3SN6R

Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-gs protein complex
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
475
structure length
443
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/hydrolase
molecule keywords Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isofor
publication title Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 148
structure length 443
sequence length 475
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
R PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
R PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sn6R01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3sn6R02
1P56A 213LA 1L63A 2OEAX 3OE6A 4WW3A 1QUGA 205LA 4G70B 4MQTA 2OU0X 1KGBA 2B74A 2M3GA 4YXAC 1KMEA 1LYHA 2NTWA 3PQRA 5C1MA 1CTWA 1L34A 3OE8A 242LA 177LA 5AHYA 4I7SA 5KKHA 3SB9A 1L37A 4LDLA 1L99A 1BRRA 3C9MA 4QIDA 2Y00A 1CVKA 4ARPA 3VI0A 4PJZA 1C6AA 238LA 2I21A 248LA 3DN8A 5B2NA 3DN1A 5LWEA 237LA 4EKSA 178LA 1L9HA 3UTYA 1I6SA 4KLYA 5FJGA 173LA 1L96A 5B35A 2O79A 1XJIA 4L6RA 2F47A 1P46A 3GUNA 1L65A 1L00A 1QTHA 4EJ4A 5H2LA 186LA 3HH4A 3QDCA 241LA 3S8GB 129LA 4XT3A 5B6ZA 2NTHA 2QARC 2YDOA 1CV4A 1QSBA 1XJUA 170LA 1E12A 5G53A 5AZDA 3QAPA 2KSBA 175LA 1D9WA 4YX7C 2YCWA 2I35A 1L0JA 3QJUB 262LA 1L17A 3D4SA 4OV0A 146LA 3C7YA 3HH3A 1C66A 3DMVA 108LA 254LA 1H2SA 1L62A 1LWGA 3HT9A 259LA 1L39A 5ETZA 107LA 1FBKA 196LA 4XTNA 256LA 1PQDA 5G28A 2WJKA 3QJQB 1P7SA 1L43A 110LA 1P64A 4DKLA 3G3WA 1PY6A 4G7SB 3HTFA 4FA7B 1LYFA 5G36A 1CU6A 1L75A 1C60A 1JFPA 3COCA 137LA 2AT9A 187LA 4EPIA 1C63A 1T8AA 1G07A 250LA 239LA 3DN2A 1H68A 1L10A 253LA 1PXRA 1PXSA 1L0KA 109LA 1DYGA 3PXOA 4MD1A 3DMXA 183LA 2ANXA 2F93A 1L92A 158LA 4GP4B 1F50A 4XTOA 5B6YA 247LA 3CDQA 3S3BB 3HTBA 1L42A 1L40A 3DQBA 1PQKA 249LA 5G2CA 4QRYA 2RH1A 1G0KA 4IARA 2B73A 1L60A 165LA 1P3NA 4A4MA 1OWYA 1EPYA 4ZPUA 1SX2A 1QKPA 1UAZA 1C6HA 4HYJA 102LA 1S53A 3WQJA 198LA 4N6HA 2HUKA 2Z73A 257LA 1LYIA 4GBRB 1TN0A 209LA 1L66A 2ZZLA 142LA 4TL3A 2L6XA 1P2RA 1QKOA 1C6TA 2B6YA 3HUKA 1GU8A 3HASA 1QT7A 1P37A 3CDRA 1CWQA 4EIYA 1L12A 1L29A 1JV7A 1L95A 1SSYA 3KJ6A 181LA 1L07A 3C8QA 1CUQA 3EH4B 1BRDA 1G0PA 1L51A 2OTZX 2OTYX 1P2LA 163LA 3HU9A 4Y9HA 210LA 3HT8A 2I20A 1S8LA 3JR6A 3A7KA 169LA 1NHBA 3HT7A 1L89A 1XJTA 2F95A 141LA 212LA 3X3BA 4FAAB 172LA 1GZMA 3NYAA 190LA 4W52A 2F2QA 1JQUA 1L55A 3L2XA 4I7JA 4S0WA 127LA 4GP8B 147LA 1G0GA 1L30A 3C8SA 2YCYA 1C61A 1L64A 1CV3A 2LC9A 3OE9A 1L41A 1CV1A 156LA 1L14A 2RBSA 1KNIA 236LA 1KG8A 4XT1A 5B0WA 220LA 4AMIA 3SB6A 3HUQA 4BEYA 234LA 3NS0A 1L31A 4ARQB 3ZPQA 1OVJA 3FA0A 1E0PA 3V2WA 2CUUA 261LA 1C68A 3DMZA 1JV6A 4UHRA 1QUDA 233LA 2OE4X 4PK0A 5H2OA 159LA 1GUEA 149LA 1OVKA 5A8EA 1L86A 1O0AA 2Q9DA 1L09A 7LZMA 1L73A 1D2YA 3VG9A 1L98A 5I14A 2B72A 5A45A 4EKQA 5TGZA 1KG9A 3QBIA 3S8FB 3HH6A 1JTMA 1D3JA 1HZXA 2J4YA 1C6CA 1LI3A 1SWZA 3CAPA 1L16A 2RBRA 251LA 3C7ZA 1P8UA 3QJTB 138LA 3HAOA 1L24A 4W56A 5B6WA 1C65A 1DYBA 201LA 2B6TA 2R4RA 1L06A 4HWLA 4IB4A 119LA 4W51A 1UCQA 1G06A 243LA 2IGCA 4OO9A 258LA 184LA 3HH5A 1CX6A 4X32A 1L05A 1S8JA 3VVKA 3FADA 4I7MA 252LA 4GPOA 1L88A 200LA 114LA 3REYA 2RAYX 218LA 1C67A 3C82A 1QTCA 4GBRA 5G2DA 1G0QA 5EN0A 1L11A 3C9LA 1VJMA 3RZEA 2B6XA 3QAKA 4N4WA 4BEZA 3HANA 1S52A 125LA 2Y02A 2RB2X 1L36A 4IAPA 3HAPA 4JR8A 1CV5A 1QSQA 6LZMA 1SWYA 1Q5JA 5H2HA 3LZMA 3UTWA 3QJVB 1C6GA 1KW5A 151LA 1CU5A 3FI5A 3HAQA 1QT5A 1L93A 1PQMA 191LA 1C62A 1P8HA 1C6DA 1JGJA 3DN0A 3AM6A 1PQIA 221LA 2KSAA 1DYCA 5ITEA 228LA 4YXCA 4N4YB 246LA 3BVDB 2QB0B 1T97A 171LA 1L82A 1L44A 2QPDB 1QS9A 3UZAA 1LWKA 150LA 1QT4A 188LA 1G0LA 1LYDA 1L50A 1L91A 3F8VA 3C83A 1DYFA 216LA 255LA 1C6JA 229LA 3UTVA 1X0K1 1CU0A 2OE9X 3DNAA 1TN5A 182LA 3F9LA 224LA 1SSWA 164LA 4JKVA 1L74A 3GUKA 1L25A 2OE7X 3NY8A 1L72A 5A44A 3SN6R 4PXFA 1IXFA 1LGWA 1L48A 1TLAA 2RB0X 1EHKB 4JQ6A 1L59A 3DKEX 3UONA 4ARQA 2WJLA 1L46A 4QI1A 1QTDA 1QT6A 3HARA 230LA 2RBQA 2RAZX 3HDEA 1F4ZA 226LA 4ARLA 5AX1A 189LA 3MBVA 157LA 1OYUA 4AMJA 4PXKA 3X3CA 103LA 3ZEVA 1P6YA 3CDVA 2YCZA 168LA 4W54A 3V2YA 4G7QB 1L33A 3C8RA 2Y01A 2EI4A 5DHGA 2A4TA 130LA 3UG9A 1L15A 1X0SA 139LA 1D3FA 2RBOA 3HTGA 3SB5A 2O7AA 1XEPA 4XXJA 217LA 1QTBA 3ABWA 3GUPA 222LA 1L35A 1OV5A 1L84A 2B6ZA 4DJHA 195LA 1T6HA 1KW7A 3SB7A 5H2NA 4I7NA 1XMEB 3NSBA 4BVNA 3VW7A 4ARMB 1L21A 1L87A 3UTXA 5JJNA 3S3CB 3HT6A 1DYEA 2X72A 4G7RB 1C6QA 1L20A 232LA 4E97A 1PQJA 2QPEB 1L61A 1L57A 4W53A 240LA 1BM1A 1L80A 1DZEA 1M0KA 5ITCA 1L32A 2I1XA 1FBBA 1OV7A 2HUMA 1C6LA 4BV0A 2KSYA 4DAJA 3ZPRA 1L83A 1L79A 3K2RA 1L70A 143LA 1L76A 4IAQA 1LPYA 1SX7A 185LA 3G3VA 4LZMA 2B6WA 2O4WA 5B34A 128LA 3PBLA 1L94A 1L68A 1C8RA 4I7KA 1L08A 4HYXA 4EA3A 3CDTA 2OU9A 2RBNA 1L22A 197LA 1IW9A 1QTZA 3VHZA 1Q5IA 215LA 3C7WA 3SBAA 3P0GA 1QS5A 2NTUA 3EH5B 3S3DB 1LLHA 5AX0A 2Q9EA 176LA 4MQSA 1M0MA 2VT4A 112LA 1L67A 5F8UA 1OVHA 3HWLA 1DYAA 1M0LA 2F32A 1LGXA 2B75A 1S54A 3DN3A 144LA 120LA 2LNLA 4X31A 1L01A 3G3XA 3DN6A 145LA 4AQNA 1IW6A 5G2AA 3C81A 5JJEA 260LA 3RFMA 2B70A 1KS3A 4LDEA 5JJJA 1CU2A 1L58A 1QT8A 4WAVA 3NY9A 211LA 2G87A 1CUPA 2HULA 161LA 1KY1A 1C6EA 1C3WA 1L18A 3HTDA 1P5CA 2ZIYA 5G54A 4EPFA 4EXMA 4I7QA 1L23A 1C6BA 3PDSA 1L71A 1L77A 1L81A 3GUOA 1L26A 1LGUA 1CV6A 1L47A 2JAGA 3AYNA 1G1VA 1LW9A 2KS9A 1L85A 1L13A 4FPDA 4I7OA 1L90A 5BR5A 1ZWNA 4G71B 1WTHA 1BRXA 1VGOA 1F88A 1LYGA 4FBZA 3GUMA 4I7PA 118LA 1JTNA 3HDFA 1U19A 2Y03A 4GRVA 3DN4A 2JAFA 3DDLA 1B6IA 1L49A 1L53A 219LA 1L69A 1C8SA 199LA 1XIOA 2Y04A 3QJSB 3PWHA 1QTVA 3L64A 4ARJA 3UZCA 1C69A 1QT3A 2L78A 2RB1X 126LA 4W55A 3QJRB 3HUAA 5H2MA 4ARMA 1P8IA 2BRDA 5DYSA 2YCXA 4I7LA 1L19A 4LDOA 1L45A 2RBPA 3HU8A 3T45A 231LA 1LN6A 1G0MA 3SB8A 111LA 1PQOA 214LA 4EKRA 2R4SA 1L28A 2B7XA 5AHZA 1CU3A 1AT9A 3GULA 5B6XA 1QUHA 167LA 225LA 1LI2A 1S51A 2Z55A 1D3MA 5J7AA 1C6MA 2ANVA 5H2IA 5B6VA 1C6FA 4KNFA 152LA 148LE 3GUJA 4W58A 4EKPA 3QBLA 3CDOA 5DHHA 4W59A 4W57A 1C6PA 1G0JA 3OAXA 3GUIA 1QM8A 1X0I1 1D2WA 1L38A 4G72B 140LA 174LA 2PEDA 1T8GA 223LA 3AYMA 1LI6A 1C64A 2OU8A 155LA 4X1HA 4UG2A 1C6NA 192LA 4BUOA 1L56A 5BR2A 5LZMA 245LA 235LA 206LA 3VGAA 123LA 4K5YA 162LA 5H2JA 4BWBA 1L27A 160LA 1L97A 2NTGA 3QBKA 1L52A 4XTLA 1QUOA 1C6IA 5H2KA 2LCBA 1CX7A 1L02A 4I7RA 4MD2A 1L03A 1G1WA 1AP9A 2ZFEA 2Z6BA 2HPYA 3ODUA 3RUNA 1P36A 166LA 1D3NA 1MGYA 1L54A 122LA 131LA 3SBBC 3EH3B 4J4QA 1K28A 4GP5B 104LA 2YDVA 1ZURA 4MBSA 1R84A 1L04A 1T8FA 5AWZA 227LA 180LA 1L0MA 5H2PA 1QHJA 1KY0A 1LYJA 4L35A 113LA 2LZMA 244LA 4I7TA 1CV0A 115LA 1C6KA 1DYDA 1R2NA 4GYCA 3C80A 1LYEA 3CODA 3QBGA 4NC3A 3EMLA 1ZYTA 3OE0A 1OWZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OE6A 9LYZA 5D5CA 2RSCA 3CSQA 2FBDA 1KGBA 2B74A 1SLYA 1LJFA 1TDYA 3PQRA 1CTWA 1MELL 2XQOA 4I7SA 5KXNA 2BQFA 4WO6A 1LHKA 1IX0A 1WTNA 3SB9A 1QQYA 4UWNA 1CVKA 4NSJA 5LA5A 4GCFA 4LGKA 1XSFA 5LWEA 3W6AA 4LT2A 5T3FA 4MSTA 3B72A 4KLYA 4L6RA 2F47A 1P46A 5H2LA 4H94A 1GBYA 3HH4A 4NGJA 3TXHA 1YROA 4NHPA 2HEAA 3P4ZA 2NTHA 2YDOA 5J7CA 4H93A 1IWWA 2F4GA 2XBSA 1D9WA 1H6MA 1HERA 2YCWA 1CKDA 4PJ2C 4OV0A 2WARA 3C7YA 254LA 1LWGA 196LA 3QJQB 3OK0A 1L43A 4DKLA 3A93A 132LA 1GE1A 4G7SB 1LYFA 1JKAA 1CU6A 137LA 4RDSA 1C46A 1T8AA 250LA 1H68A 239LA 1L10A 1L0KA 1D0MA 3ZEKA 1LZEA 183LA 1L40A 2CGIA 1IWUA 1VDTA 1RE2A 1CKGA 4IASA 4QRYA 1CKFA 2W1MA 1IP4A 3RW8A 1UIAA 1JTOL 3RZ4A 1EPYA 3K3TA 4ZPUA 2F30A 4LYBA 2W1LA 5FCPA 1XFPL 1NMMA 2HUKA 2EPEA 1JJ0A 1UICA 2YSSC 209LA 1L66A 2ZZLA 3LN2A 1QKOA 3HASA 1B5XA 1LSDA 1QTKA 3CDRA 1QSWA 1L12A 1L29A 1LMQA 3EH4B 2I6ZA 3B6LA 3WPKA 4OOTA 5LINA 169LA 2F95A 4O34A 141LA 4H9HA 1IC7Y 1HEQA 3AGGG 1JQUA 127LA 5E4PA 4WO9A 1CV3A 1XEKA 5L3HA 1L41A 1GF3A 236LA 1KG8A 4ETEA 4XT1A 1GFAA 1V7TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3SBB C;  3EH3 B;  4J4Q A;  1K28 A;  4GP5 B;  104L A;  2YDV A;  1ZUR A;  4MBS A;  1R84 A;  1L04 A;  1T8F A;  5AWZ A;  227L A;  180L A;  1L0M A;  5H2P A;  1QHJ A;  1KY0 A;  1LYJ A;  4L35 A;  113L A;  2LZM A;  244L A;  4I7T A;  1CV0 A;  115L A;  1C6K A;  1DYD A;  1R2N A;  4GYC A;  3C80 A;  1LYE A;  3COD A;  3QBG A;  4NC3 A;  3EML A;  1ZYT A;  3OE0 A;  1OWZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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