4YXCA

Complex of flim(spoa)::flin fusion protein and flih(apar)::t4lysozyme fusion protein
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
GPVDMSNELPWQVWTPDDLAPPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A common assembly module in injectisome and flagellar type III secretion sorting platforms.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein transport
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar enteritidis str. se30663
molecule keywords Flagellar assembly protein H,Endolysin
total genus 61
structure length 182
sequence length 182
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-03-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4yxcA00
1L09A 1CX6A 2B74A 1L40A 1QTHA 3NYAA 163LA 1L44A 2NTGA 1CV3A 237LA 1DYFA 1QT8A 3FI5A 3GULA 1LI3A 1L89A 103LA 4LDEA 1OVJA 3DMVA 216LA 260LA 1L23A 1L34A 1G0GA 1L92A 1C63A 1CUQA 4ARLA 1L07A 1L45A 2RAYX 1C60A 2B70A 221LA 218LA 3C8RA 1D3FA 1L30A 214LA 1NHBA 227LA 1P64A 1L37A 2RB2X 1L0JA 127LA 1L87A 1L52A 1D3MA 1QSBA 232LA 1KY1A 2HUKA 1QT5A 1C66A 1QS5A 215LA 3V2YA 1G1VA 3L64A 187LA 230LA 3NY9A 4GBRB 1LYEA 2O7AA 172LA 1B6IA 244LA 1C6KA 1L95A 3QAKA 161LA 5LZMA 1KY0A 212LA 1L90A 1P3NA 131LA 3DN3A 3SB5A 183LA 255LA 1C6IA 1QTVA 3CDVA 162LA 256LA 3OE6A 2HUMA 140LA 1G0PA 2LC9A 240LA 3HDFA 1L22A 3CDRA 164LA 1L38A 3C7ZA 185LA 141LA 1G0QA 2RB1X 1LYHA 107LA 1D2WA 206LA 1L39A 4I7TA 1L10A 4W57A 137LA 251LA 4ARQB 1L91A 1L06A 1WTHA 1C6DA 1QUHA 2ANXA 4I7PA 168LA 1SSYA 3SBAA 1TLAA 3G3XA 1G0MA 1L12A 3HTBA 1CU3A 3SB7A 4EKPA 2RH1A 1G0LA 2F32A 1QTZA 2LZMA 209LA 1L03A 4PK0A 3F9LA 1G0KA 223LA 3DN8A 1L63A 195LA 1L99A 3DN4A 1L08A 1L55A 3C82A 4W59A 3HH4A 1DYGA 4I7NA 108LA 3RZEA 171LA 1L69A 1L76A 1L41A 1LYFA 4EPIA 1L71A 1P2LA 1L21A 2B6ZA 109LA 1LWKA 1L77A 2RBOA 3G3WA 1L19A 158LA 1XEPA 4GRVA 1OWYA 1DYCA 1L57A 3GUOA 1P37A 3PBLA 4W51A 3SN6R 1L98A 2F2QA 3HT9A 1L28A 155LA 199LA 1SSWA 4LDLA 1L43A 1OYUA 2OU9A 3LZMA 4I7SA 2QB0B 1QTBA 2RB0X 3C8QA 1XJUA 1CUPA 1T8FA 2F47A 1L01A 2IGCA 2L78A 4YXCA 2B73A 1L65A 174LA 2B6TA 217LA 104LA 233LA 1KW5A 225LA 146LA 113LA 1DYDA 102LA 1L72A 4I7QA 1C69A 2HULA 3OE0A 4YXAC 3DN1A 249LA 149LA 1CV5A 3F8VA 1L26A 1L51A 3GUJA 110LA 1P46A 1C6MA 1L67A 1P7SA 4I7MA 2OU8A 1L20A 176LA 1L36A 4EPFA 2B7XA 1C6CA 1L48A 4EXMA 1L29A 7LZMA 3FA0A 3DKEX 238LA 2B6XA 1D3NA 1P2RA 1KNIA 1L02A 2O4WA 1OWZA 1L97A 4EKSA 1L75A 211LA 1CU0A 145LA 243LA 1T97A 1L33A 181LA 2RBRA 118LA 180LA 4IAPA 1LGUA 228LA 3HT6A 184LA 2B72A 188LA 3DN0A 1G06A 2B6YA 1DYBA 1DYAA 2OE7X 1L84A 2Q9DA 3SB8A 234LA 3HU9A 1PQDA 2ANVA 3G3VA 1QUDA 4ARMB 2RBQA 242LA 1L82A 1QUGA 222LA 1JQUA 3HH5A 129LA 3HTDA 1L31A 4W55A 3HTFA 170LA 178LA 5I14A 1LYGA 1SWZA 6LZMA 1CTWA 2B75A 182LA 3OE9A 1LYIA 4W56A 3SB6A 1PQJA 4K5YA 4DKLA 1C67A 4I7OA 186LA 1L85A 3C8SA 1PQKA 4S0WA 3HUAA 1QTDA 147LA 177LA 241LA 1OVHA 3GUIA 1C6FA 261LA 253LA 4W52A 1OVKA 254LA 1G07A 1LI2A 2QARC 119LA 1C6PA 262LA 1L74A 239LA 3C83A 226LA 1L35A 1L56A 4LDOA 200LA 1LLHA 4PJZA 213LA 1C62A 231LA 1PQIA 1L50A 3DMZA 125LA 1L13A 2OEAX 3HH3A 1JTNA 3SBBC 2RBPA 245LA 3HU8A 197LA 1C6AA 1CX7A 1CU2A 1C6JA 1L54A 1ZURA 1L11A 3RUNA 1L81A 198LA 128LA 1L68A 3D4SA 167LA 1L25A 1SX7A 2RBSA 1CV0A 248LA 201LA 3OE8A 1D3JA 169LA 1CV1A 1T8GA 1ZWNA 130LA 191LA 259LA 166LA 1D9WA 1LYDA 3HH6A 1C64A 192LA 4AQNA 196LA 1L18A 138LA 143LA 160LA 2CUUA 1QSQA 3NY8A 1C6TA 210LA 1L05A 2A4TA 1L96A 1SWYA 4ARQA 157LA 165LA 122LA 2Q9EA 4W58A 151LA 2RBNA 1L66A 1QT6A 189LA 1C6BA 1L0KA 1OV7A 1L46A 3DN2A 3HUQA 2OTZX 3VW7A 1ZYTA 4YX7C 1L86A 1P56A 3K2RA 1K28A 1LPYA 4I7KA 3FADA 1L27A 150LA 4EKQA 3PDSA 1PQMA 152LA 3CDQA 1CV4A 148LE 3C7YA 1CU6A 1I6SA 1L00A 219LA 2Z6BA 111LA 1L04A 1T8AA 4I7LA 3GUPA 2RAZX 229LA 3CDOA 235LA 1L73A 1XJTA 4W53A 126LA 1JTMA 3V2WA 1L93A 1G0JA 1C6LA 1PQOA 3HT7A 3HT8A 2OE9X 4W54A 1L60A 205LA 4EJ4A 190LA 246LA 252LA 1L61A 257LA 1P5CA 1C6NA 3C80A 1LYJA 1L58A 3DNAA 2O79A 1LGXA 2NTHA 3C7WA 1CV6A 250LA 4ARPA 1L15A 139LA 1L64A 1LWGA 144LA 1C65A 3GUMA 1L59A 4DJHA 2OE4X 3CDTA 1P6YA 175LA 3DN6A 1L79A 1C6GA 1L47A 1T6HA 1L80A 1LW9A 3HUKA 4E97A 1DYEA 1P36A 1QT7A 1L24A 220LA 224LA 3GUKA 142LA 4OO9A 1LI6A 3C81A 159LA 1C6QA 1C6HA 1L42A 1L83A 4ZPUA 114LA 173LA 3ODUA 1KW7A 1QT3A 4EKRA 3EMLA 1L94A 3HWLA 3GUNA 1C6EA 1C68A 1L17A 1QTCA 2OU0X 123LA 1C61A 1CVKA 1L70A 1L88A 1L49A 1SX2A 2LCBA 1L53A 112LA 2OTYX 1L32A 1L62A 1QS9A 4I7RA 1QUOA 3JR6A 4I7JA 4LZMA 1D2YA 3SB9A 1KS3A 1CU5A 3HDEA 2B6WA 1OV5A 115LA 1EPYA 236LA 258LA 1QT4A 1LGWA 3HTGA 4ARMA 247LA 1L14A 4DAJA 120LA 3L2XA 3DMXA 3UONA 4ARJA 1L16A 156LA 1G1WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UIBA 1CX6A 2Q0MX 5KXSA 1CV3A 3FI5A 3GULA 3ZVQA 1LI3A 1YANA 1VDTA 1UIHA 4H8XA 1CUQA 4ZIXA 1C60A 1WQQA 2B70A 4Z3MA 207LA 1LSZA 1L0JA 2D4JA 1L87A 2G4PA 4B4EA 1D3MA 1B5XA 1C66A 1G1VA 1GB7A 3OK0A 3SP3A 1ZMYL 2PC2A 1GB2A 5LVGA 2MEIA 1BVXA 3QAKA 4XJDA 2C8PA 1LJFA 1L90A 2LYMA 3DN3A 4H90A 4J0LA 1C6IA 5KXOA 3OE6A 2LC9A 4B49A 1GF7A 5JENB 1L22A 4NGOA 3C7ZA 141LA 2RB1X 1D2WA 4H9AA 137LA 1F0WA 4ARQB 1L06A 1C6DA 1QUHA 1XEKA 1BWIA 1SSYA 1CU3A 1G7HC 3P65A 2RH1A 3W6AA 3N9CA 209LA 1C45A 1LZ8A 1JKBA 3F9LA 1G0KA 2Z39A 4W59A 5DL9A 1B9OA 1LSBA 4I7NA 108LA 1GFAA 1SQ2L 1LJ3A 2MEHA 2IHLA 2XJWA 4EPIA 5KXNA 1LWKA 1L77A 1B0DA 1L19A 1UUZC 2ZILA 3PBLA 4N9RA 1L98A 1B7SA 1FN5A 155LA 199LA 1SSWA 4LDLA 2EKSC 2OU9A 4I7SA 3B0KA 2Y8PA 2VB1A 1YAOA 1DQJC 5LINA 1JUGA 2G4QA 1VDSA 1LTMA 3P64A 233LA 5LAFA 102LA 1GF8A 4LYTA 4I7QA 1SLYA 4GN4A 3A93A 1BVKC 1MELL 249LA 149LA 3B0OA 1C6MA 1B7NA 4XJGA 1RE2A 3WXTA 1IORA 1VATA 1LJEA 1L48A 3WPLA 1VFBC 4G4BA 3FA0A 238LA 3M3UA 2YDGA 1REZA 4DD7A 145LA 3A3RX 3A8ZA 4NGKA 118LA 2ZWBA 180LA 1YROA 4M6DA 5APDA 228LA 2BQJA 1IX0A 3AW6A 1LZ6A 2MEBA 3EO5A 1DYBA 2XQOA 1L84A 1LSYA 135LA 1B7MA 234LA 3G3VA 4XENA 2DQJY 2RBQA 1HEWA 4BAPA 4QDNA 1QUGA 4TX7A 4WM5A 1B5ZA 1L31A 3OJPA 178LA 4EOFA 2YVBA 4WLDA 3LYZA 1LZGA 2ZQ4A 1LYIA 3SB6A 1PQJA 4WM2A 1C67A 4I7OA 3F6ZA 4RDSA 1QTDA 1GB6A 2LZTA 147LA 241LA 5DN4A 1C6FA 4N8ZA 3TXFA 254LA 226LA 1LZSA 1L35A 1LMQA 2HEFA 1NHEA 200LA 4WM4A 1E8LA 4XJHA 1GBZA 3A96A 1PQIA 1HEOA 5KJ9A 3TXGA 1BB3A 2ZQ3A 3W6EA 1C6AA 4G49A 1TCYA 1ZURA 1LPIA 3RUNA 3WL2A 1L81A 2YBHA 128LA 1UIGA 1CV0A 1LYOA 201LA 4HPEA 3TMUA 1T8GA 5HQ1A 1G7MC 1CKDA 4AQNA 196LA 143LA 1ZVHL 1CKHA 1HHLA 2MEEA 4NGYA 3A67Y 1GB3A 1L96A 4NGWA 165LA 122LA 4W58A 3B0IA 1L66A 4C3WA 4YEOA 1C6BA 1L0KA 4G4CA 1D6QA 1ZVYB 3EBAB 1KIRC 2OTZX 3VW7A 4QY9A 1K28A 4NWEA 2MEDA 1IR8A 3PDSA 1PQMA 152LA 4WMGA 1CV4A 5LVIA 4LYCA 148LE 3FI7A 1L00A 2Z6BA 1T8AA 1LMOA 2ZYPA 5APEA 1QDTA 229LA 1H87A 5B59A 1HELA 2B5ZA 2HU1A 2OE9X 1JTPL 4EMNA 5KXKA 246LA 1GBWA 1HSWA 3C80A 1GWDA 3FE0A 1L58A 2CWIA 1LGXA 1CV6A 2EQLA 4OW1A 5J7CA 4NSGA 1P6YA 3HFMY 3DN6A 1D0LA 1H6MA 1L79A 1LHKA 4NG8A 3HUKA 3AYQA 1BGIA 4E97A 1DYEA 1QT7A 220LA 1RFPA 1GF3A 1NQIA 1LSPA 1C6QA 5DLAA 194LA 1V7SA 4ZPUA 4YOPA 3ODUA 1LMPA 1KW7A 1QT3A 1GE0A 5KXMA 3GUNA 1C6EA 1C68A 1L17A 2G4NA 1C43A 1HEQA 1JWRA 1EQ4A 1FDLY 1D2YA 1KS3A 1YQVY 2B6WA 2BQGA 3BKVA 1QT4A 1L14A 4DAJA 120LA 3L2XA 5B1FA 1GB8A 4HJZA 1OUHA 4NGIA 156LA 1L40A 163LA 1HENA 2H9JA 2HEAA 3QNGA 1L89A 4LDEA 5I4YA 1GF4A 5F16A 3DMVA 1L34A 4I8SA 1GPQC 1C63A 1IC5Y 4NGLA 1LCNA 3C8RA 1HNLA 3K3TA 2RB2X 4R6CA 1IWYA 1BB7A 1L52A 1QSBA 3W3EA 4WLYA 4DDBA 2HUKA 1LYZA 1QT5A 215LA 4HTKA 4GBRB 1J1XY 1LYEA 4KT3A 6LYZA 1HFYA 3WW5A 244LA 1L95A 2BQBA 4DT3A 1P3NA 1LSFA 4R0FA 4H9BA 1YILA 256LA 3LYMA 1LSNA 1G0PA 5B05A 1CJ6A 164LA 3QE8A 4ETEA 107LA 2BQEA 206LA 4ET9A 4W57A 1YL1X 3AZ4A 1TAYA 1L91A 4PRUA 4I7PA 1G0MA 1L12A 1YAPA 4EKPA 1UIAA 3LZTA 4TUNA 3AGGG 2F32A 4GCFA 1L03A 4PK0A 3DN8A 5T3FA 1L63A 4DD2A 3C82A 1PZYA 1L69A 1L76A 1L41A 5M1YA 1LZ9A 1L71A 3RU5A 1L21A 4H1PA 2B6ZA 1LMNA 2RBOA 158LA 1LZAA 4LT0A 1OWYA 3GUOA 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2YSSC 1GDXA 1QSQA 4GCBA 1YAMA 157LA 2AUBA 4N5RA 4DD3A 2RBNA 1IWUA 1NWGA 1GE4A 4GN5C 1RJCB 1FLWA 1IP1A 1OV7A 3WPJA 4MCKA 3HUQA 4HJVA 5I53A 1ZV5L 1ZYTA 4YX7C 1OQMA 1QSAA 3K2RA 4NWHA 1LZNA 1L27A 4EKQA 133LA 1V7TA 5HMJA 4CFOA 111LA 1YKXX 3GUPA 1L73A 1F6RA 4W53A 1CJ8A 126LA 3V2WA 1L93A 2Z2FA 4EJ4A 190LA 4HP0A 257LA 1C6NA 1UICA 4DYGA 5KXYA 1IWTA 2NTHA 3C7WA 3IJVA 250LA 3TMXA 1UIDA 139LA 1L64A 1LWGA 144LA 1C65A 1WVVA 3LYTA 1L59A 4DJHA 1HC0A 5D5FA 2YBMA 3AB6A 3ULRA 4NGVA 1T6HA 5FELA 1LKSA 5D5CA 3GUKA 5APCA 4OO9A 2BQMA 1IVMA 159LA 1L83A 114LA 3B72A 4DDCA 3WPKA 2DQEY 4CJ2A 4GLVA 3EMLA 3HWLA 4IASA 1GF6A 4YEMA 123LA 1L49A 1L53A 4E3UA 1L32A 1LSMA 1QUOA 3JR6A 4LZMA 1W08A 1OV5A 1B5UA 3HTGA 4ARMA 1D6PA 1LGWA 5IDDA 247LA 5F9XA 3HBEX 1OUJA 2DQFC 2B74A 4WG1A 1CKFA 1QTHA 3NYAA 1IOSA 1WQPA 1MLCE 4GCEA 237LA 4TTDA 4WO6A 5FEKA 1LHLA 1GB5A 4PGJB 5KXWA 1B5VA 3A34A 1L23A 4ET8A 1G0GA 3HBHA 1HFXA 1IR7A 1WQMA 1D3FA 1L30A 1LZCA 1GE3A 1LJNA 214LA 1NHBA 227LA 1Z55A 1P64A 1AM7A 1LMCA 5L3HA 1LMAA 1KY1A 232LA 1B5WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UIB A;  1CX6 A;  2Q0M X;  5KXS A;  1CV3 A;  3FI5 A;  3GUL A;  3ZVQ A;  1LI3 A;  1YAN A;  1VDT A;  1UIH A;  4H8X A;  1CUQ A;  4ZIX A;  1C60 A;  1WQQ A;  2B70 A;  4Z3M A;  207L A;  1LSZ A;  1L0J A;  2D4J A;  1L87 A;  2G4P A;  4B4E A;  1D3M A;  1B5X A;  1C66 A;  1G1V A;  1GB7 A;  3OK0 A;  3SP3 A;  1ZMY L;  2PC2 A;  1GB2 A;  5LVG A;  2MEI A;  1BVX A;  3QAK A;  4XJD A;  2C8P A;  1LJF A;  1L90 A;  2LYM A;  3DN3 A;  4H90 A;  4J0L A;  1C6I A;  5KXO A;  3OE6 A;  2LC9 A;  4B49 A;  1GF7 A;  5JEN B;  1L22 A;  4NGO A;  3C7Z A;  141L A;  2RB1 X;  1D2W A;  4H9A A;  137L A;  1F0W A;  4ARQ B;  1L06 A;  1C6D A;  1QUH A;  1XEK A;  1BWI A;  1SSY A;  1CU3 A;  1G7H C;  3P65 A;  2RH1 A;  3W6A A;  3N9C A;  209L A;  1C45 A;  1LZ8 A;  1JKB A;  3F9L A;  1G0K A;  2Z39 A;  4W59 A;  5DL9 A;  1B9O A;  1LSB A;  4I7N A;  108L A;  1GFA A;  1SQ2 L;  1LJ3 A;  2MEH A;  2IHL A;  2XJW A;  4EPI A;  5KXN A;  1LWK A;  1L77 A;  1B0D A;  1L19 A;  1UUZ C;  2ZIL A;  3PBL A;  4N9R A;  1L98 A;  1B7S A;  1FN5 A;  155L A;  199L A;  1SSW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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