3UONA

Structure of the human m2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRINIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein/antagonist
source organism Homo sapiens
molecule keywords Human M2 muscarinic acetylcholine, receptor T4 lysozyme fusi
total genus 159
structure length 438
sequence length 438
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3uonA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3uonA01
3GUJA 1PQDA 4GBRB 3HUAA 2NTGA 1C8RA 3QDCA 1XJUA 3AYNA 1OV7A 2B74A 1XEPA 1BRXA 4GRVA 3HAQA 1LGWA 1XMEB 1L88A 123LA 1L90A 1OYUA 109LA 111LA 3QJQB 4N6HA 3VHZA 5JJEA 1CU3A 1C6KA 217LA 165LA 1L0KA 4EJ4A 177LA 3PWHA 4MBSA 3CODA 1L35A 2BRDA 1OVHA 1B6IA 236LA 2B6YA 3T45A 181LA 2I20A 2RAZX 1P37A 1C6HA 1CTWA 1L73A 118LA 1S51A 1QS5A 4PJZA 2RH1A 150LA 104LA 170LA 1P3NA 5A44A 1ZYTA 1LI3A 1T97A 229LA 1D2WA 262LA 3C7YA 1C6LA 231LA 2B6XA 2ZZLA 173LA 1C61A 1GZMA 5BR2A 1LI6A 1P36A 1OVJA 4UG2A 3HASA 1L58A 4W54A 1H2SA 5DHHA 4FA7B 4JKVA 5B2NA 2M3GA 1LYDA 1L52A 4X32A 3REYA 1L66A 2B75A 3GUMA 3GUOA 3C8QA 1L82A 1KNIA 211LA 125LA 3DN8A 5AHYA 4LZMA 198LA 3HT9A 2OTYX 1L42A 1KW7A 2F32A 3PBLA 1L94A 4EKSA 1L08A 2F93A 1LYJA 1SSYA 3HAOA 1S8JA 141LA 246LA 4G7QB 3DMVA 1P6YA 1P56A 2Z6BA 3DN4A 3UTXA 5B35A 1L05A 3L2XA 4BV0A 2RBQA 5BR5A 260LA 3NS0A 1OWYA 245LA 1QSQA 5B6ZA 3OE8A 2Y02A 1G0JA 238LA 1VJMA 156LA 4YXCA 1X0K1 2LNLA 1L91A 1EHKB 1ZURA 2OE9X 4A4MA 4L6RA 1L39A 3C82A 4BEYA 3PQRA 213LA 110LA 1L89A 1L44A 3HUKA 1C6BA 2Y00A 1DYFA 3DMXA 4BWBA 144LA 1P2LA 4I7JA 1SWZA 3A7KA 112LA 1C67A 1P64A 220LA 4DJHA 1L83A 2LC9A 3C9LA 1P2RA 230LA 4G72B 3QAPA 1L96A 1E0PA 1I6SA 3QJRB 199LA 1L26A 1PQJA 1L06A 3VI0A 4W59A 2AT9A 2Z55A 5G53A 122LA 140LA 1LWGA 206LA 3CDTA 3KJ6A 1R2NA 1QTVA 4EKQA 3C7ZA 1C69A 3GUIA 137LA 5B0WA 1L71A 4PK0A 5H2LA 174LA 4AQNA 250LA 4KLYA 2YCYA 178LA 2RB1X 166LA 2RBPA 3DN3A 1L68A 1L54A 2YDVA 4W52A 3NY8A 1JTNA 1CV3A 1L03A 1L36A 1G1WA 1X0I1 2YDOA 4E97A 242LA 1L51A 3FA0A 2EI4A 3MBVA 1CUPA 1G0MA 1NHBA 4GYCA 4XTOA 5H2MA 1LYIA 258LA 145LA 4XTNA 3QBGA 1QTBA 2OTZX 2RBOA 4WAVA 1L85A 3HH6A 1JGJA 2QB0B 2OEAX 1KS3A 5AX0A 201LA 175LA 4BVNA 5G2DA 4ARQA 256LA 1G07A 3DNAA 1P8UA 4G7SB 1L76A 1L80A 3C8SA 1L23A 1LGUA 3DMZA 4EKRA 4I7PA 1L01A 4EPFA 1L09A 129LA 3HU8A 1L98A 5J7AA 5TGZA 1G0GA 1DYEA 1JQUA 1L64A 2LZMA 3DN1A 5AWZA 4W53A 3ZEVA 1L41A 223LA 152LA 6LZMA 3HH4A 1T8FA 4AMJA 1CWQA 3C81A 4FAAB 3HARA 2HUMA 1QKPA 1DYBA 1L53A 2HUKA 3HTGA 1R84A 2OU9A 3CAPA 5ETZA 1L16A 1SSWA 3QJVB 1KGBA 2YCZA 1H68A 1C3WA 3G3VA 1L24A 3HH3A 4GP5B 2O79A 3RZEA 4ARQB 1QTHA 241LA 2O4WA 4BUOA 4TL3A 5H2OA 1LWKA 3OE6A 1Q5JA 103LA 3NYAA 1QS9A 1QT7A 3PDSA 4I7QA 2WJLA 1SX7A 4XT3A 195LA 2Q9DA 4ARLA 1JV6A 247LA 1QUOA 1L19A 3HUQA 1XIOA 186LA 3QBKA 1DYGA 171LA 1U19A 4S0WA 2KS9A 4FPDA 1QUHA 161LA 3VVKA 1CV4A 4I7NA 3GULA 1CV6A 1G0KA 1L75A 167LA 1C6FA 5AX1A 1D3MA 4ARMA 4LDEA 5A45A 1QUDA 1LYFA 2B72A 147LA 1C8SA 1L62A 4K5YA 257LA 1T8AA 2QARC 1WTHA 3CDVA 1TLAA 3CDQA 3F8VA 197LA 1CU2A 227LA 5B34A 1C66A 1JTMA 2A4TA 1CX6A 1L20A 1G0PA 1IW9A 1LYHA 1L72A 3JR6A 1L70A 5AZDA 5H2JA 1G1VA 128LA 1XJTA 1BRRA 252LA 1CU5A 2NTHA 4EPIA 5DYSA 234LA 1HZXA 224LA 1G0QA 127LA 1L69A 3UG9A 3RUNA 3C83A 1X0SA 3F9LA 1FBKA 5B6XA 4N4YB 4WW3A 232LA 5KKHA 1O0AA 3VW7A 1D3FA 164LA 187LA 2F47A 1LN6A 1S8LA 1L30A 222LA 4I7OA 3NSBA 3K2RA 4FBZA 1L43A 2PEDA 4GP4B 1QHJA 3C7WA 1P8HA 3HU9A 1CV5A 160LA 155LA 4W55A 146LA 3QBIA 251LA 2Y04A 3P0GA 4OV0A 1KY0A 1KY1A 3WQJA 176LA 1C6MA 1LPYA 1OVKA 1DYDA 216LA 1L49A 149LA 2KSAA 3GUNA 4IAQA 1D9WA 3RFMA 3ODUA 4IARA 158LA 1L22A 1L79A 3SB5A 3HAPA 1C60A 1L12A 1L25A 4DAJA 1L13A 1SWYA 1AP9A 1C64A 4DKLA 1P5CA 3QBLA 4JR8A 210LA 3AM6A 1C6QA 1LGXA 108LA 3EMLA 3S8GB 1OV5A 1L67A 3FI5A 1L45A 5JJJA 1L18A 2YCWA 3SBAA 4BEZA 2B6WA 5JJNA 1C6EA 5H2PA 3ZPQA 2RB0X 1C63A 1L33A 239LA 1FBBA 3EH3B 1L65A 114LA 1CX7A 1L29A 2JAFA 4MQTA 3VGAA 4I7MA 2I1XA 131LA 235LA 2G87A 2VT4A 151LA 1LW9A 1K28A 1P7SA 143LA 2QPDB 4EIYA 2ANXA 107LA 1QT6A 205LA 189LA 4W51A 1Q5IA 4N4WA 5G2CA 1DYCA 1AT9A 2WJKA 4YXAC 228LA 1CU6A 2J4YA 3UTVA 2QPEB 2RAYX 1L55A 3CDOA 3X3CA 5G54A 4IB4A 5A8EA 2I21A 2L6XA 4G70B 4OO9A 5B6YA 3X3BA 1L11A 1C68A 2R4RA 5AHZA 4I7SA 3ABWA 4GBRA 237LA 5G2AA 119LA 3DQBA 1L92A 1L99A 1L17A 113LA 3G3WA 3S3CB 1JV7A 2KSYA 3HTDA 4Y9HA 1SX2A 1F50A 3HT7A 4L35A 4XT1A 1L74A 261LA 1L46A 1L77A 3HH5A 1F4ZA 1ZWNA 1L97A 4JQ6A 2ZFEA 1L63A 3DN0A 1C6GA 3S3DB 3C80A 5LWEA 142LA 214LA 1C6TA 3CDRA 1C6NA 4MQSA 4XXJA 3QAKA 1CUQA 3EH5B 5F8UA 2RBRA 3HT6A 1L10A 3UONA 4EXMA 1UAZA 259LA 120LA 2CUUA 1C6JA 1PQMA 169LA 1M0KA 2HULA 157LA 168LA 5B6VA 5EN0A 172LA 1G06A 5G36A 253LA 1D2YA 2ZIYA 1L81A 1E12A 1CU0A 7LZMA 4I7LA 2KSBA 4HYJA 4MD2A 1L0MA 1L59A 1TN5A 1L87A 4X1HA 4X31A 2JAGA 2X72A 1C65A 4IAPA 200LA 139LA 2RB2X 212LA 1S53A 3UTWA 4W57A 240LA 3NY9A 3SB9A 1L28A 5ITCA 1KW5A 3FADA 1LLHA 2RBSA 2OE7X 2RBNA 1QM8A 3GUKA 5C1MA 1D3NA 1PQIA 1L60A 2ANVA 1PQKA 5DHGA 1QKOA 2F95A 3UZCA 1S52A 225LA 1PQOA 1L9HA 1L21A 148LE 1GUEA 1MGYA 4J4QA 4HYXA 1DZEA 1P8IA 4ARMB 215LA 1JFPA 1M0MA 126LA 3DN6A 1L48A 2B73A 1S54A 3AYMA 4EA3A 184LA 1M0LA 1C6CA 4GP8B 1PXRA 3OE9A 4QI1A 3PXOA 3VG9A 1PY6A 3V2YA 2Y03A 1L84A 1KG9A 4QIDA 1QSBA 1IW6A 4GPOA 192LA 5G28A 4LDOA 1UCQA 3HDEA 218LA 2B6TA 2O7AA 1P46A 3OAXA 1L47A 254LA 4LDLA 3SB7A 2F2QA 3SN6R 2LCBA 191LA 188LA 1L93A 4ARJA 115LA 4YX7C 2HPYA 2OE4X 102LA 3DKEX 2Z73A 4AMIA 1L31A 1L37A 4NC3A 1L15A 5LZMA 3HDFA 2IGCA 5B6WA 185LA 1QT3A 3UTYA 3ZPRA 1EPYA 163LA 196LA 3S3BB 2B70A 249LA 3LZMA 180LA 4W58A 1C6DA 1PXSA 3SB6A 1TN0A 1L34A 1LI2A 5H2KA 243LA 3G3XA 4UHRA 5FJGA 3HTBA 1L40A 4G71B 4ARPA 1L38A 4XTLA 4QRYA 1L00A 3DDLA 2I35A 3HANA 1KMEA 190LA 1QUGA 3QJUB 1QT5A 3V2WA 182LA 4HWLA 248LA 4G7RB 1OWZA 138LA 1L32A 1T6HA 3DN2A 1T8GA 1F88A 1L56A 1DYAA 3C8RA 1C62A 1QTDA 3OE0A 209LA 3COCA 221LA 2B6ZA 1L61A 4I7KA 2NTWA 3GUPA 3C9MA 1L14A 4EKPA 5I14A 5H2HA 1L0JA 4I7TA 1QTCA 130LA 226LA 1CV0A 1GU8A 1L27A 2Q9EA 3HTFA 5H2NA 1C6AA 1CV1A 3L64A 4KNFA 4ZPUA 4PXKA 219LA 4PXFA 2B7XA 5ITEA 1D3JA 1L04A 1IXFA 2R4SA 5H2IA 1G0LA 1QT8A 3HWLA 1L50A 2OU0X 159LA 3BVDB 3S8FB 3SB8A 3QJSB 3D4SA 4I7RA 1LYGA 1QT4A 1L95A 1QTZA 4W56A 1XJIA 2OU8A 1BRDA 2L78A 1CVKA 1L07A 1KG8A 3SBBC 2YCXA 1BM1A 4MD1A 183LA 3EH4B 2NTUA 1L57A 1L86A 244LA 3HT8A 3QJTB 1C6IA 255LA 3UZAA 1L02A 2Y01A 1LYEA 162LA 1VGOA 1C6PA 233LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8ZA 3HUAA 2VB1A 3QDCA 3HAQA 1LGWA 1XMEB 2C8OA 3AGHA 1MELL 4B4JA 3VHZA 1OUGA 3W6AA 165LA 4EJ4A 3TMVA 1OVHA 236LA 1LZ8A 1LMTA 1P37A 1C6HA 4QDNA 1B0DA 2RH1A 4WLDA 1IIZA 4LFXA 262LA 231LA 3M3UA 1C61A 1GZMA 5BR2A 1LI6A 3WU9A 1XSFA 1TEWA 1L58A 2HUBA 1H2SA 1CKCA 1LYDA 4GCBA 4GCDA 2LHMA 2B75A 3C8QA 1VFBC 3HT9A 1HFXA 1CKFA 2F32A 1SSYA 1S8JA 141LA 4C5FA 3UTXA 1L05A 4BV0A 1OUIA 1H87A 5B6ZA 1FLYA 4X3BA 2H9JA 3WULA 1X0K1 2LNLA 1G7IC 7LYZA 4L6RA 4G49A 2BPUA 1LJNA 5F81A 1C6BA 2Y00A 4LYTA 3DMXA 4BWBA 4I7JA 1SWZA 4QY9A 220LA 3C9LA 4UWNA 4G72B 2YSSC 1LZCA 2HU3A 199LA 1L26A 1PQJA 1IP5A 2AT9A 4H9FA 122LA 140LA 3CDTA 3KJ6A 4EKQA 3C7ZA 3J4GA 1LHIA 4AQNA 250LA 4KLYA 2BQBA 2RBPA 1L68A 1L54A 3GXRA 4DWXA 3RT5X 2LYMA 1L03A 1G1WA 4PGJB 153LA 242LA 2EI4A 1LYIA 1CNSA 1WVUA 6LYTA 4NGLA 1BVKC 4GN3A 1JGJA 2Z37A 201LA 4GN4A 256LA 1G07A 1WQMA 1LGUA 4NGIA 1GFTA 3HU8A 1DYEA 1JQUA 2HECA 5AWZA 3ATOA 1FDLY 4FAAB 1JIYA 3HARA 3BKVA 4WLYA 4H93A 1JKCA 3RU5A 1H68A 1C3WA 1L24A 241LA 3AZ5A 1LWKA 3OE6A 1QT7A 4I7QA 2WJLA 4XT3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4AMI A;  1L31 A;  1L37 A;  4NC3 A;  1L15 A;  5LZM A;  3HDF A;  2IGC A;  5B6W A;  185L A;  1QT3 A;  3UTY A;  3ZPR A;  1EPY A;  163L A;  196L A;  3S3B B;  2B70 A;  249L A;  3LZM A;  180L A;  4W58 A;  1C6D A;  1PXS A;  3SB6 A;  1TN0 A;  1L34 A;  1LI2 A;  5H2K A;  243L A;  3G3X A;  4UHR A;  5FJG A;  3HTB A;  1L40 A;  4G71 B;  4ARP A;  1L38 A;  4XTL A;  4QRY A;  1L00 A;  3DDL A;  2I35 A;  3HAN A;  1KME A;  190L A;  1QUG A;  3QJU B;  1QT5 A;  3V2W A;  182L A;  4HWL A;  248L A;  4G7R B;  1OWZ A;  138L A;  1L32 A;  1T6H A;  3DN2 A;  1T8G A;  1F88 A;  1L56 A;  1DYA A;  3C8R A;  1C62 A;  1QTD A;  3OE0 A;  209L A;  3COC A;  221L A;  2B6Z A;  1L61 A;  4I7K A;  2NTW A;  3GUP A;  3C9M A;  1L14 A;  4EKP A;  5I14 A;  5H2H A;  1L0J A;  4I7T A;  1QTC A;  130L A;  226L A;  1CV0 A;  1GU8 A;  1L27 A;  2Q9E A;  3HTF A;  5H2N A;  1C6A A;  1CV1 A;  3L64 A;  4KNF A;  4ZPU A;  4PXK A;  219L A;  4PXF A;  2B7X A;  5ITE A;  1D3J A;  1L04 A;  1IXF A;  2R4S A;  5H2I A;  1G0L A;  1QT8 A;  3HWL A;  1L50 A;  2OU0 X;  159L A;  3BVD B;  3S8F B;  3SB8 A;  3QJS B;  3D4S A;  4I7R A;  1LYG A;  1QT4 A;  1L95 A;  1QTZ A;  4W56 A;  1XJI A;  2OU8 A;  1BRD A;  2L78 A;  1CVK A;  1L07 A;  1KG8 A;  3SBB C;  2YCX A;  1BM1 A;  4MD1 A;  183L A;  3EH4 B;  2NTU A;  1L57 A;  1L86 A;  244L A;  3HT8 A;  3QJT B;  1C6I A;  255L A;  3UZA A;  1L02 A;  2Y01 A;  1LYE A;  162L A;  1VGO A;  1C6P A;  233L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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