3PBLA

Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with eticlopride
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
432
structure length
432
Chain Sequence
YALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASIWNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with a d2/d3 selective antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords D(3) dopamine receptor, Lysozyme chimera
total genus 163
structure length 432
sequence length 432
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pblA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pblA01
3UTWA 5B0WA 3C8QA 149LA 4EKSA 2OE4X 1L23A 5J7AA 254LA 3C82A 1QT4A 3VVKA 3QBLA 1L89A 174LA 1PQKA 245LA 2Z73A 1C6MA 1L03A 4GRVA 1P8IA 1UAZA 3GUKA 3GUJA 3HT6A 3HH3A 1DYEA 1LYFA 1TN5A 1L16A 1LWGA 5FJGA 5H2JA 3UZAA 4LDEA 2B7XA 3QJUB 2HULA 192LA 3HTGA 1L22A 2Q9EA 1LI6A 1C62A 3G3WA 262LA 2B74A 1L36A 1AT9A 2WJLA 3MBVA 1G0PA 2LZMA 2OE9X 1LGWA 1BRRA 1LYJA 1QUDA 5H2MA 1L45A 2WJKA 209LA 1XEPA 1VGOA 3L2XA 221LA 5B6ZA 4BEZA 4AMJA 1UCQA 232LA 181LA 1FBBA 2R4RA 1OVJA 3C81A 3UTVA 3CDOA 238LA 1M0MA 1C69A 2L78A 1L40A 1QS9A 3HAPA 1SSYA 224LA 4I7KA 1L90A 167LA 255LA 1CU6A 140LA 2RBSA 4XTNA 147LA 1LYDA 4X1HA 1P8HA 1KW7A 4MBSA 4I7NA 3UONA 1D3NA 1QTDA 1DYCA 3UG9A 3CDQA 4S0WA 3HANA 3SBBC 1L70A 1JTMA 1QUOA 1CU5A 260LA 1JQUA 1DZEA 1OV7A 2YCZA 3X3BA 2RBNA 1P37A 3ZPQA 1L79A 1L60A 1OVHA 2Y00A 169LA 3GULA 4YXCA 1XJIA 4KNFA 259LA 7LZMA 142LA 1LW9A 1S51A 225LA 3DMXA 2OU8A 4G70B 113LA 4G72B 216LA 253LA 1G0MA 1K28A 3LZMA 3OE8A 150LA 3G3VA 2PEDA 1CV1A 2O4WA 4IAQA 2B6XA 4MD2A 1QT5A 1L56A 1QTZA 1CV6A 4PK0A 1S53A 1IXFA 1JFPA 4I7MA 4W57A 1T8GA 3HH5A 3DDLA 1KGBA 1L84A 1C6CA 1L82A 3EMLA 2HUMA 170LA 1L54A 1G0LA 5B6YA 1GZMA 127LA 139LA 5B6VA 123LA 184LA 2RBPA 2L6XA 1L81A 1QM8A 3K2RA 1L32A 1BRXA 1P6YA 1WTHA 2RH1A 2Y02A 1L30A 2Y03A 3QAPA 3NY9A 4XT1A 5BR2A 237LA 1VJMA 1R84A 1C6IA 138LA 1SWZA 4WAVA 4YXAC 4FA7B 2RB2X 1L42A 3CDTA 5LZMA 2O7AA 4MQTA 3HARA 4XTOA 1L77A 2KS9A 3HDFA 3DNAA 3ABWA 1L63A 1SX7A 3VI0A 107LA 3HWLA 2F93A 3S3CB 1KNIA 3L64A 189LA 2RBOA 4ARLA 3DN8A 5G54A 2RB0X 4EPFA 2KSBA 3QBIA 2HPYA 206LA 1L08A 1C6NA 1QT3A 1LI2A 5AWZA 2YCXA 1L29A 1QS5A 1XMEB 1CV0A 103LA 3DKEX 1L48A 231LA 3C80A 1QT6A 2Y01A 2Z55A 3COCA 1LI3A 233LA 196LA 3VW7A 5B2NA 3REYA 3UTXA 2I35A 2ANVA 4ARJA 3S3DB 3SB8A 1LYIA 5H2OA 3S8GB 112LA 143LA 5B34A 188LA 1IW6A 5C1MA 4I7TA 4PJZA 3PBLA 3EH5B 1L38A 3HTDA 4W58A 2OU0X 1L9HA 4GP4B 1C66A 1C6FA 1G0QA 217LA 1H2SA 1L0JA 163LA 1OV5A 4I7SA 1IW9A 248LA 3GUNA 1L80A 173LA 1Q5IA 182LA 1CTWA 1C6LA 261LA 1L98A 102LA 243LA 2B6TA 3QAKA 2NTHA 4W51A 4XXJA 1D2WA 4EKRA 1QTVA 1KG8A 4XT3A 5H2LA 1LWKA 4XTLA 1L51A 234LA 1PQDA 4EJ4A 3C9MA 145LA 1L61A 3C9LA 1L04A 4ARQB 2YDOA 2A4TA 4HYJA 4BUOA 2JAFA 3FA0A 1F50A 5ITEA 3HU9A 2QPDB 2ZFEA 223LA 1LLHA 2I20A 156LA 1L28A 1C8RA 1L55A 3HASA 1PQIA 1C65A 3T45A 1LPYA 4EKQA 119LA 3C8RA 256LA 1JV6A 5F8UA 1PY6A 1QT8A 4GYCA 198LA 6LZMA 3DN3A 3BVDB 5A44A 1L31A 3HH4A 1L88A 1L24A 2B6ZA 3RZEA 4AQNA 1L71A 1P2RA 3C8SA 1ZURA 1CX6A 1L68A 1QTBA 3WQJA 4L35A 240LA 165LA 5DHGA 3UZCA 1L72A 220LA 1HZXA 3CDVA 214LA 3QBGA 120LA 1P7SA 4J4QA 5KKHA 1P64A 4EPIA 4EXMA 1DYAA 1L00A 1L66A 2M3GA 5JJNA 1L64A 1L74A 4ARMB 258LA 197LA 4QIDA 3SB7A 246LA 4IAPA 3AM6A 1CUQA 162LA 2ZIYA 2Z6BA 1CV3A 3OE6A 1L19A 3PXOA 4MQSA 1KW5A 2OEAX 3DN4A 1CU0A 186LA 3NYAA 1L35A 1OWZA 4MD1A 1QKPA 1C3WA 1X0K1 4W55A 3DMVA 1C60A 1L20A 4UG2A 5G2AA 3AYMA 175LA 4GP8B 1P2LA 104LA 1L52A 1LYEA 1KMEA 3OAXA 4UHRA 4JR8A 3A7KA 2I1XA 5AHZA 4LZMA 4ARPA 3C7YA 1G1VA 3P0GA 1L93A 1C6PA 3S3BB 3G3XA 1L0KA 3DQBA 166LA 1L26A 2Y04A 1L69A 4N4WA 1U19A 5JJEA 1KY0A 244LA 4I7PA 108LA 1L99A 4G71B 1LYGA 5G28A 4A4MA 5A8EA 4BWBA 4IB4A 4TL3A 235LA 4GBRB 2ZZLA 4KLYA 1G0KA 4ARQA 3S8FB 4W54A 1LGXA 2B72A 3DN6A 250LA 1OVKA 3X3CA 1L02A 3VG9A 2OTZX 4L6RA 1P56A 4X32A 4OV0A 1D9WA 2B6WA 5BR5A 1PQOA 1G06A 2Q9DA 1JV7A 1SWYA 1C61A 3JR6A 183LA 4OO9A 1OWYA 1CX7A 5H2PA 1CV5A 4W56A 1L39A 3QJSB 157LA 131LA 1O0AA 1TN0A 3EH3B 1LYHA 3OE9A 1DYGA 1L97A 1L46A 4NC3A 3SB5A 228LA 148LE 1C67A 4ARMA 2F32A 3GUMA 1C6GA 2EI4A 3EH4B 1L06A 3FADA 2YCWA 1CV4A 1L50A 5B35A 3AYNA 2CUUA 1P46A 1D3MA 4GPOA 1AP9A 5H2IA 2F47A 211LA 1KG9A 1L0MA 3ZPRA 1QSBA 1DYFA 1SSWA 1QHJA 1L10A 2LNLA 4BEYA 5G2CA 1L13A 1MGYA 4JQ6A 4JKVA 1KY1A 239LA 3D4SA 3NS0A 2KSAA 4QRYA 130LA 4W59A 3VGAA 1C6QA 1I6SA 4HYXA 1L07A 1L43A 161LA 1L85A 219LA 1TLAA 2RBRA 1L57A 218LA 1L92A 1L75A 2QARC 3HAOA 3PQRA 227LA 5I14A 1L33A 3QJQB 4FBZA 1L96A 4DJHA 1EHKB 3HAQA 212LA 3QDCA 3RFMA 4GBRA 1QTCA 152LA 4E97A 125LA 3F8VA 4AMIA 5AX1A 1PXRA 241LA 3ODUA 1QUHA 1H68A 2NTGA 1G07A 1L86A 185LA 4I7QA 199LA 1P8UA 226LA 1C6TA 190LA 5G2DA 1L01A 155LA 3DN1A 3GUOA 2LCBA 5G36A 4FPDA 1EPYA 4GP5B 3HUAA 172LA 3PDSA 111LA 1L91A 257LA 1BM1A 4I7JA 2B6YA 3HDEA 3UTYA 1C68A 1QSQA 1S54A 5DHHA 164LA 3CAPA 168LA 2B70A 4G7RB 1L37A 4W53A 1LGUA 114LA 5ETZA 1C8SA 2AT9A 4Y9HA 151LA 2JAGA 1L14A 229LA 3HT9A 4IARA 2VT4A 1KS3A 3KJ6A 5H2NA 2OE7X 171LA 1L15A 1C64A 5EN0A 1C6EA 2QPEB 4HWLA 1L65A 210LA 1Q5JA 1DYDA 4YX7C 4EA3A 5B6XA 3V2WA 110LA 1C6BA 3OE0A 3V2YA 129LA 159LA 1L41A 1XIOA 1CU2A 1QUGA 3SB6A 2J4YA 2YDVA 3CODA 5AX0A 1L27A 2QB0B 4W52A 3NSBA 160LA 1X0SA 1LN6A 4EIYA 4WW3A 2YCYA 249LA 1ZYTA 3CDRA 1C6JA 1G0JA 2O79A 1CWQA 1L83A 1L53A 1T8FA 4N4YB 178LA 5A45A 1L62A 1L17A 1P5CA 1JTNA 3SBAA 1L58A 3F9LA 187LA 1CU3A 1T97A 3QBKA 247LA 2HUKA 3QJVB 5H2HA 1E12A 3SB9A 2RAYX 2RBQA 1D3JA 1XJUA 3PWHA 1L11A 1L25A 4PXFA 230LA 3RUNA 128LA 4G7QB 3FI5A 1M0LA 141LA 1NHBA 3QJTB 2I21A 2IGCA 2KSYA 201LA 5AZDA 177LA 3HUKA 109LA 1SX2A 4I7RA 1ZWNA 251LA 3HT8A 1L67A 1XJTA 2F2QA 5H2KA 2BRDA 1QKOA 3VHZA 4LDLA 5AHYA 1C63A 1T6HA 4FAAB 1L95A 3QJRB 1L94A 3HT7A 3SN6R 2X72A 4BV0A 144LA 1L34A 1L76A 3HU8A 4I7LA 1L21A 1PXSA 236LA 1D2YA 3GUPA 3NY8A 4K5YA 5DYSA 215LA 3DMZA 3DN0A 3HUQA 4EKPA 158LA 3C7WA 1L73A 2NTWA 252LA 5G53A 4N6HA 1B6IA 205LA 176LA 1C6AA 3GUIA 3ZEVA 2ANXA 4G7SB 242LA 1G0GA 2F95A 1L59A 1JGJA 4DAJA 2G87A 5B6WA 1FBKA 2RAZX 1T8AA 2B75A 1P3NA 222LA 1D3FA 1QT7A 1CUPA 4QI1A 2NTUA 1C6KA 2LC9A 1L18A 5TGZA 1GU8A 1DYBA 1PQMA 1G1WA 4LDOA 1F4ZA 1S52A 1S8LA 122LA 1CVKA 3HH6A 4DKLA 1L05A 126LA 1OYUA 1F88A 1PQJA 1GUEA 3HTBA 5ITCA 1C6HA 4X31A 3C7ZA 4I7OA 200LA 3C83A 1BRDA 1L44A 118LA 1L49A 4PXKA 2RB1X 115LA 1C6DA 2B73A 3HTFA 5LWEA 1P36A 180LA 1L87A 4ZPUA 195LA 3DN2A 2OU9A 5JJJA 2R4SA 1QTHA 191LA 1X0I1 146LA 1L47A 4BVNA 213LA 1R2NA 137LA 2OTYX 1S8JA 1E0PA 1M0KA 1L12A 1L09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C8QA 5A3ZA 2OE4X 1L23A 4J1BA 1TDYA 5D5FA 254LA 3VVKA 3QBLA 1UIBA 174LA 1PQKA 245LA 1L03A 4TSBA 1F10A 2BQFA 3BKHA 1DPXA 1B0DA 1LYFA 1GBOA 1L16A 4LDEA 3A3QA 4LT3A 3HTGA 1HSXA 1LTMA 1G7IC 1C62A 2B74A 4ZEEA 3MBVA 1LYJA 1QUDA 209LA 1XEPA 1CJ6A 4ML7A 2R4RA 3UTVA 1SLYA 1HHLA 3C81A 1GAYA 1UBZA 2DQHY 2BQBA 3RT5X 2MEFA 1QS9A 3TXKA 5LIOA 5HNCA 255LA 1CU6A 4QGZA 140LA 4XTNA 147LA 4X1HA 1KW7A 4I7NA 3WW6A 1QTDA 4NHPA 3CDQA 3HANA 1L70A 5I5QA 1OV7A 1LOZA 2RBNA 1P37A 1L79A 1OVHA 3GULA 1MELL 4YXCA 5HMVA 1NF5A 1LYZA 4NGJA 3A8ZA 1XGQC 1K28A 2PEDA 150LA 4ETCA 1QT5A 1XGRC 1CV6A 4PK0A 5IHGA 1IXFA 1T8GA 3DDLA 2ZYCA 5C6IA 1L84A 4NSHA 4LYOA 170LA 1FN5A 4TWSA 2H9JA 1G0LA 1UIGA 2DKVA 5B6YA 2Z37A 184LA 4Z46A 1P6YA 2RH1A 4XT1A 1ALCA 1L30A 2Y03A 134LA 5DN4A 1SWZA 3FE0A 3LYMA 5KXYA 2HU3A 4HP0A 1L42A 1LHMA 2O7AA 4RW1A 5APFA 2KS9A 3DNAA 1IOSA 5LVKA 3LZ2A 1KNIA 3L64A 1B5XA 5G54A 2RB0X 1GF3A 1QT3A 2XQOA 4LYMA 3DKEX 1LYYA 3TXDA 1L48A 231LA 2BQJA 3C80A 4KXIA 3COCA 4GLVA 3VW7A 4HV2A 2ANVA 3S3DB 4H91A 3W3EA 3M3UA 3PBLA 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 141L A;  1NHB A;  3QJT B;  2I21 A;  2IGC A;  2KSY A;  201L A;  5AZD A;  177L A;  3HUK A;  109L A;  1SX2 A;  4I7R A;  1ZWN A;  251L A;  3HT8 A;  1L67 A;  1XJT A;  2F2Q A;  5H2K A;  2BRD A;  1QKO A;  3VHZ A;  4LDL A;  5AHY A;  1C63 A;  1T6H A;  4FAA B;  1L95 A;  3QJR B;  1L94 A;  3HT7 A;  3SN6 R;  2X72 A;  4BV0 A;  144L A;  1L34 A;  1L76 A;  3HU8 A;  4I7L A;  1L21 A;  1PXS A;  236L A;  1D2Y A;  3GUP A;  3NY8 A;  4K5Y A;  5DYS A;  215L A;  3DMZ A;  3DN0 A;  3HUQ A;  4EKP A;  158L A;  3C7W A;  1L73 A;  2NTW A;  252L A;  5G53 A;  4N6H A;  1B6I A;  205L A;  176L A;  1C6A A;  3GUI A;  3ZEV A;  2ANX A;  4G7S B;  242L A;  1G0G A;  2F95 A;  1L59 A;  1JGJ A;  4DAJ A;  2G87 A;  5B6W A;  1FBK A;  2RAZ X;  1T8A A;  2B75 A;  1P3N A;  222L A;  1D3F A;  1QT7 A;  1CUP A;  4QI1 A;  2NTU A;  1C6K A;  2LC9 A;  1L18 A;  5TGZ A;  1GU8 A;  1DYB A;  1PQM A;  1G1W A;  4LDO A;  1F4Z A;  1S52 A;  1S8L A;  122L A;  1CVK A;  3HH6 A;  4DKL A;  1L05 A;  126L A;  1OYU A;  1F88 A;  1PQJ A;  1GUE A;  3HTB A;  5ITC A;  1C6H A;  4X31 A;  3C7Z A;  4I7O A;  200L A;  3C83 A;  1BRD A;  1L44 A;  118L A;  1L49 A;  4PXK A;  2RB1 X;  115L A;  1C6D A;  2B73 A;  3HTF A;  5LWE A;  1P36 A;  180L A;  1L87 A;  4ZPU A;  195L A;  3DN2 A;  2OU9 A;  5JJJ A;  2R4S A;  1QTH A;  191L A;  1X0I 1;  146L A;  1L47 A;  4BVN A;  213L A;  1R2N A;  137L A;  2OTY X;  1S8J A;  1E0P A;  1M0K A;  1L12 A;  1L09 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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