3NYAA

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with the neutral antagonist alprenolol
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
total genus 166
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3nyaA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3nyaA01
200LA 1L16A 1OVHA 213LA 262LA 4QI1A 4MQSA 1D3MA 3HH6A 3A7KA 5AZDA 1SX2A 1L38A 1ZURA 4IAPA 4EKQA 3OE9A 1C6NA 1QT4A 4EXMA 3UTYA 227LA 161LA 3LZMA 190LA 167LA 4AMIA 3S8FB 1L26A 1F4ZA 3DQBA 5A45A 1G1WA 1L67A 3HUKA 1G0PA 1D2YA 1L18A 3SB6A 1HZXA 3QAPA 184LA 1OVKA 3C8SA 1L17A 2OTYX 1L02A 3QBLA 3HAOA 1QKPA 1C64A 1L11A 1P36A 5A8EA 1LGUA 1F50A 4WW3A 3K2RA 4W59A 230LA 125LA 143LA 255LA 223LA 1QHJA 3CODA 2A4TA 2J4YA 4LDLA 5H2KA 1L57A 1L68A 5F8UA 1L91A 4LDEA 3DNAA 2L6XA 225LA 1H68A 5G2CA 3HTBA 4BV0A 1L59A 4W57A 1L93A 1T8FA 3HDEA 4X1HA 4ARLA 1C63A 1P56A 1L09A 4I7MA 4XT1A 1DYAA 4G71B 1DYFA 3HH4A 2KSYA 3L64A 4EIYA 3OE6A 219LA 4I7NA 1CX6A 3QJVB 1C6HA 1BM1A 1L14A 3CDQA 5JJEA 256LA 191LA 1L07A 1G0MA 1QKOA 2AT9A 3NS0A 114LA 5BR2A 240LA 3HTDA 3C9MA 4XTLA 1VJMA 3VW7A 216LA 1CU6A 3DN6A 4HWLA 3RUNA 3SN6R 1I6SA 108LA 115LA 2B6TA 170LA 1QTDA 2NTWA 1KS3A 4ARQA 118LA 1L95A 1P2RA 214LA 4W51A 2YDOA 1CV3A 4ARJA 1DYBA 2Y02A 1QUOA 2KS9A 163LA 2YCXA 3DDLA 1L98A 3UONA 1CWQA 2RBPA 4XTNA 5AHYA 1L31A 4EA3A 1C60A 221LA 1LW9A 1L54A 260LA 1L75A 7LZMA 131LA 1G0KA 2B72A 237LA 189LA 3C9LA 5B6YA 4I7OA 3QJQB 1R2NA 1L03A 1QTVA 4QIDA 1L87A 5B6VA 1CV6A 1L43A 3SB5A 2I1XA 4WAVA 2RB0X 1R84A 4PXFA 3S3DB 1CV0A 5B6WA 103LA 1QTHA 139LA 2IGCA 3G3WA 1DZEA 1KG9A 1L81A 2QPEB 110LA 4X31A 1L23A 4BEZA 186LA 2Y00A 3DMVA 1SX7A 220LA 4N6HA 4N4YB 129LA 1L51A 5H2LA 1Q5IA 209LA 2Y03A 1C6TA 4TL3A 2BRDA 1L90A 5B6ZA 4I7JA 1EPYA 1LWKA 130LA 138LA 1PXRA 158LA 1L61A 3HUAA 3UTWA 1X0SA 195LA 4I7QA 1QM8A 4W54A 5EN0A 1QUDA 1L08A 206LA 3C80A 3QBIA 2ZIYA 5H2PA 4ARMB 1C3WA 244LA 1G07A 4UHRA 1P5CA 4MBSA 4GP8B 1C6LA 211LA 3DN4A 2OE4X 1UAZA 126LA 4I7SA 1G0JA 1QSBA 1P3NA 152LA 2R4SA 2KSAA 3QAKA 146LA 3ZPRA 1DYEA 4G70B 4HYJA 3UG9A 1C67A 229LA 2OEAX 1IW6A 2RH1A 3CDOA 169LA 1JV7A 3QDCA 1BRRA 2RB2X 168LA 2RB1X 1LYFA 1E0PA 1QT8A 2HULA 1L71A 1CV5A 242LA 250LA 5B0WA 119LA 1LWGA 5KKHA 1CV4A 1L64A 2B70A 3ODUA 3G3XA 3HAPA 5JJJA 1QTZA 1L99A 1PQOA 2JAFA 4PXKA 1WTHA 2B75A 3AM6A 3HASA 3GUNA 1TN0A 1AT9A 3HANA 4PJZA 3COCA 1L69A 2Z6BA 4XT3A 1KG8A 137LA 1L04A 1L76A 2B6XA 1BRXA 1GU8A 171LA 4KNFA 1G0GA 1L34A 5G54A 1L28A 1XJUA 3PBLA 1ZYTA 1CU0A 254LA 4W58A 1QT5A 1T6HA 1OV5A 1L94A 4W55A 2F93A 1VGOA 3OE8A 1M0KA 1QS5A 1L44A 253LA 5H2IA 175LA 1P7SA 1D3JA 4GBRB 1C6QA 4BVNA 5G2AA 2O4WA 4I7RA 1L65A 4I7KA 3WQJA 3NY8A 1L15A 3DN8A 4MQTA 1L19A 1L50A 3SB9A 5AHZA 4IARA 165LA 1LYGA 3PDSA 2NTGA 197LA 4I7PA 3EH4B 1H2SA 4W53A 3QJSB 2B7XA 1C68A 2RBNA 1DYGA 2RBSA 3HDFA 1JGJA 4AQNA 1C6CA 1S52A 3SB7A 4IB4A 4EPFA 4YX7C 1O0AA 4YXAC 1C6GA 1DYCA 1L41A 3OE0A 2WJLA 2F32A 2HPYA 3HU8A 128LA 1S54A 2OTZX 1L66A 3DN1A 246LA 4DAJA 261LA 3C81A 3ZPQA 3HT7A 1L20A 5DYSA 187LA 1T97A 4GP4B 3V2YA 1LGXA 2B6WA 1F88A 3GUJA 5DHGA 238LA 249LA 1L84A 2B73A 123LA 3HTFA 144LA 4ZPUA 1JQUA 2Q9DA 5JJNA 2OU8A 1PY6A 147LA 1UCQA 1SSYA 149LA 1CU3A 1C8RA 3OAXA 3L2XA 4JKVA 4N4WA 4UG2A 150LA 4EKPA 1LI6A 4K5YA 3GUOA 3C7YA 3HAQA 2OU0X 2B6ZA 1C6BA 2F47A 4BWBA 156LA 4L6RA 1L70A 1OVJA 5I14A 1QSQA 2HUKA 224LA 1L82A 2ZZLA 3C82A 3VVKA 1L79A 3PXOA 3SB8A 4XTOA 5G28A 4GYCA 160LA 1PQKA 177LA 4ARMA 1L37A 1QT3A 2I20A 5B34A 4MD2A 182LA 120LA 183LA 1CTWA 1QT7A 1CU2A 3DN2A 1C66A 4LDOA 1L9HA 4BUOA 5A44A 2G87A 3UZCA 252LA 212LA 5B2NA 1L06A 3T45A 1L00A 2YDVA 1TLAA 5LWEA 164LA 1C6EA 1M0MA 4LZMA 1L92A 155LA 107LA 4G7SB 2RBRA 3BVDB 1L0MA 2M3GA 3RFMA 5J7AA 3ABWA 2X72A 4GRVA 2I21A 3NSBA 1P37A 4E97A 1C6MA 1LYIA 235LA 1OV7A 1LYEA 3VHZA 1LN6A 166LA 196LA 112LA 1LPYA 1U19A 1C6DA 1G1VA 3F8VA 232LA 3AYMA 1CX7A 3EMLA 241LA 4DJHA 1EHKB 162LA 3DN0A 3HT6A 1PQMA 1SWZA 5DHHA 1C6IA 1P46A 3QJRB 3HH5A 1L46A 1L39A 2KSBA 1P6YA 1JV6A 1L97A 1L83A 1S8JA 234LA 3CDVA 4G7QB 142LA 198LA 4GPOA 4KLYA 4FA7B 2I35A 4YXCA 1D9WA 3KJ6A 2OU9A 3C8QA 3DMXA 1L62A 4HYXA 4G7RB 4EJ4A 4AMJA 4NC3A 3FA0A 185LA 1K28A 145LA 1KNIA 1KMEA 1P8IA 1LI3A 3GUPA 1D3FA 1KW5A 215LA 5TGZA 1QUGA 1NHBA 4GBRA 3VG9A 3X3CA 4FPDA 1TN5A 1L40A 5ITEA 1AP9A 4XXJA 1L80A 1CUPA 5G36A 1L73A 3G3VA 111LA 1L10A 1L89A 1XJTA 1LYHA 2L78A 1L01A 1L53A 1T8AA 1S8LA 1MGYA 1JTNA 1G0LA 3C7WA 3GUKA 5C1MA 4EKSA 2RBQA 5LZMA 4DKLA 1L52A 4OV0A 159LA 3HT8A 1L22A 259LA 3HT9A 1QTBA 5G2DA 3PQRA 3PWHA 1Q5JA 2NTHA 5ITCA 1L86A 1L32A 5AX1A 1C6FA 3S8GB 148LE 1L77A 1PQJA 2ANVA 3HWLA 3HUQA 3QBKA 192LA 226LA 3F9LA 5G53A 3NYAA 1L12A 1JTMA 231LA 236LA 222LA 3HH3A 141LA 3SBBC 217LA 4GP5B 243LA 2VT4A 2CUUA 2R4RA 104LA 3C8RA 3UTVA 1LYDA 1ZWNA 2PEDA 3CAPA 258LA 2O79A 3X3BA 4G72B 3V2WA 3HU9A 157LA 1XEPA 1JFPA 3JR6A 2ZFEA 218LA 1D2WA 1OWZA 1GZMA 4FBZA 3EH5B 3DKEX 205LA 1C8SA 122LA 1PQIA 1C61A 4Y9HA 3UTXA 1L48A 4BEYA 1L45A 1C62A 1C69A 1S53A 257LA 2ANXA 2OE9X 3GUIA 1IW9A 1B6IA 201LA 4EPIA 1G06A 5AX0A 1X0I1 102LA 1KY0A 2O7AA 251LA 6LZMA 1CVKA 1IXFA 247LA 2F2QA 1L24A 1P8UA 2RBOA 178LA 1L72A 1XMEB 127LA 1DYDA 2RAZX 181LA 2LC9A 3CDRA 3REYA 1QTCA 4X32A 174LA 3C7ZA 1LLHA 188LA 1CUQA 1L25A 4FAAB 3QBGA 1KGBA 2YCWA 3HARA 1GUEA 4QRYA 5H2HA 1L21A 199LA 2LCBA 1L58A 1L56A 4ARQB 1G0QA 2F95A 1QT6A 1L88A 2WJKA 1C6JA 5B35A 1L33A 228LA 3MBVA 1C6PA 1SSWA 3ZEVA 1L96A 233LA 1KY1A 4J4QA 2JAGA 1L0JA 2OE7X 1PXSA 1X0K1 3NY9A 1C65A 3D4SA 3CDTA 1L60A 2Y01A 176LA 4W52A 2QPDB 1OWYA 1C6KA 1L05A 3SBAA 1LGWA 2RAYX 3AYNA 1L49A 1L85A 1CU5A 1P64A 1FBBA 1L30A 245LA 1L35A 2HUMA 2QARC 1S51A 2NTUA 3QJTB 4MD1A 4A4MA 2Q9EA 1P8HA 140LA 172LA 239LA 4PK0A 1L55A 1L74A 5FJGA 1QUHA 4I7LA 1L27A 2YCYA 1CV1A 1L29A 1L63A 4W56A 1XIOA 1KW7A 1XJIA 5H2MA 1L0KA 1P2LA 5H2JA 2EI4A 5B6XA 4EKRA 1E12A 5H2NA 3EH3B 1PQDA 173LA 4I7TA 1QS9A 3UZAA 2B6YA 4JQ6A 4OO9A 3S3BB 1OYUA 2YCZA 3VGAA 1BRDA 5ETZA 3S3CB 2LNLA 3C83A 3P0GA 4JR8A 1FBKA 3FI5A 3DMZA 4L35A 2Z55A 2Y04A 5BR5A 1L47A 109LA 1L42A 2LZMA 3DN3A 2Z73A 248LA 1D3NA 4IAQA 1T8GA 151LA 1C6AA 4S0WA 113LA 1M0LA 1L13A 4ARPA 2B74A 3VI0A 2QB0B 5H2OA 1SWYA 3GUMA 3QJUB 1LI2A 1LYJA 3GULA 3HTGA 210LA 5AWZA 3FADA 180LA 3RZEA 1L36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EQ4A 5FEKA 1L16A 5AZDA 1QSAA 4TTDA 1L38A 1ZURA 2YBHA 1C6NA 4EXMA 190LA 167LA 5I4YA 3QAPA 1YAPA 1HC0A 1L17A 2BLYA 4PRQA 1C64A 3P64A 5A8EA 1WQNA 230LA 4ML7A 255LA 1DI5A 1JJ1A 1GBZA 2DQDY 5F8UA 2NWDX 5M1YA 225LA 5G2CA 1IWXA 3HTBA 2Q0MX 1LZGA 4CJ2A 2HECA 2F4AA 4X1HA 1P56A 1LHHA 1L09A 208LA 1JITA 1IORA 1IP3A 1LZEA 4I7NA 3QJVB 3A93A 1L14A 5JJEA 256LA 1G0MA 3CT1A 4XTLA 4WM3A 1VJMA 3ZEKA 1A4VA 3VW7A 1VEDA 2EPEA 3ATNA 1KS3A 4LYMA 214LA 1GFVA 1CV3A 1NWGA 5E4PA 3W6BA 1JUGA 5LAFA 1DYBA 4LGKA 1LTMA 3DDLA 3UONA 2W1XA 2YDGA 1CWQA 5AHYA 2DBTA 4EA3A 221LA 1RE2A 2LZTA 2LYZA 4B4JA 2X0AA 133LA 1LSCA 1JKDA 5APFA 1LJFA 4QIDA 4EMNA 1LHLA 3TXJA 3SB5A 4OOOA 1REYA 3S3DB 4XADA 1DKJA 5B6WA 1LJKA 103LA 3G3WA 3QE8A 5DN5A 6LYTA 2A7DA 1IP4A 4BEZA 2LZ2A 4IATA 5H2LA 1FLQA 1NMMA 4TL3A 1GHLA 5B6ZA 5I4XA 4XJFA 1BVXA 1L61A 1OP9B 4ETBA 5KXOA 3AB6A 4I7QA 1QM8A 4G4BA 206LA 3C80A 2ZIYA 5B07A 3WH1A 1AT6A 4HTQA 4WLDA 1GDXA 1QSBA 1P3NA 152LA 4G9SA 5LVIA 2R4SA 1DYEA 4G70B 1C67A 229LA 2OEAX 5FDJA 4ANRA 1IW6A 169LA 1BRRA 2RB2X 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 3FI5 A;  3DMZ A;  4L35 A;  2Z55 A;  2Y04 A;  5BR5 A;  1L47 A;  109L A;  1L42 A;  2LZM A;  3DN3 A;  2Z73 A;  248L A;  1D3N A;  4IAQ A;  1T8G A;  151L A;  1C6A A;  4S0W A;  113L A;  1M0L A;  1L13 A;  4ARP A;  2B74 A;  3VI0 A;  2QB0 B;  5H2O A;  1SWY A;  3GUM A;  3QJU B;  1LI2 A;  1LYJ A;  3GUL A;  3HTG A;  210L A;  5AWZ A;  3FAD A;  180L A;  3RZE A;  1L36 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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