4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
3MXQA 3ZXQA 2Q8HA 2A24A 3BM9A 1OJ5A 1GSWA 2WI2A 4EETB 2YE5A 3RTYA 4MPCA 4GHIB 3A0TA 2ESAA 3KE6A 5F3KA 3HEKA 2EA9A 2I9VA 1XJ3A 3ZM7A 1OTIA 3VE3A 3RLRA 3RLQA 2R78A 4XITA 3ZKDA 5DJUA 2O1UA 4KSHA 2WEQA 4EFUA 4HJ3A 3C2WA 3NOPC 2D01A 1US7A 3C0EA 4I3HA 4CE1A 2YECA 4P7AA 3FC7A 1UYIA 3INXA 4O07A 4BIUA 1YSZA 3HZ5A 1S66L 2V0WA 3TZ2A 4URMA 2BU8A 1DP6A 3A0YA 2W0NA 4HI4A 5M4KA 5G4YA 5M4MA 5TBMB 4R6LA 3WHAA 3ZXOA 1TBWA 4JGQA 2QFOA 5L3JA 3B26A 2YE7A 4CWRA 2WERA 3B27A 4H7QA 1N9NA 4LP0A 3B24A 2VV8A 5CPHA 2K5BA 3EWKA 3TZ4A 3LIFA 1AH8A 4U7OA 3ULFA 3GIGB 1OTEA 3Q5JA 3OPDA 4HY8A 1ZWHA 1BKNA 3EHFA 3R4PA 1KZNA 1UYHA 5AVFA 1TIDA 1H7UA 2B02A 3G75A 1LSXA 1DP9A 2XX5A 1TS6A 4PKYG 2WI3A 1LL8A 4I38A 4BBVA 4H81A 3CRKA 4LWGA 1Y8OA 4L93A 1UYMA 3OW6A 1T18A 1UYKA 3PHYA 5M4PA 1MU5A 4CWPA 3CWVA 1TILA 1S16A 1S4SA 4YWZA 4NXBA 4BBUA 2BU7A 3PEJA 3NOUC 4YKYA 1OT9A 3UMDA 1OT6A 1R62A 3QDDA 4WUBA 4EMVA 1Z5BA 4E00A 2E0AA 4JAUA 3T0ZA 4ASAA 2CMNA 1V9ZA 1KOUA 3MJQA 4KP4A 2JN7A 1UY8A 2IOQA 1BYQA 1S67L 2YGEA 3MR0A 1QZRA 5A8BA 4BXIA 3MQQA 2YI7A 1TS7A 5IDMA 5CTWA 3T10A 3LYXA 2WI1A 4CWNA 4NH8A 3ZQ5A 1YETA 1EA6A 5DKKA 4O0BA 4AWPA 5G4ZA 4EFTA 4XT2A 1NHHA 1XJ2A 2WKPA 4KQDA 4L90A 5FNCA 3T1KA 4UROA 3CGYA 4PL9A 2YI6A 4E02A 3UE6A 2XHRA 4EEUA 3HJKA 3UB8A 3K99A 2A24B 4NXGA 2GFDA 4YKRA 4LLOB 5D7DA 2BREA 2XHXA 4CWQA 4EEPA 1OTDA 2YE9A 2W27A 4WUJA 2XDXA 2YGAA 5M4NA 3CRLA 4QPJA 2OWJA 4MPNA 2Q8IA 1GJVA 4AWOA 3QTFA 4E01A 1ODVA 2O1WA 1TS8A 5M4HA 2ZDXA 1OTBA 5AVEA 2XK2A 3PEHA 1UY7A 2H8MA 2H55A 4MP7A 4WF0A 2EXLA 3K3CA 5J4EA 3H9WA 1AJ6A 4HOIA 3O2FA 4O09A 2AKPA 2YK2A 4HJ6A 3K98A 1Y4SA 3LI8A 2V0UA 2Q8FA 2BU2A 5CTYA 2H28A 1QY8A 3KX0X 3UMEA 3R4MA 4ASBA 3D36A 2CGFA 3C8CA 2XABA 4ASGA 4CWFA 2QJ5A 3BWLA 5D7RA 2WI7A 4L8ZA 2ZDYA 3GDIA 4GFNA 2WI4A 4P8OA 4HH2A 2QG2A 4I5SA 4CE3A 4L9GA 3A0ZA 1P97A 4JQLA 3CLOA 1I5AA 4XE2A 4ASFA 2XD6A 3G7BA 4LWIA 2JKIA 1N9OA 4HP4A 2QG0A 2Q2EB 1S1ZA 3Q5LA 3P7NA 1XFQA 3UB6A 5HSQA 1I5CA 3K97A 3E4QA 3R4OA 4BIZA 1JNUA 4XC0A 3SW1A 5J71A 3HYYA 4X9LA 4B6CA 2YKHA 2KDKA 1S4RA 3FV5A 4HP9A 2YKIA 4NH7A 4YKTA 3LICA 4FPPA 5IDJA 1UY9A 3Q5KA 3H82A 3K3DA 3RKZA 2PNRA 1B62A 4HY6A 3U2DA 3B25A 1YESA 2YEHA 5HWWA 5D6QA 4JAVA 4XKKA 1QYEA 4HJ4A 4F3LA 3ZKBA 4EEHA 4EM7A 4GS9A 5IN9A 4HYMA 5IS1A 3TZ0A 1N9LA 4XT2B 2XDLA 4XIPA 2INWA 5BOCA 2YI0A 3HHUA 4MBCA 4DJ2A 1VB6A 2XDUA 2IWUA 2YJXA 2BU5A 5FNDA 4FCRA 2XJGA 2VCIA 3OMUA 4BQGA 2IWSA 3FT5A 2O1VA 2XX2A 4EERA 4MB9A 4HQAA 4GW9A 3K60A 1YT2A 1T1BA 1TC6A 4MP2A 4JGRA 4RQ9A 4BQJA 3CWFA 4DZYA 4KTNA 1S1YA 2WEPA 2QHKA 5IU1A 2BSMA 4WLAA 3MNRP 1ZW9A 4R1FA 3VHCA 1Y8PA 1LSVA 3A0VA 2FYPA 2YEGA 3O6OA 4EGKA 2ZOIA 2GQPA 1YERA 3H7WB 1GKXA 2K7SA 3VOLA 4HZ5A 4O04A 4AWQA 4WN5A 2UWDA 4M4XA 2Z6CA 3GIEA 4EQ1A 1BGQA 2GJ3A 2QJ7A 3MQOA 2ZBBA 4XCLA 5CF0A 3FG8A 3CAXA 3NMQA 1T1CA 1LT0A 1Z59A 5BODA 3UB7A 3T50A 3IBRA 4NXEA 4FCQA 4I3JA 3EHHA 4WUCA 3D2RA 2YK9A 2OWHA 4WUDA 3SL2A 2BZ5A 4ZKIA 2M1CA 4MN6A 3G7EA 4H6JA 4NH9A 4DJ3A 4URLA 4FCPA 3B33A 5DJTA 2YKCA 5FNFA 1TC0A 2YE6A 4U7NA 4KSGA 5F69A 1YT1A 1U0ZA 4XD8A 4YKXA 2D02A 1TS0A 2XJJA 4YKUA 3CGZA 1I58A 3E4PA 3LIAA 2YE3A 3GIGA 4FMTA 3NJAA 1GSVA 4I3IA 5J7EA 4K4OA 2QKPA 4R3MA 4CE2A 2HV1A 4L94A 1DRMA 4R70A 3UB9A 1UWPX 4R3AA 3INWA 1BXDA 4XDMA 4MN5A 5HD3A 4PU9A 2CG9A 2PDRA 4V26A 4LWHA 4QPKA 2WKRA 2PHYA 4LPZA 4HXWA 4YKZA 1AMWA 2QF6A 3WQ9A 2KX6A 2JHEA 2PR6A 3H82B 1OJGA 1U2OA 4GQTA 4HIAA 1THNA 3C11A 1TH8A 1JM6A 4F3LB 4CWTA 3BY9A 2VW5A 1Z5CA 3LIBA 2XDKA 5CTUA 4R38A 2IWXA 4HXZA 2PD7A 3OLOA 2YKBA 4L9EA 1AM1A 4CWOA 2BYHA 2C2AA 1BYWA 2BRCA 1L0OA 2XDSA 5HDSA 1UYLA 3A0XA 1YS3A 1P0ZA 4Q20A 2XJXA 5F5YA 3GECA 2HCHA 1I5BA 3RLPA 1AH6A 2CCTA 2YKJA 3EKRA 4LPBA 2FXSA 4GEEA 3EKOA 4E04A 4KUKA 1ZXMA 4DUHA 1KIJA 3OWBA 2V9AA 4W7TA 2IOPA 3F1OA 4LWFA 4K08A 2VV7A 3F1PA 3TTZA 4JGPA 4EGHA 4BBTA 5DKLA 1Y4UA 4EXOA 4KUOA 4XTJA 3TZ5A 3R4NA 2OOLA 2BT0A 4CWSA 3R92A 2HKJA 1D7EA 1X0OA 2Q8GA 5GGZA 5HDCA 1I59A 2L1MA 1YSRA 1EI1A 2YGFA 2BU6A 4HHDA 4JGOA 5HWTA 3A0WA 2YE8A 3NOTC 1F98A 1EW0A 1WA9A 3A0SA 2YEIA 3H4LA 1MZUA 2FWZA 1YC3A 5FWKA 4GGLA 3R91A 4H6JB 5F68A 2PYPA 3IS2A 3F1NA 5F5RA 4EESA 3FT8A 3T0HA 1LSWA 2PYRA 1UYCA 4LRZE 1V9YA 1UYFA 1A4HA 2YEBA 2CH4A 1H7SA 4XKAA 1GSXA 1XJ4A 4B9OA 3U67A 5HWVA 1PVGA 5F6AA 5CTXA 2BTZA 4XCJA 4URNA 4HY1A 3O0IA 2IORA 4XKOA 4GHIA 2BYIA 4XIRA 3RH8B 2P7JA 2YI5A 4EGIA 3VE4A 3HZ1A 3BMYA 4LWEA 3LPSA 3B28A 2YKFA 4L9FA 4YKWA 2VEAA 4HNBA 1YC1A 2XX4A 1NWZA 5EFWA 3VHAA 1OSFA 2BASA 2CCUA 3BY8A 4MPEA 3H80A 1Z5AA 5HD5A 2V1AA 3LIEA 4AS9A 5I5LA 1YT0A 3E4OA 2YKEA 2ZKJA 1OTAA 2YE2A 4H85A 3DGEA 4I3AA 3HYZA 3LIDA 2XHTA 1Y8NA 2YEFA 2ZOHA 3G6OA 5TBMA 4L91A 4NXFA 1UYDA 1UY6A 4BAEA 4PRVA 3T2SA 4HYPA 4LRYC 3EHGA 2YEDA 1UGUA 2WI6A 3ICYA 1NHJA 2YEJA 3HJIA 1XJ6A 3PYPA 2FWYA 4HZ0A 2YE4A 5D6PA 4KQVA 1XFNA 3F1OB 3LUQA 3NHQA 4XIQA 4V25A 2VV6A 4HH3A 1ZXNA 2JJCA 2L0WA 1T1AA 1UYGA 2L4RA 2WKQA 3F1PB 3OWDA 4EW7A 1DP8A 4O05A 5M4EA 1UYEA 3EHJA 4KFGA 2QWSA 1UWNX 3U2KA 4U93A 5C93A 4GCZA 1G28A 5HZHA 2YEEA 3D72A 3GIFA 1F9IA 4JASA 4I39A 1I5DA 3VADA 1Y28A 2XCMA 4YKQA 2VLGA 4GS9B 3EEHA 2ZBKB 2VCJA 2VWCA 3IEDA 3D0BA 1MX0A 3JZ3A 4B7PA 3TUHA 3VHDA 3H7WA 3A0RA 1YC4A 2YEAA 4MOTA 4ZVIA 2PD8A 5KIZA 2WI5A 4GT8A 1B63A 2PR5A 2YJWA 2Z6DA 3LNUA 3LI9A 4PKYA 4WL9A 1T19A 5D7CA 3IS2B 3F1NB 1B3QA 2CCSA 5HDDA 3MFXA 5J3WA 1GKZA 1ID0A 4LRXC 1D06A 5J6AA 2V1BA 2J80A 1S14A 2HG1A 1NHIA 4PRXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IXHA 1OJ5A 1GSWA 2WI2A 2YE5A 3ZG0A 4MPCA 4GHIB 4JF5A 3NECA 3HEKA 3TE8A 3VE3A 3RLRA 2Y2MA 3KSHA 1FSYA 4HJ3A 4NK3A 2D01A 2YECA 3FC7A 4R4RA 1TDLA 5CHMA 5G18A 5MC7A 1S66L 3S4XA 4WZ5A 2ZD8A 2BU8A 1DP6A 2FTKA 2XFTA 3A0YA 2W0NA 3NI9A 2P08A 4R6LA 4JGQA 2WERA 2XD1A 3G2ZA 4DMZA 4WEKA 3TZ4A 3LIFA 5CGSA 4G3VA 3ULFA 2HHIA 3LEQA 2VGJA 1ZWHA 4X25A 4K0WA 4E6WA 3W4PA 1H7UA 3CPTB 4NKPA 1DP9A 4PKYG 2W1RA 4H81A 1K6RA 1VETB 4RX2A 4LWGA 3SS3A 3TW8A 1Y8OA 5CECA 1UYMA 4CLCC 4CWPA 4GDBA 3CWVA 4LENA 4UAAA 3PEJA 4X56A 2ZMVA 3FWLA 1HVBA 4QY6A 4WUBA 4OQHA 1Z5BA 4E00A 4ASAA 3MJQA 5F82A 3MKEA 1S67L 3MR0A 1HD8A 1XA7A 5A8BA 2Y91A 2WI1A 1JWZA 1Y54A 2Y2NA 3T10A 4CWNA 4O01A 3ZQ5A 4WEJA 4BD1A 5DKKA 1S6RA 4AWPA 2Z2MB 4XT2A 1NHHA 1YLYA 2WKPA 2WKIA 4L90A 3VP3A 5KSCA 3CGYA 3UE6A 2XH9A 3HJKA 1CI9A 4NXGA 4YKRA 3KYQA 4EEPA 4FD8A 5HARA 5FI6A 1ESUA 2UV0E 1RP5A 4K0XA 2W27A 4NEED 4WUJA 2YGAA 3Q82A 3QNBA 3KYZA 1K55C 1LHYA 2O1WA 1TS8A 4P87A 3PEHA 1K56D 2C1IA 2JE5A 3K3CA 4CLCE 5J4EA 3H9WA 3U4LP 2ZL1A 3HLGA 4KQOA 2YK2A 2JKGA 4LV1A 3M6BA 3JYIA 3PBOA 5KZHA 3KX0X 5D7RA 1O07A 4D60A 5EVID 3A0ZA 3T4JA 4XE2A 5CTNA 3CITA 4LWIA 2QG0A 1LI0A 2PBDP 1JTGA 1S1ZA 4R3JA 3Q5LA 2ZC6B 3GV9A 3R4OA 3IT9A 4XC0A 1BLCA 4X9LA 4B6CA 2OAQ1 2YKHA 4R3BA 2X01A 3FV5A 3V3RA 4YKTA 4Y3IA 5FA7A 4FPPA 3IWIA 1UY9A 2PNRA 1KDSA 5FATA 3U2DA 3G31A 2YEHA 2HJ9C 4DKIA 4F3LA 3ZKBA 4EEHA 4GS9A 4EM7A 4P6ZM 4HYMA 1ERMA 3O87A 4XIPA 2ZC4B 2YI0A 2YJXA 3N4IA 3C7VA 2VCIA 3OMUA 4OVDA 2IWSA 5FL3A 3UO9A 3WS0A 1NYMA 4EERA 5FSRA 1YT2A 1TC6A 1K54C 2FFYA 4OPRA 2YEGA 4EGKA 1ZHHB 2ZOIA 4OP5A 3S7PA 2GQPA 5DFXA 2K7SA 4O04A 4HZ5A 1YAXA 4WN5A 2UWDA 5GL9A 3WRZA 4S2PA 3VOYA 4XCLA 3NMQA 4WMCA 3QP5A 1T1CA 3O3VA 2O9AA 5BODA 4WUCA 3EGDC 2OWHA 3W4QA 4WUDA 1L2SA 3MSHA 3NIAA 5IT5A 3SL2A 3G7EA 4URLA 3B33A 4XXRA 2YKCA 1TC0A 2YE6A 3DAVA 4XD8A 1TS0A 2XJJA 3UN7A 2XLNA 4ESPA 2PU2A 3LIAA 3LO7A 4FMTA 2UWXA 3NJAA 2PAVP 4MBKA 1YLTA 1KE4A 1NY0A 4OOLA 4CE2A 2HV1A 1DRMA 1UWPX 3IXDA 1BXDA 3N6IA 1ONGA 5HD3A 3BQAA 4LWHA 3LR4A 2QMIA 2XDMA 4LPZA 2R9WA 5F83A 2QF6A 2KX6A 5EPHA 3HLWA 3WQ9A 4QY5A 3ZVTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4HY1 A;  3O0I A;  2IOR A;  4XKO A;  4GHI A;  2BYI A;  4XIR A;  3RH8 B;  2P7J A;  2YI5 A;  4EGI A;  3VE4 A;  3HZ1 A;  3BMY A;  4LWE A;  3LPS A;  3B28 A;  2YKF A;  4L9F A;  4YKW A;  2VEA A;  4HNB A;  1YC1 A;  2XX4 A;  1NWZ A;  5EFW A;  3VHA A;  1OSF A;  2BAS A;  2CCU A;  3BY8 A;  4MPE A;  3H80 A;  1Z5A A;  5HD5 A;  2V1A A;  3LIE A;  4AS9 A;  5I5L A;  1YT0 A;  3E4O A;  2YKE A;  2ZKJ A;  1OTA A;  2YE2 A;  4H85 A;  3DGE A;  4I3A A;  3HYZ A;  3LID A;  2XHT A;  1Y8N A;  2YEF A;  2ZOH A;  3G6O A;  5TBM A;  4L91 A;  4NXF A;  1UYD A;  1UY6 A;  4BAE A;  4PRV A;  3T2S A;  4HYP A;  4LRY C;  3EHG A;  2YED A;  1UGU A;  2WI6 A;  3ICY A;  1NHJ A;  2YEJ A;  3HJI A;  1XJ6 A;  3PYP A;  2FWY A;  4HZ0 A;  2YE4 A;  5D6P A;  4KQV A;  1XFN A;  3F1O B;  3LUQ A;  3NHQ A;  4XIQ A;  4V25 A;  2VV6 A;  4HH3 A;  1ZXN A;  2JJC A;  2L0W A;  1T1A A;  1UYG A;  2L4R A;  2WKQ A;  3F1P B;  3OWD A;  4EW7 A;  1DP8 A;  4O05 A;  5M4E A;  1UYE A;  3EHJ A;  4KFG A;  2QWS A;  1UWN X;  3U2K A;  4U93 A;  5C93 A;  4GCZ A;  1G28 A;  5HZH A;  2YEE A;  3D72 A;  3GIF A;  1F9I A;  4JAS A;  4I39 A;  1I5D A;  3VAD A;  1Y28 A;  2XCM A;  4YKQ A;  2VLG A;  4GS9 B;  3EEH A;  2ZBK B;  2VCJ A;  2VWC A;  3IED A;  3D0B A;  1MX0 A;  3JZ3 A;  4B7P A;  3TUH A;  3VHD A;  3H7W A;  3A0R A;  1YC4 A;  2YEA A;  4MOT A;  4ZVI A;  2PD8 A;  5KIZ A;  2WI5 A;  4GT8 A;  1B63 A;  2PR5 A;  2YJW A;  2Z6D A;  3LNU A;  3LI9 A;  4PKY A;  4WL9 A;  1T19 A;  5D7C A;  3IS2 B;  3F1N B;  1B3Q A;  2CCS A;  5HDD A;  3MFX A;  5J3W A;  1GKZ A;  1ID0 A;  4LRX C;  1D06 A;  5J6A A;  2V1B A;  2J80 A;  1S14 A;  2HG1 A;  1NHI A;  4PRX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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