3PDSA

Irreversible agonist-beta2 adrenoceptor complex
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAACILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of an irreversible agonist-beta(2) adrenoceptor complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Fusion protein Beta-2 adrenergic receptor/Lysozyme
total genus 143
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pdsA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pdsA01
2ANVA 1PXRA 1Q5JA 5A8EA 1S8LA 1QT6A 1L52A 5ITCA 3GUPA 3PXOA 1L32A 3GUIA 1P8HA 4MD1A 2O79A 229LA 1XMEB 3VGAA 2B6YA 2Q9EA 2B75A 3AYNA 2RBOA 158LA 1QTDA 1BM1A 3QDCA 1L60A 2KSYA 5B6ZA 1JTMA 1L12A 4GBRA 5DHHA 1S51A 3UZCA 1L02A 212LA 3CDRA 2F95A 1GU8A 1K28A 254LA 1L72A 2RB0X 4UHRA 4GP8B 3UTYA 1CWQA 1G1VA 1KMEA 171LA 5TGZA 4W55A 234LA 1AT9A 5AHZA 5C1MA 1C64A 1G0MA 5AX0A 1C6PA 1M0LA 1L73A 3C7YA 1L28A 1LYFA 3SBBC 3DMXA 1G0QA 1C6MA 4I7OA 4K5YA 129LA 1CV4A 1KG9A 4UG2A 2OE9X 1C6FA 5AX1A 1ZYTA 107LA 3HH6A 4I7SA 4YX7C 1TLAA 3BVDB 3PDSA 5AHYA 3DMZA 5BR2A 169LA 123LA 1L46A 3C82A 5A44A 1P64A 1P8UA 2NTGA 3PBLA 3C80A 1C6EA 1PQJA 4I7JA 4I7TA 1D3MA 1QUGA 1AP9A 3DKEX 2OE4X 4G71B 3C8RA 1C65A 224LA 2AT9A 1L35A 4W59A 4NC3A 5EN0A 3EH4B 1CU5A 5J7AA 1LYGA 1UAZA 216LA 4W51A 1L81A 3LZMA 2Y01A 3NSBA 3VVKA 196LA 1L59A 2B73A 1S53A 3QJTB 4XTOA 2OTYX 1CU6A 3CDVA 205LA 233LA 3UG9A 2NTUA 4IAQA 4QIDA 4GYCA 5G2CA 1QS9A 1JFPA 128LA 1B6IA 3C8SA 3HH3A 5B2NA 1L14A 4HYJA 2RBRA 1FBBA 4MQTA 5KKHA 1L30A 3X3BA 4QI1A 1PQMA 1CV3A 2X72A 1JV7A 1L03A 5G2DA 5B0WA 1P5CA 2R4SA 4ARPA 2ANXA 3KJ6A 248LA 2Z6BA 1C8SA 1GZMA 3QJRB 3HWLA 4AMIA 4FA7B 241LA 4X1HA 5B35A 1R84A 1VGOA 5H2OA 4MBSA 1L37A 1G0JA 1L20A 190LA 5LWEA 4LDLA 3OE0A 2PEDA 3QJUB 1DZEA 1L9HA 3HU8A 1Q5IA 4N4WA 2QPEB 127LA 5DHGA 1D3FA 3HTGA 1L09A 222LA 1L98A 210LA 215LA 1L06A 5H2JA 3COCA 1P7SA 170LA 1P36A 172LA 122LA 2F47A 1C68A 1L17A 2ZZLA 3DN4A 1F88A 138LA 1L08A 3GUMA 246LA 3VW7A 2KS9A 1L27A 1C6TA 1OV5A 2G87A 1L86A 1L87A 1QT4A 2YDVA 7LZMA 173LA 3AM6A 182LA 261LA 1L15A 3D4SA 4EKPA 2EI4A 5H2IA 4ARQA 1L96A 2F32A 4I7LA 1MGYA 1L51A 4BV0A 3GUJA 4S0WA 1OYUA 3HUAA 4I7PA 156LA 163LA 189LA 1L16A 2F93A 2IGCA 1D2YA 1L26A 3HTBA 4GRVA 4HWLA 1L95A 250LA 3OAXA 2HUMA 137LA 3A7KA 1L91A 3DNAA 1G06A 2RBQA 1CVKA 3GUNA 3HT9A 2Z73A 3DN0A 4EKRA 4MQSA 4EJ4A 1L74A 4ZPUA 247LA 2I21A 4ARLA 1LN6A 1DYDA 3GUKA 2JAGA 220LA 214LA 1L44A 4W52A 4LDOA 257LA 3NY8A 1QM8A 165LA 1QTHA 4GPOA 4KNFA 1GUEA 244LA 1L58A 1G0LA 4G7RB 200LA 3ZEVA 1D2WA 3OE6A 2F2QA 2YCXA 2J4YA 3HAQA 160LA 2LNLA 2NTWA 1KW5A 2YCYA 4X31A 5ETZA 2OU8A 1CX7A 1D3NA 1CV0A 1BRDA 1C67A 4XXJA 1QHJA 1CV1A 2RH1A 1C6KA 2ZFEA 1C6QA 3HH4A 2B72A 5H2HA 1KY0A 2WJLA 1QUOA 4EPFA 2OU0X 1KGBA 1G0KA 230LA 2HUKA 1X0I1 2R4RA 4BVNA 1OVJA 4EKQA 1L22A 1L45A 1L0MA 130LA 1JTNA 5FJGA 5B6WA 1S8JA 195LA 191LA 4WW3A 3HUKA 2QB0B 1M0MA 143LA 103LA 1L79A 1C6GA 1TN5A 3REYA 1L80A 249LA 4FPDA 1G0GA 1L13A 1LI3A 1SWYA 219LA 4ARMB 1WTHA 3QBIA 3HT6A 2OTZX 4YXCA 3ABWA 1L33A 184LA 2O4WA 3S3CB 1L36A 104LA 1L70A 3VI0A 3HUQA 3SB5A 1L10A 3UTWA 3VG9A 147LA 5H2NA 2L78A 2RBSA 1L56A 1S54A 4PJZA 1QUDA 5H2KA 1KG8A 3V2YA 3QBKA 4WAVA 4GP5B 1C6AA 192LA 3HTDA 4IAPA 3ZPRA 5LZMA 5JJEA 1C6BA 1XIOA 1C61A 2QPDB 1L47A 3G3WA 1CU0A 1C6NA 4G70B 4W57A 1L97A 252LA 1QT3A 226LA 1QT7A 1ZURA 2I20A 3SBAA 3C83A 223LA 2HULA 3JR6A 5BR5A 5B6XA 149LA 1QTCA 1X0K1 1PY6A 2A4TA 1C6DA 1L23A 5B6YA 4BEZA 1P3NA 2YCWA 3SB6A 1XEPA 1P56A 1PQDA 4EA3A 4IB4A 1L53A 1PQIA 3OE9A 1OVKA 126LA 2YDOA 4QRYA 4FAAB 164LA 1BRRA 4EPIA 5DYSA 3C8QA 1D9WA 168LA 1KNIA 1L99A 4OO9A 4IARA 1QTZA 2B6TA 1SWZA 162LA 2RBPA 118LA 176LA 1KY1A 238LA 4J4QA 3SB9A 1C6IA 1F4ZA 1LYHA 1L19A 167LA 1L71A 5AWZA 1IXFA 3FADA 231LA 1L63A 150LA 259LA 221LA 5B6VA 2O7AA 211LA 3HDFA 1T97A 1T8AA 1L39A 242LA 239LA 1CV5A 4G72B 1L92A 1LLHA 142LA 187LA 1JGJA 1L55A 4LDEA 1HZXA 180LA 4EIYA 4AQNA 5G53A 1L75A 3HT7A 3EMLA 3HT8A 1L48A 2HPYA 3AYMA 245LA 3V2WA 1SX7A 5G28A 1G1WA 228LA 3DN8A 2LCBA 1L18A 3QJQB 4W54A 4PXKA 4Y9HA 1OVHA 1LGXA 1C60A 2B7XA 4DKLA 4L6RA 2BRDA 1C6HA 258LA 3C81A 1L42A 3DN6A 3HU9A 206LA 4L35A 5G2AA 1LWGA 2B6WA 4ARMA 3ODUA 113LA 1DYCA 1G0PA 2JAFA 1CU2A 1QKPA 1DYGA 1LI2A 4GP4B 3NYAA 1L54A 3DN1A 3K2RA 3HDEA 2Q9DA 2RB2X 1BRXA 1C6CA 240LA 1QTBA 1M0KA 3S3DB 1L49A 1P37A 1FBKA 185LA 1QSBA 181LA 4N4YB 5G54A 235LA 1C62A 3UTXA 256LA 3DDLA 131LA 3HH5A 3PQRA 1L34A 1L66A 183LA 3CAPA 1P6YA 139LA 1G07A 2M3GA 262LA 1LGWA 253LA 225LA 114LA 1L31A 1TN0A 1L93A 3SB7A 5I14A 1L11A 3PWHA 5H2LA 4JKVA 1XJUA 188LA 1L61A 1PXSA 3C9MA 3DN3A 178LA 1L41A 1R2NA 1L40A 1X0SA 236LA 1L67A 1KS3A 197LA 2KSAA 3S8FB 4BEYA 4I7QA 1NHBA 3WQJA 159LA 1QT8A 3QJSB 4HYXA 4KLYA 1I6SA 1LYEA 4MD2A 3UTVA 1SX2A 1L04A 5JJNA 3VHZA 1C6JA 146LA 4XTNA 3G3XA 3T45A 3L2XA 5G36A 1QSQA 1C6LA 2OU9A 4JQ6A 174LA 3DN2A 1C3WA 4ARQB 3MBVA 5H2PA 1L50A 2CUUA 2OEAX 4W58A 157LA 4DAJA 237LA 1L90A 3FI5A 1T8GA 3NY9A 2Y04A 4LZMA 3RFMA 3L64A 140LA 2B6ZA 1LGUA 148LE 1L43A 1LYJA 1E12A 1QKOA 6LZMA 2L6XA 2QARC 1L84A 1L85A 217LA 1LYDA 1DYBA 2RAZX 112LA 144LA 2LC9A 4I7KA 4OV0A 5F8UA 4I7MA 198LA 108LA 1OV7A 3C7ZA 4EXMA 4DJHA 2RB1X 3S8GB 1C8RA 209LA 1L24A 3C7WA 3HTFA 155LA 1PQKA 227LA 1L00A 4G7SB 1XJIA 1CTWA 251LA 4GBRB 175LA 3QAKA 1LYIA 1O0AA 213LA 2ZIYA 3CDTA 1T6HA 2LZMA 4JR8A 5A45A 1C66A 4ARJA 3HAPA 1SSWA 3SB8A 1EPYA 120LA 5ITEA 1P46A 2WJKA 1OWYA 3CDOA 1F50A 1LWKA 151LA 1CV6A 1L89A 3HANA 1L65A 186LA 1U19A 3C9LA 1CUQA 2NTHA 1L05A 1L21A 3RUNA 3HASA 3QBLA 3FA0A 1QS5A 1P2RA 1L88A 1P8IA 1H68A 255LA 201LA 102LA 3DMVA 5JJJA 1JQUA 2B70A 3UONA 3X3CA 1H2SA 1SSYA 1UCQA 1VJMA 1EHKB 1L01A 4W56A 3QBGA 2Y03A 4AMJA 1C69A 1LPYA 260LA 1DYAA 1P2LA 4I7RA 3G3VA 3RZEA 4EKSA 2B6XA 1IW6A 3UZAA 3EH3B 4YXAC 3CODA 3GUOA 4XT1A 125LA 1L38A 1IW9A 1E0PA 1CU3A 5AZDA 1L64A 3OE8A 3QJVB 4E97A 109LA 2Y02A 4TL3A 1L76A 4PXFA 166LA 1L83A 1DYEA 1L57A 1L0JA 1T8FA 1QTVA 232LA 2YCZA 152LA 3S3BB 1PQOA 1QUHA 161LA 3SN6R 2I1XA 3GULA 4I7NA 1KW7A 4PK0A 4FBZA 1L68A 1L07A 199LA 2OE7X 1L29A 4G7QB 4BUOA 1XJTA 5B34A 1C63A 3HARA 3QAPA 1JV6A 3ZPQA 1OWZA 110LA 1DYFA 3CDQA 4W53A 2Y00A 1ZWNA 4BWBA 1S52A 4N6HA 2B74A 3F9LA 2KSBA 2RAYX 141LA 2VT4A 3NS0A 2RBNA 4A4MA 2Z55A 1LW9A 1LI6A 1L25A 1L69A 3DQBA 1L82A 1L62A 3EH5B 1D3JA 177LA 119LA 4XTLA 4XT3A 145LA 3F8VA 2I35A 1L0KA 111LA 218LA 1L94A 1QT5A 3HAOA 4X32A 5H2MA 115LA 1CX6A 243LA 3P0GA 1L77A 1CUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ANVA 1PXRA 3AZ5A 1S8LA 2HU3A 2O79A 1XMEB 2Q9EA 5B05A 2MEHA 1JTMA 1GB0A 1GWDA 2F95A 1K28A 254LA 5C6JA 2D4KA 4YM8A 4W55A 4LFXA 1LSPA 5M1YA 1GB8A 2LZ2A 3C7YA 1NKHA 1FDLY 1LYFA 2YBJA 1GAZA 1G0QA 1LJ4A 4I7OA 4K5YA 4MSTA 3HH6A 4DD3A 4YX7C 3DMZA 2BQKA 3C82A 1P64A 1N4FA 1P8UA 3IJVA 1LZYA 1D3MA 2OE4X 2BQLA 4WL7A 1CU5A 4NG1A 4HPEA 1YIKA 1GF6A 1UAZA 216LA 3TXFA 2RSCA 3B0OA 1S53A 4XTOA 1FN5A 1GFJA 4M4OA 4GYCA 4OOOA 5B1FA 1QS9A 5G2CA 3HH3A 3LYTA 1L14A 1UACY 1LHMA 2DQFC 3AZ7A 1PQMA 5G2DA 1JV7A 4LYZA 3LYOA 2ANXA 2Z6BA 1C8SA 4HPIA 4X1HA 4E3UA 3A34A 5B35A 5H2OA 1HERA 1YROA 4X3BA 3WU9A 4LDLA 3TXIA 1LMQA 1EQEA 3CT0A 2G4QA 4B1AA 127LA 1D3FA 3HTGA 3LYMA 222LA 1IEEA 1IC7Y 3WMKA 4H91A 3D3DA 3WUAA 1C68A 4WL6A 4HTKA 3D4SA 4EKPA 5H2IA 5KXMA 4ARQA 1L96A 1RE2A 3GUJA 4I7PA 3J6KA 2F93A 2IGCA 4H90A 4GRVA 250LA 2HUMA 137LA 3A7KA 1IR9A 3DNAA 2RBQA 1B5XA 3A91A 4EKRA 5ILFA 4ZPUA 4IASA 1HEPA 4LYTA 4W52A 4NWEA 4GPOA 1CKFA 244LA 4G7RB 1QIOA 200LA 1XEIA 4MCKA 2Z38A 1JTPL 1FLWA 4X31A 1D3NA 4ET9A 2YBMA 5AMYA 1QHJA 1CV1A 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 186L A;  1U19 A;  3C9L A;  1CUQ A;  2NTH A;  1L05 A;  1L21 A;  3RUN A;  3HAS A;  3QBL A;  3FA0 A;  1QS5 A;  1P2R A;  1L88 A;  1P8I A;  1H68 A;  255L A;  201L A;  102L A;  3DMV A;  5JJJ A;  1JQU A;  2B70 A;  3UON A;  3X3C A;  1H2S A;  1SSY A;  1UCQ A;  1VJM A;  1EHK B;  1L01 A;  4W56 A;  3QBG A;  2Y03 A;  4AMJ A;  1C69 A;  1LPY A;  260L A;  1DYA A;  1P2L A;  4I7R A;  3G3V A;  3RZE A;  4EKS A;  2B6X A;  1IW6 A;  3UZA A;  3EH3 B;  4YXA C;  3COD A;  3GUO A;  4XT1 A;  125L A;  1L38 A;  1IW9 A;  1E0P A;  1CU3 A;  5AZD A;  1L64 A;  3OE8 A;  3QJV B;  4E97 A;  109L A;  2Y02 A;  4TL3 A;  1L76 A;  4PXF A;  166L A;  1L83 A;  1DYE A;  1L57 A;  1L0J A;  1T8F A;  1QTV A;  232L A;  2YCZ A;  152L A;  3S3B B;  1PQO A;  1QUH A;  161L A;  3SN6 R;  2I1X A;  3GUL A;  4I7N A;  1KW7 A;  4PK0 A;  4FBZ A;  1L68 A;  1L07 A;  199L A;  2OE7 X;  1L29 A;  4G7Q B;  4BUO A;  1XJT A;  5B34 A;  1C63 A;  3HAR A;  3QAP A;  1JV6 A;  3ZPQ A;  1OWZ A;  110L A;  1DYF A;  3CDQ A;  4W53 A;  2Y00 A;  1ZWN A;  4BWB A;  1S52 A;  4N6H A;  2B74 A;  3F9L A;  2KSB A;  2RAY X;  141L A;  2VT4 A;  3NS0 A;  2RBN A;  4A4M A;  2Z55 A;  1LW9 A;  1LI6 A;  1L25 A;  1L69 A;  3DQB A;  1L82 A;  1L62 A;  3EH5 B;  1D3J A;  177L A;  119L A;  4XTL A;  4XT3 A;  145L A;  3F8V A;  2I35 A;  1L0K A;  111L A;  218L A;  1L94 A;  1QT5 A;  3HAO A;  4X32 A;  5H2M A;  115L A;  1CX6 A;  243L A;  3P0G A;  1L77 A;  1CUP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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