3NYAA

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with the neutral antagonist alprenolol
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 166
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3nyaA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3nyaA01
219LA 157LA 3MBVA 5G28A 1P2LA 1QKOA 1PQOA 4PK0A 3C8RA 1L45A 3FA0A 3GUKA 1T8FA 1L54A 3QBGA 2RAZX 5AZDA 169LA 4W51A 3NY9A 4LDLA 4NC3A 4N4WA 1DYCA 2B6XA 5JJEA 232LA 1L07A 1L42A 2RBQA 1Q5JA 172LA 1OV7A 4AQNA 1HZXA 1C61A 1QUHA 2QARC 1L63A 1L0MA 2QPDB 3HASA 2B6YA 1L90A 3HUAA 3SB8A 3G3XA 4ARJA 3DN3A 1L20A 1D2YA 5J7AA 4G72B 3GULA 1C6KA 2RBNA 1C8SA 4EKPA 1T8AA 3AYMA 3AYNA 1F4ZA 1UAZA 1CUQA 1CV6A 4Y9HA 1OVHA 1P6YA 3DDLA 1JQUA 1G0JA 1L93A 3HANA 4KNFA 3EH3B 1CU5A 231LA 5A45A 1JTNA 1PY6A 1QM8A 4X1HA 254LA 122LA 1DYEA 3QJTB 4W55A 3UTVA 2OU9A 3D4SA 3QJUB 1H2SA 2F93A 1TN5A 2YCZA 3S3DB 1L69A 1CV0A 1IW6A 1VJMA 2M3GA 4XTNA 2OE4X 2OE7X 4IAPA 2KSBA 1L88A 1L82A 1Q5IA 262LA 3CODA 3UZCA 3HWLA 1QUOA 2IGCA 5JJNA 4FA7B 3CDVA 4IARA 5B6ZA 3UTXA 174LA 1L92A 1L94A 1T8GA 1CU6A 211LA 5G2CA 2OU0X 5A44A 3HH3A 2L6XA 1L27A 4QIDA 3HTBA 3C8SA 1C6LA 110LA 190LA 1C6HA 2ANXA 5B6XA 3VG9A 4KLYA 3KJ6A 4K5YA 1LYGA 1SX2A 3HTFA 2WJKA 3UZAA 3HT9A 3G3WA 206LA 3HU8A 2I20A 236LA 1PXRA 214LA 2KS9A 4EKRA 4EXMA 5H2PA 1L53A 4GBRB 1L29A 1F88A 1QSQA 1L52A 2LNLA 4W52A 216LA 1P8IA 1L37A 1QUDA 4G7RB 4ARQB 1M0LA 3C82A 1QTCA 3SN6R 4UHRA 1KW5A 213LA 2B72A 1KGBA 4ARMA 1L87A 1SX7A 150LA 233LA 5I14A 4BWBA 142LA 123LA 1QTBA 2B75A 1PXSA 4JKVA 4LZMA 5B6WA 5H2MA 4XTOA 5ITEA 3ZPRA 3V2YA 5AX1A 2PEDA 1L56A 3NSBA 1L01A 4PJZA 5H2JA 2RBPA 2Y03A 107LA 1ZURA 1L28A 3QJRB 1LGXA 1L68A 1DZEA 2NTUA 5H2LA 4GP5B 1CX7A 140LA 1T97A 1L75A 3X3BA 3VHZA 3GUIA 3HUQA 2I35A 3PXOA 1AT9A 1CWQA 217LA 176LA 199LA 1UCQA 5EN0A 1L60A 1D3MA 4XTLA 1EPYA 1LYIA 2O4WA 3WQJA 2QB0B 175LA 2F32A 4W54A 2HUKA 4EPFA 1P8HA 3RUNA 1L79A 113LA 1CU2A 4I7SA 158LA 1U19A 108LA 173LA 1C6MA 4EPIA 1P36A 1L11A 3COCA 145LA 1IXFA 2HULA 2YDVA 2OTZX 5B2NA 1G06A 3NY8A 3QDCA 1L05A 261LA 1P5CA 3UONA 1IW9A 3HAPA 146LA 3F8VA 156LA 1G0QA 4X31A 1DYAA 1C68A 1L18A 1QTDA 177LA 3DQBA 3NS0A 4L6RA 4GRVA 1L44A 1E12A 3HTGA 2KSAA 4QI1A 5B6VA 1GU8A 1JV6A 4GP4B 3BVDB 3VVKA 4WAVA 1C65A 3L2XA 2J4YA 1OV5A 197LA 1L98A 2LCBA 4FPDA 3DN4A 114LA 2RBOA 3CDQA 2ZZLA 148LE 1L0KA 2R4SA 1SSWA 3SBAA 1L17A 4EIYA 2R4RA 1L38A 1D3JA 3HDEA 4E97A 5DHHA 130LA 3DMXA 1FBKA 1L97A 3DNAA 1KY0A 2OE9X 1L19A 209LA 3DN2A 5H2OA 1L73A 2YDOA 5H2KA 1I6SA 1L49A 3C81A 1XIOA 4JQ6A 1CV4A 1QUGA 137LA 3PQRA 1KW7A 3HU9A 1S52A 2F2QA 2NTHA 3C80A 119LA 128LA 4A4MA 1CTWA 3CDTA 230LA 1L46A 1QS5A 3EMLA 3RZEA 1L83A 1LW9A 3FI5A 3HH5A 3V2WA 1JFPA 3QJSB 4L35A 3QBKA 1L16A 1L74A 3C9MA 4HYJA 1S54A 1G0KA 4GYCA 2X72A 3UTYA 4I7MA 1P56A 184LA 1L9HA 4YXAC 1L13A 3C7YA 1CU0A 5BR5A 1L81A 1L03A 4AMIA 244LA 2OTYX 1C6PA 4XXJA 258LA 228LA 182LA 4HYXA 5B35A 3HARA 215LA 1LPYA 2Q9DA 1OVJA 4BVNA 149LA 3OE6A 3PDSA 1JGJA 4OO9A 1L96A 1XJUA 1L71A 4GPOA 1TN0A 4BV0A 1SWYA 1XJTA 1NHBA 6LZMA 1L34A 1CU3A 5TGZA 4EKSA 1L50A 1L30A 4YX7C 2HPYA 1LWKA 5B34A 221LA 1PQKA 1S53A 168LA 1L64A 3A7KA 5FJGA 1L76A 1D3FA 1C8RA 2NTGA 1L06A 1L51A 3CDRA 4MD2A 3DMVA 1P3NA 1L72A 3G3VA 1L14A 4W59A 2NTWA 1S8JA 3HAOA 5H2HA 5LWEA 127LA 1KG9A 4AMJA 3VGAA 1C6NA 2LZMA 2I21A 1MGYA 1L66A 4MD1A 4ARLA 2L78A 3AM6A 1QT8A 4LDEA 102LA 1C3WA 4PXKA 4DKLA 1C6AA 5ITCA 1L67A 3SB9A 1P2RA 1C69A 1C6FA 239LA 1L70A 1L58A 1ZWNA 1LI2A 2YCWA 220LA 1BM1A 255LA 125LA 195LA 3ODUA 3OAXA 1QKPA 2G87A 1O0AA 1QT5A 234LA 3DN8A 1D9WA 1EHKB 3ZEVA 245LA 222LA 188LA 1L95A 1TLAA 186LA 1L32A 4YXCA 4FAAB 3GUPA 237LA 3QJQB 115LA 1L61A 256LA 3GUJA 3QAKA 1PQJA 3C7WA 5LZMA 5ETZA 1JTMA 3VW7A 1OVKA 3PBLA 3HH4A 2B6TA 131LA 1C6DA 166LA 1G0LA 5B0WA 5C1MA 3HT8A 1P46A 4N4YB 181LA 3K2RA 4I7QA 4JR8A 5H2NA 1QHJA 1KS3A 1LYEA 252LA 4EJ4A 1QT7A 2O79A 1CV3A 5G36A 138LA 1QTHA 1BRRA 1C62A 5AX0A 4QRYA 180LA 2A4TA 3HDFA 1R84A 160LA 4I7JA 178LA 1X0I1 4MQTA 167LA 4N6HA 2Y02A 1L0JA 3T45A 196LA 2Y04A 1DYDA 4I7LA 4BEZA 1XEPA 4I7RA 1D3NA 1L39A 3DN6A 1E0PA 1L36A 1S51A 4DJHA 109LA 1QTVA 3SBBC 159LA 3QAPA 4ARMB 227LA 118LA 1L22A 2ZFEA 1LYHA 218LA 1L80A 1C66A 1L26A 2JAFA 4I7PA 4FBZA 1M0KA 1PQMA 1L25A 201LA 120LA 3EH4B 189LA 260LA 1DYGA 7LZMA 1L85A 1QT6A 3GUNA 3SB6A 1BRDA 129LA 1WTHA 2B73A 5BR2A 243LA 3HUKA 3HT6A 1LYDA 1C67A 1LGWA 5F8UA 147LA 4S0WA 1C6IA 1H68A 2KSYA 4I7NA 200LA 1PQIA 2OEAX 5G2DA 3UG9A 4BEYA 2F95A 1L86A 225LA 144LA 212LA 152LA 1C6TA 4GBRA 1L23A 4WW3A 3EH5B 2Z6BA 3C9LA 111LA 163LA 5A8EA 248LA 224LA 242LA 4ARQA 2ANVA 1L12A 4UG2A 4J4QA 2EI4A 3X3CA 187LA 1P8UA 4IAQA 2B6ZA 3HH6A 3OE8A 1G07A 3QBLA 2RH1A 3ABWA 1L99A 223LA 3JR6A 2BRDA 241LA 2Z55A 1QSBA 1L04A 4TL3A 4OV0A 3S3BB 1R2NA 5DYSA 3HT7A 1KMEA 1AP9A 5G53A 192LA 3L64A 1L33A 126LA 1L02A 1C6CA 1G0PA 3GUMA 3HAQA 1LI6A 4G71B 1ZYTA 162LA 1L41A 198LA 4W58A 251LA 3UTWA 1CVKA 1GUEA 4MQSA 4IB4A 1FBBA 1T6HA 4G70B 2HUMA 1L48A 1LYJA 4XT1A 2YCYA 2B74A 185LA 4BUOA 1LLHA 3QBIA 2B7XA 2Y00A 2ZIYA 1P37A 1F50A 1KG8A 4LDOA 2WJLA 1L77A 1OWZA 112LA 171LA 1L59A 1OWYA 5AHYA 1SSYA 3DN0A 4EA3A 1C6QA 1LWGA 1G1VA 1JV7A 1QT4A 5G2AA 235LA 1OYUA 1LI3A 2F47A 3CDOA 1QTZA 2VT4A 3ZPQA 1L15A 1CUPA 1C6EA 1K28A 4HWLA 1GZMA 1L65A 1L00A 2YCXA 165LA 2RB0X 1DYBA 2I1XA 4I7KA 3OE9A 3LZMA 1C63A 1X0K1 5AHZA 1G1WA 1PQDA 3F9LA 1L35A 1LYFA 3SB5A 1BRXA 1LGUA 1VGOA 2Q9EA 191LA 226LA 3VI0A 3DN1A 3P0GA 1CV5A 3C83A 151LA 1QT3A 4I7OA 4W57A 5B6YA 2RBSA 1L09A 1L21A 3FADA 2B70A 3OE0A 3DKEX 1L89A 4ZPUA 1B6IA 5KKHA 1QS9A 246LA 2O7AA 103LA 4PXFA 1L24A 1L84A 3C7ZA 3CAPA 5H2IA 1L55A 3S8GB 1CV1A 3SB7A 3HTDA 3NYAA 1XJIA 3PWHA 240LA 2OU8A 2Z73A 1D2WA 2QPEB 1CX6A 1KNIA 3GUOA 5G54A 3S3CB 1P64A 2JAGA 155LA 1C6GA 238LA 2CUUA 1G0MA 1L91A 4W53A 2AT9A 4X32A 3QJVB 1L47A 1C60A 143LA 1L40A 3C8QA 183LA 259LA 4W56A 2LC9A 1L57A 1L08A 1L43A 1L31A 1KY1A 1DYFA 249LA 3RFMA 2RB1X 1C6JA 4I7TA 5AWZA 253LA 250LA 2RB2X 1M0MA 229LA 1LN6A 4GP8B 3DMZA 170LA 1C64A 210LA 2RAYX 4XT3A 257LA 205LA 3REYA 1XMEB 5JJJA 139LA 1L10A 1S8LA 4DAJA 4G7SB 1L62A 1C6BA 2B6WA 4MBSA 4EKQA 1P7SA 1SWZA 5DHGA 104LA 2RBRA 141LA 4ARPA 164LA 1G0GA 3S8FB 2Y01A 161LA 247LA 4G7QB 1X0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LZ4A 1P2LA 4NG8A 1T8FA 2RAZX 3NY9A 1DPXA 4NC3A 1GE4A 3RU5A 4CJ2A 5JJEA 1JKCA 1GE1A 5F81A 1C61A 1QUHA 3SB8A 1L90A 4ARJA 5FELA 1CKFA 3A8ZA 5J7AA 1C6KA 5I54A 1EQ5A 1C8SA 4EKPA 3W3EA 4NWEA 1G0JA 3EH3B 1CU5A 231LA 1QM8A 1LZ9A 4X1HA 122LA 3QJTB 1GFKA 3UTVA 2OU9A 3QJUB 1H2SA 2F93A 4PRUA 1L69A 1CV0A 3WULA 3HWLA 3E3DA 1LTMA 174LA 1LZAA 5G2CA 211LA 2OU0X 4NSIA 2FBDA 1HELA 1LHKA 5APEA 2L6XA 1L27A 3C8SA 4TTDA 1HFZA 5B6XA 3VG9A 4KLYA 1SX2A 3UZAA 5LVHA 1DQJC 1XEJA 236LA 3W6BA 2KS9A 5H2PA 1XEIA 1L53A 1L29A 1UIFA 1OUEA 2YDGA 1JJ0A 4W52A 4G7RB 4EMNA 1KW5A 213LA 1CJ8A 4GLVA 1P2CC 4FDYA 4EOFA 1GBZA 4JKVA 2DQAA 1GF9A 4LZMA 5B6WA 3V2YA 5I4XA 4NEBA 1DI4A 1L56A 4PJZA 5H2JA 1GWDA 1ZURA 1L68A 140LA 2HEBA 3SP3A 3X3BA 3GUIA 3FI7A 2ZYCA 3ZVQA 4J1BA 3WQJA 2QB0B 5KXWA 2HUKA 4EPFA 1JEFA 1HEOA 1IP3A 1C6MA 1P36A 2OTZX 5E9RA 3QDCA 4DQJA 4ET9A 1JTTL 4DD7A 1DKKA 4OWBA 1QTDA 3DQBA 3NS0A 1GU8A 1JV6A 3VVKA 2GV0A 4DDBA 4IASA 1OV5A 4FPDA 2RBOA 1L0KA 1W6ZA 1L38A 1D3JA 2MEEA 5DHHA 1L97A 1LHIA 1KY0A 1L19A 1HFXA 3KAMA 4HPEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4HWL A;  1GZM A;  1L65 A;  1L00 A;  2YCX A;  165L A;  2RB0 X;  1DYB A;  2I1X A;  4I7K A;  3OE9 A;  3LZM A;  1C63 A;  1X0K 1;  5AHZ A;  1G1W A;  1PQD A;  3F9L A;  1L35 A;  1LYF A;  3SB5 A;  1BRX A;  1LGU A;  1VGO A;  2Q9E A;  191L A;  226L A;  3VI0 A;  3DN1 A;  3P0G A;  1CV5 A;  3C83 A;  151L A;  1QT3 A;  4I7O A;  4W57 A;  5B6Y A;  2RBS A;  1L09 A;  1L21 A;  3FAD A;  2B70 A;  3OE0 A;  3DKE X;  1L89 A;  4ZPU A;  1B6I A;  5KKH A;  1QS9 A;  246L A;  2O7A A;  103L A;  4PXF A;  1L24 A;  1L84 A;  3C7Z A;  3CAP A;  5H2I A;  1L55 A;  3S8G B;  1CV1 A;  3SB7 A;  3HTD A;  3NYA A;  1XJI A;  3PWH A;  240L A;  2OU8 A;  2Z73 A;  1D2W A;  2QPE B;  1CX6 A;  1KNI A;  3GUO A;  5G54 A;  3S3C B;  1P64 A;  2JAG A;  155L A;  1C6G A;  238L A;  2CUU A;  1G0M A;  1L91 A;  4W53 A;  2AT9 A;  4X32 A;  3QJV B;  1L47 A;  1C60 A;  143L A;  1L40 A;  3C8Q A;  183L A;  259L A;  4W56 A;  2LC9 A;  1L57 A;  1L08 A;  1L43 A;  1L31 A;  1KY1 A;  1DYF A;  249L A;  3RFM A;  2RB1 X;  1C6J A;  4I7T A;  5AWZ A;  253L A;  250L A;  2RB2 X;  1M0M A;  229L A;  1LN6 A;  4GP8 B;  3DMZ A;  170L A;  1C64 A;  210L A;  2RAY X;  4XT3 A;  257L A;  205L A;  3REY A;  1XME B;  5JJJ A;  139L A;  1L10 A;  1S8L A;  4DAJ A;  4G7S B;  1L62 A;  1C6B A;  2B6W A;  4MBS A;  4EKQ A;  1P7S A;  1SWZ A;  5DHG A;  104L A;  2RBR A;  141L A;  4ARP A;  164L A;  1G0G A;  3S8F B;  2Y01 A;  161L A;  247L A;  4G7Q B;  1X0S A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4WM3 A;  1R2N A;  1CKD A;  1KME A;  4NGY A;  126L A;  1C6C A;  3WUA A;  207L A;  1GF7 A;  4G4C A;  4G4B A;  1LI6 A;  2HEC A;  2FYD A;  5LVG A;  4G71 B;  162L A;  4LYC A;  1UIG A;  4W58 A;  4IB4 A;  1T6H A;  1JHL A;  2Z18 A;  4XT1 A;  2YCY A;  1AM7 A;  1LJG A;  4CFO A;  2ZIY A;  4LDO A;  3K3T A;  1L59 A;  1B0D A;  1LWG A;  2IFF Y;  1FKQ A;  1G1V A;  5A3E A;  1TEW A;  3A96 A;  1L15 A;  1GAY A;  4B1A A;  1L65 A;  1UUZ C;  4I7K A;  1X0K 1;  1WQO A;  5AHZ A;  1VGO A;  1LCN A;  4RW1 A;  1LZY A;  226L A;  5B1F A;  1REZ A;  6LYZ A;  5HLL A;  5KXR A;  1CV5 A;  1LZT A;  1QT3 A;  3FAD A;  3DKE X;  2O7A A;  2BQC A;  4PXF A;  1BHZ A;  1L84 A;  4HJZ A;  1JTO L;  2ZIK A;  3D9A C;  1HMK A;  3HTD A;  3NYA A;  1XJI A;  240L A;  3MGW A;  2OU8 A;  5FHW A;  1D2W A;  3GUO A;  2Z2E A;  155L A;  4X32 A;  238L A;  1G0M A;  3QJV B;  1L40 A;  4NHP A;  4HTK A;  259L A;  1D0K A;  1F0W A;  1L43 A;  1L31 A;  5I53 A;  249L A;  4DQ5 A;  1IR7 A;  2RB2 X;  229L A;  1M0M A;  1GFV A;  1RFP A;  1GAZ A;  1C64 A;  210L A;  4AGA A; 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 5AX0 A;  180L A;  2A4T A;  3HDF A;  1R84 A;  1L0J A;  4DWX A;  1LKS A;  3T45 A;  196L A;  2Y04 A;  1XEP A;  4I7R A;  4TUN A;  109L A;  6LYT A;  2G4P A;  159L A;  1BB4 A;  4UWV A;  1LZE A;  118L A;  4XAD A;  2Z37 A;  3ATO A;  1QDR A;  1YQV Y;  1L26 A;  4FBZ A;  1IOC A;  3A93 A;  2RSC A;  4GCF A;  1VAT A;  1JTP L;  1IWT A;  1RCM A;  1L85 A;  1CJ6 A;  4BS7 A;  2B73 A;  1HEP A;  5BR2 A;  3WYH A;  1IC4 Y;  1WQP A;  1B7P A;  1UIH A;  1LGW A;  147L A;  4I7N A;  3B0I A;  4N1C C;  1PQI A;  4BEY A;  1C6T A;  1JKA A;  4B4I A;  3EH5 B;  2YBJ A;  5A8E A;  224L A;  2F2N A;  2EI4 A;  3X3C A;  187L A;  1NMM A;  3HH6 A;  5IHG A;  3CSR A;  3M18 B;  223L A;  1LZ8 A;  2Z55 A;  1L04 A;  1QTK A;  5C6J A;  5DYS A;  192L A;  4N0J A;  1C45 A;  1L02 A;  4NSG A;  1L41 A;  198L A;  132L A;  5B05 A;  1CVK A;  5DL9 A;  1FBB A;  1REX A;  1L48 A;  2LZT A;  2B74 A;  3ATN A;  4BUO A;  1LLH A;  4HV2 A;  4UWN A;  1LZ6 A;  1KG8 A;  1OWZ A;  3WU7 A;  3WPJ A;  5LIN A;  1OWY A;  1C6Q A;  1QT4 A;  4E3U A;  1OYU A;  1IP7 A;  2F47 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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