3RZEA

Structure of the human histamine h1 receptor in complex with doxepin
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
435
structure length
428
Chain Sequence
MPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHRREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Histamine H1 receptor, Lysozyme chimera
total genus 147
structure length 428
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3rzeA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3rzeA01
2NTHA 3SB7A 226LA 2PEDA 2I35A 1M0LA 125LA 2YCWA 1LYHA 1C6KA 1P7SA 4EJ4A 170LA 3DN8A 3HT9A 3C8QA 4K5YA 4J4QA 5AHYA 149LA 4HWLA 2OEAX 2AT9A 3GUIA 2KS9A 1SWYA 4OV0A 2YCXA 1KW7A 1CUPA 2A4TA 4W59A 3PWHA 1L97A 1SWZA 7LZMA 182LA 4IARA 1G1VA 1SSYA 4MQSA 4N6HA 5EN0A 1G1WA 5B6XA 1L38A 3S3DB 3QJRB 1P2LA 217LA 1L42A 159LA 233LA 3UTWA 5A8EA 1L68A 1QS9A 1P8IA 4HYXA 239LA 1QT6A 2F93A 1CX6A 2RAZX 185LA 178LA 1XJUA 4XXJA 3PBLA 1L01A 262LA 1L34A 1L23A 1DYGA 3C8SA 4Y9HA 4ZPUA 187LA 157LA 162LA 3HH4A 3EH4B 1L51A 222LA 4EPFA 1L58A 3HWLA 3NSBA 5KKHA 1L37A 1CV0A 4W54A 1L49A 2B74A 1D3FA 4YXAC 2X72A 3CDQA 5H2JA 2RAYX 4W55A 4G7QB 1L73A 2WJKA 1TLAA 4I7JA 1PXRA 1LLHA 5JJNA 4QIDA 1DYCA 3FADA 177LA 1L33A 215LA 1E0PA 5H2LA 4YXCA 4IAPA 3T45A 3G3VA 2OTYX 1L44A 2LNLA 1L96A 3HAQA 1L99A 243LA 4WAVA 1CV3A 3QJQB 1CU6A 1S51A 1L47A 2OU8A 1L0KA 1P37A 255LA 180LA 1C6CA 1L05A 261LA 1G0QA 3DN2A 3FA0A 1L62A 1QS5A 1C6PA 1FBBA 2B75A 4OO9A 1L9HA 2B73A 1HZXA 1L20A 1Q5JA 3PDSA 224LA 113LA 5G2CA 4ARQA 4EKRA 152LA 4XTOA 1H2SA 1LGWA 245LA 1L07A 235LA 2F2QA 141LA 4W51A 2VT4A 205LA 5G53A 3HUAA 1C62A 3NY8A 1F88A 1L13A 228LA 189LA 209LA 5H2HA 4MBSA 4PK0A 1LYGA 4YX7C 1IW6A 3BVDB 1ZURA 1KY1A 1S53A 1P56A 238LA 4GRVA 1UCQA 1T6HA 1X0K1 3UTXA 148LE 4GPOA 144LA 4UHRA 1G06A 1L25A 3C7YA 108LA 1QTBA 2QPDB 2RB2X 2I21A 188LA 5H2MA 1L08A 4ARMB 5B6VA 3OE6A 1L41A 1DYBA 2Z73A 1L76A 3HT6A 3DDLA 220LA 1L45A 5A44A 1L31A 1P5CA 4A4MA 1ZWNA 3K2RA 3NYAA 1GZMA 1XJTA 1OYUA 2LCBA 3GUNA 4MD2A 1C6TA 3GUMA 3HT8A 1QSBA 5I14A 4ARLA 2B70A 1U19A 3C7ZA 3AM6A 4X32A 192LA 1BRXA 1GUEA 2B6TA 4LDLA 4G71B 1L48A 1L71A 5G2AA 1L26A 5ITEA 3AYMA 190LA 171LA 1QUGA 2LC9A 5H2NA 3CDOA 1KGBA 4N4WA 131LA 3VI0A 3SN6R 1C6BA 3C81A 3C83A 1DZEA 3S3CB 3UTVA 2O4WA 3PXOA 166LA 4ARJA 4G72B 4XTLA 4BEZA 1L15A 3HTDA 5H2KA 3HH6A 3ZEVA 1L11A 1QT8A 5FJGA 103LA 3G3WA 4AMIA 2I1XA 2Y02A 1FBKA 5F8UA 3L2XA 4NC3A 2QB0B 4G70B 167LA 1G07A 1KMEA 4PXFA 1L46A 2KSBA 3HTFA 3QJTB 2YCZA 115LA 5AHZA 5LWEA 4PXKA 3HUKA 4IAQA 1L00A 1PQOA 1KS3A 176LA 3DKEX 1KY0A 1SX2A 3VGAA 1OVJA 3HH5A 2YDOA 1P8HA 1CV1A 129LA 4DJHA 107LA 4MD1A 250LA 4XT1A 1P2RA 3RZEA 146LA 1O0AA 5G54A 1P6YA 2ZIYA 1QTVA 4GBRB 4BV0A 111LA 3EH5B 254LA 1L02A 172LA 4BWBA 2RBOA 2B7XA 3HAOA 4DAJA 4EPIA 161LA 3C8RA 2B6WA 4EA3A 2M3GA 3F9LA 4I7KA 5A45A 3DN6A 2Z6BA 1VGOA 1L82A 1L92A 1P36A 1SSWA 1L19A 2RB1X 4I7QA 2I20A 1C6FA 3S3BB 1QTHA 1DYDA 2LZMA 3FI5A 1S52A 195LA 1I6SA 1L35A 3EMLA 5B34A 210LA 1QTDA 206LA 3GUOA 4FBZA 1TN5A 251LA 4HYJA 211LA 3EH3B 3HUQA 5JJEA 1DYAA 1PQIA 1PQKA 4XTNA 1LYDA 2Y03A 2WJLA 112LA 1L29A 4I7SA 3HARA 142LA 1AP9A 4LDEA 2L6XA 1L84A 3DN3A 225LA 3CDVA 1C6GA 1OV5A 3QAPA 1D2WA 1L24A 5AWZA 1B6IA 1K28A 1L36A 1KW5A 1IW9A 1JFPA 1QKPA 181LA 1C65A 1L30A 1QT5A 4I7RA 3V2WA 2ZZLA 1L85A 2HUKA 1L09A 1QUDA 248LA 201LA 4MQTA 5AX1A 1L60A 219LA 1R2NA 4JKVA 3NY9A 122LA 1XEPA 1P64A 3CDTA 1LYEA 3CODA 174LA 1L75A 1C6DA 1CV6A 1L67A 247LA 3HTGA 252LA 2ANXA 1OWZA 1BRRA 5TGZA 231LA 4TL3A 3RUNA 3REYA 1L50A 1KNIA 1L80A 4KLYA 160LA 4XT3A 2CUUA 1CUQA 3DQBA 3QJUB 1L04A 1G0PA 1L06A 2Q9EA 196LA 5LZMA 3AYNA 2NTWA 4BUOA 120LA 5B6ZA 5BR2A 258LA 4I7NA 1AT9A 3GUJA 104LA 1G0MA 1L63A 4FPDA 3OE0A 1L12A 3VG9A 3DMZA 1QTCA 1D3JA 1LI6A 2OE4X 1QTZA 3C80A 257LA 3SB6A 1L88A 3C9MA 1G0GA 1L0MA 4BEYA 3C82A 4S0WA 1L28A 1EPYA 1EHKB 3QJVB 4X1HA 1L21A 1XMEB 1T8FA 5C1MA 1PQMA 1ZYTA 128LA 1C6HA 4FAAB 1C6QA 2R4SA 2NTUA 119LA 4JR8A 1F50A 1S54A 237LA 1P46A 259LA 1QHJA 4AMJA 4JQ6A 1QT7A 3DNAA 241LA 123LA 155LA 3QJSB 1C67A 1IXFA 3MBVA 183LA 1L70A 3GUPA 2QPEB 169LA 246LA 3OAXA 1OWYA 1CU3A 2F32A 4WW3A 1L87A 1L27A 2B6YA 1X0I1 1P3NA 3A7KA 3X3BA 1OVHA 4PJZA 5B2NA 3HU8A 3QBKA 1C6AA 4I7OA 1XIOA 3HANA 3HH3A 1NHBA 3VW7A 5H2OA 156LA 5DHGA 2IGCA 2RBPA 3DMVA 1T8AA 127LA 216LA 4I7PA 145LA 102LA 1M0KA 1JTMA 2KSAA 151LA 126LA 1L43A 3HAPA 3VVKA 3ZPQA 2F95A 5BR5A 4IB4A 1LWKA 1L14A 3ZPRA 1L94A 2F47A 2YDVA 1C6MA 3ABWA 109LA 1M0MA 1CWQA 1X0SA 2R4RA 4ARMA 5JJJA 1QT3A 3X3CA 3OE8A 2BRDA 1L86A 1L91A 1F4ZA 1C68A 4W58A 1L40A 1PQJA 5AX0A 1L74A 1LGUA 1JTNA 234LA 139LA 1CV4A 1CU0A 1QUOA 200LA 3OE9A 5DYSA 2RB0X 4I7TA 1Q5IA 3JR6A 3RFMA 1L64A 5G2DA 4KNFA 213LA 3CDRA 1D3MA 1QSQA 1S8LA 1L95A 197LA 3SB5A 137LA 5H2PA 4QRYA 4W52A 5AZDA 4QI1A 1L77A 1L54A 147LA 3F8VA 4EXMA 1BM1A 3C9LA 3SBAA 3SB8A 1PY6A 3QBIA 1CU5A 1CV5A 1UAZA 212LA 5B6YA 1L10A 1L66A 4ARQB 1PQDA 1LN6A 199LA 3UG9A 230LA 2OE7X 2EI4A 191LA 1L72A 4ARPA 4W56A 1DYFA 1LYJA 2RBNA 1LI2A 1PXSA 2HULA 1CTWA 5B35A 1L56A 1L89A 1L59A 1D9WA 1QKOA 2O79A 221LA 4UG2A 1C6NA 2RBRA 2QARC 4DKLA 1L93A 6LZMA 1QUHA 1C3WA 1JV6A 1S8JA 232LA 4EKPA 3L64A 2YCYA 3KJ6A 4L6RA 143LA 3C7WA 2O7AA 260LA 3CAPA 4I7LA 2B6ZA 2Y01A 3S8GB 1LW9A 3UTYA 2RBQA 3VHZA 1L65A 1KG9A 1L17A 4GBRA 4G7RB 165LA 130LA 1C6EA 2G87A 1L22A 1L55A 2OTZX 163LA 1L83A 4W57A 249LA 4G7SB 3GULA 3G3XA 2Z55A 3UZAA 3GUKA 3QAKA 1E12A 2ZFEA 3PQRA 1QM8A 5G28A 244LA 4GP8B 1L0JA 1LYFA 3QBLA 1C6IA 2L78A 1L98A 3HTBA 1C63A 2NTGA 4EKSA 1D3NA 158LA 1CU2A 1G0KA 240LA 1LI3A 236LA 4FA7B 4EKQA 1C66A 1OV7A 1DYEA 1C69A 3DMXA 2HPYA 4N4YB 173LA 1QT4A 1C8RA 3QBGA 1WTHA 5H2IA 1LWGA 2ANVA 4W53A 5ITCA 3HDFA 1GU8A 1D2YA 1C60A 3DN0A 3NS0A 1G0LA 2JAFA 1LGXA 168LA 4GP4B 1VJMA 1T8GA 1L81A 2J4YA 4AQNA 5J7AA 1R84A 2OU9A 3HU9A 4I7MA 2JAGA 3QDCA 3UONA 1C6JA 198LA 5ETZA 1JQUA 1C61A 2KSYA 3SB9A 3ODUA 3WQJA 164LA 3DN4A 1L90A 2HUMA 1L32A 223LA 5B0WA 1XJIA 1LPYA 3S8FB 4GP5B 4LZMA 3UZCA 3V2YA 4GYCA 2RH1A 114LA 4X31A 2B6XA 2OE9X 2Q9DA 1L57A 1L16A 2OU0X 2Y04A 5B6WA 214LA 229LA 3HT7A 175LA 186LA 1L61A 1KG8A 227LA 1L18A 140LA 2B72A 2RBSA 110LA 1T97A 150LA 138LA 1L53A 1G0JA 3P0GA 1L52A 118LA 184LA 4EIYA 1TN0A 3COCA 3LZMA 4E97A 256LA 5DHHA 1LYIA 1P8UA 3DN1A 1C8SA 1C6LA 1L03A 242LA 1MGYA 4BVNA 1BRDA 5G36A 1CX7A 1H68A 4LDOA 3HDEA 1JGJA 1OVKA 4L35A 1SX7A 1JV7A 2Y00A 1C64A 1L79A 218LA 253LA 3HASA 1CVKA 1L39A 3D4SA 1L69A 3SBBC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ILCA 2I35A 1M0LA 4WL6A 3VWOA 1LYHA 1P7SA 2W1XA 4K5YA 4ZIXA 4HWLA 2OEAX 2NWDX 1SWYA 4J1BA 4OV0A 1KW7A 1GEVA 4IARA 1L97A 7LZMA 1G1VA 1JISA 5B6XA 1G1WA 3QJRB 1L42A 1LHJA 5A8EA 1LZEA 5LYZA 1P8IA 4HYXA 1QT6A 1F0WA 2Z38A 3PBLA 1IWXA 2Z39A 262LA 3RT5X 2I6ZA 3CSQA 1XEIA 3C8SA 4Y9HA 1DKJA 4ZPUA 157LA 4UWNA 4CFOA 5KKHA 1QDRA 1LSBA 2B74A 5DN4A 1OUEA 5B07A 1LLHA 2MECA 5JJNA 1DYCA 1WVVA 4NSJA 1E0PA 5H2LA 1UIGA 3T45A 1JHLA 4N9RA 1TBYA 3AYQA 2LNLA 1L96A 243LA 4WAVA 1CU6A 1GB6A 1YKYX 2OU8A 1NF5A 1BWIA 2LZ2A 4NGIA 1CKGA 4WM4A 4WL7A 1G0QA 3FE0A 4NWHA 1FBBA 1HFXA 2B73A 1HELA 1B9OA 1L20A 1LSGA 1Q5JA 4ARQA 152LA 1UA6Y 4PGJB 2BQHA 1JIYA 205LA 1C62A 2HEEA 228LA 209LA 4PK0A 1LYGA 4YX7C 1IW6A 1QSWA 1ZURA 1KY1A 3CT1A 1UCQA 4TX7A 1QUSA 3C7YA 108LA 2BQJA 2QPDB 2I21A 5H2MA 3OE6A 2Z73A 1L76A 4NY5A 5EBHA 3DDLA 1L45A 5E4PA 154LA 1GZMA 4MD2A 3GUNA 4H9CA 4B49A 3AM6A 1BRXA 1GUEA 4LDLA 5G2AA 3AYMA 2LC9A 131LA 2EPEA 4G72B 3RZ4A 5KXTA 5FJGA 1B7LA 2I1XA 5F8UA 2QB0B 1YIKA 1G07A 5FELA 1LJJA 4PXFA 1L46A 115LA 4C5FA 1L00A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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