4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
5F5YA 1P97A 2YKBA 4GS9B 2BYIA 2WI4A 2XHTA 1UYIA 1B63A 2Q8FA 3UB8A 5A8BA 1L0OA 3HJIA 3OW6A 1US7A 2H28A 2O1WA 2Q8HA 4GQTA 4HZ5A 3ZM7A 4CWRA 4YKUA 4FCRA 3CAXA 2GFDA 3NOTC 3H7WA 4GHIA 3ZQ5A 4XD8A 2WI5A 4EERA 2YK2A 3FT5A 5CTXA 4XIPA 3NOUC 3TZ0A 4M4XA 3D0BA 1UY8A 5EFWA 3C8CA 4DJ2A 3B28A 2YE5A 4X9LA 3A0SA 4CWNA 1H7SA 5FNCA 1AMWA 1GSVA 5FNDA 4O07A 4DJ3A 1OT9A 5HZHA 2YI0A 3OMUA 2YKIA 4CE2A 2ZDYA 4H85A 2XX5A 3R4MA 1EW0A 3LI8A 3EKOA 3Q5LA 5J71A 1P0ZA 1LSXA 3LIFA 4BIZA 5DJTA 2PD7A 4H7QA 2WI7A 3H82A 1UYLA 1ID0A 3GIGA 4I39A 4P7AA 3A0TA 4LRYC 4LRZE 4WUDA 4KQVA 4L9GA 3UB9A 2BTZA 3VHCA 1KIJA 3T0HA 1H7UA 5IU1A 4R1FA 1BYWA 2YKHA 3U2KA 4EGHA 4B7PA 3RH8B 2YE8A 2ZBBA 3LNUA 1OTAA 3F1NB 2VCJA 3LIDA 3SW1A 3T50A 4HYMA 3UB6A 3INXA 4ASBA 3KX0X 2YEIA 3BWLA 5C93A 4BBTA 3R91A 2FWYA 5F6AA 2XDLA 1KZNA 3D36A 3ZXOA 5TBMB 4LWIA 4BBUA 4U7NA 5HWWA 4EXOA 3VE3A 3O2FA 3ULFA 5J4EA 3B33A 1QYEA 2XDUA 2BU2A 1TS7A 2VV6A 2YEAA 4L91A 2YE7A 3BMYA 3H9WA 4HP4A 4I5SA 1I5BA 5KIZA 2XDSA 2YKEA 4KSHA 4CWFA 1N9LA 2L0WA 4XITA 1OTIA 3K3DA 1TILA 3HEKA 4MBCA 5CPHA 4L94A 2H8MA 3EHFA 2YJWA 4CWSA 3T10A 4HIAA 1S66L 2R78A 2ESAA 4MB9A 2YE3A 4W7TA 4HH2A 4BQJA 1B62A 3EHJA 1AH8A 5IDJA 1GSXA 1TBWA 3HZ1A 3R4NA 3A0WA 1UYDA 5FNFA 4PKYA 1NHHA 5AVFA 2J80A 4I3JA 2Q8IA 4YKTA 2BZ5A 2BU5A 5FWKA 3G7BA 3VHAA 2YKJA 3U67A 2CCTA 3TZ4A 4HNBA 3UB7A 2PYPA 2XX4A 3H7WB 3B24A 3R4PA 4Q20A 3FG8A 4GHIB 4FCPA 4NXBA 2VV7A 4YKYA 4V26A 4V25A 3EHHA 1DP8A 4WL9A 1AH6A 4PL9A 4UROA 4E01A 2D01A 2JHEA 1Y4SA 2WERA 3MR0A 3EKRA 2V1AA 4YKXA 1EI1A 1Z5BA 4EFUA 2YE9A 1UY9A 4BXIA 4NH8A 4R38A 1S1ZA 4LRXC 1LSWA 1LT0A 4XKAA 2YKCA 3FT8A 4HQAA 1V9ZA 2WI3A 3HYZA 1QY8A 4PKYG 1YETA 3OWBA 4H81A 4BQGA 1YSZA 1BXDA 3H82B 3P7NA 3GIGB 2BT0A 5D7DA 4JQLA 4PRVA 2YEDA 3B26A 2HV1A 1PVGA 3PHYA 2VW5A 4URLA 1AJ6A 2PNRA 1UGUA 5HSQA 3EWKA 3A0XA 3TZ2A 1YERA 2ZOHA 2ZDXA 1I58A 2QF6A 2YGFA 4YWZA 3OPDA 4HY6A 2QJ5A 1ZWHA 4WN5A 2YI5A 3LIBA 5HDSA 2PDRA 3MJQA 3C11A 4WUJA 2V0UA 2WKQA 2YEHA 3NMQA 4EEPA 2BREA 3G6OA 2JN7A 1WA9A 4EEHA 2QFOA 4EW7A 2BU6A 1YC1A 2IORA 2BSMA 2XCMA 2YI7A 3PYPA 1NHJA 4R6LA 3K99A 1Y8NA 4PU9A 2H55A 2XJGA 3G7EA 1T1CA 2ZBKB 2VLGA 2JKIA 3UMEA 5I5LA 2YE4A 4BAEA 1T1AA 4HP9A 2EXLA 2FXSA 1UWPX 3CGYA 4GEEA 1DP9A 4XKOA 1UYGA 4HJ3A 4H6JA 4MOTA 2WI2A 3RLRA 4HZ0A 1NWZA 2PR6A 4L9EA 3WHAA 1OTBA 1UYCA 4WF0A 2L4RA 3BY8A 2BU7A 2YEFA 4KSGA 4CWPA 1V9YA 3VOLA 3HZ5A 4LWEA 2IWSA 1YSRA 1YT1A 2I9VA 2IWUA 2YE2A 2IWXA 2V0WA 3IS2A 2O1UA 2QG2A 3A0RA 1I5CA 1I5DA 1U0ZA 4QPJA 5CTUA 4LPZA 3K98A 4WUBA 1OJGA 2BU8A 4JGRA 4O05A 1ODVA 1XJ4A 5IDMA 3NJAA 2A24A 2V1BA 2UWDA 1U2OA 4GS9A 4GT8A 2V9AA 3HHUA 1TC6A 2QHKA 4XT2A 3RKZA 1TS0A 5HDCA 4CWTA 3A0YA 2JJCA 2PR5A 4HH3A 4JGOA 1I5AA 3MQQA 4HHDA 3T1KA 3B27A 5G4YA 1GSWA 4LWGA 1LSVA 1F98A 2BRCA 5F3KA 5M4NA 2PYRA 3IEDA 4KQDA 3JZ3A 4JAUA 4HY1A 2CMNA 1S67L 4L9FA 3TTZA 1YC4A 4PRXA 4HY8A 2XHXA 2VV8A 2HKJA 3E4QA 4XC0A 1YC3A 5D6QA 1TC0A 4AWOA 3UMDA 1S4RA 2XABA 3LI9A 5J7EA 1UYEA 2YGAA 1OT6A 1LL8A 5F69A 4CWQA 3LIEA 2PHYA 3CWVA 1TIDA 2B02A 1BKNA 4XDMA 3RLQA 2OWHA 2IOQA 3KE6A 1I59A 4NH9A 4HJ6A 3OLOA 4GFNA 4GGLA 4XIQA 4GCZA 4LP0A 4ASAA 2W27A 4E04A 5CTYA 1UYHA 5M4EA 3NOPC 3K97A 2EA9A 4O0BA 4L90A 4EGIA 5J3WA 2W0NA 4XCLA 1Y8PA 5D7CA 3CLOA 5F68A 4MP7A 4KFGA 5TBMA 2YKFA 1S16A 4H6JB 3F1PA 3A0ZA 3RTYA 1NHIA 5HDDA 4YKQA 5CTWA 4E02A 1BGQA 4CE1A 4ASFA 5BOCA 4DZYA 1S4SA 3EHGA 4HI4A 1DRMA 3K3CA 3CRLA 4B9OA 1T18A 3F1OA 3GECA 4WLAA 2Q2EB 3GIEA 5G4ZA 3SL2A 1XFNA 1OTDA 3NHQA 3IS2B 4JGQA 4MN6A 4EETB 4I38A 5IS1A 2FWZA 2WI6A 2QJ7A 4LWFA 1UYMA 2WEPA 4F3LA 2XDXA 4R70A 4O04A 4JASA 2VCIA 5DKKA 1OSFA 2A24B 4MPNA 3ICYA 2QG0A 2CH4A 1D7EA 4YKZA 2HCHA 4XT2B 2YEEA 3E4OA 2YECA 3FV5A 1THNA 1S14A 4HYPA 4XE2A 4AS9A 4AWPA 1UY7A 3BY9A 5D6PA 4MPEA 2VWCA 1N9OA 4FPPA 3IBRA 4L8ZA 1BYQA 2YJXA 4KUOA 1B3QA 2YK9A 2YEGA 2XD6A 4FMTA 3B25A 3C0EA 3CGZA 3LYXA 1AM1A 2WKPA 1XFQA 1EA6A 4LWHA 1YT2A 3EEHA 4YKWA 1VB6A 4AWQA 4URNA 5J6AA 1TH8A 1S1YA 3VE4A 3BM9A 3DGEA 3D72A 1A4HA 4XKKA 4NXGA 5GGZA 1UYKA 4K08A 3D2RA 2WEQA 5HWVA 3UE6A 4I3AA 1OTEA 3A0VA 3CWFA 4DUHA 3PEJA 4MPCA 1T19A 3GDIA 1UY6A 2XJXA 2CG9A 4URMA 5M4HA 4K4OA 2ZOIA 5IN9A 2FYPA 4FCQA 5CF0A 4QPKA 4RQ9A 1GJVA 1YESA 4EEUA 1YT0A 5HD5A 3MNRP 3Q5KA 4LPBA 2ZKJA 5M4MA 5HWTA 2XHRA 4P8OA 4R3AA 2QKPA 3C2WA 3MXQA 5AVEA 2XX2A 2L1MA 4EQ1A 2KDKA 2Z6DA 3OWDA 2YEBA 5HD3A 5D7RA 2D02A 1YS3A 1X0OA 3QTFA 4NXFA 3LICA 2K5BA 4E00A 5M4KA 2CCSA 4XTJA 2E0AA 3ZXQA 4NXEA 3H4LA 3TZ5A 1MZUA 4HXWA 3R4OA 2C2AA 4WUCA 3U2DA 3F1PB 1TS8A 1Y28A 4CWOA 1Y8OA 2HG1A 5M4PA 1XJ2A 4XCJA 1KOUA 3VHDA 5F5RA 2YE6A 1UWNX 4I3IA 1TS6A 2KX6A 4BIUA 4MN5A 2AKPA 2GQPA 1Z5AA 3VADA 3F1OB 3WQ9A 4NH7A 3Q5JA 4B6CA 3GIFA 2O1VA 3CRKA 2YEJA 2WI1A 3H80A 4U93A 1Z5CA 1XJ6A 2VEAA 2XJJA 3RLPA 4HXZA 2PD8A 1G28A 2QWSA 4F3LB 4XIRA 2CCUA 1Z59A 4EGKA 1ZW9A 2OOLA 4O09A 1GKZA 3MFXA 4EM7A 4LLOB 4KTNA 4HJ4A 1XJ3A 3LUQA 4KUKA 4GW9A 4KP4A 1ZXNA 1JNUA 3FC7A 4R3MA 1DP6A 2P7JA 4U7OA 4I3HA 3ZKBA 4CE3A 3F1NA 1R62A 2M1CA 5DKLA 3O0IA 2Q8GA 3INWA 4ZVIA 3LIAA 1OJ5A 2YGEA 3MQOA 4HOIA 1JM6A 2BASA 3G75A 2IOPA 4EESA 1QZRA 3HYYA 1ZXMA 3LPSA 1UYFA 3T0ZA 3HJKA 1Y4UA 3ZKDA 4JAVA 1GKXA 1T1BA 4EMVA 2GJ3A 2BYHA 2XDKA 4ASGA 3QDDA 5DJUA 4JGPA 2INWA 4YKRA 4EFTA 2WKRA 5L3JA 2CGFA 2K7SA 2OWJA 1F9IA 4L93A 1D06A 2YI6A 1N9NA 3R92A 3T2SA 3TUHA 3K60A 1MX0A 4ZKIA 5BODA 3E4PA 1MU5A 4MP2A 4BBVA 3PEHA 2Z6CA 3O6OA 2XK2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P97A 2XHTA 2DCFA 1B63A 3HJIA 2XD5A 2Q8HA 4GQTA 4FCRA 4E3MA 4ZJ2A 1PZOA 3BQAA 4EERA 3FT5A 5CTXA 3NBLA 4M4XA 5M19A 5EFWA 3C8CA 4EBPA 2YE5A 4LGWA 2WYXA 2GX5A 1H7SA 5FNCA 1AMWA 4YNRA 4DJ3A 4CE2A 3W4QA 1FQGA 2XX5A 1L2SA 4BIZA 5DJTA 2Y79A 1QMFA 3Q82A 3NDGA 3MQ0A 3O87A 5GHZA 4H7QA 4P7AA 3H82A 4I39A 1G6OA 3IX8A 3ITAA 1H7UA 2J7VA 2A49A 3PR6A 1BYWA 2YKHA 2WAFA 4B4ZA 4EGHA 4B7PA 3RH8B 3UE3A 2ZBBA 1OTAA 3F1NB 4S2KA 3KX0X 4P87A 5FATA 3R91A 1L3LA 2W3DA 3PBQA 4C3QA 2XDMA 2Y2HA 4U7NA 3IXBA 4Y0OA 5HWWA 4BD1A 3VE3A 1H0MA 4QB8A 3O2FA 4O8GA 1QYEA 2XDUA 2VV6A 4L91A 2YE7A 3BMYA 3H9WA 4UHUA 4EBNA 1I5BA 4KSHA 3UDFA 2XQZA 1TILA 3HEKA 1HZOA 4FH2A 1RGZA 3NECA 4IVKA 5CPHA 2H8MA 4MB9A 4HH2A 1EI5A 1B62A 5IDJA 4U0TA 1TBWA 3QP8A 3R4NA 3A0WA 5FNFA 4PKYA 3HLGA 1NHHA 1ZTUA 1U60A 5LBRA 4PM6A 2JBFA 4MLLA 3U67A 1IYOA 3UB7A 3MFDA 3H7WB 4Q20A 3T4KA 1DP8A 4Y3IA 3PBNA 5C5KA 1AH6A 4PL9A 2D01A 4FTXA 5CEDA 3MR0A 2WERA 2V1AA 4YKXA 3A3IA 1UY9A 4R38A 1E3UA 1LT0A 2Q9MA 5GHXA 4UAAA 3VP0A 3B3XA 2YKCA 4GDNA 4RYEA 2WI3A 1JWPA 4H81A 1YSZA 5D7DA 2BT0A 2XD1A 4D60A 2HV1A 4X25A 1WYCA 5HSQA 4GB7A 3T4QA 4E3JA 4NG2A 4QJGA 1I58A 2QF6A 4KENB 3OPDA 1TEMA 2YI5A 3LIBA 1IYSA 1K55A 4FOFA 2V0UA 2WKQA 1WA9A 4EW7A 1YC1A 2YI7A 2BSMA 1NHJA 4ZAMA 4R6LA 2LB9A 2W3EA 1Y8NA 2XJGA 3TE8A 2UV0E 3O3VA 4WYYA 4WEKA 5E2FA 5HL1A 3LR5A 3UMEA 3T4LA 2FXSA 4EQIA 3CGYA 4GEEA 5IHVA 4H6JA 4MOTA 5FQ9A 2WI2A 1M40A 1MPLA 4HZ0A 1NWZA 3E2KA 4L9EA 2VZWA 3ZNYA 4M3KA 2BU7A 2YEFA 2XFTA 3HZ5A 2IWSA 1YSRA 1YT1A 2YE2A 2EWWA 5EVID 2HJEA 1I5DA 4BENA 2Y4AA 1F2KA 1OJGA 2HP5A 3IXGA 5HL6A 2WGIA 1L0GA 1H3QA 2GZAA 4GZBA 4GS9A 2V9AA 3HHUA 2FFYA 2WK0A 3HLDA 1K56D 2QMIA 3PTEA 4S2NA 5HDCA 4CWTA 4ESPA 3UPOA 2WAEA 4Y7PA 4HHDA 4PM9A 3T1KA 3D9YA 1GSWA 2ZC3B 4X6TA 1TF1A 1NRJA 4OPRA 5M4NA 3ZHHA 2PYRA 3IEDA 1LI0A 5BOHA 3TTZA 4ZJ3A 5E43A 1K6RA 4PRXA 5MC7A 2VV8A 1FIKA 1YC3A 5L10A 3HLWA 4C75A 4AWOA 1S4RA 3NDEA 2YGAA 5J7EA 3ZYTA 5KSCA 1TIDA 2HGVA 2B02A 3BFEA 4R1GA 3RLQA 3IBJA 4HJ6A 3OLOA 1NY0A 1MWUA 5FQKA 4DF6A 1UYHA 3Q7ZA 5EUAA 3NOPC 3K97A 3GMWA 4L90A 3Q81A 2W0NA 1SCWA 5D7CA 3CLOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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