5I14A

Truncated and mutated t4 lysozyme
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGGGSGGDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTHSLHALQHKHWDHAAVHLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Metal ions-binding T4 lysozyme as an intramolecular protein purification tag compatible with X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords mutated and truncated T4 lysozyme
total genus 44
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5i14A00
181LA 3L2XA 4I7KA 4I7JA 1DYDA 3HT8A 1CX6A 1C6EA 1T8GA 3GUOA 1C6JA 235LA 1QTCA 253LA 1L70A 244LA 147LA 1L23A 184LA 4ARQA 1L24A 2B6YA 1XEPA 1L88A 2B6WA 1LGWA 151LA 1DYFA 2RH1A 3DN6A 2RBSA 4I7PA 2RBQA 2LZMA 178LA 1T8AA 1JTNA 4E97A 1SX7A 172LA 3CDQA 258LA 3ODUA 1CV3A 182LA 3EMLA 4EKRA 1L39A 1L30A 1G0PA 1L99A 142LA 2A4TA 3DN0A 3FA0A 1L46A 219LA 4PJZA 3SB5A 205LA 1OVHA 4W59A 3NY9A 2RBNA 227LA 1L60A 3F8VA 1CU6A 242LA 2Q9DA 3SBBC 1QS9A 2B74A 3HH3A 1C6AA 1OWYA 3HDEA 5LZMA 4W52A 221LA 1C6PA 7LZMA 190LA 195LA 1L36A 123LA 1T8FA 3C83A 3OE0A 189LA 1QSQA 4EPFA 1KW7A 1QTDA 3CDOA 239LA 3NYAA 1PQDA 247LA 3C82A 1LGUA 4LDEA 246LA 1LW9A 1D3MA 1I6SA 3C81A 3SB6A 1L04A 1QTVA 2OE9X 1L50A 4I7TA 1P7SA 1LPYA 1LYIA 224LA 175LA 254LA 249LA 1QTHA 1P3NA 1L54A 1OWZA 1C6CA 1L98A 1ZWNA 1G07A 1C6HA 141LA 1D3FA 197LA 225LA 3VW7A 1CV4A 2RBOA 4W55A 1PQIA 3JR6A 1C6KA 1SSYA 3HUKA 1C69A 1C60A 1L82A 1B6IA 1DYCA 3HDFA 1L21A 1LLHA 4W56A 3SBAA 4PK0A 2QB0B 1EPYA 3G3WA 2B6ZA 166LA 2NTHA 1PQMA 238LA 1C66A 1L38A 3UONA 1D9WA 1L28A 1KY0A 212LA 3C7ZA 168LA 2F47A 2ANXA 216LA 3HTDA 3LZMA 241LA 2B6TA 1C62A 107LA 1L20A 2ANVA 1CU3A 1QUGA 4I7OA 1DYGA 4EJ4A 1L01A 3C80A 1XJUA 1LI3A 230LA 1CU5A 3FI5A 210LA 4YXCA 1L91A 1LYJA 1L06A 1C6MA 233LA 2QARC 1P64A 2NTGA 4EKSA 222LA 3HTFA 1L29A 3DN8A 1D2YA 1L94A 1L75A 1L37A 3OE6A 1CUQA 5I14A 209LA 1KS3A 1CV5A 2OE4X 1C64A 1C6TA 1L83A 6LZMA 120LA 1TLAA 1OVKA 2OU0X 1L22A 1L40A 138LA 3SN6R 4AQNA 3PDSA 2OTZX 198LA 213LA 2L78A 1QT8A 3D4SA 3GUMA 3HUQA 1L90A 3SB7A 1L41A 1QT5A 3F9LA 1ZURA 1LGXA 131LA 1G0QA 4W51A 1C6DA 223LA 2F32A 2RBRA 1L67A 1OV5A 1L74A 127LA 1CVKA 137LA 236LA 4W57A 3DN2A 243LA 1L73A 1C6FA 1L45A 1L84A 1LYFA 3HU8A 1JQUA 4LZMA 4DAJA 115LA 1C63A 1CU2A 4DJHA 1C6GA 109LA 4EKPA 1L95A 122LA 1L32A 2RAZX 2LCBA 2HULA 162LA 173LA 3HH5A 3HTBA 1SWYA 2OTYX 4ARPA 159LA 3GUJA 245LA 1QUDA 2HUKA 196LA 229LA 148LE 1DYEA 1P56A 1QUOA 3HTGA 4EXMA 113LA 3G3XA 2O79A 217LA 252LA 1L62A 2LC9A 3QAKA 192LA 1L71A 1OV7A 1L93A 1OVJA 2OEAX 1OYUA 1C6IA 1L86A 4W54A 150LA 1QTBA 4I7MA 3SB9A 2Q9EA 114LA 2RB0X 4ARLA 1L69A 4GBRB 1LYDA 167LA 4EPIA 176LA 1QT6A 3DMVA 155LA 3HT7A 174LA 1CV6A 1D3JA 2B75A 3FADA 156LA 187LA 4LDOA 3DKEX 1L92A 240LA 3HH6A 259LA 1L65A 1L12A 3DN4A 1L17A 1KNIA 1L47A 1JTMA 4YX7C 1G0KA 1P37A 125LA 2B72A 1L42A 118LA 4I7QA 1CV1A 1QTZA 1KY1A 1CUPA 1XJTA 4EKQA 3GUIA 1D2WA 2Z6BA 1L15A 3C8QA 4ARMB 2RAYX 1LYHA 4K5YA 111LA 2IGCA 1L44A 129LA 1C6NA 1D3NA 1T97A 2RB1X 3GUKA 2B6XA 144LA 261LA 164LA 1PQOA 1C65A 1L02A 1SWZA 1P36A 2B73A 218LA 104LA 1L80A 170LA 1L61A 1L00A 1L07A 1T6HA 1L64A 1L49A 1L03A 1LI2A 260LA 3C7YA 232LA 1PQJA 191LA 1L10A 1CU0A 1L09A 2RBPA 1L0JA 1LYEA 186LA 1LWGA 1L51A 3CDTA 1L58A 126LA 143LA 1L27A 1L81A 1LYGA 1PQKA 1LWKA 228LA 3OE8A 1L59A 231LA 3PBLA 140LA 1G0MA 1L35A 3HT9A 4S0WA 1L66A 234LA 2OU8A 250LA 112LA 1P6YA 1CV0A 2O7AA 2F2QA 220LA 1DYAA 1L25A 1QS5A 161LA 1LI6A 226LA 1SX2A 251LA 201LA 3DNAA 1L87A 3C7WA 1P2LA 4W53A 1G0LA 4I7SA 1L52A 1L33A 255LA 3DMZA 1L72A 3HH4A 110LA 130LA 1C68A 2B7XA 4ARMA 1CTWA 4OO9A 237LA 1P46A 1QT3A 257LA 103LA 158LA 1L26A 262LA 1K28A 199LA 1C6LA 185LA 3C8SA 3GUNA 1QT7A 160LA 1L68A 200LA 169LA 183LA 4I7LA 1L63A 1L96A 1L43A 171LA 139LA 1G1VA 3HWLA 145LA 1L57A 1WTHA 3CDVA 4DKLA 157LA 3K2RA 1L56A 4IAPA 4ZPUA 1L85A 1L77A 3GULA 4GRVA 1L16A 256LA 4I7NA 3L64A 2OU9A 1P5CA 2CUUA 4ARQB 3CDRA 4ARJA 1CX7A 180LA 3V2YA 1G1WA 3G3VA 1L0KA 128LA 2HUMA 1QSBA 211LA 1NHBA 1L11A 215LA 1L18A 165LA 3C8RA 1L05A 1L89A 2RB2X 1L53A 2B70A 3GUPA 1P2RA 1L08A 2OE7X 1G06A 3DN1A 188LA 163LA 1QUHA 3SB8A 1L31A 1C61A 177LA 3RZEA 3HT6A 1L97A 4W58A 1G0GA 1L76A 3RUNA 4I7RA 149LA 3HU9A 1KW5A 3OE9A 1L79A 1G0JA 102LA 3V2WA 4LDLA 1C6QA 1C67A 1L14A 1L19A 152LA 3DMXA 1L48A 214LA 2O4WA 206LA 146LA 1DYBA 1ZYTA 4YXAC 248LA 1L34A 1C6BA 1SSWA 1QT4A 1L13A 3HUAA 119LA 1L55A 108LA 3NY8A 3DN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JISA 1DYDA 4ET9A 1TCYA 3TXHA 4QY9A 1QSAA 235LA 1QTCA 253LA 5EBHA 4LYCA 2BQHA 147LA 184LA 1L24A 2B6YA 3AJNA 2WARA 151LA 3AW6A 1DYFA 1JUGA 4I7PA 1B7LA 1HMLA 1KIPC 1HENA 258LA 1JTPL 3ODUA 1BB7A 2YBJA 3G3BB 1LTMA 3W6BA 3CT0A 4IASA 142LA 2A4TA 4QEQA 205LA 4W59A 2LYZA 1HNLA 4LZTA 4TUNA 1LYSA 3HDEA 1LZ9A 4W52A 195LA 2DQCY 4XJHA 2XQOA 4H91A 1EQ5A 1KW7A 2DQHY 4ANRA 1GFAA 1NQIA 239LA 3IWRA 2I25L 3NYAA 1OQMA 1HEOA 247LA 3C82A 1LGUA 4DWXA 1A2YC 4WLYA 1CJ8A 1CKDA 2BLXA 1HERA 1GBWA 1NMMA 1L04A 1QTVA 3MGWA 4H9FA 1L50A 4J1AA 1B7RA 1B5YA 1LYIA 1ZMYL 4LT0A 175LA 4J7VA 1QTHA 1L54A 1B5UA 1IOQA 1L98A 1G07A 1D3FA 1DXJA 197LA 3WW5A 4W55A 4HJVA 3J4GA 1C60A 1L82A 1DYCA 3RT5X 2BQMA 3P64A 4KXIA 1REYA 3EXDA 4NHQA 1PQMA 4RW2A 238LA 3UONA 3BKHA 1KY0A 1CKFA 3C7ZA 2B5ZA 3LZMA 1C62A 107LA 1GE2A 1YROA 1QUGA 1DYGA 4XN6A 1LMNA 1XJUA 1CU5A 1L06A 2Z18A 4CFPA 1GEVA 1IP5A 3LN2A 1L37A 2DQDY 5I14A 209LA 2BAAA 2ZYPA 1GFGA 1LZ4A 2EKSC 120LA 5LVIA 2LYOA 2OU0X 5KXRA 198LA 3PDSA 2HU3A 4PRUA 3HUQA 3SB7A 1G7IC 1DKKA 1QT5A 2H5ZA 1JIYA 2BQDA 2FBBA 1LGXA 3M3UA 3TXJA 2DQIY 2F32A 2RBRA 1L67A 1OV5A 1L74A 1CVKA 4E3UA 4W57A 4WO9A 1IWXA 1OP9B 4G49A 1B7NA 1L84A 3HU8A 115LA 1EQEA 2BQIA 109LA 2W1YA 1G7JC 162LA 2BQKA 1B5ZA 1SWYA 4ARPA 5KY1A 1JKDA 1GAZA 3HFMY 1LZSA 3HTGA 4MR1A 4EXMA 4A7DA 3CQLA 217LA 2YBMA 5HMJA 3B72A 1DQJC 2VB1A 207LA 5A3ZA 3AZ7A 2HEEA 1OV7A 4C3WA 4II8A 1C6IA 4XADA 1B2KA 150LA 1YAOA 7LYZA 4I7MA 3SB9A 4ARLA 114LA 1WQRA 4KT3A 4GBRB 4EPIA 1BQLY 3WH1A 1D6QA 155LA 1D3JA 156LA 4WG7A 1GBOA 3A34A 4LDOA 4HJZA 240LA 3HH6A 259LA 1EL1A 3J6KA 4NGLA 1FBIX 118LA 1QTZA 4NHSA 3GUIA 1LSFA 1TAYA 2RAYX 1QQYA 111LA 2IGCA 1J1OY 3EMSA 1IWYA 1V7TA 1JHLA 3AB6A 4NG8A 4WLTA 1PQOA 1C65A 4GN4A 4WLXA 104LA 1L00A 1GB8A 1L07A 1F6SA 5C6IA 3TMXA 4CFOA 1L64A 1L49A 1L03A 1LI2A 5B1GA 260LA 3C7YA 1CU0A 1HMKA 5APEA 3WULA 186LA 3CDTA 3QE8A 1L58A 1LZNA 126LA 1L81A 4H94A 5AMYA 5LYTA 1L66A 1UICA 2OU8A 112LA 3A3QA 5T3FA 2F2QA 220LA 2YBIA 3DNAA 226LA 1SX2A 1J1PY 5B1FA 1G0LA 4XJIA 2IHLA 3EBAB 4HSFA 1IWUA 1JKBA 5APCA 255LA 3DMZA 1IP2A 1LHJA 1FDLY 1I1ZA 1V7SA 3M18B 4OO9A 1LHMA 1BWJA 257LA 103LA 158LA 1K28A 1FLQA 1C6LA 4LT2A 160LA 1A4VA 183LA 3WVXA 4H92A 2BQOA 4UWNA 1OUFA 1GFTA 2F4AA 1L57A 4DKLA 4IAPA 1YAPA 3IJUA 1VAUA 4ZPUA 1GAYA 1L85A 1L77A 3GULA 1L16A 256LA 3WUMA 4NEBA 4ARJA 3V2YA 5LVKA 4G4CA 128LA 2Y8PA 1QSBA 211LA 1HELA 4YEMA 1BB3A 1L11A 3B0IA 1FKQA 1BGIA 188LA 4AXTA 1L31A 1LZCA 3RZEA 4BAFA 1L97A 2ZYCA 1G0GA 1B5VA 4GLVA 1OUEA 2HEBA 3RUNA 4NSJA 1B7PA 149LA 134LA 1L79A 5B07A 5APFA 3V2WA 1JITA 3LZ2A 1L14A 152LA 3DMXA 1GDXA 1LYOA 206LA 3LYZA 1LZRA 1UIDA 4YXAC 4HTNA 3P65A 1C6BA 1SSWA 1BB4A 4LYMA 3AYQA 2Z39A 194LA 108LA 3DN3A 4IJ4A 181LA 135LA 1LSNA 3L2XA 3LZTA 4B4IA 5L9JA 2F4GA 1EQ4A 4OW1A 1OUGA 1GF5A 4TSBA 4ARQA 3TMWA 1XEPA 4H1PA 1JKAA 2RBQA 2LZMA 178LA 1JTNA 5LA5A 4DQ5A 4DQJA 5IDDA 3WPJA 4EKRA 4G4HA 5KXOA 4YM8A 4DYGA 1G0PA 1BWHA 1C08C 3AGIA 133LA 1HC0A 1L46A 1BB5A 3SB5A 5B06A 4H8ZA 4Z3MA 2X0AA 3TXBA 3SBBC 1C46A 1OWYA 1BHZA 2ZIKA 4G4BA 2BLYA 1C6PA 4NGJA 190LA 1L36A 5LAFA 123LA 1T8FA 5KXTA 4OWEA 1GB5A 1QSQA 4EPFA 3WU7A 2ZWBA 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4BAPA 174LA 4DD0A 4CJ2A 2B75A 3FADA 1GF9A 1GD6A 2MEDA 1CNSA 187LA 4HPEA 3A3RX 1REZA 2I6ZA 1QTKA 3BKVA 4TSCA 1L42A 3LYMA 1VEDA 3AGHA 1CUPA 4I8SA 1G7MC 1P2CC 3ATNA 3C8QA 4ARMB 1FLYA 1LYHA 4XJDA 4K5YA 1YQVY 2MEHA 4X3BA 4FDYA 4NGYA 3WUAA 4ZFPA 1D3NA 1T97A 1CJ9A 1ZV5L 4KPMA 1WVUA 1JWRA 1JKCA 2CDSA 1L80A 2Q0MX 2XJWA 4QGZA 1LSMA 1IP3A 1LZ5A 5ILCA 3AW7A 1L10A 1LHKA 1GF6A 4B49A 4CHXA 1W08A 3N9AA 143LA 1L27A 228LA 1B7OA 4WM1A 3PBLA 5LVGA 3A8ZA 250LA 1CV0A 2EQLA 1L25A 1QS5A 1GF4A 201LA 4GCFA 4RDSA 5I4WA 3WU8A 1L87A 1GE0A 1C45A 1OUIA 3WW6A 4HV2A 1L52A 5ILFA 1LZGA 1L72A 3HH4A 4HTQA 130LA 1LSAA 1GB3A 2B7XA 2MEAA 2D6BA 1P46A 262LA 2BQLA 199LA 185LA 3ZVQA 2C8PA 4LT3A 4DDBA 3WYHA 1QT7A 4LYTA 1GHLA 1YANA 1G7LC 4I7LA 1L63A 2BPUA 1LJEA 1I20A 4O34A 3HWLA 1HEQA 1WTHA 3K2RA 4NY5A 1YAQA 2I26L 1L56A 5KXXA 5APDA 4GRVA 4I7NA 5I54A 4B0DA 3L64A 2OU9A 1P5CA 2CUUA 1N4FA 2ZQ4A 3TXIA 3T36A 1CX7A 4NSHA 2DBTA 1QIOA 1KXWA 1NHBA 2C8OA 2RB2X 3GUPA 2BQGA 1L08A 4P2EA 5HQ1A 1IC7Y 1C61A 177LA 3CT5A 1ALCA 4GLAA 3P4ZA 1AT5A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JIS A;  1DYD A;  4ET9 A;  1TCY A;  3TXH A;  4QY9 A;  1QSA A;  235L A;  1QTC A;  253L A;  5EBH A;  4LYC A;  2BQH A;  147L A;  184L A;  1L24 A;  2B6Y A;  3AJN A;  2WAR A;  151L A;  3AW6 A;  1DYF A;  1JUG A;  4I7P A;  1B7L A;  1HML A;  1KIP C;  1HEN A;  258L A;  1JTP L;  3ODU A;  1BB7 A;  2YBJ A;  3G3B B;  1LTM A;  3W6B A;  3CT0 A;  4IAS A;  142L A;  2A4T A;  4QEQ A;  205L A;  4W59 A;  2LYZ A;  1HNL A;  4LZT A;  4TUN A;  1LYS A;  3HDE A;  1LZ9 A;  4W52 A;  195L A;  2DQC Y;  4XJH A;  2XQO A;  4H91 A;  1EQ5 A;  1KW7 A;  2DQH Y;  4ANR A;  1GFA A;  1NQI A;  239L A;  3IWR A;  2I25 L;  3NYA A;  1OQM A;  1HEO A;  247L A;  3C82 A;  1LGU A;  4DWX A;  1A2Y C;  4WLY A;  1CJ8 A;  1CKD A;  2BLX A;  1HER A;  1GBW A;  1NMM A;  1L04 A;  1QTV A;  3MGW A;  4H9F A;  1L50 A;  4J1A A;  1B7R A;  1B5Y A;  1LYI A;  1ZMY L;  4LT0 A;  175L A;  4J7V A;  1QTH A;  1L54 A;  1B5U A;  1IOQ A;  1L98 A;  1G07 A;  1D3F A;  1DXJ A;  197L A;  3WW5 A;  4W55 A;  4HJV A;  3J4G A;  1C60 A;  1L82 A;  1DYC A;  3RT5 X;  2BQM A;  3P64 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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