3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
3HT9A 1CVKA 4W57A 3OE8A 1D9WA 4YXCA 1L09A 2F2QA 2PEDA 1OV5A 3PWHA 2OU0X 3GULA 2YCZA 1G1VA 1L38A 188LA 1C63A 1XIOA 1XMEB 2O79A 5G2AA 4I7RA 125LA 205LA 3PQRA 1CV0A 2Y00A 191LA 3QJTB 1L97A 1P6YA 2B6YA 200LA 253LA 1CU2A 1PQIA 1CV1A 1L56A 2RBQA 4G7QB 230LA 3HASA 2B6XA 3VGAA 1T8FA 2RB1X 1L41A 1TN0A 1LYDA 1PXSA 3FA0A 4ARLA 3FI5A 4DAJA 1KY1A 2Y03A 4MQSA 174LA 1L58A 1L29A 1C65A 1C8RA 5LZMA 1AT9A 234LA 1SSYA 156LA 103LA 1OVHA 2O7AA 240LA 3SB8A 1QTVA 198LA 1L9HA 2JAFA 1LI6A 1PQKA 1UCQA 1CV6A 4Y9HA 4BV0A 1G1WA 1QUDA 5AZDA 1L35A 1X0K1 1L89A 1QT6A 5B6VA 1WTHA 4UHRA 1KG9A 160LA 4GBRB 1SX2A 1H68A 1KW7A 1L99A 3C81A 2VT4A 1L81A 206LA 2YCXA 1L20A 2YCWA 4X1HA 5B6XA 3HU9A 3DN0A 3VI0A 1C66A 1L06A 1QTZA 1CUPA 3HH3A 5G2CA 2HUKA 1L15A 1L64A 1L95A 2B6TA 3ODUA 2EI4A 1XJTA 4I7SA 107LA 4QI1A 1S8LA 3C7ZA 4LDEA 1CWQA 4GBRA 1S51A 169LA 1C61A 1LWGA 4EPIA 1C60A 108LA 183LA 224LA 1G06A 2OTZX 3GUPA 3UTXA 1M0KA 3C7YA 3GUIA 1G0LA 3OE9A 4PK0A 228LA 4N4YB 4WAVA 1L10A 1S54A 3QBLA 1ZWNA 3HT8A 4EA3A 1LGWA 3QJRB 1L19A 1JTNA 2OU8A 1C6JA 4W59A 1L24A 255LA 180LA 2RBRA 1G0GA 1XJUA 1DYAA 4GP5B 4W53A 5B6YA 1M0MA 4IB4A 1C3WA 3QBGA 1F50A 2B6WA 1BM1A 3NS0A 5A8EA 3DMZA 3HAQA 131LA 1JV7A 1L18A 2B72A 5ETZA 2HPYA 1L87A 1S8JA 2RBNA 1L48A 4I7PA 3PXOA 181LA 1C6HA 2OE4X 2F32A 3QBIA 3HT7A 5JJEA 4EIYA 4L35A 3QBKA 4L6RA 1QHJA 1QUGA 1C6NA 5C1MA 260LA 1IW9A 1C6DA 3AYMA 2RBOA 2NTUA 157LA 2QB0B 4ZPUA 2NTWA 3CDTA 3GUMA 3PBLA 2RBPA 3DN1A 4JQ6A 232LA 1D3JA 1L32A 1SX7A 2RBSA 2KSAA 1Q5IA 3HTBA 1F88A 3PDSA 1L31A 4KLYA 1GZMA 139LA 222LA 1D2WA 1D2YA 4ARJA 1L39A 1QTDA 246LA 2A4TA 4W58A 3T45A 1L21A 3DN4A 249LA 3GUJA 1L52A 1QTBA 161LA 114LA 1KNIA 3DDLA 4HYJA 1P56A 1QM8A 5G36A 1KG8A 4IAQA 150LA 3EH5B 2CUUA 3C9LA 4EXMA 146LA 1L49A 3HH4A 1H2SA 143LA 1L01A 1CX6A 1LGUA 165LA 1P46A 4LDLA 4W55A 1P8UA 4I7OA 2QPDB 1L68A 1CU3A 1HZXA 1QT3A 2RAZX 1C6PA 233LA 3GUKA 5AWZA 5G53A 2YDVA 1G0PA 5G28A 1L37A 1R84A 1OVJA 3SB5A 1KS3A 4JKVA 1L76A 3HUQA 1C69A 1AP9A 227LA 173LA 1L30A 1L14A 113LA 2JAGA 1PY6A 142LA 3F9LA 4X32A 1P7SA 151LA 3DN8A 4EKQA 1C6TA 1QTHA 3UZCA 5AHYA 4FPDA 3FADA 1L61A 119LA 3OAXA 220LA 1TLAA 1LYHA 1QS5A 2Z73A 1GU8A 1VGOA 4W52A 1L40A 3KJ6A 4I7JA 1L91A 1L33A 4MD1A 2L78A 4XTNA 5DHHA 2J4YA 3QDCA 111LA 184LA 1L70A 1L66A 1LI3A 1DYEA 3AYNA 4G71B 1C6BA 2OU9A 5EN0A 5H2KA 5B0WA 3UTWA 1L67A 4N6HA 109LA 4BEYA 1P5CA 3QJSB 4GP8B 1L53A 4DJHA 3SN6R 2F47A 1CU6A 216LA 1EPYA 3NYAA 4G70B 4BEZA 2NTGA 197LA 1PQJA 5H2PA 122LA 7LZMA 3RFMA 1CX7A 4ARMB 3UONA 3COCA 3ABWA 148LE 4HWLA 3AM6A 4OO9A 236LA 1I6SA 1KW5A 1C8SA 1X0I1 170LA 1L26A 2ZIYA 3EH3B 2Z6BA 217LA 1L08A 237LA 185LA 2ANXA 4YXAC 2Y02A 251LA 1L12A 1L27A 1QT4A 4I7MA 3P0GA 1L77A 1L65A 3HARA 4MQTA 3HTDA 1SSWA 4XT1A 5AX1A 4BVNA 1L07A 2B75A 182LA 172LA 2O4WA 192LA 1K28A 2B70A 6LZMA 4G7RB 5F8UA 5G54A 5B34A 3VG9A 1GUEA 3L2XA 1L55A 4ARQB 149LA 213LA 252LA 3EH4B 4I7LA 126LA 242LA 4LZMA 1X0SA 3QJUB 5J7AA 152LA 1QUOA 5A44A 1LYGA 1JGJA 3G3WA 4WW3A 1DZEA 140LA 196LA 4GP4B 2I21A 1QSBA 4PJZA 1C6AA 210LA 1JFPA 3HAOA 1L90A 1JV6A 128LA 3DKEX 104LA 3DMXA 2B6ZA 2X72A 3DNAA 2R4RA 3V2WA 3C8RA 3G3VA 4K5YA 3QJQB 4IARA 1L75A 4ARPA 4EPFA 4LDOA 1L17A 1XJIA 4XT3A 1C6MA 3HTFA 1L80A 3BVDB 1S52A 1L00A 4QIDA 190LA 3SBAA 2I20A 2OEAX 1SWZA 1T8AA 3EMLA 5DHGA 2Q9DA 1L05A 1QKPA 3HH6A 1L44A 189LA 5H2MA 3C7WA 2Y01A 112LA 1L69A 4IAPA 2YCYA 3UTVA 1CU0A 1PQOA 2LC9A 1M0LA 1OWZA 1P2RA 3VW7A 225LA 3CDVA 5H2LA 4FBZA 1DYBA 1L79A 3C82A 4I7QA 1O0AA 1C68A 257LA 141LA 4XTLA 3HU8A 155LA 1QTCA 1LYJA 1CU5A 1E0PA 4NC3A 1L94A 4TL3A 5KKHA 5JJNA 3MBVA 4W54A 1CTWA 5H2JA 2YDOA 2I1XA 3UZAA 1L13A 3X3CA 1C6CA 4AMJA 1U19A 1OV7A 1QT7A 3CAPA 2KSBA 256LA 4BWBA 1L82A 3L64A 1DYCA 4I7TA 2ZFEA 187LA 186LA 4W56A 1JQUA 5B6ZA 3VVKA 245LA 3LZMA 1L11A 221LA 1L45A 2AT9A 144LA 123LA 3SB6A 1C6EA 162LA 1OYUA 158LA 1T8GA 1S53A 2KS9A 1L98A 1QSQA 1L34A 147LA 1VJMA 1E12A 3DMVA 4I7KA 2Y04A 3S3CB 4J4QA 5JJJA 1CUQA 3D4SA 3DN2A 1L42A 1MGYA 168LA 2OTYX 259LA 5B6WA 1TN5A 4I7NA 1L83A 1LWKA 1KMEA 1L36A 2BRDA 3HAPA 1C6KA 4BUOA 1CV3A 1LGXA 4HYXA 1G0KA 261LA 3S8GB 1P8IA 5H2HA 1L93A 1EHKB 3UG9A 1CV4A 2HUMA 4GPOA 4X31A 231LA 4XTOA 4GRVA 4A4MA 3CDRA 1LYFA 1PXRA 3HDEA 138LA 1FBBA 3RZEA 1FBKA 1BRRA 5G2DA 1PQMA 2WJKA 4FA7B 1R2NA 2Q9EA 4EJ4A 2F95A 1KY0A 239LA 214LA 3HT6A 1L51A 5LWEA 1L50A 3OE0A 5AX0A 4GYCA 201LA 5B35A 5AHZA 250LA 1DYGA 2LCBA 2ANVA 3UTYA 2LZMA 3S3DB 3GUOA 5A45A 176LA 3F8VA 3SBBC 1L88A 1SWYA 3NY8A 1L71A 4FAAB 1DYDA 3RUNA 5BR2A 1LI2A 238LA 1QUHA 1NHBA 4ARMA 1DYFA 4JR8A 1IXFA 1G0MA 4EKRA 118LA 212LA 1L25A 1L28A 4MD2A 1L62A 2OE9X 1C62A 3DN6A 1L86A 120LA 3SB7A 1C6GA 1G0JA 1G07A 1L43A 1LN6A 2G87A 1CV5A 1L92A 211LA 4PXKA 175LA 3GUNA 1T6HA 1LW9A 4DKLA 1JTMA 110LA 1C6IA 229LA 1L84A 209LA 3HUKA 3S8FB 3QAPA 1L57A 219LA 3CDOA 2B7XA 1BRXA 5BR5A 1UAZA 2Z55A 4ARQA 1QKOA 167LA 3OE6A 1P37A 1C67A 2B73A 4QRYA 4AMIA 1P36A 3HTGA 164LA 3V2YA 1OVKA 223LA 4E97A 195LA 3QAKA 1C6LA 1D3FA 4S0WA 3QJVB 129LA 4PXFA 262LA 159LA 145LA 3DN3A 1P3NA 247LA 3CDQA 3HUAA 166LA 1L72A 102LA 1L54A 3VHZA 137LA 1P64A 1L46A 3C80A 4MBSA 1T97A 3G3XA 3JR6A 3K2RA 1BRDA 218LA 2L6XA 3ZEVA 2ZZLA 258LA 3C8QA 5FJGA 1QS9A 3HWLA 4AQNA 1L96A 1P8HA 4EKPA 2QPEB 3HDFA 4OV0A 1L16A 3S3BB 1LLHA 2HULA 1P2LA 5DYSA 1C6FA 2B74A 5ITCA 3A7KA 2NTHA 1F4ZA 2KSYA 5I14A 4XXJA 1D3MA 115LA 215LA 2M3GA 3HH5A 130LA 235LA 199LA 3DQBA 1L0KA 226LA 241LA 127LA 1LYEA 1D3NA 5H2OA 1LYIA 1L85A 5TGZA 3ZPQA 3WQJA 1G0QA 177LA 1B6IA 1L23A 2RH1A 1C6QA 1OWYA 2WJLA 248LA 3NY9A 2LNLA 3SB9A 243LA 1L22A 254LA 1L47A 3REYA 2IGCA 5H2IA 4KNFA 1C64A 2RAYX 1L73A 4W51A 1L02A 3HANA 5H2NA 1PQDA 1QT8A 4UG2A 1L74A 1L59A 1ZURA 4YX7C 1L0MA 2I35A 1LPYA 178LA 244LA 1IW6A 163LA 3C83A 3C8SA 3ZPRA 2R4SA 3NSBA 1QT5A 1L60A 1L63A 2OE7X 4EKSA 4N4WA 1L0JA 1KGBA 2RB2X 1Q5JA 3CODA 3X3BA 1XEPA 1L04A 2RB0X 4G7SB 2QARC 5B2NA 1ZYTA 3C9MA 171LA 4G72B 5ITEA 1L03A 2F93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CVKA 3OE8A 1OUEA 4OWEA 3GULA 2YCZA 1TCYA 2D4IA 9LYZA 2O79A 3AGIA 4LYZA 1WVVA 1YILA 2FYDA 3AZ5A 4TWSA 2CGIA 1PQIA 1CV1A 4YM8A 1REZA 230LA 1BHZA 3VGAA 1T8FA 1L41A 1LZEA 1LHMA 1LYDA 1PXSA 3TXJA 4ARLA 3FI5A 4DAJA 1B5WA 1QIOA 4MQSA 4UWVA 1C65A 1C8RA 5LZMA 2O7AA 1OVHA 4QI1A 198LA 1UIBA 3A6CY 1CV6A 1LZ9A 5C6LA 1L35A 1AT6A 4ML7A 4MCKA 1GB2A 1SX2A 1KW7A 3N9CA 4AGAA 3BKHA 2BQAA 2G4NA 4NHPA 2YCWA 1G7LC 3DN0A 1QTZA 3HH3A 4HTQA 1UC0A 1L95A 1OUIA 3QE8A 2IHLA 2EI4A 1XGTC 3P64A 4DS7E 2Z38A 3WMKA 2MEFA 4TSBA 2X0AA 4W94A 3UTXA 4W96A 3B0IA 3OE9A 1G0LA 228LA 4N4YB 1L10A 3LZTA 3HT8A 4EA3A 1OUJA 3QJRB 1L19A 3B6LA 4DC4A 180LA 4GP5B 4W53A 4DD7A 1WQNA 1JTTL 1JV7A 4N9RA 1LYZA 2B72A 5ETZA 1L48A 4I7PA 1C6HA 2OE4X 1IP4A 2F32A 4NGLA 1B9OA 4L35A 2F30A 1RJCB 1SQ2L 4MR1A 1GEVA 3WXTA 3WL2A 2W1LA 2DQCY 3HTBA 4WM4A 4RW1A 1L31A 4KLYA 222LA 1D2YA 4W58A 4B4JA 1QTBA 1KNIA 1LZSA 1P56A 2BQDA 4HJZA 5IHGA 1H2SA 1LGUA 1L68A 1D6PA 1HZXA 1QT3A 5AWZA 1GE2A 1UUZC 2YDVA 1L37A 1UIFA 4DWXA 1R84A 4G4HA 5I53A 1IC5Y 3HUQA 173LA 1QSAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CU5 A;  1E0P A;  4NC3 A;  1L94 A;  4TL3 A;  5KKH A;  5JJN A;  3MBV A;  4W54 A;  1CTW A;  5H2J A;  2YDO A;  2I1X A;  3UZA A;  1L13 A;  3X3C A;  1C6C A;  4AMJ A;  1U19 A;  1OV7 A;  1QT7 A;  3CAP A;  2KSB A;  256L A;  4BWB A;  1L82 A;  3L64 A;  1DYC A;  4I7T A;  2ZFE A;  187L A;  186L A;  4W56 A;  1JQU A;  5B6Z A;  3VVK A;  245L A;  3LZM A;  1L11 A;  221L A;  1L45 A;  2AT9 A;  144L A;  123L A;  3SB6 A;  1C6E A;  162L A;  1OYU A;  158L A;  1T8G A;  1S53 A;  2KS9 A;  1L98 A;  1QSQ A;  1L34 A;  147L A;  1VJM A;  1E12 A;  3DMV A;  4I7K A;  2Y04 A;  3S3C B;  4J4Q A;  5JJJ A;  1CUQ A;  3D4S A;  3DN2 A;  1L42 A;  1MGY A;  168L A;  2OTY X;  259L A;  5B6W A;  1TN5 A;  4I7N A;  1L83 A;  1LWK A;  1KME A;  1L36 A;  2BRD A;  3HAP A;  1C6K A;  4BUO A;  1CV3 A;  1LGX A;  4HYX A;  1G0K A;  261L A;  3S8G B;  1P8I A;  5H2H A;  1L93 A;  1EHK B;  3UG9 A;  1CV4 A;  2HUM A;  4GPO A;  4X31 A;  231L A;  4XTO A;  4GRV A;  4A4M A;  3CDR A;  1LYF A;  1PXR A;  3HDE A;  138L A;  1FBB A;  3RZE A;  1FBK A;  1BRR A;  5G2D A; 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 1L59 A;  1ZUR A;  4YX7 C;  1L0M A;  2I35 A;  1LPY A;  178L A;  244L A;  1IW6 A;  163L A;  3C83 A;  3C8S A;  3ZPR A;  2R4S A;  3NSB A;  1QT5 A;  1L60 A;  1L63 A;  2OE7 X;  4EKS A;  4N4W A;  1L0J A;  1KGB A;  2RB2 X;  1Q5J A;  3COD A;  3X3B A;  1XEP A;  1L04 A;  2RB0 X;  4G7S B;  2QAR C;  5B2N A;  1ZYT A;  3C9M A;  171L A;  4G72 B;  5ITE A;  1L03 A;  2F93 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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