3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
1D9WA 4WAVA 205LA 1QS9A 1M0MA 1L49A 4EA3A 1C3WA 4XT1A 3DKEX 1D3JA 1E12A 185LA 4W57A 2RB0X 3P0GA 2HPYA 3HUQA 1JQUA 1SWYA 3QJSB 4GBRA 5H2OA 1GU8A 1L18A 1JV6A 1UCQA 4BEZA 144LA 1C67A 195LA 1L17A 212LA 1TN0A 1SX2A 1BRRA 1FBKA 5B34A 5H2MA 196LA 1OWYA 1P37A 1QUDA 1OWZA 2HUMA 4EKRA 4N4YB 2CUUA 1F4ZA 3C7WA 4GPOA 1LYFA 2RBRA 2OU9A 1CV5A 1L71A 4I7PA 3NS0A 1L45A 3QBKA 3HAOA 3AYMA 3ZPQA 3SN6R 4JKVA 1PY6A 4XTOA 120LA 3BVDB 1OVHA 3COCA 1L40A 4L6RA 238LA 1L47A 2NTGA 3QJQB 139LA 4N4WA 5H2LA 1PQKA 177LA 1X0I1 250LA 3FA0A 1IW6A 243LA 1LGWA 5G36A 1C6CA 1C6AA 3DN2A 169LA 1C6HA 1P3NA 3NY8A 1L88A 4EJ4A 2B72A 4W53A 3PBLA 1CV3A 2Y01A 3UG9A 1L10A 1C65A 141LA 3A7KA 1L92A 1JFPA 1L37A 4ARJA 155LA 1L55A 2RH1A 1L60A 1S53A 131LA 4XXJA 1L43A 1P6YA 1BM1A 2Z73A 1ZURA 3EH5B 4I7NA 1AT9A 1CU3A 1L38A 1T97A 2HUKA 122LA 3OE9A 3REYA 1L22A 1L57A 3QBLA 3HASA 1L29A 4QRYA 1S54A 5BR2A 1L31A 3S3DB 3MBVA 3DN0A 3D4SA 4G7SB 5B6YA 3VW7A 1L96A 1C64A 4UG2A 4I7OA 4BEYA 5G2AA 1WTHA 3KJ6A 152LA 1L44A 2RB2X 1S8JA 3UTXA 1L03A 1L27A 1PXSA 2OU0X 1CV6A 149LA 3NYAA 5B6ZA 156LA 1QKPA 3S8FB 1QUGA 2KS9A 1R84A 184LA 3AM6A 163LA 5G2CA 2OE7X 5TGZA 4PJZA 1CTWA 255LA 1H68A 1KY0A 2NTHA 2KSYA 1XJTA 3SB8A 4DKLA 176LA 3C80A 1I6SA 1C6LA 1CVKA 4QIDA 162LA 1KNIA 2F95A 5H2IA 2WJKA 5JJJA 1G0KA 1QTZA 222LA 1IXFA 3VG9A 3GUNA 1QSQA 3GUKA 157LA 3HAQA 1IW9A 5B0WA 4BV0A 1D3FA 3OE8A 4ARMB 3VVKA 104LA 1L64A 3C81A 4WW3A 1NHBA 4PK0A 1LGXA 1QT3A 2A4TA 5C1MA 1L50A 1L02A 127LA 1L20A 4G7RB 1L51A 3RZEA 1B6IA 1L89A 3DN6A 4Y9HA 2OU8A 4YXAC 108LA 3UTVA 1DYBA 1C6QA 3SBBC 2QB0B 2B6WA 1QS5A 3OE6A 1TN5A 1KS3A 3L64A 1KG9A 1G1VA 4EKPA 1L58A 3VHZA 218LA 3HTBA 7LZMA 4I7QA 1C8RA 2Y00A 4TL3A 4K5YA 1L30A 3F9LA 1XMEB 2OEAX 3RUNA 257LA 2ZIYA 1CU5A 1L80A 1L62A 5H2HA 1L19A 3HU8A 3C9LA 1L68A 192LA 3NSBA 3HT6A 4PXKA 4AMIA 3HTFA 209LA 254LA 5G53A 1G0PA 4HWLA 3VGAA 102LA 4LDOA 1LYJA 206LA 4W52A 2VT4A 2Y03A 3SB9A 5B6VA 175LA 3HDFA 4MD1A 1LYGA 1SX7A 1PQOA 211LA 2OTZX 4GBRB 186LA 2B6TA 5F8UA 1KY1A 1L04A 2RAYX 5KKHA 2J4YA 4I7MA 1O0AA 3DN1A 189LA 261LA 3QJVB 2RBPA 1L85A 5JJEA 4I7KA 181LA 3UZAA 1KW5A 4GP4B 4ARPA 3HH4A 253LA 2B74A 1L33A 1G1WA 2YCYA 2G87A 143LA 1L32A 3GUMA 5A8EA 210LA 1L34A 4E97A 1XIOA 2EI4A 3SB7A 2L6XA 1C6TA 4X32A 213LA 229LA 2LC9A 3C82A 145LA 3G3VA 5JJNA 1PQJA 1QSBA 1DYEA 3SBAA 5ETZA 3C8QA 5H2PA 4HYJA 4MQTA 1L82A 1L28A 5J7AA 1JTMA 1QUOA 178LA 3HT7A 4KLYA 2B6YA 137LA 1C66A 1C8SA 109LA 4XTNA 1QUHA 3UTWA 1G0GA 1L36A 248LA 180LA 4DAJA 252LA 5H2JA 1L75A 1L16A 237LA 3X3CA 227LA 5AHZA 4ZPUA 197LA 3C7ZA 1MGYA 1P7SA 4BUOA 3LZMA 3V2YA 3ZPRA 1L59A 1CV1A 2ANXA 2RBSA 146LA 1C6JA 1QTDA 1LYDA 4GYCA 1D2YA 256LA 4N6HA 115LA 220LA 2F32A 2Q9EA 3G3XA 1C62A 3C9MA 123LA 1L86A 3HH6A 1VJMA 2HULA 4LZMA 241LA 1CU0A 1QKOA 5B35A 2YCXA 4PXFA 118LA 5DHHA 3ABWA 2ZZLA 1QM8A 4OO9A 2YDVA 231LA 3OE0A 2B6ZA 1QT4A 1P5CA 2O79A 245LA 110LA 1C6GA 3HU9A 1BRDA 1S8LA 1L87A 1C69A 3DDLA 4L35A 4XT3A 1C68A 1LGUA 1C6MA 1F88A 1G0JA 3HT9A 1LI2A 2Y02A 1C6EA 1ZWNA 1JGJA 1G06A 4EIYA 3S3CB 1CV0A 4ARLA 1L24A 3CDTA 1LN6A 2ANVA 3S8GB 4EPFA 1D3MA 2ZFEA 1BRXA 1DYDA 1K28A 1L91A 230LA 2NTWA 2F2QA 1D2WA 128LA 219LA 1L98A 1C6BA 4I7TA 1OVJA 1C60A 113LA 2KSAA 3HAPA 247LA 183LA 148LE 1L77A 1L72A 1L76A 1L01A 3C83A 3CDOA 4DJHA 3UTYA 1D3NA 258LA 1L41A 1H2SA 168LA 1EHKB 1LW9A 4GP5B 198LA 5AZDA 2OTYX 1SWZA 5AWZA 3RFMA 1DZEA 4W54A 1QHJA 2YDOA 1QTBA 1SSYA 1XJUA 5DHGA 2B7XA 1FBBA 1EPYA 1L84A 216LA 4FAAB 1KW7A 3PDSA 1L81A 3QBIA 158LA 2I21A 3AYNA 3HH5A 1KG8A 6LZMA 246LA 5AHYA 111LA 4BVNA 1F50A 3EH3B 244LA 4ARMA 3DQBA 3GUPA 1M0KA 2YCZA 3HANA 1Q5IA 1AP9A 3X3BA 187LA 1L74A 3DN4A 4X1HA 1L90A 2O4WA 1L65A 1LI3A 3T45A 4ARQB 1L00A 5EN0A 4G70B 3HTDA 166LA 4FBZA 103LA 236LA 4X31A 242LA 201LA 1QT8A 114LA 1CX6A 1DYAA 1L14A 1L46A 1L15A 5DYSA 1LI6A 3ZEVA 172LA 1L06A 3ODUA 1PXRA 4G71B 4LDLA 3DNAA 4EKSA 1S52A 4I7LA 1GZMA 2QPEB 4S0WA 3CODA 1LPYA 1L73A 221LA 3V2WA 1L23A 159LA 214LA 2RBOA 1L99A 5AX0A 2O7AA 2I20A 1P2RA 5LWEA 112LA 1T8AA 160LA 1L94A 4YX7C 164LA 1L13A 1LLHA 1L0KA 3VI0A 1QT5A 1XJIA 4AQNA 2JAFA 3DN8A 1G0MA 1S51A 1L21A 5ITEA 1QT7A 2RBNA 1G07A 1X0K1 259LA 1QTVA 1SSWA 260LA 5B6XA 5ITCA 1P36A 1PQDA 4W51A 2M3GA 126LA 182LA 3GULA 3C8RA 4A4MA 2LCBA 2OE4X 224LA 2X72A 1L0JA 4EKQA 119LA 2B75A 3HTGA 3GUOA 2IGCA 1LWGA 3S3BB 3SB6A 190LA 107LA 5AX1A 3G3WA 4AMJA 1L56A 2Q9DA 3DMZA 3OAXA 4G72B 3QAKA 3DMVA 1T8FA 1C63A 2B6XA 3JR6A 1KMEA 3HT8A 1C61A 228LA 1JTNA 1OV5A 1DYCA 2NTUA 3UZCA 226LA 1G0LA 165LA 1L54A 1L70A 1DYFA 215LA 3GUJA 2I35A 3HARA 5H2NA 1L97A 125LA 233LA 232LA 3DN3A 4IAPA 1VGOA 1C6KA 2I1XA 2RAZX 2PEDA 1P46A 2L78A 1ZYTA 3L2XA 1L63A 4W56A 1CX7A 1XEPA 2R4SA 4IB4A 4J4QA 2R4RA 3PQRA 4QI1A 1L52A 1L83A 1L53A 2B70A 1JV7A 174LA 1L08A 2F93A 1L12A 4I7RA 235LA 1C6NA 3QDCA 4MBSA 1P8IA 3QJUB 1M0LA 5I14A 1P8UA 3PXOA 1CU6A 2Z55A 5B6WA 1G0QA 4W59A 251LA 1X0SA 1L93A 1P64A 161LA 1L48A 1L66A 1P2LA 3FI5A 1P56A 3UONA 1L05A 188LA 1L11A 142LA 1L79A 3QJTB 1P8HA 173LA 2RBQA 1R2NA 1GUEA 3HWLA 5A44A 2OE9X 3K2RA 3FADA 4IAQA 4JR8A 1QTHA 4MQSA 2WJLA 1HZXA 1C6IA 4HYXA 4YXCA 1U19A 4IARA 3HH3A 262LA 3WQJA 3HUAA 4GRVA 129LA 3DMXA 1KGBA 3CDQA 2QARC 4LDEA 3CDVA 1LYIA 147LA 4FPDA 1DYGA 3GUIA 5A45A 1L95A 1Q5JA 1UAZA 4I7SA 5G54A 3CDRA 217LA 1L26A 1OVKA 5BR5A 4W55A 171LA 223LA 3NY9A 3F8VA 140LA 1L42A 2B73A 150LA 3C7YA 4W58A 167LA 2RB1X 3CAPA 4FA7B 4I7JA 1LYEA 1L35A 3QAPA 5LZMA 1L25A 1CWQA 2JAGA 225LA 2AT9A 1L07A 1L61A 200LA 1PQIA 1C6FA 2LZMA 4JQ6A 3HDEA 3EH4B 239LA 1LWKA 1L69A 240LA 4GP8B 2Z6BA 3EMLA 2LNLA 1L0MA 2KSBA 1L09A 199LA 1OV7A 4KNFA 1QT6A 3QBGA 151LA 4UHRA 1L67A 3SB5A 1CV4A 3C8SA 191LA 1CUQA 4XTLA 4NC3A 4OV0A 1CUPA 2QPDB 5FJGA 2F47A 2BRDA 130LA 1LYHA 1C6PA 249LA 5H2KA 4BWBA 4EPIA 3QJRB 2YCWA 1PQMA 170LA 1L39A 1OYUA 4G7QB 234LA 3PWHA 1T6HA 138LA 1E0PA 1CU2A 5G28A 5G2DA 1L9HA 1C6DA 1T8GA 5B2NA 4ARQA 4EXMA 1TLAA 4MD2A 3HUKA 1QTCA 2Y04A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D9WA 1GFEA 3G3AB 5KXNA 2HU1A 5L9JA 1NQIA 1C3WA 3DKEX 1D3JA 1GE4A 4WO6A 1JQUA 3QJSB 5H2OA 4XN6A 1REZA 2H9JA 1IP6A 1JV6A 1UCQA 144LA 1C67A 4DDAA 1BRRA 196LA 1OWYA 4LYOA 4N4YB 1LHHA 1CV5A 4GN3A 2EPEA 1LSEA 4I7PA 3NS0A 2ZYCA 3AYMA 1PY6A 5L3HA 1L40A 5LAFA 1L47A 1EQEA 3TXBA 2ZILA 1PQKA 4N4WA 177LA 1X0I1 3BKHA 250LA 5A3EA 3DN2A 1IR7A 3NY8A 1LMQA 5KKJA 4O34A 1VEDA 1L92A 5JENB 1JFPA 1L55A 1GFRA 1YKXX 4XXJA 1L43A 1LZDA 1BM1A 2Z73A 1ZURA 2FBDA 4TWSA 3REYA 2HTXA 3OE9A 3QBLA 1L57A 3HASA 1S54A 1LPIA 2MEHA 3D4SA 1AT5A 3VW7A 1C64A 4UG2A 4I7OA 5G2AA 4C5FA 3KAMA 2DKVA 2D91A 5B6ZA 1QKPA 3B6LA 4LYCA 3GXKA 4ET9A 184LA 1AT6A 5G2CA 5TGZA 1GPQC 4NSJA 2NTHA 1XJTA 1I6SA 1KNIA 3GUNA 3GUKA 1IW9A 1XGUC 3C81A 5FEKA 1L50A 3A92A 2LYOA 1L02A 4H9EA 4Y9HA 4YXAC 2HUBA 4DS7E 3WU8A 2FBBA 3UTVA 2XJWA 4DQ5A 1QS5A 1G1VA 2MEIA 4EKPA 2Y00A 1GBYA 1GF5A 1C7PA 153LA 1LSBA 4N1EI 257LA 1XGRC 1L62A 5H2HA 1L19A 1B7QA 2BAAA 3A6BY 3HT6A 3A8ZA 4PXKA 209LA 254LA 1YAMA 135LA 5APDA 4DQJA 102LA 1LYJA 4N0JA 3LYZA 1GAZA 1LZ4A 1RJCB 5B6VA 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 111L A;  4BVN A;  1F50 A;  3EH3 B;  244L A;  4ARM A;  3DQB A;  3GUP A;  1M0K A;  2YCZ A;  3HAN A;  1Q5I A;  1AP9 A;  3X3B A;  187L A;  1L74 A;  3DN4 A;  4X1H A;  1L90 A;  2O4W A;  1L65 A;  1LI3 A;  3T45 A;  4ARQ B;  1L00 A;  5EN0 A;  4G70 B;  3HTD A;  166L A;  4FBZ A;  103L A;  236L A;  4X31 A;  242L A;  201L A;  1QT8 A;  114L A;  1CX6 A;  1DYA A;  1L14 A;  1L46 A;  1L15 A;  5DYS A;  1LI6 A;  3ZEV A;  172L A;  1L06 A;  3ODU A;  1PXR A;  4G71 B;  4LDL A;  3DNA A;  4EKS A;  1S52 A;  4I7L A;  1GZM A;  2QPE B;  4S0W A;  3COD A;  1LPY A;  1L73 A;  221L A;  3V2W A;  1L23 A;  159L A;  214L A;  2RBO A;  1L99 A;  5AX0 A;  2O7A A;  2I20 A;  1P2R A;  5LWE A;  112L A;  1T8A A;  160L A;  1L94 A;  4YX7 C;  164L A;  1L13 A;  1LLH A;  1L0K A;  3VI0 A;  1QT5 A;  1XJI A;  4AQN A;  2JAF A;  3DN8 A;  1G0M A;  1S51 A;  1L21 A;  5ITE A;  1QT7 A;  2RBN A;  1G07 A;  1X0K 1;  259L A;  1QTV A;  1SSW A;  260L A;  5B6X A;  5ITC A;  1P36 A;  1PQD A;  4W51 A;  2M3G A;  126L A;  182L A;  3GUL A;  3C8R A;  4A4M A;  2LCB A; 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 1L11 A;  142L A;  1L79 A;  3QJT B;  1P8H A;  173L A;  2RBQ A;  1R2N A;  1GUE A;  3HWL A;  5A44 A;  2OE9 X;  3K2R A;  3FAD A;  4IAQ A;  4JR8 A;  1QTH A;  4MQS A;  2WJL A;  1HZX A;  1C6I A;  4HYX A;  4YXC A;  1U19 A;  4IAR A;  3HH3 A;  262L A;  3WQJ A;  3HUA A;  4GRV A;  129L A;  3DMX A;  1KGB A;  3CDQ A;  2QAR C;  4LDE A;  3CDV A;  1LYI A;  147L A;  4FPD A;  1DYG A;  3GUI A;  5A45 A;  1L95 A;  1Q5J A;  1UAZ A;  4I7S A;  5G54 A;  3CDR A;  217L A;  1L26 A;  1OVK A;  5BR5 A;  4W55 A;  171L A;  223L A;  3NY9 A;  3F8V A;  140L A;  1L42 A;  2B73 A;  150L A;  3C7Y A;  4W58 A;  167L A;  2RB1 X;  3CAP A;  4FA7 B;  4I7J A;  1LYE A;  1L35 A;  3QAP A;  5LZM A;  1L25 A;  1CWQ A;  2JAG A;  225L A;  2AT9 A;  1L07 A;  1L61 A;  200L A;  1PQI A;  1C6F A;  2LZM A;  4JQ6 A;  3HDE A;  3EH4 B;  239L A;  1LWK A;  1L69 A;  240L A;  4GP8 B;  2Z6B A;  3EML A;  2LNL A;  1L0M A;  2KSB A;  1L09 A;  199L A;  1OV7 A;  4KNF A;  1QT6 A;  3QBG A;  151L A;  4UHR A;  1L67 A;  3SB5 A;  1CV4 A;  3C8S A;  191L A;  1CUQ A;  4XTL A;  4NC3 A;  4OV0 A;  1CUP A;  2QPD B;  5FJG A;  2F47 A;  2BRD A;  130L A;  1LYH A;  1C6P A;  249L A;  5H2K A;  4BWB A;  4EPI A;  3QJR B;  2YCW A;  1PQM A;  170L A;  1L39 A;  1OYU A;  4G7Q B;  234L A;  3PWH A;  1T6H A;  138L A;  1E0P A;  1CU2 A;  5G28 A;  5G2D A;  1L9H A;  1C6D A;  1T8G A;  5B2N A;  4ARQ A;  4EXM A;  1TLA A;  4MD2 A;  3HUK A;  1QTC A;  2Y04 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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