3PDSA

Irreversible agonist-beta2 adrenoceptor complex
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAACILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of an irreversible agonist-beta(2) adrenoceptor complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Fusion protein Beta-2 adrenergic receptor/Lysozyme
total genus 143
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pdsA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pdsA01
2KSAA 177LA 4LDOA 2F47A 1L0MA 138LA 4W57A 3EH5B 4JKVA 1L10A 220LA 2HUKA 144LA 3DMXA 2CUUA 3P0GA 195LA 1L25A 4I7JA 169LA 1OVHA 1XMEB 2RB2X 216LA 2IGCA 1L34A 1O0AA 1P8UA 3UZCA 3NY8A 1JV7A 1G07A 1LYGA 2KS9A 1QS9A 115LA 1C6NA 185LA 1L18A 4J4QA 3S8FB 2NTWA 2YDVA 1DYFA 1DZEA 170LA 1L58A 107LA 3X3CA 4XT1A 1XEPA 255LA 3VHZA 1CV1A 4G71B 1D3MA 3RUNA 1WTHA 2F95A 3F9LA 1IW9A 176LA 2M3GA 1L01A 3DN0A 1LGUA 4ARJA 1C6BA 1L27A 1C67A 1QTCA 1SWYA 3CDRA 4HYJA 4PJZA 3UZAA 4GP5B 4EA3A 3HASA 3A7KA 2Y02A 3VW7A 3HDEA 211LA 1D2WA 1KS3A 4W54A 3NYAA 5J7AA 1L61A 1L16A 140LA 1L36A 4OV0A 3VI0A 3HT7A 3EH3B 173LA 2L6XA 247LA 174LA 1QT3A 3AYMA 3UONA 1BRDA 1L90A 224LA 1L23A 4BV0A 1QTDA 5G2CA 1L06A 1QT7A 1C64A 2I21A 1CVKA 147LA 253LA 2F2QA 1H2SA 3KJ6A 260LA 3UTWA 1OV5A 2RBNA 221LA 1L82A 3HARA 180LA 217LA 4W55A 1X0K1 5AZDA 123LA 1L81A 1G1WA 5C1MA 1C6PA 2Y04A 1NHBA 1L55A 5DYSA 3CODA 226LA 3ZPQA 3UG9A 1R2NA 205LA 5DHGA 1JV6A 3DMZA 4EPFA 2KSBA 4IAQA 4N4YB 1L46A 4L6RA 171LA 1LPYA 1L79A 196LA 2LZMA 5AX1A 3HT6A 2A4TA 1QTZA 1PXRA 5H2PA 5B2NA 3GUNA 3NY9A 5A45A 1L73A 2NTHA 1BRXA 1P46A 139LA 4FPDA 128LA 4S0WA 3HDFA 3QDCA 4JQ6A 4PK0A 4WAVA 1L0JA 2VT4A 1QT4A 191LA 198LA 129LA 145LA 2B7XA 114LA 1L62A 4UHRA 1QUDA 2RBRA 4OO9A 1LYDA 3HAQA 1L43A 4GPOA 4WW3A 3VGAA 1XJIA 1DYBA 1QTVA 4ZPUA 1L85A 2ANVA 2I20A 4XTNA 2EI4A 2HUMA 2R4SA 2YCXA 5H2HA 1EPYA 3HT9A 4BUOA 1P2RA 2JAGA 3QBIA 2YCYA 1L53A 2OE7X 4DAJA 3X3BA 158LA 4BVNA 4PXKA 2PEDA 2LC9A 3DKEX 3HANA 3OE9A 3DQBA 2RBSA 1LGXA 1PY6A 5JJEA 4ARQB 130LA 1Q5IA 5F8UA 1QT8A 222LA 1CV3A 2HPYA 4JR8A 4X32A 183LA 103LA 167LA 4I7KA 3HH4A 4HYXA 126LA 1JTMA 1L51A 1L42A 5AHYA 248LA 5ITEA 4W52A 3L2XA 3SBAA 3EH4B 1OWZA 3VG9A 3T45A 3HTGA 1QHJA 1BM1A 4N4WA 1PQMA 172LA 4ARQA 3PXOA 4G7RB 1L89A 3BVDB 4LZMA 1VJMA 259LA 3AYNA 189LA 1QT6A 3MBVA 1L54A 3C81A 1SX7A 2YCWA 4N6HA 1L97A 111LA 5G53A 1L72A 3ZEVA 2O4WA 1L33A 4GP4B 2BRDA 1HZXA 1JFPA 3DN1A 131LA 3QJUB 5H2IA 252LA 3DDLA 5B6VA 1CUQA 166LA 257LA 2OTZX 244LA 3DNAA 3HUKA 229LA 237LA 218LA 232LA 3SB9A 3FI5A 5TGZA 168LA 3HTFA 3HT8A 2Z6BA 4MBSA 1C61A 3DN6A 163LA 3DN8A 1C8RA 1M0MA 1DYGA 1C6LA 2Y01A 1SX2A 1CU5A 3C7ZA 1L05A 1L09A 1M0KA 3AM6A 1L40A 188LA 155LA 2X72A 110LA 2YCZA 2B6XA 1OYUA 3QJRB 5BR5A 1LYFA 3G3WA 3SB5A 5ITCA 1LYHA 1OVJA 3CDVA 1C6FA 2OU8A 238LA 1KG8A 1L13A 143LA 1C68A 3S3DB 3HU9A 3QBLA 3C8RA 5KKHA 206LA 1E12A 146LA 3OE8A 1PQOA 2J4YA 246LA 5AHZA 5B34A 1EHKB 1L70A 231LA 5LWEA 1C3WA 4HWLA 225LA 1S8JA 1P64A 5A8EA 1C6EA 161LA 3C7YA 1L76A 1L92A 3ODUA 2LNLA 254LA 1L60A 3RZEA 4QIDA 2JAFA 2NTUA 1CU6A 2WJKA 5G54A 1CU2A 3OE0A 251LA 1SSYA 4E97A 148LE 1D3NA 1KW7A 1L35A 1QSQA 160LA 212LA 262LA 4EPIA 1UAZA 4G7QB 4DJHA 5FJGA 1LYEA 2O79A 4GBRB 4I7MA 5H2JA 3S8GB 4XTOA 3GUMA 3SB6A 5EN0A 3FADA 4XXJA 186LA 1LGWA 1LN6A 1DYAA 3K2RA 3QJVB 1C65A 1CV5A 5H2LA 5B6ZA 1LWKA 1KW5A 156LA 1L48A 1LI2A 4GP8B 1PQDA 1DYEA 1L88A 4EKPA 4GBRA 4EXMA 108LA 178LA 1VGOA 3QBKA 1L02A 1L67A 1C69A 3C8QA 1L77A 1QM8A 1L63A 3DN3A 1E0PA 1R84A 3GUKA 1L17A 118LA 3L64A 1GU8A 1JTNA 102LA 1K28A 1L80A 245LA 3UTXA 2Z55A 213LA 1PQJA 1QUOA 3HH5A 1JGJA 1G1VA 4G72B 3G3VA 4MD1A 3OAXA 3S3BB 1P8HA 1L07A 200LA 4PXFA 1L04A 2I35A 2L78A 4W53A 2QPDB 1P5CA 1D9WA 1S8LA 4I7QA 2LCBA 1G0JA 2B74A 2I1XA 3QJQB 1L00A 5H2NA 3DN4A 1XJTA 1KNIA 1L93A 1F88A 1C6JA 1L47A 3PQRA 1L28A 3SB8A 1BRRA 1L45A 5ETZA 3V2YA 1OV7A 1L95A 1KY0A 2R4RA 4ARLA 6LZMA 1L52A 1T6HA 2RAYX 190LA 1D2YA 1QT5A 1KMEA 152LA 1P36A 5JJNA 1P2LA 1C6CA 1L31A 1PQKA 4LDEA 1QKPA 187LA 1L64A 1U19A 2QB0B 4UG2A 4W51A 1CV0A 3D4SA 1Q5JA 3HAOA 3VVKA 1M0LA 234LA 2O7AA 165LA 1L20A 3LZMA 239LA 4A4MA 5DHHA 4FAAB 4QI1A 119LA 1QTBA 4BWBA 243LA 3ABWA 1CWQA 1C60A 1P7SA 184LA 3SN6R 1L03A 1QKOA 1ZYTA 3F8VA 235LA 2ZIYA 2NTGA 3QJSB 3C8SA 3PBLA 2B6ZA 2RBPA 5AX0A 1L96A 228LA 3CDQA 1B6IA 127LA 1LI3A 4QRYA 4GYCA 1AP9A 4I7SA 1S52A 1X0SA 4AQNA 233LA 1L74A 1L87A 1L08A 1QS5A 241LA 4BEZA 1LI6A 5B0WA 1S51A 181LA 120LA 1L14A 240LA 3PDSA 1C62A 1L37A 1ZURA 1L99A 3C80A 4IB4A 4X31A 3OE6A 1L11A 2Q9EA 4EKQA 1L69A 3QBGA 5G2AA 3ZPRA 4G70B 1P37A 1KGBA 4K5YA 2B6WA 3HU8A 1CV6A 1DYDA 2B73A 4YXCA 109LA 1TN5A 1TN0A 1L0KA 1T8FA 4GRVA 192LA 214LA 2QARC 3GUIA 3NS0A 4YXAC 1L12A 5B35A 1G0LA 1F4ZA 210LA 141LA 3CDOA 3EMLA 1C63A 2B72A 3C7WA 1P6YA 2Y00A 2OU0X 4YX7C 151LA 1GUEA 3C9LA 159LA 4IAPA 219LA 1I6SA 4MQTA 1P8IA 1L22A 4LDLA 1PQIA 1X0I1 4MD2A 5H2OA 2RBOA 3QJTB 137LA 4DKLA 5H2KA 162LA 3HTDA 3UTVA 199LA 1L98A 2F32A 3PWHA 1IW6A 2ZZLA 3DN2A 5I14A 1L39A 1FBKA 1L71A 2ZFEA 1JQUA 242LA 1C6QA 3HH3A 2OE4X 3JR6A 1S53A 250LA 2QPEB 157LA 1L41A 1G0KA 2YDOA 4X1HA 4MQSA 1L24A 2WJLA 1L57A 1LW9A 1G06A 1L75A 1S54A 1C6DA 3HAPA 4FA7B 1C6AA 197LA 1L59A 1C6MA 5G28A 104LA 3REYA 1CU0A 4EJ4A 4BEYA 182LA 1G0MA 1L21A 2OTYX 4G7SB 5G36A 3SBBC 3HH6A 4I7OA 4IARA 4I7RA 4XT3A 1L49A 236LA 1TLAA 3GUOA 3CDTA 1C6GA 5JJJA 1KY1A 1CX7A 4NC3A 2AT9A 256LA 209LA 1XIOA 1AT9A 2B70A 5AWZA 1LLHA 1OVKA 5B6XA 2RB0X 2RAZX 5B6WA 1L83A 1L84A 3SB7A 142LA 1ZWNA 4ARMB 1DYCA 1PXSA 7LZMA 4TL3A 5A44A 4W56A 5LZMA 4FBZA 4W58A 1CTWA 3HUAA 3CAPA 1L26A 1G0QA 1L29A 1KG9A 3QAKA 1IXFA 3COCA 1LYIA 1C8SA 1L19A 1QUGA 4W59A 4EKSA 4XTLA 3GULA 4AMIA 112LA 2RH1A 1L32A 2OU9A 4I7NA 2HULA 2KSYA 3C9MA 3NSBA 3RFMA 1L50A 4KNFA 4ARMA 3V2WA 3GUJA 1H68A 1P3NA 4I7LA 1T8GA 1OWYA 1SWZA 3G3XA 1CUPA 1LWGA 1QSBA 258LA 3FA0A 1FBBA 2Z73A 5G2DA 2B6YA 3HWLA 125LA 1G0PA 1P56A 1T8AA 1L56A 4I7PA 2OEAX 1L94A 1CX6A 1L65A 4KLYA 2F93A 3S3CB 1C6HA 1L44A 261LA 1LYJA 201LA 4Y9HA 3UTYA 1L91A 2Y03A 1QTHA 113LA 3WQJA 2RBQA 150LA 1XJUA 2ANXA 3HTBA 2Q9DA 1L38A 1L30A 3QAPA 4ARPA 1T97A 1SSWA 249LA 2G87A 2OE9X 1L68A 1CU3A 1L66A 227LA 1MGYA 230LA 1UCQA 5BR2A 1D3JA 1L9HA 3C82A 3C83A 5H2MA 4AMJA 1L15A 1QUHA 149LA 1C6KA 164LA 2RB1X 4I7TA 223LA 1D3FA 1GZMA 5B6YA 3GUPA 175LA 1C6IA 122LA 4L35A 3DMVA 215LA 4EIYA 1C66A 1G0GA 2B75A 4EKRA 1F50A 2B6TA 1L86A 3HUQA 1C6TA 1CV4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KSAA 1JITA 2F47A 4LFXA 4N8ZA 4JKVA 3W6EA 4NHPA 3QY4A 2CUUA 1L25A 4I7JA 2W1XA 2FBDA 2RB2X 2IGCA 1LSBA 1P8UA 5C6IA 4NHSA 1QUTA 1C6NA 1L18A 3G3AB 4J4QA 3P66A 2YDVA 107LA 1XEPA 255LA 3VHZA 1FKQA 2BQJA 1IP4A 1BB6A 1LGUA 5AMYA 1OUCA 5F9UA 1C67A 3UZAA 4PJZA 3HASA 1LZDA 5LVHA 3EMSA 4H9HA 4H91A 2Y02A 4UWVA 3VW7A 3CB7A 1L61A 1L16A 2X0AA 1IWVA 3HT7A 4LYMA 174LA 1QT3A 1BRDA 4XYYA 5IHGA 2FBBA 1JKDA 224LA 1QTDA 1C64A 3GXRA 253LA 2D4KA 1IP7A 1H2SA 2BQBA 1LKSA 1LJIA 260LA 3ULRA 1OV5A 2IFFY 4ANRA 3HARA 3CT5A 1X0K1 123LA 4OOOA 3N9AA 2I6ZA 4R6CA 2BAAA 5KXTA 1GB8A 3DMZA 1OUEA 4N4YB 1VATA 1DI4A 1L46A 1OUJA 1RI8B 5AX1A 3LZTA 1PXRA 1QTZA 3GUNA 3NY9A 4OWHA 1BRXA 1P46A 2Z19A 4DDCA 4S0WA 1HF4A 1JPOA 4WAVA 1L0JA 4LT1A 3WVXA 4PHIA 1DKKA 1QT4A 191LA 129LA 2B7XA 4UHRA 1QUDA 2RBRA 3HAQA 5B1GA 1QTVA 1LZSA 3A6BY 1WQRA 3HT9A 1OUDA 1P2RA 4LYCA 1HFXA 3QBIA 3X3BA 1GWDA 3WULA 2YBJA 1YAOA 1DI3A 1YL1X 3OE9A 1LSMA 3AB6A 4BS7A 5F8UA 4HPEA 222LA 4X32A 1FLQA 103LA 167LA 4HYXA 4N9RA 2C8PA 5AHYA 4DD3A 1OWZA 1IWUA 4N4WA 1PQMA 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 2RB0 X;  2RAZ X;  5B6W A;  1L83 A;  1L84 A;  3SB7 A;  142L A;  1ZWN A;  4ARM B;  1DYC A;  1PXS A;  7LZM A;  4TL3 A;  5A44 A;  4W56 A;  5LZM A;  4FBZ A;  4W58 A;  1CTW A;  3HUA A;  3CAP A;  1L26 A;  1G0Q A;  1L29 A;  1KG9 A;  3QAK A;  1IXF A;  3COC A;  1LYI A;  1C8S A;  1L19 A;  1QUG A;  4W59 A;  4EKS A;  4XTL A;  3GUL A;  4AMI A;  112L A;  2RH1 A;  1L32 A;  2OU9 A;  4I7N A;  2HUL A;  2KSY A;  3C9M A;  3NSB A;  3RFM A;  1L50 A;  4KNF A;  4ARM A;  3V2W A;  3GUJ A;  1H68 A;  1P3N A;  4I7L A;  1T8G A;  1OWY A;  1SWZ A;  3G3X A;  1CUP A;  1LWG A;  1QSB A;  258L A;  3FA0 A;  1FBB A;  2Z73 A;  5G2D A;  2B6Y A;  3HWL A;  125L A;  1G0P A;  1P56 A;  1T8A A;  1L56 A;  4I7P A;  2OEA X;  1L94 A;  1CX6 A;  1L65 A;  4KLY A;  2F93 A;  3S3C B;  1C6H A;  1L44 A;  261L A;  1LYJ A;  201L A;  4Y9H A;  3UTY A;  1L91 A;  2Y03 A;  1QTH A;  113L A;  3WQJ A;  2RBQ A;  150L A;  1XJU A;  2ANX A;  3HTB A;  2Q9D A;  1L38 A;  1L30 A;  3QAP A;  4ARP A;  1T97 A;  1SSW A;  249L A;  2G87 A;  2OE9 X;  1L68 A;  1CU3 A;  1L66 A;  227L A;  1MGY A;  230L A;  1UCQ A;  5BR2 A;  1D3J A;  1L9H A;  3C82 A;  3C83 A;  5H2M A;  4AMJ A;  1L15 A;  1QUH A;  149L A;  1C6K A;  164L A;  2RB1 X;  4I7T A;  223L A;  1D3F A;  1GZM A;  5B6Y A;  3GUP A;  175L A;  1C6I A;  122L A;  4L35 A;  3DMV A;  215L A;  4EIY A;  1C66 A;  1G0G A;  2B75 A;  4EKR A;  1F50 A;  2B6T A;  1L86 A;  3HUQ A;  1C6T A;  1CV4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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