2RH1A

High resolution crystal structure of human b2-adrenergic g protein-coupled receptor.
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structure of an engineered human beta2-adrenergic G protein-coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein / hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords beta-2-adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
total genus 181
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2rh1A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 2rh1A01
2Y02A 5DYSA 2B6ZA 212LA 3QJVB 220LA 2B6TA 1L15A 4K5YA 1C6JA 1JTMA 1L28A 1L68A 3HUKA 4PK0A 140LA 1C6PA 237LA 3DN6A 1E0PA 251LA 3F8VA 1TN0A 3DNAA 2QPDB 3HDFA 5ITCA 1G1WA 3ODUA 2A4TA 3RUNA 4G7SB 261LA 2PEDA 1CUPA 3QBKA 190LA 3X3BA 1K28A 2O4WA 2ZZLA 4EKQA 108LA 1L95A 4YXAC 1EPYA 3G3VA 1OYUA 1L48A 243LA 162LA 2RAYX 1L83A 3FA0A 5B0WA 3SB8A 188LA 4J4QA 3HUAA 1C6MA 4G70B 118LA 2OTYX 1P56A 1CU6A 1GUEA 1R84A 206LA 1JV7A 1L76A 1O0AA 3HT9A 1L41A 2J4YA 3C8QA 1L34A 1GU8A 1P8UA 2B74A 1L45A 2BRDA 3CAPA 1LWGA 2YCWA 2F93A 1L40A 230LA 4BWBA 1L52A 1CU0A 3CDVA 3F9LA 129LA 1C8SA 1QTBA 1I6SA 2ZFEA 143LA 2OEAX 5J7AA 3UZCA 2NTGA 138LA 1L54A 3G3WA 226LA 4ARLA 3HU8A 2Z6BA 1C8RA 1L0MA 5TGZA 1L73A 4LZMA 229LA 1C63A 3QJUB 1VJMA 1L74A 2RBOA 1VGOA 186LA 2KSBA 4FBZA 1AP9A 1L89A 1L51A 1P46A 4GP4B 1FBBA 3DMXA 150LA 1D2WA 1KY1A 1L75A 1KMEA 2HPYA 2NTWA 1L46A 5AX0A 1L0JA 1M0LA 189LA 4IAPA 3GUOA 3S8FB 3EMLA 5B34A 4DKLA 1KG9A 4GYCA 4AMJA 1P5CA 1L88A 1L23A 1LGWA 3QAKA 216LA 235LA 139LA 3C83A 5G54A 3MBVA 1L19A 1NHBA 5EN0A 3QJSB 1T8AA 3D4SA 3QJQB 1KS3A 3AYMA 4BEYA 4UHRA 1P7SA 2B7XA 4LDEA 1L37A 3HTBA 3UTWA 1DYCA 1CV3A 2KSYA 1S53A 1QUOA 3ABWA 1CTWA 1IXFA 1L03A 4X32A 5JJEA 5AHYA 1G0QA 2X72A 1C64A 3QBLA 1LI2A 2YDVA 3SBAA 240LA 3C9LA 1P3NA 1L71A 1CV5A 4ZPUA 1QHJA 2OU0X 1OWZA 5H2OA 5B6YA 1L10A 1P2RA 1LYGA 1L13A 5H2KA 114LA 2ANVA 2O7AA 173LA 4EJ4A 4XT3A 2Z55A 5G2CA 4XTNA 242LA 165LA 2Q9EA 3L2XA 3ZPQA 1S52A 4DJHA 1PQMA 1KY0A 4G7RB 5G2AA 1JQUA 1L01A 5LWEA 1QTDA 2LZMA 4A4MA 1L31A 3EH3B 227LA 1ZURA 3OE6A 169LA 5I14A 3HH5A 2VT4A 1SSYA 3GUIA 5ETZA 1L24A 1C69A 1MGYA 3EH5B 1L43A 1FBKA 3CODA 1L0KA 5FJGA 4MBSA 3KJ6A 200LA 2R4RA 3COCA 3CDRA 1SWZA 5DHHA 174LA 3VG9A 2L78A 1L62A 4ARPA 2B72A 130LA 2Y00A 239LA 2I21A 5H2JA 1P6YA 3WQJA 1PY6A 4EKSA 4NC3A 3C8RA 1DYEA 249LA 4OV0A 4N4YB 1L57A 3NYAA 4HWLA 1SX7A 3QBGA 187LA 247LA 1L25A 1L9HA 1XIOA 1CUQA 1L65A 1M0MA 1G0PA 4W57A 1C6BA 1JV6A 1KG8A 3UTXA 2OE7X 1S8LA 1L36A 4GBRB 5F8UA 4X31A 201LA 5A8EA 3ZEVA 2ZIYA 2B73A 1P2LA 3NSBA 4IB4A 1L93A 2RB0X 5B6XA 4I7TA 2F32A 3PQRA 1IW9A 119LA 1C67A 1L92A 2QPEB 3UG9A 3HT8A 167LA 1L53A 218LA 3FADA 4I7NA 5B2NA 232LA 4MQTA 3S8GB 4GRVA 3VVKA 122LA 182LA 3AYNA 2B6WA 3QJTB 1QT6A 1QTVA 1L91A 4AMIA 4PJZA 1OWYA 3FI5A 128LA 160LA 1L20A 221LA 4W58A 2Z73A 5B35A 3UONA 1P36A 4GP5B 1ZWNA 1C6HA 1L63A 4QIDA 3GULA 5A44A 1F50A 2HUMA 1L18A 1QUHA 1E12A 1L70A 4FPDA 171LA 1SX2A 1QUDA 176LA 4W55A 1L27A 228LA 156LA 1L55A 262LA 2OTZX 1L14A 3DN8A 5BR5A 1C6EA 1QUGA 4I7RA 1L05A 4LDLA 1LPYA 4S0WA 3L64A 1Q5IA 3EH4B 3GUNA 115LA 5C1MA 5G28A 1LYEA 1L49A 3V2YA 5B6VA 197LA 1PXSA 1EHKB 1L33A 1LYIA 1LW9A 3DKEX 1G07A 4L35A 2OU9A 164LA 1L90A 3HUQA 1C6GA 2JAGA 1C6DA 1UCQA 1CV0A 1SSWA 244LA 1H68A 1C6FA 1G0KA 215LA 3SN6R 5H2HA 3T45A 1C6AA 1L60A 1C3WA 1M0KA 1BRDA 4N4WA 4KNFA 1L72A 3HU9A 2I1XA 3C9MA 255LA 1L44A 142LA 2HULA 3NS0A 1C60A 168LA 1QT7A 214LA 1CU5A 205LA 1DZEA 183LA 3LZMA 1S51A 1L85A 213LA 177LA 1CX6A 2M3GA 3BVDB 1QT3A 196LA 1T97A 1OVHA 3DMVA 224LA 1LGXA 4I7MA 1L29A 170LA 2F2QA 1LYHA 2RBRA 1L98A 3HWLA 5DHGA 2LC9A 4EKPA 5B6ZA 1OV7A 1L17A 1T8GA 5BR2A 1U19A 1JFPA 1R2NA 7LZMA 1C6CA 252LA 1L64A 3HDEA 1C66A 184LA 2B75A 3CDOA 2YDOA 181LA 159LA 3DN0A 5H2PA 4I7KA 1BRRA 1L81A 1PQJA 1PQOA 1DYFA 157LA 1QTCA 146LA 2B70A 2NTHA 1D9WA 3V2WA 1KGBA 1L04A 234LA 4DAJA 5B6WA 5JJJA 5KKHA 1L47A 233LA 1QTZA 1L56A 3SB9A 166LA 127LA 1QT5A 3S3BB 258LA 257LA 4G72B 238LA 102LA 109LA 141LA 1C62A 1UAZA 1H2SA 3A7KA 2WJKA 1L32A 4BEZA 110LA 1QT8A 2B6YA 1L02A 1OVKA 1LLHA 2KS9A 3AM6A 3DQBA 2I35A 4N6HA 1L94A 4XXJA 1C6QA 1G0LA 4ARQB 1CU2A 260LA 2RB2X 1L96A 4W56A 4HYJA 149LA 1SWYA 1L16A 1CV6A 4JQ6A 1LI6A 1L26A 4I7JA 3C8SA 1OVJA 120LA 4YXCA 5LZMA 1GZMA 1CVKA 131LA 1L12A 1L61A 4W53A 1QKPA 3VI0A 1QS9A 1PQIA 1L07A 1L97A 3S3CB 4BUOA 3G3XA 1CV4A 4Y9HA 4EXMA 1L38A 3GUJA 2RBNA 1BM1A 3C82A 4G71B 2HUKA 5JJNA 3VGAA 1L30A 223LA 1D3MA 5AWZA 1PQDA 5AHZA 3VW7A 1Q5JA 1L11A 2LCBA 1G0JA 4ARMB 1L79A 2ANXA 2RAZX 4QRYA 245LA 3VHZA 1D3NA 1JTNA 2AT9A 4I7QA 4XTOA 5AX1A 2QARC 1L09A 1LGUA 3HT6A 1KW7A 3HAPA 2F47A 172LA 4PXKA 4ARQA 5ITEA 3HARA 219LA 125LA 5H2IA 3GUKA 2O79A 4W54A 1QM8A 3HT7A 2L6XA 3PBLA 2EI4A 198LA 4MD1A 147LA 1T8FA 1LI3A 2OU8A 3DMZA 3HAOA 3RFMA 2CUUA 4GBRA 5H2NA 1DYDA 2OE9X 3S3DB 2RB1X 1PQKA 2B6XA 1QSBA 1T6HA 3HTDA 1DYBA 192LA 1D2YA 1C6IA 2RBSA 2G87A 2NTUA 5G36A 4QI1A 4EPFA 2LNLA 253LA 1B6IA 3NY9A 4ARMA 175LA 1X0I1 5H2LA 2I20A 107LA 3HAQA 4JKVA 1C6TA 222LA 151LA 1LYDA 1L22A 3UTVA 3ZPRA 1S8JA 4G7QB 1JGJA 1KW5A 1LWKA 4BVNA 2RBPA 1D3FA 2IGCA 5A45A 1CWQA 1L08A 3HTFA 4OO9A 178LA 1XJIA 1KNIA 3X3CA 5H2MA 248LA 2YCZA 4XT1A 1P8IA 1L42A 6LZMA 1D3JA 3GUPA 3C7WA 246LA 2WJLA 4W59A 4WAVA 3K2RA 126LA 1QT4A 250LA 4ARJA 4GP8B 4L6RA 3CDQA 217LA 4EA3A 1L67A 1CU3A 4WW3A 4W51A 4BV0A 191LA 148LE 2Y03A 3GUMA 1L82A 103LA 3HH3A 254LA 4LDOA 2KSAA 1LYJA 210LA 185LA 2QB0B 4FAAB 1L21A 3DDLA 3DN1A 4I7OA 4AQNA 1CV1A 1L86A 4XTLA 4YX7C 5G53A 104LA 231LA 3HTGA 1G0GA 195LA 1C68A 4W52A 225LA 3REYA 3CDTA 1L58A 1QSQA 3SB7A 1P8HA 3QBIA 1L39A 3JR6A 2R4SA 111LA 1LN6A 1X0K1 4MD2A 1S54A 137LA 1QS5A 1G1VA 4EKRA 3NY8A 3C81A 4I7LA 145LA 1L84A 1C6KA 1ZYTA 1XJUA 256LA 1IW6A 155LA 158LA 1F4ZA 1L50A 3HANA 4IAQA 4HYXA 4MQSA 3QAPA 1HZXA 1X0SA 3HH4A 1P37A 3OE0A 2YCYA 3OE9A 2JAFA 1G0MA 1C61A 236LA 163LA 1L35A 1L06A 3DN3A 3DN2A 4I7PA 4E97A 4EPIA 1F88A 4X1HA 1XEPA 5AZDA 1C6NA 4PXFA 180LA 1AT9A 1BRXA 4EIYA 1TLAA 1DYAA 1QTHA 123LA 1L80A 3RZEA 2Y01A 4I7SA 3HH6A 259LA 1TN5A 4JR8A 1XMEB 3P0GA 1C6LA 2OE4X 3SB5A 1DYGA 3SBBC 2Y04A 3OAXA 3QDCA 4FA7B 161LA 1L59A 3UTYA 3OE8A 1L66A 1OV5A 211LA 3DN4A 1L77A 2Q9DA 2RBQA 112LA 1G06A 199LA 4TL3A 2F95A 3C7YA 113LA 1P64A 1L99A 1WTHA 3PDSA 3SB6A 4GPOA 1C65A 1LYFA 3PWHA 3C80A 1L87A 1XJTA 241LA 1PXRA 2YCXA 5G2DA 3UZAA 4KLYA 1CX7A 3C7ZA 3HASA 2RH1A 3PXOA 4IARA 1QKOA 4UG2A 209LA 1L69A 1L00A 144LA 3QJRB 152LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DYSA 1NBZC 2B6ZA 2B6TA 1DPWA 1C6JA 4WM3A 1L28A 1L68A 3HUKA 5LYZA 1C6PA 237LA 1B0DA 2YVBA 3F8VA 1E0PA 5ITCA 1AM7A 2A4TA 4TUNA 5KKJA 261LA 3X3BA 1IP1A 1GF8A 2AUBA 3G3VA 1OYUA 2RAYX 1CKHA 3TXDA 3SB8A 3RU5A 4N5RA 1GFGA 118LA 3P64A 1J1PY 1P56A 1R84A 3W6AA 3ULRA 4H8YA 1LSNA 1V7TA 4G9SA 1P8UA 5FELA 2DQGY 1QUTA 3AW6A 1IC4Y 1LWGA 1JKCA 3TXGA 4WL7A 5C6IA 1OUGA 230LA 1C8SA 4DS7E 4WO9A 2ZYPA 3HBEX 2Z6BA 1C63A 2ZWBA 1VGOA 4WL6A 1C08C 186LA 4H9FA 4YOPA 2KSBA 1AP9A 1L51A 4NWEA 3S8FB 5B34A 1KG9A 4GYCA 3ZEKA 216LA 2ZQ4A 4J0LA 1B7PA 139LA 3D3DA 1NF5A 1T8AA 3QJQB 3TXJA 1W08A 2B7XA 1L37A 4LGKA 3HTBA 3UTWA 4W94A 1S53A 3VWOA 3ATNA 1CTWA 1IXFA 1LHKA 1LI2A 5B06A 1VATA 4LT2A 5IELA 2OU0X 1QHJA 1I20A 1UIEA 1L10A 2O7AA 1XGQC 1GB5A 4WM4A 173LA 1OUBA 5IHGA 2YBJA 1GXXA 5E9RA 165LA 1GE4A 3G3AB 4RW2A 1GF7A 1JQUA 1L01A 1BGIA 4A4MA 4KT3A 3EH3B 227LA 5I14A 3EH5B 1MGYA 4N0JA 1FBKA 4G4HA 4MBSA 3KJ6A 2XBRA 3CDRA 5DHHA 1L62A 2YBHA 4ARPA 1UA6Y 4DQ7A 239LA 1FBIX 1OUCA 1P6YA 4HV2A 3WQJA 4NC3A 1CKFA 1DYEA 1XGPC 3NYAA 2I25L 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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