3RZEA

Structure of the human histamine h1 receptor in complex with doxepin
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
435
structure length
428
Chain Sequence
MPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHRREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histamine H1 receptor, Lysozyme chimera
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 147
structure length 428
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3rzeA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3rzeA01
182LA 2O79A 1SWYA 1KGBA 1C6AA 4IAQA 1BRRA 158LA 3LZMA 3CODA 4X31A 226LA 4XTOA 1L52A 1CU2A 4WAVA 2O4WA 3FADA 180LA 1C6HA 112LA 159LA 1G0MA 3GUNA 3UTYA 1L91A 199LA 2WJKA 205LA 1JTNA 2OEAX 3HT7A 111LA 3DN6A 4EKQA 3G3XA 3DN2A 1AT9A 5JJJA 1L44A 1L72A 3ZPQA 1P37A 119LA 1P7SA 137LA 3CDTA 2B70A 3QBIA 3QJRB 2NTWA 3GUIA 3HT6A 188LA 2NTUA 238LA 247LA 1P5CA 1L02A 256LA 1L74A 1L60A 3CDRA 162LA 1L62A 3C7WA 4FA7B 1VGOA 2RBOA 3HTFA 4N4WA 1GUEA 5AHZA 1L73A 3HDFA 3C80A 1DYDA 1L85A 5A44A 4MQSA 145LA 1C6IA 1CX6A 4I7NA 4I7OA 113LA 1OYUA 1L66A 1P36A 3HU8A 1L57A 4I7KA 2F95A 5TGZA 1IXFA 3UG9A 200LA 4HYJA 4MQTA 1C6LA 3EMLA 260LA 1KW5A 1L10A 3EH4B 5H2HA 3C82A 1C3WA 3GUKA 1P64A 1P8IA 4YX7C 1B6IA 1BRXA 1LYJA 1IW9A 1LPYA 3DN0A 4PJZA 4EXMA 1L13A 3VG9A 4A4MA 222LA 4PXFA 2Q9EA 1EPYA 3PXOA 4AMJA 5LWEA 5B6VA 4G72B 1L97A 235LA 2ZFEA 4G70B 5H2OA 5DYSA 1LLHA 151LA 2QPDB 1D2WA 1P2LA 4EKRA 3P0GA 4I7PA 3HTGA 209LA 1M0KA 1LI6A 3NY8A 4ARJA 1I6SA 4N6HA 1G1WA 1PXRA 1L61A 1R84A 5G54A 1L75A 1QT6A 5LZMA 1DYAA 3UZCA 1C6BA 3UONA 4ARMB 1JV6A 4OO9A 2Z6BA 3JR6A 4HYXA 3FA0A 1ZWNA 5DHHA 2NTGA 5B6YA 5AX0A 4KLYA 5B35A 198LA 4K5YA 2ANVA 4ARQB 3PDSA 4LDOA 138LA 3C9MA 4I7MA 1DYBA 4XT1A 166LA 5ETZA 1LYEA 1QT8A 4L35A 4EPFA 1G0LA 240LA 249LA 5BR2A 3QJQB 2B6XA 4TL3A 3NYAA 1CU3A 4GRVA 4UHRA 1L53A 253LA 147LA 176LA 2F93A 228LA 1C6EA 3PBLA 3PWHA 3NS0A 4L6RA 4W59A 3DN8A 3RZEA 5ITEA 3HUQA 1C6JA 4IARA 4FPDA 126LA 3T45A 215LA 1C6FA 4GBRB 3AM6A 5B6XA 156LA 4LDLA 5B34A 2ZIYA 4I7JA 4JKVA 2Y00A 1OVHA 3S3BB 177LA 1L65A 3GUMA 3NY9A 1L89A 2B75A 3L2XA 102LA 172LA 245LA 3GULA 1DYFA 233LA 1QT3A 170LA 1R2NA 1QTZA 4YXCA 139LA 4X1HA 4XT3A 1CVKA 1KY0A 1AP9A 150LA 261LA 1L06A 1LGWA 168LA 103LA 220LA 1S54A 1DYEA 2JAGA 1UCQA 1OWZA 201LA 1BRDA 1LWKA 1JFPA 3QJSB 1L95A 1L0KA 2QPEB 1KG9A 2I21A 3HUAA 3GUJA 2L6XA 1L50A 1SSYA 217LA 3HAQA 1T6HA 192LA 1KNIA 1LYGA 2Y02A 211LA 258LA 1C63A 2VT4A 173LA 185LA 1G0PA 2R4RA 5JJNA 1QSBA 3DDLA 1G07A 1L07A 1FBKA 1L87A 1G0KA 1C6MA 1L37A 161LA 3HU9A 3EH5B 1L39A 1OVKA 4AMIA 1L34A 3BVDB 1L25A 5C1MA 3ZEVA 1L09A 4EPIA 3G3WA 122LA 1LYDA 262LA 1L70A 143LA 1C66A 1L51A 1PQKA 1L14A 1XJUA 3CDQA 4PK0A 3AYNA 3QDCA 1CV0A 2LZMA 2RB2X 2Z73A 1S51A 1S8LA 4G7QB 1CWQA 1L0JA 3GUPA 1L47A 1QTDA 5G28A 3VHZA 5B2NA 4G7SB 4BEYA 1SWZA 1L18A 4ARLA 130LA 1L22A 2HULA 2AT9A 206LA 237LA 2KS9A 3HARA 4W54A 1P2RA 244LA 4FBZA 3HUKA 1L9HA 3UTXA 2ANXA 1L11A 1QUHA 2I1XA 1L12A 1L27A 2Q9DA 2A4TA 1L55A 1L00A 2NTHA 1L82A 1L71A 186LA 4W51A 232LA 2B72A 5BR5A 1F50A 1CTWA 1L03A 1FBBA 191LA 1T8AA 1EHKB 3C8SA 3QBGA 1SX7A 2RBPA 3SB6A 5G53A 219LA 4N4YB 2F32A 174LA 1C68A 1L31A 4WW3A 152LA 1QUDA 155LA 1L40A 1L69A 241LA 5H2NA 3PQRA 1L49A 1L04A 4G7RB 128LA 3SB8A 3QBKA 1L88A 3QJUB 5ITCA 2RBNA 1P6YA 3HANA 3S8FB 3OE9A 3QAPA 1G1VA 1OVJA 3HH6A 230LA 3OAXA 1QUGA 1CU0A 1C64A 4EA3A 5B6ZA 1L35A 1CX7A 1O0AA 1D2YA 1BM1A 157LA 3S8GB 1L64A 1L92A 3HDEA 1C69A 3OE8A 164LA 3HAOA 3HH5A 1C6PA 2RAYX 3COCA 216LA 1PQDA 5EN0A 1LYHA 1K28A 127LA 169LA 1LI3A 2OU9A 1CV6A 1PQMA 2RBQA 3HT9A 141LA 146LA 1CUPA 3KJ6A 1XEPA 3C7ZA 1GU8A 2OU8A 1L93A 3DMXA 148LE 1C8RA 2O7AA 3MBVA 3ABWA 2Y03A 1L83A 4I7SA 1KG8A 1Q5JA 3UTWA 3K2RA 3REYA 3DN4A 242LA 1P56A 3DN1A 1D3JA 1QM8A 190LA 248LA 221LA 1L90A 3ZPRA 2B6YA 1SSWA 4ZPUA 4ARPA 1H68A 1LWGA 5J7AA 224LA 3L64A 4I7LA 227LA 5G36A 1C6QA 2F47A 3SB5A 1C67A 5B0WA 1HZXA 3S3CB 4GP4B 1MGYA 1QTHA 1H2SA 4E97A 5JJEA 1CUQA 131LA 3C9LA 1P8HA 3HH3A 1T8GA 3FI5A 5AHYA 2YCWA 1LGUA 1LYIA 2YCZA 1XIOA 2HUKA 3C83A 3SN6R 197LA 4GBRA 4OV0A 4IAPA 231LA 4LZMA 2LCBA 2RB0X 2B6TA 4YXAC 3GUOA 1DYGA 2OE7X 5KKHA 1E0PA 4W56A 1OV5A 3A7KA 1QT7A 3NSBA 1XMEB 1D3NA 1M0LA 1L98A 1C60A 1TN5A 1ZYTA 1QT5A 4JR8A 212LA 108LA 1L38A 2B73A 1F88A 1NHBA 4Y9HA 1KW7A 1LI2A 144LA 1C6GA 3HTBA 1L23A 2OU0X 3S3DB 118LA 109LA 160LA 1L56A 5AWZA 3CAPA 4QI1A 1LGXA 5I14A 3DNAA 3VGAA 1C65A 4S0WA 4W57A 1QKPA 1L17A 1L81A 1L29A 2B7XA 4G71B 4HWLA 4IB4A 140LA 171LA 1G06A 4BWBA 236LA 4GP5B 4I7QA 1DZEA 1CV4A 5H2KA 3WQJA 1S52A 3HAPA 4LDEA 1C6DA 4W55A 5AZDA 4GP8B 3CDOA 250LA 255LA 1CV3A 1F4ZA 1CU6A 3V2WA 4KNFA 4MD1A 1L59A 5F8UA 1JGJA 1X0K1 3HTDA 1E12A 3VW7A 1L26A 4QRYA 3SB7A 1L86A 2RAZX 1PY6A 4BEZA 3F9LA 1L43A 2BRDA 1UAZA 1L68A 1QS9A 259LA 2RBRA 1G0JA 1KY1A 115LA 4DJHA 2R4SA 4BUOA 3AYMA 4JQ6A 1JTMA 4MD2A 1SX2A 2QB0B 175LA 1IW6A 1L79A 1L94A 195LA 1L46A 1GZMA 1LN6A 1S8JA 2HUMA 1L20A 4XTNA 3OE6A 3SBBC 218LA 3UZAA 3C8QA 1L36A 1L58A 107LA 1VJMA 114LA 3VI0A 1L33A 1ZURA 1OV7A 4X32A 1KS3A 2RBSA 4W58A 2PEDA 1L19A 1D9WA 1L0MA 1G0GA 3F8VA 4EKSA 2LNLA 1L45A 1T8FA 2KSBA 2YDVA 1D3MA 1PQIA 1JV7A 1L32A 1OWYA 1C6KA 123LA 3DN3A 1L16A 1XJIA 5H2IA 2B74A 2LC9A 5A8EA 1L84A 5H2LA 178LA 4FAAB 1P8UA 1L24A 1L96A 3C81A 6LZMA 1D3FA 1C6CA 3CDVA 1L67A 1QHJA 2ZZLA 2WJLA 254LA 1LYFA 2G87A 4DKLA 1CV1A 2YCYA 2B6WA 2L78A 1L08A 1JQUA 3G3VA 1QSQA 4EKPA 251LA 4AQNA 2I20A 2YDOA 5H2PA 3SB9A 2OE4X 4NC3A 1XJTA 2KSYA 1M0MA 3D4SA 3QAKA 2YCXA 2I35A 3HH4A 149LA 1CV5A 243LA 2OTZX 3QJTB 129LA 3DKEX 213LA 3HASA 167LA 1TLAA 239LA 4ARMA 2JAFA 1C61A 2QARC 4GYCA 5A45A 2M3GA 3RUNA 1PXSA 4QIDA 1X0SA 165LA 5H2MA 3HT8A 189LA 2EI4A 1L76A 246LA 1L41A 2F2QA 3C7YA 163LA 1CU5A 1U19A 3QJVB 2KSAA 4ARQA 1L63A 1WTHA 214LA 2OTYX 3C8RA 4EIYA 223LA 3RFMA 229LA 1L01A 104LA 5G2DA 5G2CA 5AX1A 3X3CA 1Q5IA 1T97A 5DHGA 1L77A 1P3NA 252LA 2Y04A 5B6WA 1QTBA 7LZMA 1TN0A 4W52A 4J4QA 4I7TA 1PQOA 184LA 2RB1X 1L54A 4DAJA 120LA 1C6NA 2X72A 4XTLA 1LW9A 225LA 183LA 1DYCA 1X0I1 210LA 2Y01A 4BV0A 1QKOA 1L80A 1L99A 2RH1A 3V2YA 4I7RA 1L48A 4EJ4A 1G0QA 1P46A 3DMZA 3HWLA 1L05A 1QTVA 1PQJA 1S53A 1L21A 2J4YA 1L15A 3SBAA 1C62A 3DMVA 3EH3B 3VVKA 1KMEA 4W53A 1QUOA 2B6ZA 196LA 1L28A 3QBLA 3OE0A 1C6TA 1QS5A 5H2JA 1QTCA 1QT4A 2CUUA 2OE9X 142LA 2IGCA 4GPOA 3X3BA 5G2AA 125LA 187LA 4BVNA 3UTVA 1L30A 4MBSA 110LA 3ODUA 2HPYA 3DQBA 234LA 181LA 1C8SA 4PXKA 4XXJA 4UG2A 1L42A 5FJGA 257LA 2Z55A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HEFA 1KGBA 4IAQA 158LA 3LZMA 3CODA 3AGGG 3WUAA 2D4IA 2O4WA 3IJUA 1G0MA 3TXEA 1JTNA 3CSZA 1B9OA 1IO5A 1IOCA 3DN6A 1LCNA 1D6PA 5AMYA 119LA 1P7SA 137LA 3HT6A 3FE0A 247LA 1P5CA 1L02A 4DQJA 4ETDA 4ET9A 1L74A 3CDRA 4ET8A 3HDFA 3C80A 1YROA 1C6IA 4I7OA 1OYUA 3HU8A 1J1OY 4Z3MA 4LYOA 260LA 1KW5A 2W1YA 1BB4A 3C82A 1B7LA 2Y8PA 1P8IA 4YX7C 1LSZA 1IW9A 3P64A 4PHIA 1LPYA 4LT0A 4G70B 5DYSA 2HECA 1P2LA 1IOQA 1NBYC 3P0GA 1M0KA 1LI6A 1H87A 1BWHA 194LA 3D9AC 5L3HA 4WL7A 3B0IA 1L75A 5LZMA 1DYAA 3UZCA 3UONA 1AT5A 2NWDX 4OO9A 1KIRC 4HYXA 1YKXX 5D5FA 1OUAA 1ZWNA 2NTGA 1AM7A 4KLYA 5B35A 1HSXA 4ARQB 3PDSA 3AW6A 4I7MA 166LA 1LYEA 1QT8A 1TCYA 5FHWA 3LZ2A 4DDAA 1DXJA 5LINA 3A8ZA 1CU3A 4UHRA 253LA 176LA 3RZ4A 3PBLA 1LHHA 3DN8A 1NQIA 2LYOA 1C6JA 1B7MA 1RFPA 1RCMA 2BAAA 4NGYA 153LA 2ZIYA 3P68A 177LA 3NY9A 4NIJA 3L2XA 102LA 1VEDA 3GULA 3G3BB 2Z18A 134LA 4IJ4A 1DYFA 233LA 1GF0A 1GF4A 1LZCA 4YXCA 139LA 4X1HA 1EQ5A 1GWDA 168LA 103LA 2JAGA 1UCQA 5ILFA 2MEBA 3A95A 3QJSB 5FSTA 2BQHA 1L50A 1KNIA 211LA 185LA 1G0PA 2DKVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KME A;  4W53 A;  1QUO A;  2B6Z A;  196L A;  1L28 A;  3QBL A;  3OE0 A;  1C6T A;  1QS5 A;  5H2J A;  1QTC A;  1QT4 A;  2CUU A;  2OE9 X;  142L A;  2IGC A;  4GPO A;  3X3B A;  5G2A A;  125L A;  187L A;  4BVN A;  3UTV A;  1L30 A;  4MBS A;  110L A;  3ODU A;  2HPY A;  3DQB A;  234L A;  181L A;  1C8S A;  4PXK A;  4XXJ A;  4UG2 A;  1L42 A;  5FJG A;  257L A;  2Z55 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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