4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
1S4SA 2JKIA 1AH8A 4JQLA 2VV8A 5D7DA 3H82A 4CE3A 2BYHA 3R4MA 3PYPA 4R3MA 2HCHA 4KUOA 2VCIA 3EHFA 2CH4A 2A24A 3TZ5A 3BMYA 1N9NA 4WN5A 1QY8A 3G7BA 1T1AA 4X9LA 3KE6A 3T2SA 1UYEA 1UY8A 1F98A 1H7UA 1OJ5A 2XDXA 4GEEA 4PRVA 3ULFA 3BM9A 2QJ5A 4AS9A 5EFWA 3IEDA 4WF0A 2BT0A 1U0ZA 2YEJA 5HDSA 2XHRA 2QHKA 5J4EA 3TUHA 1DP8A 1GKXA 2BTZA 4XT2B 5I5LA 3R91A 3NOTC 1G28A 1UY7A 2YE9A 1BXDA 4KQDA 4MN6A 2ZOIA 2YEHA 4NH9A 5CTYA 4LWFA 4ZVIA 3BY9A 3LI9A 1NHIA 2WEQA 3OWBA 4W7TA 4I3AA 4CWQA 4MPEA 4PRXA 4V25A 2W0NA 4BIUA 3MNRP 2QF6A 3HEKA 5CTXA 5DKKA 5J7EA 2WEPA 2XX5A 4KUKA 1EI1A 4HY6A 1YT2A 4I3JA 4O07A 4EESA 2CMNA 3Q5KA 3NOPC 5J71A 3F1OA 3MR0A 4NXBA 1ZXMA 2JHEA 3HJKA 4E02A 3F1NA 4CWOA 2D02A 3CWFA 4JASA 1WA9A 4WUBA 1Z5CA 3GIGB 3VHAA 2IOPA 4FCRA 4L8ZA 4XCJA 2KX6A 2QG2A 1Y4UA 4RQ9A 2O1VA 3IBRA 2V1BA 4P7AA 3JZ3A 2P7JA 3D2RA 3ICYA 4FPPA 2PR5A 3MQOA 4NH8A 4HY8A 4HI4A 1L0OA 1YERA 4XKAA 1AMWA 1I59A 4LWGA 5IDJA 1H7SA 2HV1A 1UYHA 3R4NA 2INWA 1LT0A 3A0VA 3BWLA 1TC0A 4EGIA 3H9WA 2VCJA 5CF0A 4HJ3A 1YESA 3CRLA 4I38A 2ESAA 3UB6A 1QYEA 1XJ6A 3LIEA 4Q20A 4LRXC 3QTFA 3LPSA 2XJJA 1DRMA 2XX2A 3VOLA 1TS8A 2YKEA 1OSFA 4LWIA 2YI6A 5HZHA 4WUJA 2BRCA 1EW0A 3B24A 3A0TA 4O05A 5IN9A 2QFOA 1YT0A 1BYQA 3LIFA 5IDMA 3FG8A 3GECA 2YK9A 2WI6A 1OTAA 3H7WA 1DP6A 3F1PA 4MOTA 4MPNA 3PHYA 1UYGA 5A8BA 4H6JB 3GDIA 4JGRA 2OWJA 3RKZA 3CGYA 4EEPA 2XDUA 2I9VA 2YKHA 3A0RA 1P97A 3IS2B 1PVGA 2XJXA 4GS9A 5D7RA 2XCMA 2YEFA 2V1AA 2FYPA 1Y8OA 4B6CA 2QJ7A 1Z5BA 1OT6A 4HJ4A 5FNDA 4BIZA 3B27A 3RTYA 5HWWA 5DKLA 5C93A 3NJAA 4BBVA 4KFGA 4BQGA 1NWZA 2YEEA 5M4PA 2PHYA 1XJ2A 5FNCA 1ODVA 2YGEA 3R92A 5DJTA 4XE2A 2H55A 2Q8FA 4B7PA 4FMTA 1BYWA 5F69A 5TBMB 2Q8HA 3SL2A 2YE4A 4MB9A 3K98A 2O1WA 3CWVA 4YKYA 2YECA 1TS7A 1GKZA 3UMDA 1OTBA 2VLGA 4DJ3A 1Z5AA 2AKPA 2YE8A 3HZ5A 4KSHA 5M4NA 1LSWA 2YI0A 1OTEA 1UYLA 4LWHA 2XD6A 4EXOA 3H82B 1T1CA 3HHUA 2CCSA 3HYZA 3G7EA 1YETA 2A24B 2WKPA 2VV6A 4O09A 2Z6CA 3C0EA 4HH3A 4EFUA 2YKBA 3UB8A 3K3DA 2YEAA 2V9AA 3B33A 2XX4A 4HJ6A 2XK2A 4LWEA 3K3CA 4HP4A 3VE4A 4ASGA 1KIJA 1MX0A 2J80A 2Q8GA 4URNA 4HHDA 1UWNX 4GCZA 4LPZA 3EKRA 4CWSA 4I39A 1BKNA 2VWCA 4GGLA 3U2DA 4QPKA 2R78A 5GGZA 2BU5A 3LI8A 3G75A 4YKZA 5HWVA 4XIPA 4EEUA 3K99A 5CTWA 4CE1A 3EHJA 5KIZA 3A0ZA 2YE2A 2YEGA 4LLOB 1YS3A 1S4RA 4DZYA 3MFXA 1I5DA 4YKXA 2K5BA 1NHHA 1S1ZA 1UGUA 2CGFA 5HDDA 4HZ0A 2ZOHA 4HNBA 4BBTA 2BU6A 3ZM7A 1YC3A 1I5AA 4H81A 4NH7A 3F1OB 5M4MA 3PEHA 2WKRA 1LSXA 1ZXNA 2CCTA 3C2WA 1GJVA 3F1NB 2XHTA 4XDMA 4JAVA 3H80A 3MQQA 3OPDA 3O2FA 4K4OA 4WUDA 4YKWA 4HY1A 3RLQA 4L93A 3RLPA 1V9ZA 2BU2A 2WI1A 2O1UA 3O0IA 5CPHA 3E4OA 4O0BA 2YJWA 1Y4SA 4ZKIA 2YEIA 2Q8IA 1I5BA 4R70A 3VADA 4E04A 5CTUA 2PYRA 3CRKA 4URLA 1V9YA 3C11A 4GT8A 2WERA 4XTJA 1Y8PA 4YKRA 3LIDA 3EHHA 3CLOA 2VW5A 3VHDA 1X0OA 4LRZE 5F6AA 4WL9A 4F3LA 2VEAA 4LPBA 3NOUC 1TBWA 2Q2EB 1S66L 2QG0A 5F5YA 3ZQ5A 4L94A 3B25A 4CE2A 3RH8B 4CWTA 4YWZA 2YKJA 4EEHA 1OT9A 3RLRA 4L9FA 4XC0A 1AH6A 2IWXA 3PEJA 3H7WB 3F1PB 4QPJA 4R1FA 3WQ9A 2QKPA 1B3QA 4NXGA 3U2KA 5AVFA 4BQJA 3LYXA 4M4XA 2V0WA 4NXEA 1GSWA 1QZRA 4U7NA 1MZUA 4ASFA 3TZ0A 1A4HA 4WUCA 5IU1A 4GS9B 2JN7A 4BAEA 2YKIA 2YI5A 5J6AA 4YKTA 3CAXA 3UB7A 4PU9A 2WI7A 2BZ5A 3LIAA 4HOIA 2L0WA 5AVEA 4EM7A 1TC6A 2XDKA 5BOCA 2GQPA 4EERA 2H28A 3P7NA 1D06A 1EA6A 4FCQA 4I5SA 1TIDA 2OOLA 4MPCA 4HH2A 2JJCA 2L4RA 4GQTA 4GHIA 4L90A 4YKQA 4MP7A 2L1MA 4BBUA 2ZDXA 4R3AA 4GHIB 1DP9A 2PYPA 2YEDA 4L9GA 1JM6A 2CG9A 3T0ZA 4EGHA 3MXQA 2WKQA 5BODA 2XJGA 1TILA 1D7EA 4HXZA 4URMA 5M4KA 4LP0A 4JGQA 4XKOA 2WI3A 1T18A 3EKOA 2WI5A 4CWRA 1OTIA 2GFDA 1KZNA 3D36A 4L91A 3INWA 3VHCA 2ZBBA 2ZDYA 3CGZA 4JGPA 3T0HA 1UYDA 1GSVA 4L9EA 2HKJA 5M4EA 1ZWHA 4EQ1A 1F9IA 5HDCA 3G6OA 4JAUA 3FC7A 5G4ZA 5HD5A 2WI2A 4XKKA 1YSRA 3GIEA 3UB9A 5D6PA 1UY9A 3OW6A 3A0SA 4KSGA 3MJQA 5FWKA 1P0ZA 3A0XA 3FV5A 3R4OA 1YC1A 2D01A 4K08A 1B62A 4CWFA 2YE6A 3KX0X 1AJ6A 4HP9A 4HXWA 4PL9A 2YKFA 2BU8A 1OTDA 1Y28A 2VV7A 2K7SA 1UYCA 2IWUA 5D7CA 1TS0A 4EMVA 1UYKA 4XT2A 1S16A 5G4YA 2BU7A 4GFNA 4YKUA 4EFTA 1KOUA 2YE7A 1YC4A 3NHQA 2KDKA 3EHGA 3Q5JA 1B63A 3HZ1A 2FWZA 5FNFA 4B9OA 1MU5A 2PNRA 2YK2A 2YGFA 4GW9A 4PKYG 4I3HA 2XABA 3T1KA 3QDDA 1N9LA 3OWDA 1S1YA 1GSXA 5J3WA 5DJUA 5L3JA 2YJXA 3C8CA 1R62A 3LNUA 4BXIA 2W27A 2C2AA 2FXSA 3FT8A 4CWPA 2HG1A 1I58A 4LRYC 1TS6A 2IOQA 2YKCA 1AM1A 3EEHA 2BREA 5M4HA 2OWHA 3A0WA 5F5RA 4AWQA 3GIGA 2M1CA 2IWSA 4FCPA 3U67A 3INXA 1UYMA 1XFQA 4ASAA 3R4PA 4R38A 1S67L 3B26A 1ID0A 4I3IA 1YT1A 2FWYA 1T19A 3A0YA 1S14A 3SW1A 2UWDA 3K60A 4O04A 3D0BA 3OMUA 4AWOA 3TTZA 1TH8A 2H8MA 3T10A 1XJ3A 5HD3A 3HYYA 4HQAA 1I5CA 2YI7A 4EGKA 1Y8NA 3LUQA 1LL8A 2XHXA 2IORA 2BSMA 2YGAA 2PD7A 4MBCA 5HSQA 4R6LA 3UE6A 4U7OA 4H85A 4F3LB 2PD8A 3FT5A 3H4LA 4H7QA 4V26A 1THNA 4XIRA 3TZ4A 1Z59A 4E00A 3OLOA 3E4PA 4MN5A 3Q5LA 4U93A 1YSZA 1N9OA 4AWPA 3HJIA 4HYMA 3LIBA 4PKYA 3TZ2A 4KQVA 4EETB 4CWNA 3ZXOA 2YE5A 4H6JA 2YE3A 1JNUA 1U2OA 3O6OA 4XITA 1VB6A 4E01A 4DJ2A 1UWPX 2BYIA 3DGEA 4KP4A 2B02A 3IS2A 3GIFA 3NMQA 4P8OA 3D72A 5IS1A 4HYPA 2YEBA 3LICA 4XD8A 4UROA 3B28A 2ZBKB 3ZKDA 1LSVA 3EWKA 3ZKBA 2V0UA 5F68A 2BASA 2PDRA 3E4QA 2E0AA 1T1BA 1UY6A 1OJGA 2CCUA 2XDSA 1ZW9A 4XIQA 2GJ3A 1XJ4A 5F3KA 2PR6A 2XDLA 1UYFA 4NXFA 1BGQA 4XCLA 4HZ5A 2Z6DA 5D6QA 1US7A 4ASBA 2EXLA 4WLAA 5TBMA 3WHAA 4JGOA 2EA9A 2WI4A 4DUHA 2QWSA 1XFNA 4HIAA 4KTNA 3VE3A 3BY8A 1UYIA 3K97A 4EW7A 3ZXQA 1NHJA 2ZKJA 3T50A 3UMEA 5HWTA 4MP2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CLCA 3Q82A 3UE1A 4ZAMA 4CE3A 1GCEA 2BYHA 4CLCB 4K91A 3EHFA 3TZ5A 2A24A 3R7WA 4JF6A 1PZPA 3UPOA 4X9LA 1NJ4A 5U47A 5E2FA 1UY8A 3C30A 2XDXA 2JC7A 5GHYA 3T1SA 4AS9A 1H0MA 3IEDA 1YQSA 4E6XA 4M3KA 5DTTA 3TOIA 2ZOIA 3MF0A 3BW6A 4GKUA 4LENA 4ZVIA 1YLPA 4BIUA 5GHXA 3HEKA 3PXPA 5DKKA 2WEPA 2XX5A 4KUKA 2Y4AA 3KSHA 1I5QA 1YSQA 2ZC7A 3N7WA 4MDZA 5A93A 3ZYTA 3Q5KA 3NOPC 3UDXA 2V8FA 5J71A 3F1OA 3CUEC 4E02A 1ZKJA 4CWOA 2D02A 4QWOA 3VHAA 2V8CA 4Q0HA 4FCRA 2Y2PA 4L8ZA 4XCJA 4MNRA 3VOYA 4RQ9A 4LCLA 1FCMA 3A3IA 2P7JA 3OCNA 3D2RA 2WZZA 2ZMVA 1SDNA 1QMEA 4E3NA 3RJUA 1AMWA 2ZQ9A 3IXDA 5DF8A 1PFLA 1HZOA 4R1GA 3BWLA 3A3FA 1H8YA 4O7DA 4JXSA 3WWXA 5IHVA 3LPSA 2W3EA 2XJJA 3G34A 2A2LA 3VOLA 2VA0A 3D3OA 2M7VA 2OV5A 3B24A 1XX2A 1LL9A 3QP4A 2JKRM 2WI6A 2R9WA 2VGLM 3TSGA 3H7WA 1DP6A 3F1PA 3NDEA 1KE3A 4II7A 4RA7A 1FR6A 2KLIA 2EXBA 3V3RA 2OWJA 3IS2B 1K4EA 2I72A 3O3VA 3Q1FA 2VX8A 1YMXA 1YLJA 4BIZA 1K57A 3B27A 5HWWA 5C93A 4BQGA 3IH8A 2PHYA 1ODVA 5AQBA 2EFUA 4XE2A 1J9MA 4WZ4A 5TBMB 5F69A 3SL2A 3MZFA 3JVUA 2YE4A 4MB9A 2Y2LA 4C3QA 2H5SA 3GSGA 1TS7A 1K56D 2VLGA 3OPRA 5M4NA 4S2OA 5EM1A 1OTEA 3B3XA 5EVLA 1SHVA 1T1CA 4E72A 3HHUA 5CEDA 1K0KA 2WKPA 2Z6CA 2WYXA 2O9CA 4EFUA 2YKBA 1FR1A 3ZG8B 3S7OA 4HJ6A 3LGOA 3NI9A 1KIJA 4YFMA 4URNA 1SKOA 4HHDA 1UWNX 4X1MA 4LPZA 1SKFA 4XXRA 3PBSA 4LV3A 4XIPA 3LR5A 5CHUA 3K99A 1AXBA 3N6IA 4DZYA 3MFXA 4YKXA 1S1ZA 2OLUA 2CGFA 5HDDA 1SZVA 3RXWA 4DE0A 4HZ0A 4DKIA 4BBTA 2BU6A 1WE4A 4H81A 4NH7A 3PEHA 1LSXA 2CCTA 1GJVA 3LFVA 3F1NB 3WS1A 4OQHA 2QMIA 4WUDA 4ZBEA 5K5BA 1AWIA 3RLPA 2GX5A 1V9ZA 4X68A 3O0IA 3E4OA 4O0BA 3KSIA 3WS5A 2YEIA 4IVKA 3NDGA 1K38A 1L0GA 5AQAA 3OOVA 4P85A 3CYGA 2PYRA 3C11A 4XTJA 4IVIA 4YKRA 3M2JA 3VHDA 1X0OA 4F3LA 2VEAA 4LPBA 1TBWA 1JWPA 4CE2A 2J3WA 4EEHA 4Z9QA 1D1JA 2EXAA 5EV0A 3DBAA 5FSRA 1KGGA 3UE3A 3CITA 4NXEA 3NULA 1MZUA 2HDRA 4K0XA 2E8JA 4YKTA 3HLCA 3LIAA 1CJFA 2ZC3B 4UQIS 1GA0A 4KZBA 1A0KA 4EERA 1EA6A 2OOLA 4RYEA 4ARZB 1FSWA 2L4RA 4L90A 3FPWA 2UV0E 4UHUA 4X69A 2ZDXA 1O7EA 2H0TA 1DP9A 2Q0OA 2BTFP 1JM6A 2CG9A 4EGHA 2WKEA 1TILA 4URMA 4HXZA 5M4KA 4O01A 4LP0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TS6 A;  2IOQ A;  2YKC A;  1AM1 A;  3EEH A;  2BRE A;  5M4H A;  2OWH A;  3A0W A;  5F5R A;  4AWQ A;  3GIG A;  2M1C A;  2IWS A;  4FCP A;  3U67 A;  3INX A;  1UYM A;  1XFQ A;  4ASA A;  3R4P A;  4R38 A;  1S67 L;  3B26 A;  1ID0 A;  4I3I A;  1YT1 A;  2FWY A;  1T19 A;  3A0Y A;  1S14 A;  3SW1 A;  2UWD A;  3K60 A;  4O04 A;  3D0B A;  3OMU A;  4AWO A;  3TTZ A;  1TH8 A;  2H8M A;  3T10 A;  1XJ3 A;  5HD3 A;  3HYY A;  4HQA A;  1I5C A;  2YI7 A;  4EGK A;  1Y8N A;  3LUQ A;  1LL8 A;  2XHX A;  2IOR A;  2BSM A;  2YGA A;  2PD7 A;  4MBC A;  5HSQ A;  4R6L A;  3UE6 A;  4U7O A;  4H85 A;  4F3L B;  2PD8 A;  3FT5 A;  3H4L A;  4H7Q A;  4V26 A;  1THN A;  4XIR A;  3TZ4 A;  1Z59 A;  4E00 A;  3OLO A;  3E4P A;  4MN5 A;  3Q5L A;  4U93 A;  1YSZ A;  1N9O A;  4AWP A;  3HJI A;  4HYM A;  3LIB A;  4PKY A;  3TZ2 A;  4KQV A;  4EET B;  4CWN A;  3ZXO A;  2YE5 A;  4H6J A;  2YE3 A;  1JNU A;  1U2O A;  3O6O A;  4XIT A;  1VB6 A;  4E01 A;  4DJ2 A;  1UWP X;  2BYI A;  3DGE A;  4KP4 A;  2B02 A;  3IS2 A;  3GIF A;  3NMQ A;  4P8O A;  3D72 A;  5IS1 A;  4HYP A;  2YEB A;  3LIC A;  4XD8 A;  4URO A;  3B28 A;  2ZBK B;  3ZKD A;  1LSV A;  3EWK A;  3ZKB A;  2V0U A;  5F68 A;  2BAS A;  2PDR A;  3E4Q A;  2E0A A;  1T1B A;  1UY6 A;  1OJG A;  2CCU A;  2XDS A;  1ZW9 A;  4XIQ A;  2GJ3 A;  1XJ4 A;  5F3K A;  2PR6 A;  2XDL A;  1UYF A;  4NXF A;  1BGQ A;  4XCL A;  4HZ5 A;  2Z6D A;  5D6Q A;  1US7 A;  4ASB A;  2EXL A;  4WLA A;  5TBM A;  3WHA A;  4JGO A;  2EA9 A;  2WI4 A;  4DUH A;  2QWS A;  1XFN A;  4HIA A;  4KTN A;  3VE3 A;  3BY8 A;  1UYI A;  3K97 A;  4EW7 A;  3ZXQ A;  1NHJ A;  2ZKJ A;  3T50 A;  3UME A;  5HWT A;  4MP2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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