3NY9A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with a novel inverse agonist
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny9A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny9A01
4I7QA 2RBNA 5ETZA 107LA 4I7KA 1QT4A 4XT3A 3SBBC 4I7SA 1KMEA 3HH3A 1PQDA 3JR6A 1P8IA 4FBZA 4AQNA 1L40A 145LA 188LA 1G0LA 1LYJA 2B70A 158LA 3HAQA 4JKVA 3HH4A 3ZPQA 3VI0A 1L84A 4XTNA 1C69A 137LA 3HUQA 4G7QB 2YDOA 1OWYA 3ZPRA 3DN8A 1KW7A 214LA 234LA 4UG2A 4XTOA 1C6JA 1C6AA 178LA 110LA 3S3CB 4HYJA 2B6TA 1AT9A 2LNLA 1L49A 228LA 1VGOA 5A44A 2BRDA 3F9LA 3CDQA 3FI5A 150LA 1L06A 2R4RA 4QIDA 4WAVA 2B74A 102LA 143LA 1F50A 240LA 3C81A 1L24A 4K5YA 3HUAA 1CWQA 1L9HA 4WW3A 2B6YA 5A45A 164LA 206LA 3PQRA 1CV1A 190LA 3DMXA 2PEDA 222LA 1BRRA 5I14A 187LA 2Z55A 5G2DA 1L27A 252LA 1L52A 3FA0A 1MGYA 1D2WA 1L18A 4GP8B 1UAZA 1DYGA 3X3BA 1C66A 156LA 249LA 5H2LA 3UG9A 3UTVA 5H2OA 1L23A 1C6NA 1L25A 1M0KA 4GP4B 159LA 3REYA 4MQSA 4BEYA 1L26A 1KY0A 4XXJA 4YXCA 1QUOA 172LA 148LE 3GUNA 3L64A 3DQBA 2Y02A 173LA 5BR5A 3HDEA 1JFPA 3DDLA 2QB0B 1FBKA 160LA 255LA 4LZMA 3ZEVA 1L11A 2J4YA 2KSYA 3DKEX 1L91A 4W55A 183LA 2G87A 4MD2A 225LA 3HTGA 4EPIA 2YCYA 1OWZA 4UHRA 1P46A 138LA 175LA 125LA 1XJIA 4GP5B 1JQUA 1QT3A 1KG9A 3NSBA 4I7TA 4W57A 1L0JA 2B7XA 4X32A 3QBIA 7LZMA 1QTZA 1T8FA 3WQJA 3HU9A 104LA 218LA 1CTWA 4FPDA 2RBOA 227LA 3QJSB 3FADA 1LWKA 5B6XA 3HAOA 2O79A 5B0WA 1PQMA 2F47A 1SWZA 3ODUA 1JV6A 2F2QA 4HWLA 3S8FB 1G07A 3HTDA 1CUQA 3HU8A 3VHZA 4N4YB 1L08A 1LGWA 4AMIA 1S8LA 3CDTA 1P2RA 257LA 4IAPA 146LA 140LA 3DN2A 5H2NA 1C6MA 161LA 223LA 4ARQB 1CUPA 2CUUA 112LA 1L45A 1X0I1 1L81A 1QHJA 3C7WA 1L63A 4G71B 4EA3A 1H68A 1KGBA 2F32A 4GYCA 122LA 167LA 1S53A 5C1MA 1L96A 1L67A 1CVKA 2AT9A 2Q9DA 1QKOA 2VT4A 1PXSA 1P8UA 2OU8A 126LA 1LWGA 6LZMA 230LA 1IXFA 4ARPA 4G72B 259LA 5EN0A 1LI3A 4EJ4A 2I1XA 216LA 1CX7A 1E0PA 2ZFEA 4BVNA 115LA 2RBPA 1C60A 1K28A 5DHHA 2WJLA 1QTBA 1G0QA 5B6YA 192LA 4I7NA 3NS0A 1BM1A 236LA 2KS9A 241LA 1C67A 1QM8A 3SN6R 4AMJA 3P0GA 3VGAA 147LA 4ZPUA 2JAGA 119LA 201LA 199LA 1LI6A 1SX2A 239LA 4IARA 1GU8A 2EI4A 3BVDB 176LA 4LDOA 4GBRB 4EIYA 196LA 2QPDB 4N4WA 129LA 1LGXA 1VJMA 1L88A 181LA 1DYEA 1L36A 1R2NA 4Y9HA 229LA 1L05A 1PQOA 4W52A 1EHKB 3CODA 1L20A 4BEZA 2OEAX 2ANXA 3EMLA 1BRXA 2KSAA 1B6IA 4QRYA 4FAAB 2QARC 1L59A 1L50A 5H2MA 2OE4X 3CDRA 4W53A 1QT8A 180LA 1D3NA 4YX7C 1CU3A 3QBKA 3QBGA 5DYSA 1S8JA 231LA 1G0PA 4G70B 209LA 1LYDA 111LA 1CV0A 1L77A 3DN0A 4OO9A 2OE7X 166LA 1CV6A 260LA 1D3MA 4X1HA 2QPEB 2Z6BA 1QUDA 1C8SA 3EH4B 4L6RA 139LA 219LA 1XMEB 2F95A 2YCXA 3GUIA 4QI1A 3LZMA 1L38A 242LA 1QTVA 4W51A 1C6QA 1L21A 1QT5A 1LN6A 1WTHA 1C62A 3HAPA 1L15A 5G2CA 1QTHA 198LA 1R84A 3HWLA 4EPFA 3SB5A 1CU5A 1C6EA 2IGCA 3ABWA 3EH3B 1SSWA 4MD1A 1L64A 3GULA 1L02A 2HPYA 2RH1A 2I35A 3KJ6A 3GUMA 4I7MA 189LA 1G1WA 1L98A 4GRVA 3DN3A 152LA 1ZWNA 215LA 1L75A 2A4TA 2B72A 2B73A 3UTYA 1X0SA 1LGUA 1L37A 2R4SA 4EKSA 3C9MA 1QS5A 1LYFA 5H2JA 1C6GA 1GZMA 4YXAC 233LA 226LA 1L74A 3UTXA 1L01A 248LA 3VG9A 2X72A 1XJTA 1PQIA 1QSQA 2L78A 1P56A 1KG8A 4W54A 2I20A 3C8RA 142LA 3S3BB 4W58A 1T8AA 4GPOA 1KY1A 247LA 2O4WA 1L32A 1C64A 1P37A 5A8EA 1OVHA 1DYCA 1L95A 1LYHA 213LA 1L57A 244LA 1L53A 3C7YA 2YDVA 4JR8A 1U19A 3UTWA 1QTDA 4BV0A 1L99A 1C68A 3D4SA 3QBLA 165LA 1C65A 4ARMB 3OE8A 1DYDA 2Y01A 3QAPA 2LZMA 5AHZA 3RFMA 2B75A 3AM6A 157LA 4IB4A 1L46A 3G3XA 2YCWA 1M0LA 1X0K1 162LA 1L35A 1CV3A 1T97A 195LA 4PK0A 3VW7A 2B6ZA 3V2WA 1JGJA 1C6BA 3C9LA 1L43A 3MBVA 5G53A 5B2NA 3G3WA 4KLYA 1C6KA 3EH5B 5F8UA 4EKRA 258LA 1XIOA 1L17A 3HANA 1F4ZA 2OE9X 3HARA 3HH6A 2RAYX 1L47A 149LA 1L34A 3C7ZA 2OTYX 2L6XA 3A7KA 1JTNA 5KKHA 262LA 2O7AA 1P6YA 185LA 1L79A 4G7RB 5H2KA 1CV5A 3NY8A 4N6HA 1L09A 3QJRB 246LA 1S51A 4NC3A 4TL3A 1DYBA 1AP9A 3HTBA 1L83A 4PJZA 4X31A 3PXOA 1XEPA 3RZEA 3SB9A 4XTLA 1EPYA 4I7RA 5B6VA 1P64A 3HTFA 4I7LA 1L92A 1I6SA 4PXKA 3SB6A 1G0JA 1C6CA 4W56A 1LI2A 256LA 1Q5IA 5G36A 2Y00A 1OYUA 3SBAA 2YCZA 1C3WA 1LYEA 3L2XA 113LA 1GUEA 1JV7A 3QDCA 4IAQA 114LA 3C8QA 5ITCA 182LA 1L33A 2RBSA 4LDLA 3HASA 1L73A 1LPYA 4MBSA 1L48A 2NTUA 2OU0X 4I7OA 4MQTA 4ARQA 1S54A 212LA 237LA 1KNIA 3PWHA 1D2YA 4FA7B 1L41A 4XT1A 1L58A 3DMZA 4ARLA 1BRDA 5LZMA 3G3VA 1LYGA 4E97A 254LA 1G0GA 220LA 118LA 1L82A 127LA 3OAXA 4L35A 3C82A 5G54A 1IW9A 2OTZX 4DAJA 1QTCA 3AYNA 5H2IA 1L56A 4G7SB 5G28A 261LA 1QT6A 1L69A 128LA 250LA 5AX0A 174LA 4EKPA 1G1VA 184LA 210LA 1C6HA 5AX1A 3GUJA 1QKPA 1L28A 2M3GA 2RBQA 108LA 4KNFA 3VVKA 5H2HA 1L76A 2B6WA 123LA 1H2SA 1PY6A 3UZAA 1C61A 4W59A 1S52A 3QJTB 3CDVA 4A4MA 169LA 1P36A 3DN4A 1OVKA 3PDSA 1T8GA 3HH5A 5J7AA 1L93A 3HT9A 1LW9A 5AWZA 1O0AA 1OVJA 1L29A 1C8RA 103LA 109LA 3HDFA 1XJUA 1L0MA 3NYAA 3GUPA 5H2PA 3OE0A 4GBRA 3RUNA 1L00A 1CU0A 5ITEA 4EKQA 1TN5A 3F8VA 1C6FA 1P7SA 1L55A 1QT7A 1PXRA 2HULA 3K2RA 191LA 3OE9A 1L51A 186LA 1T6HA 1P2LA 235LA 1DYAA 2RB1X 2Z73A 130LA 4DJHA 3COCA 3C80A 1L71A 1SWYA 1OV7A 1KW5A 1L14A 3GUKA 1L10A 5FJGA 4EXMA 1KS3A 4PXFA 232LA 1PQJA 1L97A 1QUGA 4I7JA 3DN1A 1L65A 2RB2X 1L31A 2WJKA 5JJJA 4OV0A 3S3DB 1L68A 1L04A 1L70A 2Q9EA 5BR2A 224LA 251LA 3T45A 2Y03A 1L62A 5G2AA 200LA 1P3NA 4BWBA 3C83A 2NTHA 2KSBA 3DNAA 171LA 144LA 1SSYA 2LCBA 131LA 1L39A 2OU9A 3SB8A 1L03A 1Q5JA 3QJVB 3HT8A 4J4QA 2NTGA 1C6LA 205LA 1HZXA 4S0WA 3OE6A 1FBBA 245LA 1C6DA 1L85A 2RAZX 3C8SA 1ZURA 3QAKA 1QSBA 170LA 1L30A 1L19A 2RB0X 4I7PA 221LA 2HUKA 1L86A 1E12A 1G0MA 3PBLA 3DN6A 4DKLA 2NTWA 1L90A 5B6WA 177LA 1D3JA 1L13A 155LA 1QUHA 4ARJA 2HUMA 3AYMA 1L61A 5AZDA 1G06A 2ZIYA 4LDEA 5DHGA 1TLAA 1G0KA 1L89A 1L12A 5TGZA 2F93A 1L44A 2B6XA 5B34A 141LA 1P5CA 1LLHA 1TN0A 2Y04A 5JJNA 3CAPA 1D9WA 1M0MA 197LA 1DZEA 5AHYA 238LA 1CU6A 1CX6A 151LA 2ANVA 1C6TA 3CDOA 4ARMA 5B6ZA 4HYXA 211LA 3QJUB 3GUOA 1IW6A 1C6PA 4JQ6A 3HT6A 1UCQA 3HT7A 217LA 253LA 3X3CA 1QS9A 1L54A 3HUKA 2RBRA 1F88A 1CU2A 1LYIA 1PQKA 1NHBA 2JAFA 1DYFA 1L0KA 1L72A 1OV5A 2LC9A 1CV4A 3DMVA 3QJQB 1JTMA 1L80A 2I21A 1D3FA 1C63A 168LA 3UZCA 1L87A 3V2YA 3SB7A 1L16A 1SX7A 2ZZLA 1L66A 1L94A 4BUOA 1L22A 5JJEA 3UONA 1L07A 1P8HA 5B35A 1L42A 120LA 5LWEA 243LA 1C6IA 1ZYTA 3NY9A 3S8GB 1L60A 163LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OUFA 4H90A 4XJDA 5DL9A 3W6CA 188LA 2B70A 4NHQA 4CHXA 1LSPA 3ZPQA 4G7QB 1RJCB 2YDOA 1YILA 1UUZC 178LA 1UC0A 4NGVA 1GBYA 3M18B 228LA 5A44A 3F9LA 1D9UA 1JTTL 1F50A 2IHLA 1GD6A 5B59A 1CWQA 1LJFA 1L9HA 4NWEA 2PEDA 4BS7A 4LYMA 133LA 5G2DA 1MGYA 1L52A 1VATA 5H2LA 249LA 1IP6A 2YDGA 4NSGA 1C6NA 5KXYA 4B49A 4MQSA 4XXJA 3GUNA 3L64A 2Y02A 3DDLA 255LA 4OWHA 1LTMA 3A92A 4H91A 3DKEX 2DQEY 4W55A 2G87A 3HTGA 3P65A 1GF5A 4AXTA 1OWZA 175LA 1LSDA 4HPEA 4XYYA 1LJNA 4W57A 1L0JA 2B7XA 5EBHA 3CB7A 3WPLA 1H6MA 132LA 1LMNA 1NDGC 4NGYA 5FHWA 5B6XA 1SWZA 4HWLA 3HTDA 5DM9A 4AMIA 1BB3A 1P2RA 140LA 161LA 5KJ9A 4ARQB 112LA 1X0I1 1L81A 1ZVHL 5KXWA 2ZNXY 4ZEEA 4G71B 1DPWA 3D9AC 1KGBA 2F32A 4GYCA 1L96A 5ILCA 2Q9DA 4CFOA 1LZ5A 4LGKA 1GF0A 2OU8A 4G72B 230LA 1IXFA 4ARPA 1BWHA 1LI3A 4EJ4A 1REMA 2I1XA 3IJUA 4NHTA 1OUCA 216LA 1CX7A 1E0PA 2F30A 4ANRA 1QTBA 4WM5A 3NS0A 1BM1A 5LA8A 3WUAA 236LA 241LA 1C67A 3VGAA 1GE1A 1HMLA 3E3DA 201LA 1LZDA 1CJ7A 176LA 4GBRB 4EIYA 2QPDB 1J1XY 3TMUA 4Y9HA 1EHKB 4W52A 2YBHA 3CODA 4BEZA 1EQEA 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 1DYF A;  1L0K A;  1L72 A;  1OV5 A;  2LC9 A;  1CV4 A;  3DMV A;  3QJQ B;  1JTM A;  1L80 A;  2I21 A;  1D3F A;  1C63 A;  168L A;  3UZC A;  1L87 A;  3V2Y A;  3SB7 A;  1L16 A;  1SX7 A;  2ZZL A;  1L66 A;  1L94 A;  4BUO A;  1L22 A;  5JJE A;  3UON A;  1L07 A;  1P8H A;  5B35 A;  1L42 A;  120L A;  5LWE A;  243L A;  1C6I A;  1ZYT A;  3NY9 A;  3S8G B;  1L60 A;  163L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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