3RZEA

Structure of the human histamine h1 receptor in complex with doxepin
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
435
structure length
428
Chain Sequence
MPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHRREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histamine H1 receptor, Lysozyme chimera
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 147
structure length 428
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3rzeA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3rzeA01
4IAPA 2PEDA 1C6JA 1TN5A 3HH6A 1L40A 130LA 1KMEA 4A4MA 1BRDA 213LA 4ARMB 2F2QA 2OU9A 3QJUB 1L60A 1L00A 256LA 3OE6A 1L21A 1QUHA 4FPDA 188LA 3HTFA 3QDCA 1D2YA 3HUAA 2NTHA 1LYIA 1L44A 1C6CA 1L05A 210LA 3QAKA 3DN6A 244LA 3EMLA 4PJZA 1XMEB 2G87A 1QTZA 2WJKA 2Z73A 2B74A 1H68A 164LA 3HASA 4MQTA 4G7SB 5B6XA 1L20A 2L78A 2B70A 3NY8A 1L55A 1DZEA 3HANA 1L69A 3AM6A 149LA 3HT7A 3SBAA 4DJHA 1ZURA 3QJSB 4FAAB 1L02A 1B6IA 4BEZA 3OAXA 3UTYA 1C3WA 180LA 5G36A 1E0PA 4I7QA 4X32A 1OV7A 173LA 187LA 3GUOA 1F50A 246LA 1T6HA 4EKPA 1SSWA 4KNFA 3C7ZA 3NSBA 1K28A 1T8GA 3QBIA 1NHBA 5B6ZA 5B34A 4I7PA 252LA 235LA 1CUQA 2NTGA 1L87A 147LA 3PBLA 2ANVA 3GUNA 152LA 4L6RA 2F93A 1MGYA 1DYCA 118LA 1L35A 114LA 2RAZX 218LA 3HWLA 3L64A 229LA 104LA 4I7SA 1DYGA 5BR2A 2HUMA 156LA 5G53A 1C6HA 3FADA 4ARQA 3NYAA 3DN4A 1C66A 1QT5A 1L31A 3HH3A 3RUNA 1CV0A 1L53A 5KKHA 4GPOA 1L46A 3QJTB 1FBKA 233LA 5AZDA 1L04A 4GBRB 1R2NA 1G0LA 4EPIA 1C65A 1G1WA 1L37A 1C6PA 1C6KA 1L54A 2Y04A 123LA 4BWBA 3HDEA 3C8QA 171LA 198LA 189LA 2HULA 3L2XA 3D4SA 4TL3A 1DYEA 1QTCA 230LA 1C69A 4W54A 5B6WA 2YDVA 1PQMA 2I20A 2JAFA 4IB4A 5AHZA 5I14A 2Z55A 1F88A 4LDOA 1LWKA 3C8SA 1CWQA 2Y00A 3UTXA 178LA 1C6NA 3T45A 1QTVA 195LA 4W53A 1LI6A 1JV6A 1L28A 1C6EA 122LA 192LA 3P0GA 1KG8A 1QS9A 3HH4A 3X3CA 3HAPA 239LA 1S51A 1L29A 157LA 3DKEX 1TN0A 191LA 1L66A 1D9WA 197LA 1BRXA 2WJLA 1D2WA 1L09A 1D3MA 1XJUA 1L38A 3PQRA 2B7XA 3X3BA 232LA 1BRRA 2O4WA 2LNLA 209LA 254LA 4FA7B 1LYHA 249LA 3CAPA 3DN8A 1OVJA 4EXMA 1LI3A 234LA 1KY1A 1L61A 3S8GB 172LA 2M3GA 4W56A 4JQ6A 5LWEA 2RAYX 4EKRA 2F32A 5H2HA 258LA 1C6AA 1S54A 3EH5B 2YCZA 1C6BA 1P2RA 231LA 143LA 4YX7C 215LA 174LA 3DQBA 4XTOA 3CDTA 4YXAC 3LZMA 1JQUA 1X0SA 2EI4A 1L32A 4MBSA 5A44A 1L48A 1C6DA 2RBSA 221LA 5H2MA 4ARLA 1L49A 3SB7A 1L47A 4L35A 4AQNA 4N4WA 1L67A 1QHJA 3UZCA 140LA 1CX7A 3AYNA 4HYXA 5AHYA 1LGWA 4I7NA 4GBRA 1L19A 3K2RA 1C6QA 1G0KA 216LA 138LA 4G72B 4BEYA 2LCBA 5H2KA 2OE4X 4BVNA 4PXKA 3CDRA 1L95A 3QJQB 168LA 1C63A 1L83A 3RZEA 4GP4B 4N4YB 200LA 5B35A 158LA 3GUIA 1P37A 1L34A 255LA 1L23A 250LA 1O0AA 4I7KA 1LYDA 4IARA 1M0KA 5AX1A 1C64A 1G06A 5BR5A 3OE9A 4OO9A 3GUJA 1L62A 2RH1A 5AX0A 4LZMA 3GUPA 4G70B 1P56A 1M0LA 2Y01A 1P36A 1IXFA 1L84A 2YCYA 3CDOA 4W57A 3PXOA 1TLAA 4QI1A 1L51A 5B0WA 176LA 2B6XA 4IAQA 2RBQA 115LA 3S3CB 1CV4A 1LYGA 160LA 2OTYX 1L82A 5H2JA 1L81A 2Z6BA 5J7AA 3VVKA 3GULA 3V2WA 3ZEVA 1P2LA 1C6GA 148LE 1QSBA 3A7KA 1CUPA 4Y9HA 1KGBA 1PQOA 3F8VA 241LA 1L45A 1L39A 4HWLA 3C83A 3NY9A 3HT8A 1JFPA 4I7RA 5B2NA 2LC9A 3COCA 260LA 1D3JA 1P7SA 4EPFA 1EPYA 2ZZLA 3HDFA 1LYJA 2BRDA 167LA 1C60A 1P5CA 2I21A 2L6XA 2YCWA 4JR8A 3UZAA 5B6YA 2IGCA 3DN1A 1C68A 1LN6A 1LYEA 4X31A 3UG9A 3DN0A 2KSAA 5JJEA 1G07A 181LA 4YXCA 2KS9A 1P8HA 1L03A 1L16A 3OE0A 1SX7A 1L74A 5C1MA 1L42A 131LA 2A4TA 3VW7A 2NTWA 3DMVA 1L06A 4ARMA 3QBGA 5DHHA 2CUUA 4W52A 3QAPA 2Q9EA 1Q5JA 3S3DB 110LA 5G2DA 3ZPQA 2R4SA 5H2PA 1L43A 1P64A 1L65A 1L90A 1OWZA 185LA 2YCXA 1LLHA 4DKLA 1CV6A 1DYBA 3GUMA 220LA 1L18A 243LA 1GZMA 2I35A 1WTHA 3ZPRA 247LA 3MBVA 5ITEA 4GYCA 238LA 3C7YA 4I7TA 4I7MA 1L77A 1GU8A 1U19A 1L13A 5H2NA 1L57A 201LA 4HYJA 1CTWA 182LA 1L52A 5ETZA 1CU5A 4ARJA 2OTZX 5JJNA 1L0JA 1L12A 2RBRA 1C6MA 1DYDA 3FI5A 1E12A 1L76A 3DMXA 2OEAX 1L97A 2RB2X 2O7AA 5AWZA 139LA 137LA 1G0MA 1KW7A 1UCQA 1UAZA 169LA 1L64A 1XEPA 4LDLA 5EN0A 2B72A 1PQIA 217LA 248LA 103LA 1PXSA 170LA 2RBPA 1ZWNA 1L99A 1QT6A 3C8RA 1KG9A 2QPEB 1C6IA 4GP5B 4AMIA 2B73A 1P46A 251LA 259LA 1S8JA 1PQDA 2Q9DA 2Y03A 3S3BB 1CV5A 3EH3B 4GP8B 5G2AA 1L41A 1D3NA 4E97A 2Y02A 1L86A 1SWZA 226LA 3V2YA 1S8LA 2F95A 3CDQA 219LA 3DMZA 1IW6A 3ABWA 5A8EA 1L88A 4G7RB 3HTGA 1DYFA 2QPDB 4QRYA 4EKSA 4UG2A 4EJ4A 107LA 3VHZA 1SX2A 3HTDA 2ZIYA 4BUOA 1SWYA 2F47A 1PQJA 3HARA 4ARQB 4W59A 1L14A 4XTLA 1C61A 1XJIA 4G7QB 2OU0X 242LA 128LA 5FJGA 3CDVA 4XXJA 1C67A 1L01A 1XJTA 1H2SA 1CU2A 1X0K1 4BV0A 3VGAA 1AT9A 3QBLA 1EHKB 1C62A 1PQKA 3JR6A 6LZMA 245LA 1L79A 1QTDA 3KJ6A 1AP9A 1PXRA 3C9LA 1OWYA 4EA3A 3AYMA 175LA 1CVKA 1QSQA 151LA 1LYFA 1L72A 1L30A 4G71B 3C7WA 5G2CA 1VJMA 1BM1A 2QB0B 1L93A 1P3NA 4JKVA 2LZMA 3C82A 2O79A 3SN6R 119LA 1P6YA 3SB5A 1S52A 3PWHA 3C81A 145LA 166LA 3ODUA 5F8UA 1OV5A 3HU8A 1S53A 4K5YA 3G3VA 4OV0A 1JTMA 4FBZA 150LA 3VG9A 1G0PA 199LA 4W51A 240LA 1F4ZA 2VT4A 1L58A 109LA 1L25A 1Q5IA 1L68A 159LA 186LA 2NTUA 4X1HA 212LA 1QT3A 1L63A 196LA 1X0I1 162LA 4I7OA 3UTWA 257LA 1L07A 3HAQA 4PK0A 165LA 1C6FA 3CODA 1HZXA 2AT9A 1DYAA 3QJRB 5JJJA 1CV1A 111LA 1KNIA 1L71A 5H2OA 102LA 1T8AA 4NC3A 1C6LA 1L73A 2ZFEA 112LA 1CU6A 3FA0A 2B75A 3PDSA 1CV3A 3SB9A 2HPYA 3NS0A 4KLYA 3SB6A 1PY6A 2RBNA 2X72A 1M0MA 2J4YA 4J4QA 1L33A 4I7LA 183LA 1G1VA 1ZYTA 1L89A 2R4RA 1QUDA 3HAOA 1L85A 2RB1X 1C8RA 1G0QA 3WQJA 1OVHA 1CX6A 4MQSA 3HUQA 3HH5A 4N6HA 1KW5A 1LGXA 3RFMA 3DDLA 1L15A 4UHRA 2I1XA 1L91A 1L94A 3G3WA 4MD2A 1FBBA 253LA 2B6ZA 5H2LA 1P8UA 141LA 228LA 2B6WA 2RB0X 1QS5A 142LA 1OVKA 1L36A 1OYUA 1QT7A 205LA 4LDEA 3C9MA 2KSYA 129LA 4S0WA 2OU8A 3F9LA 4DAJA 1GUEA 177LA 5G54A 127LA 1L98A 2RBOA 4ARPA 5TGZA 227LA 3S8FB 1L17A 3SBBC 3REYA 125LA 5B6VA 1L70A 2B6TA 4XT3A 4ZPUA 4AMJA 5ITCA 1QKOA 2HUKA 1L9HA 1VGOA 3HU9A 1L0MA 1C6TA 2B6YA 2OE9X 1D3FA 1P8IA 2KSBA 261LA 1L56A 1QUOA 3G3XA 1XIOA 2QARC 4EIYA 1L80A 4W55A 1LW9A 2JAGA 4QIDA 1QT8A 3QBKA 2YDOA 225LA 4WAVA 1LWGA 1L75A 3DN3A 262LA 1CU0A 1KS3A 1JTNA 113LA 3C80A 3SB8A 2OE7X 2ANXA 144LA 5A45A 190LA 1I6SA 4W58A 1G0GA 1L59A 1QTHA 1IW9A 1C8SA 237LA 3OE8A 5H2IA 155LA 223LA 206LA 1QUGA 1SSYA 3BVDB 211LA 3QJVB 1LPYA 4EKQA 222LA 1L10A 1G0JA 1LGUA 1QKPA 1L22A 4I7JA 1KY0A 108LA 5DYSA 3DNAA 3HT6A 146LA 3UONA 1L50A 1LI2A 1L08A 4XTNA 5G28A 3VI0A 4PXFA 236LA 3HT9A 126LA 1JGJA 1R84A 163LA 5LZMA 7LZMA 1T97A 224LA 1QT4A 120LA 161LA 1T8FA 1L26A 4MD1A 4XT1A 5DHGA 1JV7A 1L92A 184LA 1L0KA 214LA 1CU3A 3HTBA 3GUKA 4GRVA 1QM8A 1L24A 3UTVA 1QTBA 3HUKA 3DN2A 1L27A 4WW3A 1L11A 3EH4B 1L96A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DQIY 1JKDA 1H87A 130LA 4WG7A 2CWIA 1KMEA 2F2QA 1L60A 2B5ZA 1XEIA 188LA 1GDXA 1LMPA 2NTHA 1LYIA 2FBDA 1C6CA 3QAKA 1XMEB 1QTZA 2B74A 4FDYA 3HASA 1SQ2L 5B6XA 1L20A 2B70A 3NY8A 4PJ2C 3IJVA 3LZTA 3AM6A 4J1BA 3SBAA 1ZURA 1HMLA 3OJPA 1YAQA 1B5VA 4BEZA 1LSCA 5G36A 1B9OA 1OV7A 173LA 3TXGA 1HHLA 1XGPC 3SP3A 1YL0X 1NHBA 1LSDA 1V7SA 1CUQA 1L87A 1SLYA 1ZVYB 152LA 3GUNA 2F93A 5FDJA 4N5RA 114LA 1F6RA 4N1CC 1WVVA 1LZGA 1C6HA 5J7CA 4ARQA 1QT5A 2DBTA 1L04A 1R2NA 1C65A 4H94A 1C6PA 2C8OA 1LZNA 1L54A 2Y04A 2MEGA 3QY4A 4WO6A 4DT3A 4NSHA 198LA 189LA 3D4SA 4TL3A 1QTCA 1YKYX 1C69A 4W54A 4D9ZA 2NWDX 2I20A 4IB4A 4G4CA 2Z55A 2MECA 1F88A 4LDOA 1LWKA 1LJGA 3T45A 1C6NA 1QTVA 122LA 192LA 1DPXA 4IJ4A 1KG8A 1QS9A 1GFAA 5A3EA 1L29A 1TN0A 194LA 5B07A 1BVKC 1LMAA 2W1MA 5KXRA 3N9AA 234LA 1REXA 7LYZA 4OWHA 4W56A 5LIOA 258LA 4M6DA 2YCZA 2HUBA 2BQKA 1YKZX 4MBSA 1P2CC 5A44A 1L48A 2RBSA 5H2MA 1HEWA 1NWGA 3SB7A 6LYZA 4AQNA 4WM6A 1QHJA 140LA 1CX7A 3AB6A 1LGWA 1HEQA 5D5CA 1G0KA 4BEYA 5KXOA 2Z2FA 1GPQC 4WL7A 4H8ZA 5LVJA 3CSQA 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 4LDE A;  3C9M A;  2KSY A;  129L A;  4S0W A;  2OU8 A;  3F9L A;  4DAJ A;  1GUE A;  177L A;  5G54 A;  127L A;  1L98 A;  2RBO A;  4ARP A;  5TGZ A;  227L A;  3S8F B;  1L17 A;  3SBB C;  3REY A;  125L A;  5B6V A;  1L70 A;  2B6T A;  4XT3 A;  4ZPU A;  4AMJ A;  5ITC A;  1QKO A;  2HUK A;  1L9H A;  1VGO A;  3HU9 A;  1L0M A;  1C6T A;  2B6Y A;  2OE9 X;  1D3F A;  1P8I A;  2KSB A;  261L A;  1L56 A;  1QUO A;  3G3X A;  1XIO A;  2QAR C;  4EIY A;  1L80 A;  4W55 A;  1LW9 A;  2JAG A;  4QID A;  1QT8 A;  3QBK A;  2YDO A;  225L A;  4WAV A;  1LWG A;  1L75 A;  3DN3 A;  262L A;  1CU0 A;  1KS3 A;  1JTN A;  113L A;  3C80 A;  3SB8 A;  2OE7 X;  2ANX A;  144L A;  5A45 A;  190L A;  1I6S A;  4W58 A;  1G0G A;  1L59 A;  1QTH A;  1IW9 A;  1C8S A;  237L A;  3OE8 A;  5H2I A;  155L A;  223L A;  206L A;  1QUG A;  1SSY A;  3BVD B;  211L A;  3QJV B;  1LPY A;  4EKQ A;  222L A;  1L10 A;  1G0J A;  1LGU A;  1QKP A;  1L22 A;  4I7J A;  1KY0 A;  108L A;  5DYS A;  3DNA A;  3HT6 A;  146L A;  3UON A;  1L50 A;  1LI2 A;  1L08 A;  4XTN A;  5G28 A;  3VI0 A;  4PXF A;  236L A;  3HT9 A;  126L A;  1JGJ A;  1R84 A;  163L A;  5LZM A;  7LZM A;  1T97 A;  224L A;  1QT4 A;  120L A;  161L A;  1T8F A;  1L26 A;  4MD1 A;  4XT1 A;  5DHG A;  1JV7 A;  1L92 A;  184L A;  1L0K A;  214L A;  1CU3 A;  3HTB A;  3GUK A;  4GRV A;  1QM8 A;  1L24 A;  3UTV A;  1QTB A;  3HUK A;  3DN2 A;  1L27 A;  4WW3 A;  1L11 A;  3EH4 B;  1L96 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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