3PDSA

Irreversible agonist-beta2 adrenoceptor complex
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAACILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of an irreversible agonist-beta(2) adrenoceptor complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein Beta-2 adrenergic receptor/Lysozyme
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 143
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pdsA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pdsA01
5ITCA 2B73A 3HUAA 1L68A 3HANA 1L22A 4G72B 4PXKA 1XMEB 3X3BA 5JJNA 3QBKA 3C8RA 1P56A 4E97A 1L32A 2M3GA 2OU0X 5G54A 196LA 226LA 1QT4A 3HTFA 184LA 1PQKA 4GRVA 165LA 3S8FB 3DN0A 1C6CA 3DN2A 3SBAA 4AMJA 5TGZA 3QBLA 247LA 1L08A 3C81A 1IW6A 103LA 1LYGA 1L79A 1BRDA 1S54A 2X72A 1KY1A 3C80A 4UG2A 1OWZA 2O79A 1S53A 200LA 119LA 2ANVA 4EKSA 1BRXA 1M0KA 3EH5B 148LE 211LA 122LA 112LA 1KY0A 1P3NA 3DMVA 223LA 131LA 5H2OA 3DN1A 2I1XA 4XTLA 5EN0A 1L24A 4QI1A 1C6DA 1L65A 4KNFA 2YCZA 157LA 201LA 1LGUA 3HH6A 2NTGA 4LDOA 4W52A 4JQ6A 143LA 3HDFA 1CVKA 1TN0A 4EXMA 1L97A 3GULA 3S3DB 2B7XA 3HTDA 160LA 1S8JA 191LA 5G2CA 1L70A 4IB4A 3DNAA 1L04A 1LYDA 4PXFA 161LA 1QT5A 1C62A 128LA 1CX7A 1C68A 1KW7A 3PDSA 1VJMA 3CAPA 2Y00A 2B6XA 2A4TA 3ODUA 4BV0A 1QM8A 1T8AA 5F8UA 4EJ4A 1F4ZA 3DKEX 4I7RA 1C66A 1L76A 3L2XA 5LWEA 1JTMA 2R4SA 2YDVA 1L74A 172LA 2ZIYA 5H2LA 3GUMA 4PJZA 3DN8A 1G0PA 4XXJA 5H2MA 145LA 1CTWA 1OWYA 1L86A 1DYGA 2RB0X 4OO9A 4DKLA 198LA 3P0GA 4MD1A 4LDEA 1QTCA 1L63A 3CODA 4QIDA 238LA 243LA 1G07A 4MBSA 4EKRA 2RBSA 1D3FA 123LA 1CUPA 1QUHA 2OEAX 1DZEA 3DMZA 187LA 258LA 1C64A 1L77A 144LA 1QTHA 1C6LA 2YCYA 1L19A 233LA 1SX7A 1L20A 1PQJA 3UONA 1Q5JA 1L06A 2RB1X 2JAFA 125LA 1QS9A 3CDRA 2ZFEA 1CX6A 1QSQA 1LI2A 205LA 2RBPA 4AMIA 1D3JA 1DYDA 195LA 1XJIA 1ZYTA 3DN3A 4ZPUA 4J4QA 2YCXA 3S3BB 1G1VA 3HTBA 1CV1A 3HDEA 1G0KA 1L80A 1CU5A 3HWLA 2I21A 1KS3A 231LA 219LA 4BWBA 1L18A 4UHRA 4G70B 2WJLA 221LA 1P6YA 4GBRA 217LA 1L58A 3HTGA 3OE9A 4W54A 4TL3A 5A44A 1P8HA 1QUOA 1L39A 1P64A 1QT3A 3DN6A 239LA 2RBNA 4YXCA 3QJTB 1XJTA 2I20A 2QB0B 3OAXA 3AYNA 4W55A 234LA 3G3XA 1OVJA 4GP4B 2Z6BA 1L48A 171LA 199LA 5AX0A 3AM6A 3QAPA 1LWGA 262LA 1PQIA 5AWZA 3SB9A 5G28A 230LA 1KG8A 1CU3A 1QTVA 2KSBA 3NSBA 2ANXA 4AQNA 4W51A 4BUOA 188LA 1JTNA 215LA 5A8EA 5DHHA 164LA 245LA 2B74A 3UTXA 2F47A 4FBZA 1LI6A 1L15A 2IGCA 4EPFA 5FJGA 3UZCA 149LA 3HAOA 4MQTA 229LA 4XT3A 3QJQB 1G0LA 1L07A 4BVNA 3C8SA 1IXFA 1C8SA 5JJEA 150LA 3RZEA 255LA 3PQRA 2QARC 1R84A 126LA 1L52A 2NTWA 3GUKA 1TLAA 3KJ6A 1L00A 2OU8A 2QPEB 4IAPA 260LA 1LPYA 2KSAA 111LA 1G06A 1D2WA 1S51A 4EKQA 173LA 1L21A 174LA 1PQDA 1T97A 3SB6A 1VGOA 1BM1A 1L64A 2LCBA 4ARPA 1L55A 1JQUA 1QTBA 1SSWA 1OVHA 1G0GA 4MQSA 1SX2A 1Q5IA 1L85A 1C6NA 1L69A 129LA 2HUKA 3JR6A 104LA 2BRDA 3OE6A 3QJUB 1NHBA 2OTZX 1GZMA 3RFMA 108LA 181LA 4GP8B 4ARLA 185LA 1JGJA 257LA 4I7JA 1SWYA 3V2YA 3L64A 1LWKA 2JAGA 240LA 3QAKA 4JKVA 4XTOA 168LA 5H2PA 5ITEA 1MGYA 3VHZA 1PQMA 118LA 4FAAB 139LA 2B70A 167LA 192LA 2O7AA 1P36A 4I7TA 1L96A 1L9HA 1L33A 7LZMA 1L16A 2OE4X 1P37A 3QBGA 252LA 1P46A 1ZURA 152LA 1M0MA 5LZMA 1WTHA 1L43A 4X1HA 3UTVA 1QT6A 1G1WA 158LA 1T8GA 169LA 1L36A 1C6TA 1QHJA 1L67A 3NYAA 4HYXA 5B6WA 120LA 3DMXA 2R4RA 2HULA 1L53A 2YCWA 1C6MA 4YXAC 3UG9A 1XEPA 146LA 4ARJA 110LA 1QKPA 1L0JA 1D3MA 1D3NA 1UCQA 1L54A 2G87A 1QKOA 3SB8A 4G7QB 4OV0A 180LA 3HT8A 4LZMA 5C1MA 1L91A 4DJHA 3QJSB 4MD2A 1L73A 1ZWNA 4IARA 1L02A 1CV6A 1L34A 1E0PA 1OVKA 1L37A 261LA 1QUDA 5AHYA 3QJVB 3HU9A 2B6WA 206LA 3AYMA 3VG9A 2B6TA 4I7PA 1L62A 1L75A 250LA 1LYEA 1C6QA 1P8IA 1B6IA 1KG9A 1PXSA 228LA 1DYBA 4I7KA 2L78A 183LA 3CDQA 4I7MA 1L44A 1L83A 3F9LA 115LA 2NTHA 4N4YB 4W59A 1L89A 3HH5A 1C60A 1LYHA 3HH3A 1L94A 1X0I1 1L84A 1L59A 3C7YA 1L13A 6LZMA 1G0QA 2RAYX 1L31A 214LA 222LA 4ARQB 166LA 1D2YA 113LA 1L14A 1X0SA 3HH4A 2LC9A 220LA 1PY6A 5B6XA 4X31A 5G53A 1PQOA 3ZEVA 1L0KA 2Y03A 2KSYA 1L57A 1L17A 3CDVA 2L6XA 1QTZA 3GUNA 1OV5A 1S8LA 4EPIA 3HARA 4ARQA 3VGAA 4EA3A 1T8FA 3HT7A 1L50A 1KMEA 4KLYA 1C6AA 1C3WA 4QRYA 3VI0A 3HU8A 2Q9EA 4FPDA 1C61A 1X0K1 5B6YA 5G36A 4WAVA 3OE0A 4L35A 2HPYA 2O4WA 3X3CA 236LA 4L6RA 3QJRB 2WJKA 5B2NA 1P8UA 4N6HA 2J4YA 209LA 140LA 1C6FA 2RB2X 2RBRA 1CWQA 1E12A 1IW9A 162LA 232LA 3CDTA 137LA 1C6BA 1L12A 4Y9HA 3SB5A 1KNIA 237LA 2HUMA 1QT7A 3QBIA 4GYCA 2RBQA 2OU9A 3ABWA 5DYSA 1LYJA 2KS9A 1L88A 5ETZA 1G0JA 1L42A 1R2NA 4XT1A 5H2KA 1L0MA 4K5YA 3EMLA 5J7AA 2LNLA 1DYCA 256LA 170LA 5DHGA 2EI4A 1F88A 249LA 156LA 4X32A 1LI3A 1C6JA 114LA 1C6HA 2F32A 1L87A 2B75A 3HT9A 1L49A 177LA 3EH4B 151LA 1JFPA 3COCA 1L99A 1T6HA 3HAQA 197LA 1C63A 4W56A 1P2LA 1LN6A 2OE7X 3C7ZA 3BVDB 3OE8A 2B72A 1C6GA 2F95A 3UTYA 1KGBA 141LA 4I7SA 1U19A 147LA 4EKPA 4I7LA 2YDOA 1CUQA 2F2QA 3T45A 2ZZLA 1L81A 1P5CA 4BEYA 1DYAA 4I7QA 1L47A 1L03A 227LA 3DN4A 190LA 5JJJA 3FA0A 1L66A 3V2WA 1AP9A 3SB7A 3C82A 3PBLA 1SWZA 3HUKA 1L56A 2Q9DA 178LA 1L46A 3C9MA 3VVKA 1CU0A 1GUEA 3C9LA 4S0WA 1L28A 176LA 3C83A 1L82A 2RBOA 127LA 4NC3A 3UTWA 142LA 1C6IA 5H2NA 1QTDA 248LA 1DYFA 4W58A 2OTYX 224LA 4W53A 5BR2A 1QS5A 1L25A 2Z73A 3VW7A 246LA 1P7SA 3FI5A 4PK0A 4IAQA 242LA 4WW3A 1TN5A 1JV6A 138LA 3C8QA 1L38A 3NS0A 4JR8A 1L09A 1AT9A 3G3WA 1I6SA 1CV3A 1L40A 3GUJA 216LA 1UAZA 1L29A 3CDOA 1GU8A 1L71A 1XJUA 1QUGA 2B6ZA 1H68A 3A7KA 3DDLA 186LA 3PWHA 4FA7B 4LDLA 1L45A 1F50A 1L61A 1KW5A 1CV0A 5BR5A 213LA 189LA 1L41A 1FBKA 3EH3B 5AHZA 225LA 1L11A 1LYIA 3NY8A 1SSYA 2RH1A 1EPYA 175LA 1L60A 1G0MA 4YX7C 2Y04A 212LA 2B6YA 2AT9A 218LA 3ZPQA 1L93A 3HT6A 1C67A 1C8RA 3RUNA 3HAPA 1L23A 1L95A 3UZAA 2PEDA 1L90A 1OYUA 2Y02A 3MBVA 3SN6R 4GPOA 3REYA 1LGWA 1HZXA 4G7RB 1JV7A 1C65A 1O0AA 1L05A 107LA 1S52A 1FBBA 1LGXA 3SBBC 3G3VA 4G7SB 3HUQA 1C6EA 1BRRA 3GUIA 1H2SA 241LA 1D9WA 1L30A 5AZDA 4EIYA 3QDCA 4ARMB 1L10A 3D4SA 1M0LA 251LA 3WQJA 235LA 1CV5A 2CUUA 1PXRA 3HASA 3C7WA 2OE9X 5B6VA 3LZMA 1C69A 4GBRB 4N4WA 5B0WA 3NY9A 253LA 2F93A 1L72A 3PXOA 5H2HA 3FADA 3GUOA 3S3CB 1CV4A 2LZMA 4W57A 1CU6A 4ARMA 1C6KA 1LYFA 5H2JA 2Y01A 5H2IA 1L51A 4HWLA 109LA 1L35A 3ZPRA 159LA 1QT8A 155LA 130LA 5B35A 163LA 210LA 2RAZX 2VT4A 5A45A 3K2RA 1L92A 1K28A 5G2AA 5B34A 2Z55A 4BEZA 1L27A 1L01A 1OV7A 2NTUA 4G71B 3DQBA 4A4MA 4GP5B 3F8VA 5G2DA 1EHKB 5B6ZA 4XTNA 5KKHA 1L98A 4I7OA 259LA 1LLHA 5AX1A 182LA 254LA 1DYEA 2I35A 2QPDB 4HYJA 102LA 4I7NA 1L26A 3GUPA 4DAJA 3S8GB 1LW9A 244LA 5I14A 1XIOA 1QSBA 1C6PA 1P2RA 1CU2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B73A 1ZMYL 4E97A 1L32A 1UIDA 3LYMA 1QT4A 1XEIA 165LA 1BB5A 4OW1A 2DQGY 1S54A 4LT1A 3C80A 4B1AA 2ANVA 1BRXA 4C3WA 3EH5B 1KY0A 2ZYCA 1QUTA 5H2OA 4LFXA 2I1XA 3B0OA 2HEEA 4IATA 1IIZA 4QI1A 1L65A 201LA 5I53A 1AM7A 4JQ6A 1YKZX 4H93A 1CVKA 4CFOA 3EBAB 3TXFA 3GULA 1B7OA 2EPEA 1D0LA 4IB4A 4PXFA 128LA 1VJMA 4BV0A 1J1PY 1TAYA 1T8AA 4DDAA 5HMVA 5F8UA 1ZVHL 1F4ZA 4NGIA 1XGPC 4YOPA 4L41A 1L74A 2Y8PA 3TXJA 1CJ8A 4DKLA 4MD1A 4LDEA 3ZVQA 243LA 1G07A 2RBSA 1HNLA 1OUGA 1CUPA 4YF2A 1DKKA 3AGIA 1HFXA 1REMA 1YAPA 144LA 2YCYA 1PS5A 4XYYA 3CB7A 1GDXA 1PQJA 3UONA 4H9AA 1L06A 4N5RA 2RB1X 2JAFA 3CDRA 1CX6A 205LA 1LI2A 2RBPA 3AB6A 1ZYTA 1LSGA 3CT1A 2YCXA 3HTBA 1WQQA 3TMXA 1CU5A 1HHLA 1JIYA 1REYA 1UACY 5KKJA 219LA 1GXV2 2W1MA 5F14A 221LA 2CWIA 1XEKA 4GBRA 3HTGA 1L39A 1P64A 1QT3A 4NSHA 239LA 2HEDA 1XJTA 2I20A 1H6MA 4H9BA 1LZ8A 3QAPA 1LWGA 4G4CA 262LA 5AWZA 3TXKA 230LA 1KG8A 1CU3A 3NSBA 4HV1A 4AQNA 4H92A 3WYHA 4BUOA 188LA 4LYZA 245LA 4NHIA 4WO6A 4FBZA 4WG1A 1LI6A 1OUAA 4N9RA 4EPFA 5FJGA 229LA 5FELA 1L07A 3A91A 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 4BEZ A;  1L27 A;  1L01 A;  1OV7 A;  2NTU A;  4G71 B;  3DQB A;  4A4M A;  4GP5 B;  3F8V A;  5G2D A;  1EHK B;  5B6Z A;  4XTN A;  5KKH A;  1L98 A;  4I7O A;  259L A;  1LLH A;  5AX1 A;  182L A;  254L A;  1DYE A;  2I35 A;  2QPD B;  4HYJ A;  102L A;  4I7N A;  1L26 A;  3GUP A;  4DAJ A;  3S8G B;  1LW9 A;  244L A;  5I14 A;  1XIO A;  1QSB A;  1C6P A;  1P2R A;  1CU2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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