3UON | Genus

Total Genus 159

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	159
sequence length	438
structure length	438
Chain Sequence	TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRINIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLM

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__564387296429856__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__564387296429856__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3UON/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__564387296429856__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"564387296429856","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3UON/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__564387296429856__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Signaling protein/antagonist
source organism	Homo sapiens
publication title	Structure of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Human M2 muscarinic acetylcholine, receptor T4 lysozyme fusi
total genus	159
structure length	438
sequence length	438
ec nomenclature	ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date	2011-11-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00959	Phage_lysozyme	Phage lysozyme
A	PF00001	7tm_1	7 transmembrane receptor (rhodopsin family)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.530.40	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Lysozyme	Lysozyme	3uonA02
1.20.1070.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins	Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins	3uonA01

4XT1A 1U19A 3OAXA 1QT5A 3VW7A 1BRRA 219LA 1L20A 4W51A 1T8GA 1C6KA 1C6DA 2AT9A 3P0GA 2YDVA 3HTBA 2B75A 1PQMA 237LA 2CUUA 5ETZA 3HT8A 3OE6A 262LA 2Z73A 1ZWNA 1OV5A 3DKEX 1LGUA 1C6TA 250LA 1DYAA 2RBQA 1G1WA 3QAPA 3REYA 1C6IA 1KG8A 1FBKA 3DMVA 3QJVB 1L19A 3HH3A 240LA 1CX6A 1C65A 1QUGA 2X72A 5B6XA 1L49A 2B6XA 2OTZX 2Y03A 1L68A 4LZMA 2Y02A 3RZEA 1C68A 1P64A 3GUKA 1LLHA 4HYXA 3OE0A 1CX7A 1E0PA 181LA 104LA 1JQUA 252LA 1L87A 4DAJA 4ARMA 1QT4A 3UZCA 2OEAX 2WJKA 3PXOA 2L78A 223LA 3G3XA 146LA 4MQTA 1KG9A 3C82A 3QBKA 1L57A 131LA 1LYFA 2Q9EA 4IB4A 184LA 1C6GA 1G06A 1L92A 3C8SA 3CDVA 1F4ZA 3VHZA 3HT6A 3EH3B 1D2WA 5I14A 4EKPA 1QUHA 3RUNA 3QBGA 2IGCA 5H2IA 1QUDA 1C67A 1T6HA 3HH4A 2Y01A 4HYJA 4OV0A 5B2NA 4GPOA 201LA 192LA 1S8JA 1OWYA 2RH1A 1JV7A 4JKVA 233LA 1DYFA 3HUQA 2LNLA 1L89A 3ODUA 2F47A 189LA 4IAQA 1M0LA 4W56A 1C6MA 2NTWA 3AYMA 102LA 126LA 4G71B 4QI1A 1LYGA 1OVKA 200LA 2B74A 3RFMA 3SN6R 3CODA 1DYEA 3QBLA 5JJNA 155LA 1L31A 1PQJA 5ITEA 4GBRB 1LI3A 1C6NA 2QPDB 5H2PA 1L75A 4EJ4A 1PY6A 4G7SB 1L98A 3C7YA 3HH6A 4EKSA 1L0KA 2RBNA 4XXJA 1DYGA 1G0PA 1XJUA 1BRDA 2I21A 3F9LA 1G0JA 1L05A 3GUMA 1C60A 2J4YA 1L55A 3DN3A 3UG9A 4GP5B 1DZEA 199LA 1L61A 1L60A 1P8HA 3MBVA 1L79A 258LA 2LZMA 1JTNA 2RAYX 1QTDA 2LCBA 1L64A 2YCXA 1HZXA 2OU0X 1XJIA 3AYNA 1P8UA 2YCYA 1C6BA 1L22A 138LA 1LI2A 4DJHA 1S8LA 1C6AA 1PQOA 147LA 171LA 1L56A 5J7AA 3FA0A 1G0LA 4X1HA 3C9MA 1QS9A 4I7OA 1L88A 3HAQA 1ZYTA 4KLYA 4MQSA 2B6YA 1L14A 4NC3A 1CU3A 3DN8A 3HARA 4I7JA 1L91A 3NYAA 1KW5A 2F95A 112LA 1L41A 1NHBA 3HU8A 218LA 107LA 2R4RA 1SX2A 1Q5IA 1QT3A 4I7PA 1L33A 1C61A 3HH5A 3UTWA 3GUIA 5H2OA 4PJZA 186LA 1L76A 254LA 3HDEA 4EXMA 1L82A 1X0SA 4UG2A 3HUAA 195LA 3LZMA 1L53A 3SB9A 3WQJA 4N4WA 4J4QA 191LA 2OE4X 5FJGA 1CU0A 4W59A 4JR8A 261LA 3FADA 4W53A 3BVDB 4GYCA 2JAFA 1UCQA 4AMJA 1L21A 1L83A 209LA 4A4MA 3CDRA 3DNAA 3CAPA 158LA 4MBSA 4HWLA 4KNFA 1QTVA 165LA 1L59A 2I1XA 2KSAA 2KS9A 1C8RA 3QJRB 1LPYA 1T8AA 4I7MA 1P56A 5BR5A 4G7RB 5EN0A 3S3BB 2RB0X 5AHZA 1P46A 123LA 3D4SA 1VJMA 242LA 3X3BA 2RB2X 3G3VA 1L96A 2I20A 4G70B 3QJUB 4YX7C 256LA 1L43A 4ARLA 187LA 2ZZLA 3EH5B 1SSYA 5F8UA 1K28A 217LA 3SB6A 1PQDA 4X31A 1L93A 1C64A 3HT7A 6LZMA 1JTMA 2B6TA 122LA 3SBAA 5AX0A 3C8QA 4EKQA 4BWBA 4FA7B 1D9WA 1C6QA 4I7KA 2L6XA 1QSBA 1L99A 1L48A 2RBSA 3DN0A 1R84A 1M0KA 2B7XA 3HANA 3CDTA 1L04A 1H2SA 1QKPA 2EI4A 2B6WA 247LA 236LA 1L26A 5B6YA 1LGWA 3DN6A 228LA 2BRDA 5DHGA 3DMXA 1LYDA 1L9HA 3V2WA 1OV7A 3C9LA 1O0AA 4G72B 2NTUA 3C7WA 4EPIA 1KS3A 2Y04A 1L63A 4XT3A 2QB0B 2YCWA 1L35A 234LA 206LA 4I7RA 1LWGA 5C1MA 1L24A 1LYJA 1S54A 140LA 1CU5A 1LYIA 161LA 2OE7X 1C3WA 156LA 3UONA 1S51A 1G0GA 1GZMA 3UTYA 1CUPA 1PXRA 3F8VA 166LA 1L39A 1C6LA 109LA 1JFPA 4AQNA 2PEDA 1G1VA 1KGBA 3HTDA 3QJSB 3C81A 1L08A 1LW9A 1CVKA 3DDLA 149LA 2ZFEA 4MD1A 103LA 5ITCA 1G0KA 178LA 3QDCA 172LA 4IARA 3GUPA 1GUEA 1L46A 3K2RA 1L23A 1P2LA 3QBIA 4N6HA 1CV6A 2Y00A 1L66A 3V2YA 3VGAA 1BRXA 225LA 1LYEA 1T8FA 3C7ZA 4E97A 3HWLA 4L35A 1IW6A 1I6SA 249LA 3FI5A 2HPYA 1S53A 211LA 3DMZA 239LA 1L45A 4ARQB 2NTHA 1QT8A 241LA 1AT9A 4X32A 3KJ6A 141LA 3SB5A 3NY9A 2LC9A 5G53A 1TN0A 2QARC 231LA 1FBBA 1P37A 1L80A 3HDFA 5G28A 5G2CA 3HUKA 1L25A 1L58A 1D3FA 1ZURA 2OTYX 4EPFA 3QJQB 1QUOA 215LA 1L44A 5A45A 159LA 127LA 1L07A 1QTZA 162LA 110LA 3OE8A 1KMEA 1DYBA 212LA 7LZMA 2NTGA 5BR2A 4N4YB 5A44A 1C6CA 4W57A 119LA 1L01A 1L71A 1SSWA 2B72A 4I7TA 4K5YA 185LA 1GU8A 1EHKB 2O79A 2O7AA 2O4WA 1L90A 1XJTA 4EKRA 2OU8A 2ZIYA 2OE9X 4W55A 3S8FB 3PBLA 2ANVA 3X3CA 169LA 1L27A 4DKLA 4FAAB 113LA 5H2MA 1SWYA 1L28A 1SX7A 4W58A 4PXKA 180LA 4LDLA 3HASA 1L47A 4YXCA 1L72A 1L77A 114LA 1CU2A 4Y9HA 3PWHA 2Q9DA 1PQIA 1L13A 1L65A 4W54A 111LA 1M0MA 3G3WA 1TN5A 1L86A 3OE9A 220LA 2KSYA 216LA 2RBRA 137LA 4YXAC 173LA 4GRVA 5B35A 3SBBC 163LA 4EA3A 1QTBA 1CV4A 151LA 188LA 4XTLA 198LA 3HAOA 5B6VA 2RB1X 253LA 4ARJA 5B6WA 1L03A 3S3CB 115LA 3DN1A 5H2HA 2YCZA 118LA 1OWZA 4FPDA 1QT6A 4XTOA 1L0JA 4IAPA 4W52A 248LA 1PXSA 238LA 145LA 4OO9A 257LA 1D3JA 1JGJA 3CDOA 1F88A 152LA 2B73A 5A8EA 1QKOA 3UTVA 3CDQA 1P5CA 3QJTB 221LA 3ZPRA 183LA 5G54A 144LA 1IW9A 175LA 1Q5JA 230LA 1CWQA 1S52A 2Z6BA 1P8IA 1L02A 174LA 3QAKA 3A7KA 5B6ZA 5JJJA 1C66A 1L69A 1D3MA 4FBZA 1R2NA 4ARPA 1C6JA 1L15A 244LA 226LA 1XMEB 224LA 1L37A 3AM6A 3L64A 2G87A 3NSBA 3VG9A 108LA 1QHJA 4I7SA 1L38A 1L34A 5H2LA 2HUKA 196LA 4L6RA 4GP4B 1JV6A 1C6EA 1CV0A 1D3NA 3S8GB 4WW3A 1L81A 4AMIA 1LI6A 232LA 4QIDA 4QRYA 5KKHA 5H2KA 1G0QA 1DYCA 143LA 1L97A 246LA 3C83A 1F50A 3C8RA 1L70A 1L30A 3SB7A 2JAGA 1L09A 222LA 4MD2A 2HUMA 1C6HA 1L32A 5LZMA 4ARMB 1X0K1 1EPYA 3UZAA 1BM1A 182LA 1P3NA 2ANXA 1XIOA 1WTHA 210LA 1QTCA 2HULA 1KNIA 5B0WA 3T45A 168LA 3GULA 1L73A 5H2NA 1L94A 5G2DA 1B6IA 4ZPUA 1L95A 197LA 4BEZA 3HU9A 1AP9A 1DYDA 3SB8A 4GBRA 1CU6A 3VI0A 3PQRA 1L50A 3HT9A 1L52A 4LDEA 4I7NA 2RBOA 4BV0A 2M3GA 167LA 4ARQA 1LWKA 3ZEVA 245LA 2F32A 125LA 1L29A 2B6ZA 1C6PA 227LA 5DHHA 2OU9A 255LA 2F93A 1QSQA 1CV1A 4I7LA 1P7SA 1KW7A 229LA 1G0MA 1L00A 1L54A 1IXFA 1C6FA 1XEPA 148LE 176LA 3EH4B 1C63A 1P6YA 5AHYA 1QS5A 1MGYA 1QM8A 1L0MA 3C80A 2R4SA 5JJEA 1L74A 139LA 1D2YA 3NY8A 1PQKA 1G07A 142LA 1C62A 3DN4A 1L36A 160LA 4G7QB 4BVNA 3GUOA 1CTWA 1P2RA 3EMLA 4PK0A 1L10A 260LA 2RBPA 1QTHA 214LA 190LA 1CUQA 1L67A 1OVJA 1L18A 4GP8B 3GUJA 128LA 1L12A 1LGXA 1QT7A 129LA 1KY1A 4LDOA 1UAZA 5H2JA 1L51A 1L11A 1L40A 1L85A 1SWZA 5B34A 2Z55A 5G36A 2RAZX 5LWEA 2F2QA 1L17A 2WJLA 4EIYA 4UHRA 3COCA 5AWZA 1CV3A 205LA 1TLAA 170LA 1CV5A 3DQBA 3JR6A 1L62A 2B70A 164LA 1KY0A 4S0WA 3S3DB 3ZPQA 235LA 3GUNA 2A4TA 1H68A 213LA 1L42A 3L2XA 3NS0A 4TL3A 1X0I1 2I35A 4JQ6A 1T97A 5DYSA 259LA 2VT4A 1LYHA 3HTGA 2KSBA 1P36A 3VVKA 3ABWA 5AZDA 1LN6A 1OYUA 3PDSA 1OVHA 2YDOA 5TGZA 4PXFA 3HAPA 4XTNA 5G2AA 243LA 3DN2A 251LA 1VGOA 3UTXA 157LA 5AX1A 130LA 150LA 3HTFA 1L16A 1E12A 4I7QA 1L06A 1C69A 177LA 2QPEB 4BUOA 1L84A 4WAVA 4BEYA 120LA 1C8SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3UONA

Total Genus

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