3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
2RAYX 1H2SA 4IAQA 5J7AA 150LA 4IB4A 155LA 3P0GA 3L2XA 2B6XA 1IW6A 3SBAA 2I20A 2VT4A 4W53A 1S52A 184LA 3UTWA 5LWEA 3S3BB 2QPEB 2I35A 1Q5IA 2JAFA 2Y02A 3KJ6A 198LA 199LA 1G0JA 1L21A 4W58A 3VW7A 197LA 210LA 5BR5A 182LA 1CU5A 1L12A 219LA 1L55A 3HT9A 2AT9A 4G71B 157LA 3A7KA 1L30A 171LA 1L82A 1L76A 1S8JA 3PWHA 3AYNA 4GYCA 5B6ZA 3UZAA 146LA 3X3BA 3BVDB 3OE0A 3QJUB 1LYFA 3UONA 5JJNA 1TLAA 4I7MA 1OV5A 4W54A 3PXOA 4GP8B 2F32A 2R4SA 1SWZA 3QJRB 1CV6A 2B75A 2OE4X 226LA 1Q5JA 2QPDB 149LA 167LA 1L15A 2Z6BA 4G72B 5H2LA 1D3NA 1L59A 5TGZA 1GU8A 3DMZA 3HARA 5DHHA 1L40A 1G0QA 2YDVA 1BRDA 4MD1A 2Y03A 5JJJA 1LLHA 1P7SA 1P3NA 1QT6A 1CX7A 1QTZA 2Q9EA 4EKRA 4N6HA 3MBVA 4EKQA 3QJSB 1AP9A 4MQTA 1F50A 1VGOA 3S3CB 168LA 1L83A 234LA 4G7QB 4X1HA 2RB0X 3C7ZA 3DN2A 1L61A 192LA 1OYUA 4BEZA 2G87A 4DJHA 3UZCA 2B7XA 1ZWNA 3VGAA 3DKEX 180LA 209LA 1C6MA 3EH3B 3HAPA 1L38A 2HUKA 163LA 3SB5A 3NY9A 115LA 4IARA 4GBRB 4W52A 4ARQA 183LA 230LA 1C6BA 1L87A 1L46A 215LA 252LA 3C7YA 4G7RB 1P5CA 206LA 144LA 2Q9DA 4MQSA 1QM8A 3X3CA 152LA 1CU2A 3FA0A 2JAGA 1KMEA 2WJKA 1D3MA 1R84A 3RFMA 1QT4A 3QJTB 3CDQA 189LA 3ZPQA 3OE6A 3CDRA 5G54A 1L92A 1E12A 1O0AA 246LA 1CUQA 1OWYA 1LYEA 109LA 2B70A 2QB0B 1L42A 1P8IA 1P46A 3CDVA 1L54A 1L00A 214LA 222LA 145LA 3COCA 1JV6A 1LWGA 1BRXA 3HAQA 1L25A 1LWKA 104LA 1JQUA 5B6XA 4FPDA 1C6KA 1KW7A 2NTGA 1D3FA 4ARLA 1R2NA 5G28A 262LA 4A4MA 4I7KA 1L34A 164LA 5H2OA 1KW5A 1LYGA 1M0MA 158LA 3GUPA 2RBRA 3HWLA 4G7SB 172LA 1L70A 1ZYTA 1C6TA 245LA 3F9LA 1C6LA 1MGYA 3HUQA 4WAVA 1XJIA 1S51A 5B6VA 2J4YA 161LA 5G53A 3GUOA 143LA 1C68A 1L73A 5G2CA 1C67A 139LA 3OE9A 3OAXA 3S8FB 4QIDA 253LA 166LA 1L37A 5ITCA 2F95A 1U19A 249LA 3PDSA 4QI1A 114LA 1C63A 1L68A 2OU9A 3F8VA 4JKVA 3SN6R 3CODA 3CDTA 3GUJA 1M0LA 2O4WA 1GZMA 224LA 4GP4B 1JGJA 5G36A 244LA 3HH3A 1C6IA 3HTFA 4LDLA 4FAAB 5A45A 2RB1X 113LA 156LA 3QAKA 1KG8A 238LA 185LA 1L19A 3PBLA 250LA 229LA 3DMVA 1L58A 170LA 3QJVB 3LZMA 4I7JA 4OV0A 1I6SA 3QAPA 190LA 1P56A 1G0LA 1PXRA 4BV0A 1LN6A 236LA 2I21A 4PXFA 2F93A 1OVJA 5F8UA 1L96A 5B6WA 110LA 1L20A 112LA 1C61A 1CVKA 3C81A 1IXFA 1G1VA 1KGBA 2B6ZA 2Y01A 2YCYA 2RBSA 4UG2A 4EXMA 3EH4B 3C83A 4HWLA 1T8AA 240LA 1G0GA 237LA 1JV7A 4GPOA 162LA 212LA 1BM1A 3QBGA 3JR6A 200LA 1L06A 4X32A 1C69A 1L41A 2B72A 1QT8A 1CWQA 1L44A 1L23A 120LA 181LA 1XJTA 3OE8A 260LA 4KNFA 191LA 5A8EA 1L62A 2LZMA 1G1WA 2CUUA 213LA 3AM6A 4I7OA 1L27A 4LZMA 1L47A 227LA 5C1MA 2L78A 4GBRA 217LA 3T45A 1G0PA 221LA 159LA 1CV5A 1KY0A 1P2LA 4G70B 4EA3A 5H2JA 1D2WA 251LA 1LW9A 1C60A 1LYDA 228LA 102LA 140LA 127LA 1QKPA 1L09A 5LZMA 257LA 3K2RA 3DN1A 3HDFA 4OO9A 2RAZX 3RZEA 5H2KA 1VJMA 4X31A 1SWYA 3QBKA 123LA 1S8LA 1L51A 4W59A 1C6HA 3UTVA 1KS3A 1SSYA 1SX7A 1CUPA 2B73A 3QBIA 3ODUA 1L75A 4FBZA 1T97A 1DYDA 1L03A 5H2HA 1L90A 2WJLA 1C62A 1L85A 4I7LA 4YXAC 254LA 1CU6A 1QTCA 1QUOA 1XEPA 3HT8A 1LI6A 4AQNA 4XT3A 3NSBA 1L49A 4XXJA 3HH5A 1H68A 1L81A 1L33A 2X72A 2OTYX 211LA 1QUGA 4XTOA 1L48A 2RBOA 1G0KA 196LA 205LA 4XTNA 5B2NA 1L18A 1C64A 3DN3A 1L32A 1L0KA 1EPYA 173LA 2OU8A 4HYXA 3G3WA 3UG9A 225LA 7LZMA 1G06A 1P8UA 137LA 1DYGA 5AHYA 231LA 1L67A 3ZPRA 4N4YB 1L98A 4K5YA 3G3VA 2ZFEA 3C9MA 1QTDA 138LA 1L53A 2LNLA 118LA 3FI5A 1L13A 4W56A 5ITEA 248LA 1C8RA 1PQOA 1L95A 1B6IA 1CV4A 1SX2A 1L16A 4LDOA 1C66A 4ARQB 4XT1A 5EN0A 3GUKA 4W51A 3QJQB 2KSBA 2LCBA 3HT7A 2KS9A 3ABWA 5KKHA 4WW3A 3C8QA 1DYFA 3AYMA 4EKSA 1S54A 2OE7X 232LA 1P36A 3REYA 5H2PA 5B34A 4ARJA 3GUIA 3VG9A 258LA 4UHRA 1L0MA 3CAPA 1L88A 2QARC 2ZZLA 1L63A 1C6AA 4ARPA 2RBQA 4I7SA 4I7PA 1L45A 1UCQA 2YDOA 1L31A 1LYIA 1QTVA 1E0PA 4GRVA 3L64A 3DMXA 5AZDA 2O7AA 1L02A 1JFPA 4AMIA 1C6JA 1L04A 2YCZA 4AMJA 3GUMA 3EMLA 1GUEA 3PQRA 1L79A 4PXKA 1QUHA 6LZMA 1FBBA 4BUOA 1BRRA 1L05A 1LGWA 2F47A 1G07A 1DYBA 3HASA 2HUMA 4HYJA 1PQKA 2B6TA 125LA 1L91A 1L22A 1XJUA 256LA 3HU9A 243LA 5G2DA 4W57A 1KNIA 187LA 1L36A 2L6XA 4DAJA 1D2YA 177LA 3HTBA 1TN5A 1P2RA 1UAZA 4MBSA 2R4RA 3DN0A 1TN0A 5AX1A 1L24A 3SB7A 4BVNA 5B0WA 218LA 147LA 4S0WA 1QS9A 216LA 1C6NA 1L08A 3HTGA 4PK0A 175LA 220LA 3C8SA 3V2WA 1DYCA 1DYEA 2RB2X 3ZEVA 3NY8A 4J4QA 1FBKA 4EIYA 1QKOA 1C6QA 5AHZA 1L66A 1PQMA 1L29A 4BWBA 2Z73A 2KSYA 1C6CA 2O79A 1DZEA 3CDOA 1KG9A 2B6WA 1OVKA 169LA 1OWZA 4IAPA 1CV0A 160LA 4ZPUA 5FJGA 119LA 103LA 1L71A 4BEYA 1L10A 1LI2A 2RBNA 2RBPA 1L86A 2NTHA 1DYAA 3DN8A 3HH4A 1C6DA 4ARMB 130LA 1PY6A 3HAOA 1L99A 1T8GA 2EI4A 1L11A 1CX6A 2HPYA 1EHKB 3G3XA 4L35A 1HZXA 4L6RA 108LA 1CTWA 1L80A 1C6EA 142LA 1D3JA 247LA 2I1XA 2ANXA 5JJEA 2IGCA 174LA 4I7QA 239LA 2KSAA 2B74A 1L07A 178LA 2HULA 1LGXA 1CV1A 1AT9A 223LA 1PQDA 5DYSA 1C6PA 195LA 4EJ4A 3QDCA 1CV3A 3S3DB 1NHBA 3NYAA 3V2YA 3UTYA 176LA 1C6FA 188LA 1SSWA 4E97A 1P8HA 4JR8A 1L57A 3HUAA 129LA 2M3GA 4MD2A 128LA 1XMEB 4LDEA 2OE9X 4I7NA 1L9HA 2Z55A 3QBLA 3GULA 3HANA 1L77A 3HUKA 5H2MA 3DNAA 4QRYA 186LA 1P64A 2RH1A 3DDLA 1QT5A 3DN4A 1L43A 1L74A 1M0KA 2F2QA 1KY1A 1L01A 1QT3A 2OTZX 3C8RA 1L97A 2ZIYA 5H2IA 3HU8A 1L35A 1L84A 1PQIA 261LA 1C65A 4EPFA 141LA 1QTHA 5AWZA 4W55A 1L0JA 4DKLA 3C82A 4NC3A 3S8GB 1L26A 1JTMA 1L14A 2YCWA 1QSQA 1F4ZA 5I14A 2BRDA 4I7RA 3VVKA 1P6YA 3FADA 4I7TA 131LA 2OEAX 1X0K1 4EKPA 1LI3A 3C80A 5AX0A 3SB6A 1CU3A 1L50A 1D9WA 5DHGA 1X0SA 4PJZA 1L56A 3D4SA 3HTDA 1L28A 148LE 3NS0A 3SB9A 3HDEA 259LA 1S53A 2NTWA 5H2NA 1L17A 5BR2A 1T8FA 1QUDA 3HT6A 3EH5B 1C8SA 1L39A 4N4WA 1LYHA 1C6GA 122LA 1T6HA 1OVHA 1F88A 4KLYA 1OV7A 1L94A 241LA 2OU0X 4FA7B 5ETZA 1QS5A 1X0I1 3GUNA 1L69A 1L60A 1L72A 126LA 1LPYA 2YCXA 4XTLA 3DQBA 1WTHA 1L65A 1LGUA 1XIOA 1QTBA 233LA 3C9LA 1CU0A 1QHJA 1G0MA 5B6YA 3UTXA 111LA 242LA 2Y04A 1P37A 1JTNA 107LA 1C3WA 1ZURA 4YXCA 4JQ6A 5G2AA 201LA 1IW9A 3HH6A 4YX7C 2B6YA 4TL3A 4GP5B 3WQJA 1L93A 1K28A 2LC9A 3DN6A 2Y00A 5A44A 3RUNA 4Y9HA 1LYJA 151LA 2A4TA 4EPIA 3VHZA 2PEDA 1L89A 3SB8A 1L52A 1PXSA 2NTUA 3VI0A 3C7WA 1QT7A 3SBBC 255LA 235LA 5B35A 4ARMA 1PQJA 2ANVA 1QSBA 165LA 1L64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RU5A 1GDXA 4PGJB 155LA 4IB4A 2I20A 1Z55A 3UTWA 5LWEA 3TXGA 2I35A 1JISA 4DYGA 3KJ6A 3HBHA 4W58A 210LA 5T3FA 5BR5A 1L12A 2AT9A 3LYTA 1IOTA 1L82A 3PWHA 3AYNA 4GYCA 3UZAA 146LA 1JSFA 3X3BA 1GB9A 1AZFA 1LMQA 2EQLA 135LA 3QJRB 1Q5JA 4CGEA 4LYOA 149LA 167LA 1D3NA 4E3UA 3WPLA 3DMZA 4BAPA 4QGZA 1LLHA 2BQDA 1P3NA 1QTZA 2IHLA 3QJSB 4N0JA 1VGOA 168LA 1T3PA 5L9JA 3E3DA 2B5ZA 2RB0X 3DN2A 3AGIA 1LMCA 4DJHA 3BKHA 1VFBC 1ZWNA 1C6MA 1DPWA 1L38A 163LA 3SB5A 3NY9A 4IARA 2Y8PA 183LA 1L87A 1BGIA 1CU2A 3FA0A 1KMEA 1D3MA 1R84A 3RFMA 3WVXA 3CDQA 154LA 2A7FA 3CDRA 1GB3A 3P66A 4AGAA 5KXNA 1O0AA 4LFPA 2B70A 4HP0A 3CDVA 1C7PA 4WM3A 2DKVA 2BAAA 5D5FA 3TXFA 1C6KA 1KW7A 2NTGA 2PC2A 5G28A 1L34A 5H2OA 1LZRA 1ALCA 1LJHA 158LA 3HWLA 1AT6A 3LYZA 4G7SB 1ZYTA 2YVBA 1ZVYB 1C6LA 1MGYA 1CKGA 3GXKA 5G53A 4NWHA 3S8FB 139LA 2XBSA 1CJ8A 166LA 2F95A 4Z3MA 1U19A 3PDSA 2YBJA 1GZMA 1B5XA 224LA 1YROA 1B5VA 1C6IA 4LDLA 3W6FA 5LVIA 238LA 1L19A 6LYTA 1L58A 1DI5A 3LZMA 4I7JA 1LZNA 3IJUA 4OWHA 1DI3A 236LA 1OVJA 1UIFA 5B6WA 1AT5A 1L20A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2RBQ A;  4I7S A;  4I7P A;  1L45 A;  1UCQ A;  2YDO A;  1L31 A;  1LYI A;  1QTV A;  1E0P A;  4GRV A;  3L64 A;  3DMX A;  5AZD A;  2O7A A;  1L02 A;  1JFP A;  4AMI A;  1C6J A;  1L04 A;  2YCZ A;  4AMJ A;  3GUM A;  3EML A;  1GUE A;  3PQR A;  1L79 A;  4PXK A;  1QUH A;  6LZM A;  1FBB A;  4BUO A;  1BRR A;  1L05 A;  1LGW A;  2F47 A;  1G07 A;  1DYB A;  3HAS A;  2HUM A;  4HYJ A;  1PQK A;  2B6T A;  125L A;  1L91 A;  1L22 A;  1XJU A;  256L A;  3HU9 A;  243L A;  5G2D A;  4W57 A;  1KNI A;  187L A;  1L36 A;  2L6X A;  4DAJ A;  1D2Y A;  177L A;  3HTB A;  1TN5 A;  1P2R A;  1UAZ A;  4MBS A;  2R4R A;  3DN0 A;  1TN0 A;  5AX1 A;  1L24 A;  3SB7 A;  4BVN A;  5B0W A;  218L A;  147L A;  4S0W A;  1QS9 A;  216L A;  1C6N A;  1L08 A;  3HTG A;  4PK0 A;  175L A;  220L A;  3C8S A;  3V2W A;  1DYC A;  1DYE A;  2RB2 X;  3ZEV A;  3NY8 A;  4J4Q A;  1FBK A;  4EIY A;  1QKO A;  1C6Q A;  5AHZ A;  1L66 A;  1PQM A;  1L29 A;  4BWB A;  2Z73 A;  2KSY A;  1C6C A;  2O79 A;  1DZE A;  3CDO A;  1KG9 A;  2B6W A;  1OVK A;  169L A;  1OWZ A;  4IAP A;  1CV0 A;  160L A;  4ZPU A;  5FJG A;  119L A;  103L A;  1L71 A;  4BEY A;  1L10 A;  1LI2 A;  2RBN A;  2RBP A;  1L86 A;  2NTH A;  1DYA A;  3DN8 A;  3HH4 A;  1C6D A;  4ARM B;  130L A;  1PY6 A;  3HAO A;  1L99 A;  1T8G A;  2EI4 A;  1L11 A;  1CX6 A;  2HPY A;  1EHK B;  3G3X A;  4L35 A;  1HZX A;  4L6R A;  108L A;  1CTW A;  1L80 A;  1C6E A;  142L A;  1D3J A;  247L A;  2I1X A;  2ANX A;  5JJE A;  2IGC A;  174L A;  4I7Q A;  239L A;  2KSA A;  2B74 A;  1L07 A;  178L A;  2HUL A;  1LGX A;  1CV1 A;  1AT9 A;  223L A;  1PQD A;  5DYS A;  1C6P A;  195L A;  4EJ4 A;  3QDC A;  1CV3 A;  3S3D B;  1NHB A;  3NYA A;  3V2Y A;  3UTY A;  176L A;  1C6F A;  188L A;  1SSW A;  4E97 A;  1P8H A;  4JR8 A;  1L57 A;  3HUA A;  129L A;  2M3G A;  4MD2 A;  128L A;  1XME B;  4LDE A;  2OE9 X;  4I7N A;  1L9H A;  2Z55 A;  3QBL A;  3GUL A;  3HAN A;  1L77 A;  3HUK A;  5H2M A;  3DNA A;  4QRY A;  186L A;  1P64 A;  2RH1 A;  3DDL A;  1QT5 A;  3DN4 A;  1L43 A;  1L74 A;  1M0K A;  2F2Q A;  1KY1 A;  1L01 A;  1QT3 A;  2OTZ X;  3C8R A;  1L97 A;  2ZIY A;  5H2I A;  3HU8 A;  1L35 A;  1L84 A;  1PQI A;  261L A;  1C65 A;  4EPF A;  141L A;  1QTH A;  5AWZ A;  4W55 A;  1L0J A;  4DKL A;  3C82 A;  4NC3 A;  3S8G B;  1L26 A;  1JTM A;  1L14 A;  2YCW A;  1QSQ A;  1F4Z A;  5I14 A;  2BRD A;  4I7R A;  3VVK A;  1P6Y A;  3FAD A;  4I7T A;  131L A;  2OEA X;  1X0K 1;  4EKP A;  1LI3 A;  3C80 A;  5AX0 A;  3SB6 A;  1CU3 A;  1L50 A;  1D9W A;  5DHG A;  1X0S A;  4PJZ A;  1L56 A;  3D4S A;  3HTD A;  1L28 A;  148L E;  3NS0 A;  3SB9 A;  3HDE A;  259L A;  1S53 A;  2NTW A;  5H2N A;  1L17 A;  5BR2 A;  1T8F A;  1QUD A;  3HT6 A;  3EH5 B;  1C8S A;  1L39 A;  4N4W A;  1LYH A;  1C6G A;  122L A;  1T6H A;  1OVH A;  1F88 A;  4KLY A;  1OV7 A;  1L94 A;  241L A;  2OU0 X;  4FA7 B;  5ETZ A;  1QS5 A;  1X0I 1;  3GUN A;  1L69 A;  1L60 A;  1L72 A;  126L A;  1LPY A;  2YCX A;  4XTL A;  3DQB A;  1WTH A;  1L65 A;  1LGU A;  1XIO A;  1QTB A;  233L A;  3C9L A;  1CU0 A;  1QHJ A;  1G0M A;  5B6Y A;  3UTX A;  111L A;  242L A;  2Y04 A;  1P37 A;  1JTN A;  107L A;  1C3W A;  1ZUR A;  4YXC A;  4JQ6 A;  5G2A A;  201L A;  1IW9 A;  3HH6 A;  4YX7 C;  2B6Y A;  4TL3 A;  4GP5 B;  3WQJ A;  1L93 A;  1K28 A;  2LC9 A;  3DN6 A;  2Y00 A;  5A44 A;  3RUN A;  4Y9H A;  1LYJ A;  151L A;  2A4T A;  4EPI A;  3VHZ A;  2PED A;  1L89 A;  3SB8 A;  1L52 A;  1PXS A;  2NTU A;  3VI0 A;  3C7W A;  1QT7 A;  3SBB C;  255L A;  235L A;  5B35 A;  4ARM A;  1PQJ A;  2ANV A;  1QSB A;  165L A;  1L64 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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