4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
1DP9A 4I39A 4P8OA 2V1AA 1WA9A 1YETA 4WF0A 4JAVA 1JM6A 5IN9A 3MQOA 1NWZA 4V25A 1UY8A 3PYPA 2H8MA 2QF6A 4BIUA 3TTZA 3UE6A 2PYRA 1OJ5A 3OWBA 1V9ZA 1Y28A 2YE6A 3HJKA 2BU2A 2VV8A 3ULFA 3BMYA 4LWEA 3OW6A 2Q8IA 5M4PA 4I5SA 4B7PA 5HWVA 2YGFA 1B62A 2Q2EB 3C0EA 4WLAA 4JGQA 3NOPC 3RH8B 5HWTA 3T0ZA 4YWZA 4I3JA 3HYYA 5D7DA 1YERA 2HG1A 4LWGA 2XDUA 1NHHA 2CGFA 2VEAA 5J3WA 1OT9A 4EESA 2YI6A 4V26A 3F1PA 4CWNA 4CE2A 2W27A 2XDKA 3O0IA 4GS9A 3A0YA 5IDJA 5DKKA 4O04A 5M4EA 1Y4SA 2BYIA 2YE9A 3B33A 1X0OA 3LUQA 4NXGA 5D7CA 4H7QA 4URLA 3UB9A 5HDDA 1Z5CA 2WI7A 1US7A 4XE2A 1MX0A 5M4KA 2WI5A 3B26A 4KUOA 2D01A 5F68A 1GSWA 3A0WA 1YSRA 3O2FA 2YI0A 4MN6A 1EW0A 4LRXC 4YKWA 4QPJA 2Q8GA 3D2RA 3OLOA 1UY7A 3R91A 1TS6A 4AWPA 3UMDA 1N9LA 2EA9A 2WI2A 4NH9A 4E02A 5HWWA 1UWNX 3KX0X 4EETB 4EMVA 2QWSA 1UYLA 4LWFA 1LSVA 4PKYA 4L9EA 3UB8A 4MPEA 2ZOIA 2WKRA 4XITA 3K3CA 3GIGB 4PL9A 1YC4A 4CWSA 2YKHA 1XFNA 1UYGA 4MP2A 2V1BA 1ODVA 1QY8A 2XCMA 1I5DA 3RLPA 3OWDA 4KP4A 2YE4A 4HYMA 2YEJA 3CAXA 2H55A 1XFQA 3VHAA 4GGLA 2JHEA 2OWHA 3LIEA 1S1ZA 1V9YA 1BXDA 2XX2A 3BWLA 2YEHA 2YKJA 2V9AA 4EFTA 4LWHA 2YJWA 1T1CA 4JAUA 5DJTA 4O09A 4XKAA 4R38A 1ZXNA 2YKEA 1Z59A 2FXSA 2YGEA 3GIFA 2ZDYA 4GHIA 4DZYA 5F5RA 2BU5A 2XX5A 4XD8A 2CCSA 1TIDA 4XKOA 1AH8A 3RTYA 1UY9A 4ASFA 2WI1A 1BYQA 5IDMA 4H6JB 4L9GA 4BBUA 1OT6A 3HJIA 1ID0A 1QYEA 5BOCA 4ZVIA 3H80A 3PEJA 5M4NA 2CH4A 4RQ9A 3MJQA 4MBCA 1UYMA 3G7EA 1NHIA 1F98A 5L3JA 4MN5A 2IWXA 1R62A 1Y8OA 2IOQA 3EHGA 1JNUA 4EQ1A 3EKRA 1S4SA 2M1CA 2WI3A 2WI4A 2ZKJA 2YI7A 1AMWA 1YC3A 3EHFA 4L8ZA 1EI1A 3Q5LA 3C2WA 2P7JA 4CE3A 2BU7A 4LP0A 4YKTA 4ZKIA 1YSZA 4BIZA 3FC7A 4XIQA 2PYPA 1QZRA 1P97A 3LIFA 5FNFA 3PHYA 3R4MA 4ASBA 5BODA 4WUDA 4ASGA 1DP8A 1KIJA 2VCJA 2YKIA 4WUJA 2CG9A 2QG0A 4P7AA 3NOTC 3EHJA 4PU9A 3WHAA 3VHCA 4HJ4A 2BTZA 4HHDA 4MPNA 1U0ZA 2CCTA 4NXFA 1EA6A 1LSXA 4CWFA 2ZOHA 2GQPA 3FT5A 2PR6A 3CWVA 1S67L 3GDIA 4EW7A 3PEHA 2W0NA 5CF0A 2BT0A 4HXZA 3UB6A 2GFDA 2IWSA 2BRCA 4GFNA 2HCHA 2YE2A 3D0BA 1TBWA 1OTDA 2K5BA 2XJXA 4HI4A 3C8CA 5CTWA 1S1YA 3VOLA 1THNA 3K60A 3CGZA 4XKKA 3BY9A 1MU5A 2YK2A 4BQGA 1I5CA 3E4PA 4NH7A 3U67A 2L1MA 2VV7A 4HIAA 3B28A 2VCIA 1F9IA 3A0ZA 4EGKA 3D36A 3NMQA 4W7TA 2Z6DA 2EXLA 4HP9A 3UMEA 2E0AA 5J71A 2QKPA 1T1BA 1I5BA 2WERA 2V0WA 1OSFA 1G28A 5A8BA 4KQDA 2YKCA 3B24A 2XJGA 1VB6A 3GIGA 4I3AA 1YS3A 1U2OA 3IEDA 2D02A 2CMNA 2L4RA 4QPKA 4XC0A 4I3HA 4BXIA 1TILA 3F1OB 4AWQA 2A24B 3LICA 5KIZA 5G4YA 1GJVA 2HKJA 4XIPA 3HHUA 3CRLA 1OJGA 4JGPA 1N9OA 2YEAA 4GQTA 3MR0A 3LYXA 4EFUA 3CWFA 2YEEA 4JQLA 5J6AA 4WUBA 1S66L 4XT2A 3IBRA 1T1AA 4EEPA 2PD7A 1AH6A 3G6OA 4LPZA 3TZ5A 2XHXA 4WN5A 1LSWA 1OTAA 1MZUA 2PHYA 2HV1A 4U7OA 3T1KA 4O05A 3OPDA 5D7RA 4HXWA 3LNUA 1T19A 1Y4UA 1Z5AA 1XJ4A 5J4EA 2XK2A 3VE4A 4L94A 4H6JA 2QJ5A 3E4QA 3MXQA 2UWDA 2L0WA 3A0SA 1UYCA 5AVEA 2XX4A 5IU1A 2YEFA 3K99A 4MP7A 3P7NA 5AVFA 2YEGA 2QFOA 1GSVA 2BSMA 1DRMA 1Y8PA 4XCJA 1I58A 1LL8A 3A0XA 5M4MA 3A0RA 2YK9A 4HY6A 2YGAA 3T50A 2YE5A 3ZKBA 1NHJA 2BASA 5C93A 4HH3A 4XDMA 4GCZA 3LIBA 1TS0A 1L0OA 2XDSA 2JN7A 4YKZA 4DJ3A 2YE8A 3ZKDA 4I38A 3MQQA 2PR5A 4KSHA 3JZ3A 2VV6A 3HZ1A 5GGZA 4CWPA 3RKZA 4HY8A 3H7WB 3MNRP 4EERA 3UB7A 3QTFA 4LWIA 4GT8A 2H28A 1YT0A 1OTBA 3OMUA 4HQAA 3VE3A 3F1NB 4H81A 4PKYG 3TZ2A 3TUHA 1YT1A 4FCQA 3K97A 1YESA 4AS9A 2VWCA 2YEBA 1DP6A 2Q8FA 5TBMB 4JGOA 4XTJA 2Q8HA 4U7NA 4EXOA 2IOPA 4HOIA 2K7SA 1D06A 4F3LB 1T18A 5CTUA 3H9WA 3R92A 5HZHA 2YEDA 3H82B 3FV5A 1UGUA 2PNRA 4URMA 1XJ3A 3NJAA 1BYWA 4KTNA 3C11A 4H85A 3LI8A 4R6LA 2FWZA 4BQJA 1KOUA 3T10A 3GECA 2BU6A 2ESAA 2IWUA 5FNDA 4M4XA 3KE6A 4K4OA 1GSXA 4PRXA 1UY6A 4WUCA 4GHIB 2INWA 1B63A 1XJ6A 4EEUA 1PVGA 3H4LA 3A0VA 1OTEA 3R4PA 1UYEA 3DGEA 1I5AA 5J7EA 3BM9A 3T2SA 3F1OA 4KSGA 4HY1A 3G7BA 3INWA 5F6AA 4CWRA 1UYKA 1UYIA 1S16A 1H7SA 3Q5JA 3VHDA 1LT0A 2I9VA 2R78A 4YKUA 1ZWHA 2WI6A 2YE7A 1TS8A 2YI5A 3CRKA 5FNCA 2XDLA 3MFXA 3Q5KA 4FCRA 1ZW9A 1TS7A 4HZ5A 2WKPA 3IS2B 2ZBBA 1Z5BA 3K3DA 3ZXQA 4R3AA 2VLGA 1A4HA 2PD8A 2ZDXA 3HZ5A 3R4NA 4EGIA 3EKOA 5HD5A 3O6OA 4KFGA 4CE1A 4CWOA 4HJ6A 4EGHA 4GEEA 1H7UA 3EEHA 3T0HA 3FT8A 4EEHA 4EM7A 1BGQA 3SW1A 4HP4A 2KX6A 1OTIA 3U2DA 2O1VA 4DJ2A 2BU8A 2VW5A 3HEKA 3K98A 3U2KA 4L9FA 4L91A 1N9NA 4NXBA 4R1FA 5F5YA 4GW9A 4I3IA 4LLOB 4MPCA 2YEIA 3NOUC 4CWTA 4PRVA 1AM1A 2XHRA 5HD3A 3INXA 4BBVA 3ICYA 2BREA 3LIDA 5FWKA 4JASA 4BBTA 1S14A 4O07A 4U93A 2YECA 4KUKA 3RLQA 4FCPA 4NH8A 2CCUA 5DKLA 4LPBA 4Q20A 4X9LA 1UWPX 2JJCA 2JKIA 5D6QA 2IORA 3H7WA 1UYDA 2V0UA 4K08A 4L93A 3SL2A 3WQ9A 1AJ6A 3D72A 1P0ZA 3F1PB 3A0TA 2YJXA 4O0BA 4CWQA 3F1NA 3CLOA 3CGYA 4GS9B 4HZ0A 1TC0A 3B27A 2O1WA 4WL9A 4YKRA 3ZXOA 4AWOA 4DUHA 2B02A 5TBMA 3LPSA 1TC6A 2WKQA 3B25A 3ZQ5A 4BAEA 4MB9A 5I5LA 3TZ4A 4F3LA 4XCLA 3H82A 4YKXA 1I59A 5IS1A 3ZM7A 4B9OA 1BKNA 4E01A 1B3QA 5HSQA 2XHTA 1KZNA 2OOLA 3BY8A 4HNBA 4E00A 2XABA 4B6CA 4YKYA 1TH8A 5CPHA 4URNA 4XT2B 4HYPA 4MOTA 2GJ3A 2OWJA 4UROA 3EHHA 3E4OA 4FPPA 1GKZA 2BYHA 1Y8NA 2QG2A 4R70A 5HDSA 4LRYC 2AKPA 4LRZE 1ZXMA 1GKXA 2XJJA 4E04A 5F3KA 2WEPA 1UYHA 1S4RA 4YKQA 2J80A 3G75A 2Z6CA 2BZ5A 4KQVA 4L90A 3LI9A 4XIRA 4NXEA 5M4HA 4R3MA 2PDRA 3VADA 4HH2A 3R4OA 3RLRA 2QHKA 3FG8A 4JGRA 3HYZA 5CTYA 5CTXA 5DJUA 2O1UA 3EWKA 2QJ7A 1XJ2A 3LIAA 5D6PA 2ZBKB 3IS2A 2WEQA 5HDCA 4HJ3A 3NHQA 2YKFA 5G4ZA 3GIEA 1YT2A 4ASAA 2FYPA 4FMTA 2KDKA 2YKBA 3TZ0A 2YE3A 3QDDA 5EFWA 1YC1A 2A24A 2XDXA 1D7EA 2C2AA 2FWYA 1UYFA 5F69A 2XD6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4G3KA 1W63M 1MY8A 5FQ9A 3MBZA 4P8OA 1YLJA 1TD5A 4PM9A 2XSSA 2H0YA 2QF6A 3TTZA 4N1HA 1Q2PA 4GJ4A 2BU2A 2Q8IA 1SKFA 4B7PA 4ID4A 3N6IA 2WKEA 3CITA 1CEFA 1YMXA 4WLAA 3CPTB 3HYYA 5D7DA 4KG6A 5CECA 4OQIA 4EESA 2YI6A 4V26A 3F1PA 4IJGA 4CE2A 5HX9A 3A0YA 1FCMA 1PRQA 1Y4SA 2YE9A 3B33A 5D7CA 4URLA 1Z5CA 4Y5FA 1US7A 4C75A 2WI5A 3B26A 2D01A 3T4JA 1GSWA 5L8MA 1K54C 4QPJA 1YT4A 5CGWA 3D2RA 3VFHA 4Y15A 3UMDA 3NC8A 3KSIA 5HWWA 4Y17A 3LY4A 4WYYA 2XFSA 3HBRA 5E2HA 4WMCD 4AFIA 2WKRA 4XITA 4PL9A 3IWOA 1YC4A 4CWSA 5CX7A 2V1BA 1I5DA 4Y0TA 2Y4AA 2X01A 2YE4A 1QMFA 5AQBA 1XFQA 2OWHA 1V9YA 5CEDA 2Y79A 4YFMA 2PBYA 1BXDA 2XX2A 3MSHA 2YKJA 2YJWA 1T1CA 4EUVA 1SDEA 5DJTA 1XKZA 4O09A 4LV1A 2Y2QA 4XKAA 5FI2A 4ME4A 2BLSA 3OPLA 2XX5A 1LI0A 4GD8A 4MBHA 2V1ZA 1NYYA 2WI1A 1BULA 4ZRRA 2Z2MB 5IDMA 1KVLA 3IX3A 1OT6A 3HJIA 1QYEA 2JE5A 4ZVIA 5M4NA 1OPXA 5AQ7A 4MBCA 1H8YA 1F98A 5L3JA 2KOIA 2IWXA 3KSFA 4IUKA 1Y8OA 3EHGA 4EQ1A 3EKRA 2O99A 2WI3A 2ZKJA 4Y7PA 4L8ZA 1ZG6A 2ACGA 4JPMA 3Q5LA 4YKTA 2IWBA 4BIZA 3M6BA 1J3WA 1QZRA 3BECA 3LIFA 3PHYA 5BODA 5TJJA 1ES5A 1KIJA 3ZG9B 2VCJA 3S7PA 4B88A 5HW3A 1W7FA 3WHAA 3VHCA 4HJ4A 4HHDA 1EA6A 4CWFA 3ZVWA 4HEFA 3FT5A 5DF8A 1G6AA 2HPBA 4ZAMA 3MKEA 5TGFA 2A49A 4GFNA 3SH8A 2YE2A 1TBWA 1XPBA 3C8CA 1ZC2A 3VOYA 3BW6A 3TE8A 2VV7A 4EGKA 3C7UA 5FAOA 4HP9A 4GB7A 3G32A 1I5BA 2V0WA 4ARZA 1OSFA 1BT5A 3VOZA 4NETA 1VB6A 4RYEA 4S2JA 3S5TA 2B18A 4I3AA 1U2OA 2Y2GA 2GZAA 3ISGA 4XC0A 1Y4OA 1EI5A 4AWQA 3IQAA 3LICA 4MBKA 2OV5A 1PZOA 1N9OA 4PHTA 3MR0A 3LYXA 4EFUA 2YEEA 3HLEA 1L0EA 3C7VA 2WGWA 4XT2A 3HLDA 3C4OA 4KZ4A 2EX9A 3IHBA 1LSWA 2HV1A 4U7OA 3HLGA 4EQIA 3T1KA 2XA7S 2K31A 5D7RA 2HJ9C 3WS4A 1XJ4A 5J4EA 5CEBA 4N92A 1HZOA 4H6JA 1JWPA 1PW8A 1JTDA 5KSCA 3BQAA 1UYCA 4MP7A 3P7NA 3Q1FA 4GDNA 5FQKA 2DNSA 1GSVA 4XCJA 3A0XA 1DY6A 2YK9A 3BFDA 2H5SA 3T50A 4ZBEA 2YGAA 2Y2OA 1NHJA 2BASA 4Q0HA 4ESPA 5C93A 3ZNYA 4GCZA 4XDMA 3LIBA 2LB5A 1TS0A 1L0OA 1NJ4A 1WYCA 4YKZA 4DJ3A 4I38A 3UB5P 2PR5A 3R7WB 2XROA 5L07A 4EERA 1H8MA 3QTFA 2CC1A 4LWIA 4GT8A 1YT0A 1OTBA 3OMUA 3VE3A 4H81A 1MKMA 2LB9A 2R9WA 1YT1A 4FCQA 2YEBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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