4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
4WUBA 4E02A 2QG0A 2HV1A 1S1YA 3B25A 4WN5A 2HKJA 4FCRA 4V26A 2YI0A 4B7PA 4L90A 4BIUA 2FYPA 2FWZA 3EHGA 3OLOA 3SL2A 3GDIA 5M4KA 1YT0A 2BT0A 3UB8A 3D0BA 2V1BA 1Y8PA 4O07A 3TUHA 4FPPA 4U7OA 1V9YA 2BYIA 3LI8A 4EEHA 4XITA 5IS1A 4LWFA 4PRXA 2P7JA 3VHDA 2BU8A 3LUQA 4WUJA 1YC1A 4BXIA 4PL9A 2CGFA 3INWA 3ZQ5A 3TTZA 4E01A 4LRZE 4URMA 4YKZA 4BAEA 3F1OB 4CWOA 1YT1A 2YE8A 4LWHA 4LRXC 1Z5BA 1US7A 3NOTC 1LT0A 1UYCA 4HXZA 5DJTA 1ZW9A 3LIFA 4HYPA 5BOCA 2QKPA 5TBMB 1UYMA 2YE9A 4Q20A 4EERA 5CTUA 5CPHA 2K7SA 1S66L 2PYPA 4L93A 4XD8A 1GKXA 4YKUA 2O1UA 3LIEA 4JGQA 3CAXA 1NHIA 5GGZA 2XX2A 2O1WA 3OW6A 3D36A 5IDJA 3C2WA 5DJUA 1YS3A 4EM7A 1BGQA 1T1CA 4WUCA 1TILA 1V9ZA 3ZXOA 4CWNA 4MN6A 3O0IA 2I9VA 2XJXA 5HWTA 4ASBA 2YEDA 2YI7A 4NH8A 5F69A 4HJ4A 4R70A 1DRMA 5D7RA 1UYEA 3HJIA 1LL8A 1ID0A 2XJJA 3H7WB 2HCHA 5HDCA 1D06A 3H4LA 3FT5A 5DKLA 1GSXA 2PR5A 4FCQA 1QY8A 4HH2A 2V0UA 1AM1A 1Z5CA 2IWXA 2Q8GA 1YC4A 3MXQA 4EXOA 3O6OA 3RKZA 4GS9B 1GKZA 1QZRA 1UY6A 1U0ZA 1G28A 4KUOA 4BBUA 2WERA 2YI5A 3A0VA 3K60A 3K97A 2YEHA 2VV6A 3G7BA 4JAUA 5FNCA 1GJVA 4L91A 3A0XA 1GSWA 3A0ZA 3TZ2A 1XJ3A 2QWSA 4MP2A 3OMUA 4XTJA 4YKYA 4XE2A 1TS0A 1P97A 2BYHA 4HYMA 2H8MA 5F3KA 5J6AA 4XKAA 1TS8A 3PEHA 4XCJA 2WEQA 3R4PA 4HIAA 1A4HA 4H6JA 3VE3A 4EEPA 2BZ5A 4AWPA 4EMVA 2PR6A 4O04A 1TS7A 3F1OA 3OWDA 4EEUA 5D6PA 3CGZA 4GGLA 4MN5A 1B63A 3LI9A 1X0OA 1OTIA 4JGRA 2YK9A 4MB9A 5TBMA 4FCPA 3GECA 3WQ9A 2QFOA 2BTZA 3HEKA 5F68A 2VLGA 3CRLA 4CWTA 2E0AA 5HSQA 3OPDA 2IOPA 4PKYA 4EGHA 2W0NA 2XK2A 3NJAA 5IU1A 1XFNA 3VE4A 3F1NB 4I3AA 4L9FA 2AKPA 3FT8A 5J71A 4EGIA 3FV5A 2KDKA 2XABA 4PKYG 1UYLA 1S1ZA 2EA9A 3D72A 3MNRP 1YETA 4O05A 2XX4A 2JN7A 2QG2A 1EW0A 2VV8A 2VW5A 4KFGA 3A0WA 1I5BA 4UROA 4R38A 5M4NA 5FWKA 3NOPC 1B3QA 4M4XA 3IEDA 1Z59A 3LYXA 4LPZA 3LPSA 2VCJA 4HJ6A 4BQJA 4ASAA 3R4OA 4ASGA 2JJCA 2Z6CA 4NH7A 1XFQA 2ESAA 4DJ3A 4HP4A 5HD3A 3H7WA 2C2AA 3UB7A 4L9GA 3PYPA 4O09A 2OWHA 2YEJA 2YKHA 4I3JA 4R1FA 5CTYA 1S14A 1QYEA 2OOLA 1KIJA 3KE6A 5L3JA 1YC3A 4I3HA 2WKRA 3VADA 2YE4A 4CE1A 4XDMA 1TC0A 4GS9A 4QPJA 3EHFA 1OJ5A 1Y8OA 1NHJA 2IORA 1OJGA 3DGEA 3H82B 2A24B 3K3DA 2YKBA 3G75A 2IOQA 4F3LB 4LLOB 2CCSA 4XCLA 1OTAA 1VB6A 3PEJA 2XX5A 4JQLA 4XC0A 3T2SA 1U2OA 3R4MA 5HDDA 3ULFA 2YJWA 3UE6A 1OT6A 2W27A 2YE6A 4LPBA 2YEFA 1ODVA 1I5CA 1XJ4A 4NXFA 1UYIA 2H28A 2PD7A 4H85A 3WHAA 4ASFA 4HH3A 4XIPA 2PYRA 4DUHA 4MPCA 2XHTA 2V0WA 1OT9A 4NXBA 2YECA 4PU9A 4DZYA 4KTNA 1T18A 3UMDA 2BU7A 4HJ3A 4CE3A 2L0WA 3KX0X 1Y4SA 3HZ1A 2V9AA 4GHIB 3UMEA 1P0ZA 5D6QA 2WI5A 3D2RA 1YERA 1TBWA 3T1KA 1F9IA 4HNBA 2BRCA 4HHDA 4CWSA 1BYQA 4MOTA 5G4ZA 4CWFA 4CWQA 1XJ6A 4JAVA 3F1NA 2XJGA 5HZHA 4KSHA 3O2FA 4K4OA 2YGAA 2GJ3A 1I5DA 1WA9A 2YKCA 1UGUA 4E04A 4FMTA 2Q8IA 2CCUA 2O1VA 2YKJA 3ZXQA 2QJ5A 2WI4A 2ZOIA 3B28A 2Z6DA 2GQPA 3K98A 4XIQA 2CMNA 2BASA 1UYDA 3BM9A 3UB9A 3FC7A 3VOLA 3SW1A 2UWDA 4YKTA 4XT2B 2B02A 4HXWA 1ZXNA 3MQQA 3Q5JA 3EEHA 4AWQA 1D7EA 3H80A 1F98A 2PDRA 2ZDXA 3EWKA 1LSVA 3HYZA 3LIDA 4GQTA 5J4EA 5G4YA 4LWGA 1Y28A 1JNUA 2M1CA 2YEEA 2K5BA 1DP8A 4LWEA 5IN9A 2WEPA 5AVFA 4EW7A 4L9EA 3RH8B 1T1AA 1Y8NA 3HHUA 1S16A 2ZKJA 5M4MA 1MU5A 3H82A 2A24A 4XKOA 3ZKDA 3T50A 4JASA 4F3LA 3LNUA 1DP9A 3FG8A 4GEEA 1UWNX 4BQGA 3U67A 2ZBKB 3C11A 3GIGB 2D02A 5C93A 4NH9A 4H81A 3T0ZA 2PHYA 1GSVA 1NHHA 2YEAA 2YEBA 2V1AA 2XDXA 3A0YA 2YKFA 4GW9A 4I38A 4BIZA 2WI2A 3P7NA 3A0RA 4R3AA 2FWYA 2YGEA 1MZUA 3GIFA 5HWVA 1TIDA 3VHAA 4KSGA 5D7CA 2VCIA 2J80A 1YESA 3Q5KA 5DKKA 2XDUA 4GT8A 4WUDA 4P7AA 4U7NA 4CWRA 3ZKBA 1I59A 2WI1A 5BODA 1AJ6A 2WI6A 3IBRA 4GHIA 2QJ7A 3F1PB 1I58A 1TS6A 1T19A 1EA6A 2R78A 4PRVA 2YGFA 4MPNA 3QDDA 3HZ5A 1EI1A 3CWVA 4P8OA 4WL9A 3TZ4A 3LICA 4EQ1A 3GIEA 1YSRA 3B24A 5FNFA 4HZ5A 1OTDA 2OWJA 2YKEA 4YKRA 1UYGA 5J7EA 3A0TA 3Q5LA 1BYWA 5AVEA 5F5RA 4LRYC 2VWCA 3RLPA 2XHRA 3CGYA 4HY1A 4L94A 4NXGA 3MR0A 1TH8A 4HZ0A 3IS2B 1H7SA 2BU2A 2Q8FA 4URLA 1R62A 4AS9A 1PVGA 1ZXMA 4XT2A 2D01A 3NMQA 2KX6A 3K3CA 1UYKA 2ZOHA 2BU6A 3OWBA 5M4HA 2ZBBA 2VV7A 4H6JB 4U93A 4E00A 3RLRA 4GFNA 1UWPX 3ICYA 4HQAA 1UY8A 2H55A 1I5AA 4MP7A 2CCTA 3BMYA 4XKKA 4ZVIA 4I5SA 4WLAA 4V25A 4HP9A 3MFXA 3U2DA 2XDSA 1KOUA 4RQ9A 2PD8A 1T1BA 2YEIA 2EXLA 2XHXA 3EHHA 4WF0A 4W7TA 2JKIA 4MBCA 2WKPA 2BU5A 3PHYA 1Z5AA 2QF6A 3G7EA 3GIGA 3T0HA 2GFDA 2VEAA 5D7DA 4ZKIA 3E4QA 1UY9A 1AMWA 1S67L 4YWZA 5A8BA 1UYHA 1OTEA 4KP4A 2YEGA 4AWOA 1S4RA 1UYFA 3TZ0A 4EGKA 1KZNA 3UB6A 3EHJA 4KUKA 4KQDA 3B26A 1YSZA 1JM6A 1OSFA 4CE2A 1ZWHA 3TZ5A 1N9NA 5J3WA 2Q8HA 1H7UA 4NXEA 3F1PA 1AH6A 1OTBA 5F5YA 2CH4A 2INWA 4HY6A 1AH8A 1LSXA 1THNA 5CF0A 4I3IA 2CG9A 3MJQA 3ZM7A 3EKRA 1Y4UA 4R6LA 3BY8A 3B33A 4LWIA 5M4EA 4QPKA 4BBVA 1TC6A 2YE5A 3RLQA 4X9LA 3R4NA 3JZ3A 4JGPA 2XCMA 1N9LA 3E4PA 2YI6A 5HD5A 1NWZA 1BXDA 5HDSA 4L8ZA 4DJ2A 5EFWA 3B27A 3IS2A 3R92A 5HWWA 4YKWA 3LIBA 4R3MA 1L0OA 2YE3A 1YT2A 3CWFA 4EESA 4H7QA 2PNRA 4EFUA 2IWSA 2YE2A 3A0SA 3VHCA 3H9WA 5I5LA 3QTFA 3C8CA 3HYYA 5KIZA 2YJXA 3CLOA 3LIAA 5FNDA 2WI7A 1BKNA 2FXSA 4XIRA 2HG1A 3R91A 2YE7A 4URNA 4K08A 2XDLA 1N9OA 4JGOA 3K99A 2BREA 1LSWA 2XDKA 2YK2A 3INXA 5F6AA 4HY8A 4BBTA 4YKXA 3CRKA 4KQVA 2Q2EB 5CTWA 4MPEA 1DP6A 2ZDYA 4HI4A 1XJ2A 3BY9A 4B6CA 4LP0A 2L4RA 4EETB 4GCZA 3HJKA 2QHKA 3NOUC 4B9OA 1B62A 3T10A 3U2KA 3EKOA 4I39A 2WKQA 1MX0A 1S4SA 4YKQA 2BSMA 5M4PA 3NHQA 2L1MA 3RTYA 1UY7A 4EFTA 3MQOA 2XD6A 5CTXA 3BWLA 4CWPA 2IWUA 2YKIA 3E4OA 3C0EA 4O0BA 4HOIA 2JHEA 3G6OA 5IDMA 2WI3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WUBA 2QG0A 1KDSA 4WEKA 4WN5A 4ETXA 2HKJA 2YI0A 3BFCA 5M4KA 1G6AA 1YT0A 5CHMA 4X69A 1Y8PA 3DTMA 4QHCA 1V9YA 4EQIA 1Y4OA 4PRXA 2P7JA 3VHDA 4R23A 3U4LP 2UV0E 2P9VB 4E3KA 4HESA 4ZJ2A 3CUEC 5K5BA 3SH7A 3INWA 1PWGA 4YKZA 1NZOA 3F1OB 3CITA 3N6IA 4ZAMA 4DMZA 3PBQA 1LT0A 1YLPA 1ZW9A 4X1LA 3C30A 1BLHA 4KZ7A 2QKPA 1ES2A 2Y79A 4YOFA 4CLCD 3WS2A 5CPHA 2K7SA 1YM1A 1GKXA 3LIEA 3CAXA 5GGZA 3C2WA 4EM7A 1YPRA 4HBTA 1TILA 3RXXA 3D4FA 4MN6A 3E0YA 5TGFA 5HWTA 4MMNA 4ASBA 1KE4A 1FIKA 5F69A 3OOVA 4ZBEA 5KSCA 4KQQA 3UE1A 1K6SA 1ID0A 2HHIA 2HCHA 3BYDA 1D06A 3H4LA 4DE3A 1GSXA 2PR5A 4S2LA 1SDEA 3VSKA 4RX2A 2Q8GA 4EXOA 1UY6A 4ETZA 1XKZA 2YEHA 3G7BA 4IBXA 4L91A 4MP2A 3OMUA 1TS0A 1P97A 5EUAA 2ZM0A 2BYHA 5FDSA 2WEQA 5DF9A 1OMEA 4EEPA 3UY6A 4AWPA 5EOOA 1XX2A 2XR0A 4EEUA 4X25A 3D3OA 4GGLA 2P04A 4BQMA 3LI9A 1X0OA 2W3HA 4IHQA 4JGRA 4HBUA 3WQ9A 2OLUA 4N1XA 5HSQA 1F5MA 2W0NA 2XK2A 3VP0A 1J9MA 4BL2A 4L9FA 4I3AA 3JPUA 3FV5A 4KZ8A 5EVLA 2Q9NA 4OKPA 1UYLA 2JN7A 2QG2A 2VW5A 1I5BA 1JVJA 2J9PA 5FWKA 1B3QA 3FV7A 4M4XA 3IEDA 3LYXA 2E8JA 2VCJA 1NY0A 4BQJA 2V20A 2JC7A 1PIOA 2ESAA 5EV0A 4KZ3A 4BJPA 4O09A 2OWHA 2YEJA 2YKHA 4I3JA 5CTYA 1QYEA 3VP4A 2LB5A 3IH9A 1YC3A 4I3HA 3VFFA 4XDMA 3G35A 3EHFA 1Y8OA 4OQ0A 3T4LA 2IORA 5CTNA 4C6YA 3DTEA 3LR5A 4LLOB 2CCSA 1KVMA 4JQLA 4AFIA 4X1MA 3R4MA 3RXWA 3DW0A 5HAIA 3HCYA 5CHJA 1OT6A 4L0LA 4LPBA 2WAFA 1XJ4A 4NXFA 4IBRA 1LI0A 4OP8A 2PYRA 3ZCZA 5CX7A 3M2JA 2XSSA 4PU9A 3UMDA 2J7VA 4X53A 4CE3A 1Q2PA 4Y5FA 3KX0X 1CEFA 3W4OA 4JF5A 1DJBA 3T1SA 5D6QA 3T1KA 4E3OA 4MOTA 5AJGA 1XJ6A 3PXPA 4JAVA 3BFDA 4KSHA 4OQHA 2HDRA 3NI9A 1K57A 1UGUA 3IX4A 1MWUA 2Y55A 2CCUA 1K54C 2O1VA 2YKJA 2QJ5A 2GQPA 4ZRRA 2K31A 1FILA 3ZDJA 3UB9A 3BW6A 1RCJA 2B02A 3L9KA 4CLCB 1K4EA 2VZWA 3Q5JA 2XA7S 4Y0UA 4Y15A 3EWKA 1LSVA 3BFFA 2C1IA 3LIDA 4GQTA 4YNRA 5CXWA 5G4YA 4LWGA 1TVFA 3UNWA 2M1CA 4N9KA 5KZHA 2YEEA 4LWEA 3VV4A 5L07A 3MS6A 4PM6A 3RH8B 1T1AA 1Y8NA 4EWFA 3HHUA 1S16A 2ZKJA 1MU5A 3H82A 1XP4A 3T50A 4F3LA 3UDFA 1DP9A 4MEZA 1PI5A 3CUEA 2A3UA 5HPIA 3HLWA 1VETB 4NH9A 2Y2NA 1GSVA 2XDXA 3A0YA 2YKFA 4OLDA 4LENA 1KGGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TS6 A;  1T19 A;  1EA6 A;  2R78 A;  4PRV A;  2YGF A;  4MPN A;  3QDD A;  3HZ5 A;  1EI1 A;  3CWV A;  4P8O A;  4WL9 A;  3TZ4 A;  3LIC A;  4EQ1 A;  3GIE A;  1YSR A;  3B24 A;  5FNF A;  4HZ5 A;  1OTD A;  2OWJ A;  2YKE A;  4YKR A;  1UYG A;  5J7E A;  3A0T A;  3Q5L A;  1BYW A;  5AVE A;  5F5R A;  4LRY C;  2VWC A;  3RLP A;  2XHR A;  3CGY A;  4HY1 A;  4L94 A;  4NXG A;  3MR0 A;  1TH8 A;  4HZ0 A;  3IS2 B;  1H7S A;  2BU2 A;  2Q8F A;  4URL A;  1R62 A;  4AS9 A;  1PVG A;  1ZXM A;  4XT2 A;  2D01 A;  3NMQ A;  2KX6 A;  3K3C A;  1UYK A;  2ZOH A;  2BU6 A;  3OWB A;  5M4H A;  2ZBB A;  2VV7 A;  4H6J B;  4U93 A;  4E00 A;  3RLR A;  4GFN A;  1UWP X;  3ICY A;  4HQA A;  1UY8 A;  2H55 A;  1I5A A;  4MP7 A;  2CCT A;  3BMY A;  4XKK A;  4ZVI A;  4I5S A;  4WLA A;  4V25 A;  4HP9 A;  3MFX A;  3U2D A;  2XDS A;  1KOU A;  4RQ9 A;  2PD8 A;  1T1B A;  2YEI A;  2EXL A;  2XHX A;  3EHH A;  4WF0 A;  4W7T A;  2JKI A;  4MBC A;  2WKP A;  2BU5 A;  3PHY A;  1Z5A A;  2QF6 A;  3G7E A;  3GIG A;  3T0H A;  2GFD A;  2VEA A;  5D7D A;  4ZKI A;  3E4Q A;  1UY9 A;  1AMW A;  1S67 L;  4YWZ A;  5A8B A;  1UYH A;  1OTE A;  4KP4 A;  2YEG A;  4AWO A;  1S4R A;  1UYF A;  3TZ0 A;  4EGK A;  1KZN A;  3UB6 A;  3EHJ A;  4KUK A;  4KQD A;  3B26 A;  1YSZ A;  1JM6 A;  1OSF A;  4CE2 A;  1ZWH A;  3TZ5 A;  1N9N A;  5J3W A;  2Q8H A;  1H7U A;  4NXE A;  3F1P A;  1AH6 A;  1OTB A;  5F5Y A;  2CH4 A;  2INW A;  4HY6 A;  1AH8 A;  1LSX A;  1THN A;  5CF0 A;  4I3I A;  2CG9 A;  3MJQ A;  3ZM7 A;  3EKR A;  1Y4U A;  4R6L A;  3BY8 A;  3B33 A;  4LWI A;  5M4E A;  4QPK A;  4BBV A;  1TC6 A;  2YE5 A;  3RLQ A;  4X9L A;  3R4N A;  3JZ3 A;  4JGP A;  2XCM A;  1N9L A;  3E4P A;  2YI6 A;  5HD5 A;  1NWZ A;  1BXD A;  5HDS A;  4L8Z A;  4DJ2 A;  5EFW A;  3B27 A;  3IS2 A;  3R92 A;  5HWW A;  4YKW A;  3LIB A;  4R3M A;  1L0O A;  2YE3 A;  1YT2 A;  3CWF A;  4EES A;  4H7Q A;  2PNR A;  4EFU A;  2IWS A;  2YE2 A;  3A0S A;  3VHC A;  3H9W A;  5I5L A;  3QTF A;  3C8C A;  3HYY A;  5KIZ A;  2YJX A;  3CLO A;  3LIA A;  5FND A;  2WI7 A;  1BKN A;  2FXS A;  4XIR A;  2HG1 A;  3R91 A;  2YE7 A;  4URN A;  4K08 A;  2XDL A;  1N9O A;  4JGO A;  3K99 A;  2BRE A;  1LSW A;  2XDK A;  2YK2 A;  3INX A;  5F6A A;  4HY8 A;  4BBT A;  4YKX A;  3CRK A;  4KQV A;  2Q2E B;  5CTW A;  4MPE A;  1DP6 A;  2ZDY A;  4HI4 A;  1XJ2 A;  3BY9 A;  4B6C A;  4LP0 A;  2L4R A;  4EET B;  4GCZ A;  3HJK A;  2QHK A;  3NOU C;  4B9O A;  1B62 A;  3T10 A;  3U2K A;  3EKO A;  4I39 A;  2WKQ A;  1MX0 A;  1S4S A;  4YKQ A;  2BSM A;  5M4P A;  3NHQ A;  2L1M A;  3RTY A;  1UY7 A;  4EFT A;  3MQO A;  2XD6 A;  5CTX A;  3BWL A;  4CWP A;  2IWU A;  2YKI A;  3E4O A;  3C0E A;  4O0B A;  4HOI A;  2JHE A;  3G6O A;  5IDM A;  2WI3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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