3VW7A

Crystal structure of human protease-activated receptor 1 (par1) bound with antagonist vorapaxar at 2.2 angstrom
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
447
structure length
442
Chain Sequence
DASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLGITTCHDVLSETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSANIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structure of human protease-activated receptor 1
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein/antagonist
source organism Homo sapiens
molecule keywords Proteinase-activated receptor 1, Lysozyme
total genus 165
structure length 442
sequence length 447
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3vw7A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3vw7A01
2ZZLA 3HU8A 3HUAA 4EJ4A 1Q5IA 5H2JA 3LZMA 3HH6A 1XIOA 4UHRA 2YDVA 3HTBA 182LA 1H2SA 1K28A 256LA 4X31A 4FPDA 3F9LA 4XTOA 3VI0A 3GUIA 1S51A 1L92A 234LA 1NHBA 1ZURA 1L0KA 1C6AA 1LWGA 161LA 1C6TA 1L96A 2F2QA 3G3XA 3UTYA 1OVKA 4EIYA 240LA 176LA 3G3WA 3PXOA 3ZPQA 1KS3A 1C61A 1L94A 1CUPA 3UZAA 3VHZA 1L16A 3KJ6A 2NTWA 2YCZA 1T6HA 1L89A 2I20A 1L25A 1OYUA 3DNAA 103LA 4N6HA 1G0JA 3DMXA 2LC9A 1IW9A 3HUQA 4W59A 2Z55A 3AM6A 1C6BA 1LGUA 258LA 4W53A 3C9LA 5ETZA 3UTWA 1IXFA 3UONA 1L68A 2OU0X 112LA 1L63A 2B73A 1G1WA 1C62A 237LA 3NSBA 1C64A 1D2YA 1AT9A 1L69A 195LA 143LA 1L87A 1QT4A 2RB1X 1P64A 1L98A 4I7SA 1S54A 3DMZA 1L00A 1L79A 245LA 5B35A 3HU9A 1SX2A 1L51A 4ARMA 1L33A 1SWYA 1JGJA 115LA 3VG9A 3C7YA 4XTNA 226LA 1L60A 1QTHA 2RBRA 1DZEA 1TN5A 1SX7A 130LA 4IAQA 1CV4A 5B6VA 3MBVA 3QBIA 1QT6A 4N4WA 1L21A 1LYFA 113LA 4ZPUA 4GBRA 1L43A 1L42A 1OVHA 1C3WA 1U19A 2OTYX 1CU5A 1L90A 3COCA 163LA 4BEYA 1Q5JA 1L36A 175LA 5BR2A 1FBKA 4KLYA 3SN6R 1QT5A 3C83A 1L26A 3HDFA 1L55A 3C81A 2YCYA 1L85A 1QT8A 3D4SA 3OE8A 260LA 1LYHA 4ARQA 4BEZA 148LE 149LA 1CV1A 2LCBA 1UCQA 1CV3A 3VW7A 3NY8A 1T97A 3CODA 4TL3A 206LA 3JR6A 3X3BA 1L41A 1DYAA 4W54A 3UTXA 1EPYA 1P7SA 2NTUA 3BVDB 3C82A 4QRYA 1LW9A 191LA 1C8RA 1L47A 1BRRA 1LWKA 1L45A 108LA 1SWZA 2JAFA 1DYDA 4FAAB 1R84A 3HASA 1CWQA 2IGCA 3C8SA 1L28A 1GUEA 1P3NA 4DJHA 1SSWA 233LA 2M3GA 2B70A 225LA 3FA0A 3S3DB 1C6CA 5H2OA 1P5CA 1CX6A 4EKQA 164LA 1L11A 238LA 2QPDB 3AYNA 4LDEA 1OWYA 2OU8A 181LA 4PXFA 1LYEA 1EHKB 196LA 147LA 1XEPA 1P46A 4GP8B 1L27A 114LA 2B72A 4G7SB 2VT4A 3UTVA 3ZEVA 4LDOA 1QTCA 2B74A 5G54A 1L65A 2BRDA 2F32A 1PXRA 3NYAA 2AT9A 3DQBA 4OO9A 3CDOA 3NS0A 1L70A 216LA 1L23A 1L40A 2Z73A 210LA 197LA 4XT3A 4JR8A 4PK0A 184LA 3QJRB 1L75A 3EH3B 4W57A 2ANVA 1R2NA 4X1HA 111LA 5KKHA 1LGXA 249LA 2YDOA 5F8UA 4G7QB 1P8IA 1X0I1 1C6GA 2RBSA 2Y03A 5B0WA 1O0AA 2RAYX 1G0GA 254LA 4I7KA 1L02A 4ARLA 1PXSA 4GP5B 3ODUA 2ZFEA 1L03A 2ANXA 1QTZA 5I14A 187LA 4MQTA 1H68A 138LA 178LA 1L61A 1TLAA 192LA 2LNLA 125LA 3OE9A 3HTFA 5B6WA 1L50A 241LA 1L77A 3GUNA 2Q9EA 1CTWA 1C6DA 1P37A 2OTZX 4G71B 1G0QA 3C7ZA 4S0WA 3QJQB 4FBZA 4W56A 2HUMA 1XJUA 127LA 5H2NA 3DKEX 1OVJA 4BV0A 1L66A 1F50A 1CU3A 2J4YA 220LA 1P2RA 1L29A 3GUJA 1E12A 1L62A 145LA 1PQJA 2L78A 1L80A 169LA 3P0GA 140LA 2Y02A 4HYJA 3QAKA 3S3BB 1C6EA 5H2HA 1P36A 1VGOA 4UG2A 139LA 1L01A 1I6SA 242LA 4I7OA 3DDLA 1LYJA 151LA 118LA 250LA 2I21A 3EMLA 180LA 185LA 4G72B 119LA 5B6ZA 3UZCA 1JQUA 1DYGA 1LYGA 4AMJA 1WTHA 1L59A 1C67A 141LA 1L99A 4QI1A 223LA 1OV7A 1MGYA 1X0K1 2I35A 2RB0X 2Z6BA 1AP9A 1JTMA 1L97A 129LA 1B6IA 1KW7A 142LA 3ZPRA 4EKRA 156LA 217LA 126LA 5AX1A 1DYFA 2RH1A 4G70B 1JFPA 215LA 5H2KA 1QTDA 1L84A 2YCWA 1D2WA 4ARJA 1QUDA 1C8SA 3V2YA 1KGBA 4J4QA 1L71A 252LA 4DKLA 1S52A 5LWEA 1DYCA 3QJVB 1C6JA 4GPOA 3X3CA 198LA 1KG9A 131LA 2RBNA 1C6IA 211LA 247LA 1QUHA 1L0MA 155LA 3HH4A 1CVKA 1L35A 1L37A 3HT9A 1L76A 4IAPA 1D3NA 3QDCA 3DMVA 199LA 2Y01A 1OV5A 209LA 4MBSA 4I7PA 1LGWA 3HDEA 5J7AA 3RUNA 231LA 1S8JA 1LI2A 3HAPA 3CDTA 128LA 1QT7A 3HTDA 4I7LA 2A4TA 214LA 2B6XA 1C66A 2B6YA 3L2XA 2WJKA 5B6YA 5C1MA 1T8AA 1ZYTA 236LA 4ARMB 3C8RA 1C60A 1L13A 4IARA 1C6QA 1L0JA 4AQNA 5DYSA 1L17A 1QUOA 3SBBC 3QJUB 3GUOA 7LZMA 3DN4A 262LA 4I7QA 4W55A 1VJMA 246LA 4E97A 4NC3A 5B34A 4EPFA 4GBRB 3EH4B 2OE9X 1KY1A 1C6KA 4GRVA 3PDSA 5AHZA 1L08A 4I7JA 2O79A 152LA 1L14A 4W51A 1GZMA 5EN0A 2KSAA 1BM1A 1PQIA 3QBGA 1JV7A 5G28A 3VVKA 109LA 162LA 1D3JA 5H2LA 1QS5A 5FJGA 5JJJA 2G87A 2F93A 1L81A 4ARQB 2B7XA 3HT7A 4PXKA 3DN8A 1L82A 1L73A 4IB4A 3QJSB 1L83A 1L18A 235LA 1PQOA 3REYA 3VGAA 1OWZA 1KY0A 3HT8A 1CU6A 1L46A 5BR5A 3C80A 5G2CA 3CDVA 4WW3A 1QSQA 3CDRA 4MD1A 5H2MA 201LA 1JV6A 3OAXA 2X72A 5ITCA 3DN0A 5AHYA 1C6NA 1G0LA 1L09A 229LA 3SB9A 218LA 2EI4A 239LA 2NTHA 1L07A 1D3FA 4Y9HA 102LA 2B6ZA 4EKSA 2RBPA 5DHHA 1D9WA 1JTNA 2Y00A 2KS9A 2RAZX 3L64A 3GUMA 1BRDA 1QTVA 219LA 1UAZA 1LLHA 1P6YA 1SSYA 5A8EA 4LDLA 3GUKA 4GYCA 2OU9A 3RZEA 3UG9A 3C8QA 2PEDA 1GU8A 1L86A 2Y04A 1E0PA 2R4RA 3PWHA 1QM8A 1LPYA 1L67A 1L32A 4I7TA 4PJZA 1L19A 1QT3A 1DYEA 4DAJA 2OE4X 1C65A 1C6HA 3QBLA 1CX7A 1IW6A 1QKOA 5DHGA 2R4SA 3HH5A 2WJLA 2LZMA 4EKPA 4QIDA 2YCXA 188LA 3GULA 5G2DA 3QBKA 1L49A 3HT6A 1L31A 1BRXA 4BVNA 2Q9DA 3HH3A 3WQJA 1ZWNA 4HYXA 1L56A 160LA 1L53A 213LA 3SB5A 4MQSA 2RBOA 4G7RB 171LA 4EXMA 2JAGA 4XT1A 5A44A 170LA 3V2WA 5B2NA 172LA 1LI6A 253LA 1G0PA 4WAVA 3HWLA 4JKVA 4KNFA 4N4YB 2I1XA 4XXJA 4EA3A 1L12A 1M0MA 1P8HA 3HARA 4L6RA 2CUUA 144LA 3DN3A 1L91A 107LA 5LZMA 3QAPA 4I7RA 5ITEA 183LA 3NY9A 4YX7C 4JQ6A 3HAQA 1LI3A 257LA 2OEAX 3HANA 3S8FB 3C9MA 2F95A 3S8GB 1L24A 1P8UA 1C6FA 157LA 4YXCA 1HZXA 1S53A 6LZMA 1C6MA 1CU0A 1L64A 1L72A 5B6XA 1LN6A 158LA 224LA 205LA 221LA 212LA 4XTLA 1QSBA 2KSBA 1T8FA 1L06A 5A45A 1F88A 2ZIYA 4L35A 3DN1A 174LA 3SB7A 5G2AA 1L10A 3K2RA 1S8LA 3ABWA 3HUKA 5AX0A 1KMEA 3S3CB 1L38A 1QS9A 190LA 1L58A 230LA 3CDQA 177LA 104LA 166LA 3FI5A 5AZDA 1XJIA 2HPYA 1L74A 1C6PA 1PQKA 3C7WA 4ARPA 1DYBA 4I7MA 1L22A 5AWZA 168LA 4YXAC 1M0KA 1C69A 159LA 1QTBA 200LA 4LZMA 146LA 3F8VA 1KG8A 4A4MA 244LA 2RBQA 186LA 1L30A 3G3VA 261LA 2B75A 1QHJA 255LA 1G07A 4BWBA 1L48A 1QUGA 1L57A 110LA 4EPIA 3SBAA 1CV0A 150LA 1KNIA 1CUQA 123LA 1L05A 228LA 1L52A 3DN6A 2HULA 4K5YA 4BUOA 1CV5A 1M0LA 1C63A 1G0KA 3PQRA 1P56A 4X32A 1LYIA 227LA 2RB2X 1C68A 251LA 2QARC 1L9HA 165LA 137LA 2OE7X 2O7AA 1L95A 5JJEA 4I7NA 2KSYA 3HTGA 122LA 3OE6A 243LA 2O4WA 1L04A 4W58A 4GP4B 1LYDA 3PBLA 4OV0A 4W52A 120LA 1FBBA 3QJTB 2B6TA 1L39A 1QKPA 1L93A 1CV6A 3FADA 248LA 3A7KA 1TN0A 1PQMA 1CU2A 1C6LA 1L15A 5JJNA 2QPEB 4MD2A 1T8GA 1G06A 3DN2A 2HUKA 5H2IA 1L44A 232LA 5G36A 1XMEB 3RFMA 5H2PA 3SB6A 2QB0B 1L54A 1D3MA 1PY6A 4HWLA 1G0MA 173LA 167LA 2F47A 3CAPA 1L34A 4FA7B 222LA 2NTGA 5G53A 3T45A 1L88A 259LA 1P2LA 5TGZA 3EH5B 3SB8A 1KW5A 2L6XA 1F4ZA 1X0SA 1L20A 1XJTA 1PQDA 3GUPA 2B6WA 3OE0A 1G1VA 3HAOA 4AMIA 3AYMA 189LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZZLA 3HU8A 1Q5IA 1XFPL 5FSTA 1XIOA 4UHRA 3TXFA 2YDVA 1BB6A 182LA 256LA 2YBMA 1HEOA 1H87A 3VI0A 1WTNA 1S51A 4QEQA 234LA 1ZURA 1C6AA 4OOOA 1LWGA 161LA 1C6TA 1QSWA 4H8YA 1JJ0A 3LYMA 3TMVA 3UZAA 1CUPA 5LA8A 2I20A 5KXXA 1L25A 1OYUA 1G0JA 4HJVA 3HUQA 4W59A 2Z55A 4H9IA 4W53A 5ILCA 4NGYA 4B4IA 1D2YA 3TXJA 2DQCY 1QT4A 4I7SA 2RB1X 1HEMA 1P64A 1YAOA 3DMZA 3TXBA 3AGHA 3N9CA 4I0CA 4ARMA 2YBLA 4XJDA 1JGJA 3VG9A 5FEKA 4LYCA 1TN5A 4IAQA 1JTOL 3QBIA 2DBTA 3T36A 1LYFA 2HU1A 4ZPUA 3COCA 4BEYA 1NQIA 8LYZA 1FBKA 4UWUA 1QT5A 3EMSA 1L26A 1L55A 1QT8A 2DQDY 1CKFA 4RW2A 1LZ1A 2YBJA 1UCQA 3A95A 1GB9A 4CGEA 206LA 3JR6A 4IASA 3X3BA 3UTXA 4W54A 1P7SA 2NTUA 3C82A 3BKVA 1L47A 1BRRA 1OUJA 4YF2A 1SWZA 2JAFA 1IWYA 1GDXA 4FAAB 1CWQA 4EMNA 4XADA 1D0KA 1JIYA 1FLQA 1JKDA 1LHIA 2LZTA 4NSIA 2B70A 3LYOA 4II8A 3S3DB 1P5CA 1CX6A 5APDA 2Z2EA 4NHPA 3AYNA 4HSFA 4P2EA 1HSXA 2YVBA 147LA 2DQHY 2B72A 3UTVA 1IWTA 1GE2A 5G54A 2F32A 4N1CC 1CKGA 2W1YA 3CDOA 216LA 4XT3A 3WU9A 4JR8A 1VFBC 3TXHA 1B7SA 1BHZA 4X1HA 1FLWA 249LA 5DN5A 3A34A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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