3VW7A

Crystal structure of human protease-activated receptor 1 (par1) bound with antagonist vorapaxar at 2.2 angstrom
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
447
structure length
442
Chain Sequence
DASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLGITTCHDVLSETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSANIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein/antagonist
source organism Homo sapiens
publication title High-resolution crystal structure of human protease-activated receptor 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proteinase-activated receptor 1, Lysozyme
total genus 165
structure length 442
sequence length 447
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3vw7A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3vw7A01
2RB1X 3S8GB 2RB2X 2I21A 141LA 3S8FB 1L07A 1L45A 1PXSA 251LA 4QIDA 5B6ZA 2NTHA 1TN5A 3T45A 5A44A 4WAVA 1C6IA 3HUQA 2Z55A 3G3XA 125LA 2OE7X 1BRRA 1L16A 2KS9A 3EH5B 149LA 4XTLA 1JTMA 1P7SA 4I7MA 1QM8A 1S52A 3EH3B 4BVNA 1G0PA 4FBZA 4XT3A 4W57A 5B6VA 1L85A 1C6DA 4I7KA 186LA 1OVHA 3X3CA 184LA 1L40A 226LA 199LA 2NTWA 1L79A 3QJUB 219LA 4AMIA 1L06A 3C8RA 3DDLA 1JV6A 4I7NA 1L96A 3UTYA 1L0MA 3RZEA 1M0KA 2Z6BA 2I20A 1L60A 3FI5A 2B70A 104LA 1D2WA 2HULA 4G70B 3HT8A 1L92A 5JJEA 1L01A 4W55A 221LA 131LA 2HUKA 4HWLA 3L2XA 3QAPA 1I6SA 1P64A 3LZMA 1NHBA 234LA 4ARMA 2YCYA 3HANA 113LA 1C6PA 1KW5A 1L64A 1OVJA 1F50A 4X1HA 2OU8A 1L91A 1OWYA 228LA 2I1XA 256LA 5J7AA 243LA 2B72A 4PK0A 1U19A 211LA 1KS3A 2F2QA 1C6TA 1L76A 1L74A 3HH4A 216LA 4EXMA 1LI2A 4IB4A 5H2NA 1JGJA 3VG9A 2YCWA 2Q9EA 1L67A 1LYIA 3ODUA 4LDEA 220LA 1XJTA 2B74A 1L32A 1CV1A 5B2NA 3OE8A 1QSQA 1QT6A 242LA 1KGBA 4FAAB 1QUHA 2OEAX 1L24A 4BWBA 5H2LA 5AX0A 1MGYA 249LA 3ZPRA 1LW9A 1OWZA 1L0JA 1C8RA 3QDCA 3QJQB 1SX7A 1QT7A 3SBAA 3GUPA 4QRYA 115LA 3A7KA 3CDQA 2Y04A 160LA 4EPFA 3V2WA 5AHYA 1L08A 1D3FA 244LA 1PY6A 4W56A 4KNFA 3SB8A 1L61A 145LA 4MD2A 4IAPA 4IARA 1L28A 2L6XA 1L65A 2VT4A 1IW9A 5ETZA 1L75A 3QBIA 4EIYA 4JQ6A 3C7ZA 3ZPQA 2KSAA 5G2CA 1G1VA 1KNIA 4DKLA 1ZYTA 5G53A 139LA 1XEPA 4I7PA 3DMVA 4I7RA 4G7SB 3HH6A 3QJTB 5DYSA 1L02A 3HWLA 3L64A 4ARLA 4N4YB 1T6HA 1LI3A 4X31A 5A45A 5JJNA 3CDVA 1UAZA 5C1MA 3DN0A 3HT7A 1L30A 4YXAC 4LDOA 168LA 3NSBA 2LZMA 155LA 2YCZA 3UG9A 1L20A 3G3VA 3UTXA 1P2RA 118LA 2O7AA 239LA 1Q5IA 182LA 4MQTA 1SSWA 1R84A 1C6AA 1PQMA 259LA 1XIOA 1KY1A 3GUNA 1QT8A 5B6WA 5B6XA 3HU9A 3UTVA 3CODA 5EN0A 3DN4A 107LA 3AYMA 1LYJA 7LZMA 1L34A 1L94A 1CV0A 2OTYX 1DYAA 2J4YA 1F88A 4GP4B 3C81A 4OO9A 1KW7A 1CV6A 1LLHA 4X32A 4W51A 4DAJA 157LA 1L72A 1G0LA 2F32A 3PWHA 130LA 2WJKA 1L14A 4YX7C 1JFPA 1D3JA 5FJGA 3UTWA 3GUOA 1VGOA 1EPYA 3OE0A 1LYFA 162LA 2B73A 3EMLA 1C64A 201LA 1L29A 1QTVA 3G3WA 3HTFA 3C83A 210LA 2ZFEA 227LA 3C7WA 240LA 108LA 1D9WA 2ANVA 3CDTA 1CU0A 1L15A 4N4WA 1C3WA 2RBRA 1BRXA 1QKOA 237LA 4DJHA 1C67A 1OYUA 3KJ6A 167LA 1UCQA 3FADA 1DYEA 4UG2A 241LA 1P36A 2HUMA 3OAXA 1JTNA 3HAQA 156LA 4I7SA 1L81A 1L51A 209LA 2F93A 143LA 2OU0X 4EKRA 5AHZA 1LWKA 4EKQA 1P6YA 112LA 1KY0A 2O4WA 2OTZX 1PQDA 3DN6A 4GPOA 5I14A 4XTNA 1CVKA 4OV0A 1L22A 246LA 1C6EA 3DKEX 1L38A 200LA 4XXJA 2HPYA 1CU5A 5F8UA 2RBSA 248LA 2M3GA 1L95A 1L56A 1PQJA 1M0LA 1L43A 1FBKA 4I7QA 3S3DB 1F4ZA 4LZMA 262LA 190LA 148LE 3SB9A 247LA 1DYFA 1L46A 1AP9A 1CX7A 180LA 3QBKA 1TLAA 3QBGA 119LA 1QT4A 2F47A 4GBRB 4NC3A 4MQSA 1L36A 3PQRA 1X0SA 1L39A 1TN0A 215LA 1H68A 2YDOA 1L09A 1E12A 1XMEB 1PQIA 1C69A 3D4SA 3PDSA 1EHKB 1C61A 2CUUA 4W59A 3F9LA 1CUPA 2PEDA 3S3BB 4L35A 3VVKA 1CU6A 1L89A 122LA 3JR6A 3FA0A 146LA 1L57A 212LA 3NS0A 1QTDA 1FBBA 189LA 1PQKA 1CTWA 1L33A 3HUKA 3DN1A 150LA 4I7JA 4PJZA 1L97A 3SBBC 1M0MA 225LA 2LNLA 3OE9A 3HT9A 252LA 2A4TA 174LA 3C8QA 1P8IA 5LWEA 1C8SA 1WTHA 4QI1A 2RAYX 3V2YA 4UHRA 1QTHA 3EH4B 1L68A 191LA 1QTCA 2YCXA 138LA 3QJVB 1CU2A 3HAPA 1LGXA 1L49A 1L54A 1L99A 4W53A 2OU9A 1IXFA 224LA 5G2DA 1L04A 1L03A 1G0KA 1C6BA 257LA 1P3NA 4EA3A 140LA 1L44A 1C6LA 1C6MA 1SX2A 4E97A 236LA 3VGAA 3CAPA 1CV3A 1L77A 5G28A 2RBQA 2IGCA 1T8GA 3DMXA 2ZIYA 3UZAA 1L88A 1LN6A 1D3NA 4J4QA 1QS9A 2Y01A 3VW7A 3DN3A 1GZMA 188LA 4BEYA 1L05A 1L25A 1L55A 3C80A 1G06A 1JQUA 142LA 3VHZA 4I7TA 3HU8A 165LA 192LA 3S3CB 1CV4A 1L58A 4MD1A 1DZEA 4I7OA 5DHHA 2YDVA 2R4RA 147LA 6LZMA 1S8LA 4EKSA 1P5CA 1R2NA 2R4SA 3PXOA 1C6QA 2BRDA 1H2SA 4GP5B 206LA 5BR2A 4FPDA 163LA 4FA7B 1QHJA 2RBOA 217LA 177LA 1L18A 1LI6A 3P0GA 1LGUA 2O79A 3HH3A 5B0WA 1Q5JA 5B35A 1QUGA 238LA 166LA 1C60A 5LZMA 3K2RA 1C66A 2JAGA 3ABWA 3DNAA 2ZZLA 2B6XA 3GUIA 1GU8A 3C7YA 1JV7A 1G0JA 4G71B 159LA 172LA 213LA 5TGZA 3GUMA 4WW3A 1QKPA 4MBSA 171LA 1E0PA 1G1WA 1L0KA 3ZEVA 5ITCA 1L83A 253LA 3WQJA 169LA 187LA 2B6YA 4EPIA 5BR5A 173LA 1QTZA 1S54A 1DYDA 4PXFA 3HDFA 1QSBA 1L70A 1L00A 1C68A 1BRDA 3UZCA 3DMZA 2ANXA 4LDLA 1L37A 4JR8A 1ZWNA 3GUKA 4G72B 102LA 176LA 1OV5A 185LA 3F8VA 4YXCA 129LA 4W54A 4ARQB 3NY9A 5H2OA 3RFMA 198LA 1PQOA 181LA 1S51A 255LA 1XJIA 3UONA 1L90A 1QUDA 1L42A 1D3MA 1L86A 1CV5A 4G7QB 245LA 1L82A 2QPEB 5H2HA 2QB0B 158LA 1L31A 5KKHA 214LA 1HZXA 3NYAA 205LA 1P46A 3HDEA 161LA 4GRVA 114LA 3AM6A 1CU3A 3HUAA 120LA 1DYGA 2B6ZA 5DHGA 3HTBA 4EJ4A 1X0K1 3C8SA 3DN8A 4PXKA 3REYA 1KG9A 1BM1A 4G7RB 4K5YA 1SWYA 232LA 4Y9HA 1C6KA 1C6FA 4ZPUA 1AT9A 5B6YA 1P2LA 3MBVA 5H2PA 2QARC 1C6HA 1G0MA 3GUJA 2NTGA 3QAKA 2Y02A 1CWQA 1LYGA 1L87A 1LPYA 3C9LA 1SWZA 1L69A 3AYNA 2NTUA 5H2MA 2LC9A 1QT3A 1G0GA 2X72A 261LA 5G36A 4IAQA 2I35A 5H2JA 2B6WA 1L13A 1SSYA 1S8JA 4GP8B 1XJUA 4ARJA 3COCA 123LA 4EKPA 1C6CA 2Z73A 4S0WA 3CDOA 5JJJA 1QUOA 222LA 1C6NA 1L80A 2B6TA 2B75A 1L19A 1IW6A 1K28A 1L23A 127LA 1QT5A 2KSYA 1ZURA 1QTBA 3HAOA 103LA 1DYCA 5ITEA 4W52A 1L21A 1L35A 218LA 1LWGA 1L48A 1L10A 2QPDB 4JKVA 4AMJA 4ARQA 1LYDA 195LA 1L27A 1X0I1 2OE4X 2EI4A 2KSBA 4A4MA 258LA 111LA 3HH5A 1L47A 1T8FA 1KG8A 1P8HA 1L62A 1LYEA 4BUOA 3HTDA 3C82A 1CUQA 254LA 2Y00A 4ARPA 4HYJA 4BV0A 3C9MA 3OE6A 1T97A 1D2YA 1L11A 1O0AA 4W58A 2F95A 2JAFA 5AWZA 4BEZA 1L9HA 1CX6A 1LGWA 1G0QA 1L50A 1L93A 1T8AA 4GBRA 4TL3A 5G2AA 5AZDA 1PXRA 3GULA 4HYXA 1LYHA 4N6HA 5G54A 1L66A 3SB6A 1L98A 1C6GA 1L52A 233LA 196LA 1S53A 152LA 2L78A 4XTOA 164LA 2RBNA 3CDRA 3RUNA 3NY8A 2LCBA 2Y03A 2OE9X 1L17A 1L84A 223LA 3DQBA 197LA 4L6RA 3SN6R 4AQNA 3VI0A 1L73A 231LA 4ARMB 3QJRB 5A8EA 5H2IA 1C62A 109LA 3HASA 1L12A 128LA 1G07A 3BVDB 151LA 5B34A 260LA 1KMEA 183LA 4KLYA 2B7XA 5AX1A 1L53A 1L71A 1B6IA 110LA 2Q9DA 3SB7A 5H2KA 3X3BA 1VJMA 2AT9A 1L63A 1OV7A 2RBPA 3PBLA 126LA 2RAZX 2G87A 3DN2A 1QS5A 1C6JA 235LA 230LA 144LA 1P37A 3HT6A 2RH1A 1P56A 175LA 2WJLA 3HARA 2RB0X 3QJSB 250LA 1OVKA 1L41A 1L26A 3HTGA 1GUEA 1C65A 170LA 1C63A 1L59A 3QBLA 3SB5A 4GYCA 137LA 178LA 1DYBA 4I7LA 1P8UA 229LA 4XT1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DKKA 5B6ZA 1TN5A 4HJZA 1OUEA 3EO5A 4HPEA 1HC0A 2KS9A 1IOCA 4XJFA 4ZEEA 149LA 1GAZA 1JTMA 1P7SA 1S52A 4XT3A 4W57A 5B6VA 1OUHA 3W6FA 1L40A 2A7FA 2YBJA 2MEHA 4I7NA 3LN2A 4G70B 1HFYA 1LJIA 5JJEA 1F10A 4W55A 221LA 3QAPA 1NHBA 1REZA 1J1OY 4A7DA 1TDYA 3HBEX 2EKSC 228LA 4NFVA 4PK0A 2F2QA 1L76A 4E3UA 3HH4A 216LA 1L67A 1LYIA 3ATNA 1BWHA 1CV1A 4LFPA 1QSAA 3OE8A 1QT6A 1KGBA 2OEAX 1YILA 4EOFA 4H8ZA 1LMTA 2LYMA 3CDQA 2Y04A 2MEBA 3V2WA 1DQJC 5AHYA 1B5WA 1PY6A 1C08C 4MD2A 1YAQA 1DZBX 1ZVHL 1HEWA 4GN3A 5LIOA 2H5ZA 4XJHA 4EIYA 2HU1A 2KSAA 5B06A 1KNIA 4DKLA 2EQLA 4DDAA 1B5ZA 4I7PA 1AM7A 4G7SB 1WQOA 1CJ8A 1L02A 3L64A 5APFA 1H87A 1GB0A 5JJNA 3CDVA 1AKIA 5C1MA 1G7HC 1IC7Y 3NSBA 2Z2EA 1WQNA 1P2RA 239LA 1Q5IA 1CJ7A 1WQPA 1GFUA 1R84A 259LA 1XIOA 5HMJA 1UUZC 5L3IA 3CODA 3AYMA 1L94A 2J4YA 2OTYX 1F88A 4GP4B 4DAJA 1G0LA 3PWHA 4WG1A 5DLAA 1VGOA 1IWYA 1C10A 2B73A 1GF3A 1UIFA 1BB7A 227LA 3ATOA 2Z38A 1LJ3A 2ANVA 2D4JA 3CDTA 1LHHA 2PC2A 1LTMA 1OYUA 4UG2A 4KXIA 1LMPA 1JUGA 1XEIA 3OAXA 1JTNA 3HAQA 1DPWA 209LA 1WQMA 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 1X0I 1;  2OE4 X;  2EI4 A;  2KSB A;  4A4M A;  258L A;  111L A;  3HH5 A;  1L47 A;  1T8F A;  1KG8 A;  1P8H A;  1L62 A;  1LYE A;  4BUO A;  3HTD A;  3C82 A;  1CUQ A;  254L A;  2Y00 A;  4ARP A;  4HYJ A;  4BV0 A;  3C9M A;  3OE6 A;  1T97 A;  1D2Y A;  1L11 A;  1O0A A;  4W58 A;  2F95 A;  2JAF A;  5AWZ A;  4BEZ A;  1L9H A;  1CX6 A;  1LGW A;  1G0Q A;  1L50 A;  1L93 A;  1T8A A;  4GBR A;  4TL3 A;  5G2A A;  5AZD A;  1PXR A;  3GUL A;  4HYX A;  1LYH A;  4N6H A;  5G54 A;  1L66 A;  3SB6 A;  1L98 A;  1C6G A;  1L52 A;  233L A;  196L A;  1S53 A;  152L A;  2L78 A;  4XTO A;  164L A;  2RBN A;  3CDR A;  3RUN A;  3NY8 A;  2LCB A;  2Y03 A;  2OE9 X;  1L17 A;  1L84 A;  223L A;  3DQB A;  197L A;  4L6R A;  3SN6 R;  4AQN A;  3VI0 A;  1L73 A;  231L A;  4ARM B;  3QJR B;  5A8E A;  5H2I A;  1C62 A;  109L A;  3HAS A;  1L12 A;  128L A;  1G07 A;  3BVD B;  151L A;  5B34 A;  260L A;  1KME A;  183L A;  4KLY A;  2B7X A;  5AX1 A;  1L53 A;  1L71 A;  1B6I A;  110L A;  2Q9D A;  3SB7 A;  5H2K A;  3X3B A;  1VJM A;  2AT9 A;  1L63 A;  1OV7 A;  2RBP A;  3PBL A;  126L A;  2RAZ X;  2G87 A;  3DN2 A;  1QS5 A;  1C6J A;  235L A;  230L A;  144L A;  1P37 A;  3HT6 A;  2RH1 A;  1P56 A;  175L A;  2WJL A;  3HAR A;  2RB0 X;  3QJS B;  250L A;  1OVK A;  1L41 A;  1L26 A;  3HTG A;  1GUE A;  1C65 A;  170L A;  1C63 A;  1L59 A;  3QBL A;  3SB5 A;  4GYC A;  137L A;  178L A;  1DYB A;  4I7L A;  1P8U A;  229L A;  4XT1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1WQN A;  1P2R A;  239L A;  1Q5I A;  1CJ7 A;  1WQP A;  1GFU A;  1R84 A;  259L A;  1XIO A;  5HMJ A;  1UUZ C;  5L3I A;  3COD A;  3AYM A;  1L94 A;  2J4Y A;  2OTY X;  1F88 A;  4GP4 B;  4DAJ A;  1G0L A;  3PWH A;  4WG1 A;  5DLA A;  1VGO A;  1IWY A;  1C10 A;  2B73 A;  1GF3 A;  1UIF A;  1BB7 A;  227L A;  3ATO A;  2Z38 A;  1LJ3 A;  2ANV A;  2D4J A;  3CDT A;  1LHH A;  2PC2 A;  1LTM A;  1OYU A;  4UG2 A;  4KXI A;  1LMP A;  1JUG A;  1XEI A;  3OAX A;  1JTN A;  3HAQ A;  1DPW A;  209L A;  1WQM A;  3CSR A;  3EXD A;  3TMU A;  4EKQ A;  4QDN A;  1KY0 A;  2O4W A;  1D0K A;  1BVK C;  1JTT L;  4KL7 A;  5AMY A;  5KXN A;  2BQB A;  246L A;  5LYT A;  2HPY A;  5F8U A;  3TXH A;  248L A;  3TXD A;  1VDT A;  3EBA B;  4PPO A;  4YEM A;  1LSB A;  1PQJ A;  1KXY A;  5LVI A;  4CGE A;  1F4Z A;  3S3D B;  1DYF A;  1CX7 A;  1KIP C;  1YRO A;  2F47 A;  3LYO A;  1KIQ C;  4MQS A;  1L36 A;  1TN0 A;  1NQI A;  3F6Z A;  1E12 A;  1PQI A;  3W6A A;  1BB3 A;  1CUP A;  4L35 A;  3AW7 A;  1KXW A;  1LJF A;  1IO5 A;  4B1A A;  146L A;  3SBB C;  1IR7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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