3PBLA

Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with eticlopride
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
432
structure length
432
Chain Sequence
YALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASIWNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with a d2/d3 selective antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords D(3) dopamine receptor, Lysozyme chimera
total genus 163
structure length 432
sequence length 432
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pblA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pblA01
1Q5JA 1D9WA 247LA 4GP5B 4YXAC 2QARC 1LYEA 2B7XA 3NYAA 1QTBA 259LA 3EMLA 1TN0A 4KLYA 211LA 1L52A 1C6CA 1L99A 3HTDA 5B2NA 5G36A 1C6BA 3CDRA 4LDLA 5H2OA 1GU8A 4UHRA 148LE 1L06A 2I1XA 4AQNA 3PQRA 243LA 1L97A 1C6QA 2O79A 168LA 1G0PA 2YCXA 3HUAA 3C7ZA 1JTMA 3DN8A 1L96A 1T97A 2OU8A 4FAAB 4YXCA 3HUQA 251LA 1KY0A 162LA 1WTHA 4G70B 3HAPA 1DYFA 3UZCA 1G0QA 244LA 1LYGA 3UTVA 1T8AA 3CDVA 3QBIA 173LA 3GUPA 1C6EA 1LYDA 4MQSA 3F8VA 1AP9A 4QI1A 1ZWNA 1L49A 3DN0A 1LGUA 4LDOA 226LA 4W58A 1BRRA 1DZEA 2KSBA 2Y04A 3AYNA 237LA 176LA 3COCA 3DN4A 5H2MA 1L32A 174LA 5B6YA 3DMVA 3T45A 4EIYA 2B6TA 3HDFA 1S52A 1ZYTA 1XEPA 4GP8B 167LA 1L47A 178LA 1VGOA 3AYMA 3QJSB 1L0MA 1KY1A 5ITCA 2ANXA 1L61A 3GUNA 5FJGA 1G1VA 1LYIA 2Y01A 4DKLA 1CV5A 2YCYA 1CV1A 1D3FA 2ZFEA 4IAPA 3S8FB 4WAVA 118LA 3SBBC 2OE9X 3C83A 3SBAA 1L94A 1R2NA 158LA 1PQMA 2RBRA 192LA 3S3CB 3QJUB 1QTCA 3EH4B 1L79A 3C7YA 1L19A 3DN2A 189LA 4K5YA 156LA 1G0GA 1C68A 1QUGA 205LA 1L89A 225LA 3D4SA 4I7JA 2NTUA 152LA 5G28A 2O7AA 2RBOA 3HU9A 1KG9A 4EJ4A 3C7WA 3GUMA 2B6WA 2PEDA 212LA 1E12A 3ZPRA 5B35A 1C6GA 1QS5A 157LA 108LA 2OE4X 5BR5A 1L20A 4YX7C 1CU0A 4ARJA 3QAKA 3SB5A 1XJIA 4LZMA 2Z55A 4ARMA 3FI5A 4JR8A 1L03A 1L50A 1L45A 1AT9A 5A45A 2RAYX 4G71B 1PQJA 4I7OA 5H2IA 5TGZA 3P0GA 4G7QB 3RZEA 4FBZA 1L39A 4GBRA 1C65A 119LA 1L28A 2OE7X 4PXFA 1SWZA 4LDEA 2JAFA 1QT7A 3SB8A 4ARQB 5H2JA 5F8UA 1LN6A 233LA 1C6DA 1L64A 4EA3A 4X31A 234LA 2RB1X 1LYHA 2RB0X 1M0KA 1C3WA 4IARA 125LA 1L75A 2WJKA 5AHZA 1DYEA 145LA 3X3BA 1L56A 3SN6R 1OWYA 4BWBA 1L76A 2WJLA 4IB4A 1P5CA 4N6HA 230LA 3HAQA 1L40A 1L98A 1L22A 1L69A 3HH4A 4ARPA 4HWLA 2Z73A 103LA 1H2SA 3DN6A 1L38A 1L90A 5LWEA 195LA 1S54A 2RBNA 1QUHA 3PBLA 3ZEVA 241LA 1OVHA 122LA 140LA 1SSWA 1P37A 4GRVA 2ZIYA 1LLHA 3AM6A 1QTZA 221LA 1L04A 2B6ZA 1R84A 1L36A 3RFMA 1NHBA 4W54A 222LA 1P8HA 1CU2A 112LA 1TLAA 3G3XA 1M0MA 232LA 1G0MA 1L86A 1L73A 1L66A 3F9LA 4J4QA 5J7AA 1CV3A 1P8UA 253LA 3HTFA 102LA 4IAQA 4EPFA 1QTVA 3S3DB 206LA 129LA 1U19A 2OTYX 1CTWA 3S3BB 3VW7A 1IW6A 2ZZLA 4Y9HA 210LA 1C62A 216LA 4I7SA 2Y00A 4BV0A 4MQTA 4W52A 1L34A 3QBGA 201LA 1KMEA 4AMIA 4FA7B 2HULA 3CDOA 1C66A 2ANVA 3OE9A 1L93A 5H2LA 3DN1A 1L77A 2I20A 1QUOA 3GUOA 3OE8A 1L07A 3VHZA 2Q9DA 1T6HA 1L42A 1L9HA 2F2QA 3CDTA 1L21A 1CUQA 1K28A 2OTZX 2F32A 2X72A 166LA 2LCBA 3L2XA 2QB0B 186LA 2BRDA 1L11A 1L17A 4G7RB 3CODA 1OVJA 5G54A 1P64A 4W56A 3NSBA 4UG2A 3QAPA 1L62A 1P2LA 1QTHA 2OEAX 3QJTB 4BUOA 191LA 182LA 1QSBA 1QT4A 3KJ6A 1G06A 242LA 197LA 2G87A 1L48A 2EI4A 1QT8A 3PXOA 1KG8A 1L84A 1BRDA 2RBPA 198LA 1CV0A 1QS9A 1L13A 217LA 1L80A 5AZDA 5B6VA 1C61A 1SWYA 2QPEB 4W57A 7LZMA 1L71A 3EH3B 4JKVA 5G2CA 1CWQA 4BEYA 1KNIA 1L01A 1L27A 1PQDA 4W59A 4DAJA 3DMZA 4KNFA 231LA 5B6WA 3HT9A 1L09A 4PK0A 1DYAA 1LYJA 3ODUA 5B6ZA 1L59A 3PDSA 2O4WA 1FBKA 1L46A 3HT8A 4X32A 2I35A 160LA 1DYGA 2RBSA 5ETZA 3QJQB 4EKPA 5JJJA 3NS0A 2RBQA 1L00A 1L83A 1LYFA 139LA 3NY9A 5EN0A 165LA 1C60A 5ITEA 4HYXA 5A8EA 1QSQA 1L10A 146LA 1C6HA 1L95A 1ZURA 4JQ6A 4N4WA 4BVNA 1CUPA 3HWLA 1P3NA 1GUEA 4I7TA 155LA 4E97A 3VI0A 187LA 228LA 109LA 223LA 1EPYA 1BM1A 1X0I1 4ARMB 1Q5IA 4W53A 4X1HA 1EHKB 1C63A 2CUUA 1JGJA 5G53A 171LA 262LA 1C6FA 1XIOA 142LA 1D3JA 1T8FA 1L15A 1CX6A 4PXKA 1UCQA 1TN5A 1C8RA 215LA 3SB7A 1QUDA 4HYJA 4MD1A 4L6RA 3CDQA 1L67A 1L05A 4GBRB 1T8GA 1QT5A 1CX7A 2Z6BA 3C81A 1CVKA 2F47A 3V2WA 1DYDA 4EKQA 2M3GA 4TL3A 1H68A 4OV0A 200LA 1FBBA 5DHGA 138LA 2F95A 1OWZA 5G2DA 1C67A 5JJNA 2L78A 141LA 1L14A 3HH6A 115LA 1G0KA 1L55A 1JTNA 4I7NA 3QBKA 3JR6A 1HZXA 1L85A 143LA 4GPOA 177LA 227LA 3RUNA 1F50A 5AX0A 1PXRA 2B75A 3OAXA 3UTYA 1OV7A 3V2YA 4S0WA 1LI6A 2B70A 3HT7A 254LA 3HT6A 1D2WA 1JQUA 2J4YA 1C6LA 123LA 1QHJA 1MGYA 2I21A 2B72A 3HU8A 3C9MA 3HDEA 131LA 1P2RA 183LA 218LA 3GUIA 1C6JA 5H2PA 3UTWA 2R4RA 1L33A 3UONA 3A7KA 3DMXA 190LA 1L65A 4MBSA 3NY8A 1L16A 2OU9A 196LA 104LA 1DYCA 1L41A 1OVKA 1PQKA 1UAZA 1C69A 4EKSA 184LA 126LA 224LA 3VGAA 4GYCA 4XT3A 2L6XA 5B0WA 1L60A 3HTBA 1VJMA 4XTNA 1L58A 3C82A 114LA 150LA 1L63A 113LA 1X0K1 4I7LA 4WW3A 163LA 1PXSA 2OU0X 1S8LA 5B6XA 1L87A 258LA 2B6YA 213LA 1C8SA 5DYSA 3EH5B 255LA 4XXJA 1KGBA 1LGWA 1P56A 248LA 3G3WA 1L88A 130LA 1SX2A 3HUKA 180LA 5A44A 1KW7A 3DNAA 1L54A 2Y02A 4AMJA 1LI3A 238LA 3C8RA 1L08A 4EXMA 1QTDA 1B6IA 3LZMA 4ZPUA 5I14A 250LA 1S8JA 1CV6A 1L31A 2IGCA 159LA 110LA 1KW5A 120LA 1GZMA 235LA 2RB2X 1JV7A 2YDOA 4A4MA 4BEZA 261LA 1L68A 2YCZA 1G0JA 1G1WA 3SB6A 1XJUA 2KSYA 1C6NA 1QT6A 4NC3A 2RH1A 1QKPA 3QJRB 3C9LA 209LA 2KS9A 1D3NA 1L30A 188LA 1C6TA 256LA 1L25A 2YCWA 172LA 1CU3A 1M0LA 2NTWA 2HUKA 5H2NA 4XTLA 3QBLA 3ZPQA 4G7SB 1L92A 1L12A 1LWKA 229LA 2B74A 249LA 2NTHA 5KKHA 5H2KA 3HAOA 1C6KA 2A4TA 5B34A 1P6YA 1G0LA 5JJEA 128LA 2AT9A 1L0KA 1L35A 3GUJA 137LA 4W51A 1IXFA 1L18A 3GULA 3OE0A 4DJHA 4I7PA 4L35A 3C8SA 1SSYA 1L43A 1CV4A 3PWHA 4OO9A 4ARLA 1QT3A 5G2AA 5C1MA 239LA 236LA 1S51A 2HUMA 5H2HA 3SB9A 3HH3A 4EPIA 1L57A 1JV6A 127LA 1L0JA 5LZMA 1LGXA 169LA 185LA 3G3VA 1LI2A 4FPDA 2B6XA 1L02A 1BRXA 2LC9A 1S53A 5BR2A 2RAZX 3QDCA 1QKOA 3WQJA 3VG9A 1L29A 260LA 246LA 1L82A 2LNLA 1F4ZA 3GUKA 1JFPA 1C64A 4N4YB 1G07A 1IW9A 3DDLA 181LA 2F93A 4QRYA 1O0AA 4I7KA 2YDVA 1LPYA 199LA 2NTGA 1CU5A 1OV5A 1L74A 2R4SA 2VT4A 4ARQA 2KSAA 175LA 1D3MA 2Y03A 161LA 214LA 147LA 3C8QA 4W55A 4PJZA 1L26A 1OYUA 149LA 4I7QA 1SX7A 3UZAA 151LA 1L37A 4XTOA 3C80A 3HH5A 4GP4B 3S8GB 1X0SA 1PY6A 5AX1A 3QJVB 3HANA 164LA 220LA 4I7MA 5DHHA 1XMEB 219LA 1L70A 1C6AA 4EKRA 3DKEX 1L51A 1P7SA 2HPYA 3BVDB 3MBVA 144LA 4MD2A 3OE6A 111LA 1KS3A 3X3CA 1L81A 3DN3A 1L91A 1P8IA 3K2RA 1C6IA 3CAPA 4QIDA 5AWZA 3DQBA 2Q9EA 1D2YA 1C6MA 3REYA 1L24A 3FA0A 1QM8A 1PQOA 3HARA 2B73A 3ABWA 170LA 1L72A 1L23A 1C6PA 1DYBA 1I6SA 245LA 252LA 1LWGA 1L44A 3HASA 240LA 3HTGA 3UG9A 2JAGA 3FADA 1XJTA 3UTXA 4XT1A 1PQIA 2LZMA 2QPDB 4G72B 6LZMA 1P46A 1LW9A 3VVKA 257LA 1P36A 1L53A 107LA 1F88A 1E0PA 3L64A 5AHYA 4I7RA 1CU6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DPWA 1D9WA 3LYTA 1LJIA 4DDBA 4QEQA 2ZILA 259LA 4XN6A 3EMLA 3IWRA 2FBBA 1E8LA 1GU8A 4UHRA 5APDA 5HQ1A 3PQRA 3FE0A 3EXDA 1C6QA 1BHZA 168LA 3HUQA 2D6BA 1KY0A 3HAPA 1B5VA 244LA 1LYGA 2WARA 3CDVA 3QBIA 4DQJA 4MQSA 1IC5Y 1F6SA 1GDWA 1L49A 1BWHA 1LGUA 226LA 1DZEA 5EBHA 3TMXA 3AYNA 3COCA 4OOOA 5H2MA 2ZNXY 3T45A 1S52A 3AYMA 1YAMA 5ITCA 4KT3A 9LYZA 5FJGA 5IHGA 1XEJA 1UUZC 1GBZA 4LT2A 3F6ZA 1V7TA 4IAPA 1YAQA 1IC4Y 3C83A 4NGYA 4GCEA 1PQMA 3QJUB 3EH4B 1GFUA 1L19A 156LA 3G3BB 205LA 1L89A 3K3TA 4Z41A 2DQCY 2RBOA 4EJ4A 3A6CY 3C7WA 2HEBA 1NMMA 212LA 1AZFA 1E12A 3ZPRA 1IWXA 1WQOA 1L20A 4HSFA 4ARJA 1XJIA 4LZMA 4QDNA 1LSNA 5LXWA 3FI5A 1HHLA 5LVKA 3LYMA 1AT9A 4R0FA 2RAYX 3AZ7A 1GBYA 1LZDA 1GEZA 1UBZA 2Z37A 3RZEA 4G7QB 1DQJC 4J1BA 1RE2A 1EQEA 3SB8A 1GF9A 1JTPL 3TMVA 1B7MA 2DQEY 3W6EA 1L75A 3FI7A 1UICA 5C6JA 2YBNA 1JKDA 1L76A 4WLYA 2WJLA 3CSZA 1GE3A 1L69A 1H2SA 5DLAA 4CFPA 5L3IA 1H87A 1QUHA 2BLYA 2YBJA 1IR8A 122LA 4GRVA 1P37A 2LZ2A 1LLHA 221LA 1R84A 1L36A 3RFMA 4QGZA 1JJ3A 1JJ0A 4NGZA 5J7AA 1NBYC 253LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1LGX A;  169L A;  185L A;  3G3V A;  1LI2 A;  4FPD A;  2B6X A;  1L02 A;  1BRX A;  2LC9 A;  1S53 A;  5BR2 A;  2RAZ X;  3QDC A;  1QKO A;  3WQJ A;  3VG9 A;  1L29 A;  260L A;  246L A;  1L82 A;  2LNL A;  1F4Z A;  3GUK A;  1JFP A;  1C64 A;  4N4Y B;  1G07 A;  1IW9 A;  3DDL A;  181L A;  2F93 A;  4QRY A;  1O0A A;  4I7K A;  2YDV A;  1LPY A;  199L A;  2NTG A;  1CU5 A;  1OV5 A;  1L74 A;  2R4S A;  2VT4 A;  4ARQ A;  2KSA A;  175L A;  1D3M A;  2Y03 A;  161L A;  214L A;  147L A;  3C8Q A;  4W55 A;  4PJZ A;  1L26 A;  1OYU A;  149L A;  4I7Q A;  1SX7 A;  3UZA A;  151L A;  1L37 A;  4XTO A;  3C80 A;  3HH5 A;  4GP4 B;  3S8G B;  1X0S A;  1PY6 A;  5AX1 A;  3QJV B;  3HAN A;  164L A;  220L A;  4I7M A;  5DHH A;  1XME B;  219L A;  1L70 A;  1C6A A;  4EKR A;  3DKE X;  1L51 A;  1P7S A;  2HPY A;  3BVD B;  3MBV A;  144L A;  4MD2 A;  3OE6 A;  111L A;  1KS3 A;  3X3C A;  1L81 A;  3DN3 A;  1L91 A;  1P8I A;  3K2R A;  1C6I A;  3CAP A;  4QID A;  5AWZ A;  3DQB A;  2Q9E A;  1D2Y A;  1C6M A;  3REY A;  1L24 A;  3FA0 A;  1QM8 A;  1PQO A;  3HAR A;  2B73 A;  3ABW A;  170L A;  1L72 A;  1L23 A;  1C6P A;  1DYB A;  1I6S A;  245L A;  252L A;  1LWG A;  1L44 A;  3HAS A;  240L A;  3HTG A;  3UG9 A;  2JAG A;  3FAD A;  1XJT A;  3UTX A;  4XT1 A;  1PQI A;  2LZM A;  2QPD B;  4G72 B;  6LZM A;  1P46 A;  1LW9 A;  3VVK A;  257L A;  1P36 A;  1L53 A;  107L A;  1F88 A;  1E0P A;  3L64 A;  5AHY A;  4I7R A;  1CU6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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