3EMLA

The 2.6 a crystal structure of a human a2a adenosine receptor bound to zm241385.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 2.6 Angstrom Crystal Structure of a Human A2A Adenosine Receptor Bound to an Antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein, receptor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Human Adenosine A2A receptor/T4 lysozyme chimera
total genus 167
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3emlA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3emlA01
4I7LA 2RBOA 1C6BA 3QJUB 1KMEA 3S3DB 4LZMA 1BM1A 1KG9A 1L51A 5B34A 4I7KA 228LA 252LA 3QBIA 5B6WA 5A8EA 1C67A 3G3WA 2L6XA 2JAGA 4ARMA 3A7KA 1QS9A 1L40A 1D2WA 139LA 4DJHA 4JKVA 4XTLA 3CDTA 5BR2A 1L50A 4DKLA 3PBLA 4AMIA 1L18A 1L74A 146LA 1L48A 2HUKA 216LA 4K5YA 3F9LA 103LA 5JJJA 3HTFA 137LA 3VG9A 1X0K1 2HPYA 1LYJA 1F4ZA 4BVNA 3QBKA 4IAQA 217LA 2YDOA 174LA 3QAPA 1L71A 1C64A 4UHRA 1MGYA 169LA 182LA 262LA 1L9HA 4ARJA 107LA 1XJIA 2Z73A 5G2AA 1C3WA 1C6FA 198LA 4KNFA 3FA0A 3SB7A 3HH3A 4GBRA 4EKSA 3ODUA 1TLAA 1L49A 1SX7A 3C7ZA 4ARQA 214LA 3HT7A 1KS3A 125LA 150LA 1L60A 233LA 1QTHA 212LA 1PQIA 147LA 1L00A 1OVKA 1M0MA 2Q9EA 3V2YA 167LA 2OTZX 155LA 192LA 4KLYA 2RBNA 1U19A 1X0I1 3DN8A 1DYCA 2R4RA 2BRDA 219LA 3GULA 175LA 1QUGA 3COCA 1QTVA 1LLHA 1T6HA 3KJ6A 3QBLA 3CDQA 1IW9A 1OWYA 1QT6A 3HT9A 205LA 1P46A 1LI3A 1GZMA 3OAXA 253LA 5H2OA 1JTNA 2F32A 3CODA 1L44A 1L86A 1L80A 4YXCA 127LA 1P2LA 3QJQB 1L09A 5EN0A 4EKRA 223LA 3OE9A 3HDFA 2G87A 1LYHA 2VT4A 2Y02A 5AX1A 3DNAA 4EPFA 149LA 1L68A 1R84A 5LWEA 1PXSA 4MD2A 3NY8A 4QRYA 4WAVA 1GUEA 1LW9A 1T97A 1L42A 1L23A 171LA 3UG9A 1F50A 5BR5A 2ZFEA 4L35A 1DYAA 1LYIA 4XT3A 4ARMB 1QUOA 113LA 3HTDA 2OTYX 5JJEA 1L0JA 4GRVA 4FBZA 4MQSA 3DN6A 4A4MA 2KSBA 2OE7X 178LA 1KY0A 3L2XA 1QT3A 1L28A 5DHGA 187LA 1C62A 131LA 3AM6A 1L95A 3OE8A 4I7RA 111LA 2RAZX 1C8RA 5G28A 5A44A 4G70B 4IAPA 4YXAC 254LA 2B74A 4HWLA 1CUQA 2YCWA 5H2LA 3VGAA 246LA 3HANA 1C6AA 4W56A 4NC3A 1C6HA 4GP5B 1D3FA 1PY6A 2WJKA 3QBGA 1DYDA 3X3BA 5AWZA 232LA 4E97A 1L04A 1R2NA 181LA 4GBRB 1P8HA 2R4SA 3S3CB 1AT9A 1L76A 1LGUA 1L26A 240LA 2B6XA 2B6ZA 1P3NA 1C6JA 122LA 5H2KA 1XJTA 1L10A 2RB2X 3HU9A 2O79A 1L59A 3DN4A 1PQKA 1KW5A 1VGOA 4PXKA 1L58A 1QUHA 1L96A 4MD1A 3S8GB 2RBPA 1D3NA 1P6YA 5ETZA 1Q5JA 2EI4A 4N6HA 5H2HA 1C68A 2RAYX 1P37A 1KY1A 4PJZA 1OV7A 249LA 4GP8B 4IB4A 3CDOA 1L31A 4W54A 1DYBA 1L99A 1PQJA 5FJGA 1QSBA 2HUMA 4QIDA 130LA 1L72A 3HTBA 5A45A 2OE9X 104LA 1L20A 210LA 4N4WA 3DN2A 1T8AA 1L75A 3JR6A 1AP9A 1QT5A 1L06A 3PDSA 1G1VA 1OVHA 3NS0A 218LA 2I1XA 1T8FA 3C81A 2I21A 3UZCA 177LA 1C6TA 4HYJA 1M0LA 2Z55A 5TGZA 1P36A 3GUOA 128LA 2Q9DA 5DHHA 2NTWA 1L77A 242LA 1C61A 4I7NA 1L46A 3G3XA 1QKPA 3SB9A 159LA 221LA 4QI1A 4X1HA 114LA 4I7QA 4G7QB 3T45A 2O4WA 1DZEA 3AYMA 3HASA 1D3MA 3HUAA 129LA 1L24A 3FADA 3UONA 191LA 1L14A 260LA 1LYFA 3PWHA 4AMJA 3DN3A 2F93A 160LA 3DDLA 3GUPA 3HU8A 3REYA 1G1WA 4WW3A 3C8QA 1L35A 5ITCA 1I6SA 143LA 1JV6A 4LDEA 1FBBA 3UZAA 3EH4B 119LA 1DYFA 4J4QA 3HTGA 3F8VA 1C6LA 3SBAA 2PEDA 3UTXA 4X32A 152LA 5JJNA 3C8SA 1P8UA 2RBSA 3FI5A 4W59A 4EJ4A 1L91A 3HT8A 1G0GA 4MBSA 3HAQA 5H2IA 1L17A 1L16A 120LA 5ITEA 3DN1A 225LA 1L67A 1L34A 2ZZLA 3VVKA 4BEZA 5F8UA 2OU9A 3QJSB 164LA 1L30A 3P0GA 168LA 4W57A 5H2PA 1L21A 2LNLA 5B6XA 1L66A 5H2JA 148LE 4I7PA 5AHZA 3S8FB 258LA 244LA 1CU3A 2X72A 2OU8A 1P64A 220LA 1L70A 251LA 3S3BB 5AX0A 1EPYA 4FPDA 5G36A 2YDVA 4TL3A 4I7OA 1S54A 5C1MA 1CX7A 1LGXA 200LA 3DMZA 184LA 1L32A 1EHKB 2ZIYA 1L45A 1L88A 3VI0A 2RH1A 238LA 3HAPA 123LA 4XXJA 259LA 3UTYA 1L53A 3C7YA 1CU0A 3UTVA 1L29A 3GUIA 2O7AA 3GUMA 4EXMA 3CAPA 1L93A 247LA 3HH4A 1L82A 4LDOA 3CDRA 5B6VA 1VJMA 2Y04A 5DYSA 1L54A 3C9LA 1L62A 3BVDB 1QTZA 1G07A 1XMEB 3HARA 1L39A 2KS9A 4G72B 4GYCA 1CV1A 1L25A 161LA 1C8SA 1P2RA 4I7JA 163LA 2IGCA 3QDCA 2A4TA 1JTMA 3RZEA 234LA 2ANXA 1T8GA 2F2QA 4ARPA 1LGWA 1KGBA 236LA 3SN6R 4EKQA 1KNIA 1L63A 239LA 1ZWNA 3V2WA 165LA 3OE6A 2KSYA 3HUKA 3GUNA 3QAKA 3RUNA 1H2SA 1C60A 3DMVA 4OV0A 1C69A 3NY9A 1L57A 1LYDA 1C6DA 213LA 1L08A 1L05A 1UAZA 5J7AA 1CV4A 1L07A 3HH5A 4G7SB 1SWYA 4G7RB 1LYEA 1L56A 172LA 197LA 2QPEB 2I35A 2QPDB 4DAJA 2QB0B 1QSQA 1PQDA 1G0JA 237LA 1L38A 2NTUA 4X31A 2Y00A 1CTWA 1X0SA 2Y03A 4UG2A 2YCXA 151LA 1LI2A 1C6IA 3PXOA 1P7SA 1S51A 4S0WA 1OWZA 3G3VA 1G0QA 2B6YA 2B6TA 1C6QA 1JQUA 2RBQA 2B7XA 1L13A 196LA 1JGJA 4BUOA 1L12A 1CWQA 4I7SA 1NHBA 156LA 115LA 1C6PA 4BWBA 4OO9A 1PQOA 1QTCA 2CUUA 2Z6BA 4MQTA 1CVKA 1L41A 3SBBC 1L94A 248LA 206LA 1D3JA 1L22A 1LWGA 6LZMA 1L0KA 3ZPRA 1CU6A 189LA 235LA 5B6ZA 199LA 1G0KA 255LA 2KSAA 1L97A 3QJRB 3UTWA 1C6MA 4W52A 2J4YA 3QJVB 5G2DA 2Y01A 1C6NA 2WJLA 3HAOA 1K28A 1OYUA 3HUQA 226LA 3EH3B 4BEYA 4AQNA 118LA 1L01A 1CUPA 3OE0A 3SB6A 1C63A 3L64A 1L11A 180LA 1PXRA 3SB8A 3VW7A 1E0PA 1G0MA 1P8IA 4JQ6A 170LA 1LPYA 2YCYA 1CV0A 1C6CA 3HDEA 4W53A 4ARLA 1P5CA 3CDVA 5B2NA 185LA 1L37A 4EPIA 109LA 1L43A 1S8LA 1QKOA 3MBVA 3QJTB 5I14A 1M0KA 2OU0X 2L78A 250LA 1P56A 1BRDA 1L55A 1L36A 224LA 1JV7A 3ZPQA 1C6KA 3LZMA 5H2MA 2B6WA 4XTOA 1QT4A 4W58A 1JFPA 2B75A 1L81A 4G71B 245LA 1C6GA 1L27A 2RB0X 3HT6A 2YCZA 3VHZA 5KKHA 3ZEVA 1SWZA 108LA 4W51A 2NTHA 2OEAX 142LA 173LA 2JAFA 1WTHA 1CV6A 1B6IA 231LA 1HZXA 1TN5A 1L85A 3AYNA 2M3GA 227LA 209LA 257LA 2LZMA 1SX2A 3C82A 1XJUA 3X3CA 4EKPA 1DYEA 1ZURA 2B73A 4EIYA 3C9MA 1C65A 157LA 3DN0A 1KW7A 1QTBA 243LA 4W55A 1GU8A 1L90A 1E12A 4GP4B 2I20A 3DQBA 5G54A 3RFMA 2NTGA 4I7MA 188LA 5G2CA 2LCBA 110LA 1L61A 2F47A 4FA7B 1QTDA 1CU2A 1L03A 4PK0A 2LC9A 1IW6A 201LA 4N4YB 2B72A 1G06A 3C8RA 183LA 1SSYA 1LYGA 5AHYA 1L47A 3C83A 3DKEX 1BRXA 112LA 3C80A 1PQMA 3SB5A 141LA 222LA 1OVJA 5AZDA 3WQJA 1FBKA 3ABWA 1UCQA 1L79A 1D9WA 1TN0A 261LA 1L15A 5B35A 1QT8A 1S53A 1KG8A 1L87A 1L98A 5B0WA 3K2RA 4LDLA 5G53A 3EMLA 1C6EA 1L73A 1CV5A 1L65A 144LA 1LWKA 145LA 1ZYTA 1S8JA 4XT1A 2RB1X 2AT9A 1SSWA 1L84A 1L0MA 140LA 1G0LA 186LA 3HWLA 4FAAB 190LA 1O0AA 176LA 1L89A 195LA 3GUKA 7LZMA 241LA 1QM8A 1L52A 1L92A 3NYAA 102LA 4IARA 158LA 1QS5A 1IXFA 3NSBA 4JR8A 3HH6A 2HULA 1Q5IA 1C66A 1L69A 3D4SA 1BRRA 4ZPUA 1CU5A 138LA 2RBRA 126LA 1L64A 4I7TA 1D2YA 1XEPA 3EH5B 4L6RA 4ARQB 4Y9HA 1CV3A 1G0PA 162LA 1L83A 2QARC 1QHJA 2F95A 5LZMA 166LA 1OV5A 1CX6A 1QUDA 2B70A 1H68A 230LA 1L02A 4YX7C 1S52A 215LA 1L19A 1LN6A 4PXFA 1L33A 4HYXA 229LA 3DMXA 1LI6A 4XTNA 4EA3A 211LA 2ANVA 3GUJA 1QT7A 4GPOA 2OE4X 5B6YA 1DYGA 256LA 1F88A 1XIOA 3C7WA 4BV0A 3PQRA 5H2NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZVYB 3QJUB 1YIKA 4YEOA 1VDPA 3ULRA 5A8EA 4ARMA 1YL0X 2XJWA 3A7KA 2DQCY 4ETBA 3CDTA 1LAAA 3PBLA 3RU5A 2HUKA 4K5YA 3F9LA 5ILFA 4HV1A 3RT5X 4NHIA 1X0K1 3WL2A 1F4ZA 4R6CA 5KXLA 217LA 1L71A 1JKAA 2BQGA 1C6FA 2LYMA 3FA0A 3SB7A 2YBJA 3W6CA 3IJUA 2DQIY 3C7ZA 2YSSC 4UWNA 1LHJA 1QIOA 4WLTA 212LA 1IP5A 1YKZX 1OVKA 2Q9EA 192LA 4KLYA 3DN8A 4PGJB 219LA 3GULA 4LYTA 1GXV2 1REZA 3HT9A 2D6BA 3EMSA 3OAXA 253LA 2BQMA 1GE0A 2F32A 1L44A 2ZYPA 1CJ9A 1L09A 3TMVA 2DQEY 2VT4A 5AX1A 3TXBA 1BGIA 3A6CY 4H1PA 3W3EA 5APFA 1LYIA 3AW7A 1CNSA 1QUOA 3HTDA 4CFPA 4MQSA 4DD3A 3P66A 3DN6A 4FBZA 1F10A 5KKIA 1L28A 5F9XA 1L95A 3OE8A 2RAZX 5KXSA 4C5FA 5A44A 3LHMA 2BQFA 1LCNA 2B74A 4DWXA 2ZNXY 5H2LA 5FEKA 5D5CA 1RFPA 1C6HA 1LJKA 4WM4A 1D3FA 1IWUA 1GPQC 1V7TA 2HU1A 3LZ2A 1IOCA 1L04A 1P8HA 4GBRB 2MEDA 4WM1A 2B6XA 2B6ZA 4NEBA 5H2KA 1JSEA 3EBAB 2RB2X 1D6QA 1IOQA 3HU9A 2O79A 1PQKA 1LSPA 1QTKA 1LSZA 2C8PA 1QUHA 3S8GB 2RBPA 1TAYA 4CHXA 1Q5JA 4RDSA 1B5XA 1XGRC 1GFGA 5H2HA 2RAYX 4I0CA 1OV7A 3AGIA 1AT5A 5KY1A 5FJGA 1L72A 3HTBA 104LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2QAR C;  1QHJ A;  2F95 A;  5LZM A;  166L A;  1OV5 A;  1CX6 A;  1QUD A;  2B70 A;  1H68 A;  230L A;  1L02 A;  4YX7 C;  1S52 A;  215L A;  1L19 A;  1LN6 A;  4PXF A;  1L33 A;  4HYX A;  229L A;  3DMX A;  1LI6 A;  4XTN A;  4EA3 A;  211L A;  2ANV A;  3GUJ A;  1QT7 A;  4GPO A;  2OE4 X;  5B6Y A;  1DYG A;  256L A;  1F88 A;  1XIO A;  3C7W A;  4BV0 A;  3PQR A;  5H2N A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5D5C A;  1RFP A;  1C6H A;  1LJK A;  4WM4 A;  1D3F A;  1IWU A;  1GPQ C;  1V7T A;  2HU1 A;  3LZ2 A;  1IOC A;  1L04 A;  1P8H A;  4GBR B;  2MED A;  4WM1 A;  2B6X A;  2B6Z A;  4NEB A;  5H2K A;  1JSE A;  3EBA B;  2RB2 X;  1D6Q A;  1IOQ A;  3HU9 A;  2O79 A;  1PQK A;  1LSP A;  1QTK A;  1LSZ A;  2C8P A;  1QUH A;  3S8G B;  2RBP A;  1TAY A;  4CHX A;  1Q5J A;  4RDS A;  1B5X A;  1XGR C;  1GFG A;  5H2H A;  2RAY X;  4I0C A;  1OV7 A;  3AGI A;  1AT5 A;  5KY1 A;  5FJG A;  1L72 A;  3HTB A;  104L A;  1AP9 A;  3JR6 A;  1QT5 A;  1LSE A;  1ALC A;  5KKJ A;  3UZC A;  177L A;  1C6T A;  5TGZ A;  128L A;  4WO6 A;  4NIJ A;  2NTW A;  1C61 A;  4X1H A;  1LOZ A;  4G7Q B;  1CKH A;  1FLW A;  5LVJ A;  3EO5 A;  1NWG A;  1YKX X;  4IAS A;  4GCF A;  3UON A;  191L A;  4DQJ A;  1LYF A;  1INU A;  4WMG A;  3W6B A;  2LZT A;  4B1A A;  154L A;  3REY A;  3C8Q A;  1LMO A;  2YBL A;  3QY4 A;  3UZA A;  207L A;  3F8V A;  1BQL Y;  4X32 A;  1IC7 Y;  3C8S A;  3HT8 A;  3HAQ A;  1UIH A;  1VDT A;  5F8U A;  1LZ6 A;  2LNL A;  1L66 A;  5H2J A;  148L E; 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 1IOS A;  4BAP A;  1QSQ A;  1L38 A;  4UG2 A;  1DI5 A;  4HJZ A;  1S51 A;  1G0Q A;  2MEH A;  2B6T A;  2RBQ A;  3A6B Y;  2B7X A;  4I7S A;  1KXY A;  3AGH A;  3WU9 A;  4GN5 C;  1C6P A;  4BWB A;  1PQO A;  2Z6B A;  2BQL A;  1LMC A;  1JJ0 A;  206L A;  4LT3 A;  1L0K A;  3ZPR A;  3WVY A;  199L A;  2KSA A;  1L97 A;  3A8Z A;  4YOP A;  1BWJ A;  3ZVQ A;  2BAA A;  1IP7 A;  3FI7 A;  1IC5 Y;  2Y01 A;  1CKD A;  3HUQ A;  5FDJ A;  1CUP A;  4OOT A;  3L64 A;  180L A;  3SB8 A;  1KIR C;  4R0F A;  3WUN A;  3HDE A;  1C6C A;  1LYO A;  4W53 A;  4ARL A;  1P5C A;  1GDX A;  4EPI A;  109L A;  1B7S A;  3QJT B;  4H9H A;  4LT1 A;  1P56 A;  1BRD A;  3WXT A;  1L36 A;  3SP3 A;  224L A;  1C6K A;  1LSD A;  3LZM A;  5LYZ A;  2DQG Y;  1QT4 A;  1LSB A;  4W58 A;  1JFP A;  1L81 A;  2ZIK A;  2RB0 X;  3HT6 A;  5FST A;  3VHZ A;  193L A;  5KKH A;  2CGI A;  1XGT C;  1SWZ A;  2AUB A;  4W51 A;  2OEA X;  142L A;  173L A;  1I20 A;  1B6I A;  3WPJ A;  1WQM A;  4NGL A;  4G4H A;  4EKP A;  4H8Y A;  5HNL A;  4H9I A;  1QTB A;  1E12 A;  1GFA A;  4I7M A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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