3EMLA

The 2.6 a crystal structure of a human a2a adenosine receptor bound to zm241385.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 2.6 Angstrom Crystal Structure of a Human A2A Adenosine Receptor Bound to an Antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein, receptor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Human Adenosine A2A receptor/T4 lysozyme chimera
total genus 167
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3emlA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3emlA01
1P46A 1C67A 4XTLA 1CV6A 1C6JA 3GUNA 1QT4A 1KW5A 3QBLA 245LA 3CDRA 1L57A 3HT8A 1KGBA 2OTYX 2NTWA 197LA 258LA 1C62A 2ZIYA 131LA 231LA 1BM1A 1C6QA 1L97A 1G0PA 2R4RA 223LA 4I7PA 2RBPA 1L52A 1C6CA 206LA 183LA 2RB0X 158LA 141LA 3CAPA 1L30A 4MQTA 255LA 5H2IA 1L15A 4E97A 1DYEA 3OE0A 3F8VA 3C9LA 3VHZA 1GU8A 4IAQA 2CUUA 2I21A 2WJLA 5DHGA 4N4YB 3UZAA 1D3JA 3SB6A 5KKHA 238LA 3L2XA 2YDVA 1G07A 2B7XA 1QTVA 3ABWA 1L64A 1G0LA 2OEAX 2L6XA 4GYCA 1L93A 3UG9A 147LA 3GUKA 2OE9X 129LA 1WTHA 1SWZA 5I14A 159LA 1L25A 248LA 4EKPA 1UCQA 3ZEVA 4G71B 3DN4A 1OV5A 4QRYA 3PQRA 142LA 1L40A 218LA 259LA 4HYXA 1T97A 166LA 1C6KA 1ZWNA 3GUJA 5C1MA 2F2QA 120LA 1QT3A 2O7AA 3HT6A 4AQNA 5BR5A 5B2NA 3V2WA 1PY6A 2HUMA 3C8SA 4GBRB 1L88A 1X0K1 5JJEA 1PQOA 3LZMA 3EH4B 252LA 3DMVA 4K5YA 5B34A 3HTGA 1L65A 3CDTA 219LA 2NTUA 1L07A 1ZYTA 1L43A 1R2NA 4PK0A 1LYIA 1EHKB 3GUIA 3GUMA 4FAAB 4W56A 2LZMA 200LA 1LYJA 1M0KA 3PDSA 3C83A 1QS9A 143LA 176LA 5JJJA 1TN5A 2QPDB 1U19A 3ZPQA 237LA 3HUKA 1L72A 2OU8A 3DN3A 5FJGA 3BVDB 2RBRA 1G0JA 210LA 1D3FA 1F50A 2YCYA 3ZPRA 1XEPA 1HZXA 3C80A 5JJNA 2KSBA 4OO9A 3HARA 1L71A 1S8JA 1L66A 1L84A 2Q9DA 3VI0A 138LA 1NHBA 155LA 1CV1A 4W53A 2X72A 1QUHA 3EH3B 1L01A 4EPIA 4KNFA 4X1HA 2RAYX 2A4TA 5LZMA 3HUAA 2KSYA 123LA 2LNLA 1T8AA 3S8GB 209LA 5BR2A 139LA 247LA 2B73A 1C6EA 3G3XA 5B6XA 1CV5A 242LA 256LA 228LA 5H2LA 1LLHA 1P8IA 2OU0X 3MBVA 261LA 1I6SA 1L10A 4I7MA 1L53A 214LA 2RBNA 1QSBA 1L50A 1XMEB 1LN6A 1KY1A 3HDFA 1L35A 3D4SA 1C3WA 1OWZA 3G3WA 1L89A 3QBIA 4DAJA 1DYGA 3F9LA 232LA 130LA 1CV4A 201LA 1CX7A 144LA 157LA 163LA 1OV7A 1T6HA 3AYMA 4XT3A 4BEYA 4JR8A 1L02A 2ZZLA 4BV0A 1QTHA 1Q5IA 2KS9A 3JR6A 3HANA 1L26A 5AHZA 3SB8A 2IGCA 3FA0A 2B6XA 5J7AA 251LA 1L39A 4L6RA 175LA 1L83A 241LA 3HUQA 181LA 3HWLA 220LA 1QKPA 2JAFA 2HULA 2YDOA 3EH5B 4S0WA 3P0GA 1L96A 217LA 4Y9HA 6LZMA 224LA 1LI6A 2AT9A 1L76A 1L20A 1L16A 2RBQA 3QJVB 5AHYA 126LA 4DJHA 1OYUA 1L61A 3QJQB 4ARQB 4N4WA 1GZMA 1L62A 1G0KA 226LA 1L22A 1L08A 1SSYA 1P8UA 1T8FA 2B6TA 3QAKA 3CODA 2B75A 1BRXA 127LA 2YCXA 3QJSB 3S3BB 222LA 168LA 3HT9A 2B70A 5AX1A 1L44A 1CUQA 1C6PA 4DKLA 156LA 198LA 1D2WA 1CV0A 1R84A 3QJRB 1QT6A 3T45A 3V2YA 1LYDA 1QHJA 192LA 1JTMA 1L99A 2RAZX 167LA 1LYEA 240LA 4W52A 1PQMA 3HAQA 1F88A 122LA 177LA 1LGUA 3C81A 1QT5A 1L31A 125LA 249LA 239LA 4ARMA 115LA 3FI5A 1QKOA 3QBKA 170LA 1QTZA 1L34A 1D2YA 3K2RA 4LDOA 3NSBA 1BRRA 4MD2A 1QTDA 1L27A 1S53A 4NC3A 5A8EA 1L48A 1C68A 1X0I1 4G72B 3NY8A 2Q9EA 215LA 1KG8A 1DYAA 1L54A 1IXFA 1PQDA 1C69A 3C8RA 1PXRA 4IARA 1C6LA 2B6ZA 1SSWA 1AP9A 3EMLA 2QARC 4EKRA 4X31A 164LA 1BRDA 3QAPA 2B6YA 2Y01A 1L03A 1OWYA 236LA 1C66A 233LA 1KMEA 4MBSA 3S3DB 3QDCA 4HWLA 1L68A 174LA 4EKQA 1PXSA 1C65A 4I7LA 1Q5JA 1C60A 4XT1A 3NYAA 3QBGA 3HH5A 4EKSA 3DN1A 3GUPA 4I7NA 3UTYA 1XJUA 4I7QA 1IW6A 4I7KA 165LA 4YXCA 3COCA 5H2KA 4A4MA 1L86A 149LA 2OE4X 2I1XA 5A44A 1XJIA 1QT8A 199LA 2I35A 3DQBA 1L0MA 2RBSA 4BEZA 5G36A 1C6NA 1QT7A 4EPFA 1L49A 1LYGA 2WJKA 3HTFA 1P3NA 1L90A 1D9WA 1UAZA 4G7QB 1LWKA 1K28A 4BUOA 250LA 244LA 3WQJA 2G87A 4GBRA 4EA3A 195LA 2ANXA 1EPYA 4KLYA 1L55A 4XTOA 1L67A 1P64A 2OTZX 1L32A 1L28A 1L00A 1C8RA 2OE7X 2YCZA 1DZEA 111LA 1C61A 1G0GA 1QUGA 213LA 182LA 3PWHA 4W54A 3AM6A 5F8UA 1C6BA 1MGYA 5DHHA 1E12A 3G3VA 1CU5A 1PQJA 3SB7A 190LA 3DN2A 3UZCA 5H2HA 2F93A 4IAPA 1QTCA 4JQ6A 2QB0B 3C7WA 1C6TA 1M0LA 1L81A 257LA 4J4QA 229LA 3REYA 2I20A 212LA 1L33A 246LA 5AZDA 3AYNA 5ITCA 5EN0A 109LA 3HH4A 1QUOA 4X32A 4FA7B 186LA 4W55A 4G7RB 225LA 2F95A 4LZMA 1L06A 1L74A 3X3CA 4JKVA 253LA 3VGAA 1L45A 160LA 5G2CA 1G0QA 1VJMA 3DDLA 1L9HA 3S8FB 4W58A 1PQKA 1DYDA 3HU8A 2J4YA 151LA 4EIYA 113LA 3CDOA 1KG9A 2Y04A 1CVKA 1G1VA 3GUOA 3PBLA 4FPDA 4ARPA 1DYFA 1L95A 1C8SA 4HYJA 4N6HA 4XTNA 5G2DA 5B6VA 2OU9A 196LA 2NTGA 1L87A 4BVNA 4I7RA 4MD1A 3PXOA 1D3NA 3C7ZA 3A7KA 1S52A 1G06A 5B0WA 5B6ZA 114LA 3HDEA 4OV0A 1QUDA 137LA 161LA 191LA 1G1WA 3FADA 5AWZA 3X3BA 171LA 3SBAA 108LA 1T8GA 1L73A 1P56A 5H2OA 4XXJA 4L35A 184LA 4W57A 5G2AA 3HT7A 2EI4A 3UONA 4WW3A 2RBOA 5G28A 1KNIA 5H2MA 1L85A 7LZMA 4ARMB 1O0AA 5DYSA 1QM8A 3C7YA 1LYFA 3HASA 3DN0A 1L41A 1L69A 4UHRA 1LI3A 5LWEA 173LA 3UTXA 4ARQA 1L0JA 1JFPA 2F47A 1CUPA 1L19A 180LA 1P7SA 1IW9A 1CWQA 3KJ6A 5B6WA 3SN6R 2B72A 3S3CB 2L78A 5B35A 1L21A 3RZEA 1LGXA 1LWGA 1L56A 1JV7A 4TL3A 1LI2A 187LA 5H2JA 3ODUA 1ZURA 1LGWA 3GULA 1C6GA 3NS0A 4AMJA 1L11A 3RUNA 1G0MA 1L59A 1SWYA 2F32A 3SBBC 1VGOA 1X0SA 1CU3A 2PEDA 1L91A 3OAXA 1L92A 4FBZA 1L38A 1TLAA 1KS3A 4I7OA 4QIDA 119LA 2O79A 4GP8B 4G70B 1F4ZA 3OE9A 1P8HA 3L64A 3QJUB 102LA 3DNAA 188LA 3HTBA 1L05A 2KSAA 3UTVA 227LA 3VW7A 2HPYA 4PXKA 3HU9A 1JGJA 146LA 1L58A 3NY9A 3SB9A 1L80A 2O4WA 3DN6A 3C9MA 1L13A 5G54A 2Z6BA 1CU2A 216LA 1L14A 1OVKA 5TGZA 128LA 3DMXA 3VVKA 1S8LA 1OVJA 1P2LA 3HAPA 162LA 1L24A 3OE8A 1AT9A 2Z73A 1LPYA 4W51A 1L18A 5G53A 1CV3A 1OVHA 4UG2A 1C6AA 1L36A 4G7SB 260LA 1QSQA 1H2SA 1L60A 2RH1A 4ARLA 1E0PA 4EXMA 178LA 2Y00A 262LA 1L82A 3VG9A 4IB4A 2Y03A 1C6IA 1KW7A 1XIOA 1H68A 1P37A 3DKEX 205LA 1L79A 1JV6A 4GRVA 1C6FA 3HH6A 2JAGA 4GP5B 4GPOA 1KY0A 1P5CA 2QPEB 2VT4A 4I7JA 1FBBA 1L09A 1P36A 1L77A 1L29A 4PXFA 3RFMA 118LA 243LA 2Y02A 1PQIA 2Z55A 254LA 1L51A 1L63A 2RB2X 3CDQA 1LW9A 3OE6A 3SB5A 2B6WA 1C6MA 4ARJA 5H2NA 4EJ4A 172LA 3C8QA 145LA 1QS5A 1B6IA 1C63A 2R4SA 1XJTA 1GUEA 1L75A 1QTBA 5H2PA 1C6DA 1L0KA 1CU0A 4AMIA 1L23A 4GP4B 1SX7A 5A45A 235LA 1P2RA 107LA 140LA 3HH3A 1S54A 2LCBA 5B6YA 169LA 189LA 148LE 1CX6A 4I7TA 103LA 2RB1X 1CU6A 1L98A 5AX0A 4YXAC 3HAOA 1L47A 1CTWA 4I7SA 2LC9A 3C82A 1L37A 1L42A 1FBKA 1P6YA 1L17A 5ETZA 2ZFEA 1L94A 1LYHA 1L70A 1S51A 230LA 1SX2A 221LA 4LDLA 4LDEA 3HTDA 152LA 3DMZA 2YCWA 2BRDA 1L12A 1L46A 4W59A 2ANVA 4MQSA 1C6HA 3QJTB 2HUKA 1M0MA 2NTHA 4YX7C 234LA 2M3GA 3UTWA 211LA 1DYBA 112LA 1C64A 3DN8A 185LA 4ZPUA 1TN0A 2B74A 104LA 5ITEA 1DYCA 1JTNA 1JQUA 3CDVA 4WAVA 4QI1A 1D3MA 4PJZA 1L04A 4BWBA 110LA 150LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P46A 3AB6A 3ATNA 5LYTA 1LZCA 4HJZA 245LA 1L57A 2NTWA 3WUNA 1IWVA 4O34A 5DN5A 2F4AA 131LA 1LSDA 1L97A 4CFOA 223LA 3AJNA 4I7PA 3W6CA 1YL1X 206LA 183LA 3W6DA 1L30A 1IOQA 4E97A 2A7FA 3F8VA 1G7MC 4N4YB 7LYZA 4ANRA 2YDVA 1L93A 1B5UA 3GUKA 5HNCA 4ET8A 2Z18A 159LA 1LHHA 1UCQA 1LHJA 1UIAA 1OV5A 1G7JC 1KIQC 2HUBA 4YF2A 5HMVA 1C6KA 1ZWNA 5B59A 2F2QA 1PY6A 5JJEA 2W1YA 3DMVA 4WL7A 1JSEA 1L65A 2EQLA 4DWXA 1GDXA 1BGIA 3G3BB 1M0KA 3PDSA 2ZNWY 5C6LA 143LA 4WLYA 5FCPA 1TN5A 3HUKA 5KXNA 1C46A 3DN3A 3BVDB 1IC4Y 1HEPA 1D3FA 1F50A 3ZPRA 5JJNA 1WTMA 4OO9A 4LFXA 1L71A 1S8JA 1L84A 1HHLA 2Q9DA 1OUIA 1CV1A 2ZWBA 4LT1A 4W53A 2X72A 2BQCA 4G4CA 4EPIA 1UCOA 1DI5A 1LMCA 1CV5A 256LA 2MEIA 3WULA 1L53A 1D6QA 1QSBA 1E8LA 1XMEB 1KY1A 1L35A 1OWZA 3G3WA 1L89A 5KXSA 3F9LA 4QDNA 4XT3A 4BEYA 4JR8A 1OUJA 2DQHY 1QTHA 1UIHA 3HANA 4W96A 3SB8A 1UIGA 4DDBA 1L83A 4UWUA 3HUQA 220LA 2BQIA 2HULA 1BVKC 1B5ZA 224LA 1LI6A 3QJVB 5I4YA 4DJHA 3A34A 1L62A 1C45A 226LA 1L22A 1QUTA 1CKHA 1GE0A 1JHLA 3QAKA 5DM9A 222LA 1BB7A 1UICA 1CUQA 1IOCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4JKV A;  253L A;  3VGA A;  1L45 A;  160L A;  5G2C A;  1G0Q A;  1VJM A;  3DDL A;  1L9H A;  3S8F B;  4W58 A;  1PQK A;  1DYD A;  3HU8 A;  2J4Y A;  151L A;  4EIY A;  113L A;  3CDO A;  1KG9 A;  2Y04 A;  1CVK A;  1G1V A;  3GUO A;  3PBL A;  4FPD A;  4ARP A;  1DYF A;  1L95 A;  1C8S A;  4HYJ A;  4N6H A;  4XTN A;  5G2D A;  5B6V A;  2OU9 A;  196L A;  2NTG A;  1L87 A;  4BVN A;  4I7R A;  4MD1 A;  3PXO A;  1D3N A;  3C7Z A;  3A7K A;  1S52 A;  1G06 A;  5B0W A;  5B6Z A;  114L A;  3HDE A;  4OV0 A;  1QUD A;  137L A;  161L A;  191L A;  1G1W A;  3FAD A;  5AWZ A;  3X3B A;  171L A;  3SBA A;  108L A;  1T8G A;  1L73 A;  1P56 A;  5H2O A;  4XXJ A;  4L35 A;  184L A;  4W57 A;  5G2A A;  3HT7 A;  2EI4 A;  3UON A;  4WW3 A;  2RBO A;  5G28 A;  1KNI A;  5H2M A;  1L85 A;  7LZM A;  4ARM B;  1O0A A;  5DYS A;  1QM8 A;  3C7Y A;  1LYF A;  3HAS A;  3DN0 A;  1L41 A;  1L69 A;  4UHR A;  1LI3 A;  5LWE A;  173L A;  3UTX A;  4ARQ A;  1L0J A;  1JFP A;  2F47 A;  1CUP A;  1L19 A;  180L A;  1P7S A;  1IW9 A;  1CWQ A;  3KJ6 A;  5B6W A;  3SN6 R; 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 1L82 A;  3VG9 A;  4IB4 A;  2Y03 A;  1C6I A;  1KW7 A;  1XIO A;  1H68 A;  1P37 A;  3DKE X;  205L A;  1L79 A;  1JV6 A;  4GRV A;  1C6F A;  3HH6 A;  2JAG A;  4GP5 B;  4GPO A;  1KY0 A;  1P5C A;  2QPE B;  2VT4 A;  4I7J A;  1FBB A;  1L09 A;  1P36 A;  1L77 A;  1L29 A;  4PXF A;  3RFM A;  118L A;  243L A;  2Y02 A;  1PQI A;  2Z55 A;  254L A;  1L51 A;  1L63 A;  2RB2 X;  3CDQ A;  1LW9 A;  3OE6 A;  3SB5 A;  2B6W A;  1C6M A;  4ARJ A;  5H2N A;  4EJ4 A;  172L A;  3C8Q A;  145L A;  1QS5 A;  1B6I A;  1C63 A;  2R4S A;  1XJT A;  1GUE A;  1L75 A;  1QTB A;  5H2P A;  1C6D A;  1L0K A;  1CU0 A;  4AMI A;  1L23 A;  4GP4 B;  1SX7 A;  5A45 A;  235L A;  1P2R A;  107L A;  140L A;  3HH3 A;  1S54 A;  2LCB A;  5B6Y A;  169L A;  189L A;  148L E;  1CX6 A;  4I7T A;  103L A;  2RB1 X;  1CU6 A;  1L98 A;  5AX0 A;  4YXA C;  3HAO A;  1L47 A;  1CTW A;  4I7S A;  2LC9 A;  3C82 A;  1L37 A;  1L42 A;  1FBK A;  1P6Y A;  1L17 A;  5ETZ A;  2ZFE A;  1L94 A;  1LYH A;  1L70 A;  1S51 A;  230L A;  1SX2 A;  221L A;  4LDL A;  4LDE A;  3HTD A;  152L A;  3DMZ A;  2YCW A;  2BRD A;  1L12 A;  1L46 A;  4W59 A;  2ANV A;  4MQS A;  1C6H A;  3QJT B;  2HUK A;  1M0M A;  2NTH A;  4YX7 C;  234L A;  2M3G A;  3UTW A;  211L A;  1DYB A;  112L A;  1C64 A;  3DN8 A;  185L A;  4ZPU A;  1TN0 A;  2B74 A;  104L A;  5ITE A;  1DYC A;  1JTN A;  1JQU A;  3CDV A;  4WAV A;  4QI1 A;  1D3M A;  4PJZ A;  1L04 A;  4BWB A;  110L A;  150L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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