1QTEA

Crystal structure of the 70 kda soluble lytic transglycosylase slt70 from escherichia coli at 1.90 a resolution in complex with a 1,6-anhydromurotripeptide
Total Genus 269
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
269
sequence length
618
structure length
618
Chain Sequence
DSLDEQRSRYAQIKQAWDNRQMDVVEQMMPGLKDYPLYPYLEYRQITDDLMNQPAVTVTNFVRANPTLPPARTLQSRFVNELARREDWRGLLAFSPEKPGTTEAQCNYYYAKWNTGQSEEAWQGAKELWLTGKSQPNACDKLFSVWRASGKQDPLAYLERIRLAMKAGNTGLVTVLAGQMPADYQTIASAIISLANNPNTVLTFARTTGATDFTRQMAAVAFASVARQDAENARLMIPSLAQAQQLNEDQIQELRDIVAWRLMGNDVTDEQAKWRDDAIMRSQSTSLIERRVRMALGTGDRRGLNTWLARLPMEAKEKDEWRYWQADLLLERGREAEAKEILHQLMQQRGFYPMVAAQRIGEEYELKIDKAPQNVDSALTQGPEMARVRELMYWNLDNTARSEWANLVKSKSKTEQAQLARYAFNNQWWDLSVQATIAGKLWDHLEERFPLAYNDLFKRYTSGKEIPQSYAMAIARQESAWNPKVKSPVGASGLMQIMPGTATHTVKMFSIPGYSSPGQLLDPETNINIGTSYLQYVYQQFGNNRIFSSAAYNAGPGRVRTWLGNSAGRIDAVAFVESIPFSETRGYVKNVLAYDAYYRYFMGDKPTLMSATEWGRRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High resolution crystal structures of the Escherichia coli lytic transglycosylase Slt70 and its complex with a peptidoglycan fragment.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE SLT70
total genus 269
structure length 618
sequence length 618
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
A PF14718 SLT_L Soluble lytic murein transglycosylase L domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qteA03
1.10.1240.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Methyltransferase, Methionine Synthase (B12-binding Domains); Chain A, domain 1 Lytic transglycosylase, superhelical linker domain 1qteA02
1.25.20.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe 70-kda Soluble Lytic Transglycosylase; domain 1 Bacterial muramidases 1qteA01
1CKDA 3WU7A 1NWGA 4NEBA 1HEQA 4OOOA 4M4OA 3QY4A 1WQOA 4GN4A 1D6PA 3WXTA 1GFGA 2HEAA 1NQIA 1HC0A 4H9HA 4NIJA 3TXIA 5LVHA 1CKHA 1LZ8A 2MEIA 1A2YC 1PZYA 4P2EA 1B7PA 2XTHA 1FLUA 1UCOA 1XGPC 1G7JC 2VB1A 4LYTA 5IELA 2DQIY 1YAPA 2BQIA 1GE4A 2BLXA 1B9OA 1LSNA 1NBZC 1PS5A 3WULA 1IWTA 5DL9A 4G4HA 4C5FA 1QQYA 2F2NA 2Z19A 5AMYA 4DD2A 1ALCA 1LSCA 1GFEA 1LYYA 2MEEA 3WPLA 5LXWA 1GBOA 3TXHA 1OUEA 5KXPA 1B7MA 4AGAA 1IOSA 1IR9A 1LZTA 2FYCA 1LCNA 4WLXA 4DD7A 3CQLA 1B7LA 1IWVA 1RCMA 2YBLA 4NGJA 3WUAA 3ZVQA 1B7NA 4ZFPA 1LYOA 2CGIA 2A7DA 5KXXA 4YOPA 1GBZA 3AZ7A 2YBMA 4NGOA 2YSSC 5KXNA 1G7LC 1LZRA 1GF0A 1KXWA 2BQFA 4LZTA 1XGTC 5DN5A 2HTXA 3AW7A 1CKGA 4RLNA 1I20A 3AGIA 4YEOA 1LJFA 1IP2A 5FSTA 2DQJY 1B5ZA 4H9IA 5C6IA 1FDLY 1GXXA 4DWXA 4H9BA 2YBNA 2HECA 2B5ZA 1F0WA 3W6FA 3QE8A 4DT3A 3EBAB 1GFJA 1EQEA 5A3EA 1CJ7A 4NGWA 1G7MC 2D4KA 4A7DA 4NGZA 4KPMA 5LYZA 3ZVQB 4EOFA 1GBYA 2ZNWY 1BB7A 2FBDA 3W6AA 4WG1A 1BWIA 1LHKA 4DC4A 2BPUA 2YBIA 4DDCA 1LZDA 5LVIA 5KXKA 2A7FA 1VEDA 4X3BA 2BQLA 4B4EA 193LA 1HSXA 1UA6Y 5I54A 3P4ZA 4WM2A 4II8A 1LKRA 2CJLA 1GB9A 1SQ2L 3LYZA 4EMNA 4ET8A 1OUDA 5LYTA 4J0LA 5E4PA 1BWJA 1FLQA 1HEPA 4I0CA 1IWWA 2Z2FA 3ZEKA 4PHIA 1LZYA 1B5XA 4YM8A 1QUTA 1YAQA 1HEWA 4C3WA 1IP6A 4WMGA 1UC0A 1LMQA 4WO6A 1OUBA 1JISA 1DKKA 1C10A 1LJEA 2F4GA 5LVJA 1LZ1A 1CJ9A 1F6RA 4Z41A 4HTQA 4YENA 1LSEA 1B5UA 3WYHA 4TWSA 2LZTA 3A3RX 5F16A 5II3A 2F4AA 4G4BA 3OK0A 1UIFA 1UIBA 5KJ9A 5I5QA 2MEFA 1NKHA 3A95A 5APEA 5DN4A 4B0DA 5B59A 5IHGA 4WL6A 5KXOA 208LA 4H90A 5LAGA 134LA 2DKVA 1TDYA 2DQEY 5KXYA 1LMPA 4NG1A 2C8OA 3HBDA 1GB3A 3TXEA 4TSBA 1UIAA 4RW1A 4WLDA 1GF3A 4E3UA 1LZNA 5L9JA 1LJGA 5KXTA 4H92A 5F14A 1DI5A 2IFFY 2MEDA 3A96A 4NSIA 2IHLA 1RJCB 3D9AC 5LIOA 4CJ2A 2CWIA 2LYOA 4HV2A 1F10A 4H9EA 1GF9A 5A3ZA 3A93A 9LYZA 4ETDA 1I1ZA 4PGJB 3RT5X 4HJYA 4NHTA 4QDNA 3N9AA 5DM9A 3BKVA 3HBHA 1G7IC 1UIHA 1GFHA 2AUBA 2FYDA 4FDYA 2HEDA 3TXFA 3WH1A 3WW6A 3BKHA 4HJZA 4H9CA 5ILFA 3RW8A 4N1CC 1CKFA 2BQCA 1IO5A 1RE2A 1JSEA 1HENA 1ZMYL 4FJRA 4LYOA 1LJ3A 1GBXA 1AM7A 7LYZA 1UIDA 1LOZA 4ETCA 3W6BA 1GBSA 3P65A 4LT0A 1LJIA 1C46A 2RSCA 4XJIA 4GCCA 3WMKA 1H87A 3ULRA 2MEGA 1JKDA 4PPOA 1KIRC 1UACY 3A8ZA 4GCDA 1IC5Y 4NG8A 5HMJA 1HFYA 4M6DA 1QUSA 1TEWA 1OUFA 3P68A 4PJ2C 2MEAA 3AZ6A 2BQMA 4HTNA 2HEEA 4R6CA 4W94A 1YAOA 1JIYA 1IWZA 5EBHA 1IVMA 1LMCA 4LFXA 1YKXX 1GPQC 5HMVA 3B0OA 3WU8A 1W08A 1GFKA 3M18B 4ZIXA 4LT1A 3KAMA 4DDBA 4WLYA 1YL0X 1W6ZA 2HEBA 1UBZA 4OWCA 1B7SA 1J1OY 2MEHA 5LAFA 3TMXA 4G9SA 1GF8A 4WM5A 4WM3A 4BAFA 3WVXA 1OUHA 4RLMA 3W6DA 4HPEA 4J7VA 3TMVA 1GFUA 133LA 1GFRA 2LZ2A 2GV0A 1OQMA 5D5FA 2D91A 1WQQA 1GB6A 4NWHA 5I4WA 3RZ4A 1LZEA 3WUNA 3VWOA 4GLVA 1LHHA 1DKJA 1D6QA 1DI3A 2ZYCA 3WL2A 2DQAA 3WW5A 1JWRA 2D4JA 1LZ6A 2BQEA 1VDTA 1J1XY 1KXXA 1LZGA 4N5RA 1VDQA 1LSBA 1IORA 1LMAA 1VFBC 1DQJC 1GHLA 1AT5A 1YL1X 2NWDX 2Z2EA 2ZWBA 4LT2A 1JHLA 1GB0A 1REMA 2Y8PA 1TAYA 3IWRA 2LYZA 1CJ8A 1N4FA 5C6JA 2CDSA 3T6UA 1HERA 1LTMA 3TMUA 1IC7Y 1CNSA 3WVYA 1UIEA 1LHMA 1CKCA 3CSZA 3A34A 1GDXA 2YDGA 1A4VA 3A91A 1LZBA 3G3BB 1D0LA 1BGIA 5F9XA 2XBSA 3CB7A 3J4GA 1GBWA 4XJBA 1E8LA 1YANA 4RDSA 4B4IA 1OUJA 5IDDA 2HUBA 5LA5A 4H1PA 1B5YA 3A6BY 2LYMA 1F6SA 2WARA 4UWNA 4J1BA 5APFA 1LSYA 3B6LA 3GXKA 1BWHA 2EPEA 1JTOL 2ZIJA 1GF4A 2ZIKA 3A92A 4Z98A 5HQ1A 3WU9A 1GE0A 1LJNA 5KXRA 154LA 2EIZC 3AGGG 4H8XA 4WM6A 3N9CA 4HP0A 3TXBA 3ATNA 4GLAA 4CFOA 5T3FA 1LSZA 1NHEA 1FBIX 4HTKA 4H8YA 4LYBA 3W6EA 1IC4Y 2I26L 4NFVA 1IWUA 1HNLA 1RFPA 1JKCA 1B5VA 1LHIA 4W96A 4H91A 4CGEA 2F30A 1JITA 1IP7A 1MLCE 3TXKA 1YIKA 2Q0MX 3IJUA 1C08C 1GFAA 1UUZC 2G4PA 3LYTA 2H9KA 132LA 8LYZA 4NHSA 1IR7A 4ETEA 5LYMA 1B7QA 1LZ9A 3A3QA 4NHQA 3K3TA 3LZTA 4LYCA 1GF7A 1D0MA 2I25L 5F9UA 1GDWA 1LSGA 4ET9A 1IWXA 3AGHA 4H8ZA 2ZQ3A 1QSAA 5FHWA 1LMTA 1IY4A 4IJ4A 1IP4A 5D5CA 4NSHA 1B7OA 5B05A 1HEMA 1OUCA 1T6VL 2N5ZA 4H93A 4ETBA 1FLWA 1REZA 5FDJA 6LYZA 5DLAA 5LVGA 194LA 3EXDA 4I8SA 1IP1A 4YF2A 4KL7A 1WVVA 3G3AB 1B0DA 4WG7A 1ZVYB 2W1XA 2Z39A 2EKSC 2XBRA 3B0KA 1GWDA 1WQMA 1IWYA 4XENA 3F6ZA 1LMNA 4BADA 5KXMA 3B0IA 1JKAA 4WLTA 1DPWA 3E3DA 1YROA 1AT6A 1JSFA 1INUA 4HV1A 1LSMA 1HMLA 3EMSA 4H94A 4OOTA 1WQRA 1NF5A 3WXUA 1IY3A 4NHPA 1P2CC 1EQ5A 1YAMA 1IR8A 4ZEEA 5KXWA 2DQFC 3LZ2A 4N1EI 1YKYX 1GFVA 1FKQA 1LMOA 1D0KA 1QDRA 1TBYA 3CT0A 3LYMA 1IX0A 2BQJA 1LHJA 4XADA 4DD1A 1HSWA 3OJPA 1LYZA 3AZ4A 1DXJA 1V7SA 1BB6A 1C7PA 1HMKA 2DQCY 4QEQA 5B1GA 2MEBA 1B7RA 4NGKA 1IOTA 1BVXA 1JEFA 1HHLA 1I56A 1SLYA 2BQAA 1BVKC 1IP5A 1HELA 153LA 3WPKA 3A67Y 4KXIA 1VDSA 5FEKA 1VAUA 1NMMA 4OWEA 5FELA 4YEMA 1LSPA 1ZV5L 1GEVA 1XGUC 1MELL 4LT3A 4OWBA 1WTMA 2XJWA 4XN6A 1GAYA 5HLLA 1LJ4A 4KT3A 4ANRA 1J1PY 2YBJA 1YILA 5K7OA 1VATA 4MR1A 3HFMY 1WQPA 4CFPA 4WM1A 1WVUA 3D3DA 3P64A 2DQHY 1JTTL 4R0FA 5HNCA 5I4YA 1VDPA 1GE3A 1XEJA 2BAAA 1LJKA 1GXV2 2W1YA 3AB6A 3LHMA 1DPXA 2BLYA 4NGYA 4NGLA 3GXRA 1JUGA 4BS7A 2H9JA 3IJVA 1HFZA 3LN2A 1LZ5A 3CSRA 4LYMA 4DD9A 4PRUA 1HF4A 4ML7A 3RU5A 3W6CA 2G4NA 4TTDA 4XJDA 4GN5C 1GB5A 4XJGA 6LYTA 1C45A 1OUGA 5I53A 2ZQ4A 5FCPA 2DQDY 1FKVA 1XGQC 1LSAA 4H9FA 4MCKA 3SP3A 3WUMA 1REXA 5M1YA 2X0AA 4XYYA 4TX7A 5J7CA 2ZYPA 3W3EA 1FLYA 1DZBX 2D6BA 2PC2A 4XJHA 4QY9A 5I4XA 1KIQC 1WQNA 2D4IA 1GB7A 3A90A 3CT1A 4NY5A 3WPJA 1OUAA 1IOCA 2Z12A 4B4JA 3A94A 1LHLA 4QGZA 5B06A 3AYQA 1B2KA 1T3PA 4GCFA 1QTEA 1LJHA 2BQGA 1BB4A 5F81A 4NGIA 4TUNA 1GFTA 1QDTA 4OWAA 5B07A 1LZSA 5KXZA 1AKIA 1G7HC 2HU3A 1XEKA 4IASA 5APCA 2ZNXY 3TMWA 1BB3A 1GAZA 4UWVA 1BQLY 1ZVHL 1BHZA 1OP9B 2FBBA 5KXSA 1QSWA 2LHMA 4WM4A 5LVKA 1HEOA 1LZ4A 1DI4A 3MGWA 4WL7A 1NDMC 1XGRC 2YBHA 3RNXA 2HU1A 4AXTA 1TCYA 2DBTA 3AW6A 3BJDA 4TSCA 4DYGA 207LA 4GCBA 1GD6A 1GF5A 4LYZA 2ZILA 3M3UA 1NDGC 1XEIA 2W1MA 2BQBA 5LINA 4MSTA 4WOAA 4G4CA 4U3XB 4DDAA 4DD0A 1GE2A 1FN5A 4IATA 1CJ6A 2DQGY 1LKSA 1XFPL 3EO5A 2BQOA 1RI8B 5LA8A 1GE1A 1LSDA 3A6CY 4GN3A 4NWEA 4N0JA 1B5WA 4G49A 2Z37A 3AJNA 3P66A 5L3HA 3B72A 135LA 4J1AA 5C6LA 2BQDA 1V7TA 2C8PA 1GB8A 2BQHA 2W1LA 4DD3A 1IOQA 1YQVY 4B1AA 4GCEA 2HEFA 1JJ1A 5APDA 5E9RA 1AZFA 5HNLA 4HJVA 2G4QA 1D9UA 4Z3MA 4HSFA 4RW2A 1QIOA 5KKJA 3CSQA 3LYOA 3FE0A 4XJFA 5B1FA 4D9ZA 2YVBA 4Z46A 1JJ3A 1REYA 4UWUA 1JJ0A 3TXGA 4LFPA 4WO9A 4NSJA 3TXJA 1XSFA 4PRQA 4N8ZA 1LPIA 5KKIA 3AZ5A 1LSFA 1JPOA 4ETAA 5KXLA 3HBEX 5ILCA 3TXDA 1KXYA 5L3IA 3ATOA 1EQ4A 4B49A 1QTKA 2BQKA 3QNGA 1Z55A 1YKZX 1EL1A 4O34A 4OWHA 5JENB 4H9AA 4N9RA 2MECA 2H5ZA 4BAPA 4CHXA 1UICA 1LJJA 1C43A 1LAAA 3CT5A 1IP3A 1IEEA 1LZAA 3T36A 2EQLA 2I6ZA 3N9EA 4NGVA 1O23A 4LGKA 2Z38A 1OUIA 1LYSA 3J6KA 4NHIA 3FI7A 1IIZA 1GEZA 1JKBA 1BB5A 1GF6A 1GB2A 1HFXA 1H6MA 2BQNA 4OW1A 5KY1A 1WTNA 1UIGA 1LZCA 4HPIA 1NBYC 2Z18A 4NSGA 1KIPC 4L41A 1JTPL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
138LA 1L64A 4OOOA 1L06A 1CV1A 4H9HA 1CKHA 1B7PA 2XTHA 219LA 5IELA 2DQIY 1L95A 2BQIA 1PS5A 1LGXA 1ZURA 229LA 4C5FA 2OE9X 2F2NA 5AMYA 175LA 1D2WA 1LSCA 1LYYA 2Q9DA 3WPLA 1GBOA 1B7MA 1IOSA 130LA 1I6SA 1G0LA 3CQLA 1B7LA 1C68A 232LA 231LA 4EKRA 1B7NA 1LYOA 4YOPA 3AZ7A 1QTBA 3FA0A 167LA 1LI3A 3AGIA 149LA 1LJFA 1OWZA 1QT8A 1GXXA 4DWXA 2B5ZA 1L88A 1F0WA 3W6FA 4DT3A 3EBAB 1EQEA 1L53A 4NGZA 1C61A 1BWIA 1LHKA 1L89A 1L84A 5KXKA 1LWGA 1L36A 4X3BA 1C62A 4B4EA 3DMZA 1UA6Y 1LKRA 186LA 127LA 1SQ2L 4EMNA 5LYTA 4ZPUA 1BWJA 1IWWA 227LA 4WO6A 1UC0A 1PQJA 1JISA 1L47A 5LVJA 1CJ9A 1B5UA 2LZTA 221LA 5F16A 4G4BA 2B6XA 109LA 1OV5A 2B73A 5B59A 1P37A 214LA 4H90A 1P2LA 3FADA 2ANXA 1C66A 3HBDA 209LA 205LA 4TSBA 4WLDA 1LZNA 1L0JA 2OTYX 4JGIA 5KXTA 4H92A 5F14A 2IFFY 3EZXA 2IHLA 1RJCB 5LIOA 4CJ2A 2CWIA 3HH4A 139LA 1F10A 1GF9A 4H9EA 3A93A 4ETDA 1I1ZA 3OE9A 128LA 4NHTA 4QDNA 1G7IC 1OYUA 1CU3A 2FYDA 2HEDA 3WH1A 3RW8A 2BQCA 1IO5A 4FJRA 1JSEA 1C6DA 1UIDA 1LW9A 1L56A 4I7TA 2RSCA 4XJIA 3WMKA 1H87A 3ULRA 1C6EA 1JKDA 4PK0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CKD A;  3WU7 A;  1NWG A;  4NEB A;  1HEQ A;  4OOO A;  4M4O A;  3QY4 A;  1WQO A;  4GN4 A;  1D6P A;  3WXT A;  1GFG A;  2HEA A;  1NQI A;  1HC0 A;  4H9H A;  4NIJ A;  3TXI A;  5LVH A;  1CKH A;  1LZ8 A;  2MEI A;  1A2Y C;  1PZY A;  4P2E A;  1B7P A;  2XTH A;  1FLU A;  1UCO A;  1XGP C;  1G7J C;  2VB1 A;  4LYT A;  5IEL A;  2DQI Y;  1YAP A;  2BQI A;  1GE4 A;  2BLX A;  1B9O A;  1LSN A;  1NBZ C;  1PS5 A;  3WUL A;  1IWT A;  5DL9 A;  4G4H A;  4C5F A;  1QQY A;  2F2N A;  2Z19 A;  5AMY A;  4DD2 A;  1ALC A;  1LSC A;  1GFE A;  1LYY A;  2MEE A;  3WPL A;  5LXW A;  1GBO A;  3TXH A;  1OUE A;  5KXP A;  1B7M A;  4AGA A;  1IOS A;  1IR9 A;  1LZT A;  2FYC A;  1LCN A;  4WLX A;  4DD7 A;  3CQL A;  1B7L A;  1IWV A;  1RCM A;  2YBL A;  4NGJ A;  3WUA A;  3ZVQ A;  1B7N A;  4ZFP A;  1LYO A;  2CGI A;  2A7D A;  5KXX A;  4YOP A;  1GBZ A;  3AZ7 A;  2YBM A;  4NGO A;  2YSS C;  5KXN A;  1G7L C;  1LZR A;  1GF0 A;  1KXW A;  2BQF A;  4LZT A;  1XGT C;  5DN5 A;  2HTX A;  3AW7 A;  1CKG A;  4RLN A;  1I20 A;  3AGI A;  4YEO A;  1LJF A;  1IP2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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