3UONA

Structure of the human m2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRINIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/antagonist
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Human M2 muscarinic acetylcholine, receptor T4 lysozyme fusi
total genus 159
structure length 438
sequence length 438
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3uonA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3uonA01
3T45A 1X0I1 4Y9HA 4W56A 1L10A 1FBBA 3X3BA 1E12A 2YCWA 4PXKA 2OTZX 4W55A 3QBIA 260LA 2RBPA 1P8HA 4XXJA 1LYGA 2B75A 1U19A 2Z73A 1XEPA 3OE0A 3VI0A 103LA 1C63A 1L31A 1P46A 1L63A 4MBSA 3ZPRA 3GUNA 1L60A 2F32A 1EHKB 4W52A 2Y00A 261LA 1PXRA 1KG9A 1JFPA 1DYBA 4YXCA 1GU8A 4G7RB 2LC9A 2Q9EA 1L81A 196LA 2IGCA 4HYJA 1UCQA 221LA 3REYA 4L35A 5TGZA 3RUNA 3UONA 1L9HA 4EKSA 5H2IA 4EIYA 1L69A 1L83A 4N4YB 1L40A 1KNIA 176LA 4FBZA 3A7KA 3HUQA 1BM1A 1L43A 1QSBA 234LA 3G3WA 4WAVA 119LA 1MGYA 1L58A 3WQJA 1CV6A 2O7AA 3VG9A 161LA 4I7KA 3HTGA 3RZEA 4L6RA 2Y04A 3OE9A 1BRRA 175LA 3ZEVA 1D3FA 1G1WA 118LA 110LA 2F93A 4I7JA 5FJGA 3EH3B 4QIDA 3QBLA 3PXOA 1LPYA 4G72B 1L30A 1L94A 4ZPUA 2BRDA 1R84A 1L70A 1PQMA 2OE4X 4G7QB 1L06A 2HUKA 4IAQA 3C83A 107LA 3PBLA 2Y01A 1L67A 152LA 3EH4B 247LA 4W58A 157LA 2RBQA 3QJVB 4XTOA 1OV7A 4AQNA 3UTVA 1L56A 4FPDA 1L79A 1T8AA 4WW3A 1D9WA 4G71B 5B6VA 4EXMA 2RB1X 3QJQB 217LA 1R2NA 4W53A 223LA 2QB0B 253LA 191LA 4I7QA 1G0KA 1L82A 130LA 1LW9A 1D3NA 229LA 1P2RA 5G54A 5H2NA 227LA 2R4SA 5G2DA 1QSQA 1T6HA 3MBVA 1SWYA 1QT3A 4OO9A 1L48A 1LGWA 1QUHA 201LA 2B7XA 1L46A 1C3WA 3GUJA 255LA 2F2QA 1L74A 3S8GB 2RAZX 1L95A 3NY8A 160LA 222LA 1C6TA 177LA 1D3MA 1C62A 1C6JA 1L07A 199LA 3VVKA 4LDLA 4TL3A 5B35A 1KW7A 3NY9A 2O79A 1E0PA 142LA 4LDOA 4I7OA 1H2SA 1VJMA 143LA 2RAYX 1D2WA 1DYDA 3QJUB 4BEYA 2JAGA 137LA 4I7SA 250LA 3HH5A 146LA 1QS9A 1OVJA 104LA 252LA 122LA 5H2LA 4QI1A 3RFMA 3S8FB 1AP9A 1QM8A 4HYXA 1L68A 1I6SA 170LA 2B6YA 3HTBA 1C6HA 4EKPA 4PXFA 1FBKA 1IXFA 1H68A 5DHGA 111LA 1QKOA 198LA 1L14A 4XTLA 1CV4A 155LA 1F50A 1C6CA 113LA 1EPYA 2HUMA 4MD2A 5G28A 5JJEA 1L39A 1L15A 1L35A 1QTHA 1P7SA 1C6KA 1L87A 3LZMA 4QRYA 1L86A 1P2LA 1C64A 231LA 1KG8A 3HAPA 2M3GA 4EPIA 5LZMA 1L0MA 1VGOA 1ZURA 3HASA 3UTYA 1LWKA 1LI2A 1CU2A 2HULA 4EKRA 169LA 5G36A 2B6WA 1P5CA 1QUDA 1S52A 1L52A 190LA 3DMXA 1KY0A 228LA 1L98A 1S8LA 4MQTA 1D2YA 3NS0A 195LA 1LWGA 1QT4A 1S8JA 1L53A 1O0AA 5AHYA 129LA 1L97A 206LA 3C7ZA 3GUOA 5B6ZA 1QT8A 5B6WA 1GUEA 108LA 185LA 172LA 4A4MA 4BWBA 246LA 4DAJA 5JJJA 1L0KA 1S54A 3BVDB 1QTZA 1QUGA 2VT4A 3SN6R 1OWZA 1QT7A 1CV5A 1L93A 4KLYA 4XT3A 3QJTB 1L57A 225LA 1L75A 215LA 3F9LA 1P8UA 4JKVA 1LYFA 5AX0A 1L45A 1P3NA 163LA 242LA 1PQKA 3SB6A 209LA 188LA 256LA 1C65A 262LA 180LA 1GZMA 1JV7A 4J4QA 2A4TA 4JQ6A 238LA 1KW5A 1CX7A 164LA 2I35A 5B34A 3G3VA 192LA 4ARPA 1C61A 2QPEB 1L84A 4BEZA 1LI3A 1CUPA 5H2PA 4YX7C 2ANXA 3S3DB 181LA 216LA 5KKHA 1G0QA 214LA 4FAAB 167LA 259LA 1L09A 1QHJA 186LA 1CX6A 1JQUA 1L92A 205LA 2CUUA 3QAKA 3HT9A 4I7MA 3SB5A 1ZYTA 2NTWA 1PXSA 5B2NA 3DN4A 1L61A 1C6NA 1C6LA 3DN1A 1B6IA 3D4SA 1P6YA 2B74A 1XIOA 2F95A 2R4RA 1L0JA 2YCZA 1DYAA 4PJZA 2YDVA 220LA 2LZMA 151LA 3HUAA 1UAZA 1XMEB 4N6HA 1CU0A 3HAQA 2OU8A 2OU0X 1C68A 5ITCA 3DNAA 1C60A 4KNFA 2YCXA 1L08A 4GP8B 4GBRA 1L03A 5EN0A 4G7SB 3ZPQA 1KY1A 2NTHA 2B72A 1XJUA 5B6XA 145LA 3HT6A 2RBRA 3UZAA 5H2MA 2QARC 5AZDA 1L76A 197LA 4FA7B 1HZXA 1QKPA 5B0WA 4AMIA 3S3BB 1X0K1 237LA 149LA 3K2RA 3EMLA 2X72A 184LA 4BVNA 4DJHA 147LA 173LA 1CU6A 1CWQA 1KGBA 3S3CB 3DN6A 251LA 4ARMB 3SB7A 2L78A 3ODUA 1JGJA 4I7LA 1L22A 1L62A 1QUOA 1L02A 1L59A 4EKQA 3UTXA 1LYIA 3HDEA 1M0LA 3DDLA 3QAPA 2L6XA 1QTDA 4BUOA 4MD1A 1K28A 210LA 1L65A 243LA 3HUKA 1TN0A 1JV6A 3DQBA 4BV0A 235LA 248LA 3JR6A 1L28A 1XJIA 4N4WA 1F4ZA 1QTCA 1QTVA 1T97A 3UZCA 2B70A 224LA 4YXAC 3HU8A 3G3XA 1SWZA 1OYUA 3C82A 1L54A 2KSYA 5AX1A 5G2CA 1PQDA 1QT6A 244LA 3OE6A 187LA 1C69A 258LA 1CVKA 1P56A 112LA 1G0GA 1L44A 3DMVA 1C6GA 4I7PA 236LA 3HANA 131LA 5H2JA 2YCYA 174LA 5C1MA 6LZMA 1P8IA 2RB0X 1AT9A 1IW6A 1G0MA 1L49A 165LA 2RBOA 168LA 1C6AA 3CDVA 4ARLA 1F88A 2WJKA 1CU3A 233LA 128LA 1L77A 1LYHA 240LA 3C7YA 1CV0A 3C80A 1L16A 4IAPA 5H2KA 2B6XA 123LA 1C6MA 3SB8A 1P36A 2JAFA 120LA 4G70B 219LA 4GYCA 3VGAA 189LA 5AHZA 1G0PA 1L41A 1L42A 1G06A 1Q5JA 2LNLA 3ABWA 4IB4A 4X32A 1G0LA 3HAOA 3F8VA 3C81A 3HH6A 2Z55A 3QBKA 4W59A 162LA 1L00A 4UG2A 5ETZA 3HT8A 2B6ZA 158LA 1PY6A 3X3CA 1CV1A 254LA 2PEDA 1L50A 211LA 1XJTA 1TLAA 1T8FA 4E97A 1X0SA 4I7TA 3QJRB 4I7RA 4JR8A 1LGUA 1S51A 1OWYA 5A45A 3V2WA 1L47A 2KS9A 141LA 5AWZA 3CDQA 200LA 1LYJA 115LA 4K5YA 3CODA 4PK0A 1L17A 1PQIA 3HWLA 4DKLA 1C6PA 1C6FA 3OAXA 1JTMA 1G07A 139LA 171LA 230LA 1C6EA 3OE8A 3DMZA 4ARQB 114LA 1L12A 3SB9A 5H2HA 1L51A 1L90A 3CDTA 3HARA 3C9MA 1LYDA 1SSYA 183LA 3VW7A 5J7AA 1L72A 1G0JA 1SX2A 4GP5B 4W57A 2ZIYA 5LWEA 1L34A 1DYCA 4W54A 2NTUA 4GBRB 102LA 218LA 3HU9A 1DYGA 126LA 3DN0A 1P37A 2ZZLA 1LGXA 4LDEA 3P0GA 3SBBC 2Z6BA 257LA 2Y03A 4ARMA 127LA 2NTGA 4IARA 232LA 3HTFA 226LA 3QDCA 2OTYX 1L05A 212LA 1KS3A 3CDRA 3L64A 1Q5IA 1C6DA 1C66A 1QS5A 4MQSA 1L36A 4GP4B 1M0KA 2KSAA 4GPOA 2AT9A 1C6QA 2I20A 1G1VA 1LLHA 4I7NA 4X31A 1L27A 5A8EA 5ITEA 2EI4A 1L19A 1CUQA 2Q9DA 2OU9A 3HH4A 1L18A 1L99A 4HWLA 5DHHA 1C8SA 2RBSA 3C9LA 2OE7X 3PQRA 4UHRA 1CTWA 109LA 1QT5A 3DN3A 3KJ6A 1NHBA 2LCBA 1KMEA 3EH5B 3QBGA 150LA 1DYFA 4EJ4A 3UTWA 1L23A 159LA 3PWHA 5I14A 5A44A 1OVHA 2WJLA 2YDOA 1L64A 1OV5A 3FADA 4EPFA 3COCA 4LZMA 3FA0A 1L20A 3L2XA 3QJSB 144LA 2ANVA 1L21A 1L04A 1L24A 3UG9A 5BR5A 2F47A 3GUIA 1WTHA 3CAPA 4XT1A 1L32A 239LA 1S53A 5G2AA 1D3JA 3AYNA 166LA 1C6IA 5F8UA 1CV3A 3SBAA 1BRXA 5G53A 3AM6A 3C8QA 1L26A 182LA 4NC3A 1L55A 1M0MA 1L11A 5BR2A 1L33A 1L89A 4AMJA 1L85A 3C8RA 3GUPA 2KSBA 1C6BA 2OEAX 1T8GA 1L13A 3V2YA 1OVKA 3HDFA 5DYSA 1TN5A 3HH3A 1QTBA 1C8RA 125LA 1LI6A 2I1XA 1L37A 3AYMA 1CU5A 1L80A 213LA 3DN8A 1L88A 1DYEA 1LN6A 4GRVA 3C7WA 2RB2X 241LA 4X1HA 178LA 2RH1A 2QPDB 1SX7A 2HPYA 2B73A 3VHZA 1C67A 1L38A 3NYAA 2OE9X 1L01A 1L73A 138LA 1L25A 156LA 2B6TA 4OV0A 3DKEX 4EA3A 1P64A 1JTNA 3GUMA 2G87A 2I21A 3GUKA 1DZEA 1L91A 1PQJA 4ARQA 1SSWA 4W51A 2J4YA 1PQOA 7LZMA 3NSBA 4ARJA 1L66A 1BRDA 3FI5A 1ZWNA 1L96A 2Y02A 2RBNA 3C8SA 4XTNA 140LA 5B6YA 5JJNA 3HTDA 249LA 5H2OA 1L71A 3CDOA 148LE 1IW9A 1LYEA 3HT7A 3PDSA 4S0WA 2ZFEA 245LA 1L29A 3DN2A 2O4WA 3GULA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0MX 4GCBA 4J7VA 1FBBA 3X3BA 4W55A 3CSQA 2CGIA 1AKIA 1U19A 1GB2A 3OE0A 1C63A 1L31A 1P46A 3ZPRA 1EHKB 3A3QA 4WOAA 1FLQA 261LA 5HMJA 4ETCA 4G7RB 2Q9EA 1I56A 4HYJA 196LA 1WQPA 3REYA 1SLYA 5TGZA 4EKSA 2X0AA 4G4BA 1BM1A 234LA 4WL6A 4WAVA 119LA 3AZ4A 1CV6A 2CWIA 3VG9A 1WQNA 4KXIA 3D3DA 207LA 1G1WA 3ATOA 4QIDA 4WO9A 2DQJY 4GCFA 4IAQA 107LA 4DC4A 1OV7A 4AQNA 1L56A 5KXPA 1T8AA 2H9JA 4G71B 4W53A 2A7DA 253LA 191LA 1HC0A 1P2RA 5H2NA 1BWJA 3W6BA 1RE2A 1L48A 2B7XA 4ZEEA 3GUJA 255LA 3S8GB 3NY8A 1C6TA 1B7SA 2MEIA 4TL3A 3AZ7A 3WUMA 2O79A 1E0PA 142LA 4LDOA 4I7OA 2Z38A 1VJMA 4DD1A 2RAYX 1DYDA 4HTKA 3QJUB 2JAGA 9LYZA 146LA 1OVJA 3WW6A 5H2LA 2BQIA 3FI7A 1I20A 1DXJA 4PXFA 4EKPA 3FE0A 5DHGA 5DLAA 1HFXA 198LA 2DBTA 1L14A 4PRUA 1HEQA 2C8OA 4CHXA 5G28A 5JJEA 1OUFA 1GE2A 1JKBA 1P7SA 3OJPA 3LZMA 3WXTA 4QRYA 4GLAA 1P2LA 1C64A 1MELL 231LA 5KXZA 1CJ8A 5LZMA 1H6MA 1L0MA 1LJEA 1LWKA 4R6CA 5APFA 4EKRA 1GFJA 1LMCA 1P5CA 2HEDA 3TXGA 3TXKA 3NS0A 1QT4A 5AHYA 206LA 3GUOA 4TX7A 1HNLA 2BQOA 3ZVQA 1OUIA 3HFMY 4GN5C 4BWBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 131L A;  5H2J A;  2YCY A;  174L A;  5C1M A;  6LZM A;  1P8I A;  2RB0 X;  1AT9 A;  1IW6 A;  1G0M A;  1L49 A;  165L A;  2RBO A;  168L A;  1C6A A;  3CDV A;  4ARL A;  1F88 A;  2WJK A;  1CU3 A;  233L A;  128L A;  1L77 A;  1LYH A;  240L A;  3C7Y A;  1CV0 A;  3C80 A;  1L16 A;  4IAP A;  5H2K A;  2B6X A;  123L A;  1C6M A;  3SB8 A;  1P36 A;  2JAF A;  120L A;  4G70 B;  219L A;  4GYC A;  3VGA A;  189L A;  5AHZ A;  1G0P A;  1L41 A;  1L42 A;  1G06 A;  1Q5J A;  2LNL A;  3ABW A;  4IB4 A;  4X32 A;  1G0L A;  3HAO A;  3F8V A;  3C81 A;  3HH6 A;  2Z55 A;  3QBK A;  4W59 A;  162L A;  1L00 A;  4UG2 A;  5ETZ A;  3HT8 A;  2B6Z A;  158L A;  1PY6 A;  3X3C A;  1CV1 A;  254L A;  2PED A;  1L50 A;  211L A;  1XJT A;  1TLA A;  1T8F A;  4E97 A;  1X0S A;  4I7T A;  3QJR B;  4I7R A;  4JR8 A;  1LGU A;  1S51 A;  1OWY A;  5A45 A;  3V2W A;  1L47 A;  2KS9 A;  141L A;  5AWZ A;  3CDQ A;  200L A;  1LYJ A;  115L A;  4K5Y A;  3COD A;  4PK0 A;  1L17 A;  1PQI A;  3HWL A;  4DKL A;  1C6P A;  1C6F A;  3OAX A;  1JTM A;  1G07 A;  139L A;  171L A; 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 3PWH A;  5I14 A;  5A44 A;  1OVH A;  2WJL A;  2YDO A;  1L64 A;  1OV5 A;  3FAD A;  4EPF A;  3COC A;  4LZM A;  3FA0 A;  1L20 A;  3L2X A;  3QJS B;  144L A;  2ANV A;  1L21 A;  1L04 A;  1L24 A;  3UG9 A;  5BR5 A;  2F47 A;  3GUI A;  1WTH A;  3CAP A;  4XT1 A;  1L32 A;  239L A;  1S53 A;  5G2A A;  1D3J A;  3AYN A;  166L A;  1C6I A;  5F8U A;  1CV3 A;  3SBA A;  1BRX A;  5G53 A;  3AM6 A;  3C8Q A;  1L26 A;  182L A;  4NC3 A;  1L55 A;  1M0M A;  1L11 A;  5BR2 A;  1L33 A;  1L89 A;  4AMJ A;  1L85 A;  3C8R A;  3GUP A;  2KSB A;  1C6B A;  2OEA X;  1T8G A;  1L13 A;  3V2Y A;  1OVK A;  3HDF A;  5DYS A;  1TN5 A;  3HH3 A;  1QTB A;  1C8R A;  125L A;  1LI6 A;  2I1X A;  1L37 A;  3AYM A;  1CU5 A;  1L80 A;  213L A;  3DN8 A;  1L88 A;  1DYE A;  1LN6 A;  4GRV A;  3C7W A;  2RB2 X;  241L A;  4X1H A;  178L A;  2RH1 A;  2QPD B;  1SX7 A;  2HPY A;  2B73 A;  3VHZ A;  1C67 A;  1L38 A;  3NYA A;  2OE9 X;  1L01 A;  1L73 A;  138L A;  1L25 A;  156L A;  2B6T A;  4OV0 A;  3DKE X;  4EA3 A;  1P64 A;  1JTN A;  3GUM A;  2G87 A;  2I21 A;  3GUK A;  1DZE A;  1L91 A;  1PQJ A;  4ARQ A;  1SSW A;  4W51 A;  2J4Y A;  1PQO A;  7LZM A;  3NSB A;  4ARJ A;  1L66 A;  1BRD A;  3FI5 A;  1ZWN A;  1L96 A;  2Y02 A;  2RBN A;  3C8S A;  4XTN A;  140L A;  5B6Y A;  5JJN A;  3HTD A;  249L A;  5H2O A;  1L71 A;  3CDO A;  148L E;  1IW9 A;  1LYE A;  3HT7 A;  3PDS A;  4S0W A;  2ZFE A;  245L A;  1L29 A;  3DN2 A;  2O4W A;  3GUL A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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