3SN6R

Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-gs protein complex
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
475
structure length
443
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isofor
molecule tags Signaling protein/hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 148
structure length 443
sequence length 475
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
R PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
R PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sn6R01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3sn6R02
1C8SA 2RBRA 188LA 1L13A 226LA 4I7JA 3C7WA 251LA 3HH5A 157LA 3S8GB 171LA 3SN6R 3NSBA 5G2AA 1CU3A 1I6SA 239LA 1L23A 1QT6A 1L37A 1QUDA 223LA 3EH4B 1L33A 1L28A 259LA 192LA 4EPIA 3DKEX 1QS9A 225LA 5AZDA 2B75A 5B6YA 5FJGA 3G3VA 3S3DB 1L59A 5JJEA 107LA 164LA 1L29A 3HT9A 4I7OA 163LA 2RBPA 221LA 4EKSA 4E97A 186LA 1QTDA 1CU5A 2OE4X 1CV4A 1L65A 255LA 3PXOA 3GUIA 7LZMA 5H2JA 3VI0A 2Y00A 1IXFA 3P0GA 1L38A 150LA 2ANVA 5DHHA 3SB6A 3REYA 1L86A 4I7KA 1L94A 1L48A 1S51A 1C6NA 3HU9A 115LA 4GRVA 2KSBA 1D3MA 233LA 3HU8A 166LA 3G3WA 5LZMA 142LA 3COCA 5H2NA 1HZXA 5ITCA 5B6WA 1R2NA 4S0WA 3HANA 5JJJA 201LA 3EH3B 129LA 1L80A 4GBRA 1L32A 4NC3A 4Y9HA 2QARC 1T6HA 156LA 3C7ZA 4OO9A 3SBBC 2F2QA 1E12A 214LA 1H2SA 3QJQB 1JFPA 1L60A 3GUPA 1X0I1 1G0GA 1G0JA 1OWZA 2OE7X 1EHKB 2EI4A 215LA 4FBZA 1L42A 3F9LA 4TL3A 4UG2A 1L0JA 3OE6A 1L77A 3HT7A 3QDCA 4KLYA 4N4WA 3S3CB 1L71A 4GBRB 104LA 190LA 1L68A 211LA 2R4SA 1CU0A 2F32A 249LA 1L47A 1SX7A 5B34A 3DN0A 1D3NA 2B6XA 3SB9A 2B7XA 1QTVA 2AT9A 3PWHA 1CX7A 120LA 2ZFEA 1G07A 1QSQA 4JR8A 1L89A 1CV6A 1CUPA 244LA 1L81A 1LI2A 1C60A 1L79A 4BVNA 1OVJA 3UTYA 1L40A 5JJNA 1C66A 4L35A 4EJ4A 2YCZA 3HASA 4EIYA 195LA 5G2DA 5BR5A 5A8EA 4G71B 1L08A 3GUMA 2Z6BA 1G0KA 4BEZA 177LA 4MBSA 2YCWA 1P37A 1QSBA 4W52A 3K2RA 3L2XA 5G2CA 1CV0A 146LA 205LA 3X3CA 2Y04A 155LA 5AHYA 2B74A 1P7SA 1ZURA 3D4SA 1L39A 1WTHA 242LA 3C9LA 1L44A 1JTNA 1LLHA 1P2RA 2O4WA 3C83A 4BWBA 119LA 4EKRA 1QS5A 1L14A 1L21A 1L73A 2ANXA 4LDLA 4FA7B 147LA 2QPDB 4MQSA 138LA 5B6ZA 2RBSA 1C65A 1LWKA 1PY6A 4YXCA 1KG9A 5H2KA 1KG8A 1P8HA 3S8FB 2B72A 140LA 1T8FA 1P8UA 2Y01A 1LYGA 175LA 1C6HA 4W53A 1L70A 1L51A 1PQJA 1QT5A 5H2IA 1P3NA 1JV7A 3UZAA 1LI3A 1L45A 1QTHA 4W58A 196LA 4I7SA 127LA 180LA 182LA 3DN8A 3GUNA 1NHBA 1L11A 5A44A 1C68A 189LA 148LE 4J4QA 1L05A 3HTFA 2KSYA 2KSAA 1L16A 169LA 4G70B 3ZEVA 4DJHA 1QUOA 1JTMA 1L52A 1C69A 1C3WA 1KY1A 3SB5A 4QIDA 1M0KA 5H2PA 1L82A 216LA 2M3GA 1L04A 1X0SA 3ZPRA 123LA 1LYIA 1C6PA 4KNFA 1OYUA 149LA 5G28A 1L0KA 2L78A 262LA 1QHJA 2L6XA 2ZZLA 3UTVA 3QAKA 2B6YA 1L31A 2RBOA 3HARA 3CDRA 1GU8A 1LGXA 1XJUA 2J4YA 2YDOA 1L24A 4N4YB 1OV7A 1BRDA 1X0K1 4EXMA 3AM6A 144LA 1D2YA 2F47A 1QT4A 2YDVA 2RBNA 1L41A 3CDTA 3OAXA 1L26A 152LA 174LA 1L99A 3C8SA 1P8IA 1PQOA 4HWLA 2YCXA 3DMVA 160LA 3C82A 3AYMA 2JAFA 3HAQA 4PXKA 1L85A 5AWZA 1O0AA 2OU9A 3QJTB 1C62A 232LA 4I7NA 1C6LA 1L02A 1L03A 1L61A 243LA 3DN2A 1XMEB 3HDFA 125LA 1Q5IA 1SX2A 200LA 1KS3A 3RUNA 3HUQA 1L10A 3A7KA 3QBLA 4XTNA 2YCYA 4ARLA 4ARQA 4DKLA 2Y02A 222LA 4WW3A 219LA 1S54A 213LA 1S8LA 4G72B 4MQTA 4MD2A 238LA 4XT3A 237LA 5EN0A 1S52A 1DYEA 1LYDA 1L25A 185LA 1S8JA 4QRYA 2WJLA 3QBGA 1L97A 3HTDA 247LA 4W57A 4AMJA 2OU0X 3CODA 3HWLA 1L62A 5BR2A 4QI1A 3EH5B 4AQNA 2I1XA 3ODUA 3FADA 1CUQA 113LA 1QT3A 5AX0A 4OV0A 3NYAA 2B70A 4ARQB 3SB8A 3PQRA 1DYGA 228LA 1G0LA 5G36A 1F50A 1SSYA 1C63A 2NTWA 252LA 2OEAX 197LA 1IW9A 3CDVA 5LWEA 1C6TA 1L98A 1L54A 130LA 1L07A 1F4ZA 191LA 229LA 4G7QB 2OU8A 3V2WA 4GP4B 1ZWNA 3ZPQA 246LA 4K5YA 3V2YA 1C8RA 3C9MA 1G06A 3HH6A 3NS0A 1L01A 3VGAA 4YXAC 3DN3A 1QM8A 2HUMA 2NTUA 1UCQA 3DNAA 3OE9A 1G1WA 3CDOA 256LA 3EMLA 4PXFA 1PQIA 4W54A 1Q5JA 1QKOA 122LA 4BEYA 245LA 137LA 110LA 109LA 1KW7A 2I35A 4X32A 2LNLA 1CV5A 4UHRA 162LA 4FPDA 3RFMA 3AYNA 3WQJA 1L56A 3DN4A 209LA 2QB0B 1PXRA 4BUOA 1OWYA 3FI5A 1F88A 1L0MA 173LA 1L36A 1LYFA 1L17A 231LA 4PK0A 2RH1A 3C8QA 5B0WA 1L67A 165LA 2RBQA 1L74A 172LA 1CV1A 1L46A 1C64A 261LA 2LCBA 5G54A 1L30A 4GYCA 1CU6A 5H2MA 5H2HA 1GUEA 4ARMB 158LA 3HDEA 159LA 4JQ6A 1ZYTA 1D2WA 1L43A 253LA 240LA 2IGCA 114LA 3OE8A 1KNIA 2ZIYA 1KY0A 1D3JA 3X3BA 3HH3A 4I7TA 2RB0X 5KKHA 4EPFA 4LDOA 4AMIA 141LA 1QTZA 2LZMA 5B6VA 181LA 1DYDA 1BRXA 1C6IA 3KJ6A 1L69A 1L09A 3DDLA 1P46A 5F8UA 1OVHA 3DN6A 1L84A 1AT9A 4L6RA 1FBBA 3S3BB 4A4MA 217LA 4W56A 4W51A 2B6WA 1C6GA 260LA 2CUUA 1LW9A 128LA 1L57A 1K28A 2Q9EA 3GUKA 3LZMA 1CTWA 1D3FA 1L90A 1QT7A 2A4TA 1L49A 3NY8A 3QAPA 2X72A 145LA 1CVKA 1D9WA 3UTWA 5C1MA 236LA 4W59A 2VT4A 5AHZA 2QPEB 1C67A 1QTCA 2I20A 3SBAA 1P36A 111LA 4GP5B 1TN0A 5I14A 3QJSB 1KW5A 1C6KA 1LPYA 1E0PA 2Q9DA 2PEDA 1CX6A 1QUGA 257LA 2RB1X 3HUKA 139LA 2RB2X 3HTBA 5AX1A 1PXSA 183LA 1XEPA 1SSWA 3HTGA 5A45A 1DYCA 1CU2A 4ZPUA 4I7LA 198LA 3DN1A 1L63A 3CAPA 5H2LA 3HAPA 1C6MA 2KS9A 4GP8B 1AP9A 3UTXA 1QKPA 1MGYA 258LA 1L19A 1T8AA 4I7RA 4XTLA 112LA 3UZCA 4EA3A 1L66A 1DYBA 3HH4A 4BV0A 1L27A 1KGBA 3C8RA 3QJRB 4XT1A 3VHZA 224LA 1LYEA 1PQMA 4G7SB 5DHGA 3CDQA 1C6FA 2OE9X 2Y03A 2I21A 2B6ZA 4IAQA 1FBKA 3UG9A 2F95A 4FAAB 3F8VA 3SB7A 1L12A 1L34A 1VJMA 1L64A 1G1VA 1XJTA 4I7PA 4W55A 1TN5A 1L88A 248LA 5H2OA 1L95A 1L06A 1EPYA 2F93A 1QT8A 212LA 230LA 5G53A 1C6BA 3ABWA 3MBVA 1B6IA 220LA 168LA 1L35A 167LA 1PQDA 4YX7C 1L72A 218LA 1PQKA 1LGWA 1L22A 3C80A 2OTYX 234LA 1L75A 1JGJA 5B6XA 3PBLA 3RZEA 4XTOA 4XXJA 4I7MA 1S53A 3C7YA 235LA 2RAYX 2Z55A 1C61A 1L76A 1G0MA 4JKVA 2WJKA 254LA 4LZMA 1L00A 3VVKA 3VG9A 1UAZA 2HUKA 2Z73A 3QJUB 1LYHA 3QBKA 227LA 206LA 2RAZX 4LDEA 3NY9A 4HYXA 5TGZA 4IARA 1M0MA 1CV3A 4ARMA 5ETZA 1C6EA 6LZMA 184LA 1P64A 3HUAA 4ARJA 4ARPA 1CWQA 1LN6A 1QUHA 1M0LA 4X31A 3PDSA 1L83A 2O79A 131LA 1C6CA 1LGUA 1L15A 4WAVA 3T45A 4EKQA 1P6YA 1L53A 1OV5A 3G3XA 1IW6A 3JR6A 3VW7A 3HT8A 3DMZA 1L87A 1DYFA 3QBIA 1L9HA 4HYJA 1LWGA 1XJIA 2LC9A 4IB4A 2HPYA 1L93A 161LA 1L58A 1T8GA 1T97A 4X1HA 1P2LA 4IAPA 2NTHA 4MD1A 1L55A 126LA 1JQUA 2O7AA 2JAGA 1DYAA 3C81A 3GUJA 1LI6A 1TLAA 102LA 1XIOA 1C6JA 1P56A 3GULA 151LA 3HT6A 1JV6A 5B2NA 176LA 2G87A 1L91A 108LA 1R84A 1G0QA 1SWZA 1L92A 1C6AA 187LA 1BRRA 199LA 2OTZX 4N6HA 4DAJA 143LA 2B6TA 3QJVB 2B73A 5J7AA 1C6DA 3HAOA 241LA 1L50A 3BVDB 5ITEA 1KMEA 4G7RB 3FA0A 4GPOA 178LA 170LA 1G0PA 4I7QA 1U19A 1H68A 5DYSA 1SWYA 1P5CA 210LA 4PJZA 1BM1A 1QTBA 250LA 3UONA 3DMXA 118LA 1C6QA 3DQBA 1VGOA 1OVKA 3GUOA 4EKPA 1L20A 1L18A 5B35A 3OE0A 103LA 2NTGA 3L64A 2BRDA 1L96A 2R4RA 2HULA 1GZMA 1DZEA 1LYJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L9JA 4Z46A 157LA 3M18B 171LA 3SN6R 1CU3A 1I6SA 4QDNA 5KXYA 239LA 4LYZA 1GBOA 1L28A 2VB1A 4N8ZA 2B75A 1UIAA 1NBYC 107LA 1L29A 5KXNA 163LA 4HJZA 186LA 1QTDA 2OE4X 1CV4A 3VI0A 5LIOA 4DQ5A 1LJGA 2F2NA 2DQEY 2B5ZA 4XADA 4AXTA 1D3MA 4RDSA 5JJJA 1AM7A 3EH3B 1REMA 2D91A 2QARC 1D6QA 3SBBC 2F2QA 3HBDA 5IELA 2PC2A 4H9IA 1G0JA 1OWZA 2OE7X 2EI4A 215LA 3W6AA 4J1AA 4FBZA 4TL3A 2X0AA 4HSFA 4GBRB 1KIQC 1L68A 4XN6A 249LA 1YROA 1SX7A 1P2CC 3PWHA 3B0KA 1YQVY 1CV6A 244LA 1L79A 3UTYA 1C66A 4L35A 1FDLY 2YCZA 4NG1A 1IP4A 2FBDA 1IP6A 1L08A 4RLNA 2Z6BA 2YCWA 4W52A 5F9UA 5G2CA 205LA 1LZCA 1GD6A 1UBZA 3D4SA 2MEFA 4H9EA 1P2RA 3C83A 4EKRA 2EPEA 1IEEA 1L73A 1B5ZA 1UACY 1PY6A 1KG8A 5F81A 4I0CA 2Y01A 5C6JA 1PQJA 1B7MA 1GFGA 1GE3A 1JISA 3GUNA 5LINA 1NHBA 1VFBC 189LA 4XYYA 1JITA 5II3A 1IY4A 1JKDA 1C69A 4DD2A 3SB5A 4QIDA 3P66A 1L04A 1C43A 1GF3A 1J1XY 1LYIA 3IWRA 3UTVA 2L78A 2L6XA 1IOSA 1LSNA 5L3HA 2LYMA 4H8ZA 1QTEA 5KXTA 1IOCA 1OV7A 5LAGA 3AM6A 144LA 4KPMA 2F47A 1QT4A 4NGLA 1L26A 174LA 1F10A 1ZMYL 2YCXA 2JAFA 1L85A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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