3NY9A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with a novel inverse agonist
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
total genus 162
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny9A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny9A01
1L56A 1LYJA 2I20A 1P7SA 261LA 4UHRA 1L03A 1QTBA 4QRYA 5H2KA 3DN0A 3CAPA 3EH3B 3DN1A 1C6KA 1L41A 1BRDA 4MQTA 3UTYA 1L0KA 4EA3A 4PJZA 3QAKA 259LA 3C8SA 3DN8A 1GZMA 1P2RA 165LA 1LI3A 1CVKA 2F47A 2HULA 1CV6A 3JR6A 4WAVA 4W52A 4W53A 1L89A 1CV0A 3GUMA 137LA 3OAXA 1L94A 1GUEA 1QUDA 3CDRA 1L43A 1L63A 1XJTA 3UZCA 1CU2A 4OV0A 3REYA 209LA 1KG9A 1L16A 1C6PA 243LA 1LI2A 1VJMA 1L18A 1CV1A 3PBLA 2OU8A 4PK0A 1TLAA 247LA 1L34A 1L27A 3C9MA 4G70B 1C65A 1CX7A 2OU9A 3HARA 3VI0A 109LA 1L66A 1LYEA 1M0MA 2R4RA 3G3WA 4I7SA 2ANXA 3A7KA 1L32A 2QARC 4PXKA 102LA 1G0MA 3S8GB 2OE7X 1L85A 3GUOA 1QTZA 1C6GA 2B6ZA 4GPOA 3HAPA 118LA 1L57A 1C6HA 1L04A 1LGUA 1P8UA 1C69A 1DYAA 1G07A 160LA 240LA 191LA 1QT3A 215LA 1QUGA 3EH5B 4PXFA 1CU3A 2NTGA 1L84A 1QTCA 4YXAC 3HH6A 1L14A 3QJQB 1L05A 186LA 139LA 158LA 2RBPA 2F95A 4BEYA 4G7RB 3HDEA 5B6XA 2VT4A 3DN3A 2X72A 1L76A 3MBVA 3CDVA 171LA 2WJKA 4IAQA 248LA 110LA 4W56A 1F50A 4OO9A 112LA 2B70A 2R4SA 3AYMA 5C1MA 1PQJA 5B2NA 3QBGA 1L21A 1L0MA 1XJIA 1TN0A 3ODUA 1L97A 5AZDA 5JJJA 1EPYA 3SBAA 1L44A 2Z6BA 6LZMA 3KJ6A 1C62A 1C64A 4W55A 1L28A 2LCBA 4ARMB 115LA 1C6JA 1T97A 5TGZA 1QTHA 3HUQA 2YCXA 1EHKB 1L68A 5BR5A 5H2NA 169LA 5DYSA 5ETZA 1L46A 2RB0X 3L64A 1JGJA 2YDVA 4EIYA 3G3XA 1LGWA 232LA 253LA 219LA 4EKRA 176LA 127LA 4ARQA 5B6WA 1ZWNA 4N4YB 197LA 1L59A 1KGBA 5G36A 4QI1A 242LA 4W51A 4IAPA 128LA 5KKHA 3RZEA 1C6IA 5G2CA 220LA 217LA 3X3BA 1L49A 1BRRA 3L2XA 5ITCA 4LDLA 1DYGA 4XT1A 192LA 1QSQA 1XJUA 1QM8A 3QBIA 4E97A 1R2NA 1JQUA 2B6XA 2RH1A 3ZEVA 1L91A 229LA 1L47A 1QT7A 2I35A 3UZAA 3S3BB 1LYFA 3UTXA 1L80A 2OU0X 5B6ZA 4LZMA 3C8QA 1P6YA 2RB2X 2B74A 1FBKA 3DKEX 3ZPQA 3HASA 1F88A 2OTZX 3DMXA 218LA 5H2OA 199LA 210LA 1C6DA 1CUQA 4X32A 236LA 3HAOA 2Y01A 4EXMA 114LA 1L90A 3G3VA 185LA 2NTHA 1KS3A 1CU5A 1QHJA 4ARJA 2L6XA 1L45A 5AX0A 4S0WA 1DYBA 1L70A 2ANVA 1E0PA 4GBRA 4UG2A 5B0WA 2G87A 2LZMA 1PQDA 125LA 1AP9A 4BEZA 1LI6A 3HT6A 1C6EA 1C6CA 1CU6A 1L02A 1S51A 180LA 3PQRA 2RB1X 1L08A 4XTOA 1LWGA 5H2MA 159LA 1C66A 1L42A 3VG9A 1AT9A 4MD2A 2NTWA 1D2YA 1LYIA 196LA 1C6FA 1HZXA 1G06A 3OE9A 4LDEA 1E12A 1L95A 2OE4X 4MD1A 120LA 175LA 1L23A 2Z55A 3HT8A 205LA 1QTDA 1L52A 2ZZLA 4KNFA 155LA 2OTYX 4YX7C 1L93A 1VGOA 2M3GA 1LN6A 3HTGA 4GP4B 1G1WA 3SB9A 168LA 2QPDB 1PY6A 1XEPA 4I7QA 2O79A 1L98A 1L53A 1L50A 4I7NA 5DHHA 1KY1A 1LYDA 1FBBA 4TL3A 1P3NA 2B75A 1CUPA 2Q9DA 5JJNA 183LA 4MBSA 3VGAA 1QSBA 4A4MA 1KW7A 4GBRB 5A45A 1L12A 250LA 1P2LA 5EN0A 225LA 111LA 4G7QB 2RBNA 4FBZA 3T45A 3EMLA 3GUIA 1ZYTA 3SBBC 4BUOA 1OVKA 2Q9EA 1H2SA 1JTNA 241LA 3HWLA 1L15A 2IGCA 3CODA 3DN4A 1M0KA 3UG9A 4IARA 4BVNA 1SX2A 146LA 1T6HA 1F4ZA 1K28A 4EKPA 1PXSA 1G0GA 222LA 1G0LA 1SSWA 249LA 4GP8B 4AMIA 166LA 2L78A 5G2DA 1L17A 4FPDA 5AWZA 254LA 4GP5B 1C6QA 1P64A 4XXJA 5B6YA 1X0K1 1C68A 1L51A 1LWKA 2A4TA 3BVDB 235LA 2F32A 4DJHA 3ZPRA 206LA 1L99A 1XMEB 2I21A 145LA 3QJRB 3NY8A 1L62A 103LA 157LA 1L07A 1L54A 1QT5A 257LA 3V2YA 3PXOA 156LA 4AMJA 3FI5A 3C80A 2ZIYA 1DYCA 4EKSA 5J7AA 237LA 2RBRA 1JV7A 2QPEB 5H2PA 4J4QA 4I7KA 1C6LA 2WJLA 3VVKA 4L6RA 1P37A 213LA 3GUJA 4I7RA 3HT9A 1O0AA 1QKOA 108LA 162LA 1D3JA 2LC9A 3K2RA 3RFMA 1LYGA 195LA 233LA 1L09A 3HH3A 2KS9A 1LYHA 2F93A 1H68A 3AYNA 1L81A 1C60A 1M0LA 4XTNA 1C6BA 2NTUA 1KMEA 1D3MA 130LA 3GUNA 3VW7A 4I7JA 4I7PA 1D2WA 1L48A 4HYXA 5A44A 1G0PA 3AM6A 211LA 182LA 1JFPA 1L72A 4LDOA 3HAQA 4BV0A 3DMZA 1OWYA 5I14A 3LZMA 5H2HA 173LA 1ZURA 3HU9A 187LA 4EPFA 190LA 1LW9A 3CDOA 1S8JA 3FADA 3HANA 2RBOA 1L88A 4Y9HA 201LA 2OE9X 3QDCA 4I7OA 1L0JA 3COCA 3C8RA 1L01A 4GRVA 4XTLA 1P36A 5B35A 119LA 107LA 1BRXA 1L22A 2LNLA 4X31A 4I7LA 1SWYA 239LA 1L24A 3QBLA 1XIOA 1X0SA 5DHGA 4WW3A 7LZMA 5G2AA 5H2JA 1PQIA 113LA 4ZPUA 2KSBA 1JTMA 227LA 4YXCA 4W54A 1QS9A 244LA 1P56A 5B34A 1L33A 1G0KA 3HTBA 3HH4A 4ARQB 1BM1A 4EJ4A 262LA 3DQBA 5FJGA 1B6IA 251LA 2RAZX 1R84A 238LA 4GYCA 1G1VA 1CV4A 1DYDA 1CV5A 1KNIA 1PQKA 1L58A 3C82A 1C8RA 1L55A 3HTFA 1S8LA 1UAZA 4HWLA 1OVJA 1IW9A 2Y04A 2KSAA 1OYUA 260LA 3C7YA 228LA 1CTWA 1Q5IA 1L40A 256LA 123LA 3RUNA 4FAAB 4MQSA 5LWEA 1G0QA 1KW5A 189LA 223LA 2Y03A 2ZFEA 2QB0B 3SB8A 4I7MA 3C7ZA 3OE0A 1JV6A 3HTDA 3S8FB 4FA7B 1OV7A 163LA 2RBQA 245LA 4DKLA 131LA 1L77A 3F8VA 3DN2A 1X0I1 1SSYA 3HDFA 1L36A 4W57A 1L65A 200LA 3S3CB 3HT7A 3OE6A 1UCQA 1L29A 4G7SB 142LA 4ARPA 5G28A 2RBSA 258LA 2BRDA 1L67A 2YCWA 4I7TA 4EPIA 4JKVA 1C6AA 178LA 2EI4A 3QBKA 3SB7A 2OEAX 4QIDA 5AX1A 1L92A 4EKQA 1TN5A 1L19A 1QTVA 1P8HA 224LA 2YCYA 2B6WA 3SB6A 1C3WA 1D9WA 231LA 129LA 1L31A 1IW6A 1L71A 2JAGA 4ARMA 2Z73A 1C6NA 1MGYA 3UONA 4XT3A 4W58A 177LA 3C9LA 1C6MA 4L35A 3P0GA 122LA 4JQ6A 1L79A 3NY9A 1T8FA 1C8SA 2O7AA 1L60A 3X3CA 2HPYA 4KLYA 181LA 1OVHA 2CUUA 1S54A 167LA 221LA 3S3DB 3PDSA 2HUMA 3QJVB 1I6SA 1P8IA 2B6TA 1DYFA 4AQNA 198LA 4G72B 5ITEA 2F2QA 1L26A 1C6TA 3DN6A 1DZEA 4K5YA 1CV3A 2I1XA 2J4YA 1L75A 1NHBA 104LA 3UTVA 3DDLA 2B72A 5G54A 3SB5A 2KSYA 1CX6A 5B6VA 1P46A 1SX7A 1PQMA 3C81A 3NS0A 212LA 1L86A 3DMVA 1S52A 4IB4A 1L39A 4NC3A 3UTWA 5H2LA 3NSBA 147LA 3F9LA 1PXRA 255LA 2YCZA 3C83A 252LA 1C61A 4W59A 140LA 3D4SA 143LA 1L30A 3HU8A 3SN6R 1L35A 3V2WA 1L64A 1L82A 3VHZA 138LA 1T8AA 2AT9A 1DYEA 5JJEA 226LA 1G0JA 3CDQA 2PEDA 3CDTA 1QUHA 246LA 184LA 150LA 1KG8A 2RAYX 5AHZA 5AHYA 1LGXA 4JR8A 1L37A 1OWZA 1LPYA 2Y02A 4X1HA 126LA 1L74A 1OV5A 1C67A 148LE 230LA 1PQOA 1QUOA 1Q5JA 3GUPA 161LA 5H2IA 141LA 1L10A 4G71B 3ABWA 2B7XA 1L96A 1LLHA 3C7WA 1S53A 1L61A 1P5CA 2JAFA 149LA 170LA 188LA 1L38A 4N6HA 1QT8A 5LZMA 1QT4A 1L73A 3OE8A 1KY0A 1L13A 1WTHA 1IXFA 3WQJA 3HUKA 1L06A 2B73A 3GULA 5BR2A 3QJUB 1CWQA 4BWBA 4ARLA 174LA 2Y00A 3DNAA 3PWHA 234LA 3NYAA 3EH4B 1QKPA 172LA 4N4WA 5G53A 1L00A 1QT6A 3FA0A 1CU0A 1L20A 1L69A 1L83A 1L9HA 5A8EA 1T8GA 1D3FA 2O4WA 3QJSB 4HYJA 164LA 1SWZA 1L87A 2B6YA 3GUKA 3QAPA 214LA 1QS5A 5F8UA 1L11A 3HH5A 3QJTB 1D3NA 152LA 216LA 1U19A 151LA 1GU8A 2YDOA 4DAJA 1L25A 3HUAA 2HUKA 1C63A 144LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B0OA 4QRYA 4II8A 4LFXA 1GBYA 4NHPA 4EA3A 4DQ5A 1XEKA 1GZMA 1AT6A 1IWZA 3JR6A 1CVKA 2F47A 4W52A 4W53A 1L89A 1RE2A 3HFMY 4PPOA 4NGLA 3CDRA 1GF4A 1LSZA 3UZCA 209LA 193LA 1WQOA 1L18A 2OU8A 4NY5A 1AKIA 4H8YA 2OU9A 109LA 1M0MA 3G3WA 1WTNA 4PXKA 4H8XA 1G0MA 1GAYA 1L85A 3GUOA 4H9FA 4M6DA 3HAPA 1L04A 1HF4A 1LGUA 1P8UA 1IWVA 7LYZA 1DYAA 160LA 5HNCA 1HEWA 1QT3A 215LA 1QUGA 3EH5B 2LYOA 4YXAC 3QJQB 2RBPA 139LA 1JKCA 3RT5X 3HDEA 1L76A 1DI4A 1W08A 171LA 1INUA 248LA 4W56A 112LA 5C1MA 4UWVA 4G4HA 1L21A 1L0MA 1TN0A 1XEJA 1I56A 1L97A 3SBAA 3KJ6A 4W55A 1H6MA 5B59A 5LXWA 1GF0A 169LA 4D9ZA 4ZFPA 5ETZA 1L46A 2BQHA 2RB0X 2YDVA 3G3XA 1B5VA 1LGWA 3W6FA 5KY1A 219LA 3TXDA 2LZ2A 4WM2A 1ZWNA 197LA 5G36A 1VDPA 3CT1A 1LSMA 4IAPA 1NBZC 4W96A 1HHLA 3ULRA 1QDTA 1TAYA 4GCFA 3X3BA 3AZ6A 1LZGA 1VATA 3L2XA 5ITCA 1DYGA 4ETDA 1GF8A 1HFYA 1QSQA 1YQVY 1JQUA 1LKSA 1LHMA 1L47A 3UTXA 2OU0X 1IC7Y 3C8QA 4NG8A 1P6YA 2LYZA 1IWXA 3DKEX 3TMUA 4B0DA 2OTZX 5B1FA 4AXTA 218LA 199LA 210LA 1CUQA 4X32A 3TXEA 4DQJA 1NDMC 114LA 1AZFA 1CU5A 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 1L86 A;  3DMV A;  1S52 A;  4IB4 A;  1L39 A;  4NC3 A;  3UTW A;  5H2L A;  3NSB A;  147L A;  3F9L A;  1PXR A;  255L A;  2YCZ A;  3C83 A;  252L A;  1C61 A;  4W59 A;  140L A;  3D4S A;  143L A;  1L30 A;  3HU8 A;  3SN6 R;  1L35 A;  3V2W A;  1L64 A;  1L82 A;  3VHZ A;  138L A;  1T8A A;  2AT9 A;  1DYE A;  5JJE A;  226L A;  1G0J A;  3CDQ A;  2PED A;  3CDT A;  1QUH A;  246L A;  184L A;  150L A;  1KG8 A;  2RAY X;  5AHZ A;  5AHY A;  1LGX A;  4JR8 A;  1L37 A;  1OWZ A;  1LPY A;  2Y02 A;  4X1H A;  126L A;  1L74 A;  1OV5 A;  1C67 A;  148L E;  230L A;  1PQO A;  1QUO A;  1Q5J A;  3GUP A;  161L A;  5H2I A;  141L A;  1L10 A;  4G71 B;  3ABW A;  2B7X A;  1L96 A;  1LLH A;  3C7W A;  1S53 A;  1L61 A;  1P5C A;  2JAF A;  149L A;  170L A;  188L A;  1L38 A;  4N6H A;  1QT8 A;  5LZM A;  1QT4 A;  1L73 A;  3OE8 A;  1KY0 A;  1L13 A;  1WTH A;  1IXF A;  3WQJ A;  3HUK A;  1L06 A;  2B73 A;  3GUL A;  5BR2 A;  3QJU B;  1CWQ A;  4BWB A;  4ARL A;  174L A;  2Y00 A;  3DNA A;  3PWH A;  234L A;  3NYA A;  3EH4 B;  1QKP A;  172L A;  4N4W A;  5G53 A;  1L00 A;  1QT6 A;  3FA0 A;  1CU0 A;  1L20 A;  1L69 A;  1L83 A;  1L9H A;  5A8E A;  1T8G A;  1D3F A;  2O4W A;  3QJS B;  4HYJ A;  164L A;  1SWZ A;  1L87 A;  2B6Y A;  3GUK A;  3QAP A;  214L A;  1QS5 A;  5F8U A;  1L11 A;  3HH5 A;  3QJT B;  1D3N A;  152L A;  216L A;  1U19 A;  151L A;  1GU8 A;  2YDO A;  4DAJ A;  1L25 A;  3HUA A;  2HUK A;  1C63 A;  144L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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