4YEOA

Triclinic hewl co-crystallised with cisplatin, studied at a data collection temperature of 150k - new refinement
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallography and chemistry should always go together: a cautionary tale of protein complexes with cisplatin and carboplatin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4yeoA00
4WO6A 4ZFPA 4I0CA 1JJ0A 1LSYA 2YBMA 4WM2A 1KIQC 1FDLY 1V7SA 2AUBA 1BWHA 2H5ZA 2MEDA 4NGKA 5KXSA 1GFTA 1LZBA 2BQIA 2MEAA 3QY4A 4N8ZA 4WO9A 2BQFA 1W08A 4IASA 1QSWA 1LSGA 1JHLA 2ZIKA 4H9IA 5KXPA 4ANRA 1YL0X 3A95A 1T6VL 5II3A 1I56A 1LMQA 1HFZA 1JJ1A 3ZVQB 1LJGA 5DL9A 1LZ9A 1UACY 1GE3A 1XSFA 4HV2A 5C6IA 5B06A 2BLYA 1LHHA 1IC7Y 1VDQA 4HJYA 3IWRA 1B7OA 1C10A 208LA 1LSCA 1E8LA 4H9FA 2F4AA 2BQCA 2ZYPA 193LA 1BWJA 3VWOA 3B0KA 1DXJA 2C8OA 3A90A 1LMPA 1YAOA 2D4IA 1CKHA 2Q0MX 3AB6A 1B7MA 4EMNA 3A93A 3CSQA 1DI5A 3HBEX 5EBHA 1NHEA 1GF8A 4WLYA 1LZAA 1GF4A 2W1MA 2BQLA 4TSBA 4WG1A 4H8ZA 4GN5C 1JISA 3AYQA 1OUIA 4GLAA 1FLYA 2FYDA 2BPUA 3N9AA 4OW1A 2EQLA 154LA 1O23A 5B1FA 4QY9A 1BWIA 1NF5A 1CKFA 5B1GA 4KL7A 1DI4A 4G9SA 5E4PA 2DQAA 2FBBA 4XJIA 1QTKA 1I20A 3A92A 3WW6A 5KXMA 5LVHA 1WQOA 5D5FA 2MEIA 4ZEEA 1LHMA 1BB5A 1HEQA 4CGEA 135LA 5ILCA 1YROA 4E3UA 3CSZA 5IHGA 1VAUA 2MEFA 4UWUA 1UUZC 1GE0A 1GFHA 1YAMA 4IJ4A 1JTTL 3LZ2A 3CSRA 1J1XY 1J1PY 1FKQA 1GEZA 1AM7A 3HBDA 1NDGC 4BAFA 2Z39A 1LZSA 1GFAA 1LSPA 1OQMA 1TCYA 3P68A 4TTDA 4X3BA 1IR7A 1GE2A 4NHTA 3WXUA 1RE2A 1XEIA 2BQMA 1D0MA 3AW6A 3P64A 1WQRA 3N9CA 1GF6A 4NGOA 5DN4A 1GFGA 4GCCA 5APFA 4G4CA 1UIGA 1JUGA 1P2CC 3WL2A 1AT6A 1IC5Y 3LYMA 2HEBA 4DDCA 3WPKA 4ETCA 1B5WA 5A3ZA 3RZ4A 4H92A 1JKCA 1C43A 3W6AA 4TX7A 3WUAA 1LJJA 1KXWA 2Z2EA 3A96A 4GCFA 3W6BA 4NG1A 1GXV2 3QE8A 1B7QA 5LAGA 1B7PA 1LAAA 1VDPA 2BQEA 2YSSC 4HV1A 1J1OY 4NSGA 1IP4A 194LA 3WU7A 4ETAA 2W1LA 4UWVA 1I1ZA 5KXXA 4NGWA 1UIAA 1IY4A 1GE4A 4NEBA 4Z98A 5K7OA 1GB9A 3A34A 1G7HC 1AT5A 1JEFA 4DT3A 1BQLY 4LYTA 1GBXA 4DWXA 2H9KA 4NG8A 1B7LA 2CWIA 4LYBA 3IJVA 4H8XA 5I53A 5IELA 1JWRA 1BB4A 4HJVA 1VDSA 2C8PA 1JPOA 1IY3A 5B05A 2YVBA 1LCNA 4DD0A 4NSIA 4NFVA 3TXJA 1IWXA 5FELA 2LZ2A 4U3XB 1XEJA 5HMVA 2GV0A 1OUCA 1GFVA 1TAYA 2EKSC 1GB6A 1IOSA 1DQJC 1F6SA 1LZYA 2Z37A 4IATA 3WULA 1EQ5A 1QSAA 4PPOA 1LJFA 4LT0A 5LVIA 5KXTA 2BQAA 3A6BY 2D91A 2G4PA 1HELA 1GF3A 4KT3A 1IVMA 1GF0A 1RFPA 1NBZC 1CJ7A 1F10A 2FYCA 3CT5A 1TBYA 3WVYA 5ILFA 1HC0A 3GXKA 1LZ6A 1BHZA 1PZYA 4WM5A 2Z2FA 4GLVA 4HPIA 5KXZA 1B2KA 1LYSA 1GB5A 1GE1A 207LA 2HEFA 1VDTA 4N5RA 2EIZC 5KKIA 1GFKA 2BLXA 3P4ZA 3W6EA 1G7IC 2NWDX 1LZTA 4H9CA 4XYYA 1GPQC 2DBTA 5HNCA 1LMAA 1QTEA 4QEQA 1LHLA 3J6KA 3KAMA 1OUEA 1IORA 1JIYA 1HENA 3CQLA 1QQYA 4H94A 1UC0A 1HMLA 3T36A 1CKDA 1B0DA 3ATOA 4XJBA 2BAAA 1UIDA 1IP6A 3B0IA 3TMWA 2MEEA 3LYZA 5B07A 3A91A 4XENA 2IHLA 4M4OA 1GB8A 1GBYA 5A3EA 1LSNA 1OUDA 2CGIA 2ZYCA 3RW8A 1B5ZA 4BADA 4DD9A 1HEMA 4CJ2A 1LKSA 2Y8PA 2HU1A 2ZILA 1IWWA 1XGTC 3ATNA 5KXYA 5F81A 3LYTA 1HFYA 2LYMA 3ZEKA 5DM9A 4NGZA 2G4NA 3TMVA 2Z12A 1LJIA 1IOCA 1EQ4A 5L3HA 3W3EA 5C6JA 1OUAA 2DQJY 4DD7A 4YEMA 3FI7A 3WU9A 1INUA 3WXTA 5L3IA 5M1YA 1C45A 1XGUC 1REZA 3RNXA 3RT5X 4CHXA 1B5YA 5FEKA 4PRQA 4PHIA 2B5ZA 1VATA 3ZVQA 9LYZA 1LSZA 2MEHA 1HMKA 1MLCE 4LFPA 1LJ4A 4O34A 4WLXA 1D6QA 2HTXA 5KXWA 4NSHA 3TXDA 1IC4Y 4ZIXA 1QUSA 4LZTA 1EQEA 4YM8A 1PS5A 1F6RA 2LYOA 2LZTA 4B4EA 4LYOA 1GB7A 1LHIA 5KKJA 4OWAA 4ETBA 153LA 2Z18A 5KXLA 1FBIX 4OOTA 4MR1A 2D4JA 3A3QA 4W94A 1LYZA 5APCA 3FE0A 3TMXA 1GAYA 1CKGA 5I4YA 1WTMA 3HFMY 1LPIA 1LZ4A 1UBZA 4GN3A 5J7CA 4XN6A 4Z3MA 1OUJA 2Z19A 2HUBA 1LZ1A 4WMGA 5F14A 1YAPA 2G4QA 1C7PA 3TXFA 5C6LA 2XBSA 3IJUA 4FDYA 4MSTA 3SP3A 5FSTA 6LYZA 5LA8A 3B0OA 3TXEA 2D4KA 2DQCY 3AW7A 4L41A 1D0KA 1IO5A 2Z38A 1GBSA 1JSEA 1NKHA 5DLAA 2YDGA 3WW5A 4ETDA 2DQEY 2W1XA 2HEAA 4OWHA 5LVKA 5I4XA 2XTHA 1LOZA 3AZ6A 4YOPA 2MECA 2YBIA 4HTNA 1GBZA 3EO5A 132LA 1FLUA 1LYOA 2BQKA 1JITA 2BQBA 1DKKA 3P66A 1XFPL 1YAQA 1WVVA 5HNLA 4NHSA 4G4HA 4J1AA 5KY1A 1ZMYL 1Z55A 4H9EA 2RSCA 5D5CA 1CNSA 1JTPL 4YENA 2MEGA 1HFXA 3RU5A 1B5VA 2ZQ4A 1FN5A 1LJEA 1IWZA 1REMA 4II8A 4NWEA 4GCDA 1JTOL 3A94A 3TMUA 2D6BA 1HHLA 2YBJA 1MELL 4UWNA 1QDTA 1XGQC 3EMSA 4B49A 1A4VA 1LZCA 1IIZA 4BAPA 4D9ZA 5LYTA 1GBWA 1CKCA 1UIBA 4WM1A 2W1YA 1GF5A 4A7DA 4WG7A 2LHMA 2I26L 1LJ3A 4B0DA 1IX0A 5HLLA 2DQFC 1ZVYB 4H8YA 4I8SA 1B5UA 4LT1A 1JKAA 4NGJA 1TDYA 2VB1A 1LJKA 3WMKA 1NBYC 1LTMA 4H9AA 2CJLA 4WM3A 5LAFA 5FDJA 2ZWBA 4EOFA 1A2YC 5KXKA 4H1PA 1JSFA 2BQOA 1AKIA 2I6ZA 1IP3A 1LYYA 3AGHA 3F6ZA 1XGPC 4AXTA 2XBRA 4RW1A 1XGRC 1DPWA 1GFRA 4OWBA 1IWVA 5LYZA 5LVGA 3W6FA 1ALCA 5LXWA 5LVJA 1WTNA 1B7RA 3BKHA 3AZ7A 4TUNA 1LZ5A 4HJZA 1FLQA 1YANA 1YKXX 4NWHA 4PRUA 5KXRA 1SLYA 4HP0A 1B5XA 5FCPA 1VFBC 3LZTA 4RW2A 1OUHA 4YEOA 5F9XA 3AJNA 4TSCA 2A7DA 1DKJA 4Z41A 5AMYA 4J0LA 1HEOA 1VEDA 5DN5A 5FHWA 4B4JA 2YBHA 1IR9A 5L9JA 1CJ6A 4HPEA 4NHIA 1IWUA 2BQNA 3G3BB 2HECA 1GWDA 2MEBA 1HNLA 1W6ZA 4NHPA 4ET8A 1LMNA 1LZGA 3TXIA 4LFXA 1D0LA 3M18B 1HEWA 5I5QA 4XJDA 3CB7A 1FKVA 1LJHA 3CT1A 3GXRA 4HTKA 4LT2A 1UCOA 2WARA 1GF7A 1RI8B 4WOAA 5F16A 3LYOA 5IDDA 1GB0A 3D9AC 1LZEA 4LT3A 3WPJA 2N5ZA 5JENB 4NSJA 5LIOA 3TXBA 1KIPC 3HBHA 1BVXA 5APEA 1N4FA 4QDNA 1WQQA 3B6LA 1ZV5L 3E3DA 1IP1A 3WU8A 3AZ5A 2X0AA 4XADA 1LZRA 4R0FA 2BQGA 2YBLA 3LHMA 1BGIA 1GDWA 1LSMA 4AGAA 3MGWA 4CFPA 1G7LC 2ZIJA 4OOOA 1HERA 1B9OA 4ETEA 1C08C 5LA5A 4M6DA 4R6CA 1B7SA 4LGKA 1YILA 1IOQA 4N0JA 4DC4A 1RCMA 1HEPA 3G3AB 4N9RA 3TXKA 1GF9A 4W96A 3TXGA 4RLNA 4BS7A 3N9EA 1LZ8A 1TEWA 2BQDA 3P65A 4YF2A 4DD1A 1JJ3A 3LN2A 1IWTA 3WPLA 2H9JA 4P2EA 8LYZA 4NGIA 4QGZA 5B59A 1LHKA 1IWYA 1D9UA 3WVXA 4HTQA 1JKBA 1CJ8A 3EBAB 1IP2A 4WM4A 4H91A 1H6MA 4RLMA 4J7VA 1CJ9A 4DDAA 3K3TA 1GB3A 1QDRA 5T3FA 4Z46A 1WQNA 4J1BA 2PC2A 4B4IA 5KXNA 1UIEA 1LKRA 5E9RA 1LHJA 4GCEA 4H90A 4XJGA 3WH1A 1LSAA 3T6UA 2ZQ3A 4CFOA 1D6PA 1UIFA 7LYZA 133LA 3A3RX 1AZFA 1IR8A 4OWCA 3QNGA 1GBOA 1V7TA 2XJWA 2ZNWY 4PJ2C 4N1EI 2DQDY 2ZNXY 2F4GA 3J4GA 4WLDA 4WL6A 4XJHA 1LMCA 4DDBA 1GHLA 1BB6A 4ML7A 4RDSA 1EL1A 3D3DA 1SQ2L 1ZVHL 1FLWA 2DKVA 3WUMA 5KJ9A 1GDXA 1DI3A 6LYTA 1DPXA 1HF4A 3WUNA 4LYCA 2F2NA 4LYZA 1H87A 1LSFA 1QIOA 3A8ZA 1REXA 3W6DA 1NQIA 3OK0A 4H9BA 4NGLA 4PGJB 4WLTA 1C46A 1WQPA 1YKZX 4KPMA 1KXYA 2HU3A 4NIJA 1HSXA 1LJNA 4DYGA 1REYA 1LSBA 4XJFA 5I4WA 1QUTA 4OWEA 1WQMA 3M3UA 1HSWA 1JKDA 3A6CY 4C5FA 1F0WA 2HEEA 1LMOA 4KXIA 1IOTA 5LINA 134LA 1T3PA 5KXOA 1G7MC 3A67Y 1GD6A 1LZDA 1RJCB 4GN4A 4H9HA 4C3WA 5I54A 4WM6A 1GFUA 1GAZA 1DZBX 3EXDA 1XEKA 2LYZA 1OUFA 3ULRA 4DD2A 2IFFY 1IP7A 4H93A 4G49A 3B72A 2YBNA 4TWSA 1GFEA 3OJPA 2DQHY 4LYMA 1UIHA 4NY5A 1GEVA 5HMJA 1YKYX 1BVKC 3TXHA 1GXXA 5LYMA 1OUBA 1YQVY 1WVUA 4NGYA 3AGGG 1B7NA 2A7FA 2BQHA 4NGVA 3W6CA 1IP5A 1NDMC 3WYHA 4FJRA 1LSEA 1LSDA 1OUGA 2DQIY 3AZ4A 3BKVA 4N1CC 5F9UA 1GFJA 1KXXA 4HSFA 2EPEA 5APDA 4WL7A 2F30A 1YL1X 2BQJA 1BB7A 1NWGA 4G4BA 1GB2A 1LZNA 4DD3A 1KIRC 2FBDA 4ET9A 4B1AA 1NMMA 1YIKA 2CDSA 1UICA 1BB3A 2I25L 4MCKA 2DQGY 4NHQA 1LMTA 1IEEA 1OP9B 1UA6Y 3AGIA 5HQ1A 4GCBA 3CT0A 2HEDA 1G7JC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
250LA 4ZFPA 3HT8A 262LA 1L22A 2MEAA 3QY4A 4WO9A 1LSGA 1SSWA 1YL0X 3A95A 1L50A 5II3A 5DL9A 2HULA 1B7OA 1C10A 1LSCA 1T8AA 1L08A 3B0KA 258LA 2C8OA 3GULA 3EMLA 156LA 2A4TA 233LA 3DMVA 3HBEX 1DI5A 3D4SA 1GF4A 2W1MA 1P64A 1OWZA 1QS5A 3AYQA 241LA 154LA 4QY9A 4G9SA 4XJIA 3DNAA 181LA 4ARMB 1LHMA 4EXMA 4CGEA 135LA 5ILCA 1C6EA 1XJTA 3K2RA 152LA 1ZYTA 112LA 3V2YA 1GEZA 3SB6A 2O4WA 4BAFA 2Z39A 1LZSA 1LSPA 3P68A 201LA 4I7LA 4X3BA 222LA 1GE2A 1XEIA 1G0PA 2BQMA 3P64A 3N9CA 4NGOA 5APFA 1P2CC 1AT6A 1IC5Y 4H92A 1C43A 3WUAA 1KXWA 3A96A 1UIAA 1IY4A 1GB9A 1P37A 244LA 3A34A 1G7HC 1AT5A 1D3FA 237LA 3PDSA 3IJVA 228LA 1P2RA 4NSIA 3TXJA 1L83A 1XEJA 2GV0A 2EKSC 1LZYA 1DQJC 1CV1A 1QSAA 5LVIA 5KXTA 2G4PA 3HWLA 1CJ7A 1PQKA 5ILFA 4WM5A 2Z2FA 4GLVA 1B2KA 1GB5A 1VDTA 3W6EA 2NWDX 4XYYA 1C6AA 1C66A 1LZTA 1GPQC 1L63A 1L13A 1LMAA 1QUHA 3J6KA 149LA 1HENA 1L34A 3CQLA 212LA 3JR6A 1UIDA 5A3EA 1C6FA 1C6JA 4CJ2A 1L73A 3ODUA 1LKSA 2ZILA 1L65A 1IWWA 1XGTC 1JQUA 2LYMA 3ZEKA 1LJIA 4IAPA 1EQ4A 5L3HA 5C6JA 3WXTA 1XGUC 1REZA 3RT5X 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WO6 A;  4ZFP A;  4I0C A;  1JJ0 A;  1LSY A;  2YBM A;  4WM2 A;  1KIQ C;  1FDL Y;  1V7S A;  2AUB A;  1BWH A;  2H5Z A;  2MED A;  4NGK A;  5KXS A;  1GFT A;  1LZB A;  2BQI A;  2MEA A;  3QY4 A;  4N8Z A;  4WO9 A;  2BQF A;  1W08 A;  4IAS A;  1QSW A;  1LSG A;  1JHL A;  2ZIK A;  4H9I A;  5KXP A;  4ANR A;  1YL0 X;  3A95 A;  1T6V L;  5II3 A;  1I56 A;  1LMQ A;  1HFZ A;  1JJ1 A;  3ZVQ B;  1LJG A;  5DL9 A;  1LZ9 A;  1UAC Y;  1GE3 A;  1XSF A;  4HV2 A;  5C6I A;  5B06 A;  2BLY A;  1LHH A;  1IC7 Y;  1VDQ A;  4HJY A;  3IWR A;  1B7O A;  1C10 A;  208L A;  1LSC A;  1E8L A;  4H9F A;  2F4A A;  2BQC A;  2ZYP A;  193L A;  1BWJ A;  3VWO A;  3B0K A;  1DXJ A;  2C8O A;  3A90 A;  1LMP A;  1YAO A;  2D4I A;  1CKH A;  2Q0M X;  3AB6 A;  1B7M A;  4EMN A;  3A93 A;  3CSQ A;  1DI5 A;  3HBE X;  5EBH A;  1NHE A;  1GF8 A;  4WLY A;  1LZA A;  1GF4 A;  2W1M A;  2BQL A;  4TSB A;  4WG1 A;  4H8Z A;  4GN5 C;  1JIS A;  3AYQ A;  1OUI A;  4GLA A;  1FLY A;  2FYD A;  2BPU A;  3N9A A;  4OW1 A;  2EQL A;  154L A;  1O23 A;  5B1F A;  4QY9 A;  1BWI A; 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 1DPX A;  1HF4 A;  3WUN A;  4LYC A;  2F2N A;  4LYZ A;  1H87 A;  1LSF A;  1QIO A;  3A8Z A;  1REX A;  3W6D A;  1NQI A;  3OK0 A;  4H9B A;  4NGL A;  4PGJ B;  4WLT A;  1C46 A;  1WQP A;  1YKZ X;  4KPM A;  1KXY A;  2HU3 A;  4NIJ A;  1HSX A;  1LJN A;  4DYG A;  1REY A;  1LSB A;  4XJF A;  5I4W A;  1QUT A;  4OWE A;  1WQM A;  3M3U A;  1HSW A;  1JKD A;  3A6C Y;  4C5F A;  1F0W A;  2HEE A;  1LMO A;  4KXI A;  1IOT A;  5LIN A;  134L A;  1T3P A;  5KXO A;  1G7M C;  3A67 Y;  1GD6 A;  1LZD A;  1RJC B;  4GN4 A;  4H9H A;  4C3W A;  5I54 A;  4WM6 A;  1GFU A;  1GAZ A;  1DZB X;  3EXD A;  1XEK A;  2LYZ A;  1OUF A;  3ULR A;  4DD2 A;  2IFF Y;  1IP7 A;  4H93 A;  4G49 A;  3B72 A;  2YBN A;  4TWS A;  1GFE A;  3OJP A;  2DQH Y;  4LYM A;  1UIH A;  4NY5 A;  1GEV A;  5HMJ A;  1YKY X;  1BVK C;  3TXH A;  1GXX A;  5LYM A;  1OUB A;  1YQV Y;  1WVU A;  4NGY A;  3AGG G;  1B7N A;  2A7F A;  2BQH A;  4NGV A;  3W6C A;  1IP5 A;  1NDM C;  3WYH A;  4FJR A;  1LSE A;  1LSD A;  1OUG A;  2DQI Y;  3AZ4 A;  3BKV A;  4N1C C;  5F9U A;  1GFJ A;  1KXX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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