3QAKA

Agonist bound structure of the human adenosine a2a receptor
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
453
structure length
444
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of an agonist-bound human A2A adenosine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Homo sapien
molecule keywords Adenosine receptor A2a,lysozyme chimera
total genus 167
structure length 444
sequence length 453
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qakA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3qakA01
1JGJA 3EH4B 192LA 1C62A 258LA 3MBVA 142LA 1L31A 232LA 259LA 3C82A 256LA 3HTDA 4W52A 1L99A 4AMIA 1LYEA 2F2QA 1L97A 3HAQA 234LA 1L47A 1L73A 1DYGA 4W51A 1AP9A 1QM8A 211LA 2B6XA 4I7KA 5B34A 1OVJA 4LZMA 1L49A 3HAPA 2OE9X 4EPIA 1QT6A 2OU8A 1OV7A 2WJLA 109LA 1CX7A 1CV1A 1L82A 199LA 3DN8A 4XTLA 129LA 1C6PA 1PQKA 3WQJA 2L6XA 2HUMA 3HT9A 150LA 4EKSA 4W57A 3UTXA 3GUKA 1C3WA 2B6TA 3OE6A 3SB6A 120LA 1VJMA 1L51A 169LA 1C61A 2B70A 161LA 3ZPRA 1L75A 3FI5A 3ODUA 1M0KA 115LA 229LA 1L09A 1L43A 2KSAA 5H2IA 4QI1A 4EKPA 1JV7A 4BVNA 3X3BA 1PQMA 1C6TA 143LA 3K2RA 5H2OA 1LLHA 3T45A 220LA 2LCBA 1QTHA 3SN6R 3D4SA 5I14A 1PQOA 175LA 1WTHA 145LA 113LA 3SBBC 162LA 197LA 4YXAC 4OO9A 1LYIA 1XJTA 1GUEA 1QTBA 219LA 2F32A 1LI2A 5B35A 254LA 233LA 4I7LA 255LA 4YXCA 159LA 3V2YA 3S8GB 176LA 1L58A 1L60A 2OEAX 1PXSA 1L14A 1QHJA 1X0K1 1L01A 3DMVA 1QS9A 1Q5IA 1HZXA 1Q5JA 3VHZA 244LA 190LA 5H2KA 1E0PA 4ARPA 4W55A 4PXFA 1QTZA 205LA 3GUPA 3PDSA 1X0SA 1L10A 2RBOA 4HYXA 4EA3A 3HARA 1KGBA 4J4QA 3VGAA 2RH1A 4G72B 4DJHA 2ANVA 156LA 3CDOA 1U19A 4GPOA 1OYUA 5H2NA 5ITEA 1M0MA 3C7ZA 139LA 3HUKA 1L92A 1OWZA 3C9LA 2NTUA 1L85A 4JR8A 1C6QA 223LA 4EJ4A 4N4YB 114LA 1PY6A 5A45A 1L88A 2RBPA 1S54A 1P2LA 1L25A 2RBQA 1OVKA 1DYDA 2R4RA 2X72A 5AHZA 1LGUA 2RB2X 1CU3A 200LA 245LA 1E12A 2KS9A 1QSBA 4I7NA 1C6JA 1D9WA 1C69A 3VI0A 3HTGA 2IGCA 2NTHA 1CU6A 1CTWA 213LA 1UCQA 5C1MA 3PBLA 3VG9A 122LA 2B6YA 4FPDA 1L38A 1L55A 1D3MA 1QT4A 2QPDB 1L98A 138LA 261LA 2JAFA 1SWZA 2OU0X 3QAKA 3DN3A 171LA 2CUUA 1PQIA 1P6YA 1C60A 1BRRA 2M3GA 3HASA 1L28A 5AWZA 1L21A 3F9LA 3OE0A 1C8RA 1CX6A 1PQJA 4HWLA 4EIYA 5AHYA 157LA 170LA 3DN4A 166LA 1TN5A 1D3FA 1C64A 2ZIYA 2LZMA 5ITCA 3C8QA 4KNFA 1L33A 2ANXA 5H2HA 5BR5A 195LA 3QAPA 4OV0A 1IXFA 1GZMA 1S8LA 1CUPA 209LA 1L20A 1P8HA 4GP8B 4HYJA 3C83A 4PXKA 5B6ZA 4A4MA 1L34A 4QRYA 1L66A 3QBKA 3QJUB 1GU8A 1PQDA 1L16A 191LA 3GUMA 3ZEVA 2B6WA 4ARLA 1L69A 3UTYA 4GP4B 222LA 1L22A 4G70B 4AQNA 214LA 1ZURA 3QJRB 4I7MA 4GYCA 165LA 1C6FA 1L46A 160LA 4FBZA 3F8VA 3C8SA 4I7RA 4K5YA 4XTNA 4GBRA 3VVKA 5B6YA 1K28A 2A4TA 4G71B 206LA 3AYMA 2Y02A 1LYJA 1C63A 1P46A 3UZAA 1QT5A 1P8IA 1CV0A 4QIDA 104LA 1QTDA 3GUOA 1L39A 4X32A 3AM6A 2Z55A 172LA 1KG8A 4GRVA 1P7SA 1L07A 1L42A 1P64A 188LA 3HH5A 3UZCA 1C6BA 3CAPA 3G3WA 3S8FB 1QSQA 3HT6A 2F95A 2QARC 4S0WA 3GULA 239LA 3HAOA 163LA 5FJGA 1BRXA 4I7JA 1G1VA 3COCA 137LA 167LA 1L32A 1QS5A 1X0I1 1L37A 2QPEB 168LA 2O79A 1LGXA 4MD1A 1L90A 1S53A 1L23A 2OE7X 155LA 1IW9A 2EI4A 4DKLA 4XTOA 2OTZX 1OWYA 147LA 4YX7C 1L08A 1L0JA 237LA 3X3CA 1D3JA 3DN0A 3HH4A 1L63A 3GUIA 1SSWA 1XJIA 2Y00A 2ZZLA 3UTVA 4MQSA 1L94A 1LW9A 5G54A 3EMLA 1R2NA 4ARJA 4MQTA 1KY0A 1AT9A 1QUHA 119LA 2Z6BA 108LA 2OTYX 174LA 3L2XA 4W53A 5G53A 1C6IA 1KNIA 1L80A 1T97A 260LA 3CDQA 225LA 5A8EA 1L71A 3C81A 2B73A 2O7AA 1T8AA 186LA 1LYGA 123LA 2RAYX 1FBBA 1IW6A 5ETZA 1DYFA 3CDVA 4LDOA 4BUOA 3NYAA 2Q9EA 3NS0A 1L29A 5AX1A 1LYHA 1L24A 2YCYA 3HWLA 4BWBA 3HTBA 221LA 2I21A 216LA 251LA 3DMXA 1G07A 3GUNA 4IAPA 1S51A 252LA 4KLYA 5EN0A 111LA 1I6SA 1CWQA 1FBKA 127LA 2RB1X 3QJTB 1L0MA 4EPFA 235LA 1QT7A 4BEZA 4IARA 2B6ZA 4W56A 1L96A 4G7RB 1C6LA 1C6GA 3SBAA 4N6HA 1C66A 1L02A 5F8UA 1UAZA 5G2AA 1L15A 5B0WA 1DYEA 1OVHA 5H2PA 1BM1A 180LA 5AX0A 7LZMA 226LA 3KJ6A 1C6CA 1CV5A 1G0LA 3HH6A 246LA 177LA 4GBRB 4XT1A 3HUAA 110LA 185LA 1LPYA 4FA7B 1QTCA 1L45A 1LYFA 1C8SA 1L84A 238LA 5KKHA 1QUOA 1C6AA 3G3XA 1G0QA 4X1HA 201LA 2Q9DA 3RFMA 1LI3A 1P2RA 3PXOA 3DMZA 3DN1A 1L06A 4WW3A 1G0PA 1L64A 4I7OA 4PJZA 1SWYA 1DYAA 1CV4A 1QKOA 1R84A 2B75A 1L30A 4DAJA 2F93A 3HANA 230LA 3A7KA 4LDLA 1QT8A 1L87A 1L00A 3NY9A 1L35A 4JKVA 149LA 3QBIA 4EXMA 1L13A 2I1XA 1EPYA 3L64A 1L76A 224LA 4L35A 2O4WA 1L52A 2RBSA 2WJKA 231LA 1L65A 1CV3A 4NC3A 1L44A 1SX7A 2YCXA 125LA 5DYSA 173LA 228LA 1F50A 1L81A 240LA 4G7SB 1KW5A 5J7AA 118LA 253LA 1DZEA 249LA 3HH3A 3JR6A 3DN2A 3HUQA 2B7XA 1L57A 1D2WA 2I35A 1CU2A 1QTVA 1L79A 102LA 4I7QA 1JFPA 2VT4A 1P37A 1XJUA 2JAGA 1C6MA 1G0KA 4ARMA 1D2YA 1L05A 2LNLA 5G28A 4GP5B 1DYCA 184LA 1QUDA 4WAVA 3RUNA 1G0JA 5A44A 1L36A 1P5CA 1CU0A 1XIOA 3AYNA 3HU8A 1L27A 4N4WA 4L6RA 4W58A 4G7QB 3RZEA 146LA 1L61A 1H68A 182LA 4BV0A 4BEYA 4UHRA 5B2NA 2R4SA 2I20A 198LA 1KY1A 3NY8A 5B6XA 3CDTA 1L62A 2OU9A 2Y03A 3HT8A 1L72A 1BRDA 2NTWA 3UTWA 1MGYA 212LA 4I7TA 2BRDA 3C80A 3UG9A 1LN6A 4UG2A 1C6KA 1L03A 2G87A 1D3NA 2RBRA 3GUJA 2AT9A 2RBNA 1KG9A 2YDVA 1L26A 4ARQA 1KS3A 1T8GA 210LA 4W54A 1L53A 227LA 1C6NA 112LA 2PEDA 144LA 2Y04A 5LZMA 3CDRA 3ABWA 1CV6A 3S3BB 1CU5A 3OE9A 1P3NA 1G1WA 2Z73A 5TGZA 1JTMA 3QBLA 5JJEA 1VGOA 187LA 3C8RA 1L41A 196LA 3SB8A 1L40A 236LA 1ZYTA 4TL3A 2KSBA 3NSBA 247LA 3QJQB 1EHKB 1L68A 3DN6A 3CODA 5H2MA 5DHHA 5LWEA 5B6WA 1TN0A 250LA 5B6VA 1NHBA 262LA 3PWHA 218LA 3QDCA 148LE 1C67A 1L18A 3OE8A 3QBGA 1LWGA 5G2CA 215LA 2YCWA 3S3DB 107LA 1LWKA 1G0GA 5G36A 4Y9HA 140LA 1L50A 1L04A 1C6EA 1P56A 3HTFA 3DDLA 2B74A 2Y01A 3QJSB 5JJNA 2L78A 6LZMA 1OV5A 4PK0A 1JTNA 3C9MA 3HDEA 4IB4A 4AMJA 1XMEB 4ZPUA 3DKEX 151LA 4XT3A 1P36A 2RB0X 1C65A 1C6HA 3G3VA 1CVKA 3SB7A 1L12A 3SB9A 2OE4X 1S52A 2HPYA 3PQRA 1T8FA 241LA 5H2LA 1KW7A 152LA 3ZPQA 3HDFA 2F47A 248LA 1SSYA 1O0AA 1L59A 5H2JA 1L9HA 1M0LA 1QT3A 1F88A 2LC9A 3OAXA 1TLAA 4E97A 3C7WA 3C7YA 131LA 178LA 242LA 1C68A 181LA 1L77A 2ZFEA 3EH5B 1P8UA 257LA 141LA 2QB0B 3DQBA 3QJVB 1ZWNA 183LA 2RAZX 4ARMB 3S3CB 128LA 5BR2A 3VW7A 1G0MA 3P0GA 1L74A 1L56A 4MD2A 1L19A 4IAQA 5JJJA 164LA 4I7SA 3SB5A 1QKPA 1L89A 158LA 130LA 4JQ6A 1JV6A 2YCZA 1L91A 1LGWA 3DNAA 1DYBA 1JQUA 1L11A 1L0KA 2J4YA 3BVDB 1L83A 103LA 1F4ZA 2YDOA 1B6IA 1T6HA 3UONA 3FA0A 2B72A 3EH3B 3V2WA 1C6DA 1PXRA 1SX2A 4MBSA 1H2SA 1LI6A 4X31A 2HUKA 4LDEA 1QUGA 4ARQB 1L17A 4EKQA 4W59A 4I7PA 4EKRA 3FADA 1L95A 2HULA 2KSYA 4FAAB 1XEPA 2NTGA 189LA 1S8JA 5AZDA 1CUQA 1KMEA 3HU9A 3REYA 1G06A 5DHGA 1L54A 3LZMA 3HT7A 1L70A 1LYDA 5G2DA 243LA 1L86A 1L67A 217LA 1L48A 4XXJA 126LA 1L93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IWWA 2RSCA 4I8SA 1LZYA 259LA 5I4XA 1L99A 234LA 4W51A 1OVJA 2ZQ4A 1L49A 4GLAA 2WJLA 1CV1A 3DN8A 1OUFA 4XTLA 3WQJA 1IO5A 2L6XA 150LA 1HEWA 4EKSA 1BB4A 3UTXA 4H8XA 4NFVA 1VJMA 120LA 1L51A 4GN3A 2B70A 5D5CA 2ZIKA 1B5YA 1L43A 4EKPA 4BVNA 1VATA 4NSHA 1JPOA 3T45A 4PRUA 4GCFA 5KXPA 1QTHA 5I14A 1PQOA 113LA 4WLYA 4YXAC 4OO9A 2BQAA 2CWIA 1GUEA 4PJ2C 3IJVA 1L58A 1L60A 2OEAX 4NWHA 133LA 4Z98A 1FKVA 1L01A 5LA5A 4H8ZA 1HZXA 1C46A 244LA 4ARPA 1QTZA 3PDSA 1X0SA 1L10A 2RBOA 3D3DA 4J4QA 4GCDA 1LZNA 2RH1A 1XSFA 1BWJA 1LYYA 5LVGA 3RT5X 2YBJA 4GPOA 2D4IA 1M0MA 139LA 1OWZA 4G9SA 1L85A 5A3EA 4N4YB 4ETEA 1UCOA 1KIRC 1WTNA 114LA 5A45A 1HFXA 2RBPA 1P2LA 1QUTA 2RBQA 4MSTA 1OVKA 1TEWA 4QDNA 5AHZA 3WMKA 1WQOA 4H9EA 200LA 245LA 1WVVA 4I7NA 2CGIA 1C6JA 1D9WA 4LZTA 1CU6A 213LA 2BQNA 3VG9A 3PBLA 1LHHA 1L38A 1D3MA 4HJZA 2Z12A 1CJ7A 1SQ2L 1WQNA 4WL6A 1PQIA 1ZVYB 2BPUA 4FJRA 5AWZA 1VDPA 3OE0A 1KIPC 170LA 4G4CA 5LIOA 3TXEA 3DN4A 1TN5A 3AZ6A 4WG1A 5HLLA 1MELL 207LA 1D0MA 3RZ4A 1IP2A 1IWYA 4OV0A 1IXFA 3RU5A 5B6ZA 1B7OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1QKO A;  1R84 A;  2B75 A;  1L30 A;  4DAJ A;  2F93 A;  3HAN A;  230L A;  3A7K A;  4LDL A;  1QT8 A;  1L87 A;  1L00 A;  3NY9 A;  1L35 A;  4JKV A;  149L A;  3QBI A;  4EXM A;  1L13 A;  2I1X A;  1EPY A;  3L64 A;  1L76 A;  224L A;  4L35 A;  2O4W A;  1L52 A;  2RBS A;  2WJK A;  231L A;  1L65 A;  1CV3 A;  4NC3 A;  1L44 A;  1SX7 A;  2YCX A;  125L A;  5DYS A;  173L A;  228L A;  1F50 A;  1L81 A;  240L A;  4G7S B;  1KW5 A;  5J7A A;  118L A;  253L A;  1DZE A;  249L A;  3HH3 A;  3JR6 A;  3DN2 A;  3HUQ A;  2B7X A;  1L57 A;  1D2W A;  2I35 A;  1CU2 A;  1QTV A;  1L79 A;  102L A;  4I7Q A;  1JFP A;  2VT4 A;  1P37 A;  1XJU A;  2JAG A;  1C6M A;  1G0K A;  4ARM A;  1D2Y A;  1L05 A;  2LNL A;  5G28 A;  4GP5 B;  1DYC A;  184L A;  1QUD A;  4WAV A;  3RUN A;  1G0J A;  5A44 A;  1L36 A;  1P5C A;  1CU0 A;  1XIO A;  3AYN A;  3HU8 A;  1L27 A;  4N4W A;  4L6R A;  4W58 A;  4G7Q B;  3RZE A;  146L A;  1L61 A;  1H68 A;  182L A;  4BV0 A;  4BEY A;  4UHR A;  5B2N A;  2R4S A;  2I20 A;  198L A;  1KY1 A;  3NY8 A;  5B6X A;  3CDT A;  1L62 A; 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 1JTN A;  3C9M A;  3HDE A;  4IB4 A;  4AMJ A;  1XME B;  4ZPU A;  3DKE X;  151L A;  4XT3 A;  1P36 A;  2RB0 X;  1C65 A;  1C6H A;  3G3V A;  1CVK A;  3SB7 A;  1L12 A;  3SB9 A;  2OE4 X;  1S52 A;  2HPY A;  3PQR A;  1T8F A;  241L A;  5H2L A;  1KW7 A;  152L A;  3ZPQ A;  3HDF A;  2F47 A;  248L A;  1SSY A;  1O0A A;  1L59 A;  5H2J A;  1L9H A;  1M0L A;  1QT3 A;  1F88 A;  2LC9 A;  3OAX A;  1TLA A;  4E97 A;  3C7W A;  3C7Y A;  131L A;  178L A;  242L A;  1C68 A;  181L A;  1L77 A;  2ZFE A;  3EH5 B;  1P8U A;  257L A;  141L A;  2QB0 B;  3DQB A;  3QJV B;  1ZWN A;  183L A;  2RAZ X;  4ARM B;  3S3C B;  128L A;  5BR2 A;  3VW7 A;  1G0M A;  3P0G A;  1L74 A;  1L56 A;  4MD2 A;  1L19 A;  4IAQ A;  5JJJ A;  164L A;  4I7S A;  3SB5 A;  1QKP A;  1L89 A;  158L A;  130L A;  4JQ6 A;  1JV6 A;  2YCZ A;  1L91 A;  1LGW A;  3DNA A;  1DYB A;  1JQU A;  1L11 A;  1L0K A;  2J4Y A;  3BVD B;  1L83 A;  103L A;  1F4Z A;  2YDO A;  1B6I A;  1T6H A;  3UON A;  3FA0 A;  2B72 A;  3EH3 B;  3V2W A;  1C6D A;  1PXR A;  1SX2 A;  4MBS A;  1H2S A;  1LI6 A;  4X31 A;  2HUK A;  4LDE A;  1QUG A;  4ARQ B;  1L17 A;  4EKQ A;  4W59 A;  4I7P A;  4EKR A;  3FAD A;  1L95 A;  2HUL A;  2KSY A;  4FAA B;  1XEP A;  2NTG A;  189L A;  1S8J A;  5AZD A;  1CUQ A;  1KME A;  3HU9 A;  3REY A;  1G06 A;  5DHG A;  1L54 A;  3LZM A;  3HT7 A;  1L70 A;  1LYD A;  5G2D A;  243L A;  1L86 A;  1L67 A;  217L A;  1L48 A;  4XXJ A;  126L A;  1L93 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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