3PDSA

Irreversible agonist-beta2 adrenoceptor complex
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAACILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of an irreversible agonist-beta(2) adrenoceptor complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Fusion protein Beta-2 adrenergic receptor/Lysozyme
total genus 143
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pdsA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pdsA01
109LA 158LA 3SBBC 2LZMA 4MQTA 2OEAX 3L64A 4GP5B 1QT6A 1X0I1 1GU8A 1L34A 2RBNA 3GUIA 1L12A 1DZEA 4EKRA 4ARQA 3QJUB 214LA 3QJSB 1PQOA 1C6FA 4EXMA 2Q9EA 1L85A 3QAKA 3HAQA 243LA 2VT4A 3HARA 1L37A 1LGWA 1L63A 3RZEA 4W57A 1H2SA 4EKSA 3GUOA 4E97A 237LA 2RBRA 2O79A 1BRXA 3T45A 6LZMA 2F95A 1L26A 4W52A 113LA 1KG8A 2HPYA 1QTBA 1M0LA 3HT9A 4I7KA 4I7LA 4PK0A 2OE7X 1L97A 240LA 246LA 3CDRA 210LA 1IW9A 1OV5A 4GBRB 2M3GA 1L58A 1R2NA 182LA 1BM1A 1IXFA 4MD2A 1L15A 4I7OA 1C8RA 2QB0B 2NTWA 217LA 260LA 3G3XA 1G0KA 196LA 198LA 1C6EA 2RAYX 1BRDA 2I35A 3CDVA 2Z55A 5A45A 4BEZA 3DMVA 1L16A 3OAXA 5B2NA 4LZMA 1QS9A 226LA 2F32A 1LYHA 1G1VA 1L60A 3DQBA 4ARMB 4NC3A 3UTWA 5ETZA 1KMEA 4JKVA 1LYEA 3AYMA 1OVKA 5C1MA 1B6IA 4JQ6A 1JV6A 1QT5A 1L38A 1ZURA 1JTNA 128LA 1LWKA 1L92A 1JFPA 3PDSA 3F9LA 1L71A 178LA 3CDOA 1ZWNA 1QUOA 2I1XA 2Z6BA 1CV0A 1L41A 1L24A 2OTZX 1OYUA 1SSYA 1L89A 3SB9A 1L67A 181LA 1C6KA 1L56A 1PQDA 3SB8A 2EI4A 2Y03A 157LA 120LA 3DN8A 4GBRA 3AYNA 1D3NA 1D3FA 1P5CA 1QTHA 1CV5A 1JQUA 206LA 1L47A 1OVHA 1DYAA 1DYCA 1E12A 187LA 2JAGA 4J4QA 3C8QA 245LA 4G7QB 1L32A 1L72A 3CDTA 5AWZA 2YCXA 5DHGA 4XT1A 2KSYA 3FA0A 1JGJA 3UTVA 3NY9A 2O7AA 1TN5A 3C9MA 4N6HA 1CUPA 4IAQA 5G54A 2B7XA 3MBVA 1L99A 1OV7A 5JJJA 2A4TA 4IB4A 1QT8A 1D9WA 145LA 3OE0A 173LA 152LA 1ZYTA 2YCYA 5B6YA 1C63A 1S54A 2NTUA 5B6VA 2Q9DA 1QT4A 2Y02A 3ZPQA 262LA 3HH3A 3DN0A 2OU9A 1C6BA 1GZMA 4XTOA 2B6ZA 1CU3A 4FBZA 1DYBA 3DDLA 1QSBA 197LA 3SB5A 4W55A 1QKOA 1L68A 224LA 3DMZA 4W56A 4IAPA 212LA 1L79A 1AT9A 3PXOA 4LDLA 1L14A 3ABWA 3RFMA 205LA 1L75A 4YXAC 1L0KA 1L90A 1D2YA 5H2JA 3F8VA 4DKLA 3HAPA 1H68A 2HUMA 4I7PA 1R84A 1XIOA 2ZFEA 1G1WA 2YDOA 1C6CA 5B0WA 1CX7A 127LA 3UG9A 119LA 4EPIA 5G2DA 2KS9A 5BR2A 259LA 146LA 1LYIA 3C82A 1G0PA 1L29A 2IGCA 3SB6A 1L59A 4DAJA 112LA 2BRDA 1L22A 1PY6A 1L46A 2QARC 5JJEA 1L36A 3QJRB 1P36A 3NYAA 1P8IA 2ZZLA 1L03A 1L51A 3PBLA 1L94A 1L42A 1XJTA 209LA 5KKHA 3S3DB 4KLYA 1L66A 3HH6A 1CX6A 147LA 2NTHA 1QKPA 1L00A 190LA 2B6XA 1P8UA 1L81A 3EMLA 4JR8A 1C65A 247LA 1C6LA 3EH5B 3GUPA 1L20A 111LA 1TLAA 2LCBA 3NY8A 3QJVB 189LA 1KG9A 118LA 110LA 1L35A 1L07A 4OO9A 1C8SA 4GPOA 1L0JA 1L54A 1BRRA 1O0AA 3OE6A 2B6TA 1CUQA 4KNFA 155LA 1LWGA 3A7KA 3EH4B 5G36A 174LA 2Y01A 4HWLA 1LPYA 151LA 1DYDA 230LA 1G07A 3HUQA 191LA 2RBOA 4I7TA 4N4YB 252LA 5H2PA 1QTCA 3HH4A 103LA 3SBAA 4BUOA 4G70B 1QT7A 4UHRA 1L57A 170LA 3GUMA 5BR5A 1L70A 5G2CA 5AX0A 1L01A 5AX1A 3VGAA 1L06A 1U19A 1JTMA 2OTYX 3ODUA 4N4WA 1L04A 4I7NA 2AT9A 3HANA 1CU0A 3C7ZA 3HU9A 1T6HA 1LI3A 2O4WA 3RUNA 5A8EA 2F2QA 3HTBA 4G72B 4BV0A 1OVJA 255LA 4FA7B 1C6QA 4MBSA 1L76A 1CTWA 3FADA 1L21A 1P46A 3G3VA 1PXRA 5G2AA 177LA 3DN1A 1GUEA 1L62A 1SX7A 242LA 3VI0A 1T8GA 3C80A 3HAOA 3CODA 2Y04A 1I6SA 1L08A 1CV1A 4QI1A 4G7RB 1KW5A 1E0PA 3L2XA 1G0QA 161LA 149LA 3C81A 2B6YA 5G28A 3C7YA 1L40A 257LA 3WQJA 4ARLA 3EH3B 3NS0A 251LA 114LA 2OU0X 1L91A 220LA 1P37A 5H2LA 5DYSA 186LA 1D2WA 2HULA 3HWLA 1QM8A 1LGXA 258LA 1S52A 3X3CA 107LA 1C69A 1L95A 5B6XA 1L50A 115LA 1F4ZA 1CU2A 3G3WA 5AHZA 4IARA 3UZAA 4ARJA 4ARPA 1L39A 4LDOA 1EPYA 4EKQA 1LI6A 1L55A 1X0K1 1L31A 180LA 1L87A 201LA 2G87A 1JV7A 3ZPRA 233LA 3HT7A 4K5YA 231LA 4XXJA 3PWHA 1L83A 5A44A 4I7QA 1G06A 3ZEVA 172LA 104LA 4XTNA 1XJIA 4FAAB 3REYA 1P56A 1NHBA 1PQKA 4W53A 4HYJA 4GRVA 3HUKA 1CWQA 3HT8A 4X32A 1L19A 5J7AA 3QDCA 4L35A 1SWYA 1L25A 1QTDA 3SN6R 3KJ6A 5G53A 1L96A 1T8AA 2ANVA 2WJLA 4X31A 5AZDA 3HU8A 1KGBA 1P2LA 261LA 236LA 3UTYA 1L53A 3HTFA 1LW9A 2OU8A 1KY0A 1LGUA 7LZMA 1KY1A 2Z73A 148LE 3S8GB 3P0GA 1L0MA 3K2RA 2R4RA 227LA 1FBKA 2J4YA 3HASA 122LA 1C67A 2WJKA 160LA 1XEPA 244LA 2I21A 1L65A 1CVKA 1P2RA 1X0SA 2L78A 4FPDA 1S8LA 4PXKA 1DYGA 3C8SA 150LA 1L10A 137LA 2LNLA 1C6PA 3DN6A 1C60A 1L48A 156LA 1L52A 2KSBA 3JR6A 4YXCA 1IW6A 1C6JA 5ITCA 1D3JA 4EPFA 1CV3A 1S53A 5I14A 131LA 3S3BB 4AQNA 228LA 235LA 3HT6A 1P8HA 1PXSA 1L45A 1KS3A 108LA 5JJNA 215LA 1L09A 1QHJA 2KSAA 139LA 1LYFA 1P3NA 3HH5A 4MQSA 3VG9A 1UCQA 1L84A 1WTHA 1LN6A 2QPDB 4X1HA 1FBBA 1VJMA 241LA 5B6ZA 1L98A 1CU6A 5B34A 4I7JA 3GUNA 141LA 3QBIA 3DN4A 200LA 1VGOA 4I7RA 1C6IA 1LI2A 1F50A 3QJQB 169LA 2L6XA 1C6TA 1P6YA 3S3CB 5EN0A 176LA 3LZMA 5H2HA 1QUDA 1L13A 2ZIYA 5LWEA 1F88A 239LA 1XMEB 4QRYA 5LZMA 1QTZA 3DMXA 2YCWA 1SWZA 1G0LA 1UAZA 1QUGA 3FI5A 4BWBA 167LA 2OE9X 4YX7C 4A4MA 4PJZA 1L23A 164LA 1C6NA 1T97A 2RBSA 2JAFA 1PQMA 256LA 3C8RA 4L6RA 175LA 1DYFA 3CDQA 3DKEX 5FJGA 1P7SA 4AMJA 1C6HA 3DN3A 4EJ4A 184LA 1K28A 3CAPA 1C61A 2RH1A 1QUHA 248LA 3OE8A 168LA 1L27A 1PQJA 1S51A 1LYGA 4W59A 1G0GA 2X72A 2ANXA 223LA 2RBQA 5B6WA 253LA 185LA 3DN2A 5H2IA 123LA 3AM6A 3QBGA 3S8FB 216LA 225LA 2F47A 5ITEA 3HDEA 4EKPA 3NSBA 222LA 5H2OA 1L74A 2B75A 2RB1X 2B70A 1LYDA 3DNAA 1C6AA 229LA 1QSQA 1L88A 3C9LA 1QS5A 1CV4A 2RB2X 2PEDA 3PQRA 5DHHA 138LA 4OV0A 4S0WA 4BEYA 2CUUA 1P64A 3QBKA 3D4SA 3VHZA 1L33A 163LA 1T8FA 1XJUA 2B73A 143LA 3VVKA 3BVDB 5AHYA 188LA 3X3BA 3GULA 1CU5A 1L80A 1SSWA 1M0MA 4GYCA 2B72A 3HTGA 1L77A 4WW3A 2F93A 5H2NA 144LA 2QPEB 3COCA 165LA 4XTLA 3C7WA 4G71B 221LA 4GP8B 1C6GA 183LA 1PQIA 1DYEA 1OWYA 4LDEA 4AMIA 232LA 159LA 2RBPA 3UZCA 2RB0X 1HZXA 1L82A 1L18A 1OWZA 130LA 213LA 1G0MA 2B6WA 2LC9A 1L02A 1EHKB 3UTXA 2NTGA 3QBLA 1L9HA 4I7MA 1QTVA 4PXFA 1CV6A 4EA3A 1L61A 4HYXA 1L44A 1M0KA 1L49A 4ARMA 140LA 1AP9A 126LA 2Y00A 1TN0A 250LA 4ZPUA 2B74A 1C6MA 4TL3A 3V2YA 1Q5IA 3V2WA 3GUJA 1L86A 5F8UA 4Y9HA 1KW7A 2R4SA 2OE4X 3HUAA 1S8JA 3OE9A 1C62A 1L93A 142LA 2HUKA 5TGZA 199LA 5B35A 1L28A 4W54A 195LA 3QAPA 1L17A 3VW7A 1C3WA 4W58A 4DJHA 3HDFA 4ARQB 102LA 3HTDA 1LYJA 1QT3A 1L64A 1G0JA 4I7SA 219LA 2I20A 4WAVA 4EIYA 5H2KA 1MGYA 249LA 166LA 3QJTB 2YCZA 192LA 4XT3A 1L30A 1L11A 1Q5JA 2RAZX 1C64A 1L73A 1L69A 3UONA 129LA 171LA 1D3MA 1KNIA 1L43A 3SB7A 4MD1A 2YDVA 1SX2A 1C6DA 1C66A 3C83A 1C68A 218LA 162LA 1L05A 234LA 254LA 3GUKA 4W51A 4BVNA 4QIDA 238LA 4UG2A 5H2MA 125LA 4GP4B 1LLHA 4G7SB 211LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
109LA 3SBBC 2LYMA 1OUHA 1JHLA 4QDNA 4WLYA 1GFHA 2W1XA 1L34A 2LZTA 4H92A 2BLXA 1GE4A 4HJZA 1DZEA 4EKRA 1GEZA 3QJSB 1GPQC 2VT4A 1GE3A 1L37A 1LGWA 3HARA 4W57A 4E97A 3T45A 2F95A 1KG8A 1M0LA 1J1OY 3HT9A 1OUEA 2OE7X 1HEWA 1IR7A 1OV5A 2M3GA 1L58A 3D9AC 1R2NA 1BM1A 4P2EA 1L15A 3TXDA 2QB0B 4R0FA 260LA 3G3XA 3RU5A 1W08A 196LA 1B5YA 198LA 3CDVA 1A4VA 3CT0A 1REZA 2F32A 2BQCA 4HPEA 2XBRA 1B7PA 1I56A 4JQ6A 1QT5A 1L38A 4UWUA 128LA 3F9LA 1ZWNA 1IWZA 2VB1A 2I1XA 1L24A 2OTZX 2BLYA 1OYUA 1SSYA 181LA 1C6KA 4DD1A 1L56A 2DQHY 2EI4A 2Y03A 3TMWA 4LYOA 4ZEEA 1VDSA 3KAMA 1D3FA 1QTHA 1CV5A 1YANA 5LVKA 4TWSA 1E12A 3WXTA 1EQEA 1CKHA 3CDTA 5AWZA 2YCXA 2BQJA 1JGJA 3UTVA 5HNCA 4YOPA 3W6DA 1CUPA 4WM1A 1L99A 4XENA 4IB4A 1D9WA 3CSZA 145LA 173LA 4LFPA 2NTUA 1FLUA 3ZPQA 3ATNA 3HH3A 3DN0A 1QSBA 3LN2A 1GF8A 1L68A 1QKOA 3DMZA 4PHIA 1L79A 3ABWA 1IR8A 4N9RA 1GHLA 1L75A 1GBZA 1L90A 3N9CA 3E3DA 2N5ZA 3HAPA 1GF9A 4I7PA 8LYZA 1R84A 127LA 5G2DA 1LYIA 1LHKA 1B7MA 4WL6A 3AGIA 4DAJA 112LA 4M4OA 5KXNA 5KXOA 1L36A 2LZ2A 3QJRB 5I54A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4GYC A;  2B72 A;  3HTG A;  1L77 A;  4WW3 A;  2F93 A;  5H2N A;  144L A;  2QPE B;  3COC A;  165L A;  4XTL A;  3C7W A;  4G71 B;  221L A;  4GP8 B;  1C6G A;  183L A;  1PQI A;  1DYE A;  1OWY A;  4LDE A;  4AMI A;  232L A;  159L A;  2RBP A;  3UZC A;  2RB0 X;  1HZX A;  1L82 A;  1L18 A;  1OWZ A;  130L A;  213L A;  1G0M A;  2B6W A;  2LC9 A;  1L02 A;  1EHK B;  3UTX A;  2NTG A;  3QBL A;  1L9H A;  4I7M A;  1QTV A;  4PXF A;  1CV6 A;  4EA3 A;  1L61 A;  4HYX A;  1L44 A;  1M0K A;  1L49 A;  4ARM A;  140L A;  1AP9 A;  126L A;  2Y00 A;  1TN0 A;  250L A;  4ZPU A;  2B74 A;  1C6M A;  4TL3 A;  3V2Y A;  1Q5I A;  3V2W A;  3GUJ A;  1L86 A;  5F8U A;  4Y9H A;  1KW7 A;  2R4S A;  2OE4 X;  3HUA A;  1S8J A;  3OE9 A;  1C62 A;  1L93 A;  142L A;  2HUK A;  5TGZ A;  199L A;  5B35 A;  1L28 A;  4W54 A;  195L A;  3QAP A;  1L17 A;  3VW7 A;  1C3W A;  4W58 A;  4DJH A;  3HDF A;  4ARQ B;  102L A;  3HTD A;  1LYJ A;  1QT3 A;  1L64 A;  1G0J A;  4I7S A;  219L A;  2I20 A;  4WAV A;  4EIY A;  5H2K A;  1MGY A;  249L A;  166L A;  3QJT B;  2YCZ A;  192L A;  4XT3 A;  1L30 A;  1L11 A;  1Q5J A;  2RAZ X;  1C64 A;  1L73 A;  1L69 A;  3UON A;  129L A;  171L A;  1D3M A;  1KNI A;  1L43 A;  3SB7 A;  4MD1 A;  2YDV A;  1SX2 A;  1C6D A;  1C66 A;  3C83 A;  1C68 A;  218L A;  162L A;  1L05 A;  234L A;  254L A;  3GUK A;  4W51 A;  4BVN A;  4QID A;  238L A;  4UG2 A;  5H2M A;  125L A;  4GP4 B;  1LLH A;  4G7S B;  211L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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