2RH1A

High resolution crystal structure of human b2-adrenergic g protein-coupled receptor.
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structure of an engineered human beta2-adrenergic G protein-coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein / hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords beta-2-adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
total genus 181
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2rh1A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 2rh1A01
4XTLA 1L09A 4OV0A 4AMIA 4JQ6A 1QM8A 1G0QA 253LA 156LA 2OE7X 103LA 181LA 1L93A 2F95A 4GBRA 1P8IA 1OVHA 1R2NA 4LDLA 1LGXA 1L71A 3SBAA 1XMEB 1XEPA 1L51A 1L54A 1P2RA 1L30A 3HT7A 2RB0X 1LI6A 1L70A 5EN0A 4W55A 1LN6A 2ANXA 3UONA 1CU5A 1SX2A 3AM6A 1CV1A 1P5CA 4MQTA 109LA 1D9WA 3DN2A 1L0KA 2OTYX 3HAQA 1QSBA 1CV5A 3WQJA 2B70A 1LYDA 3UZCA 1CU0A 1L95A 1D3FA 171LA 1GUEA 4HYJA 161LA 5ITEA 3C7YA 4I7PA 4IB4A 1DYAA 4W59A 1G0MA 1OV7A 5AHZA 3HASA 1QT7A 1WTHA 2OU0X 1KGBA 3MBVA 1G0PA 4N4YB 1B6IA 1L86A 2B6WA 1L59A 5BR2A 254LA 2Y01A 192LA 1X0SA 1C6HA 1Q5IA 1C60A 220LA 4PK0A 1XIOA 1L32A 2NTUA 1S8LA 4JKVA 1E12A 4EPFA 1DYCA 258LA 3FADA 2OE9X 1G1WA 2LNLA 5H2JA 1LWGA 1R84A 4PJZA 3UZAA 3V2YA 1L60A 3V2WA 2R4SA 5G2AA 4I7TA 2F93A 7LZMA 257LA 1L38A 1EHKB 1L57A 1L66A 2B73A 1KNIA 4BVNA 1P36A 186LA 4MD1A 3FI5A 119LA 237LA 4W51A 4IARA 114LA 1C66A 1L72A 1D3MA 115LA 3DDLA 1G0JA 5G36A 4DJHA 221LA 1L68A 1OWYA 1DZEA 224LA 1C62A 1L73A 137LA 1TLAA 200LA 2Q9DA 1PQDA 4W58A 4I7QA 1ZURA 144LA 4X1HA 251LA 4X32A 1C6PA 1PXRA 4W56A 3OE6A 3DQBA 1L92A 2RBPA 3HH6A 4EJ4A 1CV3A 1P7SA 3EH4B 123LA 3ODUA 3CDOA 1L41A 142LA 3GULA 1C6QA 4LDOA 1L26A 1F50A 1X0K1 2RBQA 2Z6BA 3AYNA 241LA 2RAYX 2HPYA 158LA 3PWHA 1OVJA 1L13A 4W52A 3QBLA 2NTGA 3HWLA 1HZXA 1CX6A 4S0WA 5AWZA 2RB2X 3X3BA 1BRXA 3C8QA 4EKSA 5G28A 209LA 178LA 205LA 1H68A 3C9MA 238LA 118LA 249LA 1GU8A 2QPEB 3G3XA 188LA 1CUQA 1JFPA 3HH4A 2Y02A 228LA 1QT8A 1L39A 107LA 2A4TA 3HH3A 1L25A 3C82A 1M0LA 1M0KA 1L85A 2YDVA 3T45A 5TGZA 3CDRA 1QT3A 3S8GB 1F4ZA 1QTDA 3DMVA 3SB6A 1L45A 1L65A 172LA 189LA 1BM1A 159LA 139LA 225LA 1X0I1 1P2LA 1NHBA 4W54A 4QI1A 1L28A 5FJGA 3QDCA 3C81A 1D3JA 4FAAB 5LZMA 4AQNA 3QAKA 187LA 4I7JA 1P56A 1PQKA 1DYEA 1SX7A 4W53A 199LA 1L02A 236LA 3C8SA 1UCQA 2Y03A 3P0GA 4G72B 5DYSA 1LI2A 1L52A 108LA 3HUQA 3PXOA 5B6VA 1L88A 3QJRB 4L6RA 1OV5A 239LA 1C3WA 1L27A 215LA 4KLYA 5B6XA 1T8AA 4EXMA 5B6YA 1LYEA 4XTOA 120LA 1C6BA 262LA 250LA 2B75A 4EPIA 3COCA 162LA 1L67A 1S54A 1Q5JA 3NS0A 4AMJA 170LA 1JV6A 4XXJA 4BV0A 3SN6R 4N6HA 216LA 127LA 1EPYA 4YXAC 2QARC 1CVKA 1L21A 1L19A 3NYAA 1PY6A 2B6TA 3VW7A 146LA 1L04A 1D3NA 3VHZA 4BUOA 1I6SA 240LA 1L14A 167LA 4FA7B 261LA 1T8FA 2YCXA 3GUKA 3VGAA 1L16A 4BWBA 2HUMA 2WJKA 4XTNA 2G87A 3DN8A 212LA 1XJIA 2B72A 6LZMA 3C83A 2JAFA 2HULA 168LA 3QJQB 1CV0A 2LC9A 128LA 1L07A 1AT9A 1F88A 1AP9A 1PQMA 1L31A 1IW9A 2M3GA 1KY1A 2KSBA 3UTWA 3ZPRA 1C6GA 1JV7A 1CTWA 149LA 163LA 3S3CB 4UHRA 223LA 2O7AA 1P37A 1PQOA 2OU9A 3DN3A 1GZMA 1M0MA 2EI4A 2RAZX 4HYXA 4I7NA 1L76A 1L82A 2RBOA 1XJTA 4G7QB 4GP8B 4MBSA 5G2DA 1QTBA 1L74A 5B34A 1L08A 1LYHA 3HTBA 2RB1X 1L77A 1UAZA 155LA 1LI3A 1QUDA 4I7SA 4W57A 1IXFA 2KSYA 3QJTB 1QT6A 1C6NA 3SB7A 1L40A 3BVDB 5A44A 1C63A 2I35A 1L90A 1C6JA 4EIYA 1LYFA 1G1VA 190LA 1SWYA 1T8GA 3HANA 5H2OA 1QTZA 4ARPA 1L69A 3SB9A 5DHGA 5ETZA 4YX7C 1D2YA 1L96A 2RBNA 2RBRA 4N4WA 1KG9A 1C64A 3CDQA 5H2IA 3L64A 2Z73A 2YCYA 1G06A 3HTFA 1PQIA 3DNAA 3OAXA 1C6AA 211LA 185LA 5JJEA 3HU8A 157LA 214LA 1L64A 3NY8A 2ZFEA 2IGCA 3ZPQA 148LE 4K5YA 1L98A 1DYBA 3A7KA 5A8EA 1LGWA 3C80A 1VJMA 242LA 5JJNA 3UTYA 2BRDA 3VG9A 1C6EA 1T97A 2HUKA 198LA 1U19A 4KNFA 3SBBC 2PEDA 1L18A 1LWKA 2F47A 3CAPA 3C7ZA 1KMEA 260LA 5DHHA 5C1MA 2QB0B 4NC3A 184LA 141LA 2CUUA 4ARLA 3PQRA 4GP4B 2B6XA 1C69A 3OE9A 5KKHA 1C67A 4BEYA 4G71B 1C6FA 1L24A 1LPYA 1L0MA 4LZMA 3X3CA 3GUJA 1DYDA 1L20A 3UG9A 1P6YA 3EH3B 1XJUA 3AYMA 3ZEVA 2O4WA 3HTDA 4G7RB 3QJSB 1QHJA 3FA0A 1P3NA 1QTVA 3HARA 1KY0A 4MQSA 152LA 3HAOA 4IAQA 1L36A 1L80A 213LA 4BEZA 147LA 1QTHA 2B6ZA 2B7XA 4EKPA 1G07A 1L75A 2ANVA 3GUPA 3G3WA 3OE8A 1CU3A 1FBBA 1K28A 1L56A 4I7LA 1L29A 3RUNA 4ARQB 2WJLA 1QUOA 4EKQA 4A4MA 3JR6A 3EH5B 1TN0A 4L35A 1L97A 4QRYA 1P8HA 5BR5A 1JTNA 1L22A 3QAPA 1L42A 2R4RA 1L03A 1L12A 5B6ZA 1E0PA 174LA 169LA 3DMXA 1L89A 191LA 1C6LA 1QSQA 1DYGA 4DKLA 2YCZA 3F8VA 5JJJA 1BRRA 4GPOA 4MD2A 1CV6A 210LA 3HT6A 3UTVA 3DN0A 4J4QA 1L99A 126LA 1L10A 4EA3A 4WW3A 4I7MA 1TN5A 2ZIYA 5AZDA 4WAVA 3PBLA 122LA 2RBSA 1KS3A 1P8UA 1S52A 3GUOA 3ABWA 3S3DB 3HDEA 247LA 1JQUA 2JAGA 4PXFA 1L46A 4QIDA 4I7KA 2YCWA 235LA 1DYFA 2VT4A 1C68A 3DN6A 3OE0A 176LA 3PDSA 2B6YA 1OWZA 4JR8A 1C6KA 3F9LA 3DKEX 1KG8A 1PQJA 173LA 182LA 3HT8A 2KSAA 259LA 5H2NA 3SB5A 1CUPA 1L01A 1L62A 206LA 2LZMA 2Y04A 4TL3A 4XT3A 2X72A 222LA 3VI0A 1QUHA 4IAPA 1L33A 3D4SA 2OEAX 1S51A 226LA 3KJ6A 3EMLA 3DN1A 164LA 1CX7A 4ARQA 1S8JA 1L17A 4XT1A 3NY9A 2Z55A 2NTWA 248LA 3QBKA 3HU9A 145LA 1VGOA 218LA 4I7RA 4EKRA 1LYGA 2L6XA 1L94A 4FPDA 180LA 131LA 1P64A 245LA 1L05A 244LA 3HT9A 1JTMA 1C6CA 3HUKA 3QJVB 196LA 3GUMA 1L44A 1H2SA 166LA 160LA 2I20A 5B6WA 4UG2A 3GUNA 177LA 2B74A 1C6TA 1L81A 1L11A 2OE4X 4DAJA 2NTHA 3HDFA 1O0AA 1KW7A 4LDEA 3C9LA 5G2CA 4HWLA 3QBIA 3REYA 231LA 2OU8A 5AX0A 232LA 1T6HA 102LA 5B0WA 1C6IA 2J4YA 3CDTA 3G3VA 1C6MA 1IW6A 234LA 1QT5A 2I21A 5H2LA 1L63A 113LA 1L34A 233LA 5G54A 1L83A 2O79A 3QJUB 5J7AA 1PXSA 2OTZX 4FBZA 3K2RA 2F2QA 1CV4A 1QS9A 2ZZLA 1L87A 1QUGA 4ARMB 4I7OA 5G53A 3SB8A 217LA 143LA 151LA 1L58A 3C7WA 1C8RA 3GUIA 4Y9HA 138LA 5AHYA 195LA 3LZMA 4GRVA 125LA 3NSBA 5F8UA 3HAPA 1C8SA 201LA 230LA 4OO9A 243LA 4ARJA 3VVKA 197LA 165LA 1L9HA 3DN4A 3S3BB 1L23A 5A45A 1CU6A 3HH5A 1L37A 2LCBA 1ZWNA 219LA 1S53A 1L53A 246LA 1BRDA 1C6DA 4YXCA 5H2MA 3RZEA 5B35A 2I1XA 129LA 4GBRB 3UTXA 5H2HA 2RH1A 229LA 4PXKA 1L49A 1LYJA 1G0GA 1G0KA 1L50A 4G7SB 255LA 1SSYA 4X31A 2F32A 1L0JA 130LA 2Y00A 1JGJA 3CDVA 183LA 1C65A 1QT4A 1L61A 104LA 1L48A 1L43A 112LA 5B2NA 3DMZA 1FBKA 1G0LA 1LW9A 3RFMA 1L91A 1QKPA 3S8FB 3HTGA 3QBGA 5H2PA 252LA 4ZPUA 1LGUA 1QTCA 1L15A 1KW5A 4E97A 3L2XA 2AT9A 4G70B 2L78A 3HUAA 110LA 4GP5B 140LA 1CU2A 4ARMA 1ZYTA 2YDOA 1L55A 1C61A 1CWQA 5I14A 150LA 1L84A 1LLHA 2KS9A 1L35A 1OYUA 5ITCA 5AX1A 1P46A 3C8RA 1L79A 1MGYA 175LA 1SSWA 2QPDB 1D2WA 256LA 3CODA 5H2KA 111LA 1OVKA 227LA 4GYCA 1L47A 2Q9EA 5LWEA 1SWZA 1L06A 1LYIA 1L00A 1QS5A 1QKOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XTLA 2I26L 1OUGA 1QIOA 1G0QA 2ZIKA 156LA 1L93A 1R2NA 1GHLA 4LDLA 3A94A 1LGXA 4G49A 1XMEB 1XEPA 1L54A 1KIPC 4N5RA 3HT7A 4DQ5A 1REYA 1CV1A 1HEQA 109LA 1D9WA 3M3UA 3AB6A 3HAQA 2D4IA 2B70A 4HYJA 1GFVA 161LA 2HEEA 3C7YA 4IB4A 2DQIY 1G0MA 4GN4A 1QT7A 3LYOA 4L41A 4N0JA 2YBNA 1X0SA 1C6HA 220LA 2FBBA 3IWRA 1VDQA 3CT1A 1GB8A 4XJIA 2NTUA 2MEEA 4EPFA 1GEVA 4ZFPA 258LA 2YDGA 4TSCA 1R84A 1H6MA 5G2AA 1OUFA 4DD9A 2LYMA 2YBIA 257LA 5F9XA 5C6JA 1UACY 4UWVA 2LZTA 1GF4A 1O23A 1C66A 1YKYX 1D3MA 4YOPA 2H9JA 4H9CA 1L68A 1DZEA 224LA 1TLAA 1PQDA 3SP3A 4X32A 251LA 2ZWBA 4H90A 1L92A 3DQBA 4ML7A 123LA 3WU8A 4GLAA 4WM4A 142LA 4LDOA 1CKGA 241LA 3LZ2A 4N9RA 5DLAA 1HZXA 4S0WA 2RB2X 4EKSA 1IEEA 5HQ1A 178LA 205LA 1JJ0A 249LA 4PRUA 4H91A 1CUQA 1HEWA 2Y02A 1L39A 1L25A 1B7OA 1M0KA 2YDVA 5APCA 1F4ZA 3SB6A 5I4YA 1CNSA 172LA 3K3TA 4Z41A 1X0I1 1B7PA 5FJGA 4NGVA 3W6EA 1LHIA 1LJHA 4AQNA 4RLNA 3QAKA 187LA 199LA 3C8SA 5DYSA 3P0GA 4YENA 1LI2A 3PXOA 4DD1A 5B6VA 1L88A 1C3WA 5B6XA 4H9FA 3WU7A 120LA 4XTOA 1NMMA 2B75A 3COCA 162LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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