4E7KA

Pfv integrase target capture complex (tcc-mn), freeze-trapped prior to strand transfer, at 3.0 a resolution
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
DAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Recombination/dna
molecule keywords Pro-Pol polyprotein
publication title 3'-Processing and strand transfer catalysed by retroviral integrase in crystallo.
pubmed doi rcsb
source organism Human spumaretrovirus
total genus 96
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2012-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4e7kA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 4e7kA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4e7kA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4e7kA03
3ZSYA 2B4JA 2WACA 3OYGA 3QJ6A 1Q9YA 3PX0A 3L42A 2EHGA 3OYJA 3KKSA 3OS1A 1JLFA 4CK1A 2HHVA 3O3HA 3META 3EY1A 4CGJA 2KZMA 4FJ9A 3HL8A 1GOBA 3SZ2A 3SQ1A 4DLEA 4C8LA 3LWLA 4M42A 2G8UA 1SL1A 3G10A 2HHXA 3OYIA 2RO0A 3C6UA 3ZSVA 4KHNA 4AHCA 4DTPA 4ELTA 4OLAA 2Y1JA 4IUUA 3M8QA 5J2PA 4FJIA 1LAVA 1NK8A 3QERA 2YKNA 3PFSA 1EETA 4FLVA 1RT3A 1CZ9A 3AO2A 4OKJA 2JGUA 3OMCA 2G3RA 3PX6A 4CJLA 2BKDN 4E3SA 2G8VA 3DOKA 1NOZA 3AO4A 4J2BA 3SUOA 3AV9A 2RHZA 4KHYA 5DK5A 4OKEA 2YNFA 2G8KA 1XWLA 1U4BA 4FLTA 4B9VA 2DAQA 4Z4GA 1VSLA 1NKEA 2OPRA 3LP1A 4MQ3A 1HQUA 1NJZA 2G8HA 3NGZA 2X6NA 4OPKA 2F5KA 2XY6A 4FJXA 1WLJA 3QEVA 5SZTA 1T7PA 2A1SA 1VRTA 2BDPA 1HYZA 1ITGA 1DTTA 1NK4A 3CQ8A 2GBZA 3PMIA 3OYNA 2VG7A 3D45A 3VQ7A 4BE2A 5E41A 3VQ5A 3RMBA 4HUEA 1NKBA 3AVKA 3C4SA 3SNNA 3TI0A 4CEFA 3ZSQA 2LTOA 2AJQA 3LAKA 1JLQA 3AO3A 4B8AB 1L3UA 2ATQA 4OGEA 1RT7A 1NK0A 3TABA 2RF2A 5EU7A 4ZTJA 3P8DA 4YNQA 4CEDA 1VRUA 4KI6A 3ZCMA 4BDPA 3FDRA 3AVNA 4ZTFA 2E6LA 3U3YA 5C42A 3QEWA 2PYJA 4DSKA 2O4XA 1J9AA 3DOLA 3KLEA 4HCCA 5KGWA 2NLUA 4FZYA 2RHUA 2QXFA 2HQXA 5D6YA 3LP3A 2X74A 2JZ2A 1SL0A 2RJEA 1RTDA 1TK5A 4I9LA 1IO2A 1Q8IA 1S1VA 5CY4A 3LP2A 2DFEA 1NK5A 1JLAA 1G15A 1NK9A 4KAZA 1WAJA 3NDKA 4H4MA 1C1CA 3H08A 2XY5A 4NCAA 1SKWA 5D6WA 2BGGA 1ZYQA 1OI1A 3AVIA 3HO1A 2RHIA 3PNWC 3QETA 4ID5A 4QQ6A 4DTOA 4F2SA 3L8BA 4CJKA 3BDPA 4FLXA 1KSPA 4N56A 1X9WA 1J54A 4KHWA 1S1UA 5KE3A 3K2PA 3ASMA 3L2WA 3H8ZA 2PZSA 3I8DA 3HVRA 1VSIA 1BHLA 4CFCA 2X4WA 4H4OA 3VQDA 4QVZA 4L8RB 2VG6A 4J2DA 1KLNA 3KJVA 4DS4A 1IKVA 1X9SA 5HRPA 3LYIA 4FM1A 5D6XA 4CEOA 2RI3A 1JLGA 3ZSXA 3OA6A 1BI4A 3M8SA 4DSIA 4KFBA 1A5XA 3MEDA 4BE1A 1KTQA 2D0BA 1BCMA 4CFDA 4F8RA 5HBMA 3MP1A 4OLBA 4KB0A 1JL2A 1FK9A 4FJ8A 4FJMA 4F3OA 3OS0A 3ASKA 2EKOA 4CEQA 3HVTA 4E7HA 3OQ5A 3HPOA 2DTUA 4TSXA 3LH0A 4KB1A 3FLGA 4W5QA 3VQBA 4A4FA 4QAGA 1S1WA 1N5YA 4M3ZA 3WNGA 5CYQA 4Q0BA 2GUIA 2D5RA 3LPTA 4KO0A 4A4EA 4E7KA 1IG9A 3CYMA 2FBXA 2YNIA 4OVLA 1BIUA 2R7YA 4DQSA 4ELUA 4DQPA 1BQNA 4DFPA 3PO5A 4YFUA 1VSHA 2LCCA 2OPQA 1IKYA 2DIQA 3V4IA 3HM9A 1WN7A 2L3RA 2VG5A 4CF8A 3TANA 4FLYA 1UA0A 5FRMA 4R5PA 3VA0A 4LSNA 2HVIA 4FJ5A 3AVAA 3AVFA 5FROA 4IURA 1A5WA 4EZ6A 1QS4A 1WSHA 3LZJA 4CJ3A 3ZSRA 3SCXA 1B92A 1HQEA 2RHYA 3F73A 4UQGA 1ASVA 4I9QA 3RR8A 1ASUA 4RW7A 3EAEA 1RBVA 4RW4A 4CGIA 1JLBA 2R5AA 1LWCA 5J2NA 3HPHA 2L89A 2VWKA 3KKRA 1RT2A 4LH5A 1KFSA 3LALA 2ETJA 2VWJA 2HVHA 4CJFA 4CJRA 4DTSA 2EX3A 1D9FA 1C0MA 1S6PA 4FCYA 4E7LA 3NTIA 3VA3A 4O0IA 4FLUA 3DB4A 4XIUA 4LH4A 4CK3A 5M9OA 4M45A 2LDMA 5IAYA 3LDSA 4DTNA 4LD0A 3LGFA 4OPJA 2FBTA 3KD5E 2BUDA 3CEYA 1TL3A 4JS5A 3RRGA 3FFIA 3IS9A 2HW3A 1Y97A 1GOAA 4W5NA 2B5JA 3S3NA 3MEUA 1X9MA 2IS3A 3ULDA 3CM5A 1S1XA 1FXXA 1BGXT 1J5OA 1UWBA 2OPSA 3AVGA 3AA4A 3L2QA 2RHXA 4DTRA 2CKKA 3ZEHA 2YHBA 2Z1HA 3P1GA 2OPPA 3NF8A 4UC4A 3AA3A 1XHZA 3OJSA 2YKMA 2XY8A 2HNYA 1I39A 4N4IA 1RTIA 1Q9XA 3DLGA 3LGLA 2EQJA 1F21A 3IG1A 1NK6A 4M3TA 1S5JA 3KLIA 2BIVA 1ZBUA 5C24A 3AVHA 1VSDA 4WE1A 5SWMA 5HP1A 4CF0A 2O4IA 1LWFA 3NHGA 4EDUA 1L3TA 2FHDA 4O0JA 1C0UA 1NOYA 2P1JA 3NBPA 3M9QA 2X4XA 4IUPA 3DLHA 1WSFA 4II1A 4KHQA 4AHRA 5KRTA 3SUNA 1YTAA 2EQUA 4CECA 1BCOA 1RILA 4RW8A 1JXEA 3ISNC 3NF7A 4E7IA 2F8SA 3RR7A 1HJRA 3G0ZA 1L5UA 2XK0A 2KFZA 2IG0A 4ZHRA 3ZSZA 3VQEA 4L59A 2YNHA 1U47A 1C1BA 1VSFA 4KTQA 3OVNA 1C1AA 5KE2A 3OYKA 4RG8A 2XO7A 3MECA 4B08A 3QBYA 2HNDA 1UOCA 3V9XA 5HLFA 1N27A 3MEGA 2FC0A 4CF9A 4CEBA 4Y1CA 2RPIA 2XRIA 4E0DA 1SKRA 2KQ2A 3DMJA 2XY7A 1RCHA 3ITHA 3SPZA 4DMNA 3CFRA 3VQCA 2OA8A 1EXQA 4GW6A 1D8YA 4OVAA 1NJYA 3I0RA 4IDKA 4H8KA 3ZT4A 3T3FA 3OMGA 4B9MA 5C0MA 3HK2A 3B6OA 2Z1JA 1BQMA 4CRIA 1I3AA 4IG3A 4AHTA 2A1RA 4DS5A 1A5VA 4O44A 3DRSA 2FBVA 1HMVA 3SQ0A 1KFDA 3NGIA 3NH1A 4O55A 2RJCA 3ZT1A 3L2UA 2XDPA 4LD6A 3EZ5A 1FKOA 1TV6A 4Z02A 4BACA 2IGIA 4CJ4A 3E9GA 1OYXA 2IAJA 2JLEA 3DRRA 2GV9A 5J1EA 4NYNA 4CJQA 3IRXA 2G8WA 4M3XA 2QQSA 5KTQA 4CJEA 2ZE2A 4Q5WA 1N6QA 1B9DA 2QKBA 3E9FA 3KTQA 3V1RA 3P8HA 3LZIA 1HNIA 4O5BA 3L2VA 2B8AA 1NK7A 2MWPA 2G8IA 2QQRA 2R5MA 3NFAA 4DF8A 2X6SA 3NTKA 2E4LA 3FC3A 2F96A 3JYTA 4MFBA 3KD1E 1EX4A 4LY7A 3TAFA 3RWUA 4IUTA 3DLMA 4AH9A 5KGXA 1KRPA 1U45A 1XC9A 1W9HA 1LAWA 1LW0A 4E89A 1YT3A 2LRQA 1HYSA 4E1NA 1J53A 3QNOA 4EZ9A 3K57A 4PLLA 4CJVA 1WJQA 3S3OA 3VQ8A 3OJUA 3VQ6A 1JLEA 3KK2A 4CHOA 4DU3A 3O8VA 3OB9A 1K6YA 3RMCA 1T8EA 3MEAA 3VQAA 1FKPA 3PX4A 2ZD1A 4CIGA 1RBRA 4AHSA 4Y1DA 2X35A 4CHNA 2HQEA 4C8KA 4Z4CA 4FLWA 1WJRA 1C0TA 3P83D 2OYQA 2XHBA 1LW2A 3LAMA 4FW2A 4E19A 3TAPA 4N41A 2R58A 3OY9A 1G5VA 3L2RA 3DLRA 4KV8A 4PWDA 3VN5A 2M1HA 5HRRA 4PUOA 4OJRA 2HHUA 5T7BA 3UT1A 4HCZA 2YRVA 4DU4A 3MXIA 1VSKA 1VSEA 3ZT0A 3HP9A 4B8CA 2HHWA 1KCFA 4I7FA 4FM2A 1HPZA 3MO8A 1D5AA 4CGFA 3UIQA 4A4HA 1XNIA 3AO1A 3JSMA 3ME9A 4IKFA 1XHXA 3TARA 4CEAA 4M3UA 4CHZA 5CIUA 1ZBHA 5I42A 4FYDA 3O4QA 3WNFA 1CXQA 4OKKA 3PV8A 1QQCA 4BWJA 5IN1A 2OZMA 4HCBA 3U6FA 3TR8A 1TK0A 1L3SA 4B9LA 4IFVA 3OYMA 4FVMA 2YHAA 4DFJA 5KH6A 2O4GA 1WSEA 4GMJB 1YTUA 2PYLA 4I2QA 4KREA 5CYMA 2BE2A 4HUGA 4EP4A 4IG0A 1KVCA 1GOCA 2RJFA 4N5SA 3QESA 1TAUA 1RTHA 3DI6A 3V1QA 3LP0A 1KHCA 5JS2A 4F3TA 3K58A 1OZ3A 1REVA 1WSGA 4BWMA 1LV5A 4N4HA 5CZ1A 3QEPA 1HNVA 3V1OA 4C5HA 3ZSOA 4QQGA 4CERA 3A2FA 3CFOA 1TKDA 1RT1A 3DLBA 3S3MA 3PMTA 1BIZA 4K8ZA 1KVAA 3T19A 4RW6A 4OGCA 5I3UA 1WAFA 3PY8A 4FU6A 4FZXC 4M3RA 3CM6A 3CFPA 4C8MA 1UA1A 2DFHA 4FJNA 3VQPA 3SUPA 4K8XA 3GOXA 1RBSA 4KTZA 3QIPA 4FJ7A 4Q5VA 1NJWA 3AVLA 2D9TA 3VQ4A 1WJSA 4Z0UA 4B9SA 1S6QA 3NNQA 1Z25A 2ZQBA 4KKOA 1T03A 3LPUA 2MWOA 4O4GA 4ICLA 5JS1A 1SUQA 5KCOA 2DY4A 3TAQA 1ZBFA 5KRSA 2FBYA 4DQRA 3OYCA 1QTMA 4KI4A 1XI1A 4KPYA 3E01A 4CEEA 3RRHA 3MEEA 2M0OA 1RDAA 3OYEA 4GY5A 2HHQA 1ZBIA 2Z1IA 3K5OA 2E5QA 4CJUA 1RTJA 3TAEA 1MHNA 4I2PA 4N47A 1JL1A 4DTXA 2X4YA 1IKWA 5CZ2A 2QK9A 4Z4HA 1QE1A 2IDOA 2IOCA 1RDBA 3SJJA 1BL3A 3AA5X 2GFUA 3HSTB 1JLCA 5HROA 3QIIA 4DFKA 3LANA 1X1PA 1RDCA 1TKTA 2EQKA 1SSFA 4DSLA 3TWHA 3B6PA 2HB5A 2RI5A 3K5LA 3O3FA 1RDDA 4QW2A 2RI2A 2I5JA 3V9ZA 1TKZA 3AVJA 4CFBA 3MP6A 1RT4A 3DLKA 5DMRA 4CK2A 3SI6A 3I0SA 3ZSWA 4FXDA 1IH7A 1TK8A 3HT3A 3QIOA 3AO5A 3HXMA 4DWIA 2K3XA 3MXMA 3SV3A 3SV4A 3UWNA 4DG1A 1WSJA 1Z26A 2D0AA 4PL6A 3RTVA 1QSLA 4IUQA 1TGOA 2P51A 3ZT3A 4CE9A 1NJXA 4B9NA 4NCGA 3KLGA 2K3YA 3CG7A 3ALYA 3SPYA 3T1AA 4M41A 3SUQA 2E6MA 1JXBA 3MP8A 1SV5A 3LX7A 3EYZA 2P5OA 2Z1GA 4CCHA 4BD3A 4FZZA 2KTQA 3HPGA 3V6DA 3C94A 2GFAA 4CGHA 4DSEA 1HRHA 2EQMA 3Q1JA 4KHUA 1DTQA 3LWMA 3THVA 4J2AA 4B9TA 1S9EA 4CGDA 3MEWA 4CJSA 1EP4A 4ELVA 2P5GA 4X34A 1U48A 2RKIA 1YVUA 2O4XB 3KIOA 3NF9A 4QCLA 4DQQA 1KLMA 3HP6A 4JRPA 3MAQA 4CIFA 3O3GA 4PQUA 1IKXA 1VSJA 3DYAA 1RT5A 3VQ9A 2BANA 3IAYA 4C8OA 4DTUA 2YNGA 4Z4IA 4PA1A 3K59A 1HYVA 4FK0A 2EFIA 5HRSA 1B9FA 4CFAA 5J39A 3OYFA 4E1MA 4JRQA 2KFNA 4DLGA 3H6ZA 3WNHA 4CF1A 3U3GA 1L3VA 4C5EA 1RBUA 1S1TA 1WSIA 1U04A 2QKKA 1S9GA 5J2QA 1H3ZA 3S6WA 4FJHA 3NH2A 1EKEA 1RNHA 4DFMA 4PY5A 4CEZA 3OYLA 2KW4A 4CHYA 3OYAA 3OYHA 4EP5A 3S9HA 4CJWA 1TL1A 4M3WA 3HYFA 1TKXA 4Z4FA 4M3YA 3QEXA 1VK0A 1T05A 2DIGA 4W5TA 1RBTA 3PO4A 2Q3SA 4BE0A 3V9SA 4NS5A 4FM0A 4CGGA 3AVCA 3D0PA 1RI0A 1RT6A 1SKSA 1CXUA 3K5NA 4DTJA 4N76A 2P0KA 3P5JA 2HHSA 1BI4B 3NF6A 5D3GA 3L3VA 2W42A 3TAGA 4CJ5A 3PUFA 1QHTA 4KTWA 3QO9A 2Y1IA 4CJPA 5HRNA 3RMDA 5J2MA 1SL2A 2D0CA 3TAMA 3OS2A 1JKHA 2DFFA 2R57A 3F70A 2HNZA 3NE6A 4IBNA 1MU2A 2YV0X 4JLHA 3KLFA 3DLEA 4CESA 5KI6A 4A4GA 4FJGA 4G1QA 2KZZA 4FJKA 2M16A 2LVMA 4IFYA 3K5MA 2VYTA 5J26A 1D9DA 4JS4A 4RW9A 3SQ4A 1BISA 2JTFA 4DSJA 3AA2A 4HVJA 4FK2A 3L3UA 4E7JA 3M8PA 4CIEA 3SYZA 1VSMA 3DM2A 4F4KA 1KVBA 3NGYA 3MEVA 4FJLA 3LLRA 2NUBA 1NKCA 3O4NA 3OYDA 4FW1A 2ITGA 1WNSA 2HMIA 4BDZA 2WOMA 3BGRA 5C25A 4Z4EA 3QINA 4HHTA 4FL6A 1ZBLA 2RN2A 4N4GA 4F2RA 3QNNA 4AILC 4QOZB 4C5GA 3SD4A 3AVMA 3NTHA 1TVRA 4KRFA 2GF7A 4CF2A 1QSSA 3KUFA 1C6VA 2RJDA 3NH0A 4KHSA 4HUFA 4PLIA 4DU1A 4NCBA 2WONA 1R0AA 4BDYA 1WGSA 3KK1A 3QLHA 4NZGA 4IUVA 3MXJA 4LSLA 4B9UA 3V9UA 4W5RA 1U49A 3FEOA 1O1WA 4B3OA 1W0HA 3NCIA 3C95A 4FK4A 1CLQA 2E6NA 2HHTA 1OZ2A 4RG2A 3QKJA 4CJTA 1LWEA 3ZT2A 4C5IA 3KLHA 3HJFA 3M8RA 2F8TA 4J2EA 4HTUA 3QEIA 4DSFA 1DLOA 4W5OA 4ID1A 3DB3A 3RMAA 3DRPA 4DQIA 4GVMA 4C8NA 4FLZA 4FJJA 2L8DA 2X78A 3SQ2A 4AHUA 5K14A 3NAEA 4B9WA 4CHQA 4DF4A 2G8FA 1CZBA 2PY5A 3VQQA 2OZSA 2B6AA 5C6SA 1ASWA 2LSNA 3V81A 1UAXA 3BDLA 4AHVA 3F9KA 4QQDA 3WNEA 4DTMA 2IC3A 4CHPA 3KK3A 5FRNA 3V9WA 2PQWA 1TAQA 3C6TA 5FDLA 1QSYA 3OYBA 5KCHA 3AVBA 4B9XA 4NYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X9CA 1GLCG 1S7OA 1J6ZA 4KH6A 2K9MA 3OYGA 5IHNA 3QJ6A 4CUGA 2X0LA 1BK2A 1Q9YA 3PX0A 2Q8KA 1WZ2A 5AQWA 3H41A 5HY6A 5AZJA 3PE0A 2F1LA 2IGOA 2DF6A 3QYEA 2LBFA 3F8FA 4I76A 3WVDB 2CT4A 3P4IA 1UFMA 1VQ9I 3I53A 2DPUA 4BR0A 3G6EN 2XF7A 2HHVA 2QBYB 4CZGA 2DOAA 4B1RA 2EPFA 2HAXA 3GG4A 3SQ1A 3SZ2A 3BTJA 1FJLA 1ZA2B 4M42A 1EQYA 2G8UA 1KJWA 3G10A 1ZSZB 3OYIA 2VT2A 4KHNA 3DXKA 4RTVA 4MTDA 2Z16A 2F69A 3M8QA 5GPAA 4BUPA 2JHJA 2KKOA 3IHUA 2YT6A 1MDUB 5GADJ 1RUOA 3QPSA 1HOMA 2JT4A 5KPTA 3SHFA 5K5RA 5JI6A 2DJZA 2G3RA 3RERA 4HEA2 1NOZA 3M8JA 4J2BA 3SUOA 3FXUA 2O8FA 1R1UA 2H94A 2V52B 5LJ5f 1ETKA 4OKEA 1Q7YU 1QZZA 1IDZA 4FLTA 4B9VA 2X1DA 5J8FA 3INZA 1S5LC 1AWOA 2XGXA 2NRVA 4F93B 1VSLA 4IRGA 4KGZB 4IHWA 1UJ0A 2OPRA 4MQ3A 1RI7A 5HS8A 1XUPO 2X6NA 4OPKA 4H5WA 5B5EC 2F5KA 2KPMA 3H1CA 5FKOA 5KYWB 4XU1A 1ONVA 2DYRH 2R4GA 2O3FA 3VEPA 1Y56A 4G12A 1G2HA 1BJZA 1CZAN 1LDKB 1HYZA 1VQ7T 4S05A 4RCCA 3DU6A 2PZ1A 3CHWA 4XNFA 5FKNA 4GCVA 2A0FB 3DKMA 3MZHA 2ROTA 1YI2A 3JRDA 2HOTA 1ZBSA 4YOVA 1NKBA 4WCIA 1T98A 2KIQA 3C4SA 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 1BI4 B;  3NF6 A;  5D3G A;  3L3V A;  2W42 A;  3TAG A;  4CJ5 A;  3PUF A;  1QHT A;  4KTW A;  3QO9 A;  2Y1I A;  4CJP A;  5HRN A;  3RMD A;  5J2M A;  1SL2 A;  2D0C A;  3TAM A;  3OS2 A;  1JKH A;  2DFF A;  2R57 A;  3F70 A;  2HNZ A;  3NE6 A;  4IBN A;  1MU2 A;  2YV0 X;  4JLH A;  3KLF A;  3DLE A;  4CES A;  5KI6 A;  4A4G A;  4FJG A;  4G1Q A;  2KZZ A;  4FJK A;  2M16 A;  2LVM A;  4IFY A;  3K5M A;  2VYT A;  5J26 A;  1D9D A;  4JS4 A;  4RW9 A;  3SQ4 A;  1BIS A;  2JTF A;  4DSJ A;  3AA2 A;  4HVJ A;  4FK2 A;  3L3U A;  4E7J A;  3M8P A;  4CIE A;  3SYZ A;  1VSM A;  3DM2 A;  4F4K A;  1KVB A;  3NGY A;  3MEV A;  4FJL A;  3LLR A;  2NUB A;  1NKC A;  3O4N A;  3OYD A;  4FW1 A;  2ITG A;  1WNS A;  2HMI A;  4BDZ A;  2WOM A;  3BGR A;  5C25 A;  4Z4E A;  3QIN A;  4HHT A;  4FL6 A;  1ZBL A;  2RN2 A;  4N4G A;  4F2R A;  3QNN A;  4AIL C;  4QOZ B;  4C5G A;  3SD4 A;  3AVM A;  3NTH A;  1TVR A;  4KRF A;  2GF7 A;  4CF2 A;  1QSS A;  3KUF A;  1C6V A;  2RJD A;  3NH0 A;  4KHS A;  4HUF A;  4PLI A;  4DU1 A;  4NCB A;  2WON A;  1R0A A;  4BDY A;  1WGS A;  3KK1 A;  3QLH A;  4NZG A;  4IUV A;  3MXJ A;  4LSL A;  4B9U A;  3V9U A;  4W5R A;  1U49 A;  3FEO A;  1O1W A;  4B3O A;  1W0H A;  3NCI A;  3C95 A;  4FK4 A;  1CLQ A;  2E6N A;  2HHT A;  1OZ2 A;  4RG2 A;  3QKJ A;  4CJT A;  1LWE A;  3ZT2 A;  4C5I A;  3KLH A;  3HJF A;  3M8R A;  2F8T A;  4J2E A;  4HTU A;  3QEI A;  4DSF A;  1DLO A;  4W5O A;  4ID1 A;  3DB3 A;  3RMA A;  3DRP A;  4DQI A;  4GVM A;  4C8N A;  4FLZ A;  4FJJ A;  2L8D A;  2X78 A;  3SQ2 A;  4AHU A;  5K14 A;  3NAE A;  4B9W A;  4CHQ A;  4DF4 A;  2G8F A;  1CZB A;  2PY5 A;  3VQQ A;  2OZS A;  2B6A A;  5C6S A;  1ASW A;  2LSN A;  3V81 A;  1UAX A;  3BDL A;  4AHV A;  3F9K A;  4QQD A;  3WNE A;  4DTM A;  2IC3 A;  4CHP A;  3KK3 A;  5FRN A;  3V9W A;  2PQW A;  1TAQ A;  3C6T A;  5FDL A;  1QSY A;  3OYB A;  5KCH A;  3AVB A;  4B9X A;  4NYF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4IRG A;  4KGZ B;  4IHW A;  1UJ0 A;  2OPR A;  4MQ3 A;  1RI7 A;  5HS8 A;  1XUP O;  2X6N A;  4OPK A;  4H5W A;  5B5E C;  2F5K A;  2KPM A;  3H1C A;  5FKO A;  5KYW B;  4XU1 A;  1ONV A;  2DYR H;  2R4G A;  2O3F A;  3VEP A;  1Y56 A;  4G12 A;  1G2H A;  1BJZ A;  1CZA N;  1LDK B;  1HYZ A;  1VQ7 T;  4S05 A;  4RCC A;  3DU6 A;  2PZ1 A;  3CHW A;  4XNF A;  5FKN A;  4GCV A;  2A0F B;  3DKM A;  3MZH A;  2ROT A;  1YI2 A;  3JRD A;  2HOT A;  1ZBS A;  4YOV A;  1NKB A;  4WCI A;  1T98 A;  2KIQ A;  3C4S A;  3FRN A;  1MMN A;  3LL3 A;  4B21 A;  4CEF A;  1K78 B;  3LAK A;  1U0J A;  1JLQ A;  4HNU A;  2PNI A;  1BR1 A;  1K0X A;  2QWN A;  1V29 B;  4L5I A;  4KBM B;  2KLA A;  1RT7 A;  2HQR A;  1QZE A;  3QXE B;  2VBW A;  3P8D A;  2XAU A;  4RAY A;  2P6S A;  2PJR B;  3T9N A;  3ZCM A;  5AQT A;  2OUM A;  1O3R A;  3B8A X;  2O9S A;  1YW9 A;  4OB3 B;  3FX3 A;  3U3Y A;  5C42 A;  3QEW A;  3L9F A;  4JZ3 A;  4DSK A;  3ZMV A;  1J9A A;  2Q1Z B;  3HGG A;  1YJW N;  1JUM A;  4BRI A;  2LJ1 A;  1JJ8 C;  1E3M A;  1JQQ A;  1WA7 A;  5KGW A;  1VQP Q; 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 5CR4 A;  1MV3 A;  1TGO A;  2P51 A;  3L7W A;  4B9N A;  2L2P A;  4ILJ A;  4NCG A;  4ABZ A;  3WTU C;  1P6R A;  4UY8 I;  1GHC A;  4M41 A;  2OZ6 A;  3SUQ A;  2E6M A;  1APL C;  1I94 K;  1BI0 A;  1SV5 A;  3GME A;  4PSX A;  1M90 U;  1BWF O;  1QVF M;  5FPD A;  4BD3 A;  4M77 A;  1WPY A;  5BQT A;  1YTY A;  1OVY A;  4H0Y B;  5GAN 7;  1QW1 A;  2ZCF B;  4JD2 A;  2ABK A;  4CGH A;  4M75 A;  1LMZ A;  1DTQ A;  3THV A;  5A0L A;  3VOV A;  1R58 A;  2V8K A;  1ATN A;  2JA7 J;  3GTG J;  4ELV A;  3K9T A;  2KQW A;  2QQB A;  3CCE T;  4EFH A;  1ZA1 B;  5GMK i;  3SAG A;  2RGV A;  4X34 A;  4JKG A;  2K3P A;  3DPL C;  4E9G A;  1Z9Z A;  3NF9 A;  4M7A F;  4QCL A;  4FE7 A;  4JX6 A;  4IHY A;  4B1X B;  5JFR A;  3CME T;  3WEE B;  3HFO A;  3O3G A;  3QZ9 B;  3PVL A;  4XU0 A;  1IKX A;  1VSJ A;  1BIA A;  3KP2 A;  1R1V A;  1Z05 A;  2BAN A;  3ISP A;  3L00 A;  4DTU A;  4C8O A;  5FB2 A;  4PA1 A;  3GXO A;  3FSP A;  2KEA A;  5AQY A;  2RC4 A;  1TL8 A;  2EFI A;  4J6X A;  4A3J J;  3A5N C;  1TUD A;  5J39 A;  3OYF A;  1RRQ A;  5F1X A;  2PUO B; 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 1YI2 T;  2W4S A;  2E65 A;  1LE8 A;  4LFA K;  2JSP A;  2ID6 A;  2DQR A;  1H64 1;  5D6E A;  2EIM H;  3S2D J;  3R6M A;  4XBF A;  2CH4 W;  3VET A;  2L3S A;  1YJ9 A;  3ZX3 A;  1JLC A;  1RNL A;  4A2A A;  4JI7 K;  4PCQ A;  2F6C A;  3M58 A;  3QII A;  5K1Y A;  1BC8 C;  2FEZ A;  2HL5 C;  2NRR A;  1VIE A;  2KLO A;  1RZ4 A;  3LWI A;  3F3X A;  1TKT A;  2XAS A;  4DSL A;  3PGG A;  3B6P A;  2HB5 A;  4RGU A;  3O3F A;  4KBO A;  4QW2 A;  1YWP A;  2DRM A;  2I5J A;  1D4X A;  5BPN A;  4CFB A;  3MP6 A;  3JAM K;  5LJ5 d;  4IX7 A;  1RAH B;  4YEL A;  1RT4 A;  1IDY A;  4KDP A;  4M4Z A;  2HXI A;  2G0E A;  4GV6 A;  1IH7 A;  1TK8 A;  1RFQ A;  4BB7 A;  5KPZ A;  2FOW A;  3HT3 A;  2VOD A;  1WJB A;  2Y0M A;  1P4W A;  2L4M A;  1KU7 A;  3AY9 A;  4PL6 A;  1QSL A;  4EQQ A;  2OAW A;  4IUQ A;  3ZT3 A;  3CWA A;  2LC2 A;  1TUC A;  3KLG A;  4FSV A;  4HAM A;  3CJ9 A;  3HUG A;  3SPY A;  4YDU A;  3QOD A;  1IN7 A;  2HBW A;  1JXB A;  3MP8 A;  3EUH A;  4VUB A;  3CCR A;  2UUZ A;  2RM4 A;  2MOX A;  2P5O A;  1ZAR A;  4FZZ A;  1KD1 O;  3V6D A; 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 4NS5 A;  5AQZ A;  3AVC A;  3D0P A;  5LJW A;  5GJV B;  3QSU A;  2UXD K;  4G6Q A;  1GT0 C;  4XRM A;  2A3S A;  2PVG B;  3PQK A;  3DJC A;  4FWM A;  3VEO A;  2W42 A;  5IP6 A;  3PUF A;  2J06 A;  3I55 T;  1QHT A;  4KTW A;  3QO9 A;  1HST A;  4AF1 A;  4K41 A;  3S1N J;  1TUU A;  1U1S A;  2D0C A;  4DNC A;  3MDQ A;  3TAM A;  4EJW A;  1Y0M A;  2DFF A;  1FP1 D;  4LIV A;  2HNZ A;  1R5G A;  4CZH A;  1MU2 A;  2CP7 A;  4BRN A;  4QPQ A;  3UB5 A;  3KLF A;  3DLE A;  4M78 B;  2A40 A;  3AFH A;  5KYU B;  5KQD A;  3SBG A;  4JJN K;  1WHH A;  4FJG A;  3PM1 A;  2GWJ A;  1JXM A;  1M2V A;  3ENH A;  4JKA A;  4FJK A;  3KVG A;  1CSK A;  2M16 A;  3E1S A;  1O7L A;  5FD6 A;  3K5M A;  1QWE A;  5CCA A;  4XR6 A;  1WRJ A;  4DSJ A;  2V79 A;  4IHX A;  3M8P A;  4A93 J;  4H03 B;  1VQK T;  3MEV A;  1HW2 A;  5A2Q E;  3LLR A;  2OPT A;  4UVC A;  1VQ4 T;  3GF2 A;  2ZSH B;  1NKC A;  5K7H A;  1GDT A;  3OYD A;  4FW1 A;  4UXN A;  3H35 A;  2CGK A;  2HMI A;  4IEI A;  1FMW A;  2E64 A;  3K9J A;  3LSJ A;  2LF7 A;  5CVU A;  4C2M J;  3QIN A;  4FL6 A;  5GAM g;  2BEO A;  1BBY A;  1ZBL A;  1SMT A;  3D5R C;  4F2R A;  3QP6 A;  3KNT A;  1LWY A;  1P2F A;  3SD4 A;  3ATU A;  5HLG A;  4AI5 A;  3AAP A;  4KRF A;  4QS7 A;  1EFN A;  4FQG A;  2UXC K;  4BHB A;  2RJD A;  1ILY A;  4KRT A;  2M1B A;  2QSG X;  1JGG A;  2DK3 A;  5B1B H;  5EC7 A;  3N0U A;  2YWW A;  1R0A A;  2XHK A;  1PUF A;  3LDO A;  5AR0 A;  4E6R A;  2RQQ A;  4EGZ A;  4M7D A;  2CO5 A;  2W1O A;  1WH5 A;  1WGS A;  3QLH A;  2XHI A;  1VYT A;  5ICC A;  4B9U A;  3V9U A;  4W5R A;  1U49 A;  3HFN A;  2A5Y B;  1ZUU A;  3L2C A;  2PMH A;  4FK4 A;  1K0S A;  5L3F A;  3VUZ A;  4BJT A;  3R2X C;  2E6N A;  2E1Z A;  2DL4 A;  3TGN A;  4WXC A;  1IRE B;  1R22 A;  1VQN I;  3OH6 A;  7AT1 B;  1C0W A;  4CJT A;  4BY9 C;  2AHJ B;  3ZT2 A;  3KLH A;  3M8R A;  3CF5 F;  5HVQ C;  2VIX A;  4DSF A;  1DLO A;  1U5T B;  2HF3 A;  2D1H A;  1QQM A;  3BRO A;  5GPC A;  3DRP A;  4HF1 A;  4DQI A;  4AD9 A;  4HV5 A;  2L8D A;  2X78 A;  4RTT A;  2P9K B;  3NAE A;  2O8E B;  2FBH A;  4Z8A A;  3D2F B;  3RSE B;  2PY5 A;  1TTH B;  1AA7 A;  2B6A A;  2JRM A;  4KMF A;  1NZ9 A;  4C9Y A;  4AHV A;  3O9Q A;  1U2V B;  3VRZ A;  1NGD A;  1JRI A;  2DBK A;  2DA3 A;  3WU2 C;  4U88 A;  3KK3 A;  1OOT A;  3U9Z A;  2VGM A;  1FOW A;  3KLN A;  3V9W A;  2KBT A;  2PX9 A;  3JCM f;  5AFU H;  1N75 A;  1CF7 A;  5EX5 A;  2WBM A;  3E6B A;  2XAQ A;  2JXB A;  4X65 K;  3ABM H;  4IOA F;  4H0X B;  3CCM N;  4B6M A;  3IKV A;  2CW0 F;  2M51 A;  3CJA A;  2ITM A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 1EET A;  4FLV A;  1RT3 A;  1CZ9 A;  1VQL T;  1UGQ B;  3AO2 A;  4OKJ A;  1Z7L A;  3LFU A;  2JGU A;  3OMC A;  5I2M A;  4C8Q D;  2DJZ A;  2G3R A;  3PX6 A;  4CJL A;  2KRC A;  1Z3X A;  2BKD N;  1Q7Y C;  1QVF A;  1U1T A;  4YTL A;  3RER A;  4E3S A;  4HEA 2;  3DOK A;  2G8V A;  1NOZ A;  3M8J A;  3AO4 A;  4J2B A;  3SUO A;  4F7U G;  2K5F A;  3RMS A;  3OBY A;  3AV9 A;  2RHZ A;  4KHY A;  4CI0 C;  5LJ5 f;  3K4J A;  5J3B A;  5DK5 A;  4OKE A;  2YNF A;  1G3W A;  5GAM f;  1MGQ A;  3I56 A;  4XTX A;  1Q7Y U;  3V8K A;  5GAO q;  2A6T A;  4HA8 A;  1V5E A;  4E47 A;  1XWL A;  1U4B A;  3C2H A;  2G8K A;  4FLT A;  2X6Y A;  2X1D A;  4XLE A;  3INZ A;  4B9V A;  2DAQ A;  3MKZ A;  4Z4G A;  4F93 B;  1VSL A;  4J01 A;  1NKE A;  2OPR A;  3LP1 A;  4MQ3 A;  1HQU A;  2QDY B;  1NJZ A;  2G8H A;  3SFM A;  3NGZ A;  2X6N A;  4OPK A;  2F5K A;  2XY6 A;  2KPM A;  1UEL B;  4Y4R A;  3CXC S;  4A4K A;  4II3 A;  4FJX A;  1WLJ A;  1VQN A;  3QEV A;  3FDY A;  5SZT A;  4XU1 A;  1T7P A;  3CP8 A;  2A1S A;  2R4G A;  2VJ5 A;  3ZBD A;  3GP8 A;  1Y56 A; 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