3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
1XJIA 4IARA 3DMZA 1C6LA 1C6KA 1JTMA 3S3CB 1P36A 3DN4A 4LDEA 1CV6A 4YXCA 2I1XA 3OAXA 1DYCA 1L21A 1AP9A 5BR2A 1LYGA 3QJUB 2ZIYA 216LA 1L83A 1L28A 3HWLA 4EKQA 1L92A 1LI6A 1QT3A 4DAJA 3VG9A 3NYAA 4EPFA 1F88A 3UZCA 1L02A 3NY9A 4ARJA 2Z6BA 1L14A 1L34A 1PQDA 1T6HA 4WAVA 1L45A 1H2SA 1L39A 2B6YA 1LPYA 3GULA 2B73A 1L00A 1L40A 2OEAX 1L85A 236LA 1L42A 1QT7A 3CDRA 3ZPQA 3X3BA 1C63A 1L86A 5B35A 5DHHA 4HYXA 1P8IA 4MBSA 3HANA 5AHYA 4E97A 1G07A 1OVKA 1B6IA 2O4WA 2L78A 3EMLA 4XXJA 1L96A 5H2NA 3HTDA 4G71B 3QAKA 3NY8A 4S0WA 2ZZLA 3QBIA 5DHGA 4I7PA 3PXOA 1QUGA 1BRRA 5JJJA 169LA 2AT9A 2KSBA 244LA 3C81A 227LA 3DDLA 2RBSA 2NTUA 3VI0A 149LA 213LA 2RB2X 3BVDB 4W59A 1C6JA 1LI3A 219LA 2YCZA 2RBNA 2YDVA 1TLAA 1L82A 4N6HA 1ZWNA 1L90A 4W58A 1JQUA 2HUKA 4ARLA 2NTWA 4FPDA 186LA 4G72B 1OV7A 1D9WA 165LA 1L98A 3GUNA 4OO9A 5B0WA 1CUQA 1D2WA 4LZMA 1FBBA 247LA 2QPEB 3UTVA 3SBAA 151LA 3HT7A 4I7RA 5G2AA 4X32A 1SSWA 129LA 3K2RA 4GP8B 1LYHA 1WTHA 4GYCA 5B6VA 4W51A 3QBGA 2Q9DA 1DZEA 1L61A 2B6WA 1L36A 1L66A 1L18A 1L37A 3WQJA 1C3WA 3HARA 4IAPA 1LWGA 1PQKA 3MBVA 3HU8A 1L33A 1L31A 1CX7A 1C6IA 2B75A 256LA 2OU9A 1L29A 3RZEA 3S8GB 1L23A 3AYMA 1C8RA 262LA 2JAFA 1D3NA 177LA 3ZPRA 1L93A 145LA 1S54A 150LA 3F8VA 2BRDA 2O7AA 195LA 229LA 1C66A 1OV5A 2HUMA 1M0LA 2I20A 1P8HA 1CU5A 1D3JA 3DN1A 1C8SA 5B2NA 1C6TA 1L94A 160LA 3UTWA 4QI1A 1L60A 1L52A 1L16A 4GPOA 3AYNA 1QTBA 4OV0A 2B72A 188LA 1CV3A 4EXMA 5AHZA 2OU8A 164LA 232LA 1PXRA 1X0SA 1S52A 4XT1A 1CU2A 1GUEA 1CV1A 3GUKA 2O79A 3GUJA 239LA 5FJGA 3QBLA 1QUHA 3QJSB 1LW9A 1IXFA 1C6FA 1C6NA 175LA 3HH3A 1VGOA 2F47A 4PXFA 2Y03A 1L38A 4GBRB 1E0PA 1L32A 2B74A 241LA 166LA 1C61A 5AX1A 128LA 168LA 1MGYA 3CDTA 110LA 5C1MA 1C6GA 1QTCA 4MQSA 122LA 3UZAA 217LA 155LA 5AZDA 3C7YA 3UTXA 3KJ6A 1PQMA 1C6PA 1LLHA 4HYJA 103LA 162LA 1L0MA 111LA 1QUOA 1L91A 2RB1X 142LA 1KY0A 2YCYA 1L35A 3HT6A 2IGCA 3VHZA 1L43A 1L75A 1P6YA 223LA 1S53A 3HAOA 5H2KA 4A4MA 3PDSA 1KS3A 1QTZA 4FAAB 176LA 1L17A 2LNLA 252LA 4I7LA 1L55A 3ODUA 3DN6A 3CDVA 3S8FB 1G06A 1E12A 1L64A 1L65A 3NSBA 5G2CA 120LA 4I7TA 107LA 5G28A 222LA 4YX7C 1XMEB 2RH1A 1PQIA 138LA 2RBOA 1KMEA 180LA 1LI2A 1R2NA 1TN0A 237LA 1S8LA 4XT3A 1QT5A 4ZPUA 161LA 1U19A 1T97A 4G70B 4X31A 1Q5JA 2Q9EA 1G0LA 1XEPA 3OE8A 2F2QA 2Z55A 5EN0A 1FBKA 248LA 1QT6A 1L24A 3DNAA 1C6CA 3HTBA 2Z73A 3HAQA 1D3MA 2RB0X 197LA 3EH3B 3REYA 1JTNA 5G53A 5H2HA 3QAPA 249LA 3OE9A 1KW7A 1L19A 1X0I1 108LA 143LA 1QTVA 1CV0A 4AQNA 1CU6A 1L20A 3C8RA 3V2WA 205LA 4XTLA 2B6TA 4BUOA 210LA 3QJRB 228LA 1C6MA 2RAZX 2Y02A 4QIDA 3S3BB 3HDEA 1CX6A 255LA 1P64A 1G0PA 4W53A 1ZYTA 259LA 1QHJA 167LA 5J7AA 1JV7A 246LA 1C62A 1G0KA 4G7SB 3LZMA 214LA 5JJNA 1JGJA 5ITCA 3VGAA 1L70A 1L22A 4JQ6A 4DJHA 1L01A 1L89A 4LDOA 1C60A 1L07A 1T8FA 1PY6A 1DYBA 4W54A 1C64A 2ZFEA 4L35A 187LA 1QUDA 3FADA 2B70A 1L41A 1JV6A 1L10A 2YCXA 1QSBA 1L53A 140LA 3JR6A 3HH5A 1Q5IA 1UCQA 4EKPA 257LA 1P56A 3G3WA 4YXAC 1C68A 3SN6R 2OE9X 4UHRA 5TGZA 1L08A 1P7SA 3HUKA 3OE0A 1G0JA 3G3XA 3GUPA 1IW6A 4QRYA 1CUPA 1HZXA 2KS9A 3C9MA 4MD2A 230LA 1QS9A 3DN0A 4EIYA 2LZMA 4EPIA 2J4YA 2HULA 2Y01A 1S8JA 1H68A 5AX0A 1L87A 4W55A 1L0JA 3C7ZA 3ABWA 181LA 1I6SA 1DYDA 1L58A 2QARC 182LA 5H2PA 1QT8A 2B6ZA 2OE4X 1G1VA 3SBBC 3SB5A 1OVJA 2NTGA 4KLYA 4I7KA 261LA 4GP5B 2OTYX 1L47A 1LYFA 1P46A 1L13A 1GZMA 157LA 5G54A 1QSQA 5KKHA 114LA 3PBLA 1G0GA 1SX7A 3FA0A 4I7QA 218LA 1QM8A 1L71A 5A44A 212LA 1PQJA 1C67A 2PEDA 191LA 3CDQA 1VJMA 123LA 4G7RB 2Y00A 1BRDA 131LA 238LA 4ARMA 1C6DA 240LA 2RBQA 3GUOA 4EKRA 2M3GA 4MQTA 139LA 3UONA 173LA 242LA 2LC9A 2X72A 198LA 1L05A 3OE6A 4LDLA 1C6AA 4AMIA 3HT8A 196LA 3RUNA 3CAPA 1C6BA 3UTYA 1L74A 3AM6A 127LA 1QKPA 1P5CA 1LGUA 2QB0B 243LA 4PXKA 172LA 3HT9A 2OU0X 251LA 3VW7A 1L72A 4Y9HA 254LA 3GUMA 1DYAA 115LA 5AWZA 2NTHA 1R84A 2F93A 4EJ4A 1DYFA 1L03A 1PXSA 3DQBA 3QJQB 5B6WA 1L15A 148LE 1L77A 3P0GA 1L67A 1F50A 1CTWA 4FA7B 174LA 4PJZA 1F4ZA 1L73A 1L12A 4PK0A 3PQRA 225LA 3CDOA 4X1HA 1T8GA 1L62A 3C83A 5H2MA 1TN5A 189LA 3C80A 2LCBA 4W52A 2VT4A 5A45A 4IB4A 1L56A 4I7SA 1ZURA 1L57A 1L69A 1P2LA 1L99A 258LA 4N4WA 4W56A 2RBRA 4EA3A 5LWEA 3HUQA 1L63A 4N4YB 2RAYX 4BEYA 3QBKA 2R4RA 4ARQA 1CU3A 1LYJA 1LYIA 245LA 3EH5B 4IAQA 250LA 4MD1A 5F8UA 3QJTB 3VVKA 3A7KA 1OWZA 192LA 1L11A 1D2YA 1QTDA 5ETZA 3G3VA 1L26A 2OTZX 1QS5A 1SSYA 3HDFA 1L04A 146LA 1L44A 3SB6A 152LA 3HU9A 2ANXA 2L6XA 5B6XA 4AMJA 3HH6A 3QDCA 112LA 171LA 137LA 1SWYA 3V2YA 5I14A 1M0MA 1KG8A 1SX2A 1XJTA 1PQOA 201LA 5DYSA 4I7MA 3HUAA 1KW5A 2B7XA 4ARPA 7LZMA 6LZMA 3HASA 4UG2A 1CV4A 1P3NA 5B34A 1DYGA 1LGXA 1SWZA 5LZMA 3SB8A 3GUIA 224LA 1L50A 4XTOA 113LA 3CODA 4GP4B 200LA 4WW3A 2F32A 1AT9A 125LA 226LA 1L97A 4KNFA 4GBRA 5JJEA 231LA 4ARMB 3PWHA 1S51A 1L51A 1L68A 2QPDB 3EH4B 170LA 5ITEA 4DKLA 1NHBA 4I7OA 3COCA 3RFMA 1C69A 2I21A 220LA 1KGBA 147LA 1L49A 2WJLA 4BV0A 3FI5A 5H2LA 1IW9A 1BM1A 1EHKB 1OYUA 234LA 3L64A 1KY1A 1L46A 4FBZA 1CV5A 3DMXA 1L09A 1LGWA 3D4SA 2OE7X 3HAPA 178LA 1DYEA 206LA 1BRXA 3S3DB 1L59A 2CUUA 1L80A 2Y04A 235LA 2YDOA 5BR5A 2ANVA 3DN8A 3DN2A 185LA 1L06A 1LYEA 1L95A 118LA 3HTFA 215LA 2HPYA 3ZEVA 3C8QA 3C82A 1KG9A 3UG9A 3T45A 1L79A 141LA 1L30A 5B6YA 1XIOA 4G7QB 4EKSA 1C6HA 209LA 3QJVB 4BVNA 1L9HA 1OWYA 159LA 4TL3A 109LA 1T8AA 5G2DA 163LA 3F9LA 1QTHA 5G36A 1LYDA 3HTGA 2R4SA 1P37A 3DKEX 126LA 3L2XA 2F95A 4XTNA 183LA 4GRVA 2JAGA 2I35A 4BWBA 3SB7A 4ARQB 4JKVA 1L25A 3C8SA 5H2JA 156LA 1L48A 104LA 1L81A 5H2OA 1LN6A 184LA 3NS0A 1L84A 2YCWA 1C6EA 1D3FA 1L54A 2EI4A 119LA 4L6RA 4W57A 144LA 233LA 1EPYA 1LWKA 3C9LA 5B6ZA 4J4QA 5A8EA 4I7JA 1L0KA 2G87A 1O0AA 2WJKA 1M0KA 1P8UA 190LA 1CU0A 199LA 1G0MA 1GU8A 1QT4A 5H2IA 1OVHA 158LA 260LA 3C7WA 102LA 1P2RA 130LA 1XJUA 1CVKA 253LA 4NC3A 3SB9A 1QKOA 1X0K1 2KSYA 1L76A 1L27A 4JR8A 3DMVA 1K28A 1C6QA 221LA 4HWLA 2RBPA 2A4TA 4BEZA 3DN3A 4I7NA 2B6XA 1UAZA 1CWQA 4K5YA 1JFPA 2KSAA 211LA 1C65A 1G0QA 1L88A 3X3CA 1G1WA 1KNIA 3HH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XJIA 3A8ZA 1C6LA 4H8YA 4LT1A 2FYCA 1A2YC 4NGLA 3AW6A 2ZIYA 4XJFA 1L83A 2BQHA 2Y8PA 4NSGA 4EPFA 3UZCA 4ARJA 1L34A 4N0JA 4WAVA 1L45A 3QNGA 1GFEA 1QDTA 3CDRA 3X3BA 1L86A 4AGAA 1G7LC 4LT2A 4HYXA 2XTHA 2L78A 4B49A 4XXJA 3LZ2A 1UIFA 2YBMA 1BRRA 5JJJA 244LA 3C81A 2NWDX 2NTUA 3WVYA 4W59A 1C6JA 219LA 4B4IA 2YDVA 4DS7E 4GCFA 1L90A 1IR7A 186LA 1OV7A 165LA 3GUNA 2BQIA 5B0WA 1B7QA 1D2WA 4LZMA 4NHQA 3WU9A 3J4GA 1DI5A 247LA 2QPEB 1HFYA 2BLXA 4QGZA 4X32A 1SSWA 129LA 5I4XA 1DKKA 4UWNA 4GYCA 5B6VA 1LHLA 1VATA 3FE0A 4W51A 1CKGA 1DZEA 1LZ8A 3TXDA 1LCNA 1L31A 4HSFA 3AYMA 4H8ZA 2BQOA 1BB4A 1D3NA 1B5XA 1L93A 5J7CA 229LA 1J1PY 1IP7A 4Z98A 1D3JA 4J7VA 1L94A 1B5UA 1LMPA 1L60A 4OV0A 1HEOA 1CV3A 4EXMA 5AHZA 4WM3A 1LSFA 1A4VA 1UC0A 1GUEA 5FJGA 4DD0A 1VDTA 1IXFA 3CT0A 1VGOA 4TX7A 2Y03A 4GBRB 1HMKA 1E0PA 166LA 1UIAA 5AX1A 3P66A 1GF9A 1MGYA 1BB5A 1GE0A 4HTKA 2BQGA 1L43A 3W6CA 1P6YA 5H2KA 4A4MA 1KS3A 4G49A 1BQLY 252LA 3ODUA 1LMAA 1L65A 3NSBA 4I7TA 107LA 5KXWA 1OQMA 1XEIA 5G28A 3AZ7A 4YX7C 2RH1A 1F10A 1IP2A 1DZBX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 178L A;  1DYE A;  206L A;  1BRX A;  3S3D B;  1L59 A;  2CUU A;  1L80 A;  2Y04 A;  235L A;  2YDO A;  5BR5 A;  2ANV A;  3DN8 A;  3DN2 A;  185L A;  1L06 A;  1LYE A;  1L95 A;  118L A;  3HTF A;  215L A;  2HPY A;  3ZEV A;  3C8Q A;  3C82 A;  1KG9 A;  3UG9 A;  3T45 A;  1L79 A;  141L A;  1L30 A;  5B6Y A;  1XIO A;  4G7Q B;  4EKS A;  1C6H A;  209L A;  3QJV B;  4BVN A;  1L9H A;  1OWY A;  159L A;  4TL3 A;  109L A;  1T8A A;  5G2D A;  163L A;  3F9L A;  1QTH A;  5G36 A;  1LYD A;  3HTG A;  2R4S A;  1P37 A;  3DKE X;  126L A;  3L2X A;  2F95 A;  4XTN A;  183L A;  4GRV A;  2JAG A;  2I35 A;  4BWB A;  3SB7 A;  4ARQ B;  4JKV A;  1L25 A;  3C8S A;  5H2J A;  156L A;  1L48 A;  104L A;  1L81 A;  5H2O A;  1LN6 A;  184L A;  3NS0 A;  1L84 A;  2YCW A;  1C6E A;  1D3F A;  1L54 A;  2EI4 A;  119L A;  4L6R A;  4W57 A;  144L A;  233L A;  1EPY A;  1LWK A;  3C9L A;  5B6Z A;  4J4Q A;  5A8E A;  4I7J A;  1L0K A;  2G87 A;  1O0A A;  2WJK A;  1M0K A;  1P8U A;  190L A;  1CU0 A;  199L A;  1G0M A;  1GU8 A;  1QT4 A;  5H2I A;  1OVH A;  158L A;  260L A;  3C7W A;  102L A;  1P2R A;  130L A;  1XJU A;  1CVK A;  253L A;  4NC3 A;  3SB9 A;  1QKO A;  1X0K 1;  2KSY A;  1L76 A;  1L27 A;  4JR8 A;  3DMV A;  1K28 A;  1C6Q A;  221L A;  4HWL A;  2RBP A;  2A4T A;  4BEZ A;  3DN3 A;  4I7N A;  2B6X A;  1UAZ A;  1CWQ A;  4K5Y A;  1JFP A;  2KSA A;  211L A;  1C65 A;  1G0Q A;  1L88 A;  3X3C A;  1G1W A;  1KNI A;  3HH4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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