5I14A

Truncated and mutated t4 lysozyme
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGGGSGGDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTHSLHALQHKHWDHAAVHLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords mutated and truncated T4 lysozyme
publication title Metal ions-binding T4 lysozyme as an intramolecular protein purification tag compatible with X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 44
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5i14A00
1L90A 123LA 185LA 172LA 3QAKA 3SBAA 1L49A 1LI6A 4EJ4A 1KY1A 4ARLA 1L97A 3G3WA 1C65A 1K28A 3HTDA 170LA 1L84A 1L56A 2A4TA 1D3FA 1CU2A 1LWKA 118LA 1C64A 1QTBA 2OE7X 108LA 1C6IA 1G0QA 3PDSA 238LA 1P37A 6LZMA 225LA 1C63A 1OV7A 1L60A 230LA 214LA 4YXCA 1DYFA 1SX2A 1T8FA 1L23A 127LA 1L68A 1L86A 4ARPA 2HUMA 3HUQA 1L19A 1CV6A 4W54A 113LA 1D2WA 3OE6A 1L41A 3GUJA 138LA 1LYHA 1SSYA 1QTZA 231LA 2F2QA 1P36A 1L73A 1L36A 1NHBA 198LA 3SB6A 1L81A 3G3VA 1C6HA 1QT7A 2RBPA 148LE 160LA 1C6CA 1WTHA 4I7OA 1L52A 1L27A 4ARMB 3DN6A 258LA 1L15A 1LLHA 1D2YA 1L63A 260LA 103LA 4EPIA 3HTFA 1L09A 1QUHA 3HT6A 3C8RA 1L96A 1LYFA 1G0MA 1XEPA 1L42A 4I7RA 1QUDA 1CUQA 1D3MA 4EPFA 1QT6A 2QB0B 1PQJA 3L2XA 228LA 2NTHA 1L98A 4DKLA 2HUKA 3DMVA 3SBBC 1P2RA 4YXAC 2O79A 2B74A 229LA 1L35A 1SWZA 1LGUA 3C80A 158LA 1L22A 5I14A 1L31A 2OU9A 1L25A 120LA 232LA 1CTWA 139LA 1C6QA 2OTZX 3DN1A 1LYJA 144LA 1CV0A 171LA 1I6SA 1PQOA 1QT8A 2ANVA 4OO9A 142LA 1KW5A 1L61A 1G0GA 4LDEA 222LA 4ARQA 2B6TA 1LGXA 1L16A 2B70A 4EKQA 1QUOA 3CDQA 1P3NA 197LA 1LYDA 254LA 3GUPA 1G0JA 1L12A 3C83A 3CDVA 1CU3A 188LA 1L64A 1P5CA 1CU6A 178LA 3HWLA 2B6XA 140LA 1L85A 1L28A 206LA 2LC9A 4LZMA 1L53A 205LA 1L37A 2RBSA 235LA 1C69A 1LYGA 2RBRA 1JTNA 7LZMA 1L38A 1L46A 3HT7A 1L26A 3SB7A 4I7MA 195LA 1C6PA 1D9WA 5LZMA 3F9LA 1PQMA 3C81A 104LA 233LA 1L80A 252LA 243LA 255LA 3F8VA 173LA 1L87A 190LA 1C60A 157LA 3HUAA 1L08A 152LA 213LA 3D4SA 3CDRA 125LA 1DYGA 1L13A 1L10A 1JTMA 1L01A 245LA 1L04A 1L94A 3K2RA 1PQKA 1L39A 1L88A 218LA 2NTGA 1OV5A 1L06A 2OEAX 220LA 161LA 1L21A 4DAJA 3OE9A 3DN2A 159LA 1DYCA 1G07A 1L58A 3OE8A 1L05A 246LA 2B72A 1C6MA 3GUIA 3HTBA 2OE4X 3SB8A 163LA 3LZMA 4EXMA 1CU5A 1EPYA 150LA 1L92A 2OU8A 1ZURA 4EKPA 3JR6A 1C6TA 1G0PA 1SX7A 1KS3A 3CDTA 2O4WA 261LA 1KW7A 1OVKA 183LA 1OVHA 3GUNA 112LA 107LA 147LA 211LA 1L54A 192LA 1JQUA 1CVKA 251LA 111LA 2OU0X 2Q9EA 4I7QA 1P64A 1C68A 1DYAA 3GUKA 1L07A 2B6YA 2RB1X 1L30A 1QTVA 3HT8A 3SB9A 1L71A 2HULA 3L64A 1L29A 1D3JA 200LA 4IAPA 2OE9X 3HH5A 3DNAA 114LA 2F47A 1L03A 221LA 1L44A 1L77A 2RAZX 1L11A 1L62A 156LA 1C67A 1L59A 1CV4A 1QT3A 1QTDA 4GRVA 223LA 110LA 3C7ZA 1L70A 4I7NA 1KY0A 216LA 1OWZA 3V2WA 224LA 247LA 191LA 2ANXA 4ZPUA 1SSWA 2RAYX 3DMXA 236LA 3CDOA 3G3XA 1L48A 1XJTA 1CU0A 3HT9A 2RB2X 3HH3A 166LA 4W56A 4EKRA 1QS9A 1L45A 199LA 1QSQA 1P7SA 3DMZA 209LA 1L91A 4DJHA 4W52A 257LA 1LYEA 1QTHA 1PQDA 1L20A 4E97A 217LA 4I7KA 234LA 1L75A 1C6GA 1L82A 1B6IA 1C6BA 175LA 3PBLA 227LA 1G0KA 115LA 1CX6A 1G06A 1LI3A 176LA 4I7LA 4ARQB 2B73A 2Z6BA 1P56A 1C6KA 1C6JA 1OWYA 1OYUA 253LA 130LA 1DYEA 3FA0A 4LDOA 129LA 168LA 2B6WA 2QARC 1G0LA 1L18A 3DN8A 1L34A 3FADA 239LA 1L43A 1L89A 167LA 3GUOA 1ZYTA 4W51A 1L93A 3GULA 3VW7A 146LA 1SWYA 3HTGA 1L50A 169LA 4I7TA 3HUKA 109LA 151LA 3HH6A 119LA 187LA 3HU8A 1C6FA 4ARMA 1P6YA 141LA 4I7PA 201LA 1QTCA 1L72A 1CUPA 3DN0A 210LA 259LA 1LYIA 4W55A 1PQIA 181LA 1DYDA 2CUUA 3SN6R 1LW9A 180LA 4LDLA 1CV5A 3V2YA 3C82A 128LA 1P2LA 4PJZA 1L55A 182LA 241LA 186LA 1L83A 2F32A 4AQNA 1L0KA 2LZMA 165LA 137LA 131LA 1L76A 1G1VA 215LA 1QSBA 1LWGA 164LA 149LA 1C6LA 1L69A 250LA 3RUNA 1LPYA 196LA 262LA 1G1WA 1ZWNA 1L66A 240LA 2RH1A 3HDFA 2O7AA 3GUMA 2IGCA 2OTYX 3OE0A 4W59A 4I7JA 1TLAA 3NY9A 1T97A 1C6AA 1L32A 249LA 1L02A 143LA 1CV1A 219LA 2B6ZA 162LA 1C6EA 1L51A 3HU9A 177LA 3RZEA 1L99A 2RBNA 1C6NA 1CV3A 244LA 3C7YA 1T8GA 1L00A 212LA 4YX7C 1L33A 184LA 1L95A 3EMLA 1OVJA 4GBRB 1XJUA 1D3NA 1P46A 145LA 237LA 4W57A 1L0JA 1QT5A 3HH4A 2RB0X 2B75A 4I7SA 1QUGA 102LA 4K5YA 4EKSA 2RBOA 226LA 3DKEX 3C8QA 1L65A 4W58A 3HDEA 4W53A 3FI5A 122LA 1DYBA 1L74A 3C7WA 1C6DA 1L14A 189LA 4PK0A 248LA 3DN4A 1KNIA 242LA 2B7XA 3NYAA 1T6HA 1L79A 2L78A 3DN3A 1LGWA 1L67A 1T8AA 2RBQA 1L40A 1QT4A 155LA 126LA 1LI2A 1L17A 1C62A 1C66A 2LCBA 4ARJA 2Q9DA 1QS5A 1L57A 1C61A 174LA 1CX7A 1L24A 3SB5A 3C8SA 1L47A 3ODUA 3NY8A 4S0WA 256LA 3UONA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L90A 5C6LA 3CT5A 1LI6A 4EJ4A 1KY1A 1YKYX 1OUIA 1JKAA 3BKVA 1C65A 4ET9A 1OQMA 1L84A 3HBEX 4HTKA 1L56A 2A4TA 5KXXA 1LWKA 1QDTA 3TXEA 2OE7X 5LA8A 4WG7A 1C6IA 3PDSA 5KXKA 4CGEA 2Q0MX 214LA 4NGYA 1LMTA 4C5FA 2Z38A 4HSFA 4DQJA 2Z12A 1GAZA 2CJLA 4W96A 1FLWA 3W6BA 5B1FA 1L68A 2MEBA 2B5ZA 4H90A 4WLTA 1CV6A 4NG1A 4DD1A 4Z46A 1L41A 4ETCA 3GUJA 1NHBA 4QDNA 3EXDA 198LA 3SP3A 3SB6A 1IC4Y 3G3VA 1QT7A 1WTHA 1WVVA 1L52A 5KY1A 4ARMB 5I4YA 4DC4A 1HEOA 1D2YA 3HFMY 3TXGA 1B7MA 2D91A 3HTFA 1HEMA 1DI3A 1INUA 1LYFA 3TMVA 2IFFY 4I7RA 3WU9A 1CUQA 1D3MA 1WQRA 228LA 2ZIKA 4DKLA 4DT3A 3M18B 3WH1A 3D3DA 4YXAC 2O79A 1BGIA 1L35A 1L22A 4DD0A 5I14A 1JIYA 4NGOA 4B49A 232LA 1C6QA 4RW1A 4XJGA 1LSDA 1C45A 1CV0A 171LA 4OO9A 4X3BA 4NHIA 1L61A 134LA 4XJDA 1QTKA 2PC2A 2F2NA 2B6TA 5K7OA 1VDTA 2B70A 2HEDA 5KXSA 3CDQA 3A91A 1HFYA 254LA 3CDVA 188LA 1CU6A 2B6XA 1L85A 4DD7A 1DPWA 5B06A 2RBRA 1C69A 1BWJA 1LJ3A 4KL7A 1L38A 1L46A 3HT7A 3VWOA 4NEBA 4I7MA 3F9LA 5FELA 2VB1A 2CGIA 1JEFA 1HELA 4OW1A 173LA 4NGZA 1BVKC 3HUAA 1REXA 1W08A 4M4OA 125LA 1XFPL 1XGUC 3K2RA 1PQKA 2NTGA 1L06A 3RW8A 1NDMC 1C10A 3WPJA 4N0JA 1ZVYB 3DN2A 3ZVQB 4HTNA 3J6KA 1DYCA 1FLUA 1L05A 246LA 4LYZA 3HTBA 2OE4X 4Z98A 1GWDA 2HEAA 4NHPA 3E3DA 3A34A 2C8OA 3B0OA 4EXMA 1T3PA 150LA 4EKPA 3JR6A 1G0PA 5AMYA 2DQHY 1VATA 1OUDA 1IP6A 3LYMA 1HFZA 1JQUA 4WM3A 1CVKA 1TDYA 5F9XA 1LJJA 5LAGA 4I7QA 4WMGA 4UWUA 3GUKA 1GDWA 1QTVA 3HT8A 1LKRA 4GN4A 2HULA 1GFGA 3KAMA 5KXLA 1LMQA 1H6MA 1L77A 1IP7A 5I4XA 1GBZA 1NKHA 1LHKA 1C67A 2FYDA 1L59A 1QTDA 3C7ZA 3P4ZA 4R6CA 1L70A 224LA 247LA 1JHLA 4W94A 4YF2A 1JWRA 3DMXA 4H8ZA 4WO6A 3ULRA 1GFVA 2RB2X 4BS7A 1P7SA 2H9JA 3LYOA 4LGKA 1QUSA 2DKVA 1IORA 2EKSC 4EMNA 4I7KA 1UA6Y 2F30A 1G7IC 1L82A 1LYSA 3A90A 1LMPA 3B6LA 3T36A 227LA 4NSIA 115LA 3LZ2A 3B0KA 176LA 3W6EA 4ETEA 1LMAA 4YEOA 5FHWA 5ILCA 4GN5C 1P56A 1C6KA 3LYTA 1C6JA 1OWYA 1B5XA 3A6BY 4GCBA 5FDJA 1ALCA 253LA 4YEMA 130LA 3FI7A 4LDOA 129LA 1LZTA 168LA 1LHLA 4TSCA 2Z18A 3A95A 1G0LA 3AGGG 3DN8A 3EO5A 1B9OA 4DQ7A 4ZEEA 4OWHA 1NBZC 1B5WA 4OWBA 1I1ZA 2BQJA 1YAOA 1WQMA 2MEFA 5APFA 5HMVA 4ZFPA 1SWYA 3WUMA 3HTGA 1LSPA 4H8YA 1RI8B 1JKDA 1UIGA 187LA 4PRQA 3HU8A 5I4WA 4ARMA 3A92A 3TXIA 1XEKA 2BQGA 2W1LA 5IELA 2MEHA 193LA 3CQLA 1LW9A 1LZNA 3V2YA 3C82A 128LA 1YKZX 3AZ6A 5LVIA 241LA 1L83A 2LZMA 1D9UA 1SLYA 165LA 1L76A 1KIQC 1UIFA 1LWGA 5B07A 154LA 1B5VA 1C46A 2YSSC 3A67Y 2EPEA 1IP1A 1LPYA 1TBYA 4NGVA 1ZWNA 2LHMA 5F16A 2W1XA 3WL2A 1OUBA 2DQIY 1W6ZA 1OP9B 1LHJA 1TLAA 1LZAA 1IOSA 2BQCA 1C6AA 249LA 3ATOA 143LA 1GF5A 219LA 2DQDY 162LA 3AYQA 1C6EA 177LA 5L3IA 3RZEA 1L99A 1IR9A 1C6NA 1AM7A 244LA 1WQQA 1LHIA 4YX7C 1CKDA 4H91A 1XEJA 1XJUA 1P46A 4PJ2C 5L3HA 3EBAB 4N8ZA 1LZ4A 1LTMA 2B75A 4H8XA 4I7SA 4WM2A 1QUGA 1B7PA 1LSAA 4EKSA 3FI5A 3C7WA 5I5QA 1L14A 3AW7A 5KXOA 1HFXA 1BB6A 1UBZA 3A3QA 3P65A 3TMWA 126LA 1C62A 1L17A 4NG8A 4KXIA 2Q9DA 1QS5A 174LA 3SB5A 2MEEA 4WL7A 4S0WA 1OUEA 1NHEA 1GF0A 3QAKA 1HNLA 2YDGA 1Z55A 3ZVQA 1D3FA 1C64A 238LA 1OV7A 3A8ZA 1ZMYL 1DI5A 1YIKA 1IC5Y 1FDLY 127LA 1L86A 1MLCE 2HUMA 3HUQA 4B0DA 1L19A 4WM4A 1GFTA 4ET8A 138LA 2ZNXY 1J1PY 1IP4A 1ZVHL 5II3A 1L73A 1GFHA 160LA 207LA 1L27A 1LZYA 4AGAA 3TXJA 1L63A 1O23A 1IY4A 2X0AA 4NGLA 3TMXA 2BQAA 2A7DA 1G0MA 2W1YA 1L42A 4WLDA 1QT6A 2ZILA 3L2XA 1WQPA 4RLMA 1C43A 2HUKA 1VDPA 229LA 2BLYA 1CKCA 4N1EI 1LSZA 1L31A 5APDA 4DDAA 1L25A 120LA 1DXJA 1QT8A 2ANVA 1F6RA 142LA 1RCMA 1G0GA 4LDEA 2DBTA 222LA 9LYZA 5HQ1A 4AXTA 1CJ7A 1QUOA 1JTTL 4I8SA 4WM5A 1YROA 1E8LA 2WARA 4B4JA 1LYDA 1HSXA 1L12A 3C83A 1L64A 1G7MC 4HJZA 2DQAA 1GB8A 2I6ZA 206LA 1B7SA 2LZTA 1IWZA 1IX0A 235LA 3AGHA 4H94A 1UIAA 1L26A 3SB7A 1D9WA 4ETDA 1PQMA 233LA 1L80A 4GCCA 1TEWA 3F8VA 1LSGA 1C60A 4ZIXA 3D4SA 213LA 1B0DA 3CDRA 1DYGA 1L13A 5KKIA 1GB5A 1JTPL 5B1GA 1OV5A 3WU8A 3CSQA 1HEWA 1B5ZA 1REMA 1LAAA 1AT6A 4DAJA 4BAFA 159LA 153LA 4R0FA 3WW5A 2MEGA 2G4NA 1T6VL 163LA 3AB6A 3SB8A 3TXHA 1G7JC 5LVKA 1GE1A 2BQDA 5LVGA 1KS3A 3CDTA 5EBHA 1OVKA 183LA 1OVHA 3GUNA 192LA 4G4HA 4C3WA 1GF4A 5I54A 2ZQ3A 3N9EA 1C68A 1JJ1A 1GBYA 2B6YA 1YILA 4NFVA 2MEIA 1D3JA 2Z39A 4HPEA 200LA 4IAPA 1HHLA 2HU3A 1DZBX 4NGIA 4LZTA 156LA 1QT3A 2A7FA 223LA 2XBRA 4NHTA 1KY0A 1OWZA 4WLXA 1IWWA 2BQKA 2ZIJA 2ANXA 4ZPUA 1C08C 1SSWA 2YBMA 1LZ8A 1LZ1A 236LA 7LYZA 2ZQ4A 1NF5A 1LKSA 3CDOA 4PPOA 1N4FA 4NHQA 4Z41A 4B1AA 3HH3A 1KIPC 1QS9A 1QSQA 3DMZA 257LA 1PQDA 1HMLA 1LSCA 1GDXA 1GBOA 5FEKA 217LA 4HJVA 1IO5A 234LA 4Z3MA 1C6GA 1D6PA 4QEQA 5F81A 2H9KA 1HF4A 1G06A 1CX6A 4I7LA 4ARQB 2B73A 132LA 3OJPA 4QGZA 3LZTA 4EOFA 1GE0A 1OYUA 3CB7A 1BWIA 3FA0A 2HEFA 2LYMA 1JKCA 4FDYA 5A3ZA 1L18A 1L34A 5DM9A 1ZV5L 1VAUA 1L43A 1F6SA 1C7PA 1L93A 1DQJC 1OUFA 6LYZA 4CHXA 3WVYA 3G3BB 3AGIA 3AZ7A 4NIJA 1L50A 4NSGA 169LA 109LA 3P66A 119LA 3HBDA 1P6YA 4H93A 1QTCA 2BQOA 2G4QA 1LSFA 3DN0A 210LA 4GLVA 1G7LC 1HENA 4W55A 1D0KA 4G49A 4MR1A 1LSMA 180LA 4LDLA 1CV5A 4PJZA 1WQOA 1J1OY 5HLLA 4G4CA 1UIDA 4FJRA 1WTMA 1G1VA 164LA 1OUAA 1L69A 1LYYA 250LA 3RUNA 5IHGA 1CKGA 1UIEA 5M1YA 1FBIX 1G1WA 1L66A 1IR8A 1FLQA 4ETBA 2IGCA 1VDSA 1DPXA 1HMKA 1P2CC 2EIZC 1BWHA 4GN3A 4NWEA 1JSFA 2BQBA 1L51A 1CV3A 4WO9A 2XJWA 3EMLA 4GBRB 5C6IA 1GF6A 1LSYA 4WM6A 3QNGA 1FN5A 3W6FA 4TUNA 4W57A 4WL6A 102LA 3DKEX 2D6BA 4W58A 3HDEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L90 A;  5C6L A;  3CT5 A;  1LI6 A;  4EJ4 A;  1KY1 A;  1YKY X;  1OUI A;  1JKA A;  3BKV A;  1C65 A;  4ET9 A;  1OQM A;  1L84 A;  3HBE X;  4HTK A;  1L56 A;  2A4T A;  5KXX A;  1LWK A;  1QDT A;  3TXE A;  2OE7 X;  5LA8 A;  4WG7 A;  1C6I A;  3PDS A;  5KXK A;  4CGE A;  2Q0M X;  214L A;  4NGY A;  1LMT A;  4C5F A;  2Z38 A;  4HSF A;  4DQJ A;  2Z12 A;  1GAZ A;  2CJL A;  4W96 A;  1FLW A;  3W6B A;  5B1F A;  1L68 A;  2MEB A;  2B5Z A;  4H90 A;  4WLT A;  1CV6 A;  4NG1 A;  4DD1 A;  4Z46 A;  1L41 A;  4ETC A;  3GUJ A;  1NHB A;  4QDN A;  3EXD A;  198L A;  3SP3 A;  3SB6 A;  1IC4 Y;  3G3V A;  1QT7 A;  1WTH A;  1WVV A;  1L52 A;  5KY1 A;  4ARM B;  5I4Y A;  4DC4 A;  1HEO A;  1D2Y A;  3HFM Y;  3TXG A;  1B7M A;  2D91 A;  3HTF A;  1HEM A;  1DI3 A;  1INU A;  1LYF A;  3TMV A;  2IFF Y;  4I7R A;  3WU9 A;  1CUQ A;  1D3M A;  1WQR A;  228L A;  2ZIK A;  4DKL A;  4DT3 A;  3M18 B;  3WH1 A;  3D3D A;  4YXA C;  2O79 A;  1BGI A;  1L35 A;  1L22 A;  4DD0 A;  5I14 A;  1JIY A;  4NGO A;  4B49 A;  232L A;  1C6Q A;  4RW1 A;  4XJG A;  1LSD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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