3EMLA

The 2.6 a crystal structure of a human a2a adenosine receptor bound to zm241385.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 2.6 Angstrom Crystal Structure of a Human A2A Adenosine Receptor Bound to an Antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Human Adenosine A2A receptor/T4 lysozyme chimera
molecule tags Membrane protein, receptor
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3emlA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3emlA01
4I7OA 3C9LA 4N6HA 3QJSB 1AP9A 1IXFA 3CODA 4EKRA 4E97A 160LA 1QUOA 1OVHA 243LA 1X0K1 1CU3A 3OE9A 1QT4A 1C64A 1LYEA 3A7KA 1IW9A 1LI2A 3VHZA 147LA 2B6TA 3FI5A 3HT6A 3UONA 2QPEB 1KNIA 3P0GA 4IARA 1T97A 1D9WA 225LA 1L22A 2F47A 119LA 2JAGA 4N4YB 5G53A 3SB6A 1LLHA 2KSAA 112LA 2A4TA 4EIYA 5G36A 2KS9A 5B6VA 1L83A 4ARPA 2Z73A 3GUKA 1L20A 1LI6A 2RBRA 3PBLA 1L12A 1CUQA 1L34A 4FPDA 1OV7A 2RBNA 1L30A 1DZEA 195LA 232LA 3UTWA 5B6WA 2R4SA 255LA 1L44A 4X31A 1CVKA 1C3WA 226LA 2F32A 4L6RA 5DYSA 1D2WA 4MD1A 3DN2A 5J7AA 1PY6A 1X0I1 3REYA 1L36A 2J4YA 4OV0A 2I21A 1QTVA 1LWGA 1P2LA 3CDTA 3HUAA 1IW6A 1L9HA 3G3VA 2HPYA 1X0SA 1CU2A 4I7SA 2WJKA 122LA 1L58A 1PQOA 1L49A 1CV3A 5G2CA 4EKSA 3SB7A 177LA 5ETZA 1KY1A 4GP8B 5G2DA 3HDFA 186LA 3WQJA 1SX2A 5H2OA 1G1VA 4I7TA 4LDEA 5TGZA 1LYGA 1AT9A 2RB1X 1KGBA 120LA 3ODUA 4W55A 2QARC 178LA 1XMEB 5B6ZA 3HH3A 180LA 4W53A 1L72A 4EPFA 2QPDB 1SX7A 4WAVA 1L29A 1G07A 2OE7X 1HZXA 157LA 1L0JA 3RZEA 2LC9A 167LA 187LA 1C6JA 1D3JA 125LA 3QJTB 185LA 261LA 1L42A 3AM6A 227LA 3CAPA 1C6KA 4AQNA 4KNFA 1BRDA 2F2QA 126LA 1L26A 1CUPA 3L64A 3KJ6A 3UTYA 4GP5B 4FBZA 4I7RA 5B2NA 3HTDA 6LZMA 1QTZA 2YCXA 3GUNA 2ANXA 4W56A 174LA 1G0QA 1E0PA 1L82A 4MBSA 4GBRA 1L86A 1LYFA 1L56A 108LA 4MQTA 4BUOA 1L04A 3QJQB 3GUPA 4QI1A 155LA 1T8GA 1EPYA 2NTWA 1LYJA 4ARMA 5A44A 1DYGA 1LPYA 218LA 2Q9EA 2RAYX 1XJUA 4XT3A 4IAQA 3S8FB 5FJGA 242LA 2OTZX 214LA 251LA 3EH4B 3VVKA 2F95A 130LA 3S8GB 3HU9A 1DYAA 172LA 1XJIA 2NTUA 1QT8A 212LA 4X32A 3HH6A 1C6GA 3C9MA 1G0LA 1L24A 3VW7A 1GZMA 150LA 2RBOA 1P8UA 1L63A 2B74A 2Y03A 3OAXA 1SWYA 146LA 1L16A 2YCYA 5LWEA 3NY8A 148LE 1GU8A 4ARQB 1P8HA 3DN6A 2Z6BA 1JGJA 1C6TA 4S0WA 5AHYA 3S3BB 1QKPA 4GP4B 4BV0A 3HT7A 164LA 1I6SA 5A8EA 1CV5A 1P56A 1D3FA 1P3NA 2NTHA 2RAZX 2I20A 4XT1A 3QBLA 3EH5B 3GUJA 3HUKA 3F9LA 3GUMA 3HTGA 4I7LA 4YXAC 103LA 3DNAA 3C8SA 1C67A 2PEDA 5AHZA 3UZAA 1MGYA 2B7XA 3QAKA 5ITCA 5EN0A 2O4WA 2NTGA 3OE0A 138LA 1L25A 1PXSA 3DN1A 1QTCA 3C80A 168LA 5BR2A 143LA 1P7SA 235LA 1S8JA 2RB0X 1XJTA 3UZCA 163LA 1KW5A 3HTBA 3QBGA 4LZMA 1QT5A 4A4MA 1D2YA 1OYUA 4JR8A 3C81A 2Y04A 260LA 3DN4A 3HWLA 1Q5JA 2Y02A 3PXOA 3HH4A 1CU0A 2YCWA 4L35A 3VI0A 3HAOA 1JV7A 244LA 3HANA 1XEPA 1L17A 5AX0A 3X3CA 5B0WA 3L2XA 113LA 4EKPA 4ARLA 1C6NA 3DQBA 4G7RB 258LA 2LCBA 1L65A 1NHBA 1OVKA 4I7MA 262LA 241LA 4KLYA 3C82A 1U19A 131LA 4I7PA 1QKOA 3QAPA 213LA 1G0MA 2LZMA 5AWZA 3DN0A 3C8RA 3V2YA 190LA 1XIOA 1QTBA 1L61A 1L81A 4X1HA 3HASA 5F8UA 1C6CA 2RH1A 1C6FA 5H2JA 1LYDA 188LA 3QDCA 210LA 1UCQA 4EA3A 1P46A 3COCA 3DDLA 1L14A 1L59A 1L68A 3HUQA 3SN6R 109LA 5JJNA 1C6HA 3G3WA 4BEZA 3CDOA 1CV1A 4J4QA 4UG2A 111LA 4G70B 1L33A 1L57A 152LA 5B35A 1C6AA 219LA 3BVDB 1L11A 171LA 3NY9A 4HWLA 1ZURA 1F88A 1S52A 145LA 1L23A 159LA 1F4ZA 4HYXA 1L46A 191LA 1L79A 3HTFA 1KG8A 7LZMA 259LA 3GUIA 165LA 1K28A 140LA 1GUEA 4UHRA 1LGUA 1P5CA 1L60A 4EKQA 2ZFEA 137LA 3HDEA 1Q5IA 3VGAA 3HAPA 1SSYA 4LDOA 2YDVA 5B34A 3S3DB 4G7QB 2Y00A 223LA 234LA 1KY0A 1P6YA 3OE8A 2G87A 1QS9A 1L50A 1QSQA 200LA 1M0LA 1TLAA 1DYCA 1L21A 4W59A 221LA 2B72A 4DKLA 151LA 114LA 1L47A 1QT6A 257LA 166LA 3HU8A 1C63A 4LDLA 1DYBA 4K5YA 1OWYA 3OE6A 1CWQA 4QIDA 3CDVA 4EXMA 1C62A 1L00A 1L01A 1L48A 1L80A 5H2IA 2QB0B 4GYCA 1L0KA 1JFPA 2JAFA 3DN8A 4PXFA 3UG9A 2OE4X 1C65A 2L78A 1L09A 205LA 1R2NA 1L76A 3DMXA 3SB9A 169LA 4BVNA 3C83A 2Q9DA 1FBKA 4MD2A 4JQ6A 1L87A 5BR5A 3S3CB 1L62A 3C8QA 1CTWA 141LA 1C66A 1CX6A 3CDQA 118LA 4OO9A 1C8RA 1L89A 1QUGA 3GUOA 1L0MA 149LA 2AT9A 4G71B 1H68A 239LA 1CV4A 4PXKA 5AX1A 1L93A 238LA 3NYAA 254LA 1QUDA 3DMVA 1QTHA 3PWHA 2B6YA 1S8LA 2HULA 3HH5A 175LA 1CX7A 2RBPA 1L67A 3RUNA 1L35A 5H2PA 1L95A 1LYIA 1BRRA 127LA 1QTDA 1OVJA 184LA 3T45A 1L05A 1L13A 1D3MA 1L96A 228LA 5B6YA 176LA 4I7NA 4YXCA 199LA 123LA 1S51A 1CU6A 2YDOA 4JKVA 5A45A 3DKEX 107LA 3QBKA 4I7KA 1QUHA 1WTHA 3PDSA 5H2HA 224LA 4ARQA 1L54A 1C6BA 1L02A 1C6QA 253LA 1L19A 1L77A 1VJMA 1L98A 3QJRB 4XTNA 1L91A 4G72B 189LA 1PQJA 2RB2X 1L70A 1R84A 4QRYA 4XXJA 1L28A 2OE9X 3SB5A 1PQIA 4IB4A 1CV6A 1JTMA 1L45A 1S53A 2KSYA 4EPIA 142LA 156LA 1LYHA 1L71A 2Z55A 1VGOA 1L51A 1L97A 1PQDA 245LA 2RBSA 1L32A 1EHKB 1UAZA 2X72A 4EJ4A 220LA 4W52A 2ZZLA 2OU9A 1SWZA 4I7QA 170LA 5DHGA 1G1WA 197LA 4I7JA 1LWKA 2M3GA 229LA 5H2LA 1L74A 1L88A 248LA 1PXRA 1C61A 3JR6A 1BM1A 4W58A 3RFMA 173LA 1DYDA 1M0MA 1L90A 2VT4A 1L64A 4W57A 1L85A 1OV5A 2O79A 4AMJA 1PQMA 236LA 182LA 3GULA 4FAAB 1QT7A 2HUMA 3UTXA 4MQSA 1P64A 1LGXA 2B6WA 3C7ZA 4DAJA 1L41A 1E12A 209LA 2B75A 4ZPUA 3QBIA 3QJUB 4HYJA 4XTOA 1TN5A 2R4RA 1L75A 3UTVA 3HT8A 5H2KA 4YX7C 1KMEA 1JV6A 1KG9A 1G06A 1L69A 2BRDA 2I35A 252LA 2RBQA 3ZEVA 1QSBA 1ZYTA 3AYNA 1L37A 1T8FA 3VG9A 1G0KA 233LA 1F50A 183LA 4DJHA 4PK0A 1S54A 1C6IA 2L6XA 104LA 1OWZA 181LA 1P2RA 1LI3A 250LA 2EI4A 1L52A 3FADA 4N4WA 3V2WA 1JQUA 1C6DA 1C6LA 1L40A 1QS5A 201LA 4IAPA 1QHJA 222LA 215LA 2KSBA 1L94A 1L08A 1KS3A 1L92A 3D4SA 5DHHA 4GBRB 1L31A 2YCZA 1LGWA 3ZPRA 3HAQA 2LNLA 5JJJA 4Y9HA 115LA 4ARMB 1B6IA 1L10A 1P36A 2CUUA 4AMIA 4W54A 2Y01A 3PQRA 1G0PA 2IGCA 129LA 4FA7B 1LW9A 1C6PA 3X3BA 249LA 3AYMA 1C68A 1D3NA 1T8AA 1L39A 1L53A 3EMLA 2OU8A 5B6XA 3F8VA 1P37A 1L15A 1C69A 1L84A 161LA 206LA 4NC3A 1C6MA 247LA 2B73A 1G0GA 1T6HA 1KW7A 3DMZA 5AZDA 3MBVA 5ITEA 2WJLA 237LA 3ZPQA 4BEYA 162LA 1FBBA 4BWBA 139LA 3K2RA 1L27A 1L18A 1L07A 4WW3A 5G54A 1DYFA 231LA 3ABWA 3SBBC 2O7AA 1L66A 4PJZA 5LZMA 1P8IA 4XTLA 4W51A 1M0KA 3HARA 4ARJA 5JJEA 246LA 4GRVA 110LA 3EH3B 5I14A 2ANVA 5G28A 196LA 1L73A 1CV0A 1QT3A 3SB8A 1L43A 158LA 256LA 3HT9A 3QJVB 2ZIYA 1JTNA 5KKHA 1L99A 211LA 1PQKA 240LA 3C7YA 3NSBA 1C6EA 1ZWNA 2OEAX 2OTYX 5H2NA 216LA 1L55A 3FA0A 1C8SA 2I1XA 2HUKA 1L03A 2F93A 230LA 3C7WA 3NS0A 1CU5A 1L06A 5C1MA 1BRXA 2OU0X 4G7SB 2B6XA 3LZMA 1H2SA 5G2AA 4TL3A 2B6ZA 198LA 3DN3A 1SSWA 4GPOA 102LA 1G0JA 1O0AA 1L38A 217LA 3CDRA 144LA 3G3XA 1LN6A 1DYEA 1QM8A 5H2MA 128LA 1C60A 192LA 2B70A 1TN0A 3SBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3J6KA 5KXWA 5B05A 4EKRA 5L3IA 2I6ZA 4NWHA 1CKHA 1NBYC 1GF3A 3OE9A 3A7KA 1IW9A 3VHZA 2EQLA 2B6TA 3UONA 3FI5A 2QPEB 4M6DA 2DQEY 3B0KA 6LYTA 4NGIA 112LA 1HEWA 3EBAB 1HERA 3PBLA 2RBNA 195LA 232LA 2EIZC 3GXKA 1L44A 4XJFA 5DN4A 4MD1A 3DN2A 4NSGA 5J7AA 1LSGA 2J4YA 3HUAA 3CDTA 1LJKA 1CU2A 1REMA 122LA 1NWGA 4KT3A 1GF4A 5HNCA 1CJ9A 5G2DA 1DKJA 186LA 1LHIA 4XJBA 1YAOA 5H2OA 4I7TA 4LDEA 1LYGA 1GAYA 1AT9A 2QARC 1IC7Y 2H9KA 1L29A 157LA 3AB6A 1IWUA 5HMVA 4HJVA 1ALCA 187LA 1JKBA 3A95A 4H94A 3WPKA 5A3EA 4WL6A 1BRDA 4NSJA 4GP5B 3WW6A 4FBZA 4I7RA 6LZMA 4W56A 4LYCA 4UWVA 3VWOA 1E0PA 1B7SA 1JIYA 1L56A 108LA 4MQTA 3GUPA 1T8GA 5A44A 2RAYX 1XJUA 4DD1A 214LA 2F95A 1VAUA 2NTUA 2D91A 3N9AA 3C9MA 1WTMA 1P8UA 1D0MA 4J1AA 4LZTA 3AW6A 1SWYA 4ARQB 2HEBA 3LYZA 1LJEA 2Z6BA 4S0WA 3WXTA 1GPQC 1QKPA 4H8YA 4H9HA 5C6IA 1I6SA 1WVUA 4XT1A 1BWHA 1LAAA 1GDWA 4OWAA 4I7LA 5AHZA 103LA 1C67A 1GHLA 2B7XA 2MEAA 3CSRA 4CGEA 1REYA 2B5ZA 138LA 1PXSA 3DN1A 3C80A 143LA 1J1PY 2F2NA 2RB0X 1G7LC 5E4PA 1GBWA 3A92A 2ZQ3A 1QT5A 4LZMA 194LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5JJJ A;  4Y9H A;  115L A;  4ARM B;  1B6I A;  1L10 A;  1P36 A;  2CUU A;  4AMI A;  4W54 A;  2Y01 A;  3PQR A;  1G0P A;  2IGC A;  129L A;  4FA7 B;  1LW9 A;  1C6P A;  3X3B A;  249L A;  3AYM A;  1C68 A;  1D3N A;  1T8A A;  1L39 A;  1L53 A;  3EML A;  2OU8 A;  5B6X A;  3F8V A;  1P37 A;  1L15 A;  1C69 A;  1L84 A;  161L A;  206L A;  4NC3 A;  1C6M A;  247L A;  2B73 A;  1G0G A;  1T6H A;  1KW7 A;  3DMZ A;  5AZD A;  3MBV A;  5ITE A;  2WJL A;  237L A;  3ZPQ A;  4BEY A;  162L A;  1FBB A;  4BWB A;  139L A;  3K2R A;  1L27 A;  1L18 A;  1L07 A;  4WW3 A;  5G54 A;  1DYF A;  231L A;  3ABW A;  3SBB C;  2O7A A;  1L66 A;  4PJZ A;  5LZM A;  1P8I A;  4XTL A;  4W51 A;  1M0K A;  3HAR A;  4ARJ A;  5JJE A;  246L A;  4GRV A;  110L A;  3EH3 B;  5I14 A;  2ANV A;  5G28 A;  196L A;  1L73 A;  1CV0 A;  1QT3 A;  3SB8 A;  1L43 A;  158L A;  256L A;  3HT9 A;  3QJV B;  2ZIY A;  1JTN A;  5KKH A;  1L99 A;  211L A;  1PQK A;  240L A;  3C7Y A;  3NSB A;  1C6E A;  1ZWN A;  2OEA X;  2OTY X;  5H2N A;  216L A;  1L55 A;  3FA0 A;  1C8S A;  2I1X A;  2HUK A;  1L03 A;  2F93 A;  230L A;  3C7W A;  3NS0 A;  1CU5 A;  1L06 A;  5C1M A;  1BRX A;  2OU0 X;  4G7S B;  2B6X A;  3LZM A;  1H2S A;  5G2A A;  4TL3 A;  2B6Z A;  198L A;  3DN3 A;  1SSW A;  4GPO A;  102L A;  1G0J A;  1O0A A;  1L38 A;  217L A;  3CDR A;  144L A;  3G3X A;  1LN6 A;  1DYE A;  1QM8 A;  5H2M A;  128L A;  1C60 A;  192L A;  2B70 A;  1TN0 A;  3SBA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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