3NY8A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with the inverse agonist ici 118,551
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
total genus 167
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny8A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny8A01
1LGXA 257LA 4BVNA 1D2WA 149LA 1SSWA 4BEYA 163LA 1S54A 2ANXA 2J4YA 7LZMA 4L6RA 190LA 1L12A 2HULA 175LA 3ABWA 1L83A 3NSBA 3HUQA 1SWYA 1PQKA 4LZMA 138LA 199LA 1L13A 1L17A 1KG9A 1JQUA 1L10A 1P8HA 1QS5A 1L16A 2OTZX 3VG9A 260LA 216LA 2KSYA 1L48A 230LA 4W58A 3C8SA 152LA 220LA 3GUKA 3EH5B 2LC9A 4GYCA 1L09A 3DN6A 4KNFA 1QSBA 213LA 1LYEA 3ODUA 1G0PA 1L28A 1T8AA 1P2RA 2QB0B 3G3WA 3COCA 2I21A 3UG9A 5B2NA 1C60A 114LA 1OYUA 1VGOA 4JKVA 189LA 1G0GA 2OU9A 1L20A 3CODA 1L96A 2RB1X 5JJEA 1L0MA 4ARMB 2Y02A 4W54A 1F50A 4I7TA 2LNLA 3DN0A 5H2NA 2OE7X 3DNAA 1LPYA 1C61A 4EKPA 5AX1A 5H2HA 4IARA 1L73A 1L95A 250LA 1QUHA 1KY1A 171LA 1L04A 1LYGA 4LDOA 123LA 1LYIA 3F8VA 2ZZLA 1QHJA 1L90A 4HYXA 111LA 2HUMA 144LA 1K28A 1CX7A 1L14A 2KSAA 3DN2A 3T45A 1C6EA 4GBRA 1BRDA 185LA 1LGWA 1UCQA 3CDOA 1JTNA 1E12A 3L64A 122LA 261LA 3UTWA 1P37A 3C7WA 1DZEA 159LA 2B75A 1CX6A 168LA 1PQOA 1QT4A 4GP4B 174LA 1I6SA 1L32A 4ARPA 5AHZA 4W59A 1L45A 5I14A 1SWZA 3HT6A 3C81A 3FI5A 214LA 4EKQA 1H68A 1L51A 3HH4A 4I7QA 4FPDA 5ITEA 5B6XA 1IW9A 4N4WA 1L22A 2F2QA 2Y04A 1KY0A 2NTGA 4YXAC 2KSBA 1L69A 1GU8A 1C62A 1CU6A 4YXCA 3HDFA 3DMVA 164LA 1L57A 2F47A 3VI0A 1LWGA 1BRRA 173LA 1L46A 1L44A 1SX7A 4J4QA 1XJTA 3QAKA 3HUAA 4HYJA 1PXSA 120LA 3DQBA 5LZMA 3PWHA 4X31A 196LA 3UZCA 5B6WA 1C64A 1MGYA 1L23A 1C8SA 4MBSA 247LA 1G0QA 1WTHA 191LA 4L35A 2RBSA 3S3CB 1DYCA 3UTVA 4W55A 2L78A 1L38A 3GUOA 253LA 4DKLA 212LA 1L82A 1B6IA 2NTHA 1L0KA 1L77A 3HTDA 139LA 2RBNA 3GULA 4QRYA 5H2JA 5DYSA 4DAJA 1L66A 156LA 4I7RA 4EPFA 2NTUA 3HDEA 1P8IA 1DYBA 4TL3A 4GBRB 1TN5A 1G0LA 104LA 1L53A 151LA 2QPDB 1CU0A 3F9LA 1L52A 4I7MA 4EKRA 1QM8A 4AMIA 4PXKA 5BR5A 4G7RB 2L6XA 1HZXA 1QT7A 1QKOA 1QTBA 4K5YA 3HWLA 3UTYA 4QIDA 3PDSA 1DYEA 129LA 2YCWA 4I7NA 1L91A 201LA 1XJIA 3QBLA 3QDCA 4E97A 1OWZA 4OV0A 1SSYA 1C6JA 148LE 2RBPA 3C8RA 5G2CA 2Q9DA 1M0KA 157LA 1OV5A 3V2WA 1C68A 1L94A 2Z55A 2M3GA 3SB8A 1L65A 1FBKA 1L27A 3FA0A 3S8GB 1PXRA 2B73A 4ZPUA 1F4ZA 1VJMA 3CAPA 1L70A 126LA 251LA 2B6XA 167LA 1L37A 1QTDA 4I7KA 2WJKA 1XMEB 4QI1A 1ZURA 3SB5A 4W56A 180LA 4G70B 3DDLA 3SB7A 5EN0A 182LA 3DKEX 146LA 3HAPA 233LA 219LA 3DN1A 210LA 4MQTA 1XJUA 5B35A 3SB6A 143LA 4GRVA 1C8RA 4I7JA 4EIYA 222LA 4PK0A 4MD1A 4I7SA 4XTLA 1CV5A 5TGZA 3DMXA 3HU9A 3UONA 108LA 1DYDA 246LA 5A44A 4G71B 2Q9EA 1L05A 4ARQA 1KGBA 3QJUB 4G72B 1QT3A 162LA 209LA 1L34A 2Z6BA 4GPOA 3UTXA 1L84A 3HAOA 4N6HA 4UG2A 2RBQA 140LA 1KS3A 5G2DA 5G53A 1G1VA 5BR2A 141LA 1L85A 1QUOA 1L74A 249LA 3HT9A 2HPYA 1QTCA 1L54A 3GUMA 1C6GA 3NYAA 5A8EA 4EJ4A 1L62A 1CV3A 1C3WA 1CV1A 3K2RA 1L18A 1L0JA 3DN8A 1X0I1 1G0KA 1L33A 2OE9X 4YX7C 1L30A 1L11A 1SX2A 5LWEA 2R4RA 1T97A 200LA 3SN6R 1H2SA 1UAZA 238LA 195LA 1C6NA 5DHHA 1QUDA 2Y01A 3S8FB 1XIOA 1QT8A 1PQDA 1L81A 1P36A 1CV6A 3C82A 243LA 1KMEA 1O0AA 5G2AA 5ITCA 3QJQB 5KKHA 2I20A 4BEZA 3VVKA 5FJGA 5JJNA 1D3FA 1L03A 1L50A 2YCYA 4GP8B 3OE8A 2YDVA 221LA 1T8FA 2RBOA 3C7YA 1FBBA 256LA 3HH6A 2RAYX 206LA 2YDOA 1JTMA 3QJVB 1C6TA 1C6KA 1CVKA 1D3JA 3NY8A 3HASA 1EPYA 240LA 1P3NA 2RAZX 3RFMA 215LA 2B6WA 3SBBC 1L87A 3SB9A 1L49A 1QT5A 3SBAA 1CWQA 2X72A 1CUPA 2O4WA 3G3XA 2BRDA 184LA 1C6CA 1S51A 241LA 1C6FA 3GUJA 4BWBA 255LA 1L93A 1C6BA 2OU8A 1R2NA 1P6YA 3VHZA 1L97A 131LA 1L67A 2F95A 5H2KA 4BV0A 3QBKA 3HT7A 1CV4A 3PBLA 4ARQB 3C9MA 234LA 188LA 1L89A 1R84A 3KJ6A 112LA 1G07A 2KS9A 3A7KA 1LI2A 1JFPA 1QKPA 1IXFA 4S0WA 1C6DA 4LDEA 2JAGA 3CDQA 150LA 1L21A 5B34A 1LYDA 3DMZA 1GUEA 236LA 3HH3A 2Y03A 3PXOA 3QAPA 3QJRB 248LA 205LA 1QS9A 3DN3A 1AT9A 4IB4A 4EA3A 1DYAA 1L79A 109LA 1AP9A 3FADA 1BRXA 3QBIA 3AM6A 4MD2A 1L88A 2A4TA 1L99A 3OE6A 4AQNA 1L72A 1Q5IA 3X3CA 229LA 2OTYX 3CDRA 1G06A 3CDTA 5B6ZA 1L00A 4EPIA 5JJJA 3AYNA 3C8QA 2VT4A 3OAXA 4XXJA 4W51A 5J7AA 1LYHA 192LA 1LGUA 2HUKA 1L41A 197LA 110LA 1P8UA 3BVDB 170LA 1L61A 4PXFA 3L2XA 4I7LA 3P0GA 3OE0A 1PY6A 1L15A 1QSQA 3D4SA 4WAVA 2B74A 3QJTB 5AWZA 1L06A 1L01A 1S8JA 158LA 3OE9A 2LZMA 4FA7B 1GZMA 1U19A 4IAPA 4G7SB 3HUKA 1L75A 1D3NA 1C63A 1LI6A 1LYFA 1P2LA 2B6TA 103LA 3HU8A 2JAFA 2ANVA 224LA 3EH4B 5G36A 186LA 172LA 4KLYA 2IGCA 211LA 6LZMA 242LA 1L86A 235LA 258LA 1DYGA 3UZAA 3ZPRA 1PQJA 3X3BA 4ARJA 3HTFA 1L9HA 2QPEB 183LA 1QTVA 1QT6A 226LA 1L08A 1X0K1 2WJLA 1P56A 4OO9A 113LA 1C65A 2B72A 181LA 1L25A 1PQIA 3HTBA 3ZEVA 1LLHA 165LA 1KW5A 1OWYA 3C7ZA 1C6LA 1L40A 237LA 1L35A 1L58A 1CU2A 1L02A 5C1MA 3RZEA 1M0LA 137LA 166LA 4W52A 1S52A 198LA 1D2YA 3CDVA 5H2LA 1L98A 1S53A 125LA 4FAAB 245LA 2RB2X 5AX0A 3JR6A 2OU0X 3NY9A 1TLAA 155LA 1L56A 160LA 1C6QA 2Y00A 1L19A 187LA 2F32A 4UHRA 4XT1A 3RUNA 5ETZA 3GUPA 1C6MA 227LA 3REYA 1CUQA 1QTHA 2O79A 4EXMA 4GP5B 1S8LA 1BM1A 225LA 3S3BB 4W57A 1CV0A 2OEAX 4N4YB 5B6VA 142LA 1L39A 2RH1A 3HAQA 4JR8A 1OVKA 4A4MA 1L42A 1EHKB 118LA 1QUGA 3V2YA 1Q5JA 4Y9HA 3C9LA 2LCBA 4NC3A 1P5CA 2PEDA 1ZYTA 2B6YA 176LA 127LA 1L24A 4X1HA 1C6IA 1KG8A 244LA 1LYJA 217LA 252LA 3LZMA 1P7SA 1G0JA 2OE4X 1LI3A 1L64A 1TN0A 177LA 3HT8A 254LA 3ZPQA 3HH5A 3QJSB 1KW7A 5G28A 218LA 4XTOA 1P64A 2ZFEA 1X0SA 1G1WA 1L68A 1JV7A 3MBVA 147LA 2QARC 5B6YA 3NS0A 5H2IA 1C67A 1JV6A 1L76A 145LA 1NHBA 2ZIYA 4JQ6A 1F88A 1L07A 2O7AA 3HARA 1L31A 1CU5A 5G54A 1ZWNA 1L80A 178LA 259LA 4DJHA 2YCXA 3EH3B 239LA 3AYMA 1C6AA 1OVJA 2B70A 228LA 4I7PA 102LA 5H2MA 1T8GA 1XEPA 3VW7A 4FBZA 1LWKA 3S3DB 107LA 1L55A 4W53A 1DYFA 1D3MA 1L63A 1CU3A 2I1XA 2B7XA 4AMJA 119LA 1L36A 2CUUA 2EI4A 4EKSA 3C80A 1CTWA 5F8UA 1C6PA 232LA 1L92A 1L26A 3HTGA 5H2OA 1IW6A 3GUIA 2B6ZA 1LN6A 2RB0X 4XTNA 1L47A 1QTZA 1L43A 5H2PA 2AT9A 161LA 3GUNA 2YCZA 1L59A 1P46A 169LA 4PJZA 2R4SA 4X32A 4I7OA 223LA 3C83A 5AHYA 1L60A 231LA 4WW3A 128LA 1C66A 4G7QB 262LA 1M0MA 1G0MA 4MQSA 4LDLA 4ARLA 1OVHA 4ARMA 1JGJA 2G87A 4IAQA 4HWLA 5A45A 1PQMA 3QBGA 130LA 5B0WA 1KNIA 1L29A 3G3VA 3WQJA 1LW9A 3VGAA 115LA 2F93A 3EMLA 2NTWA 2I35A 3HANA 1D9WA 1L71A 3PQRA 4XT3A 5DHGA 5AZDA 4BUOA 1C69A 1E0PA 1OV7A 1C6HA 1T6HA 3DN4A 2Z73A 2RBRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP3A 1IWVA 163LA 3LYOA 4XJIA 2J4YA 190LA 1L12A 4B0DA 175LA 1B7OA 3ABWA 1LJFA 1YROA 3HUQA 3T36A 4LZMA 1L13A 1KG9A 4LZTA 1QS5A 3IJUA 2OTZX 3TMWA 4TTDA 152LA 4H93A 4A7DA 1L09A 3EXDA 3ODUA 1IY4A 1VDSA 1P2RA 2QB0B 4H9HA 2F30A 1YKXX 189LA 2OU9A 3ATOA 2MEAA 3FI7A 1LMCA 1LZ6A 2HEBA 2RB1X 4C5FA 4I7TA 1WTMA 3DNAA 1C61A 4EKPA 1L95A 1QTEA 5F9XA 4LDOA 1KY1A 171LA 4WG1A 2ZZLA 4ML7A 4XJDA 144LA 4Z41A 193LA 5LA8A 1C6EA 4GBRA 3FE0A 4YEMA 3CDOA 1GPQC 4DS7E 4CJ2A 122LA 261LA 4H8ZA 4M6DA 3ULRA 4GP4B 4NGJA 2BQBA 4EKQA 1L51A 3HH4A 4ET8A 1IW9A 1L22A 2Y04A 1KY0A 2NTGA 1B5YA 3HDFA 3DMVA 2F47A 1LWGA 4QEQA 4WO6A 1LSYA 1SX7A 3QAKA 2BPUA 120LA 3PWHA 1LZ5A 5B6WA 1MGYA 4MBSA 5B59A 1BVKC 4RW2A 4W55A 4M4OA 212LA 1L82A 3HTDA 2BQDA 2RBNA 2FBBA 4XJBA 5APDA 4IATA 5DYSA 4DAJA 1OUJA 156LA 2EPEA 3RZ4A 2NTUA 1ZVHL 1DYBA 1GE3A 4GBRB 1TN5A 1G0LA 5E4PA 1L53A 3DQBA 3WXUA 4PXKA 4XADA 2HEEA 1TBYA 3WW5A 1QT7A 4GCEA 3UTYA 2XBRA 4GCBA 1L91A 1XJIA 4OV0A 2RBPA 148LE 2Q9DA 4PRUA 1LJJA 1C68A 1O23A 3B6LA 1FBKA 2B73A 1GFUA 2DBTA 1VJMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3HH5 A;  3QJS B;  1KW7 A;  5G28 A;  218L A;  4XTO A;  1P64 A;  2ZFE A;  1X0S A;  1G1W A;  1L68 A;  1JV7 A;  3MBV A;  147L A;  2QAR C;  5B6Y A;  3NS0 A;  5H2I A;  1C67 A;  1JV6 A;  1L76 A;  145L A;  1NHB A;  2ZIY A;  4JQ6 A;  1F88 A;  1L07 A;  2O7A A;  3HAR A;  1L31 A;  1CU5 A;  5G54 A;  1ZWN A;  1L80 A;  178L A;  259L A;  4DJH A;  2YCX A;  3EH3 B;  239L A;  3AYM A;  1C6A A;  1OVJ A;  2B70 A;  228L A;  4I7P A;  102L A;  5H2M A;  1T8G A;  1XEP A;  3VW7 A;  4FBZ A;  1LWK A;  3S3D B;  107L A;  1L55 A;  4W53 A;  1DYF A;  1D3M A;  1L63 A;  1CU3 A;  2I1X A;  2B7X A;  4AMJ A;  119L A;  1L36 A;  2CUU A;  2EI4 A;  4EKS A;  3C80 A;  1CTW A;  5F8U A;  1C6P A;  232L A;  1L92 A;  1L26 A;  3HTG A;  5H2O A;  1IW6 A;  3GUI A;  2B6Z A;  1LN6 A;  2RB0 X;  4XTN A;  1L47 A;  1QTZ A;  1L43 A;  5H2P A;  2AT9 A;  161L A;  3GUN A;  2YCZ A;  1L59 A;  1P46 A;  169L A;  4PJZ A;  2R4S A;  4X32 A;  4I7O A;  223L A;  3C83 A;  5AHY A;  1L60 A;  231L A;  4WW3 A;  128L A;  1C66 A;  4G7Q B;  262L A;  1M0M A;  1G0M A;  4MQS A;  4LDL A;  4ARL A;  1OVH A;  4ARM A;  1JGJ A;  2G87 A;  4IAQ A;  4HWL A;  5A45 A;  1PQM A;  3QBG A;  130L A;  5B0W A;  1KNI A;  1L29 A;  3G3V A;  3WQJ A;  1LW9 A;  3VGA A;  115L A;  2F93 A;  3EML A;  2NTW A;  2I35 A;  3HAN A;  1D9W A;  1L71 A;  3PQR A;  4XT3 A;  5DHG A;  5AZD A;  4BUO A;  1C69 A;  1E0P A;  1OV7 A;  1C6H A;  1T6H A;  3DN4 A;  2Z73 A;  2RBR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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