2RH1A

High resolution crystal structure of human b2-adrenergic g protein-coupled receptor.
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structure of an engineered human beta2-adrenergic G protein-coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords beta-2-adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
molecule tags Membrane protein / hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 181
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2rh1A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 2rh1A01
3GUMA 2Y00A 3DQBA 2NTUA 4N4YB 2KSYA 1OVKA 220LA 1PXSA 3C9MA 2RBOA 5AHZA 4TL3A 5G54A 3C9LA 181LA 3S3CB 1L37A 4W59A 1MGYA 3QJUB 1P46A 1DYFA 1L75A 3HAQA 1L90A 4DJHA 3BVDB 1L97A 1C69A 122LA 2F47A 3CAPA 5G2AA 120LA 213LA 1BRDA 129LA 3PWHA 1CUPA 2YCXA 2ZZLA 168LA 1L67A 2F2QA 4XXJA 1SX7A 218LA 5H2HA 1D2WA 1CV1A 6LZMA 3QJTB 236LA 3HDEA 3VW7A 2KSAA 1L46A 238LA 1L04A 1JGJA 3DN3A 185LA 1P3NA 104LA 4A4MA 1CU5A 5LZMA 1LYGA 1BM1A 4JQ6A 5H2LA 1LWGA 3S3DB 1KY1A 3EMLA 4K5YA 1C67A 254LA 3EH3B 140LA 1CV3A 1SX2A 4UHRA 2R4RA 5G2CA 4I7JA 1L49A 1L53A 139LA 171LA 256LA 3VHZA 2B6YA 5G36A 222LA 260LA 3RFMA 1QS5A 1CWQA 1L88A 5B0WA 4S0WA 5H2JA 4LDOA 2RB2X 1TN0A 4PJZA 3DN6A 143LA 2NTGA 160LA 2RB0X 2YDOA 3COCA 4KNFA 187LA 3HDFA 1XJTA 3HASA 198LA 4BWBA 102LA 1L26A 169LA 250LA 5H2NA 1L54A 1CU2A 1KW5A 1L48A 1P6YA 1PQMA 1PXRA 2NTWA 4IAPA 3ABWA 1SWYA 2RBNA 4I7LA 3FA0A 3PXOA 4E97A 3V2YA 4ARMA 157LA 4G7SB 227LA 1SSWA 1QKPA 2B6ZA 2JAGA 1L59A 4ARMB 2OE9X 4GRVA 1DYCA 1CX7A 4LZMA 4XT1A 138LA 4DAJA 4QRYA 3SB5A 4I7KA 115LA 1L19A 5AX0A 223LA 4J4QA 2RBSA 4XTLA 1GU8A 1C68A 3HAOA 1C6TA 1C65A 1L56A 230LA 2QARC 197LA 119LA 1SSYA 2WJLA 5JJNA 3OE8A 1P64A 4YXCA 243LA 4L35A 3C8SA 2RBQA 5G53A 2YCZA 4MQTA 3KJ6A 1L07A 3GUKA 3C80A 3GUNA 3C81A 1ZYTA 5I14A 3HU8A 1K28A 1LGWA 177LA 131LA 1C3WA 3NY9A 3HTDA 4PXFA 2F95A 1L69A 1D3MA 1LYJA 1OV7A 3DN1A 125LA 3DMXA 1OVJA 3CDRA 2RH1A 3FADA 2X72A 1G0LA 1L57A 1QT3A 249LA 1G0PA 1QT7A 3OE0A 2I1XA 4OO9A 2HPYA 5J7AA 1QUHA 196LA 4JKVA 4MBSA 1L09A 1L30A 1LI3A 241LA 1L27A 1G07A 3ZPQA 4XTNA 2LCBA 2KS9A 1L15A 1LGUA 1L99A 2B6WA 1L24A 1UCQA 4WW3A 5H2IA 5KKHA 1L84A 1T8GA 3S8GB 2OU8A 4W56A 3DN8A 1S8LA 3QBGA 237LA 5A8EA 1L44A 3SBAA 1G0GA 144LA 4I7SA 215LA 4FPDA 4LDLA 1H2SA 5H2PA 123LA 1QTCA 3HH4A 1KY0A 1P8UA 1TLAA 5A45A 183LA 3SB7A 1QKOA 1L13A 1LGXA 3DMZA 1L01A 1L66A 1PQKA 3HUKA 1L05A 3G3WA 4X1HA 3ZEVA 1EPYA 186LA 3PBLA 1C6AA 4ARPA 2VT4A 1S8JA 4MD1A 1S51A 4HWLA 2I35A 1L83A 1L73A 224LA 4GP4B 1XIOA 3CDOA 1P36A 3NYAA 3QJVB 5F8UA 109LA 1CV5A 1QSBA 1KG9A 1L96A 1PQDA 5B6ZA 3HT8A 2YCYA 1CUQA 2Q9EA 3HH5A 1C6DA 2O7AA 2QPDB 1C6IA 1C6NA 3NSBA 3QJQB 3OE6A 2B72A 2QPEB 182LA 1L35A 1P56A 3UG9A 1OV5A 1L43A 3WQJA 1CVKA 1L25A 1QT8A 4BVNA 217LA 1QTVA 3C7WA 228LA 4W58A 4W53A 172LA 1C62A 3DNAA 3RZEA 1KGBA 1L36A 1NHBA 1L89A 5G28A 3D4SA 1L41A 3QBKA 2OU0X 3S8FB 1UAZA 1T8FA 1QTBA 1IXFA 4WAVA 1C6CA 4N4WA 4EJ4A 5A44A 1AP9A 226LA 1LI6A 1L62A 3DKEX 3L2XA 3SN6R 3HUAA 4W55A 118LA 4EA3A 4YXAC 3VG9A 4EKQA 2B7XA 2Q9DA 3CDQA 164LA 4EKRA 3PQRA 1L11A 4GP8B 1WTHA 1LPYA 3EH5B 147LA 174LA 3QBLA 5BR5A 5TGZA 1ZWNA 201LA 3C8RA 3UONA 5LWEA 4ARQA 1I6SA 1L18A 219LA 1DYDA 3OAXA 4GBRA 4EKPA 4N6HA 1DYAA 1L34A 1LYEA 3DN4A 1L08A 1L28A 2OTYX 2YDVA 4GBRB 251LA 3JR6A 3QDCA 191LA 2B6TA 2HUMA 4I7OA 1L40A 1QUDA 3X3CA 3HTFA 2NTHA 258LA 2M3GA 3UTWA 3OE9A 1L29A 1P7SA 108LA 2LNLA 173LA 5G2DA 151LA 3T45A 1E0PA 5B34A 1DZEA 1X0I1 5DYSA 1T97A 5ITCA 1L0MA 4G72B 2RAYX 1ZURA 2RAZX 1EHKB 2L78A 2I21A 1JFPA 4HYJA 1L50A 1F50A 2YCWA 4QI1A 3HT9A 225LA 184LA 3F8VA 1L51A 4G7QB 1LWKA 1LYHA 242LA 5H2KA 229LA 247LA 1R2NA 1LI2A 1L06A 1L21A 4G71B 113LA 4ARLA 1KMEA 1Q5JA 4GP5B 4BUOA 4IAQA 178LA 145LA 246LA 1PQJA 4KLYA 1L61A 1CX6A 4GYCA 1DYEA 1D3FA 2O4WA 3HH6A 155LA 1G1WA 1S53A 1M0LA 231LA 3ZPRA 158LA 127LA 1GUEA 1L55A 4ARJA 1L85A 5FJGA 180LA 3MBVA 3HT7A 3VI0A 3C83A 3VVKA 1L98A 1O0AA 2F32A 1L22A 1F88A 1PY6A 1F4ZA 1L52A 1C6KA 221LA 4AMJA 1G06A 3NY8A 1C6PA 1H68A 4AMIA 2HULA 4NC3A 1C6JA 3S3BB 1L79A 5ETZA 1C63A 3PDSA 1S52A 1CTWA 3HARA 2BRDA 1QS9A 259LA 1QTZA 5DHHA 3HT6A 1C61A 232LA 1CV6A 156LA 4OV0A 3FI5A 1E12A 1CV0A 1L20A 3GUOA 2Z55A 1C8SA 176LA 3P0GA 1L10A 1C6HA 1C60A 3SB8A 1C6BA 3QJRB 3HTGA 1QUGA 1IW9A 2RB1X 2Z6BA 252LA 3HU9A 170LA 1P5CA 245LA 2OU9A 1P2RA 3C82A 2IGCA 3GUPA 3UTVA 2B75A 4W51A 3UZCA 1L74A 1L00A 1TN5A 239LA 1G0JA 1L86A 3G3XA 3HAPA 3ODUA 3AM6A 4Y9HA 4EKSA 3VGAA 189LA 211LA 1QHJA 4I7TA 2Y03A 111LA 1LN6A 2J4YA 4BV0A 3DN0A 1LYIA 5C1MA 1L38A 233LA 253LA 1LLHA 3GULA 5BR2A 3C7YA 1D9WA 126LA 4UG2A 1L47A 3CDVA 2OE7X 1LW9A 1G0KA 3V2WA 1FBBA 4GPOA 4I7RA 4HYXA 4MD2A 1BRXA 4IB4A 1PQIA 1D2YA 5B6YA 1L17A 1LYDA 3L64A 128LA 3REYA 3CDTA 1L60A 152LA 150LA 4G7RB 166LA 1L63A 3A7KA 2HUKA 5ITEA 162LA 1M0MA 1OVHA 2WJKA 2ZIYA 1L39A 175LA 1L95A 1QSQA 212LA 1L9HA 1P37A 255LA 3CODA 257LA 159LA 3DDLA 5H2MA 1L65A 1M0KA 1FBKA 4DKLA 107LA 1L91A 1QT6A 248LA 4X32A 4X31A 167LA 1JTNA 2B74A 1L45A 4MQSA 1G1VA 5JJJA 112LA 3SB6A 7LZMA 244LA 5AWZA 1L93A 163LA 3UZAA 3LZMA 1HZXA 2Y02A 234LA 1XJUA 2I20A 1DYBA 1L03A 1CU6A 5B35A 4BEYA 4AQNA 4EXMA 1U19A 2Z73A 216LA 3AYMA 1XEPA 4ARQB 5AZDA 2ZFEA 4IARA 1D3JA 1L33A 1L68A 1QM8A 1C66A 1C6MA 1CU0A 1JV6A 1XMEB 4G70B 110LA 1KW7A 2A4TA 4I7QA 3X3BA 5AX1A 146LA 4I7MA 2F93A 142LA 1L72A 1JV7A 3K2RA 4PXKA 1OYUA 1CU3A 130LA 1QT5A 2LC9A 1L80A 1L23A 103LA 1CV4A 3QJSB 1B6IA 1C64A 1P2LA 2RBRA 262LA 4QIDA 240LA 5B6VA 190LA 1L32A 1L71A 2CUUA 1P8HA 1L31A 3NS0A 214LA 4PK0A 209LA 137LA 3DN2A 4JR8A 1L77A 195LA 3QBIA 2R4SA 3SBBC 1BRRA 3HANA 1L42A 1C6LA 2OE4X 2Y01A 4ZPUA 1X0SA 3HUQA 149LA 1L0KA 3G3VA 2OTZX 1L70A 3F9LA 3C8QA 114LA 3GUJA 1OWYA 3RUNA 5H2OA 1VJMA 2L6XA 3QAPA 3C7ZA 1G0MA 1AT9A 1C6EA 2Y04A 200LA 2QB0B 1SWZA 2B6XA 1DYGA 1IW6A 5AHYA 4LDEA 2PEDA 2ANXA 1KNIA 4XTOA 1L82A 1Q5IA 1C8RA 2O79A 3AYNA 3EH4B 4EPIA 1QTDA 1S54A 5B2NA 1L87A 4W52A 1L94A 2B73A 141LA 165LA 1L12A 2AT9A 1L81A 2RBPA 1L58A 4FA7B 199LA 210LA 3DMVA 1X0K1 1L0JA 5EN0A 3HTBA 1C6QA 3QAKA 1OWZA 2G87A 192LA 2B70A 4EIYA 205LA 261LA 3SB9A 5B6WA 3HH3A 206LA 1QTHA 4BEZA 4XT3A 1D3NA 1L76A 1PQOA 3UTXA 1JTMA 1L64A 5JJEA 3HWLA 235LA 5DHGA 1G0QA 4W57A 1L92A 148LE 4I7PA 1L14A 4FAAB 4EPFA 3GUIA 4FBZA 2LZMA 1JQUA 1C6FA 1T8AA 2OEAX 2ANVA 1XJIA 1P8IA 4YX7C 1VGOA 2KSBA 1R84A 188LA 4W54A 4I7NA 161LA 1QUOA 1KS3A 1T6HA 1GZMA 1C6GA 4L6RA 5B6XA 1LYFA 1QT4A 2EI4A 1KG8A 2JAFA 3UTYA 1L16A 1L02A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HEFA 9LYZA 1HSWA 2Y00A 2NTUA 2KSYA 2RBOA 5KXPA 2BQKA 5G54A 3S3CB 1XSFA 1LZRA 1NDGC 1OP9B 4EMNA 213LA 4OOOA 4J1AA 129LA 1REYA 218LA 3J4GA 1DKKA 4KPMA 3VW7A 2KSAA 1AM7A 1J1PY 3A95A 185LA 2BQJA 1F6RA 5LZMA 1BM1A 3M18B 1ZV5L 1KY1A 3EMLA 1JKAA 1GE0A 1CV3A 1SX2A 4I7JA 1L49A 4N5RA 1IWTA 4LYCA 3T6UA 4PRQA 2YDGA 1IP5A 2B6YA 3RFMA 1GEZA 1CWQA 4S0WA 5H2JA 4LDOA 4PJZA 1HEQA 3DN6A 4G4BA 3HASA 4BWBA 1L48A 1YL1X 1LSDA 1SWYA 4ZEEA 3PXOA 4E97A 3V2YA 4L41A 4ARMA 2B6ZA 1L59A 5F14A 4XT1A 4DAJA 115LA 1LYYA 5AX0A 4FJRA 4J4QA 4XTLA 1C65A 4NHIA 1EL1A 1NHEA 1P64A 4YXCA 1BHZA 243LA 4X3BA 1LJEA 2RBQA 4HTKA 3GUKA 3C81A 5DN5A 5I14A 3WU8A 1B7LA 4ETDA 1LSEA 3DN1A 3FADA 1XFPL 5DYSA 1AT6A 1SLYA 1QUHA 2DQIY 4JKVA 5LA8A 4HP0A 1LOZA 4XTNA 1HSXA 1L99A 2CDSA 5KKHA 1L84A 1AZFA 3S8GB 1B7SA 2EQLA 3QBGA 5A8EA 1L44A 4WLYA 3SBAA 2H5ZA 3TXKA 1H2SA 5H2PA 1LZTA 1KY0A 1TLAA 4DQ7A 183LA 3SB7A 1L05A 3G3WA 1EPYA 4WO6A 4HWLA 2I35A 224LA 2BQOA 4GP4B 1IR9A 1QSBA 1QSAA 1KG9A 1L96A 1EQ5A 1MELL 1ZVYB 4GLAA 3QJQB 2O7AA 1C6IA 1D0MA 5HNLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2CUU A;  1P8H A;  1L31 A;  3NS0 A;  214L A;  4PK0 A;  209L A;  137L A;  3DN2 A;  4JR8 A;  1L77 A;  195L A;  3QBI A;  2R4S A;  3SBB C;  1BRR A;  3HAN A;  1L42 A;  1C6L A;  2OE4 X;  2Y01 A;  4ZPU A;  1X0S A;  3HUQ A;  149L A;  1L0K A;  3G3V A;  2OTZ X;  1L70 A;  3F9L A;  3C8Q A;  114L A;  3GUJ A;  1OWY A;  3RUN A;  5H2O A;  1VJM A;  2L6X A;  3QAP A;  3C7Z A;  1G0M A;  1AT9 A;  1C6E A;  2Y04 A;  200L A;  2QB0 B;  1SWZ A;  2B6X A;  1DYG A;  1IW6 A;  5AHY A;  4LDE A;  2PED A;  2ANX A;  1KNI A;  4XTO A;  1L82 A;  1Q5I A;  1C8R A;  2O79 A;  3AYN A;  3EH4 B;  4EPI A;  1QTD A;  1S54 A;  5B2N A;  1L87 A;  4W52 A;  1L94 A;  2B73 A;  141L A;  165L A;  1L12 A;  2AT9 A;  1L81 A;  2RBP A;  1L58 A;  4FA7 B;  199L A;  210L A;  3DMV A;  1X0K 1;  1L0J A;  5EN0 A;  3HTB A;  1C6Q A;  3QAK A;  1OWZ A;  2G87 A;  192L A;  2B70 A;  4EIY A;  205L A;  261L A;  3SB9 A;  5B6W A;  3HH3 A;  206L A;  1QTH A;  4BEZ A;  4XT3 A;  1D3N A;  1L76 A;  1PQO A;  3UTX A;  1JTM A;  1L64 A;  5JJE A;  3HWL A;  235L A;  5DHG A;  1G0Q A;  4W57 A;  1L92 A;  148L E;  4I7P A;  1L14 A;  4FAA B;  4EPF A;  3GUI A;  4FBZ A;  2LZM A;  1JQU A;  1C6F A;  1T8A A;  2OEA X;  2ANV A;  1XJI A;  1P8I A;  4YX7 C;  1VGO A;  2KSB A;  1R84 A;  188L A;  4W54 A;  4I7N A;  161L A;  1QUO A;  1KS3 A;  1T6H A;  1GZM A;  1C6G A;  4L6R A;  5B6X A;  1LYF A;  1QT4 A;  2EI4 A;  1KG8 A;  2JAF A;  3UTY A;  1L16 A;  1L02 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TMW A;  1KW7 A;  3X3B A;  5AX1 A;  3K2R A;  3AGI A;  1LHM A;  1KXW A;  1GE3 A;  1QT5 A;  1L80 A;  1L23 A;  1CV4 A;  4ZIX A;  5F9U A;  5B6V A;  1L32 A;  4HTQ A;  2F2N A;  1P8H A;  1L31 A;  4BAD A;  1DKJ A;  214L A;  209L A;  3A6C Y;  5L3H A;  1GF0 A;  3OJP A;  4XJD A;  3QBI A;  2HUB A;  3HAN A;  1C6L A;  2Y01 A;  4WM5 A;  3HFM Y;  135L A;  3A67 Y;  5H2O A;  2BQL A;  3C7Z A;  2MEF A;  2XQO A;  4DD7 A;  1BWH A;  2ZIJ A;  4GCF A;  1HEW A;  1IW6 A;  4E3U A;  5LXW A;  2ANX A;  1KNI A;  1WTM A;  1QTD A;  3CT1 A;  1S54 A;  1MLC E;  3WUN A;  4MST A;  3A6B Y;  141L A;  1LMT A;  1L12 A;  1L81 A;  1LSG A;  1I20 A;  2RBP A;  4XN6 A;  1L58 A;  1BB7 A;  199L A;  3DMV A;  4I8S A;  3HTB A;  3TMX A;  4DS7 E;  2B70 A;  1NBZ C;  3HBH A;  4EIY A;  3UTX A;  3LZT A;  3HWL A;  235L A;  4Z46 A;  4O34 A;  1G0Q A;  2YBN A;  1LSM A;  2YBH A;  4NHP A;  1UUZ C;  1FBI X;  1GB0 A;  2ANV A;  1LSC A;  4DYG A;  2I25 L;  188L A;  1WQQ A;  1D0K A;  1T6H A;  1C08 C;  5B6X A;  1GPQ C;  1LMC A;  1KG8 A;  4CGE A;  1KIP C;  3UTY A; 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 3AM6 A;  2HU1 A;  1YL0 X;  4NHQ A;  1IWX A;  1LN6 A;  3FE0 A;  3DN0 A;  1LYI A;  5C1M A;  1L38 A;  3AW6 A;  4NGO A;  4TSB A;  4XJH A;  1BB3 A;  3WW6 A;  3N9C A;  4C5F A;  4I7R A;  1QSW A;  5APE A;  4GPO A;  4IB4 A;  1TBY A;  4H93 A;  1OUF A;  4DDA A;  128L A;  3CDT A;  1LJF A;  1L60 A;  4RDS A;  5ITE A;  4LYT A;  2BQC A;  2F30 A;  1B2K A;  107L A;  1QT6 A;  1T3P A;  248L A;  4NGY A;  4X31 A;  4LZT A;  1BB6 A;  2YSS C;  2B74 A;  1L45 A;  2B5Z A;  4MQS A;  3WPJ A;  2C8P A;  3B72 A;  5AWZ A;  1G7H C;  1HER A;  2YBI A;  1DYB A;  1QDR A;  2BQG A;  1GFK A;  1IWY A;  4RW1 A;  2ZFE A;  1D3J A;  1L68 A;  1IY3 A;  1FN5 A;  1C6M A;  1IP4 A;  3RU5 A;  3LYO A;  2A4T A;  4RLN A;  4I7M A;  2F93 A;  1LZC A;  1GFJ A;  2BQI A;  142L A;  1L72 A;  1OYU A;  1CU3 A;  130L A;  2LC9 A;  1B6I A;  2RBR A;  240L A;  3SP3 A;  2CUU A;  3NS0 A;  1N4F A;  1LYZ A;  5LIO A;  137L A;  195L A;  1IO5 A;  2I26 L;  1LKR A;  1LZ9 A;  1IY4 A;  1HEP A;  4A7D A;  1X0S A;  149L A;  1L0K A;  3G3V A;  3C8Q A;  114L A;  3RUN A;  4DD2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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