5F14A

Structure of native hen egg-white lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Investigating the Impact of Polymer Functional Groups on the Stability and Activity of Lysozyme-Polymer Conjugates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5f14A00
3A92A 1JJ1A 4II8A 5LA8A 1LZGA 3CSRA 1EQEA 1YIKA 2BLXA 1RCMA 4A7DA 3ULRA 5LVGA 1MELL 1GF3A 1LSNA 1XGTC 1YL0X 1LHHA 1C08C 3A93A 2W1YA 1YKYX 5KXMA 4NHQA 4DDAA 2EIZC 4B49A 3WVXA 1WQQA 4QEQA 2F4GA 4N5RA 4DYGA 1DZBX 1IOSA 4DDCA 1IC5Y 2BQHA 1H6MA 5I53A 1KXWA 4NSGA 1CJ8A 4WLDA 4OWBA 4GN3A 3AGIA 2MEHA 4WL7A 2YBMA 5A3ZA 9LYZA 1IP3A 5KXWA 4ANRA 1SLYA 1IP1A 2EQLA 5FSTA 3WU8A 4GCCA 2D4KA 2Z38A 4IJ4A 2Z37A 2HECA 1IP7A 4TWSA 4NHPA 4M4OA 3A3QA 4I0CA 4YF2A 1QUTA 4HTKA 5I5QA 1LSMA 4Z3MA 1RI8B 4B1AA 4WO6A 193LA 2HEBA 4NGIA 1IWTA 1ALCA 4OWAA 3RU5A 2FBDA 1LJFA 4DC4A 3RT5X 4O34A 1XGRC 1B7LA 4J1BA 4OW1A 1IWVA 1LYSA 2DQGY 2DQJY 5KXPA 1GXXA 3LHMA 1CKFA 3B72A 4WM3A 3GXRA 5C6IA 3FI7A 3CB7A 1GE4A 4FJRA 1GFKA 3K3TA 1FLUA 1LJ4A 1OUBA 4XJIA 4OWCA 3W6BA 1LZBA 4CGEA 2G4NA 2YVBA 1DKKA 3A96A 1LSAA 4IASA 1UIBA 4PHIA 1D0MA 3T36A 1OUAA 1LMAA 2W1LA 1LSZA 3AZ4A 3CT5A 1GBOA 4WOAA 4R0FA 3OJPA 4LYMA 1JKCA 2D91A 2DQIY 2XBSA 5L3IA 2Z18A 5A3EA 4LFPA 4YOPA 5B1FA 1GB8A 1GEVA 1LJJA 4G49A 194LA 4WM1A 2ZYPA 4HJYA 1JSEA 4XJDA 154LA 2ZQ3A 3W6EA 5IELA 4QGZA 2W1XA 5FEKA 4GCFA 4H8YA 1HEPA 4GCBA 1B5VA 1LJNA 2H9JA 4RLNA 4XYYA 1BWJA 1BWHA 4N0JA 4EOFA 1LJ3A 3TXDA 4NSHA 3TXEA 1LZ8A 5F14A 1XEJA 1XEKA 3N9AA 4RDSA 4AGAA 3QE8A 5LIOA 3BKHA 4H9EA 5T3FA 3QNGA 1LAAA 1HEQA 2BQNA 5L9JA 3B6LA 3P68A 1GFTA 1WQPA 1GFUA 4B0DA 1BGIA 1GFEA 1OUIA 4GN5C 1TAYA 1B5YA 5LXWA 3MGWA 1BVKC 2MECA 4NHSA 3AYQA 4MCKA 2FYDA 1AM7A 1NKHA 2YBIA 1REZA 1YAOA 3LYZA 3W6AA 2Z12A 1FLQA 1GPQC 1WQNA 1IEEA 3CSQA 4G4BA 4ML7A 4DD9A 1LZTA 5KXRA 4QDNA 1YKZX 4H94A 1B2KA 2XJWA 3CT0A 2X0AA 1CKDA 1UIGA 1LSDA 5KXSA 1HERA 3WXTA 132LA 1WTMA 5KXZA 3A3RX 1KIRC 3W6FA 4HP0A 1VDTA 1W08A 1OUCA 1JKBA 1NWGA 5LYZA 2G4QA 3KAMA 3P4ZA 6LYTA 5HNCA 5I4YA 4OOOA 4NSIA 4NG8A 4G4HA 2CJLA 2MEFA 4D9ZA 4N1CC 3A34A 5FDJA 1BWIA 1YQVY 1HFXA 3A94A 1F6SA 1GBYA 4XJHA 3AW6A 1J1PY 4HPEA 1GF0A 3WUNA 3F6ZA 2A7DA 1HFZA 3RNXA 1WVVA 2F30A 5F9UA 1HMKA 4LGKA 1RE2A 1YAPA 5LA5A 2F2NA 4CJ2A 1HEWA 4GCDA 4WLTA 1IC4Y 1MLCE 1D9UA 1ZMYL 1GWDA 3WVYA 3WUMA 1IC7Y 1BB3A 1OUEA 3AZ5A 4H9FA 1INUA 4LT0A 1GF8A 2DQHY 2DQDY 4DD3A 5B59A 2XBRA 1OP9B 1YANA 1UIEA 1IP4A 1DI5A 5LVKA 1IWWA 5FCPA 5I4WA 1AZFA 1GB5A 1GE3A 2BPUA 4NGJA 4WM6A 4XJGA 2N5ZA 4NHIA 4DD0A 1G7LC 1LHJA 4GN4A 3TXBA 1C46A 4LZTA 1BB6A 2DBTA 3EXDA 2AUBA 1GB3A 1G7HC 5F16A 7LYZA 3HBHA 1HEOA 4NY5A 1OQMA 1YAMA 4LYZA 3D3DA 2D4IA 2DQCY 4BAFA 3CSZA 1LZCA 1LZEA 4FDYA 4BAPA 1I1ZA 1IY3A 2WARA 1UA6Y 3ATNA 4NFVA 1WQMA 1GAYA 1QTKA 1A2YC 4N8ZA 4RW1A 2BQFA 4RLMA 2B5ZA 4C3WA 3G3BB 4WG7A 5DN5A 3TXKA 2BQEA 4H9IA 4ETCA 1HMLA 4P2EA 1OUDA 1QTEA 5F81A 1HFYA 1KXXA 1LJHA 4CHXA 4W94A 1DXJA 1GF4A 2Y8PA 1WQRA 2BQJA 4G9SA 3WMKA 5I4XA 4KPMA 1IP2A 3T6UA 1NDGC 5HNLA 3WU7A 1I20A 1FKVA 1VDSA 5KXOA 1JTTL 3D9AC 4H1PA 4HV1A 4EMNA 5DM9A 1QDTA 2F4AA 1LMNA 1UIAA 5B1GA 1AT5A 4NWEA 1FBIX 4YM8A 1LMOA 4H8XA 2EKSC 2ZYCA 1LPIA 1UACY 1FLYA 1EL1A 4DDBA 3BKVA 4LT2A 1BB4A 1QDRA 1GD6A 1XFPL 3AGGG 3A90A 4N9RA 5HMVA 1HEMA 4KXIA 1KXYA 3WW5A 1RFPA 2CGIA 3HBDA 1CJ9A 1LSPA 208LA 2DKVA 4HJZA 4XADA 5ILFA 1YL1X 2PC2A 2IFFY 1REMA 2HEDA 2FBBA 3LN2A 1JPOA 1UICA 5DL9A 1BB5A 1GFRA 3FE0A 1D6PA 1JIYA 3IJVA 4H9CA 4NGVA 4NSJA 5L3HA 1HENA 3LYTA 2I25L 2G4PA 1BB7A 1YAQA 1D0KA 4X3BA 1EQ4A 1B7OA 1PS5A 1QSAA 1XGQC 2LYZA 2W1MA 4R6CA 5LVIA 4B4JA 5LYMA 2IHLA 1LYOA 3AZ6A 3E3DA 4CFOA 1JKAA 4ZEEA 4PRQA 5JENB 2BQDA 1C7PA 1A4VA 1JSFA 1OUFA 2C8OA 4MSTA 1GE0A 1JKDA 1GFGA 2Z39A 1GEZA 3P66A 3N9EA 2RSCA 1I56A 4BS7A 4HTNA 4NGWA 4CFPA 2H9KA 3A67Y 1VATA 3A6CY 1CKHA 5AMYA 1LMTA 4DWXA 5M1YA 1REYA 1JJ0A 1WVUA 4ZFPA 3J6KA 2YSSC 3A95A 2BQIA 1TBYA 1TCYA 2ZIJA 4H92A 4H9HA 1VFBC 4LYOA 4LT1A 5KXYA 4GLAA 1ZVYB 3ZEKA 2BQOA 1GBWA 1GF7A 2I26L 4H91A 1IORA 1IP6A 3AGHA 1IO5A 1LSFA 2MEBA 4W96A 1HSWA 1SQ2L 1FN5A 1G7MC 1GXV2 5C6JA 3LYOA 1G7JC 3LZ2A 2ZIKA 1B7MA 1AKIA 1CKCA 2HU3A 1IWXA 1GB7A 1GE1A 1BHZA 1LYZA 3N9CA 1LZ4A 1JUGA 1LYYA 1UIFA 4J0LA 2BQGA 1LZ9A 1JHLA 1HHLA 1LZRA 4GLVA 1JTPL 2HU1A 1FLWA 4GCEA 1LTMA 4TX7A 1W6ZA 3RZ4A 2H5ZA 1IOQA 1GFJA 2BQAA 2Z2EA 3WW6A 4B4IA 1LSCA 1LZ6A 4DT3A 1TDYA 1B5XA 1B7RA 4HPIA 5II3A 1GHLA 1IP5A 1LZDA 2HEEA 2D6BA 3LYMA 4PRUA 1NMMA 1UIDA 1P2CC 1BVXA 2BAAA 2LZTA 5KXLA 3WPLA 1NBZC 1PZYA 135LA 3TXIA 1IWYA 2LYMA 5E4PA 3VWOA 2BLYA 3J4GA 3CT1A 5J7CA 1OUHA 1BQLY 3TMWA 1FKQA 3AJNA 1WTNA 1LSEA 5FELA 3LZTA 3WUAA 1ZVHL 1AT6A 3WU9A 5KXTA 4ETAA 4KT3A 4YEMA 4HSFA 4HJVA 2MEIA 4WMGA 5DLAA 3SP3A 3TXGA 4LFXA 1D0LA 4NGOA 5ILCA 1DPWA 4RW2A 1HNLA 2LZ2A 2VB1A 3B0OA 1LZYA 4WM5A 1IR9A 1JEFA 1LKSA 1LZ5A 3AB6A 3TXHA 1GB9A 4LYCA 2BQMA 1XGUC 1LHLA 4M6DA 1LHMA 1GBXA 5DN4A 3IWRA 1B7QA 1JTOL 4I8SA 1QQYA 4LYBA 1B9OA 4WLXA 4Z98A 1DPXA 1LHKA 2D4JA 5IHGA 1GFAA 1B7PA 1YROA 4L41A 133LA 5APDA 3GXKA 5HMJA 1GAZA 3ZVQB 1WQOA 4UWNA 1GB0A 153LA 1NBYC 3TMVA 4C5FA 1IX0A 5B05A 1GDWA 1XGPC 4N1EI 1YKXX 1GBZA 4WM2A 3W3EA 2Z2FA 3M18B 1RJCB 1F0WA 3TMXA 1GBSA 5APFA 2ZNWY 1CJ6A 1B0DA 2BQCA 1OUJA 1DKJA 4ETEA 1IWUA 1LZSA 4XENA 5KKIA 5D5FA 1GF6A 4WO9A 4PJ2C 5D5CA 4YEOA 2EPEA 4NWHA 1HC0A 4NHTA 3IJUA 1IOTA 1EQ5A 4WL6A 4MR1A 4UWVA 4H8ZA 2YBJA 5LVJA 1N4FA 1O23A 3EO5A 3WXUA 2MEEA 1NQIA 5APEA 2CWIA 1IR7A 1OUGA 1LJKA 5K7OA 1NDMC 5KJ9A 2GV0A 1QIOA 1GF9A 2HTXA 1VDPA 1E8LA 1F6RA 1LJGA 4NGKA 1LKRA 1LHIA 3P64A 4YENA 1KIPC 1VEDA 5E9RA 2Q0MX 1GFHA 1J1OY 2LHMA 2YBLA 4Z46A 2YBNA 3CQLA 2ZNXY 2LYOA 1H87A 1IWZA 1DI3A 1HSXA 3G3AB 3TXFA 1LZNA 3WULA 5IDDA 3WPJA 4ET9A 4XJFA 1TEWA 5C6LA 5KXKA 4NEBA 2NWDX 1JITA 3WH1A 1FDLY 6LYZA 1CKGA 5HQ1A 1B5WA 1VDQA 4J1AA 1QUSA 3HBEX 5B07A 4TUNA 1UCOA 1LJEA 5APCA 4WM4A 1IR8A 3EBAB 3WL2A 5KKJA 4OOTA 1IOCA 2DQAA 4ETBA 1JWRA 1GB2A 1LSGA 3B0KA 5B06A 8LYZA 5I54A 3A8ZA 4DD1A 2MEDA 4QY9A 1LZ1A 1DQJC 1HF4A 5KXNA 1LOZA 2A7FA 4ET8A 5LINA 1C45A 1GDXA 3OK0A 4NGZA 1LSBA 1KIQC 5KXXA 2ZILA 1LMCA 2I6ZA 4HV2A 1B7SA 4B4EA 134LA 1UBZA 3AZ7A 4TTDA 1UC0A 5LAGA 4E3UA 4PPOA 4H90A 2HEFA 1CNSA 1UIHA 4OWHA 4J7VA 4NGYA 3WYHA 1LMQA 3WPKA 4LYTA 3TMUA 4TSCA 4TSBA 1V7SA 1CJ7A 2MEAA 1JJ3A 1V7TA 1GB6A 1IY4A 1QSWA 1VAUA 1XSFA 2CDSA 1D6QA 2BQBA 207LA 3B0IA 3QY4A 1GFVA 1LCNA 2BQKA 2BQLA 2DQFC 2ZQ4A 4XN6A 1LJIA 2MEGA 3EMSA 4OWEA 1C43A 1T6VL 4H93A 4WG1A 5HLLA 1GE2A 5F9XA 4Z41A 4AXTA 2YBHA 1C10A 1IVMA 2C8PA 2Z19A 5LAFA 4NG1A 4WLYA 4ZIXA 4HTQA 5KY1A 1XEIA 5FHWA 3W6CA 2FYCA 4NIJA 4DD7A 1GF5A 3A6BY 2HEAA 4G4CA 4U3XB 1F10A 1NF5A 3M3UA 2DQEY 3TXJA 5LYTA 1G7IC 1IIZA 4LT3A 5EBHA 1Z55A 1UUZC 3HFMY 3RW8A 1T3PA 3P65A 1J1XY 4UWUA 5LVHA 1LMPA 1LZAA 3A91A 1JISA 1LSYA 3ZVQA 1NHEA 1B5ZA 3ATOA 3AW7A 4IATA 1YILA 4H9AA 2YDGA 4XJBA 4PGJB 3W6DA 4H9BA 2XTHA 1B7NA 2ZWBA 1B5UA 4NGLA 4BADA 1DI4A 4DD2A 4ETDA 2HUBA 1REXA 1ZV5L 4KL7A 1HELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LA8A 3CSRA 4YXCA 3ULRA 1MELL 1LSNA 249LA 1OWZA 4DQ7A 2W1YA 1YKYX 1L34A 4EKRA 1IC5Y 5I53A 1JQUA 4NSGA 1C65A 2RBNA 3HH3A 5A3ZA 214LA 190LA 1QTCA 4GCCA 2D4KA 1P6YA 219LA 4YF2A 5I5QA 1LSMA 4W59A 4B1AA 253LA 3HTFA 4NGIA 4EKQA 1XGRC 3LHMA 1CKFA 149LA 5C6IA 3CB7A 3PBLA 255LA 3K3TA 1FLUA 4XJIA 4OWCA 7LZMA 2G4NA 1P36A 1QUDA 4LDEA 1D0MA 1L71A 4W55A 4EKSA 2RAZX 1DYGA 4W58A 1JKCA 2D91A 2DQIY 1L93A 5L3IA 1PQDA 3V2YA 1JSEA 4ARMA 140LA 1TLAA 4GCFA 2H9JA 4ARQA 1L44A 4EOFA 1L47A 3ODUA 4NSHA 4RDSA 5LIOA 3BKHA 1C61A 1HEQA 4B0DA 1GFUA 1BGIA 1B5YA 5LXWA 2MECA 4NHSA 1AM7A 3W6AA 1FLQA 1WQNA 5KXRA 1L31A 211LA 2O4WA 1B2KA 2XJWA 1L59A 2Q9DA 1L74A 1CX7A 262LA 1LSDA 1L62A 1JKBA 2G4QA 3P4ZA 4DAJA 4NSIA 4G4HA 2MEFA 3A94A 1EPYA 3RNXA 5LA5A 3HDFA 1L21A 4GRVA 4H9FA 1L98A 1G1WA 2DQDY 3OE0A 1GB5A 1GE3A 1L54A 1LHJA 3EXDA 7LYZA 1G7HC 1HEOA 4NY5A 1OQMA 4LYZA 2D4IA 4BAFA 226LA 2WARA 1UA6Y 3RUNA 3OE9A 1QTKA 1A2YC 3GUMA 2OE4X 4RLMA 1HMLA 5F81A 1KXXA 1L41A 1GF4A 1QUOA 1IP2A 1CU6A 237LA 5KXOA 4EJ4A 180LA 4LDOA 1QDTA 1AT5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A92 A;  1JJ1 A;  4II8 A;  5LA8 A;  1LZG A;  3CSR A;  1EQE A;  1YIK A;  2BLX A;  1RCM A;  4A7D A;  3ULR A;  5LVG A;  1MEL L;  1GF3 A;  1LSN A;  1XGT C;  1YL0 X;  1LHH A;  1C08 C;  3A93 A;  2W1Y A;  1YKY X;  5KXM A;  4NHQ A;  4DDA A;  2EIZ C;  4B49 A;  3WVX A;  1WQQ A;  4QEQ A;  2F4G A;  4N5R A;  4DYG A;  1DZB X;  1IOS A;  4DDC A;  1IC5 Y;  2BQH A;  1H6M A;  5I53 A;  1KXW A;  4NSG A;  1CJ8 A;  4WLD A;  4OWB A;  4GN3 A;  3AGI A;  2MEH A;  4WL7 A;  2YBM A;  5A3Z A;  9LYZ A;  1IP3 A;  5KXW A;  4ANR A;  1SLY A;  1IP1 A;  2EQL A;  5FST A;  3WU8 A;  4GCC A;  2D4K A;  2Z38 A;  4IJ4 A;  2Z37 A;  2HEC A;  1IP7 A;  4TWS A;  4NHP A;  4M4O A;  3A3Q A;  4I0C A;  4YF2 A;  1QUT A;  4HTK A;  5I5Q A;  1LSM A;  4Z3M A;  1RI8 B;  4B1A A;  4WO6 A;  193L A;  2HEB A;  4NGI A;  1IWT A;  1ALC A;  4OWA A;  3RU5 A;  2FBD A;  1LJF A;  4DC4 A;  3RT5 X;  4O34 A;  1XGR C;  1B7L A;  4J1B A;  4OW1 A;  1IWV A;  1LYS A;  2DQG Y;  2DQJ Y;  5KXP A;  1GXX A;  3LHM A;  1CKF A;  3B72 A;  4WM3 A;  3GXR A;  5C6I A;  3FI7 A;  3CB7 A; 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 1LOZ A;  2A7F A;  4ET8 A;  5LIN A;  1C45 A;  1GDX A;  3OK0 A;  4NGZ A;  1LSB A;  1KIQ C;  5KXX A;  2ZIL A;  1LMC A;  2I6Z A;  4HV2 A;  1B7S A;  4B4E A;  134L A;  1UBZ A;  3AZ7 A;  4TTD A;  1UC0 A;  5LAG A;  4E3U A;  4PPO A;  4H90 A;  2HEF A;  1CNS A;  1UIH A;  4OWH A;  4J7V A;  4NGY A;  3WYH A;  1LMQ A;  3WPK A;  4LYT A;  3TMU A;  4TSC A;  4TSB A;  1V7S A;  1CJ7 A;  2MEA A;  1JJ3 A;  1V7T A;  1GB6 A;  1IY4 A;  1QSW A;  1VAU A;  1XSF A;  2CDS A;  1D6Q A;  2BQB A;  207L A;  3B0I A;  3QY4 A;  1GFV A;  1LCN A;  2BQK A;  2BQL A;  2DQF C;  2ZQ4 A;  4XN6 A;  1LJI A;  2MEG A;  3EMS A;  4OWE A;  1C43 A;  1T6V L;  4H93 A;  4WG1 A;  5HLL A;  1GE2 A;  5F9X A;  4Z41 A;  4AXT A;  2YBH A;  1C10 A;  1IVM A;  2C8P A;  2Z19 A;  5LAF A;  4NG1 A;  4WLY A;  4ZIX A;  4HTQ A;  5KY1 A;  1XEI A;  5FHW A;  3W6C A;  2FYC A;  4NIJ A;  4DD7 A;  1GF5 A;  3A6B Y;  2HEA A;  4G4C A;  4U3X B;  1F10 A;  1NF5 A;  3M3U A;  2DQE Y;  3TXJ A;  5LYT A;  1G7I C;  1IIZ A;  4LT3 A;  5EBH A;  1Z55 A;  1UUZ C;  3HFM Y;  3RW8 A;  1T3P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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