4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
2Z6CA 4L93A 1LL8A 2ESAA 1BXDA 3VHAA 3PEHA 4XKOA 4EMVA 3BY9A 2JJCA 3R4PA 3CLOA 2YE5A 4URNA 2BU8A 1X0OA 1OSFA 2YE7A 4BBVA 4E02A 2BU7A 2WI4A 2QF6A 3IS2B 2WEPA 4GS9A 4FCRA 1YS3A 3VHDA 2BRCA 4QPJA 3HHUA 4XDMA 1OT6A 3GDIA 3K60A 3O2FA 1YT1A 5FNCA 5IN9A 1OTBA 3NHQA 2I9VA 3H9WA 1TS6A 2PDRA 3T50A 2BT0A 4CWSA 3C0EA 3H7WA 5DJTA 1MZUA 5M4MA 3INXA 4CWNA 3Q5LA 4U93A 1YESA 2D02A 1UY6A 5HDDA 2ZKJA 4E01A 2YEAA 4LWGA 4NXGA 1DP6A 1LSVA 4YKUA 2YKBA 2YEGA 1G28A 3A0WA 2IWSA 1OJ5A 2UWDA 3QTFA 1UYKA 3EEHA 1QYEA 1UYGA 4WLAA 2GJ3A 4L8ZA 3LIAA 1YSZA 2CCTA 4HY1A 4XT2B 4V26A 2YEIA 2Q2EB 1S67L 1T19A 4HHDA 5J3WA 2ZBKB 4U7NA 2OWHA 2YEJA 2YKIA 4LWIA 4EEPA 3HZ5A 4H81A 4W7TA 3LICA 3FG8A 4I5SA 2INWA 3UMEA 4XCLA 5TBMA 3UE6A 1ZXNA 4WF0A 4XCJA 1Z5CA 1S1YA 3H7WB 3A0RA 4JQLA 1F98A 1S4RA 1XJ2A 2XDSA 1OTDA 2CMNA 2W0NA 1AM1A 3R4MA 4O05A 4HOIA 2VV6A 1OTEA 4HP4A 4WUDA 4XIPA 3INWA 2YEEA 5HSQA 1XFQA 4X9LA 2YK2A 1D7EA 2A24A 3LNUA 4MN6A 2JHEA 4EESA 4R1FA 5CTWA 4AWPA 4URLA 1S66L 4B7PA 1U2OA 5HZHA 4HJ3A 1AH6A 5M4NA 5G4YA 1XJ6A 2W27A 4HJ6A 1Z5AA 3ICYA 4WUCA 5F5RA 4CWRA 1OTIA 4DZYA 1V9YA 2WI3A 5FNDA 3C8CA 3EHJA 1DP9A 1I58A 5D6PA 1LSXA 4HH3A 5TBMB 3E4PA 4KP4A 3FV5A 1YSRA 1UY7A 3HYZA 2XJGA 3TZ5A 1Y28A 4R70A 1PVGA 4YKRA 2VW5A 1AMWA 1LT0A 2YK9A 1UWNX 1NHHA 3GIGA 3UB7A 3A0TA 1TILA 2AKPA 4E04A 3TZ0A 1BGQA 5FNFA 5F68A 2KX6A 2IORA 1THNA 2YEBA 1I5DA 4HZ0A 4L9GA 1GKXA 4JGRA 3R91A 4YKXA 2YKCA 4LRYC 5IS1A 2XJXA 1GSVA 1B3QA 2O1VA 4I39A 1ZWHA 4MPEA 1UGUA 3LPSA 1TIDA 3T1KA 3K3DA 4HY8A 4H7QA 2E0AA 1EI1A 4EGHA 4K4OA 3K3CA 4LRXC 5C93A 2XX4A 2VWCA 2YE8A 1MX0A 2XK2A 3GECA 2FWZA 1TS7A 4LPBA 3ZM7A 1YERA 2OWJA 1I5BA 1NHJA 3GIEA 4U7OA 3MFXA 1YT2A 4NH9A 3O6OA 3NOTC 1P0ZA 4BBTA 3SL2A 5J71A 4MOTA 3TZ2A 1XJ4A 4JASA 3NOPC 2WI1A 3LI9A 2M1CA 5M4EA 3H82A 2CCSA 4HZ5A 3RH8B 1US7A 3LIEA 3LI8A 2BREA 2PNRA 2D01A 4I38A 3BMYA 1YETA 3CRKA 4YKYA 2YE9A 2Q8HA 4JGOA 4EFTA 2YKJA 3T10A 2QJ5A 3F1NB 2FWYA 3WQ9A 3ZKBA 4GHIA 5M4HA 1UY9A 4HIAA 4F3LA 2YKEA 3IBRA 1JNUA 4NXFA 4UROA 2J80A 3FT8A 4WUJA 1YC4A 4BAEA 2XABA 1T1AA 4H6JB 2BU6A 2XDUA 3LUQA 3MQQA 3HEKA 1KOUA 4LWFA 3SW1A 3TZ4A 4MPNA 3D72A 3G6OA 3T0ZA 5F3KA 2V1AA 1YC1A 2CCUA 3F1OA 4EFUA 5AVFA 1H7SA 3C11A 4ZVIA 2XHRA 2YE3A 2PD8A 1UYDA 4EEHA 1TS0A 1OTAA 4MBCA 1AJ6A 2QG0A 4YKQA 3PHYA 5HDSA 2FXSA 3F1PA 2WI5A 3GIFA 3OWDA 3U67A 5D7RA 4YWZA 2H28A 4GS9B 2YGFA 3QDDA 4BBUA 3TUHA 4CE2A 4GT8A 5HWVA 2K7SA 1Z5BA 2YEDA 3P7NA 1QZRA 4XKAA 3VOLA 3CRLA 1EW0A 3U2DA 3WHAA 2ZOHA 1XJ3A 4O04A 5IDJA 4AWOA 4WN5A 4R38A 3A0ZA 3A0SA 5A8BA 1S1ZA 2Z6DA 1ID0A 5BOCA 4AS9A 5DKLA 3HJKA 3D2RA 3D0BA 2WKRA 4CE1A 3CWVA 4GEEA 3G75A 3G7EA 2H8MA 1GSWA 3F1PB 4GFNA 3HYYA 4HXWA 3EWKA 2YEHA 4KFGA 4V25A 3UB9A 2QG2A 5HDCA 5CTUA 2XDKA 1B63A 4BIZA 4CE3A 4I3HA 2WKQA 3OMUA 4XKKA 3D36A 2PYPA 3ZXOA 2EA9A 4XITA 1T1BA 3T2SA 1TH8A 4ASFA 3EHGA 2WEQA 4XD8A 2VV7A 3A0YA 2YEFA 1LSWA 2WKPA 1S16A 5F5YA 1S14A 2XX5A 3CAXA 1UYFA 2BZ5A 4CWPA 2BU5A 2BYIA 1UYHA 2IWUA 1T18A 5HWTA 4LP0A 2HV1A 2A24B 2VLGA 2XCMA 4WUBA 4KQDA 4HXZA 5DKKA 4L91A 4YKTA 3PEJA 1P97A 1KIJA 3LIBA 4XTJA 4EW7A 4GW9A 4KSHA 4CWQA 2R78A 4KTNA 2O1UA 1UY8A 4EGIA 3MNRP 4EXOA 3H80A 3RLPA 2VEAA 1VB6A 1GSXA 4I3IA 2YGEA 2YI7A 2FYPA 2K5BA 3JZ3A 4YKWA 3LYXA 3MR0A 4HI4A 4GCZA 4FCPA 5M4KA 4EEUA 4ASBA 1WA9A 4BIUA 3GIGB 3Q5JA 3UMDA 1N9NA 2YECA 2HG1A 2PYRA 4QPKA 4KQVA 4WL9A 3K98A 2XDLA 3NMQA 4K08A 1UYCA 2BYHA 1UYMA 4NXBA 4JGQA 1D06A 1YC3A 2L1MA 4PRXA 4HJ4A 5DJUA 2VV8A 2CG9A 1UYLA 3IS2A 4R6LA 5BODA 3PYPA 2Q8IA 4MB9A 2JKIA 2YI0A 4E00A 5L3JA 4JGPA 1GKZA 2CGFA 3B26A 1F9IA 4ASAA 3B27A 2V0WA 1NWZA 4EERA 5IDMA 3T0HA 2Q8FA 1GJVA 3O0IA 1I59A 4XC0A 5CF0A 3LIFA 4EM7A 1Z59A 4R3AA 2HCHA 4I3JA 1I5AA 4HQAA 1T1CA 4L90A 4NH7A 1BKNA 2EXLA 1DP8A 4GQTA 5F69A 2V1BA 2PR6A 1NHIA 2YE6A 3R92A 4XIRA 1UYEA 2YJWA 3H82B 4MN5A 4O07A 2V9AA 3EHHA 3ZQ5A 4H85A 2BASA 1OT9A 4XT2A 4HNBA 2GQPA 1V9ZA 2L0WA 2QJ7A 2VCJA 2XDXA 1OJGA 2C2AA 1KZNA 4JAVA 2BU2A 3A0VA 5CTXA 3TTZA 5HD5A 2QWSA 1TC6A 4GHIB 2H55A 4F3LB 4L94A 3OLOA 4CWOA 2YJXA 3G7BA 1MU5A 4MP7A 5CPHA 4FMTA 2PR5A 4LWEA 3BY8A 2YKHA 1Y4UA 1YT0A 3R4NA 3R4OA 3NOUC 4BQJA 3OWBA 4B6CA 5EFWA 2JN7A 4M4XA 4HYMA 2B02A 3Q5KA 1L0OA 3E4OA 3U2KA 3NJAA 3F1OB 4NH8A 4HYPA 1ZXMA 4L9EA 2YE4A 3EHFA 4HP9A 3OPDA 2ZBBA 4JAUA 1JM6A 4EQ1A 1BYWA 1A4HA 2ZDXA 3K99A 4CWFA 1B62A 1AH8A 2YGAA 3CGZA 3H4LA 3E4QA 3ULFA 3MQOA 1Y8PA 1TS8A 4LPZA 2BSMA 3CGYA 4HH2A 3BM9A 4PRVA 4XIQA 3RLRA 1Y8OA 4DUHA 2YI6A 4LWHA 2YI5A 5D7DA 2QHKA 3VHCA 5KIZA 2IOQA 1TC0A 4NXEA 1ODVA 3IEDA 4DJ3A 2XX2A 2WI6A 1N9OA 3C2WA 4P7AA 4R3MA 1DRMA 2KDKA 1BYQA 2IWXA 4FPPA 2Q8GA 4BQGA 2QKPA 1ZW9A 2GFDA 4ZKIA 4LRZE 4EGKA 3LIDA 1Y8NA 3UB6A 4HY6A 2WI7A 2O1WA 3A0XA 3B28A 3FC7A 3K97A 3FT5A 2XHTA 3KX0X 1R62A 5AVEA 2ZDYA 4FCQA 3EKOA 2WI2A 3ZXQA 4O0BA 3B33A 4DJ2A 3MXQA 4MP2A 5M4PA 2OOLA 3VADA 3ZKDA 2PHYA 2CH4A 1N9LA 4KUOA 3B25A 4B9OA 2XJJA 3HJIA 4PKYG 3CWFA 3RLQA 3VE3A 4EETB 5D7CA 4P8OA 2XHXA 1Y4SA 4O09A 2V0UA 5HWWA 3MJQA 5J4EA 4AWQA 5G4ZA 2WERA 2YE2A 4GGLA 4I3AA 4PKYA 3DGEA 5F6AA 5GGZA 1H7UA 2HKJA 2ZOIA 4CWTA 3RKZA 4RQ9A 2YKFA 5CTYA 5J7EA 4LLOB 4ASGA 1UYIA 2IOPA 2XD6A 3RTYA 3BWLA 3F1NA 4BXIA 1UWPX 4KUKA 4L9FA 1U0ZA 4PL9A 3KE6A 5D6QA 2VCIA 3UB8A 2L4RA 1TBWA 4Q20A 1S4SA 1I5CA 4H6JA 1QY8A 2PD7A 5HD3A 4MPCA 3B24A 2P7JA 1XFNA 5J6AA 5IU1A 4URMA 3VE4A 2QFOA 4YKZA 3HZ1A 4PU9A 4XE2A 5FWKA 2BTZA 3OW6A 1EA6A 4KSGA 5I5LA 3EKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ESAA 1BXDA 3LGOA 4EMVA 4URNA 1X0OA 4R4SA 4E02A 2WI4A 3IS2B 4GDNA 1YS3A 3VHDA 2JCHA 1PIOA 3C30A 4C75A 1OTBA 2PDRA 3C0EA 3INXA 4CWNA 4QJGA 3Q5LA 1ONHA 3LMMA 1SKOB 1YMXA 2PBDP 3KSIA 2EXAA 1WE4A 3IXDA 4E01A 3O86A 4NXGA 4M3KA 3RXXA 3QTFA 1G28A 2IWSA 1OJ5A 2UWDA 1UYKA 4FTXA 1QYEA 1UYGA 4E6XA 3O3VA 3O5YA 4WLAA 2HDRA 3LIAA 4GLQA 4OLGA 2YEIA 1YLYA 1S67L 3OOVA 4HHDA 4KZ5A 3WWXA 2ZBKB 5HAQA 2YKIA 3WS2A 3HZ5A 4H81A 1S6RA 3UMEA 5TBMA 4WF0A 2OV5A 4XUZA 1PWDA 3LR3A 3A0RA 1F98A 2K31A 1VHMA 4ARZA 2CMNA 1AM1A 3R4MA 4HP4A 3BQ8A 4XIPA 2YEEA 3LO7A 2YK2A 3E2LA 3A3EA 4EUVA 1D7EA 2Y59A 4DE2A 3LNUA 5EM0A 2C5WB 3PBSA 4R1FA 2WGWB 2W27A 2DCFA 4HJ6A 3IF6B 5CERA 4QY5A 1L0EA 4IHQA 5FNDA 3C8CA 1DP9A 2VK3A 3PBNA 1I5QA 3SH9A 4HH3A 4EV4A 3E4PA 4RYEA 3HLWA 3TZ5A 1PVGA 1BLSA 2XFSA 1LT0A 1Q2PA 3MKEA 5CGSA 3G32A 2WAFA 3IBJA 4E04A 4Y2FA 2HJ9C 4GB7A 2IORA 4K0XA 1THNA 4CPKA 3UNWA 4P87A 3R91A 5FQMA 4LV0A 1GSVA 3VFHA 1B3QA 1E3UA 4QD4A 3FKVA 4ME4A 2P04A 3IT9A 3GMWA 3HUNA 4DXBA 3K3CA 5C93A 2YE8A 1MX0A 1TS7A 4YOFA 3BM6A 4E3IA 4Y15A 1CQAA 3MFXA 3MKFA 4NH9A 4CLCD 4MOTA 3TZ2A 2WI1A 3OC2A 4ZJ3A 1US7A 3SH8A 3G2YA 3IX3A 3LI8A 4WZ5C 2W3HA 3CI6A 2D01A 2P74A 4GZBA 3RFBA 2E8IA 4GHIA 4F3LA 3IBRA 1JNUA 1K54C 4NXFA 4S2NC 3S1YA 2J80A 3CHWP 4BAEA 4H6JB 2HF6A 4LV2A 3AGDA 3N8SA 2EFUA 2M7UA 3C11A 3KSGA 4EEHA 4OKPA 1IOUA 2QG0A 2G2WA 3PHYA 3AGFA 5HDSA 3E0YA 3MS6A 3ZG8B 2WI5A 3ZVTA 3GIFA 1F2KA 1NZUA 4WM9A 3TRCA 3QDDA 3BLMA 1WYCA 5HWVA 4X68A 1QZRA 3HVFA 2X01A 1D1JA 3NDEA 4XKAA 2BTFP 5K5BA 3IQAA 3U2DA 1K4EA 1SHVA 3OCNA 4OPYA 4AWOA 1H8ZA 1YLPA 3A0ZA 1ES3A 5IT5A 5A8BA 1S1ZA 1ID0A 5BOCA 5DKLA 3D2RA 3T1RA 2WKRA 2Y2OA 5TFQA 2ACGA 4WMCD 3G7EA 2PBYA 5CRFA 2H8MA 4CLCE 4HXWA 2ZQ8A 3WS4A 4BWIA 2W1RA 2GNXA 4QY6A 2GZAA 3D36A 2V8CA 2HP9A 4ASFA 1PRQA 5EM1A 2WEQA 4XD8A 3A0YA 2YEFA 2WKPA 1S14A 4CWPA 3NDGA 2BYIA 4EBNA 2A24B 1MC0A 4HXZA 4L91A 1P97A 3M6HA 3LIBA 2ZLYA 1K55A 4E3MA 4N9KA 1KE3A 4Z9QA 5A92A 2ZC6B 1H0MA 1UY8A 1VM1A 2P9VB 1GHPA 2VX8A 2VZWA 4KZ6A 3IH9A 1KDWA 2JBFA 2FYPA 3MR0A 1PI4A 4DDYA 4ASBA 3ZYTA 5M18A 2ZL1A 4QPKA 5EECA 3LY4A 3VFFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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