3SN6R

Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-gs protein complex
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
475
structure length
443
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein/hydrolase
source organism Bos taurus
molecule keywords Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isofor
total genus 148
structure length 443
sequence length 475
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
R PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
R PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sn6R01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3sn6R02
4PK0A 1PY6A 4MD1A 165LA 1C6NA 1DYBA 1CV3A 1QKOA 217LA 4G7SB 1L08A 163LA 2O4WA 4UHRA 3QJQB 3C81A 1C8SA 3HANA 1L11A 4J4QA 3HT6A 189LA 1C6GA 110LA 3CDTA 5H2HA 128LA 4G71B 1SX2A 1T97A 176LA 4ARMA 1O0AA 103LA 162LA 151LA 262LA 4EPFA 4QIDA 2O79A 3UZAA 1DYCA 4IB4A 2I35A 1D9WA 1SWYA 3UZCA 2G87A 5G2DA 3F9LA 184LA 3DMVA 1L9HA 126LA 1L50A 4EJ4A 4XTLA 3DN6A 1ZWNA 4XT1A 156LA 3CDVA 1X0K1 2YCXA 4Y9HA 2Y01A 4I7PA 245LA 2WJLA 4AMIA 1LGWA 4EIYA 108LA 2ZFEA 1L97A 5TGZA 1SWZA 3QAPA 1BRDA 2R4RA 3QAKA 5B0WA 3GUIA 3UTXA 1OWZA 5AWZA 1C6TA 5B6ZA 3C83A 3ODUA 3QBKA 1LPYA 1CV0A 3HTDA 1CWQA 148LE 1JTNA 1DZEA 1C6AA 145LA 1L80A 115LA 1L52A 157LA 1CV6A 3FADA 2ZZLA 3VHZA 1OVJA 3HAOA 4YX7C 1LLHA 138LA 3BVDB 3PQRA 1LYDA 5G2AA 209LA 1S8JA 2RB2X 5G54A 4EKQA 4G70B 127LA 161LA 1QHJA 4HYXA 1L21A 1IW6A 1QTHA 4EXMA 1XJUA 1QM8A 4JQ6A 1UCQA 5A8EA 3PXOA 144LA 1GU8A 2YCZA 3QJUB 3HH3A 4W57A 3AYNA 2X72A 3OE8A 171LA 1X0I1 1LN6A 1VGOA 4MD2A 1L48A 123LA 1P56A 1P8UA 3DMXA 4ARJA 1L83A 1L18A 4DKLA 1PQMA 1S53A 1FBBA 4ARLA 4X31A 2Z6BA 191LA 1L64A 1L73A 1L69A 1L72A 252LA 2HUKA 2OEAX 3S3CB 146LA 215LA 2B74A 182LA 4I7NA 2RBPA 3VW7A 1L92A 221LA 1QT5A 3MBVA 205LA 3HAPA 5H2OA 4YXCA 1QTDA 219LA 1C6DA 4GP5B 4A4MA 4GRVA 1C6HA 1KS3A 4X1HA 3HH6A 6LZMA 231LA 192LA 3CAPA 1L0KA 1DYEA 1LI6A 3C8SA 1PXSA 2KSYA 5DHHA 174LA 1L49A 1CUPA 2Y03A 3FA0A 1C6CA 4W56A 1L01A 5DHGA 2OU9A 3COCA 175LA 188LA 1QT6A 3OE9A 3HU9A 4L35A 4TL3A 3SN6R 2HUMA 131LA 1L68A 1L43A 5AHYA 2RH1A 1OWYA 2JAGA 1G0GA 5B34A 1P2RA 3HTBA 2AT9A 1IXFA 1P8HA 1L10A 1T8FA 4AQNA 1D3JA 5FJGA 167LA 2Y04A 250LA 1KGBA 4W54A 1L81A 2A4TA 1OVKA 2LCBA 5A45A 3QBIA 1P37A 1L60A 4DJHA 3S8GB 2WJKA 3HDEA 4W52A 4X32A 2B73A 1L39A 5KKHA 2I1XA 1L0JA 3EH5B 1PQJA 3UTYA 200LA 3JR6A 1L84A 2KS9A 1L36A 1NHBA 1EPYA 4EPIA 3HT7A 3OE0A 1L90A 1L24A 1T8AA 3UONA 1L87A 5AHZA 1XJIA 1L98A 2OTZX 1C62A 3AYMA 2LC9A 1C6IA 218LA 1DYFA 142LA 1L27A 5H2KA 3C7ZA 4I7LA 244LA 190LA 3HUQA 4MQSA 1G07A 1D3MA 4XXJA 150LA 237LA 224LA 1L53A 197LA 241LA 1X0SA 2NTWA 260LA 1L25A 206LA 3EH3B 2NTUA 4QI1A 1DYDA 4I7QA 1P64A 1L38A 1AT9A 3DKEX 5ITEA 4BEYA 3HH4A 247LA 1C69A 1S51A 4I7MA 4LZMA 1BM1A 232LA 2KSBA 1F88A 2NTHA 1G0LA 223LA 2F2QA 1SSWA 1P3NA 3QJVB 3UTVA 3D4SA 1C6EA 183LA 3NSBA 3VG9A 172LA 5JJNA 1FBKA 1D3NA 1L15A 1C60A 1D2WA 1L19A 3G3VA 2Y02A 4FPDA 3VGAA 2ANXA 3HAQA 3DNAA 2B7XA 3SB8A 5B2NA 5ITCA 4FAAB 1L70A 1L85A 257LA 4AMJA 2RBOA 3HWLA 168LA 1BRRA 240LA 4PJZA 4XTNA 1KW5A 3S3DB 1L54A 1QT7A 1L58A 1CVKA 2BRDA 3QBLA 1L46A 3KJ6A 1TLAA 1S8LA 1C61A 4KLYA 1S54A 4G7RB 4BEZA 1KG9A 1PQIA 1L42A 255LA 251LA 169LA 2QPEB 1IW9A 2Q9EA 243LA 2CUUA 3DN4A 1JGJA 1TN0A 3QJSB 4JR8A 4ZPUA 2B6YA 1D2YA 177LA 1L40A 3SB5A 2F32A 3HARA 3C7WA 3EMLA 4XTOA 2OU0X 1G0KA 1C64A 3GUMA 3DDLA 5B6WA 1L62A 1L34A 238LA 3EH4B 254LA 1L23A 1L63A 1L89A 2Q9DA 1EHKB 2JAFA 1D3FA 3OE6A 3HTGA 1LGXA 4I7OA 2M3GA 137LA 4W58A 1L59A 220LA 2L6XA 4MBSA 1E12A 152LA 225LA 4ARMB 3GUOA 2OE7X 1B6IA 4GPOA 3QDCA 1OV7A 1P46A 3C8RA 3CODA 2ANVA 1L41A 3RUNA 1JFPA 1H2SA 261LA 5B6YA 4BUOA 4N6HA 2LZMA 2RAZX 2O7AA 5J7AA 3SBAA 1C66A 1P6YA 5EN0A 3QJRB 3QBGA 1LYGA 4GBRB 4I7KA 1L35A 112LA 1L76A 5AX0A 1QT3A 3C82A 1L17A 5G36A 3RZEA 1G0PA 2HULA 4EKRA 1ZURA 4I7RA 253LA 3RFMA 3X3CA 2B70A 1XMEB 4HWLA 1MGYA 2F95A 1CU0A 2RBQA 227LA 4LDEA 1LWKA 1L57A 1ZYTA 1OVHA 2EI4A 1L31A 147LA 230LA 1KNIA 1L86A 1KY0A 3V2YA 2RBNA 1QTCA 1QKPA 1G0MA 3HUAA 4KNFA 4ARQB 5G28A 1L30A 3GULA 2YDVA 249LA 1CX7A 2B6WA 5H2JA 2LNLA 111LA 1LYJA 173LA 4BWBA 1P36A 3HUKA 4N4WA 259LA 1OYUA 3UTWA 1CU2A 1L88A 3ZPQA 4NC3A 1JQUA 5JJEA 1DYAA 1JV6A 1L26A 7LZMA 4BVNA 3HT9A 4W53A 130LA 1QUOA 1QS5A 1CU3A 3C8QA 233LA 2R4SA 4WW3A 2OE4X 3SB7A 5H2IA 226LA 5H2LA 4BV0A 1C6PA 1BRXA 3HASA 4IAQA 3T45A 2Z73A 3AM6A 1L65A 1L29A 235LA 3HH5A 3GUNA 3CDRA 187LA 170LA 3NY8A 4QRYA 2VT4A 1XEPA 5B6XA 1CV1A 1L28A 1L77A 3SBBC 3UG9A 4EKSA 1PQOA 1L03A 1L82A 1P7SA 3HU8A 212LA 1CU6A 248LA 1F4ZA 3NYAA 1S52A 1G1VA 164LA 1CTWA 1QUDA 4XT3A 5H2NA 1VJMA 3S3BB 213LA 1L0MA 3DN3A 239LA 155LA 4IAPA 1CV4A 256LA 1C3WA 2B6XA 1SSYA 2OTYX 1JV7A 1KY1A 3CDOA 3DQBA 139LA 5F8UA 1M0KA 1QSQA 1M0LA 5B35A 1L91A 1JTMA 4FBZA 1OV5A 1CUQA 3VI0A 228LA 120LA 2RBRA 1C68A 1L56A 3NY9A 1C6LA 1L71A 3F8VA 1P5CA 3G3XA 3HT8A 1K28A 4I7JA 3OAXA 1LYFA 5H2PA 3ZPRA 1Q5JA 3FI5A 166LA 3X3BA 1LYIA 1L44A 1L94A 1L06A 2Y00A 4GBRA 1C6JA 199LA 210LA 5A44A 1KG8A 1L61A 1L04A 143LA 3NS0A 1C6KA 2F47A 1M0MA 1L95A 1PQDA 3LZMA 141LA 4G7QB 3GUJA 5I14A 4W59A 2YDOA 2B72A 1E0PA 158LA 1G0JA 159LA 1H68A 4LDLA 2PEDA 3PWHA 1L02A 3PBLA 1L66A 2QB0B 3V2WA 229LA 236LA 3SB6A 2YCYA 1TN5A 4EA3A 1L13A 1QSBA 3DN2A 122LA 5LZMA 4ARQA 1CX6A 3A7KA 4GP4B 2B6ZA 3C80A 2OU8A 3VVKA 149LA 216LA 3HTFA 1L37A 4W55A 2Z55A 1L14A 1L09A 1QT4A 3WQJA 160LA 1I6SA 113LA 1LWGA 1PQKA 1QTZA 4YXAC 1L74A 3L64A 1T6HA 1G0QA 1L79A 1QUHA 5LWEA 5AZDA 181LA 3HDFA 2QARC 258LA 4G72B 5JJJA 1LGUA 1C6FA 1L22A 107LA 211LA 4K5YA 2KSAA 1LI3A 1L96A 4N4YB 5ETZA 3S8FB 1LW9A 3G3WA 5G2CA 4GYCA 1C67A 4FA7B 4IARA 246LA 2B6TA 2OE9X 129LA 2ZIYA 1XJTA 3DN8A 2RB0X 2J4YA 5C1MA 1C65A 1U19A 1L12A 1R84A 4ARPA 1GZMA 3DMZA 3L2XA 4PXFA 222LA 1L47A 4WAVA 195LA 4LDOA 3P0GA 104LA 2F93A 1LI2A 4S0WA 2QPDB 3C9MA 1XIOA 1L20A 1C8RA 3DN1A 1QTVA 1CV5A 1L51A 114LA 185LA 1F50A 3ABWA 5DYSA 1DYGA 4HYJA 4JKVA 4L6RA 1LYEA 1QT8A 2YCWA 118LA 1R2NA 1UAZA 2RAYX 1Q5IA 3SB9A 1C6BA 1L05A 3DN0A 5G53A 5BR2A 3GUPA 5H2MA 1LYHA 178LA 242LA 3C9LA 198LA 4W51A 4MQTA 3K2RA 1L32A 4OO9A 4EKPA 4GP8B 5BR5A 1WTHA 1G1WA 1SX7A 186LA 1L33A 125LA 1L00A 3GUKA 140LA 196LA 1L16A 1L93A 3CDQA 201LA 4I7SA 180LA 4E97A 1L07A 2RB1X 3REYA 1GUEA 102LA 2RBSA 1L55A 2L78A 2HPYA 2NTGA 3PDSA 1AP9A 1G06A 1L75A 4I7TA 2I20A 234LA 1L45A 214LA 1QUGA 1CU5A 1C63A 2B75A 1KW7A 4DAJA 1HZXA 1PXRA 2IGCA 1QTBA 4UG2A 1P8IA 3ZEVA 1C6MA 5B6VA 109LA 1C6QA 1P2LA 1L99A 1QS9A 1KMEA 5AX1A 4OV0A 4PXKA 1L67A 3QJTB 119LA 3C7YA 1T8GA 2I21A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
165LA 1C6NA 4G7SB 2C8PA 163LA 1D0MA 4UHRA 1L11A 4WM2A 1LMAA 3HT6A 1GFHA 3CDTA 1T97A 1VEDA 176LA 1GHLA 4N5RA 1V7SA 2LZTA 262LA 2XJWA 1F6RA 1D9WA 1SWYA 3UZCA 1XEJA 1GE4A 2G87A 9LYZA 1L9HA 126LA 5E9RA 4EJ4A 4XT1A 1X0K1 4Y9HA 4EIYA 108LA 1LZ8A 3AW7A 1LSFA 1MELL 1SWZA 1GB3A 1BRDA 5B0WA 3GUIA 1OWZA 3W6DA 4B1AA 5B6ZA 3ODUA 1CV0A 3HTDA 4WO6A 1I20A 4M4OA 1L80A 1CV6A 7LYZA 1IWWA 3HAOA 138LA 3BVDB 4YOPA 3PQRA 5G2AA 4NSIA 3LZ2A 4N9RA 4HYXA 1LHLA 3A3RX 1L21A 1WQQA 1IW6A 5B59A 1UICA 4EXMA 1XJUA 4JQ6A 1GDXA 5A8EA 144LA 4PJ2C 4W57A 1FN5A 2HU1A 5KXWA 2DQCY 1L48A 123LA 1J1OY 4ARJA 1L83A 3EBAB 3IJUA 4B0DA 1HEQA 3W6BA 4KT3A 4UWVA 4GN4A 3VW7A 4YXCA 4GP5B 2C8OA 4X1HA 3HH6A 231LA 3IWRA 3B0KA 3C8SA 5KXLA 174LA 5ILCA 1L49A 1GPQC 1LYOA 1GBSA 3W6AA 1L01A 1YKXX 3COCA 3OE9A 1LPIA 3BKVA 3QY4A 1L68A 4FJRA 5B1GA 2RH1A 1UIGA 4OWHA 1C46A 1L10A 1T8FA 1LHIA 1D3JA 3FE0A 2A4TA 1OVKA 2LCBA 1GBZA 1CKCA 1P37A 5KXPA 5FSTA 4DJHA 4W52A 5I54A 3EH5B 5LVGA 1PQJA 3UTYA 4WLDA 1EL1A 5ILFA 1L36A 1NHBA 5APEA 2EPEA 4EPIA 4DQ5A 1T8AA 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 4N4Y B;  5ETZ A;  3S8F B;  1LW9 A;  3G3W A;  5G2C A;  4GYC A;  1C67 A;  4FA7 B;  4IAR A;  246L A;  2B6T A;  2OE9 X;  129L A;  2ZIY A;  1XJT A;  3DN8 A;  2RB0 X;  2J4Y A;  5C1M A;  1C65 A;  1U19 A;  1L12 A;  1R84 A;  4ARP A;  1GZM A;  3DMZ A;  3L2X A;  4PXF A;  222L A;  1L47 A;  4WAV A;  195L A;  4LDO A;  3P0G A;  104L A;  2F93 A;  1LI2 A;  4S0W A;  2QPD B;  3C9M A;  1XIO A;  1L20 A;  1C8R A;  3DN1 A;  1QTV A;  1CV5 A;  1L51 A;  114L A;  185L A;  1F50 A;  3ABW A;  5DYS A;  1DYG A;  4HYJ A;  4JKV A;  4L6R A;  1LYE A;  1QT8 A;  2YCW A;  118L A;  1R2N A;  1UAZ A;  2RAY X;  1Q5I A;  3SB9 A;  1C6B A;  1L05 A;  3DN0 A;  5G53 A;  5BR2 A;  3GUP A;  5H2M A;  1LYH A;  178L A;  242L A;  3C9L A;  198L A;  4W51 A;  4MQT A;  3K2R A;  1L32 A;  4OO9 A;  4EKP A;  4GP8 B;  5BR5 A;  1WTH A;  1G1W A;  1SX7 A;  186L A;  1L33 A;  125L A;  1L00 A;  3GUK A;  140L A;  196L A;  1L16 A;  1L93 A;  3CDQ A;  201L A;  4I7S A;  180L A;  4E97 A;  1L07 A;  2RB1 X;  3REY A;  1GUE A;  102L A;  2RBS A;  1L55 A;  2L78 A;  2HPY A;  2NTG A;  3PDS A;  1AP9 A;  1G06 A;  1L75 A;  4I7T A;  2I20 A;  234L A;  1L45 A;  214L A;  1QUG A;  1CU5 A;  1C63 A;  2B75 A;  1KW7 A;  4DAJ A;  1HZX A;  1PXR A;  2IGC A;  1QTB A;  4UG2 A;  1P8I A;  3ZEV A;  1C6M A;  5B6V A;  109L A;  1C6Q A;  1P2L A;  1L99 A;  1QS9 A;  1KME A;  5AX1 A;  4OV0 A;  4PXK A;  1L67 A;  3QJT B;  119L A;  3C7Y A;  1T8G A;  2I21 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1LYI A;  2Y00 A;  3T6U A;  4GBR A;  199L A;  210L A;  5A44 A;  1KG8 A;  1L61 A;  1L04 A;  143L A;  1B7R A;  4XJI A;  2G4Q A;  141L A;  2BQC A;  3GUJ A;  2YDO A;  1G0J A;  1GB5 A;  1H68 A;  4LDL A;  3PBL A;  1QUS A;  4CGE A;  2BQK A;  3A94 A;  2AUB A;  4E3U A;  2FBD A;  2BQI A;  5LVJ A;  5C6L A;  4XJF A;  2B6Z A;  2LYZ A;  1BGI A;  5KXZ A;  1UID A;  3TXJ A;  3HTF A;  1KXY A;  1L14 A;  2YVB A;  4UWN A;  1GE3 A;  3WQJ A;  160L A;  1LWG A;  1W08 A;  1L79 A;  4RLM A;  1EQE A;  5AZD A;  4Z41 A;  1BWH A;  1C6F A;  1B2K A;  2XBR A;  1D6Q A;  211L A;  2KSA A;  1LW9 A;  5G2C A;  1LHM A;  4GYC A;  1LJ3 A;  1C67 A;  1DXJ A;  4IAR A;  1B5Y A;  2B6T A;  1XJT A;  2J4Y A;  1C65 A;  2FYC A;  3DMZ A;  3L2X A;  1ZVH L;  4WAV A;  1LI2 A;  3P65 A;  2QPD B;  3TMU A;  3C9M A;  1QT8 A;  1XSF A;  5LYM A;  2FYD A;  1LYH A;  4OO9 A;  4EKP A;  3K3T A;  186L A;  1L33 A;  3CT1 A;  1HEO A;  4TUN A;  3P64 A;  1DPW A;  4E97 A;  3TXK A;  5FEL A;  1WQO A;  1L55 A;  3CB7 A;  3PDS A;  1GB8 A;  1DI4 A;  1GFR A;  5LVH A;  3B6L A; 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 4BVN A;  5APC A;  5IDD A;  1QS5 A;  233L A;  226L A;  1UAC Y;  1JTO L;  1LKS A;  1YIK A;  1GEZ A;  1GB6 A;  1L65 A;  1LZ9 A;  3HH5 A;  3WUN A;  3NY8 A;  1TEW A;  5HLL A;  2YSS C;  1CV1 A;  1L28 A;  1TCY A;  2HTX A;  5DN4 A;  5HNL A;  1CU6 A;  2LYO A;  3G3B B;  3NYA A;  1S52 A;  164L A;  1CTW A;  3DN3 A;  155L A;  1B9O A;  1XGR C;  256L A;  5KJ9 A;  1SSY A;  2BQH A;  2OTY X;  1KY1 A;  5F8U A;  4HV1 A;  5B35 A;  1L91 A;  1JTM A;  2RBR A;  1L56 A;  1C6L A;  1GB0 A;  1IEE A;  1K28 A;  3ZPR A;  5LAG A;  1Q5J A;  1HEP A;  2MEF A;  1C6J A;  1CJ7 A;  3NS0 A;  1ZMY L;  4GCF A;  3LZM A;  5I14 A;  158L A;  1DI5 A;  2ZNX Y;  159L A;  1CKG A;  3PWH A;  1L66 A;  236L A;  3WH1 A;  5I4Y A;  4DQJ A;  4EA3 A;  1GDW A;  4LYB A;  4R6C A;  4MR1 A;  1CJ9 A;  1IX0 A;  149L A;  3AB6 A;  216L A;  1L37 A;  1LZ1 A;  1L09 A;  1I6S A;  2Z2F A;  1KXX A;  1LTM A;  5A3Z A;  1T6H A;  181L A;  2QAR C;  5D5C A;  5LXW A;  107L A;  1HFX A;  1LI3 A;  1L96 A;  3S8F B;  3G3W A;  3LN2 A;  1LZE A;  4FA7 B;  246L A;  2ZIY A;  3DN8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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