3QAKA

Agonist bound structure of the human adenosine a2a receptor
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
453
structure length
444
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of an agonist-bound human A2A adenosine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Homo sapien
molecule keywords Adenosine receptor A2a,lysozyme chimera
total genus 167
structure length 444
sequence length 453
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qakA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3qakA01
4ARQA 4XTLA 2O79A 120LA 4UG2A 4E97A 5BR5A 2Z55A 1C8RA 4AQNA 4KLYA 3EH4B 1LN6A 5ITCA 1QTVA 1G0JA 3HAQA 1L0MA 3DDLA 1L0KA 1L82A 2HUMA 177LA 5H2MA 1L46A 113LA 3QJUB 1L42A 3QBLA 2OU0X 3HH6A 3PDSA 3UTWA 1L48A 250LA 1JTMA 1QT8A 1L30A 3HTBA 4J4QA 4WW3A 5B6XA 3DMZA 1D2WA 1L38A 3HDFA 1TN0A 3UG9A 5AWZA 4EIYA 4FA7B 1KS3A 1KG9A 4JR8A 1C6HA 1L68A 3V2YA 1LYJA 1SX2A 2B6XA 2O4WA 1G0KA 218LA 129LA 5H2NA 1F50A 3DN1A 2OTZX 1S8LA 2LC9A 1L11A 1P2RA 1KY1A 5B6ZA 1ZURA 248LA 3C9MA 3NSBA 3CDRA 4XT1A 2NTWA 3OE6A 143LA 4W51A 1C3WA 1XMEB 1L84A 4A4MA 4G7QB 1L25A 3RZEA 1C68A 1PQJA 1C66A 196LA 3PXOA 3HT8A 1QUHA 2OEAX 3OAXA 1OV5A 221LA 261LA 5B6VA 3HDEA 1H68A 1R84A 2ZZLA 1LI2A 1L08A 1L05A 4I7JA 3C81A 1QT5A 224LA 4MQTA 3HAPA 4N6HA 3COCA 3WQJA 165LA 189LA 4EJ4A 1P8IA 1L59A 1P8UA 251LA 1OWZA 1LYEA 1L06A 2I35A 215LA 1QUOA 5F8UA 239LA 1SWZA 1L66A 1DYBA 2HPYA 2Y02A 3EH3B 1JGJA 3C8SA 155LA 2Q9DA 131LA 1L55A 141LA 1DYCA 3AYMA 2OE7X 5DYSA 162LA 2B74A 3SN6R 1JV7A 5A8EA 237LA 1KW7A 4MBSA 216LA 3CAPA 2B72A 1JV6A 4FBZA 1CUPA 1Q5IA 2J4YA 4HWLA 5DHHA 1L69A 214LA 195LA 168LA 3SB5A 3DMXA 1D9WA 3SBAA 145LA 1L85A 1L88A 1L96A 217LA 1CU2A 1IW6A 3V2WA 4PXFA 190LA 140LA 1L37A 3C8QA 3L2XA 3NY9A 4W55A 3SB8A 1DYGA 1JFPA 5AZDA 238LA 3LZMA 4BEZA 1L20A 3DMVA 4I7OA 3OE9A 2B7XA 4WAVA 2Z6BA 114LA 3RUNA 1R2NA 1D2YA 4I7PA 171LA 1L34A 2I20A 4DJHA 3QAKA 2G87A 2L78A 1CVKA 4BVNA 1OWYA 2M3GA 1P37A 1QTHA 4I7MA 4GP8B 104LA 3ABWA 192LA 4EKQA 1QSQA 1C62A 3GUOA 3HH5A 1CV0A 1L50A 164LA 4X32A 1L29A 4QI1A 230LA 4NC3A 2ANVA 4I7LA 1JTNA 1KGBA 4ARMA 5ITEA 2QPDB 4GBRB 2YDOA 184LA 2OTYX 4MQSA 1LWGA 1C61A 3DN8A 2RBRA 1CV4A 3HU9A 1CUQA 1G0MA 1P6YA 4L35A 178LA 1L32A 256LA 103LA 1P36A 2B6WA 5JJEA 167LA 2RAYX 4K5YA 1L79A 5G36A 3QJSB 3QBKA 4BUOA 1B6IA 4XTNA 212LA 4G72B 3QBGA 1L75A 1AT9A 160LA 4JQ6A 1CU5A 4JKVA 4W53A 1L24A 3SBBC 1L09A 4YXCA 5BR2A 1C67A 4AMJA 2L6XA 232LA 4LDLA 1LYGA 1L10A 3UZAA 1GU8A 3ODUA 1L77A 3VVKA 4KNFA 148LE 5H2HA 3HASA 1CV3A 2OU8A 2QPEB 4EA3A 3VI0A 3HANA 3S3CB 1CU6A 1UCQA 1SX7A 231LA 3S8GB 1L19A 5AHZA 1LLHA 152LA 3HU8A 3CODA 3VG9A 1QKOA 176LA 1T8FA 2RBSA 127LA 1ZWNA 1LWKA 2R4RA 1LYFA 149LA 1L86A 209LA 3UTVA 5B6YA 1IXFA 4MD1A 3VW7A 233LA 1L33A 1BRRA 4G70B 125LA 1IW9A 1L02A 1L22A 1QM8A 173LA 3A7KA 1FBBA 1L18A 3F8VA 3QJTB 1L81A 3NS0A 4GP5B 3UTYA 2RBQA 157LA 2WJLA 5G2CA 4YX7C 191LA 3PWHA 2QB0B 2NTGA 1L39A 5J7AA 4EKSA 1GUEA 262LA 4ZPUA 3HWLA 1UAZA 1L60A 236LA 2QARC 4L6RA 128LA 1PQMA 249LA 1CV6A 3G3VA 150LA 4GPOA 3DNAA 2F93A 3K2RA 4OO9A 2NTUA 1PQKA 1L87A 3CDQA 3EH5B 187LA 254LA 3RFMA 5B6WA 3L64A 3ZPQA 3C9LA 1BM1A 1CTWA 186LA 4YXAC 1QSBA 2YCYA 158LA 3KJ6A 4QRYA 5B35A 5EN0A 5H2PA 1G06A 3S3BB 102LA 3DN0A 3G3WA 4I7KA 3GUJA 4QIDA 1L53A 1L92A 4LDOA 5G53A 188LA 1C6QA 1P46A 245LA 3GULA 4I7NA 1P5CA 3SB7A 3X3BA 3HT6A 1QKPA 201LA 108LA 4W59A 1C6TA 1OVJA 5I14A 3DN2A 1XJUA 1L97A 118LA 1L45A 234LA 1TN5A 2X72A 4ARQB 1PXSA 2YDVA 3HT9A 4IAQA 4PK0A 1L93A 2B6ZA 2NTHA 1MGYA 1XJIA 219LA 4XXJA 1P64A 5H2LA 2YCXA 1S54A 7LZMA 1PQIA 4PXKA 3UZCA 4OV0A 1L98A 1C64A 3DQBA 3CDOA 1HZXA 130LA 2R4SA 1L14A 1L41A 3GUPA 3AM6A 175LA 3C7YA 1Q5JA 222LA 5JJNA 1L44A 2JAFA 1OVKA 4I7QA 2I21A 2RB0X 1KW5A 1LGUA 227LA 1XEPA 1P3NA 1QHJA 2ZIYA 1T6HA 2RAZX 1D3NA 1G1VA 1G07A 3C8RA 1L27A 1QT3A 2Q9EA 3GUNA 1L31A 2WJKA 3C7WA 5H2OA 3X3CA 3QJQB 1PXRA 4I7RA 3HT7A 1L13A 2F47A 5AX1A 1L99A 4LZMA 1X0K1 2F32A 1PQOA 5ETZA 1L0JA 1LI3A 2Y00A 1L00A 1P8HA 4HYXA 1PQDA 205LA 1G0GA 1E0PA 3DKEX 146LA 3G3XA 253LA 1G0QA 3UONA 139LA 1XJTA 3HUKA 4MD2A 5TGZA 4EPIA 260LA 2F95A 3C80A 2B6TA 2KSYA 1G0LA 4EXMA 110LA 1OV7A 2I1XA 1P56A 3ZEVA 1TLAA 2EI4A 1CX6A 1L51A 1L28A 1C60A 3CDTA 4HYJA 1T97A 197LA 1C8SA 3JR6A 115LA 1T8GA 3C7ZA 4IB4A 1M0KA 2KSAA 4BWBA 2LCBA 1D3MA 242LA 3D4SA 2JAGA 1C69A 2RBPA 4X1HA 1L23A 1C6DA 174LA 1C6JA 1L56A 1ZYTA 1DYEA 3GUKA 1VGOA 1LPYA 1M0LA 181LA 2Z73A 4N4YB 1C6EA 2RBNA 3QBIA 259LA 112LA 1LGXA 210LA 4W56A 199LA 111LA 1L94A 5DHGA 1L15A 200LA 5LWEA 156LA 1C6NA 3SB9A 4GRVA 1D3FA 1D3JA 211LA 1L95A 1L91A 1QUDA 2PEDA 1L40A 1L54A 4DKLA 3P0GA 1C6MA 4S0WA 4I7SA 3VHZA 1S8JA 4EPFA 2RB2X 4G7RB 1L01A 1L49A 240LA 3GUMA 3PBLA 4W54A 4W57A 246LA 1SSWA 1DYAA 172LA 4ARPA 5AHYA 1QS9A 5B0WA 4ARJA 255LA 1LYHA 1CV5A 1L65A 1CU0A 1O0AA 1QTDA 1XIOA 1SWYA 3QAPA 3SB6A 3OE0A 5A45A 6LZMA 1VJMA 229LA 2OU9A 1JQUA 1LYIA 4Y9HA 1F88A 1I6SA 4W58A 241LA 1CWQA 1PY6A 2ZFEA 3QJVB 4GYCA 1L03A 1L36A 3FA0A 1L58A 223LA 1L07A 1QT6A 123LA 4FAAB 2RBOA 4G7SB 169LA 1C65A 243LA 3DN4A 4ARMB 1BRXA 1L35A 1SSYA 1T8AA 3S3DB 144LA 3EMLA 2KSBA 4XT3A 163LA 5G2DA 2B6YA 1C6AA 3HAOA 4GBRA 5LZMA 4X31A 1L04A 5G28A 5H2KA 5JJJA 4LDEA 1L83A 3ZPRA 1C6LA 4EKPA 1E12A 183LA 1C6KA 1L16A 1NHBA 1L71A 3CDVA 1F4ZA 5KKHA 4I7TA 1S52A 2YCWA 1AP9A 185LA 3HTGA 1QTCA 1L61A 247LA 2HULA 1L21A 4IARA 5B2NA 4IAPA 5G54A 2IGCA 2BRDA 126LA 1QUGA 3NY8A 1S51A 1L89A 1M0MA 3BVDB 1L80A 1BRDA 1C6PA 138LA 1QT4A 1DYDA 2O7AA 1KNIA 159LA 3F9LA 3QDCA 213LA 3FADA 5FJGA 1GZMA 4AMIA 2OE9X 4GP4B 142LA 1C6GA 1L43A 3C83A 1KMEA 1L9HA 3AYNA 1DYFA 3HH3A 1CU3A 170LA 3GUIA 3T45A 1L72A 1FBKA 1QT7A 137LA 2Y04A 5H2IA 2HUKA 3DN3A 119LA 5H2JA 1C6CA 1C6IA 1L63A 3OE8A 122LA 4W52A 1H2SA 5A44A 198LA 1P7SA 257LA 2B75A 2LZMA 2RH1A 1KG8A 2LNLA 4FPDA 226LA 252LA 1OYUA 2KS9A 2Y01A 4TL3A 3REYA 3UTXA 3HARA 1C63A 1L67A 220LA 235LA 3HUQA 107LA 151LA 1KY0A 1EHKB 2OE4X 206LA 1LGWA 3FI5A 4EKRA 3NYAA 3MBVA 1QTZA 1P2LA 3C82A 5G2AA 3HUAA 1L76A 3QJRB 2ANXA 180LA 1CV1A 1G0PA 2VT4A 4BV0A 3VGAA 4DAJA 1L70A 161LA 166LA 1X0SA 3DN6A 1QS5A 1L52A 4G71B 1OVHA 2YCZA 1DZEA 1LI6A 1L62A 1L12A 2AT9A 4PJZA 1L26A 1L47A 4BEYA 182LA 1WTHA 4XTOA 1U19A 1C6BA 5C1MA 2A4TA 1K28A 1L57A 2CUUA 1LW9A 228LA 3HTFA 4N4WA 4UHRA 3HTDA 1L73A 2B70A 1EPYA 1L90A 1L74A 5AX0A 1X0I1 1CX7A 225LA 1L64A 1C6FA 1G1WA 147LA 5B34A 3HH4A 1L17A 2RB1X 109LA 258LA 4ARLA 3S8FB 244LA 2F2QA 2B73A 1LYDA 1QTBA 3PQRA 2Y03A 1S53A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXKA 4CJ2A 4ARQA 4HTKA 5BR5A 4UG2A 1TCYA 3EH4B 2YBHA 113LA 4II8A 1HC0A 1LSPA 3HH6A 1L48A 5LVIA 2BLXA 4J4QA 1GWDA 1TN0A 5AWZA 1LZ6A 1C6HA 1TBYA 1L68A 3M18B 3DN1A 1IWVA 2LC9A 1P2RA 1KY1A 2MEHA 3C9MA 3CDRA 4P2EA 4XT1A 143LA 208LA 1L84A 4TTDA 4G7QB 3RZEA 1C68A 3PXOA 1RJCB 3HT8A 5APCA 1GBSA 1OV5A 221LA 261LA 1OUGA 4HSFA 1LI2A 224LA 4NGWA 1OUJA 1WQMA 1OWZA 239LA 5KXZA 4KL7A 1HEQA 1DYBA 1LJHA 3C8SA 155LA 3ATOA 3TMVA 1JV7A 1HEMA 5A8EA 216LA 1JV6A 1CUPA 2J4YA 5DHHA 1L69A 4ZFPA 195LA 168LA 1JISA 2AUBA 1L96A 1IW6A 4PXFA 1CU2A 3V2WA 1D0KA 1L37A 3C8QA 1HHLA 3SB8A 5AZDA 1XGRC 5I4YA 1JTOL 2HEBA 1L20A 3DMVA 4I7OA 4R6CA 2DQFC 4I7PA 171LA 1L34A 2I20A 2BQJA 1P37A 4GP8B 3LZTA 4CGEA 1CV0A 1B5XA 4I7LA 1JTNA 5HLLA 1IR8A 1KGBA 3D3DA 184LA 1HMKA 4MQSA 1CV4A 1G0MA 1LSMA 4L35A 178LA 1L32A 4LGKA 1KXYA 3QJSB 2FYDA 4M4OA 1GFAA 1C08C 1L75A 1AT9A 2ZILA 1CU5A 1LSFA 1UIDA 4HV1A 1L09A 2X0AA 1NBZC 2BQGA 4LDLA 2HEDA 1IP2A 2EPEA 4PJ2C 4EA3A 1LJKA 231LA 152LA 3VG9A 1UACY 1T8FA 5FSTA 2MEIA 1ZWNA 1LYFA 149LA 1GF8A 1IXFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CV5 A;  1L65 A;  1CU0 A;  1O0A A;  1QTD A;  1XIO A;  1SWY A;  3QAP A;  3SB6 A;  3OE0 A;  5A45 A;  6LZM A;  1VJM A;  229L A;  2OU9 A;  1JQU A;  1LYI A;  4Y9H A;  1F88 A;  1I6S A;  4W58 A;  241L A;  1CWQ A;  1PY6 A;  2ZFE A;  3QJV B;  4GYC A;  1L03 A;  1L36 A;  3FA0 A;  1L58 A;  223L A;  1L07 A;  1QT6 A;  123L A;  4FAA B;  2RBO A;  4G7S B;  169L A;  1C65 A;  243L A;  3DN4 A;  4ARM B;  1BRX A;  1L35 A;  1SSY A;  1T8A A;  3S3D B;  144L A;  3EML A;  2KSB A;  4XT3 A;  163L A;  5G2D A;  2B6Y A;  1C6A A;  3HAO A;  4GBR A;  5LZM A;  4X31 A;  1L04 A;  5G28 A;  5H2K A;  5JJJ A;  4LDE A;  1L83 A;  3ZPR A;  1C6L A;  4EKP A;  1E12 A;  183L A;  1C6K A;  1L16 A;  1NHB A;  1L71 A;  3CDV A;  1F4Z A;  5KKH A;  4I7T A;  1S52 A;  2YCW A;  1AP9 A;  185L A;  3HTG A;  1QTC A;  1L61 A;  247L A;  2HUL A;  1L21 A;  4IAR A;  5B2N A;  4IAP A;  5G54 A;  2IGC A;  2BRD A;  126L A;  1QUG A;  3NY8 A;  1S51 A;  1L89 A;  1M0M A;  3BVD B;  1L80 A;  1BRD A;  1C6P A;  138L A;  1QT4 A;  1DYD A;  2O7A A;  1KNI A;  159L A;  3F9L A;  3QDC A;  213L A;  3FAD A;  5FJG A;  1GZM A;  4AMI A;  2OE9 X;  4GP4 B;  142L A;  1C6G A;  1L43 A;  3C83 A;  1KME A;  1L9H A;  3AYN A;  1DYF A;  3HH3 A;  1CU3 A;  170L A;  3GUI A;  3T45 A;  1L72 A;  1FBK A;  1QT7 A;  137L A;  2Y04 A;  5H2I A;  2HUK A;  3DN3 A;  119L A;  5H2J A;  1C6C A;  1C6I A;  1L63 A;  3OE8 A;  122L A;  4W52 A;  1H2S A;  5A44 A;  198L A;  1P7S A;  257L A;  2B75 A;  2LZM A;  2RH1 A;  1KG8 A;  2LNL A;  4FPD A;  226L A;  252L A;  1OYU A;  2KS9 A;  2Y01 A;  4TL3 A;  3REY A;  3UTX A;  3HAR A;  1C63 A;  1L67 A;  220L A;  235L A;  3HUQ A;  107L A;  151L A;  1KY0 A;  1EHK B;  2OE4 X;  206L A;  1LGW A;  3FI5 A;  4EKR A;  3NYA A;  3MBV A;  1QTZ A;  1P2L A;  3C82 A;  5G2A A;  3HUA A;  1L76 A;  3QJR B;  2ANX A;  180L A;  1CV1 A;  1G0P A;  2VT4 A;  4BV0 A;  3VGA A;  4DAJ A;  1L70 A;  161L A;  166L A;  1X0S A;  3DN6 A;  1QS5 A;  1L52 A;  4G71 B;  1OVH A;  2YCZ A;  1DZE A;  1LI6 A;  1L62 A;  1L12 A;  2AT9 A;  4PJZ A;  1L26 A;  1L47 A;  4BEY A;  182L A;  1WTH A;  4XTO A;  1U19 A;  1C6B A;  5C1M A;  2A4T A;  1K28 A;  1L57 A;  2CUU A;  1LW9 A;  228L A;  3HTF A;  4N4W A;  4UHR A;  3HTD A;  1L73 A;  2B70 A;  1EPY A;  1L90 A;  1L74 A;  5AX0 A;  1X0I 1;  1CX7 A;  225L A;  1L64 A;  1C6F A;  1G1W A;  147L A;  5B34 A;  3HH4 A;  1L17 A;  2RB1 X;  109L A;  258L A;  4ARL A;  3S8F B;  244L A;  2F2Q A;  2B73 A;  1LYD A;  1QTB A;  3PQR A;  2Y03 A;  1S53 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1CV0 A;  1B5X A;  4I7L A;  1JTN A;  5HLL A;  1IR8 A;  1KGB A;  3D3D A;  184L A;  1HMK A;  4MQS A;  1CV4 A;  1G0M A;  1LSM A;  4L35 A;  178L A;  1L32 A;  4LGK A;  1KXY A;  3QJS B;  2FYD A;  4M4O A;  1GFA A;  1C08 C;  1L75 A;  1AT9 A;  2ZIL A;  1CU5 A;  1LSF A;  1UID A;  4HV1 A;  1L09 A;  2X0A A;  1NBZ C;  2BQG A;  4LDL A;  2HED A;  1IP2 A;  2EPE A;  4PJ2 C;  4EA3 A;  1LJK A;  231L A;  152L A;  3VG9 A;  1UAC Y;  1T8F A;  5FST A;  2MEI A;  1ZWN A;  1LYF A;  149L A;  1GF8 A;  1IXF A;  1LHK A;  3VW7 A;  1DKK A;  233L A;  2XJW A;  1JJ0 A;  4FDY A;  4U3X B;  1L18 A;  3F8V A;  3NS0 A;  3WUA A;  1XEI A;  1AZF A;  2QB0 B;  3ATN A;  1L39 A;  3HWL A;  2A7D A;  1CKH A;  1ZVY B;  5F81 A;  3G3V A;  3K2R A;  2NTU A;  3W6F A;  4N8Z A;  4OOO A;  1CTW A;  186L A;  2YCY A;  3DN0 A;  1L92 A;  4NIJ A;  5DN4 A;  1IP3 A;  1HEO A;  4WO9 A;  3HT6 A;  1QKP A;  1XSF A;  1BB4 A;  5I14 A;  1XJU A;  1L97 A;  1HSX A;  4ARQ B;  2YDV A;  3EXD A;  4PK0 A;  5KKJ A;  1UC0 A;  1JKD A;  2YCX A;  3TXD A;  3UZC A;  3CDO A;  2IHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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