5II3A

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme and compound 3, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ii3A00
4C3WA 1T6VL 1ZVYB 2FYDA 4EOFA 1XGTC 1NBZC 4H1PA 4XJHA 1B7NA 4NGOA 4ETEA 2LYOA 5J7CA 5KXTA 1WQOA 5LXWA 4DYGA 1QDRA 2CDSA 1JKDA 4WM5A 1CJ6A 2YBMA 4ANRA 2DQAA 4B4IA 4DDCA 1CKFA 1AZFA 2I6ZA 1N4FA 2YBLA 4CGEA 4H9AA 4NG1A 1NQIA 1RE2A 1GE1A 4L41A 1A4VA 1JSFA 2HEAA 1FLYA 1Z55A 5B59A 3J6KA 1C08C 4XENA 1HHLA 2D4KA 4HJZA 4TWSA 5I4XA 1GBXA 2MEEA 4H9BA 1IWVA 1GFKA 2MEHA 1H6MA 4ETAA 7LYZA 4G49A 1BWJA 4QDNA 4DD1A 4X3BA 1JJ1A 1WQPA 1GF3A 1NDGC 1YROA 2C8PA 2CGIA 2G4NA 1CKCA 1VFBC 4GCBA 1GBSA 2N5ZA 5APEA 4WLXA 1D0LA 4KT3A 3AYQA 3TXGA 3WPLA 2BPUA 3LYMA 194LA 3LYZA 1G7MC 2DQDY 1TAYA 2FBDA 4OWBA 4W96A 1GBWA 1D0MA 1JITA 1GE0A 1IC4Y 3A34A 4NWHA 5LYZA 4HTNA 1HENA 5E9RA 2LYMA 3B0KA 4LYMA 1IP6A 1I20A 193LA 3A94A 1WQQA 5HMVA 1UIAA 1OUHA 1YIKA 1DPWA 2BAAA 4WL6A 4R6CA 5KXOA 5HQ1A 2NWDX 3AGHA 1LHHA 1UA6Y 4LYBA 4OWEA 1EL1A 3CB7A 4CFPA 1IX0A 1LZRA 1QQYA 4B49A 2EPEA 1B5YA 3GXKA 1HEPA 4WM6A 3EO5A 4GCEA 2YDGA 1INUA 1OUFA 1JSEA 2EQLA 3MGWA 5JENB 2D91A 1LSEA 2LZTA 6LYZA 3N9AA 4J1AA 1GB3A 4R0FA 5ILFA 2ZNWY 1B5VA 4TTDA 1GB6A 4NIJA 1LZNA 5D5FA 2XBSA 2DBTA 4WL7A 4WO9A 5IELA 1HFZA 4CFOA 3AZ6A 2ZWBA 1ALCA 1LZYA 4QEQA 5AMYA 3HBDA 4NSGA 4H92A 1LSBA 3GXRA 1VAUA 3M18B 4HPEA 1NKHA 2BQOA 3LZTA 1LAAA 5LAGA 5B05A 5KY1A 134LA 3CT0A 4HJVA 1D0KA 1VDQA 3WVXA 4BADA 2FBBA 3P66A 3B6LA 5KXMA 1I1ZA 5KXLA 3WPJA 1UIFA 1B0DA 1CJ7A 1GFUA 5FDJA 2HTXA 1LMNA 2RSCA 1LHMA 1ZV5L 4LT3A 4FJRA 4NFVA 1DI4A 1G7HC 3N9EA 3B0OA 4NSJA 1TDYA 1LZ9A 1VDTA 1LJFA 3J4GA 1GFTA 4DD9A 1GFEA 3CT5A 1IP3A 1GE4A 1LZ4A 1GB2A 1LYSA 3P65A 4G9SA 3A91A 2C8OA 4WM3A 1UCOA 135LA 3W6AA 1A2YC 1LHIA 1BB4A 4ETDA 5L3IA 1LJHA 1IOTA 3CT1A 4XJGA 4M6DA 1UUZC 1GF9A 1GBYA 1GB0A 1GB8A 1NHEA 1RCMA 1LJ3A 2BQHA 2Q0MX 3IJUA 4N0JA 5ILCA 5LINA 4N1EI 2XTHA 3WVYA 1IORA 1JWRA 1REYA 2AUBA 4O34A 1JUGA 1LTMA 4CHXA 1LJEA 2YBIA 2DQFC 4XJBA 2YBJA 1FLQA 3QNGA 1GDXA 3TXIA 1LSYA 4XN6A 3A90A 1B7QA 1GWDA 1LSFA 1UIHA 2DQIY 2YBHA 2BQBA 4PJ2C 5LA8A 3ULRA 1FKVA 1GHLA 2XBRA 3A67Y 1P2CC 4WMGA 4H90A 1KIRC 1LSMA 2BQKA 1LZSA 2ZYPA 1LMOA 1IEEA 1F6RA 2ZQ3A 2HUBA 3WW6A 2DQJY 4YF2A 1KIPC 1LZBA 1REMA 1B7RA 2HEEA 2MEAA 3TMVA 1YKZX 1CKDA 1LHLA 1WQMA 2YSSC 1LYOA 3G3AB 4MR1A 2D4IA 4TSCA 4XADA 1OUIA 1YAQA 2CJLA 3TXHA 1UIDA 4PPOA 4BS7A 1UICA 5D5CA 4RLMA 3WXTA 1GFGA 1DZBX 1LSGA 1IC7Y 4QY9A 1UBZA 3F6ZA 4AGAA 1B5ZA 1IC5Y 4PRUA 4RW1A 2BQEA 1GB9A 1NF5A 1YAPA 4NHTA 1D9UA 5C6IA 2Z37A 3T36A 1FN5A 2Z2FA 4H94A 3W6CA 2XJWA 1LZDA 2ZYCA 2DQEY 3HFMY 3AZ5A 4WO6A 1WTMA 1LMTA 1JHLA 3TXEA 4WM4A 1JJ0A 1GEZA 1IWXA 154LA 1J1XY 1YL1X 1LSNA 4HJYA 2HU1A 4H9FA 1DXJA 4XJFA 4HSFA 1LZGA 2F2NA 1GXV2 3WL2A 3AW6A 3RU5A 5IHGA 4GCFA 2HEFA 4B4JA 2W1LA 2I26L 4NEBA 1LSAA 3AGIA 3W6DA 5LVGA 3W6FA 2GV0A 3RNXA 1GB5A 1IWTA 1YQVY 1JTPL 1BWHA 1IOQA 1XEKA 4NG8A 3D3DA 5DN4A 3E3DA 3W6BA 4BAFA 1OUBA 4N9RA 1F10A 1B5UA 1LCNA 1QUSA 1QUTA 2BQGA 2F4GA 1DI5A 1QTKA 1KXXA 133LA 3W3EA 3TMWA 4I0CA 3WU8A 1GF8A 4DDBA 1GF6A 4NSHA 2A7DA 3LHMA 5L3HA 3A3QA 2Z2EA 1LJGA 1LSPA 1NBYC 1QSAA 2YVBA 4DD3A 4G4BA 1IO5A 1B7OA 4NSIA 1B7MA 4NWEA 4D9ZA 5M1YA 5F16A 4NGWA 3TXDA 5I4YA 3OK0A 1LMQA 3OJPA 1B2KA 4OOOA 2WARA 2HEBA 2IHLA 4GCDA 1FKQA 1BVXA 1GPQC 1OUEA 4NHSA 1GDWA 3CSZA 5T3FA 2CWIA 3B0IA 1XSFA 1BQLY 3TXKA 2Z18A 1WQRA 1HSXA 5I4WA 5LA5A 4DC4A 3T6UA 4H93A 1E8LA 1AT6A 5FELA 1DKJA 1HEMA 1IR8A 1IP4A 1C45A 2W1MA 9LYZA 5KXPA 1JKCA 2BQMA 2D4JA 1GF0A 2EKSC 4II8A 3G3BB 4LFPA 3WMKA 4RDSA 4DT3A 1HEWA 1B9OA 1LOZA 1BGIA 4PGJB 4BAPA 2HEDA 1G7IC 3ATNA 1G7JC 1V7SA 4NHPA 2FYCA 4YOPA 4WLDA 5F9UA 4B0DA 3A3RX 4LZTA 1DPXA 3N9CA 1TBYA 2VB1A 5EBHA 4UWNA 1IVMA 1B5XA 1BB7A 1LJIA 1CKHA 5APFA 1AKIA 2HU3A 3A96A 2W1YA 1QSWA 3A6BY 1C43A 1F0WA 4A7DA 1LJJA 4H8ZA 4IJ4A 1YANA 4GCCA 5LVKA 1YKYX 1JIYA 1LMCA 4KPMA 4LT1A 4WLTA 5KXKA 4NGKA 1EQ5A 1SQ2L 4WG1A 4ETBA 1QDTA 4H91A 1LSDA 4P2EA 1H87A 5F14A 5HLLA 1HFYA 3EMSA 2PC2A 1C7PA 1OP9B 1IWUA 4ZEEA 3AW7A 4DD0A 1JPOA 1LSCA 5FHWA 1OUAA 1LZAA 4IASA 4UWUA 5DLAA 1GBZA 1ZMYL 1LHJA 4XJIA 1LZCA 2BQDA 3LYOA 1PS5A 4Z98A 2YBNA 5A3EA 1LMAA 5HNLA 5KKIA 1RJCB 2IFFY 4OWAA 4OWHA 3LN2A 1LKRA 3K3TA 2BQJA 2Z12A 2F30A 1RI8B 1IY4A 2F4AA 4H8YA 4TX7A 4OOTA 1O23A 1B7LA 4NGVA 1JTTL 4J1BA 1HMKA 1GBOA 1LSZA 1CKGA 1PZYA 5FSTA 1CNSA 3AZ4A 4H8XA 4YENA 4WG7A 4PHIA 1HC0A 1AM7A 1XFPL 5DN5A 1UIGA 5B1GA 4ZIXA 1HEOA 3QE8A 4N8ZA 1GD6A 1LZ8A 4NHQA 1BB3A 5LVHA 2I25L 2W1XA 4XJDA 4QGZA 3RT5X 1IY3A 1C10A 2B5ZA 1OUJA 1TCYA 1UIBA 3B72A 1DKKA 1UACY 2G4PA 4NGIA 2H9KA 4G4HA 1GFRA 4H9CA 5B1FA 1VDPA 4ZFPA 1FLWA 3WUAA 5IDDA 5II3A 1NDMC 4LFXA 1OUDA 5FEKA 1HERA 3A6CY 2MEIA 1VEDA 2BLYA 8LYZA 1ZVHL 3P68A 1DI3A 2ZNXY 3VWOA 2H5ZA 5C6JA 1RFPA 5KXNA 1GAYA 1GAZA 3TXFA 2LZ2A 1LYZA 1JKAA 1XGPC 4DDAA 1GF5A 5B06A 4B1AA 3P4ZA 3WUNA 1KIQC 1HELA 1YILA 3WUMA 1GEVA 4DD7A 5L9JA 1GFHA 1BVKC 1WVUA 4W94A 4NGLA 153LA 3M3UA 1QTEA 5B07A 4OW1A 4GN5C 4RLNA 2ZIJA 1IOSA 3CSRA 1UC0A 2BQIA 5KJ9A 3FE0A 2MEFA 4MSTA 1DQJC 1IR9A 1LJ4A 4GN3A 5I5QA 3WW5A 1T3PA 1J1OY 2MEBA 1OQMA 5LVIA 5FCPA 1FLUA 4OWCA 5DM9A 4IATA 5KKJA 4UWVA 1D6QA 1IOCA 1JISA 1WTNA 4H9IA 5KXSA 3RZ4A 6LYTA 2BQNA 1V7TA 1YL0X 4NGZA 1TEWA 4M4OA 1YAMA 1QIOA 3BKHA 3CQLA 4Z46A 1LPIA 4GN4A 5LYMA 2X0AA 1KXWA 1AT5A 2Y8PA 3AB6A 3SP3A 3WULA 4C5FA 1GXXA 3HBEX 4Z3MA 2LYZA 4PRQA 1XGRC 1GFAA 4GLAA 1FBIX 2Z39A 4NGYA 1LZTA 1OUCA 2BQCA 4LT0A 1VDSA 1JEFA 2A7FA 1NMMA 4YEOA 1J1PY 3EXDA 4KL7A 3TXJA 5KXYA 5HMJA 1F6SA 4WOAA 3A95A 4WM2A 1JKBA 3TMXA 5KXXA 1B7PA 1BB5A 1GFJA 1LJKA 1LYYA 4HV2A 2Z38A 3HBHA 3CSQA 5C6LA 1REZA 1UIEA 3TXBA 2BQLA 2DQGY 3KAMA 1MELL 2BLXA 4ML7A 1KXYA 4H9HA 2D6BA 4YEMA 5F9XA 4DWXA 4Z41A 3P64A 1LZEA 5LVJA 1BWIA 132LA 1IP2A 1GF7A 2BQAA 2MEGA 1OUGA 4XYYA 4YM8A 1D6PA 1LHKA 4N5RA 4J0LA 4H9EA 1IWWA 5KXRA 3D9AC 5HNCA 4HP0A 4NY5A 4HPIA 1LJNA 1WQNA 4WM1A 1VATA 3TMUA 4TSBA 1HMLA 3AZ7A 4HTQA 2DQHY 5E4PA 1GE2A 5DL9A 4B4EA 3LYTA 4RW2A 1NWGA 1W08A 1XGQC 2LHMA 4GLVA 5APDA 1FDLY 3RW8A 3W6EA 1LZ5A 2DKVA 4I8SA 3ATOA 1B7SA 3WH1A 1XEJA 4E3UA 1C46A 5LIOA 1GE3A 1MLCE 1BHZA 1GF4A 1IP7A 2HECA 1IWZA 4J7VA 4NGJA 4LYOA 5APCA 3WPKA 3ZVQB 1JJ3A 1YAOA 2EIZC 3LZ2A 1SLYA 4FDYA 4LGKA 4AXTA 1G7LC 1IIZA 3IJVA 4CJ2A 1HEQA 4EMNA 2DQCY 5A3ZA 1HNLA 2ZIKA 3BKVA 4MCKA 2MEDA 2ZILA 3AGGG 1LZ6A 2ZQ4A 2MECA 2Z19A 1CJ8A 3WYHA 5LAFA 4KXIA 1W6ZA 4TUNA 4U3XB 1XEIA 208LA 3FI7A 3IWRA 4HTKA 4WLYA 3A93A 4HV1A 1GFVA 1HF4A 1HFXA 3A8ZA 4LYZA 4N1CC 5I53A 3WXUA 4DD2A 3QY4A 4LYCA 4ETCA 4NHIA 2BQFA 3A92A 1IP1A 1EQEA 1IWYA 1JTOL 207LA 1IP5A 3WU7A 5K7OA 1EQ4A 5LYTA 1YKXX 5F81A 5KXWA 1IR7A 4ET9A 3ZVQA 1XGUC 2G4QA 2H9JA 1I56A 3AJNA 1LZ1A 4LYTA 1B5WA 4G4CA 5KXZA 3ZEKA 1LKSA 4LT2A 3EBAB 1GB7A 1BB6A 1HSWA 3WU9A 4ET8A 1WVVA 1LMPA 5I54A 1REXA 1CJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T6VL 1ZVYB 4DAJA 1NBZC 4XJHA 1B7NA 4DYGA 1CJ6A 1OYUA 1L35A 4ANRA 1DYGA 1AZFA 1L79A 2I6ZA 168LA 4CGEA 4L41A 1CV3A 1P6YA 4XENA 1HHLA 4PJZA 1IWVA 119LA 1EPYA 4I7TA 4YX7C 1OWYA 2G4NA 1GBSA 4WLXA 2BPUA 5LYTA 1L70A 151LA 3VW7A 4NWHA 115LA 1SX2A 5LYZA 4I7OA 1YIKA 130LA 2NWDX 4OWEA 1L66A 1ZURA 1LZRA 1QQYA 2EPEA 1HEPA 4WM6A 1L73A 1OUFA 5JENB 1L53A 1P36A 1LSEA 2LZTA 6LYZA 243LA 4J1AA 4E97A 5D5FA 4WL7A 4ARPA 1DYDA 160LA 1C6NA 2RB1X 1D2YA 5AMYA 3HBDA 1LSBA 4YXCA 1G1WA 2BQOA 5LAGA 5B05A 4DQJA 3CDRA 1D3JA 3SB9A 1GFUA 2RBNA 1G0JA 1QT6A 1C64A 1PQDA 1L98A 1ZV5L 4FJRA 1QUHA 1L07A 4LT3A 4BADA 1LZ9A 3J4GA 1QTCA 1GFTA 3G3WA 1GB2A 1QUOA 129LA 3HH5A 1IOTA 3CT1A 4XJGA 139LA 225LA 5LINA 1L62A 2XTHA 2AUBA 3SB7A 4O34A 2YBJA 1FLQA 3TXIA 1LSYA 142LA 1UIHA 1P2CC 1KIRC 1L04A 1LZSA 1L10A 1REMA 2HEEA 1LHLA 3G3AB 1QTZA 1OUIA 1UIDA 4RLMA 4RW1A 1GB9A 4NHTA 3W6CA 4H94A 1L74A 1P37A 2ZYCA 167LA 3HFMY 1JHLA 3TXEA 165LA 232LA 1GEZA 4HJYA 2HU1A 4H9FA 4HSFA 2F2NA 3WL2A 143LA 1LGUA 1LYDA 4LDLA 1BWHA 3D3DA 3E3DA 2OU8A 4N9RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4C3W A;  1T6V L;  1ZVY B;  2FYD A;  4EOF A;  1XGT C;  1NBZ C;  4H1P A;  4XJH A;  1B7N A;  4NGO A;  4ETE A;  2LYO A;  5J7C A;  5KXT A;  1WQO A;  5LXW A;  4DYG A;  1QDR A;  2CDS A;  1JKD A;  4WM5 A;  1CJ6 A;  2YBM A;  4ANR A;  2DQA A;  4B4I A;  4DDC A;  1CKF A;  1AZF A;  2I6Z A;  1N4F A;  2YBL A;  4CGE A;  4H9A A;  4NG1 A;  1NQI A;  1RE2 A;  1GE1 A;  4L41 A;  1A4V A;  1JSF A;  2HEA A;  1FLY A;  1Z55 A;  5B59 A;  3J6K A;  1C08 C;  4XEN A;  1HHL A;  2D4K A;  4HJZ A;  4TWS A;  5I4X A;  1GBX A;  2MEE A;  4H9B A;  1IWV A;  1GFK A;  2MEH A;  1H6M A;  4ETA A;  7LYZ A;  4G49 A;  1BWJ A;  4QDN A;  4DD1 A;  4X3B A;  1JJ1 A;  1WQP A;  1GF3 A;  1NDG C;  1YRO A;  2C8P A;  2CGI A;  2G4N A;  1CKC A;  1VFB C;  4GCB A;  1GBS A;  2N5Z A;  5APE A;  4WLX A;  1D0L A;  4KT3 A;  3AYQ A;  3TXG A;  3WPL A;  2BPU A;  3LYM A;  194L A;  3LYZ A;  1G7M C;  2DQD Y;  1TAY A;  2FBD A;  4OWB A;  4W96 A;  1GBW A;  1D0M A;  1JIT A;  1GE0 A;  1IC4 Y;  3A34 A;  4NWH A;  5LYZ A;  4HTN A;  1HEN A;  5E9R A;  2LYM A;  3B0K A;  4LYM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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