8 A;  161L A;  3AYQ A;  4MR1 A;  1QUT A;  5KXT A;  3CQL A;  3CDO A;  3C83 A;  1LZ8 A;  4W94 A;  224L A;  3EO5 A;  2FBB A;  3DN4 A;  1LPI A;  2D4J A;  244L A;  1REY A;  1L54 A;  112L A;  4TSC A;  3A3Q A;  1LYE A;  154L A;  1L55 A;  3LZT A;  1FN5 A;  1QSA A;  1AZF A;  104L A;  1RFP A;  1BB3 A;  1IC5 Y;  1QSW A;  4H90 A;  1ZVH L;  2MEA A;  1L51 A;  1WQM A;  3WW6 A;  3HDE A;  3E3D A;  1V7T A;  1C63 A;  4YX7 C;  2XBR A;  2NTH A;  1VAT A;  1EQE A;  2PC2 A;  1K28 A;  1C6D A;  3F8V A;  3GUI A;  1SSW A;  254L A;  4WO6 A;  4AXT A;  1LMP A;  3KAM A;  2EPE A;  1L14 A;  1WQR A;  1BVK C;  4E97 A;  3WPK A;  1QTH A;  3GUP A;  3ZEK A;  1QUH A;  1L12 A;  5KXX A;  3DN6 A;  1C6J A;  1F0W A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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