4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
1YSZA 5F69A 4EEPA 4HQAA 4JGOA 4URMA 4MN6A 3F1NB 4YKXA 2W0NA 3EHFA 3B33A 5TBMA 3H82A 2CH4A 4ASFA 4URNA 3HZ5A 4GHIA 3EKOA 3VHCA 1I5CA 2YGEA 4GEEA 3RLRA 4GS9B 3MJQA 3RH8B 3MQQA 4H7QA 3QDDA 3F1OB 2KX6A 3KX0X 2VCJA 2ZBBA 2PR6A 2XK2A 1I58A 4MBCA 4XT2B 4H6JA 4EGKA 2QKPA 2HCHA 2YKCA 4CWSA 5L3JA 1V9YA 1UWPX 4XIQA 2YI5A 1AH8A 3GIGB 3VE3A 1NHJA 2YJXA 5M4KA 1B63A 1D06A 4WUJA 3A0XA 3OLOA 1YT0A 2BYIA 4HYMA 4O0BA 1BYQA 4YKZA 3BMYA 5AVEA 1Z5AA 2VLGA 3RTYA 2IORA 1N9OA 3K3CA 2CCUA 2V1BA 3MNRP 4K08A 4KSHA 2W27A 3NHQA 2JN7A 4WL9A 5HWWA 4HNBA 1MU5A 1U2OA 1UYEA 3MQOA 2CCTA 3TUHA 4XIRA 2XDKA 1F98A 4JGPA 4XE2A 4XC0A 4W7TA 2FWZA 4EESA 3PEJA 3G75A 2CG9A 2XHRA 5FNDA 2Q2EB 3IEDA 4JAVA 2WEPA 1JNUA 4YKUA 4KTNA 4MB9A 3VE4A 5J7EA 2QG0A 5IDMA 1TIDA 3ULFA 3HYYA 4I39A 2XJJA 4LPBA 2Q8IA 3OWDA 4PKYA 2VV7A 4FCPA 4O04A 2KDKA 4GW9A 2VV6A 4URLA 5G4YA 2WI7A 4LWGA 3BY9A 4RQ9A 1YETA 5J71A 4R3AA 5IDJA 1XJ4A 4LP0A 3GIFA 4P8OA 4YKQA 3CAXA 2BU6A 3D0BA 4FCRA 2Z6CA 2UWDA 1NHIA 3LUQA 3HEKA 4FPPA 4GQTA 2YI7A 5D7CA 2CGFA 1OT9A 4FCQA 2V0WA 4PRVA 3DGEA 1KZNA 2XDLA 1AMWA 1BYWA 2FXSA 4UROA 4H81A 4YKRA 5A8BA 3K3DA 1UYFA 1US7A 1U0ZA 3A0YA 4ASBA 3K98A 2YKHA 2D02A 3LICA 4BBVA 1TILA 4NH9A 4HJ4A 3LIDA 4EERA 3TTZA 5DJTA 4R3MA 3VOLA 4O07A 3FC7A 5HDDA 3T2SA 4ASAA 1UWNX 3MXQA 2OWJA 1N9LA 4GT8A 5M4HA 3TZ0A 4HZ0A 1Y28A 2YE4A 5TBMB 3H82B 5M4MA 3ICYA 4HOIA 1YT2A 4U7OA 4EFTA 1OJGA 4GHIB 4HJ6A 1DP8A 3T1KA 3RKZA 4P7AA 3H9WA 3FV5A 1VB6A 2EA9A 4JGRA 3R4OA 4ASGA 3NMQA 4XIPA 2VW5A 1PVGA 4H6JB 4MP2A 1TS6A 2K5BA 2GJ3A 1YC4A 2XDSA 2GFDA 2WI6A 4CWFA 3SL2A 1MZUA 1KIJA 2ESAA 2WI4A 1S1ZA 5DKKA 2E0AA 4YKTA 1YERA 4XCJA 3NOUC 4EEHA 2YI0A 4PL9A 4BXIA 4LWFA 2WKPA 3A0RA 3EKRA 2IOPA 2YECA 2ZDXA 3CRLA 2O1WA 3SW1A 4EETB 4HH2A 2WI3A 1UYIA 3K97A 4HY6A 2P7JA 1OSFA 4I3AA 2FYPA 2YEEA 1XJ2A 1ZXMA 4BIUA 2XDXA 4B7PA 4JQLA 2Q8FA 1QZRA 3CWVA 4EGHA 4JAUA 4U93A 1NWZA 1GSVA 3E4QA 1OJ5A 3NJAA 2ZKJA 4WUDA 4XCLA 1UYLA 3LYXA 2VEAA 4I3IA 1P97A 2BT0A 4EMVA 3A0TA 1T19A 3K99A 2XHTA 3U67A 2A24A 4AWOA 2I9VA 3VHDA 2BREA 2WERA 4FMTA 4LWHA 4HJ3A 4HZ5A 2B02A 3HJIA 1Z5BA 2L0WA 4HXZA 1OTEA 3T0HA 4JASA 4WUBA 4B9OA 2YEFA 1NHHA 2YKJA 4LRZE 5HD3A 4LRYC 5I5LA 4XKOA 4CWPA 3R91A 2PNRA 4E01A 3JZ3A 2WEQA 3GIEA 4F3LA 3B27A 2XJXA 2YGAA 4EGIA 5HD5A 2QF6A 1H7UA 4V25A 1TS7A 3UB6A 5F6AA 3T50A 3Q5JA 2Q8HA 4EFUA 1UYDA 2CCSA 4CE2A 1GSWA 2Z6DA 1GJVA 1UYMA 2QFOA 2O1VA 2R78A 2VV8A 4HP9A 1XFNA 4O09A 2BSMA 4BBTA 3EWKA 5AVFA 4HIAA 4JGQA 2BYHA 2QWSA 1BGQA 3R4PA 1I5BA 1THNA 4YWZA 4L9EA 2PDRA 3C11A 3C2WA 4MPCA 5D7DA 4LRXC 4KP4A 2YE6A 4MP7A 2XABA 2H55A 2BU7A 3Q5KA 2K7SA 5CTYA 4XDMA 3E4PA 2H8MA 2WKRA 1LSWA 1LSVA 2YI6A 3EHHA 5F3KA 2BU5A 2YE3A 5BODA 4B6CA 5M4NA 1T1AA 4LPZA 2WI1A 1BXDA 3TZ4A 3BY8A 2YEJA 3RLQA 1S16A 1JM6A 4HH3A 1YSRA 3U2KA 5J6AA 2OWHA 2XX4A 3Q5LA 2EXLA 2BTZA 1P0ZA 4HY1A 1Y8NA 2PD8A 2YKFA 4XKAA 2YE2A 4CWOA 1YT1A 3BWLA 2YE8A 2YEGA 5F5YA 1DP6A 3CWFA 4HY8A 3MR0A 4MOTA 5M4EA 2L4RA 2IOQA 4XTJA 4L9FA 3ZKDA 5HWVA 3K60A 3G6OA 1MX0A 4QPKA 4E00A 2H28A 2YKBA 2QJ5A 1OTBA 3GECA 3KE6A 1WA9A 5EFWA 3D36A 3LI8A 3ZXOA 4PKYG 4LWEA 4AWPA 4CE3A 1Z59A 5FNFA 2PD7A 2YK9A 1ID0A 3O0IA 2PYRA 2OOLA 2XHXA 3B25A 4DJ3A 2A24B 4U7NA 2YE9A 3NOTC 4NXGA 1UYHA 2XCMA 3MFXA 2IWSA 2JJCA 4CE1A 2AKPA 1TS0A 4YKYA 4I38A 4QPJA 5DJUA 3EHJA 3ZKBA 1UY6A 4KUKA 1ZWHA 3FT5A 1UYGA 4CWQA 3D72A 1Y8PA 5D7RA 5CPHA 3TZ2A 4EXOA 3A0WA 4F3LB 4BIZA 4KUOA 1T1CA 4R38A 4O05A 5M4PA 3R4NA 3CRKA 2BASA 5HWTA 5KIZA 4LWIA 3ZXQA 5HSQA 2L1MA 1TBWA 1LT0A 1AH6A 3O6OA 1ZXNA 3H4LA 1B62A 4I5SA 4WUCA 2ZDYA 3IBRA 4HI4A 3INWA 1UGUA 2INWA 5D6QA 2YK2A 5HZHA 3C8CA 4L9GA 2YEIA 1UY7A 2YEHA 1UY8A 3OMUA 1YC1A 3H80A 2J80A 1R62A 1EI1A 1I59A 1S4RA 4NH8A 3TZ5A 1GKXA 3UMEA 2YKEA 4ZVIA 5D6PA 2V0UA 5HDSA 1GSXA 1X0OA 3UMDA 3HYZA 3ZQ5A 4KQDA 1T1BA 1GKZA 2YEDA 3HZ1A 3HHUA 5CTWA 1DRMA 3H7WA 1I5DA 1S67L 3LIEA 3PHYA 3F1PA 2PR5A 1LL8A 5J4EA 3UB9A 1XJ6A 4MPNA 1S66L 4HP4A 1Z5CA 5CF0A 1L0OA 1QY8A 1S14A 2CMNA 2YKIA 1EW0A 2GQPA 4MPEA 4Q20A 1ODVA 1V9ZA 2BU2A 4XD8A 3IS2A 2QG2A 2XX2A 4HYPA 2XJGA 4WN5A 1XFQA 4XKKA 2D01A 1QYEA 3FT8A 4DUHA 1N9NA 3CLOA 3INXA 1G28A 1F9IA 4GCZA 2YE7A 4E04A 1Y8OA 5CTUA 2V9AA 2IWXA 4KFGA 3P7NA 4EQ1A 3CGZA 3LI9A 5G4ZA 4R70A 2BZ5A 4CWNA 2WI5A 2XX5A 3F1NA 5F5RA 3LNUA 2ZBKB 3E4OA 1TC0A 1T18A 3GDIA 2BRCA 3VHAA 3T10A 3FG8A 5HDCA 4NXEA 4L94A 2HKJA 2C2AA 4GS9A 1EA6A 3D2RA 3NOPC 3O2FA 4BBUA 3F1OA 4NXFA 2VCIA 3OW6A 2WKQA 1H7SA 2YEBA 4CWTA 1UYKA 3LIBA 2YEAA 4EEUA 2BU8A 4H85A 4PU9A 4XT2A 2WI2A 4YKWA 5BOCA 3R92A 3U2DA 3LIAA 1YC3A 3UE6A 2YGFA 1ZW9A 4L8ZA 3HJKA 5IS1A 3UB7A 3GIGA 3G7EA 4K4OA 4L91A 1S1YA 2O1UA 3QTFA 5J3WA 2QHKA 3T0ZA 2JHEA 1YESA 3OPDA 1I5AA 4I3JA 4R6LA 1UYCA 3G7BA 4LLOB 4WF0A 4I3HA 2YJWA 5DKLA 1A4HA 4L90A 4CWRA 3B24A 4AS9A 4AWQA 1TS8A 4KQVA 2VWCA 1LSXA 3C0EA 4E02A 4ZKIA 4HHDA 3B26A 3A0ZA 5FWKA 1OT6A 2FWYA 3LPSA 4NXBA 3OWBA 4R1FA 4V26A 3EEHA 2PYPA 3CGYA 2HV1A 2M1CA 1D7EA 1S4SA 2HG1A 3WQ9A 4NH7A 3PYPA 2Q8GA 1Y4UA 1Y4SA 3WHAA 4DJ2A 2ZOHA 4PRXA 1UY9A 4X9LA 5GGZA 3H7WB 3A0SA 3A0VA 4L93A 4WLAA 4GFNA 2XD6A 4M4XA 3F1PB 1AM1A 4EM7A 1YS3A 3R4MA 3BM9A 2ZOIA 2XDUA 2YE5A 4GGLA 1OTIA 2QJ7A 1KOUA 4KSGA 3ZM7A 2IWUA 4BQJA 1DP9A 5IU1A 3B28A 4XITA 5CTXA 1OTDA 1OTAA 1B3QA 3PEHA 4BAEA 5C93A 1TC6A 3IS2B 1BKNA 4BQGA 1TH8A 5IN9A 1XJ3A 3UB8A 5F68A 3EHGA 4EW7A 2PHYA 3LIFA 4HXWA 2JKIA 4DZYA 1AJ6A 4MN5A 2V1AA 3RLPA 3VADA 5FNCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZHHB 5F69A 4C75A 4HQAA 4JGOA 2JC7A 3RFBA 4YKXA 2W0NA 1FCOA 3H82A 2Q0OA 3HVFA 3EKOA 2B18A 5CTMA 4GEEA 3RH8B 3ITBA 2E8JA 2IWBA 3KX0X 2VCJA 1MWUA 1KE3A 1TEMA 4H6JA 4XT2B 4EGKA 4GNUA 1SKOA 2PRFA 4XIQA 4GJ4A 2YI5A 3ZNYA 4NETA 3VE3A 3GIGB 5F83A 4Q0JA 1FCNA 1YM1A 3OLOA 1YT0A 2XH9A 1BYQA 2J3TC 4YKZA 4GLQA 2VLGA 4X1MA 2IORA 3K3CA 4RYEA 5EOOA 5TJJA 2CCUA 2W27A 3DW0A 3UE3A 5HWWA 5GHYA 2CCTA 4XIRA 1IKGA 2FWZA 3BECA 4Y5FA 4E3LA 5FNDA 4KQRA 2WEPA 4MB9A 3C5AA 3ZFZA 4N1HA 3ULFA 2OSUA 3G34A 4PKYA 1PRQA 3OPPA 2KDKA 1XPBA 2VV6A 4NEED 3BY9A 1K4EA 4LP0A 2Z6CA 3LUQA 3HEKA 4FPPA 3GTCA 5D7CA 5J8XA 2CGFA 1OT9A 2VJWA 2V0WA 3IWOA 2XDLA 1AMWA 1CJFA 2FXSA 2HDUA 4LV2A 4H81A 5A8BA 3IQAA 4E3KA 1U0ZA 2ZC3B 3LICA 1L0DA 3TTZA 1YMSA 4O07A 4ASAA 3MXQA 2OWJA 3ISGA 4GT8A 2HGVA 1Y28A 4GZBA 5TBMB 3ICYA 4HOIA 1ES3A 2LB9A 1OJGA 4GHIB 3T1KA 1FCMA 3S4XA 4P7AA 3RKZA 1SDNA 2EXBA 2ZD8A 4UAAA 3NMQA 4OPRA 4MP2A 2K5BA 1NLYA 2XDSA 2ZJ9A 2WI6A 5DKKA 4FSFA 4PMAA 1YERA 1QMFA 4BL3A 1C3BA 4DDYA 3FKVA 3A0RA 2J3WA 2XA7S 2WZZA 2YECA 3CRLA 4R3JA 2O1WA 3LEZA 3SW1A 4EETB 4HH2A 4WBGA 5E2GA 1M40A 3K97A 4ARZB 4HY6A 2HJ9C 1MKIA 1L2SA 3G32A 1ZXMA 4U0TA 4X56A 4EGHA 4JQLA 1QZRA 2ZM8A 1ZG6A 5HPIA 5EVID 4BD1A 1UYLA 5E2HA 3PR6A 2G7UA 3JVUA 2ZQ8A 4KQQA 1P97A 4EMVA 2Y55A 5HAIA 4QB8A 3MMHA 3U67A 4AWOA 3VHDA 1XXMA 1IFQA 2B02A 1EWZA 4JASA 4WUBA 2YKJA 4LRZE 2W3DA 2PNRA 3W4QA 4D60A 5BOHA 2WEQA 3B27A 2FTKA 2XJXA 5HD5A 4V25A 5L07A 3CPTA 5F6AA 3Q5JA 2Q8HA 2Y2JA 5FAOA 5MC7A 1S0WA 1UYDA 2CCSA 4KZAA 1UYMA 4DDSA 4E6XA 4E3IA 3O3VA 1A0KA 4U0XA 2VV8A 5L10A 5FEGA 2ZMVA 4JGQA 2B5RA 3R4PA 2JKRI 1RGYA 3C2WA 3B47A 3BEBA 4XDMA 2WKRA 4MDZA 1G6OA 1LSWA 4Y15A 1HVBA 4B6CA 1BXDA 3BY8A 1JM6A 3BLMA 2DCFA 4HH3A 4Y13A 1YSRA 3T4JA 1XX2A 3BFGA 3E2KA 3S7NA 2XX4A 2BTZA 4UA6A 4X25A 3CJMA 3KYEA 1Y8NA 1K38A 2VX8A 4XKAA 1I5QA 5F5YA 4OOYA 5M4EA 2L4RA 2IOQA 3BQAA 3QNCA 3T12B 5HWVA 2J9PA 4S2MA 3JVVA 4H8RA 3R7WB 2QJ5A 1OTBA 3MKFA 2H0YA 2ZC7A 1FQGA 3IXHA 4PKYG 1KVLA 4AWPA 4CE3A 3C7UA 5FNFA 2PYRA 2OOLA 1WYBA 1OPXA 2XCMA 4JPMA 2IWSA 5EM1A 1PI5A 1K6RA 4QPJA 4BQMA 4MCWA 4DN0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TC0 A;  1T18 A;  3GDI A;  2BRC A;  3VHA A;  3T10 A;  3FG8 A;  5HDC A;  4NXE A;  4L94 A;  2HKJ A;  2C2A A;  4GS9 A;  1EA6 A;  3D2R A;  3NOP C;  3O2F A;  4BBU A;  3F1O A;  4NXF A;  2VCI A;  3OW6 A;  2WKQ A;  1H7S A;  2YEB A;  4CWT A;  1UYK A;  3LIB A;  2YEA A;  4EEU A;  2BU8 A;  4H85 A;  4PU9 A;  4XT2 A;  2WI2 A;  4YKW A;  5BOC A;  3R92 A;  3U2D A;  3LIA A;  1YC3 A;  3UE6 A;  2YGF A;  1ZW9 A;  4L8Z A;  3HJK A;  5IS1 A;  3UB7 A;  3GIG A;  3G7E A;  4K4O A;  4L91 A;  1S1Y A;  2O1U A;  3QTF A;  5J3W A;  2QHK A;  3T0Z A;  2JHE A;  1YES A;  3OPD A;  1I5A A;  4I3J A;  4R6L A;  1UYC A;  3G7B A;  4LLO B;  4WF0 A;  4I3H A;  2YJW A;  5DKL A;  1A4H A;  4L90 A;  4CWR A;  3B24 A;  4AS9 A;  4AWQ A;  1TS8 A;  4KQV A;  2VWC A;  1LSX A;  3C0E A;  4E02 A;  4ZKI A;  4HHD A;  3B26 A;  3A0Z A;  5FWK A;  1OT6 A;  2FWY A;  3LPS A;  4NXB A;  3OWB A;  4R1F A;  4V26 A;  3EEH A;  2PYP A;  3CGY A;  2HV1 A;  2M1C A;  1D7E A;  1S4S A;  2HG1 A;  3WQ9 A;  4NH7 A;  3PYP A;  2Q8G A;  1Y4U A;  1Y4S A;  3WHA A;  4DJ2 A;  2ZOH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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