5ILFA

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme and compound 4, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ilfA00
1CKCA 1JWRA 1DI3A 1UIFA 4LFPA 4GCBA 1LZRA 3TXKA 1T3PA 4NSIA 2MEGA 4WOAA 2Z19A 1CKHA 1GF5A 2BQFA 3BKVA 3CSZA 4H94A 4Z46A 4OW1A 3WUAA 5HLLA 1IWTA 1LJIA 4H1PA 1NF5A 3TXBA 1HFZA 1B5ZA 1V7SA 1JSEA 2ZILA 3K3TA 1WQRA 4R6CA 5I53A 1HC0A 3QNGA 1XGTC 3EO5A 4GN4A 5L3HA 4WG1A 4UWUA 4H93A 4NHIA 2BQGA 1IY4A 2VB1A 1LJ4A 1GFAA 1TEWA 4OOTA 3P4ZA 1LSAA 3WPKA 1LKRA 3RU5A 4WL7A 2BQDA 3KAMA 1QUSA 3RNXA 3A3RX 1GEZA 3ULRA 1JIYA 1IWYA 1UIGA 3GXKA 5IELA 4G4CA 3EXDA 2DQAA 2DQIY 1NMMA 3LZ2A 1HERA 1IWVA 4WM1A 4XN6A 1IOQA 5KXNA 3TMVA 1H6MA 4DD2A 5KXXA 1BB4A 2ZIJA 4H9HA 4M6DA 1LZGA 1VAUA 4LT0A 2W1MA 1GF8A 2C8PA 3B6LA 1VDTA 193LA 1HMKA 4WO6A 3QY4A 1GFJA 1GFHA 5KY1A 3A96A 4LZTA 5DN4A 1F0WA 1OUDA 2GV0A 4BAPA 5KXMA 1IWUA 1P2CC 4TX7A 1IOSA 3WUMA 1FDLY 1IIZA 4H9IA 4LYTA 3TXFA 4XJDA 3AGGG 5ILFA 5LVGA 1GBSA 4NHPA 1DXJA 3VWOA 1B2KA 1JKDA 1TCYA 2AUBA 1LZSA 1QSWA 1QTEA 3P64A 4J7VA 2BQAA 1YKZX 4HJVA 6LYTA 3WH1A 2LZTA 2MECA 4LYOA 1D0LA 2DBTA 3D3DA 1H87A 1T6VL 1FLQA 1IP2A 4Z98A 1QTKA 5KKJA 5LINA 1OUJA 3A34A 4H9EA 4XJHA 1B7QA 1HHLA 2BQKA 4KPMA 4NGVA 1BB3A 1GE4A 1IC7Y 1YAQA 2Z12A 153LA 1JSFA 1SLYA 4ETDA 1YANA 4LT1A 1QIOA 2HEBA 2MEFA 4QGZA 5APDA 4MR1A 3ATOA 1GB9A 2YBJA 3WUNA 2HU3A 2LYOA 2BQLA 2HEEA 4H92A 2F4AA 2HECA 1D6QA 5KXRA 4NFVA 4B4EA 4OWAA 4U3XB 5F14A 1YKYX 2IFFY 4NHQA 5M1YA 1YAOA 1LSDA 4WM6A 4XJBA 1B7OA 4NSGA 5KXLA 1I56A 1YIKA 2CWIA 4XYYA 4NSJA 1LYOA 3F6ZA 1MELL 1W08A 1Z55A 2I6ZA 2YBNA 3RW8A 1GE2A 1J1XY 1N4FA 4G49A 1FKVA 5LYTA 4LGKA 4A7DA 1LSNA 1YL0X 1F6SA 2ZQ3A 5I4WA 1OUEA 1G7LC 3AJNA 1HF4A 4R0FA 1KIRC 1PZYA 1JEFA 3GXRA 4P2EA 1CKGA 1UIEA 1KIPC 3WXUA 5L3IA 2I25L 4WLYA 2Z39A 2W1LA 4NG8A 1YQVY 5LAGA 3CT1A 4NGZA 1PS5A 4ML7A 4CJ2A 1JTPL 1LZAA 5JENB 5LAFA 4CFOA 1YILA 4LYZA 1WQOA 1D0KA 4BS7A 1NQIA 4LT2A 1C45A 4LYBA 1AT5A 3D9AC 1LAAA 1UIBA 4NIJA 4AXTA 4L41A 3A94A 4DD7A 3LZTA 4X3BA 1XEKA 1LHJA 3N9CA 2D6BA 1HFXA 3W6AA 1IC4Y 5F16A 4YOPA 4DD0A 5KXYA 4PRUA 2BQMA 4G4HA 4B4JA 7LYZA 1XFPL 1HEWA 1LSYA 3N9EA 4NG1A 4I8SA 4WLXA 1LJNA 1G7IC 1JJ3A 4DYGA 2BQHA 5APCA 3CT0A 4H91A 1B5UA 1LJ3A 2MEHA 4H8ZA 3TXJA 1IP6A 3W6CA 1UCOA 3WVYA 5A3ZA 3AGIA 4GLAA 5HQ1A 1F10A 3J4GA 1GWDA 1VFBC 5LYMA 4OOOA 2EQLA 2F4GA 1YKXX 4HP0A 4WMGA 4RLMA 4CHXA 2D4KA 4EOFA 2W1YA 3AGHA 2FBBA 5KXZA 3FI7A 4DDAA 2ZYCA 4H90A 2I26L 4GN5C 3TMXA 1GAZA 2FYDA 1HEMA 4BADA 4ETEA 4YEOA 5KXSA 3BKHA 4OWHA 4RDSA 5APEA 2YBLA 1GDWA 1GPQC 5HNCA 4OWCA 1GBZA 5C6JA 3TMUA 2HU1A 4TTDA 4ETAA 134LA 2D4JA 3LYMA 4TUNA 4BAFA 2WARA 4GLVA 5LVIA 3T6UA 3IWRA 5DM9A 4XJGA 1IR9A 3AW6A 5DLAA 4DD9A 1IP1A 3LYZA 1INUA 1TBYA 2HTXA 1CJ8A 4ZIXA 1LSZA 5F9XA 1B0DA 1NBZC 2A7DA 1LMNA 3AYQA 1AT6A 1LHIA 4H8YA 1WQQA 1B7PA 1IORA 2YBHA 1BGIA 3ATNA 4NWHA 4NY5A 1O23A 4RW2A 4ETBA 4YENA 1B5YA 4NGJA 3RT5X 2BQBA 3AW7A 4FDYA 1DI4A 1GBWA 1LKSA 1C08C 1G7MC 3B0IA 4HTNA 1IVMA 1VDPA 1LMPA 2Z2EA 3AZ5A 1GFVA 1ZMYL 1BB6A 1EQEA 2BQCA 3LYOA 4XADA 1HNLA 4B1AA 4B49A 1LJJA 3RZ4A 1JPOA 1NHEA 2PC2A 1GFEA 1BWIA 2BLYA 2EKSC 1LSMA 3HBEX 3ZVQA 3AZ6A 4NGLA 3WW6A 1AM7A 2YBMA 2FBDA 4DD1A 1OQMA 4LFXA 4TSCA 4II8A 2H9JA 1BVXA 1LZEA 4CGEA 1J1PY 5KXOA 1ALCA 1QSAA 4WM2A 2BQJA 5IDDA 1CJ6A 4NWEA 1IC5Y 1DKKA 1C7PA 5DL9A 1UBZA 1FLUA 1LJHA 5LVHA 1GFRA 1XGRC 1FLWA 4G4BA 2W1XA 133LA 5B1FA 1B7LA 1B5VA 2DQJY 5KXPA 3WL2A 4DC4A 4WM4A 3QE8A 1GB0A 4AGAA 3CT5A 2HUBA 1LSCA 3FE0A 3P65A 5E4PA 5A3EA 154LA 4PPOA 3G3BB 4HJZA 1CKDA 4ZEEA 2XBSA 1IWZA 3OK0A 5B05A 1OUHA 1EQ4A 2LZ2A 5FHWA 4W94A 2CGIA 1A2YC 1JTTL 1NKHA 4WM3A 3LN2A 1LZBA 1LJFA 1XEIA 4H9AA 1JJ1A 1XEJA 4LYMA 1REXA 1JKCA 2LHMA 3B0KA 4I0CA 1BVKC 5LVJA 1LYYA 1MLCE 1C46A 1G7HC 4KL7A 2NWDX 3HBHA 4YF2A 1GB6A 3CSRA 4J0LA 1GAYA 1LTMA 208LA 1LJKA 1TAYA 3WMKA 4WO9A 1I20A 1LHHA 1LMOA 3M18B 1LZ5A 5L9JA 3CSQA 4DDBA 1EQ5A 1OP9B 5FDJA 1REMA 2IHLA 4E3UA 2DQEY 3IJVA 1NDGC 1ZVYB 2XBRA 1CJ7A 3LHMA 4HV2A 5KXTA 1LSFA 1GF9A 1HEQA 1KXYA 4TSBA 1NBYC 9LYZA 1NDMC 1SQ2L 5I54A 1RI8B 2BPUA 4EMNA 5B1GA 4ET9A 1DPWA 1XSFA 1YROA 1VDQA 2YVBA 8LYZA 1GE1A 1LZ4A 1AKIA 1XGPC 2RSCA 1AZFA 2DQGY 4KXIA 2HEAA 5C6LA 2BQOA 1FLYA 4B0DA 1WTMA 1DQJC 3ZEKA 1GB2A 1IOTA 3N9AA 4H9CA 4ANRA 4DWXA 4C3WA 5LXWA 1HSWA 3HBDA 1UUZC 5E9RA 1JUGA 2BQIA 1JTOL 2CDSA 3EBAB 4RLNA 1LOZA 1DKJA 3WU8A 3A6CY 1BHZA 1IR7A 3TXDA 1LMQA 1QUTA 3A90A 5KKIA 2CJLA 2G4PA 1G7JC 1FKQA 1JKBA 4WM5A 1WQMA 5D5CA 5HMVA 4N0JA 2N5ZA 3TXEA 4NGIA 4XENA 1KXXA 2XTHA 1LZTA 1IOCA 3A6BY 1E8LA 1GB5A 2D91A 2HEFA 3MGWA 4N9RA 4W96A 4YM8A 3WU7A 1OUBA 4NGKA 3B0OA 5DN5A 3AZ4A 5LVKA 4PRQA 4YEMA 5FEKA 2Z37A 3M3UA 5II3A 1UACY 1D0MA 3CQLA 1HELA 4B4IA 2MEAA 4MSTA 1LMCA 2YBIA 3WXTA 1BB5A 4OWBA 1B7MA 4GCFA 1LZNA 3T36A 1NWGA 5LIOA 3AB6A 1HMLA 1OUIA 4FJRA 5APFA 3W3EA 1LJGA 2BQNA 1LSGA 1FN5A 1LJEA 5B59A 1GBXA 2DQDY 1EL1A 4J1BA 2C8OA 1GBYA 4HSFA 1IP5A 1REYA 4NSHA 1HEOA 5HNLA 2MEIA 1BWHA 1GB8A 5F9UA 4ET8A 1F6RA 1LMTA 1LZ6A 4H9FA 2BAAA 3WULA 4NHTA 4PGJB 4UWNA 3WU9A 5KJ9A 1DPXA 3W6FA 1UICA 4N5RA 2DQHY 3E3DA 5I5QA 1QQYA 2LYMA 2H5ZA 1LSEA 1UIHA 2Z38A 1A4VA 1OUAA 1YAMA 4Z41A 2MEDA 4QDNA 4CFPA 2LYZA 1LZ8A 4M4OA 1GFUA 1GF4A 3A92A 5J7CA 4HPEA 1VATA 1GFTA 194LA 2EIZC 207LA 5ILCA 1GF7A 1C43A 3TXGA 1LHLA 1OUFA 4NGWA 3IJUA 2ZIKA 1GBOA 3SP3A 4N1CC 5F81A 4XJIA 1B7SA 3A91A 1UC0A 4PHIA 5EBHA 1LZ1A 2B5ZA 4D9ZA 1B5XA 1LZYA 1HSXA 1GEVA 3J6KA 1JISA 1HENA 5LA5A 1OUGA 4IJ4A 4NEBA 4GCDA 1BQLY 1OUCA 3OJPA 2Y8PA 2ZNWY 2ZQ4A 3A8ZA 3WPJA 1GXV2 4NGYA 4J1AA 5B06A 4DDCA 6LYZA 1D6PA 4WL6A 1GB7A 1LHMA 1LYSA 1GF0A 2Z2FA 2ZWBA 3B72A 4NGOA 4N8ZA 2X0AA 4G9SA 4MCKA 5LA8A 132LA 4ETCA 1WTNA 3P68A 2DKVA 4UWVA 4IATA 4C5FA 4IASA 1TDYA 1IR8A 2FYCA 1UIDA 4HV1A 2D4IA 4OWEA 2Q0MX 1RJCB 3W6BA 1IP7A 1LZDA 4GN3A 2MEEA 1IP3A 1CKFA 2BLXA 1UIAA 1B7NA 1JHLA 1WVVA 3A95A 1LZCA 5HMJA 135LA 1IO5A 1CNSA 5I4YA 2F30A 2ZNXY 5K7OA 1XGUC 2YDGA 4QY9A 2HEDA 1GHLA 1LHKA 1QDRA 1ZVHL 3A3QA 1HEPA 3ZVQB 1DZBX 5LYZA 3P66A 4LYCA 1QDTA 5FCPA 1GXXA 1W6ZA 1JJ0A 1LYZA 1LCNA 1FBIX 2MEBA 2Z18A 4N1EI 1WQNA 4O34A 1KXWA 1GE3A 4Z3MA 5KXKA 1REZA 3WVXA 1V7TA 2EPEA 4LT3A 1CJ9A 4HTKA 1GB3A 2DQFC 4QEQA 2H9KA 1LZ9A 3TXHA 5T3FA 1RCMA 3HFMY 4NHSA 1B5WA 4TWSA 4WLTA 3TXIA 1J1OY 1GFKA 1ZV5L 1D9UA 5AMYA 1RFPA 1GF3A 1JKAA 2G4NA 1GE0A 4RW1A 3TMWA 1IEEA 5C6IA 1B9OA 4XJFA 1IY3A 1LPIA 1GFGA 5IHGA 4H8XA 4HTQA 3W6EA 3EMSA 5FSTA 3AZ7A 1VEDA 4PJ2C 2YSSC 1YL1X 4GCCA 1LSPA 4GCEA 3CB7A 1UA6Y 2A7FA 1DI5A 1WVUA 1B7RA 1HFYA 1RE2A 3A67Y 4DT3A 1XGQC 2G4QA 3LYTA 4KT3A 1WQPA 2BQEA 1BB7A 1LMAA 2XJWA 4H9BA 1VDSA 4HPIA 3WW5A 1GF6A 2ZYPA 4WG7A 4WLDA 5I4XA 3G3AB 1GD6A 1JITA 1IX0A 5FELA 1BWJA 4DD3A 1I1ZA 1LSBA 3W6DA 4ZFPA 1IWXA 3WPLA 1IWWA 1IP4A 1KIQC 2DQCY 3A93A 5D5FA 1YAPA 5B07A 3WYHA 4HJYA 2F2NA 1C10A 5KXWA 1GDXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QSQA 1JWRA 4LFPA 1L87A 4GCBA 4NSIA 2Z19A 1L24A 1GF5A 4OW1A 1LW9A 4H1PA 1B5ZA 141LA 4R6CA 3EO5A 1L77A 4NHIA 2VB1A 1LKRA 3RU5A 1QUSA 2F32A 3A3RX 1C6EA 1JIYA 1IWYA 1UIGA 1CU5A 3OE0A 3EXDA 1HERA 1H6MA 2ANXA 4M6DA 2W1MA 3QY4A 4W53A 1GFHA 5KY1A 1KS3A 1LYHA 5LZMA 1F0WA 1OUDA 2GV0A 1IWUA 1P2CC 3WUMA 4LYTA 5ILFA 1D3FA 3C81A 210LA 2MECA 4LYOA 1T97A 5LINA 1FLQA 5KKJA 4XJHA 4NGVA 4KPMA 2IGCA 3D4SA 1GE4A 1ZURA 153LA 1JSFA 1QTZA 1L09A 1YANA 4ETDA 4QGZA 5APDA 4DAJA 4MR1A 3ATOA 4W52A 1GB9A 2HU3A 251LA 2LYOA 3GUNA 2HEEA 3HT7A 2F4AA 2HECA 199LA 4GBRB 1L68A 1YAOA 1B7OA 4NSGA 2CWIA 4XYYA 4NSJA 1Z55A 5LYTA 1YL0X 1OUEA 1L03A 3GULA 5L3IA 192LA 1YQVY 3CT1A 1JTPL 1LZAA 4LYZA 1QT5A 4BS7A 4LT2A 1C45A 3A94A 4DD7A 3LZTA 4ARJA 3N9CA 1IC4Y 5F16A 4YOPA 1SSYA 3GUJA 4DD0A 3FA0A 4PRUA 4B4JA 7LYZA 2RBPA 4I8SA 1LJNA 1JJ3A 3TXJA 1L83A 2OE7X 4H8ZA 3W6CA 4EKQA 4RLMA 3AGHA 4DDAA 3TMXA 5KXSA 2YBLA 1GDWA 5HNCA 5C6JA 1QTDA 3DN1A 134LA 3LYMA 4TUNA 1L79A 4DKLA 1LSZA 1ZYTA 1LHIA 1IORA 1L57A 4RW2A 1O23A 1B5YA 4NGJA 2BQBA 1L76A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CKC A;  1JWR A;  1DI3 A;  1UIF A;  4LFP A;  4GCB A;  1LZR A;  3TXK A;  1T3P A;  4NSI A;  2MEG A;  4WOA A;  2Z19 A;  1CKH A;  1GF5 A;  2BQF A;  3BKV A;  3CSZ A;  4H94 A;  4Z46 A;  4OW1 A;  3WUA A;  5HLL A;  1IWT A;  1LJI A;  4H1P A;  1NF5 A;  3TXB A;  1HFZ A;  1B5Z A;  1V7S A;  1JSE A;  2ZIL A;  3K3T A;  1WQR A;  4R6C A;  5I53 A;  1HC0 A;  3QNG A;  1XGT C;  3EO5 A;  4GN4 A;  5L3H A;  4WG1 A;  4UWU A;  4H93 A;  4NHI A;  2BQG A;  1IY4 A;  2VB1 A;  1LJ4 A;  1GFA A;  1TEW A;  4OOT A;  3P4Z A;  1LSA A;  3WPK A;  1LKR A;  3RU5 A;  4WL7 A;  2BQD A;  3KAM A;  1QUS A;  3RNX A;  3A3R X;  1GEZ A;  3ULR A;  1JIY A;  1IWY A;  1UIG A;  3GXK A;  5IEL A;  4G4C A;  3EXD A;  2DQA A;  2DQI Y;  1NMM A;  3LZ2 A;  1HER A;  1IWV A;  4WM1 A;  4XN6 A;  1IOQ A;  5KXN A;  3TMV A;  1H6M A;  4DD2 A;  5KXX A;  1BB4 A;  2ZIJ A;  4H9H A;  4M6D A;  1LZG A;  1VAU A;  4LT0 A;  2W1M A;  1GF8 A;  2C8P A;  3B6L A;  1VDT A;  193L A;  1HMK A;  4WO6 A;  3QY4 A;  1GFJ A;  1GFH A;  5KY1 A;  3A96 A;  4LZT A;  5DN4 A;  1F0W A;  1OUD A; 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 135L A;  1IO5 A;  1CNS A;  5I4Y A;  2F30 A;  2ZNX Y;  5K7O A;  1XGU C;  2YDG A;  4QY9 A;  2HED A;  1GHL A;  1LHK A;  1QDR A;  1ZVH L;  3A3Q A;  1HEP A;  3ZVQ B;  1DZB X;  5LYZ A;  3P66 A;  4LYC A;  1QDT A;  5FCP A;  1GXX A;  1W6Z A;  1JJ0 A;  1LYZ A;  1LCN A;  1FBI X;  2MEB A;  2Z18 A;  4N1E I;  1WQN A;  4O34 A;  1KXW A;  1GE3 A;  4Z3M A;  5KXK A;  1REZ A;  3WVX A;  1V7T A;  2EPE A;  4LT3 A;  1CJ9 A;  4HTK A;  1GB3 A;  2DQF C;  4QEQ A;  2H9K A;  1LZ9 A;  3TXH A;  5T3F A;  1RCM A;  3HFM Y;  4NHS A;  1B5W A;  4TWS A;  4WLT A;  3TXI A;  1J1O Y;  1GFK A;  1ZV5 L;  1D9U A;  5AMY A;  1RFP A;  1GF3 A;  1JKA A;  2G4N A;  1GE0 A;  4RW1 A;  3TMW A;  1IEE A;  5C6I A;  1B9O A;  4XJF A;  1IY3 A;  1LPI A;  1GFG A;  5IHG A;  4H8X A;  4HTQ A;  3W6E A;  3EMS A;  5FST A;  3AZ7 A;  1VED A;  4PJ2 C;  2YSS C;  1YL1 X;  4GCC A;  1LSP A;  4GCE A;  3CB7 A;  1UA6 Y;  2A7F A;  1DI5 A;  1WVU A;  1B7R A;  1HFY A;  1RE2 A;  3A67 Y;  4DT3 A;  1XGQ C;  2G4Q A;  3LYT A;  4KT3 A;  1WQP A;  2BQE A;  1BB7 A;  1LMA A;  2XJW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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