3PBLA

Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with eticlopride
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
432
structure length
432
Chain Sequence
YALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASIWNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with a d2/d3 selective antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords D(3) dopamine receptor, Lysozyme chimera
total genus 163
structure length 432
sequence length 432
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pblA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pblA01
4QRYA 3G3WA 1D2WA 1L42A 1QUDA 1C6GA 4PXFA 215LA 1C6MA 3D4SA 3SBAA 1IW9A 3HAQA 2B6WA 3LZMA 3QJTB 130LA 5ITEA 1C6HA 1E0PA 4FA7B 1BRDA 1P8HA 4G72B 1L54A 2ANXA 2RB2X 1L00A 4TL3A 1L48A 1L39A 1L82A 5H2HA 1CUQA 261LA 2AT9A 1PXRA 3QJRB 3HTFA 4EXMA 4L35A 4K5YA 1CTWA 2QPDB 5G2DA 1C6JA 1KY1A 4EA3A 4W52A 252LA 1LYEA 1G0MA 1L10A 2OTZX 1ZURA 2O79A 1L05A 1C6QA 1L37A 221LA 3GUJA 240LA 2ZZLA 1X0SA 3AYMA 2Z6BA 3JR6A 1KG8A 3QBIA 4BEYA 178LA 1C6IA 1L09A 1L18A 4G7SB 1L31A 2B72A 2F2QA 1L24A 2QB0B 2KSYA 1L93A 5ETZA 1CV4A 1QTVA 249LA 1LWKA 239LA 1C8RA 4ARMB 1KG9A 1S52A 3CAPA 4XT3A 182LA 3HAOA 5EN0A 1L46A 4I7OA 168LA 4KLYA 143LA 3HH4A 4LZMA 1ZWNA 4GP5B 3L2XA 1KW5A 1S8LA 227LA 2YCXA 3C9MA 1C6EA 5B0WA 1CU5A 212LA 5A8EA 4HWLA 5G54A 1XMEB 1C6LA 1QHJA 1D3MA 3CODA 118LA 4DAJA 4XTOA 3HT7A 4JQ6A 4EKPA 1PQKA 1L27A 4DKLA 201LA 1QUGA 5JJNA 1EHKB 3QJQB 4WAVA 1KW7A 251LA 3VHZA 2NTUA 4LDLA 1L9HA 5G2CA 196LA 1L77A 4X32A 3EMLA 4S0WA 1XJTA 4MD2A 3UONA 1M0KA 5J7AA 5B6WA 4W59A 1D2YA 4X31A 1SWZA 5G28A 3S3DB 3HT6A 1DYEA 1L95A 1L22A 3HT9A 2F47A 5A44A 2QARC 1X0I1 1IW6A 3MBVA 1KGBA 1T6HA 4XT1A 1L47A 2RB1X 1PY6A 2OE4X 186LA 1OWYA 3DMZA 1D3NA 3CDRA 195LA 256LA 224LA 1UAZA 4FBZA 4XTNA 4LDOA 1E12A 3OE9A 185LA 1QT7A 4W55A 4WW3A 1L80A 5B34A 3HU9A 1DYAA 1EPYA 3UTYA 1TN5A 1L90A 4MQTA 4MQSA 241LA 188LA 3DKEX 5AHYA 4EPFA 1L26A 1TN0A 1G0GA 4QIDA 177LA 220LA 2YCWA 1L29A 1L88A 1L68A 1L04A 3QAKA 4GPOA 1C6PA 2B6TA 1R84A 120LA 1QTHA 1P8UA 3ZPRA 5I14A 1LLHA 1C67A 1G1WA 1L85A 1CUPA 1C3WA 4BUOA 115LA 5H2KA 3VI0A 1AP9A 3DMXA 5C1MA 4FAAB 2YCYA 1C6NA 226LA 4HYXA 1SX7A 2B6XA 4N4YB 1C61A 1G0LA 1L20A 4MD1A 1B6IA 3C8QA 108LA 1SX2A 5DYSA 1L01A 1L23A 1OVHA 5F8UA 4W54A 187LA 190LA 5AZDA 258LA 209LA 1FBBA 5AWZA 1L38A 1CU0A 213LA 4YXAC 3DQBA 4KNFA 3PBLA 5DHHA 174LA 1CV1A 1L45A 3HWLA 4JKVA 1L62A 1C6TA 223LA 2B74A 3SBBC 2HPYA 3HASA 2PEDA 157LA 2O7AA 4ARPA 2Y04A 3NY8A 2I1XA 222LA 1VGOA 4AQNA 1L60A 3COCA 4I7PA 1NHBA 1D3FA 1LGUA 1P46A 1XIOA 3NS0A 1L34A 131LA 1G1VA 3HH6A 1L73A 3VVKA 148LE 244LA 1LYFA 2OU8A 1M0MA 4EKQA 4GBRB 1LYJA 3GUPA 3G3VA 1L84A 3S8FB 3UTWA 1OV5A 4PJZA 4EKRA 189LA 1T97A 172LA 3X3CA 2G87A 2RAYX 1QKOA 5A45A 1C63A 205LA 2I20A 1G07A 3SB9A 126LA 1L66A 3HDFA 2KSAA 230LA 3SB5A 3AYNA 4UG2A 5BR5A 1F4ZA 3RZEA 3V2YA 1C6FA 1QM8A 151LA 225LA 1DYDA 170LA 4I7QA 2I21A 1QUOA 1R2NA 141LA 1SWYA 2WJKA 110LA 125LA 3FI5A 1P64A 3GUOA 4ZPUA 2RBOA 1LGXA 1JTMA 3ZPQA 1C69A 1LGWA 3V2WA 3GULA 158LA 1OVKA 228LA 2X72A 1L92A 1H2SA 1GU8A 1MGYA 4BWBA 1C6KA 3P0GA 4GP8B 1L30A 1LYDA 1L57A 113LA 1L51A 1DZEA 173LA 3DN8A 3HANA 216LA 2LZMA 5H2NA 3VG9A 1JQUA 169LA 3CDOA 3REYA 2Q9DA 1L58A 1OVJA 2RB0X 5H2JA 3RFMA 1X0K1 102LA 2O4WA 1SSWA 4J4QA 4OO9A 1GUEA 4W56A 1U19A 237LA 1QS9A 1C64A 3T45A 1I6SA 1L0JA 3AM6A 2HUKA 3GUMA 5G53A 175LA 2M3GA 122LA 5B6VA 1QS5A 104LA 1L74A 6LZMA 152LA 146LA 1L76A 1L83A 3HDEA 4GBRA 5G36A 3CDTA 4PXKA 1CV5A 2IGCA 5ITCA 1M0LA 4YX7C 1C8SA 255LA 1KNIA 4UHRA 3QJUB 235LA 260LA 5JJJA 3HT8A 3X3BA 3QBKA 1LN6A 214LA 1L02A 1WTHA 234LA 257LA 3DN0A 1IXFA 1HZXA 3OE8A 3FA0A 4IARA 1AT9A 167LA 1S51A 2R4RA 159LA 1LYHA 107LA 1L96A 1P7SA 1L67A 2B6ZA 2HULA 171LA 1LYIA 2A4TA 2OE7X 232LA 1L32A 1GZMA 3PQRA 1C62A 138LA 1P2LA 1CV0A 3C8SA 1O0AA 1LI3A 1P8IA 4W53A 238LA 1L91A 1L44A 1XJUA 4I7SA 4EKSA 4IB4A 3PXOA 3EH4B 1L43A 5B6XA 109LA 1P36A 1ZYTA 2F93A 1DYFA 3C9LA 1L11A 4PK0A 1JTNA 1T8FA 3CDQA 4ARLA 1Q5IA 3EH5B 1L36A 1LPYA 2Q9EA 1L35A 1CU6A 4I7RA 3HUQA 123LA 2L78A 2Y00A 128LA 1CV6A 5B35A 5LZMA 4G70B 1TLAA 1JGJA 1PXSA 2R4SA 2YCZA 3QJSB 3C7WA 199LA 1D9WA 3PDSA 5H2IA 1QUHA 3NY9A 1G06A 2I35A 3SB8A 4XTLA 2HUMA 1L79A 1CWQA 1L75A 5H2OA 1L19A 3GUIA 163LA 4G7QB 1L40A 2OEAX 4I7NA 3HTBA 3ABWA 3QBGA 4AMJA 5H2LA 1DYCA 2Z73A 3QJVB 140LA 1L08A 3HH5A 2B70A 3C7YA 2L6XA 149LA 164LA 1CU3A 1L21A 3PWHA 4QI1A 3C82A 2OTYX 5B6YA 3HUAA 3CDVA 144LA 3F9LA 2RBQA 2KSBA 4NC3A 1C6CA 3C83A 181LA 5B2NA 211LA 4W51A 4IAQA 4XXJA 2YDOA 1P5CA 2CUUA 1L15A 2RH1A 2BRDA 1C65A 1G0JA 2Y03A 1L49A 1JV7A 147LA 231LA 1BRRA 3UG9A 1KY0A 3OE0A 1G0KA 3S3BB 1L69A 1CU2A 2B75A 5H2MA 184LA 2ZFEA 4JR8A 3OAXA 3DMVA 3DN4A 200LA 5FJGA 4N6HA 192LA 2YDVA 3NSBA 1QT6A 1L61A 3UTXA 145LA 3OE6A 4DJHA 4BEZA 1UCQA 4EPIA 3SB6A 5H2PA 259LA 1DYGA 1XJIA 4BVNA 2RBRA 2QPEB 2B7XA 1L03A 1K28A 4I7LA 1BM1A 1P37A 2ANVA 2Y01A 3DDLA 3QBLA 243LA 3DN2A 4W58A 5B6ZA 2JAFA 4L6RA 4X1HA 3DN3A 242LA 1QTZA 2KS9A 1G0PA 2EI4A 5JJEA 248LA 3SB7A 1S8JA 3HTGA 1QSBA 198LA 3BVDB 3KJ6A 165LA 162LA 3VW7A 4IAPA 1JV6A 245LA 4ARQA 139LA 3HH3A 246LA 2ZIYA 210LA 1PQIA 2B6YA 4A4MA 254LA 1QSQA 2F32A 3SN6R 5TGZA 1L25A 1QTDA 1CX7A 3DNAA 1PQMA 3HTDA 219LA 1VJMA 5G2AA 1F50A 1L06A 3C80A 2LNLA 1P56A 4HYJA 3QDCA 1PQJA 183LA 2F95A 161LA 3DN6A 4OV0A 1LWGA 3HAPA 112LA 1OWZA 1C6DA 3GUKA 3HU8A 3F8VA 119LA 3L64A 4I7KA 1L50A 3NYAA 1XEPA 1QKPA 1CX6A 1L70A 1CV3A 1L12A 1F88A 129LA 2OE9X 1C6AA 3VGAA 2RBPA 4G7RB 160LA 3G3XA 1H68A 1L65A 1S54A 206LA 4LDEA 3HARA 1QT3A 1SSYA 1L13A 253LA 155LA 3FADA 1L33A 2OU9A 1L16A 1L81A 2OU0X 2NTHA 5AHZA 1JFPA 4MBSA 2LCBA 3ZEVA 229LA 1L94A 1S53A 150LA 1KMEA 1L28A 1L71A 2NTWA 3DN1A 103LA 1T8AA 4I7TA 197LA 5DHGA 236LA 3C7ZA 217LA 4YXCA 1L97A 1T8GA 4EJ4A 4GYCA 137LA 3WQJA 1C66A 1L98A 1L17A 1OYUA 1C6BA 3EH3B 1L87A 4Y9HA 5LWEA 1OV7A 5AX0A 1LI6A 1PQDA 1L0KA 262LA 127LA 4I7JA 4W57A 7LZMA 1L0MA 4AMIA 1QT8A 3A7KA 1G0QA 1L53A 1C68A 1L41A 1L89A 1LYGA 166LA 114LA 250LA 2RBSA 2RBNA 1L55A 4ARMA 180LA 2Z55A 3GUNA 5KKHA 1P3NA 1L72A 3UZCA 2VT4A 5BR2A 1CVKA 142LA 3QAPA 1QT4A 3S8GB 1FBKA 4FPDA 1Q5JA 4GP4B 1L07A 2Y02A 3UZAA 1KS3A 1C60A 4ARQB 2B73A 2RAZX 1LW9A 1QT5A 4EIYA 3HUKA 1L52A 3ODUA 4I7MA 218LA 4ARJA 1L86A 1P2RA 176LA 1DYBA 1L99A 191LA 3C81A 1L64A 233LA 2LC9A 3K2RA 4E97A 4BV0A 5AX1A 3UTVA 3RUNA 3C8RA 156LA 4GRVA 1L59A 2NTGA 2J4YA 4N4WA 1L63A 247LA 1LI2A 1P6YA 2JAGA 2WJLA 1D3JA 111LA 1PQOA 1QTCA 1QTBA 1BRXA 1L14A 4G71B 3S3CB 1L56A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A3EA 3W3EA 1L42A 1QUDA 1C6GA 2BQMA 3LZMA 1LMOA 1E0PA 2RB2X 2H9JA 4Z46A 3HTFA 5AMYA 1IWWA 1C6JA 1KY1A 4ETBA 1LZRA 1UBZA 2YBHA 5I53A 1HELA 1L37A 2ZZLA 4DDCA 5KXWA 3AYMA 1FLWA 1KG8A 2D4IA 4BEYA 4RLMA 1OUDA 1L09A 1LAAA 3B0OA 2F2QA 1L24A 2AUBA 1CV4A 1QTVA 1I1ZA 4G4CA 1IP7A 4XT3A 182LA 1V7SA 1IP2A 3AW7A 212LA 2RSCA 4H94A 4RLNA 3AZ7A 1H6MA 1XEKA 1G7LC 1UICA 3ZEKA 1H87A 3HT7A 4JQ6A 1PQKA 5LYZA 1WQQA 2EQLA 5JJNA 3A34A 4NY5A 2LYMA 251LA 1KXWA 2NTUA 196LA 1GF3A 1UIBA 3UONA 4GLAA 4DQ5A 5B6WA 2YBMA 4I0CA 2YBLA 1SWZA 4H8YA 3HT9A 1GB8A 5KXLA 1HSXA 1IP6A 1PY6A 1IR8A 3A94A 1OWYA 3M3UA 4LDOA 1BB6A 1J1PY 5B06A 1DPWA 1JIYA 1EPYA 1TCYA 5LXWA 1LSDA 241LA 188LA 3IJVA 1L26A 3WXUA 3N9CA 1GFHA 1L88A 1P8UA 3CT5A 5I14A 3LYTA 1D9UA 1EQ5A 3VI0A 3DMXA 5C1MA 1GBSA 4MSTA 1RE2A 1B6IA 2BQCA 4NGWA 4LYMA 1SX2A 1JUGA 4ZEEA 1FBBA 1HERA 5DHHA 1CKFA 174LA 1G7HC 3HWLA 1YILA 3LHMA 1C6TA 3SBBC 5LAGA 3A6BY 4KPMA 5F9XA 4WL6A 2Y04A 2I1XA 4QY9A 1IR9A 3ATNA 4OW1A 1L34A 1SQ2L 1L73A 1JJ0A 4EKQA 1GB6A 3RU5A 3GUPA 3S8FB 4DT3A 3TMUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3HAR A;  1QT3 A;  1SSY A;  1L13 A;  253L A;  155L A;  3FAD A;  1L33 A;  2OU9 A;  1L16 A;  1L81 A;  2OU0 X;  2NTH A;  5AHZ A;  1JFP A;  4MBS A;  2LCB A;  3ZEV A;  229L A;  1L94 A;  1S53 A;  150L A;  1KME A;  1L28 A;  1L71 A;  2NTW A;  3DN1 A;  103L A;  1T8A A;  4I7T A;  197L A;  5DHG A;  236L A;  3C7Z A;  217L A;  4YXC A;  1L97 A;  1T8G A;  4EJ4 A;  4GYC A;  137L A;  3WQJ A;  1C66 A;  1L98 A;  1L17 A;  1OYU A;  1C6B A;  3EH3 B;  1L87 A;  4Y9H A;  5LWE A;  1OV7 A;  5AX0 A;  1LI6 A;  1PQD A;  1L0K A;  262L A;  127L A;  4I7J A;  4W57 A;  7LZM A;  1L0M A;  4AMI A;  1QT8 A;  3A7K A;  1G0Q A;  1L53 A;  1C68 A;  1L41 A;  1L89 A;  1LYG A;  166L A;  114L A;  250L A;  2RBS A;  2RBN A;  1L55 A;  4ARM A;  180L A;  2Z55 A;  3GUN A;  5KKH A;  1P3N A;  1L72 A;  3UZC A;  2VT4 A;  5BR2 A;  1CVK A;  142L A;  3QAP A;  1QT4 A;  3S8G B;  1FBK A;  4FPD A;  1Q5J A;  4GP4 B;  1L07 A;  2Y02 A;  3UZA A;  1KS3 A;  1C60 A;  4ARQ B;  2B73 A;  2RAZ X;  1LW9 A;  1QT5 A;  4EIY A;  3HUK A;  1L52 A;  3ODU A;  4I7M A;  218L A;  4ARJ A;  1L86 A;  1P2R A;  176L A;  1DYB A;  1L99 A;  191L A;  3C81 A;  1L64 A;  233L A;  2LC9 A;  3K2R A;  4E97 A;  4BV0 A;  5AX1 A;  3UTV A;  3RUN A;  3C8R A;  156L A;  4GRV A;  1L59 A;  2NTG A;  2J4Y A;  4N4W A;  1L63 A;  247L A;  1LI2 A;  1P6Y A;  2JAG A;  2WJL A;  1D3J A;  111L A;  1PQO A;  1QTC A;  1QTB A;  1BRX A;  1L14 A;  4G71 B;  3S3C B;  1L56 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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