3RZEA

Structure of the human histamine h1 receptor in complex with doxepin
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
435
structure length
428
Chain Sequence
MPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHRREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Histamine H1 receptor, Lysozyme chimera
total genus 147
structure length 428
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3rzeA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3rzeA01
4HYJA 5G2DA 4E97A 1QKOA 1L31A 3UTWA 2OTZX 1L86A 220LA 165LA 2NTWA 127LA 4DKLA 1L87A 1C65A 3D4SA 1UAZA 201LA 1L88A 4EKRA 1L69A 3DN6A 2OTYX 2HUKA 1C61A 3PQRA 231LA 4YX7C 109LA 234LA 2YDOA 2R4RA 1QTHA 176LA 1L23A 180LA 125LA 1GZMA 3COCA 4W56A 4QRYA 1L07A 2JAGA 1BRRA 167LA 2HPYA 1L52A 2J4YA 3X3BA 5ITCA 1C6QA 1C6KA 2RB1X 3ZEVA 2WJKA 4IB4A 3C9MA 1D3NA 4GBRB 1OVJA 1L85A 3C83A 1OWYA 1C66A 3CODA 1JV7A 4EKPA 5DYSA 2RBRA 3SB9A 4ARQB 3HU8A 1C6LA 1L28A 3RFMA 247LA 1CV6A 1XMEB 1TN5A 150LA 4GRVA 4XT3A 3S3CB 1CUPA 3MBVA 1L96A 4KLYA 4PXFA 1L16A 2Y01A 1PQDA 1L47A 3WQJA 183LA 1L72A 1CU2A 1L56A 189LA 1C6DA 244LA 1L37A 7LZMA 2KSBA 1P56A 1T8GA 3EH3B 210LA 3QDCA 2RBPA 2F95A 4EA3A 1K28A 253LA 2Z55A 4MQTA 2OE7X 4DJHA 242LA 146LA 4LDOA 1L14A 3SB7A 3HTGA 1IW9A 1DYDA 4I7MA 1C6FA 1L22A 1L34A 122LA 158LA 1L76A 1E0PA 102LA 1PXSA 1JTMA 1S53A 1QM8A 3HUKA 4L35A 137LA 1L80A 261LA 1L0MA 2NTUA 3DN8A 2OE4X 2B74A 1XEPA 1LGXA 3VG9A 3UTYA 2ZIYA 1X0K1 1P36A 1KW7A 245LA 1P8HA 1L82A 1XJIA 221LA 1G07A 4EIYA 3DKEX 2RB2X 4NC3A 3HH4A 4ARMB 1L43A 182LA 1Q5JA 4FA7B 4G70B 3VGAA 1C6PA 2I21A 1NHBA 206LA 185LA 1JQUA 1LW9A 4EJ4A 108LA 5G2CA 2LZMA 1QT4A 1QT8A 1L95A 1QT3A 3QJTB 1L35A 1T8AA 3C7ZA 1GUEA 4I7QA 3GUPA 103LA 2QPEB 163LA 3HH5A 3V2YA 259LA 1KY1A 184LA 4YXAC 3NY8A 2Z73A 119LA 1G0JA 1L04A 1L20A 4AQNA 1L57A 159LA 2RAZX 1OVHA 2ZFEA 3QAPA 1F88A 1PQOA 4GYCA 1G0LA 1L39A 4ZPUA 1H2SA 196LA 3C9LA 4MBSA 2M3GA 1VJMA 3VI0A 4I7NA 126LA 1G0QA 1D2WA 4EKSA 1L49A 2EI4A 3DN3A 1JFPA 1LN6A 6LZMA 186LA 1QKPA 2O79A 3QBLA 1L89A 2NTHA 5LZMA 3OAXA 5B6ZA 1L91A 4HWLA 168LA 228LA 128LA 1DYGA 1QT7A 5JJNA 3G3WA 4I7RA 1QUGA 172LA 252LA 1HZXA 111LA 2KSYA 4JKVA 3BVDB 1BM1A 1LYEA 1L98A 3HU9A 3QAKA 1G1VA 241LA 3C82A 4GP5B 5EN0A 1OVKA 3S3DB 5B6WA 151LA 1LWKA 1LI3A 232LA 3K2RA 217LA 5DHGA 3SB8A 3HAPA 1SWZA 1KW5A 1XJUA 188LA 4PXKA 1X0I1 3A7KA 3ZPRA 1L51A 3REYA 1DYBA 1TN0A 1XJTA 2OEAX 1L50A 1L26A 4I7SA 1L70A 1L62A 1L00A 1L60A 251LA 3SN6R 4DAJA 156LA 4S0WA 1L59A 1L93A 1Q5IA 4MD1A 161LA 5G36A 4LZMA 4BEZA 143LA 1WTHA 3UONA 3FI5A 3NSBA 2RBNA 1T97A 1C62A 2OE9X 113LA 2OU0X 3FADA 4EPIA 2WJLA 1L40A 1L66A 1L27A 112LA 4BUOA 3SB5A 2RBOA 4EXMA 5H2KA 1D9WA 205LA 139LA 1L02A 3PXOA 1P37A 1KG9A 3QJUB 1L46A 1GU8A 1L25A 5B6YA 2VT4A 1CV4A 1L81A 3EH4B 4X31A 3NYAA 3FA0A 1L05A 1CTWA 2HUMA 1C6MA 1CU5A 2O4WA 3X3CA 1LGWA 3HARA 1L67A 1LGUA 1M0MA 5A8EA 115LA 1L08A 1MGYA 1L0JA 4XXJA 4PJZA 200LA 1L84A 2AT9A 1P3NA 1QTCA 1QTVA 190LA 4BV0A 3AYMA 1C8SA 3GUNA 3SBAA 5B6XA 1FBBA 191LA 1L18A 4W51A 3ABWA 2PEDA 1L01A 4I7TA 4W59A 1L30A 1BRXA 3UTVA 2JAFA 3GUOA 1T8FA 2Z6BA 1DYFA 229LA 3GUJA 3HDEA 1L99A 1S51A 5G28A 140LA 1LYGA 2OU9A 256LA 1C6CA 1QTBA 3CDVA 1SWYA 2R4SA 5BR2A 4X32A 216LA 1QS9A 1DYCA 3DMXA 3DN2A 4JQ6A 1L09A 3HT8A 3T45A 3GUIA 3HASA 1C6NA 243LA 3QJSB 1L73A 1L90A 224LA 5A45A 1L13A 1IXFA 3HAQA 3V2WA 4X1HA 4UHRA 1L38A 166LA 1L48A 1CX7A 1L94A 262LA 4I7JA 1C6HA 142LA 3PDSA 223LA 3OE6A 4LDEA 1L58A 2B6TA 4BWBA 4I7OA 2Q9DA 1JV6A 1D3MA 3HANA 110LA 3CDTA 3UG9A 3DN4A 170LA 1L33A 1P2RA 152LA 3VVKA 3HH3A 226LA 1L41A 4W58A 4GBRA 5AHZA 5H2OA 2F2QA 4I7KA 2I20A 130LA 1CV5A 5B34A 1D2YA 1QT5A 1EHKB 1FBKA 1TLAA 215LA 3GULA 2YCZA 1L21A 1H68A 1L12A 3EH5B 4W53A 4N4YB 1L53A 2RBSA 1P6YA 2ZZLA 257LA 2B7XA 3P0GA 5AX0A 1ZYTA 181LA 1KS3A 1P46A 4XTLA 1L29A 5ETZA 4AMJA 1C6GA 222LA 3F9LA 1PXRA 1CV3A 3C8SA 175LA 1F50A 230LA 212LA 3C8RA 1KY0A 2B73A 198LA 147LA 3CDOA 3DMZA 5I14A 2Y03A 3DDLA 1SX7A 1S8LA 104LA 1L11A 5LWEA 214LA 238LA 1P8IA 2RAYX 1KGBA 1QSBA 2B75A 218LA 2NTGA 4BEYA 5H2PA 2L6XA 1L71A 1X0SA 2LNLA 5H2NA 3UZAA 3QJQB 5TGZA 2Q9EA 4WW3A 4PK0A 3QBKA 254LA 1C69A 2BRDA 3HH6A 2KSAA 3QBGA 4IARA 3DMVA 227LA 3OE0A 169LA 1KMEA 1XIOA 3AYNA 3DN0A 1AP9A 3ZPQA 1B6IA 1OWZA 1PQKA 249LA 4OV0A 3JR6A 1C63A 3HUQA 3NS0A 5KKHA 3C80A 1LYFA 1QUDA 2YDVA 3HTFA 3S8FB 5A44A 4EPFA 3EMLA 173LA 2ANXA 1QT6A 4HYXA 164LA 1P2LA 1OYUA 219LA 3QJVB 5AX1A 1S52A 1L9HA 1DYAA 1L63A 1L83A 3LZMA 2O7AA 1L42A 4XT1A 129LA 1C64A 1R84A 1L17A 1KG8A 209LA 3GUMA 177LA 4Y9HA 1L64A 1CU6A 3HT9A 1S8JA 5F8UA 2RBQA 5H2HA 3CAPA 1CV0A 3S3BB 2YCYA 1LLHA 2X72A 5AWZA 4XTNA 3PBLA 1OV5A 211LA 4K5YA 1ZWNA 2RH1A 4AMIA 4ARLA 1G0GA 1PQIA 239LA 4G7SB 3ODUA 237LA 2B6WA 195LA 1LWGA 1C68A 3C7WA 1S54A 2I1XA 2B70A 1EPYA 1F4ZA 4W55A 2Y04A 2F93A 197LA 131LA 114LA 1CX6A 4W54A 1G0KA 4FBZA 5H2JA 1M0LA 1QSQA 5J7AA 5FJGA 2HULA 1U19A 1L24A 1PQMA 148LE 1L03A 1L68A 1C6TA 2IGCA 2G87A 3G3XA 1L15A 4G71B 1QUHA 5B2NA 1DZEA 4W52A 5C1MA 3UTXA 5G2AA 192LA 1D3FA 1UCQA 5DHHA 1P64A 3HT7A 4QIDA 107LA 1P5CA 4I7LA 2B6XA 1PY6A 1DYEA 1SSYA 5H2MA 1L92A 4L6RA 1L65A 3DN1A 1L75A 1O0AA 144LA 1I6SA 1PQJA 5H2LA 1P7SA 5BR5A 1L61A 4YXCA 2I35A 4IAPA 3HUAA 3NY9A 3SB6A 1G06A 3RUNA 2QPDB 4GP8B 4A4MA 160LA 1L97A 1M0KA 1QHJA 5AZDA 1LI6A 4JR8A 157LA 1ZURA 225LA 260LA 1C8RA 3DQBA 3QBIA 120LA 1CUQA 1L10A 1L77A 235LA 4N6HA 4WAVA 1LI2A 3L2XA 1LYIA 1IW6A 149LA 2A4TA 2OU8A 3CDRA 2ANVA 2YCWA 145LA 3VW7A 3HT6A 1C6EA 4KNFA 141LA 2Y02A 1AT9A 4LDLA 1KNIA 4ARQA 1P8UA 4MD2A 162LA 2QARC 5ITEA 3OE9A 178LA 2QB0B 4GP4B 3HTBA 258LA 1CWQA 2KS9A 5AHYA 187LA 1QTDA 1QTZA 250LA 4XTOA 1L36A 3UZCA 1QS5A 1LYHA 3KJ6A 3G3VA 4QI1A 1SX2A 174LA 1L19A 2B6YA 4G72B 5JJEA 1QUOA 3HWLA 1L0KA 3HTDA 4UG2A 2F32A 4MQSA 1JTNA 5G54A 4GPOA 1C3WA 1LYDA 1L74A 1VGOA 2LC9A 2Y00A 1CU3A 4FAAB 3GUKA 4EKQA 2L78A 1T6HA 1C60A 199LA 1CVKA 3C8QA 3DNAA 4G7RB 1G0MA 1C6BA 1C6AA 2RB0X 3RZEA 4BVNA 213LA 1OV7A 4I7PA 240LA 4IAQA 3CDQA 1L45A 1L44A 1LPYA 2LCBA 3PWHA 3VHZA 1G1WA 3L64A 4FPDA 3AM6A 4N4WA 1L54A 4J4QA 4ARJA 1L55A 3F8VA 5B6VA 118LA 2B72A 2CUUA 1C67A 236LA 2YCXA 4ARMA 2F47A 1E12A 246LA 1CU0A 4ARPA 1L06A 3QJRB 3OE8A 5B0WA 3C7YA 5B35A 1C6IA 3C81A 5JJJA 3HAOA 255LA 1D3JA 171LA 4G7QB 1JGJA 1R2NA 4TL3A 1L79A 5G53A 123LA 1C6JA 1CV1A 138LA 233LA 2B6ZA 248LA 3HDFA 4OO9A 155LA 1BRDA 3SBBC 3S8GB 1L32A 1LYJA 1SSWA 1G0PA 5H2IA 4W57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HYJA 5G2DA 1XEKA 1I56A 1HEMA 5KXSA 3UTWA 1L86A 165LA 5KXXA 1L87A 4DD3A 1UICA 3DN6A 1C61A 3PQRA 4ETEA 1YQVY 109LA 3WVXA 1GZMA 2JAGA 5ITCA 4O34A 1HEQA 2WJKA 1JTTL 1OVJA 4QEQA 1JV7A 2RBRA 3SB9A 1G7IC 4ARQB 4DDCA 3LN2A 1XMEB 4GRVA 3P65A 1L96A 4GN3A 5LIOA 1L16A 1L72A 1GB8A 1L56A 2F4AA 1C6DA 1L37A 7LZMA 2KSBA 1T8GA 3LYTA 1C46A 2RBPA 2F95A 253LA 1IVMA 2D4JA 146LA 1NBZC 1L14A 4LZTA 3AZ7A 1L22A 1E0PA 2DQAA 4FDYA 1QM8A 1L0MA 2MEDA 1LGXA 1LZ6A 2ZIYA 1P36A 1CKFA 1KIQC 1IEEA 3WXUA 3DKEX 1DI4A 182LA 1Q5JA 1IC4Y 4G70B 2ZIKA 1C6PA 1TAYA 3VGAA 1GF4A 206LA 185LA 1LW9A 2BQOA 2YBJA 2LZMA 1L95A 1L35A 3N9EA 1NHEA 1F10A 1D0LA 3V2YA 2QPEB 259LA 1KY1A 4XJGA 2Z73A 1CJ9A 5IELA 4WLTA 3QAPA 4GYCA 1D0MA 1G0LA 4ZPUA 1T3PA 1GF6A 2DQDY 4I7NA 1QSWA 2DQEY 1B7OA 3QBLA 3OAXA 1L91A 1EQEA 4RW1A 2W1MA 2I26L 3N9AA 1D9UA 3G3WA 2BQGA 252LA 1HZXA 111LA 3A67Y 3CSQA 1LYEA 1L98A 3QAKA 1G1VA 4GP5B 1BGIA 1OVKA 5B6WA 1RCMA 232LA 1GFRA 3SB8A 1IP1A 188LA 2YBHA 4I0CA 3REYA 4GLVA 3TXJA 1L26A 4KL7A 1L70A 1L62A 4Z41A 4DYGA 1B0DA 4ETBA 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 1QSB A;  2B75 A;  218L A;  2NTG A;  4BEY A;  5H2P A;  2L6X A;  1L71 A;  1X0S A;  2LNL A;  5H2N A;  3UZA A;  3QJQ B;  5TGZ A;  2Q9E A;  4WW3 A;  4PK0 A;  3QBK A;  254L A;  1C69 A;  2BRD A;  3HH6 A;  2KSA A;  3QBG A;  4IAR A;  3DMV A;  227L A;  3OE0 A;  169L A;  1KME A;  1XIO A;  3AYN A;  3DN0 A;  1AP9 A;  3ZPQ A;  1B6I A;  1OWZ A;  1PQK A;  249L A;  4OV0 A;  3JR6 A;  1C63 A;  3HUQ A;  3NS0 A;  5KKH A;  3C80 A;  1LYF A;  1QUD A;  2YDV A;  3HTF A;  3S8F B;  5A44 A;  4EPF A;  3EML A;  173L A;  2ANX A;  1QT6 A;  4HYX A;  164L A;  1P2L A;  1OYU A;  219L A;  3QJV B;  5AX1 A;  1S52 A;  1L9H A;  1DYA A;  1L63 A;  1L83 A;  3LZM A;  2O7A A;  1L42 A;  4XT1 A;  129L A;  1C64 A;  1R84 A;  1L17 A;  1KG8 A;  209L A;  3GUM A;  177L A;  4Y9H A;  1L64 A;  1CU6 A;  3HT9 A;  1S8J A;  5F8U A;  2RBQ A;  5H2H A;  3CAP A;  1CV0 A;  3S3B B;  2YCY A;  1LLH A;  2X72 A;  5AWZ A;  4XTN A;  3PBL A;  1OV5 A;  211L A;  4K5Y A;  1ZWN A;  2RH1 A;  4AMI A;  4ARL A;  1G0G A;  1PQI A;  239L A;  4G7S B;  3ODU A;  237L A;  2B6W A; 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 2ANV A;  2YCW A;  145L A;  3VW7 A;  3HT6 A;  1C6E A;  4KNF A;  141L A;  2Y02 A;  1AT9 A;  4LDL A;  1KNI A;  4ARQ A;  1P8U A;  4MD2 A;  162L A;  2QAR C;  5ITE A;  3OE9 A;  178L A;  2QB0 B;  4GP4 B;  3HTB A;  258L A;  1CWQ A;  2KS9 A;  5AHY A;  187L A;  1QTD A;  1QTZ A;  250L A;  4XTO A;  1L36 A;  3UZC A;  1QS5 A;  1LYH A;  3KJ6 A;  3G3V A;  4QI1 A;  1SX2 A;  174L A;  1L19 A;  2B6Y A;  4G72 B;  5JJE A;  1QUO A;  3HWL A;  1L0K A;  3HTD A;  4UG2 A;  2F32 A;  4MQS A;  1JTN A;  5G54 A;  4GPO A;  1C3W A;  1LYD A;  1L74 A;  1VGO A;  2LC9 A;  2Y00 A;  1CU3 A;  4FAA B;  3GUK A;  4EKQ A;  2L78 A;  1T6H A;  1C60 A;  199L A;  1CVK A;  3C8Q A;  3DNA A;  4G7R B;  1G0M A;  1C6B A;  1C6A A;  2RB0 X;  3RZE A;  4BVN A;  213L A;  1OV7 A;  4I7P A;  240L A;  4IAQ A;  3CDQ A;  1L45 A;  1L44 A;  1LPY A;  2LCB A;  3PWH A;  3VHZ A;  1G1W A;  3L64 A;  4FPD A;  3AM6 A;  4N4W A;  1L54 A;  4J4Q A;  4ARJ A;  1L55 A;  3F8V A;  5B6V A;  118L A;  2B72 A;  2CUU A;  1C67 A;  236L A;  2YCX A;  4ARM A;  2F47 A;  1E12 A;  246L A;  1CU0 A;  4ARP A;  1L06 A;  3QJR B;  3OE8 A;  5B0W A;  3C7Y A;  5B35 A;  1C6I A;  3C81 A;  5JJJ A;  3HAO A;  255L A;  1D3J A;  171L A;  4G7Q B;  1JGJ A;  1R2N A;  4TL3 A;  1L79 A;  5G53 A;  123L A;  1C6J A;  1CV1 A;  138L A;  233L A;  2B6Z A;  248L A;  3HDF A;  4OO9 A;  155L A;  1BRD A;  3SBB C;  3S8G B;  1L32 A;  1LYJ A;  1SSW A;  1G0P A;  5H2I A;  4W57 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1HEN A;  5B6Y A;  4X31 A;  3FA0 A;  5F16 A;  1LYO A;  1CTW A;  1C6M A;  4ET8 A;  5KXR A;  4H94 A;  1L67 A;  1LGU A;  1M0M A;  1L08 A;  1FKV A;  3N9C A;  2CGI A;  2AT9 A;  3WU8 A;  1QTC A;  1QTV A;  4H9C A;  4R6C A;  4NEB A;  2I6Z A;  3AYM A;  1C8S A;  3GUN A;  1FBB A;  4W51 A;  1L01 A;  1LZG A;  2MEG A;  2AUB A;  2JAF A;  1B7N A;  1RFP A;  1LZR A;  140L A;  3BKV A;  1VFB C;  2OU9 A;  1C6C A;  1IOQ A;  1GF8 A;  1QS9 A;  1LSA A;  2EQL A;  4H9I A;  3GUI A;  4NG8 A;  243L A;  1GF5 A;  1L73 A;  1LSY A;  1IXF A;  3HAQ A;  4X1H A;  2DQG Y;  1L94 A;  1HSW A;  3PDS A;  223L A;  2MEE A;  4ETA A;  4BWB A;  4XJI A;  4I7O A;  2Q9D A;  3VWO A;  1CJ8 A;  3CDT A;  3UG9 A;  1C7P A;  3VVK A;  4N9R A;  1ALC A;  226L A;  4W58 A;  5H2O A;  1VDP A;  1DZB X;  5B34 A;  5KKI A;  2YCZ A;  2ZWB A;  3EH5 B;  4W53 A;  1NKH A;  2YBN A;  4H1P A;  4G4C A;  3P0G A;  5AX0 A;  1JSF A;  1KS3 A;  4NGJ A;  4WO9 A;  4HP0 A;  1GB0 A;  1L29 A;  1C6G A;  1PXR A;  1B2K A;  3AZ5 A;  3C8R A;  1KY0 A;  198L A;  147L A;  3CDO A;  4L41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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