5IHGA

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme a compound i, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ihgA00
1CJ9A 1BQLY 1LYYA 1LSDA 1UC0A 3CSZA 1D0LA 1IR8A 2BQAA 2LYZA 3AJNA 1WVUA 1I20A 4J0LA 3WYHA 1KXWA 3BKVA 1LMAA 2C8OA 2Q0MX 1IP6A 3ATOA 3WMKA 1JKBA 4ETCA 1LZCA 2MEBA 4B4IA 4TTDA 4Z98A 5B06A 1JKAA 4NHTA 5APCA 3G3BB 3LYZA 4H9AA 1LSMA 1JUGA 4B1AA 1NDGC 1UACY 4LT3A 4ETBA 1LZ5A 1W08A 4W96A 1FLWA 3CQLA 3HBEX 4NGIA 1I1ZA 2Z19A 1LPIA 1B5ZA 133LA 1VDQA 1GB9A 1ZV5L 4GLAA 2BQCA 3WULA 4ZIXA 1B5UA 3WL2A 2DQGY 4NGYA 4G4BA 4B0DA 2XBSA 1B7RA 1LSBA 2G4QA 3WU9A 4OWEA 5APEA 4L41A 1WQMA 1UIAA 1IP1A 5K7OA 1GE4A 3CT0A 3TXJA 4RW1A 4KPMA 4TX7A 1GFVA 2VB1A 2DQFC 2DQIY 4AXTA 1IX0A 4N5RA 2MEGA 1LZNA 2DQEY 4LFXA 5E4PA 5ILCA 1GFRA 2ZWBA 1BB7A 2D91A 1SQ2L 1MLCE 4C5FA 2FYDA 1WQRA 1DQJC 4MSTA 3J6KA 5A3EA 1GXXA 2HUBA 4NGJA 2LYMA 4DT3A 4TSCA 2BQIA 4KT3A 1RJCB 1IOQA 4UWVA 2H9JA 1GE0A 4OOOA 4DDAA 1RFPA 2BQFA 2CDSA 2GV0A 1GB8A 1C46A 1CJ8A 3CSQA 1WQOA 1ZVHL 4HJYA 5LVGA 3B72A 1LSCA 3WXTA 2HEBA 3A3RX 1RI8B 2PC2A 1LMCA 4J7VA 4WO6A 3WPJA 5E9RA 1YANA 1J1XY 1IP4A 3IJVA 1GB0A 4ETEA 2DBTA 3A90A 4H9FA 4DWXA 3BKHA 4H9EA 1E8LA 1XGUC 1N4FA 1GE2A 1XEIA 5IHGA 4WL6A 1NBZC 5KXSA 4NSHA 5DM9A 1D9UA 4YEMA 5LVKA 1JSEA 1XFPL 1JTPL 1OQMA 3VWOA 1B7PA 1LZDA 1GEVA 4O34A 1NMMA 3OJPA 3WUAA 1EQEA 3WUMA 4H8XA 3AZ7A 2D4KA 1GD6A 3CT5A 3AZ4A 1XGQC 4KL7A 4A7DA 4C3WA 1VATA 2A7DA 4WLDA 2HEEA 1GHLA 1W6ZA 1LZRA 1LJFA 2A7FA 1CKFA 4II8A 2F30A 2BQDA 1UIEA 2DQDY 4GCFA 1IR7A 1LJHA 3RT5X 3MGWA 1IWXA 3B0KA 4NSJA 1GE3A 1IOSA 1GF3A 1HSXA 3WW5A 4DC4A 5KXXA 5F81A 4GN4A 1BB6A 2HEFA 4B4EA 5B59A 4H93A 4NGWA 2ZQ3A 1HMLA 1JIYA 1IC4Y 3LZTA 3RNXA 4ML7A 4XJDA 4WL7A 4H9CA 4ETAA 1OUAA 3FE0A 4WO9A 1GXV2 5APDA 1T6VL 2F4AA 3A67Y 1LMNA 1GDXA 4RW2A 1YL0X 2HTXA 1HFYA 2CWIA 4UWUA 1LHLA 3TMXA 1OUDA 4GCCA 5KY1A 1IVMA 4D9ZA 1GFUA 2D4JA 2NWDX 1REMA 4FJRA 1LJ4A 1G7LC 5HNCA 1XGRC 1RCMA 1IO5A 4LZTA 1REXA 2Z2EA 4P2EA 4FDYA 5FSTA 4PJ2C 3ZVQA 3EBAB 1G7IC 1LOZA 1FKQA 1LYSA 3P4ZA 4WMGA 1OP9B 4WM6A 1OUFA 4XJHA 5C6LA 1IEEA 1F6SA 4NWHA 5EBHA 4CHXA 1IP3A 1QSWA 3HBDA 5F9XA 3M18B 1LSPA 4H8YA 3ZVQB 2DKVA 3E3DA 5I54A 2I6ZA 5AMYA 4PGJB 2ZQ4A 1QTKA 4WM4A 4WM1A 1IY3A 1CKDA 1LMOA 1OUCA 1HEMA 3GXRA 4G4HA 4QDNA 1GFGA 2Z2FA 2G4NA 3TXKA 3A34A 1B5WA 135LA 3RW8A 1GFTA 1FLQA 4YOPA 4HTQA 3P64A 1YAQA 5KJ9A 1JJ1A 1LCNA 1SLYA 5DL9A 3T36A 5DLAA 4NG1A 3A92A 1WTMA 3A91A 1DZBX 1IY4A 1GB5A 1LZAA 4J1AA 4DD9A 2XBRA 1JJ0A 4NIJA 3W3EA 4HTNA 3LYOA 2F4GA 1GF6A 4ET8A 1GWDA 3B6LA 1B7NA 4GN3A 4WLTA 1OUBA 1FLUA 3EMSA 3WPKA 5KXKA 4PRQA 4LYCA 4HTKA 1QSAA 1H6MA 3A3QA 1FKVA 4U3XB 1HF4A 1LMPA 3A6CY 4WG7A 5LINA 1JEFA 1UIBA 1TDYA 1C10A 1BHZA 4WM2A 3ULRA 1GEZA 1D0KA 1LJGA 1LZEA 1IWTA 1TEWA 2D4IA 3GXKA 4HPIA 4LYOA 4NHIA 4YEOA 1LJEA 3CT1A 4I0CA 4H9HA 4HV2A 4H9BA 4LYMA 1HC0A 5B1GA 1TCYA 1LZ6A 4WLYA 4DYGA 2BQBA 4UWNA 3LZ2A 4RLNA 4NHQA 2BLYA 4OW1A 4IJ4A 1EQ4A 4ZFPA 5L3IA 1LZ1A 134LA 1YAOA 4G49A 2Z39A 4GN5C 4YF2A 1LJKA 3AW6A 1UUZC 1NQIA 3EO5A 1JWRA 4H94A 4HJVA 5B05A 4H90A 1LZYA 3A6BY 1VDSA 1WQQA 4LGKA 4XN6A 1HHLA 1LMTA 5D5FA 4NHSA 5HLLA 1YAPA 5KXMA 2BQNA 1RE2A 2HU1A 8LYZA 1AM7A 4DD1A 1JHLA 1LAAA 3B0OA 1BB3A 5T3FA 5KKJA 2HEDA 4G9SA 1HENA 2BQMA 2FBBA 4J1BA 3FI7A 1MELL 1EL1A 1IOCA 4H1PA 1T3PA 5FDJA 5KXNA 1LSYA 1XGTC 4XADA 1GBXA 2MEAA 4N0JA 1CKGA 5JENB 1KIPC 3WUNA 1XEKA 1LMQA 1LSAA 3TMUA 6LYZA 1OUJA 3EXDA 5KXTA 5KXOA 1GFKA 3G3AB 4WM3A 1GB6A 4LYZA 4AGAA 3N9CA 1D6PA 3CB7A 3P65A 3OK0A 1I56A 4LT1A 3M3UA 1LJJA 1JTOL 2YBHA 4Z41A 4CJ2A 2ZYPA 4LT0A 2N5ZA 4XENA 2YBMA 1GDWA 1JITA 2YBLA 5LAGA 5LIOA 7LYZA 1IP2A 1JTTL 2I26L 2YDGA 2IFFY 1QTEA 1JKCA 1GF0A 1B2KA 2DQAA 2BQOA 4R6CA 4N8ZA 1DI3A 1OUHA 3P68A 1DXJA 1QQYA 4PPOA 1GBSA 1ZVYB 2F2NA 2ZNWY 1QDRA 3J4GA 1HELA 1CJ7A 1LHJA 2C8PA 3QY4A 3TXIA 4BAFA 4H8ZA 5F14A 4H9IA 5I4YA 5LAFA 5LYZA 4DDBA 1DPXA 2MEEA 1C7PA 1F6RA 1GB3A 1GF9A 2MECA 3D9AC 3TXFA 1UIFA 1HEQA 1NF5A 3TMVA 1LZ8A 5ILFA 4PHIA 2H9KA 1IOTA 5LYTA 1LKRA 1UA6Y 1B7LA 2XJWA 4NSIA 1IC7Y 5C6JA 1LHIA 4OWAA 3A8ZA 5I5QA 3WH1A 1YILA 1C45A 1B5VA 2W1YA 4Z46A 1B5YA 3A93A 208LA 4RDSA 3W6BA 1DI5A 2BQLA 2D6BA 5I4WA 4GLVA 1QIOA 2EPEA 1KXYA 2HECA 1IWVA 1WVVA 1VDPA 4LYBA 1J1OY 5J7CA 1YL1X 1GFAA 2BQJA 1GPQC 5HMJA 2MEIA 3AW7A 1LTMA 3A94A 3TXDA 1GB2A 4XJGA 194LA 5APFA 4HP0A 4ZEEA 1GFJA 4HJZA 4LT2A 4TSBA 1GFEA 1KIRC 1VAUA 5L3HA 1HFZA 2CGIA 1DPWA 2MEDA 2WARA 2Y8PA 1XEJA 4N1EI 1O23A 3LYMA 1C08C 1UICA 5D5CA 1XGPC 1YKXX 3QNGA 5KXZA 3N9AA 4CFOA 1XSFA 154LA 1PS5A 4NWEA 1GF5A 3WU7A 1HFXA 4HV1A 1UIGA 1IWUA 2ZNXY 1HEPA 1GF7A 1QUSA 1BGIA 2YBJA 1HERA 4XYYA 1REZA 1B7MA 4M6DA 1JSFA 1REYA 4HPEA 1GFHA 5I4XA 5LYMA 1UIHA 1NHEA 2MEHA 5II3A 4BAPA 1ZMYL 5IELA 1H87A 1WTNA 1F0WA 1IWZA 4E3UA 153LA 4XJFA 1IP5A 3LN2A 3D3DA 1LJIA 1DI4A 1LZBA 2CJLA 1P2CC 1G7HC 2Z38A 3WVYA 4NGZA 1LHMA 1IR9A 1IP7A 2W1XA 2YBIA 1GBZA 3RU5A 4DD0A 6LYTA 3WU8A 4OOTA 3AGHA 5M1YA 2ZIKA 4XJBA 2Z12A 3WXUA 4EMNA 1BVXA 2X0AA 1GAYA 2LHMA 1YKZX 2LZTA 4GCBA 9LYZA 5L9JA 193LA 2EQLA 1ALCA 1YIKA 3CSRA 5HMVA 1IWYA 3LHMA 1IORA 5DN4A 3W6AA 4G4CA 1AZFA 1LZSA 1QUTA 1LSEA 1V7SA 4WLXA 3F6ZA 2DQHY 1BWHA 1FBIX 3TXEA 2BQHA 1G7MC 3TMWA 5F16A 4ETDA 1D0MA 4DDCA 5FCPA 5KXWA 4X3BA 4RLMA 2ZYCA 1B7SA 1FN5A 3IWRA 5FEKA 1VFBC 2EIZC 4WOAA 1IIZA 4WM5A 4CFPA 4QEQA 1YQVY 5IDDA 2FBDA 2IHLA 4B49A 4BS7A 3AB6A 1UIDA 1FDLY 1AT6A 1HNLA 1NBYC 2YBNA 3ATNA 1GE1A 3HBHA 5DN5A 5HNLA 3T6UA 1LSNA 1LJNA 1LZTA 2DQCY 4QY9A 4NG8A 4HSFA 3KAMA 4TUNA 3AZ5A 1WQPA 5KXLA 2G4PA 4QGZA 5B07A 1G7JC 2B5ZA 2FYCA 5KXYA 4NGOA 3W6DA 3A95A 4EOFA 2BLXA 1LHKA 3LYTA 2W1LA 1NKHA 3W6FA 1CNSA 1HEOA 1HSWA 2EKSC 3WVXA 4R0FA 1F10A 4N1CC 5LVHA 5LA5A 1C43A 2MEFA 4OWCA 1GB7A 2BPUA 3HFMY 1LYOA 1OUGA 2AUBA 5KKIA 1BB4A 1BWJA 1HMKA 2HEAA 2XTHA 1JISA 3ZEKA 1OUIA 2H5ZA 1CJ6A 4NGLA 1IWWA 5LVJA 3P66A 4M4OA 5KXRA 2DQJY 2W1MA 1UCOA 1LSZA 4ANRA 2ZIJA 1JKDA 1B9OA 1NWGA 4B4JA 1A2YC 1HEWA 3W6EA 3IJUA 3WW6A 132LA 1LJ3A 1WQNA 4IASA 4DD3A 2LZ2A 1VDTA 5FELA 1B5XA 1GBOA 4MCKA 4NHPA 3TXHA 2LYOA 3WPLA 4ET9A 1Z55A 3AYQA 1YKYX 3N9EA 5A3ZA 5LXWA 2Z18A 1CKHA 1D6QA 4N9RA 4NGKA 1LYZA 4IATA 4CGEA 1TBYA 2Z37A 4H91A 5LA8A 1YROA 4OWBA 4XJIA 2BAAA 5FHWA 4BADA 4NY5A 5KXPA 1LHHA 1VEDA 1INUA 1CKCA 1DKKA 2HU3A 2BQEA 1GBYA 4I8SA 1GAZA 1LSFA 3AGIA 3QE8A 1KIQC 4H92A 4PRUA 3W6CA 1KXXA 5I53A 4NEBA 1QDTA 4LFPA 207LA 4TWSA 5C6IA 1EQ5A 3TXBA 5LVIA 3TXGA 2YVBA 3A96A 2I25L 4DD2A 4GCDA 3RZ4A 1YAMA 4YENA 4OWHA 1TAYA 1GF8A 3K3TA 1PZYA 3B0IA 1LZ9A 1JJ3A 1GF4A 1LZGA 1LSGA 2BQKA 5B1FA 1NDMC 1B7OA 4Z3MA 5HQ1A 1AKIA 4NSGA 1LKSA 1V7TA 2ZILA 3AGGG 2YSSC 4GCEA 4NFVA 1GBWA 2BQGA 4W94A 4YM8A 4DD7A 1BVKC 1LZ4A 4LYTA 4WG1A 1J1PY 2RSCA 4MR1A 5F9UA 4NGVA 1IC5Y 4KXIA 3AZ6A 1DKJA 1BWIA 3SP3A 1FLYA 1AT5A 1UBZA 1BB5A 1A4VA 1B7QA 1JPOA 1OUEA 1B0DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQ5A 1L43A 1KXWA 3BKVA 1IP6A 3HUKA 1JKBA 1LGUA 1TLAA 2MEBA 4TTDA 1G1WA 1JKAA 3G3BB 3LYZA 1JUGA 1NDGC 3HTFA 4ETBA 1LZ5A 1FLWA 3CQLA 3WULA 1VDQA 1L66A 4G4BA 4B0DA 1LSBA 5APEA 1IP1A 120LA 1L72A 3TXJA 152LA 4TX7A 1GFVA 3GUOA 107LA 155LA 2ZWBA 3HH3A 2FYDA 4MSTA 1DQJC 3J6KA 1QTZA 1L28A 4KT3A 1IOQA 4UWVA 4OOOA 1L46A 1RFPA 2BQFA 1GB8A 1C46A 3CSQA 3B72A 3WXTA 2HEBA 119LA 1RI8B 5E9RA 1J1XY 1C6BA 3IJVA 3A90A 1L26A 4YX7C 5KXSA 1L20A 5DM9A 4YEMA 219LA 1C6QA 1I6SA 3F8VA 1OQMA 3VWOA 2RBRA 2XQOA 3CDRA 3HUAA 3WUAA 1EQEA 3WUMA 147LA 3AZ7A 4ARMA 1OYUA 3AZ4A 4C3WA 1L02A 1P5CA 1C62A 4AQNA 1L00A 3DN6A 1QS5A 1GF3A 171LA 1L09A 1IC4Y 4ML7A 4H9CA 1L10A 5APDA 1T6VL 4RW2A 2CWIA 2OE9X 1LHLA 251LA 1GFUA 2NWDX 1REMA 1RCMA 2B70A 1L91A 1OVJA 4FDYA 4PJ2C 3ZVQA 2A4TA 2IGCA 1G7IC 1FKQA 1LYSA 3P4ZA 146LA 3SB7A 5EBHA 1IP3A 3HBDA 2DKVA 102LA 2B6WA 4G4HA 1GFGA 1B5WA 1C6TA 4GRVA 262LA 3HT6A 3DN4A 175LA 1DZBX 1L31A 3W3EA 2F2QA 4HTNA 129LA 2F4GA 1CV0A 1B7NA 4W51A 2QARC 3EMSA 4PRQA 4HTKA 1FKVA 3A6CY 1C6DA 1UIBA 1C6CA 1GEZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CJ9 A;  1BQL Y;  1LYY A;  1LSD A;  1UC0 A;  3CSZ A;  1D0L A;  1IR8 A;  2BQA A;  2LYZ A;  3AJN A;  1WVU A;  1I20 A;  4J0L A;  3WYH A;  1KXW A;  3BKV A;  1LMA A;  2C8O A;  2Q0M X;  1IP6 A;  3ATO A;  3WMK A;  1JKB A;  4ETC A;  1LZC A;  2MEB A;  4B4I A;  4TTD A;  4Z98 A;  5B06 A;  1JKA A;  4NHT A;  5APC A;  3G3B B;  3LYZ A;  4H9A A;  1LSM A;  1JUG A;  4B1A A;  1NDG C;  1UAC Y;  4LT3 A;  4ETB A;  1LZ5 A;  1W08 A;  4W96 A;  1FLW A;  3CQL A;  3HBE X;  4NGI A;  1I1Z A;  2Z19 A;  1LPI A;  1B5Z A;  133L A;  1VDQ A;  1GB9 A;  1ZV5 L;  4GLA A;  2BQC A;  3WUL A;  4ZIX A;  1B5U A;  3WL2 A;  2DQG Y;  4NGY A;  4G4B A;  4B0D A;  2XBS A;  1B7R A;  1LSB A;  2G4Q A;  3WU9 A;  4OWE A;  5APE A;  4L41 A;  1WQM A;  1UIA A;  1IP1 A;  5K7O A;  1GE4 A;  3CT0 A;  3TXJ A;  4RW1 A;  4KPM A;  4TX7 A;  1GFV A;  2VB1 A;  2DQF C;  2DQI Y;  4AXT A;  1IX0 A;  4N5R A;  2MEG A;  1LZN A;  2DQE Y;  4LFX A;  5E4P A;  5ILC A;  1GFR A;  2ZWB A;  1BB7 A;  2D91 A;  1SQ2 L;  1MLC E;  4C5F A;  2FYD A;  1WQR A;  1DQJ C;  4MST A;  3J6K A; 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 2W1M A;  1UCO A;  1LSZ A;  4ANR A;  2ZIJ A;  1JKD A;  1B9O A;  1NWG A;  4B4J A;  1A2Y C;  1HEW A;  3W6E A;  3IJU A;  3WW6 A;  132L A;  1LJ3 A;  1WQN A;  4IAS A;  4DD3 A;  2LZ2 A;  1VDT A;  5FEL A;  1B5X A;  1GBO A;  4MCK A;  4NHP A;  3TXH A;  2LYO A;  3WPL A;  4ET9 A;  1Z55 A;  3AYQ A;  1YKY X;  3N9E A;  5A3Z A;  5LXW A;  2Z18 A;  1CKH A;  1D6Q A;  4N9R A;  4NGK A;  1LYZ A;  4IAT A;  4CGE A;  1TBY A;  2Z37 A;  4H91 A;  5LA8 A;  1YRO A;  4OWB A;  4XJI A;  2BAA A;  5FHW A;  4BAD A;  4NY5 A;  5KXP A;  1LHH A;  1VED A;  1INU A;  1CKC A;  1DKK A;  2HU3 A;  2BQE A;  1GBY A;  4I8S A;  1GAZ A;  1LSF A;  3AGI A;  3QE8 A;  1KIQ C;  4H92 A;  4PRU A;  3W6C A;  1KXX A;  5I53 A;  4NEB A;  1QDT A;  4LFP A;  207L A;  4TWS A;  5C6I A;  1EQ5 A;  3TXB A;  5LVI A;  3TXG A;  2YVB A;  3A96 A;  2I25 L;  4DD2 A;  4GCD A;  3RZ4 A;  1YAM A;  4YEN A;  4OWH A;  1TAY A;  1GF8 A;  3K3T A;  1PZY A;  3B0I A;  1LZ9 A;  1JJ3 A;  1GF4 A;  1LZG A;  1LSG A;  2BQK A;  5B1F A;  1NDM C;  1B7O A;  4Z3M A;  5HQ1 A;  1AKI A;  4NSG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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