3VW7A

Crystal structure of human protease-activated receptor 1 (par1) bound with antagonist vorapaxar at 2.2 angstrom
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
447
structure length
442
Chain Sequence
DASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLGITTCHDVLSETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSANIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structure of human protease-activated receptor 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proteinase-activated receptor 1, Lysozyme
molecule tags Signaling protein/antagonist
source organism Homo sapiens
total genus 165
structure length 442
sequence length 447
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3vw7A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3vw7A01
3GUMA 2J4YA 3HUKA 3X3BA 1PQJA 4IB4A 5FJGA 4BWBA 1PQKA 115LA 1C6PA 1L77A 2ANVA 3G3VA 1L04A 4FAAB 4L35A 4LDOA 1L05A 216LA 161LA 3DNAA 4MQSA 1S54A 4G70B 3FI5A 3EH5B 1L63A 4N4YB 3VG9A 3QAPA 1L38A 3SB9A 1P8HA 3HH6A 3OAXA 3QJUB 1L0KA 248LA 1LN6A 1PY6A 2HULA 1L34A 3C7ZA 3SBBC 162LA 2Y01A 3ODUA 2ZFEA 1QS9A 3COCA 4FBZA 4BVNA 1CV0A 1L11A 232LA 3G3WA 2B7XA 1QT3A 2RBNA 2Y00A 4G7RB 1L0JA 228LA 1CX7A 1LGXA 1P2LA 3L2XA 3EH3B 1L55A 4K5YA 4PJZA 3GUPA 1L26A 2JAGA 5B6YA 2YCYA 1G07A 1L19A 4LDEA 5AWZA 3OE8A 3QBLA 109LA 1CUPA 5G2AA 2OEAX 3S8FB 1O0AA 2B6YA 2LC9A 2QB0B 1XIOA 144LA 1SWYA 3HH3A 1QTBA 4W54A 3HARA 4GP4B 3P0GA 4JQ6A 1L03A 234LA 249LA 2B70A 1C65A 1L25A 5H2IA 1L56A 1M0KA 1K28A 1LI2A 3GULA 1L62A 4ZPUA 211LA 3C7YA 171LA 1L45A 4ARQB 1DYEA 206LA 1C8SA 253LA 4I7LA 1QM8A 103LA 3VW7A 2F47A 3V2YA 1G0KA 1G0MA 1KS3A 5H2JA 1G0LA 184LA 3VI0A 3RUNA 1SSYA 3KJ6A 1ZYTA 1C6IA 2ZZLA 152LA 260LA 3ZPRA 3UG9A 3SBAA 1CV3A 4AMIA 2OU9A 1P46A 262LA 1L89A 1L24A 1LPYA 1C66A 1LLHA 1SSWA 5A45A 4QI1A 1C6HA 1L42A 1L86A 3LZMA 3HH4A 1KNIA 1L22A 1QT4A 4W55A 5JJEA 2OTYX 1C67A 4GP8B 1P64A 3HUAA 5LWEA 107LA 250LA 1L13A 2X72A 3NY9A 137LA 1G06A 1UAZA 1S8JA 1X0I1 221LA 3NY8A 1L92A 5B6WA 236LA 3GUKA 2YDVA 229LA 3HT8A 4J4QA 1L27A 170LA 1CU2A 5ETZA 131LA 3UTXA 1QUGA 2B74A 1DYFA 1PXSA 4ARLA 4Y9HA 5G54A 1T8GA 1SWZA 1C63A 2B6ZA 2NTHA 4EJ4A 1L68A 3F9LA 5ITCA 1L95A 1L16A 122LA 2YDOA 1S8LA 2KSBA 2RAZX 4ARMB 196LA 1D3MA 1L81A 108LA 3CDRA 1L94A 185LA 1L54A 4XT1A 1D3JA 3AYNA 1L00A 1C6LA 2G87A 3S8GB 256LA 2HPYA 173LA 2WJLA 4NC3A 1L98A 1C69A 209LA 3C83A 149LA 223LA 120LA 3C82A 3L64A 1LWKA 3QBGA 4YXCA 2KSYA 1X0SA 1C62A 1CU6A 212LA 113LA 217LA 3BVDB 219LA 1L20A 4E97A 1L49A 3F8VA 3HT7A 1L69A 3GUNA 3GUJA 1R2NA 5A8EA 3HWLA 1BRDA 1OWZA 1L31A 3FA0A 2B6WA 3HASA 2HUKA 4I7MA 1L52A 189LA 230LA 238LA 1L17A 3C81A 5H2HA 5B0WA 183LA 1WTHA 1H68A 1U19A 1BM1A 2F93A 1GU8A 3UZAA 4XTOA 4I7TA 4LZMA 3V2WA 1Q5JA 1C6NA 5C1MA 4ARMA 7LZMA 167LA 1C6CA 1OV7A 1P6YA 3DN2A 1KGBA 4QRYA 4BEZA 5AX0A 5H2KA 1T8FA 1L12A 1KMEA 2O79A 4JR8A 4I7PA 4GYCA 164LA 2KS9A 5B34A 4MD1A 3HU8A 2OTZX 3DN4A 1PXRA 1T6HA 4LDLA 4FPDA 4I7KA 4FA7B 1IW9A 3S3BB 1C60A 1VGOA 159LA 3UTYA 244LA 1P36A 4EPFA 1HZXA 4MD2A 1KW5A 3OE0A 3PDSA 4EIYA 1DYGA 4W59A 1P8IA 1C3WA 5H2LA 126LA 1NHBA 119LA 1P2RA 1LYGA 2Y02A 1L73A 2L6XA 1KG8A 3AM6A 4PK0A 3D4SA 1QT6A 1LYIA 3HU9A 2JAFA 180LA 1GUEA 1L21A 1S52A 1CTWA 1L80A 5BR5A 3GUIA 192LA 4W56A 4QIDA 4GP5B 5G2DA 4DAJA 1PQOA 4HYXA 1C6JA 1KW7A 3UONA 1L51A 3HTFA 1LWGA 3K2RA 3C8SA 4W57A 1DYAA 1L47A 1L01A 4MQTA 5B6XA 1GZMA 3C8QA 3QJSB 2CUUA 166LA 5B35A 1C6AA 2ANXA 3ABWA 3QJTB 3QJVB 3CDVA 195LA 3NSBA 138LA 1G0PA 3SB8A 1L29A 2RH1A 5H2PA 148LE 5DHGA 4I7RA 1L67A 3HT6A 1JGJA 214LA 205LA 1L71A 1L14A 1JFPA 5B2NA 3PXOA 4TL3A 1LYJA 4UG2A 3G3XA 1L36A 1OVHA 2VT4A 5EN0A 1XJIA 4YX7C 1F50A 4PXFA 2RBPA 182LA 3QBKA 1L37A 1X0K1 1P8UA 4G7SB 1L91A 2A4TA 4W52A 4KLYA 5G53A 239LA 1IW6A 4ARQA 1T8AA 247LA 233LA 1CUQA 1L30A 3HUQA 1AT9A 3PQRA 4KNFA 3ZPQA 4G71B 2Z55A 186LA 220LA 1M0MA 1S53A 4GPOA 4X1HA 5AHYA 3AYMA 3HANA 4EA3A 3RZEA 2LZMA 3C8RA 2OE7X 163LA 1JQUA 4WW3A 1H2SA 128LA 1D2WA 3T45A 1C61A 224LA 3DN6A 2B6TA 4JKVA 3UTWA 165LA 4UHRA 1L59A 1L85A 3SB5A 225LA 169LA 1QTCA 160LA 191LA 1DYDA 3HT9A 4PXKA 259LA 3HTBA 4BUOA 2RB1X 1S51A 114LA 3SN6R 1L0MA 1P37A 102LA 198LA 3VHZA 2I35A 1KG9A 2NTGA 4EKPA 3JR6A 3REYA 1QUHA 2RBSA 1L44A 3OE6A 1QSBA 147LA 172LA 1L53A 1QS5A 1Q5IA 1L84A 2NTUA 1C6KA 2F32A 4DKLA 3HAQA 3HDEA 4DJHA 1L18A 1LGWA 4I7OA 1L57A 104LA 1IXFA 1BRRA 1L23A 4W58A 139LA 2B75A 3A7KA 125LA 2Y03A 2WJKA 1AP9A 2I21A 4GBRB 3NS0A 5B6ZA 158LA 1QT5A 241LA 5I14A 177LA 2QPDB 1CV5A 178LA 3DKEX 1L10A 4ARPA 1L76A 1BRXA 4I7SA 168LA 3FADA 1LW9A 2B72A 4EKQA 4A4MA 1QUOA 1E0PA 1LI3A 1ZURA 1C6GA 1F4ZA 1C6QA 240LA 151LA 111LA 1G1WA 1CV6A 1C6BA 5H2OA 3DQBA 1L28A 1LYEA 3GUOA 242LA 1OVKA 1L43A 1C6EA 1L75A 1L99A 218LA 3CDOA 1XJUA 2B73A 5B6VA 2IGCA 1LGUA 5H2NA 197LA 3S3DB 3DMZA 4ARJA 6LZMA 2R4SA 1F88A 1G0JA 4X32A 1L61A 4XTLA 2RBQA 1QT7A 1L70A 5AZDA 3QJRB 200LA 4MBSA 1QKPA 4EKRA 4EPIA 2QPEB 4GRVA 5AX1A 1LYHA 4OV0A 1L79A 1L64A 1PQDA 235LA 1XJTA 2PEDA 5DHHA 187LA 1C6TA 5DYSA 2RBOA 2QARC 1D9WA 1QHJA 4GBRA 3VGAA 1FBKA 5ITEA 1L08A 1MGYA 3QJQB 1TLAA 3DN8A 3HAOA 1C8RA 3DN1A 112LA 1L32A 1SX7A 4W51A 2EI4A 2Y04A 5G2CA 261LA 3C9MA 4HWLA 1ZWNA 5A44A 5G36A 3C7WA 143LA 1G0GA 1G0QA 1L02A 1T97A 2ZIYA 4G72B 1SX2A 1XEPA 1L50A 1L83A 252LA 2RB2X 5JJJA 1QTHA 2KSAA 1L58A 3VVKA 2Q9EA 190LA 1KY0A 2O7AA 5BR2A 2Z73A 3C9LA 1C6FA 1VJMA 3HH5A 1C6MA 222LA 2OE9X 1CV4A 1LYFA 2YCWA 1L07A 3HDFA 1L74A 4WAVA 2OU0X 2RB0X 1C64A 3DMVA 1L9HA 4L6RA 4EXMA 4IARA 2L78A 4HYJA 251LA 5LZMA 3NYAA 2O4WA 3HAPA 3S3CB 5F8UA 3MBVA 2YCZA 4N6HA 2LNLA 4XTNA 175LA 1L90A 1OVJA 174LA 2F95A 1P5CA 1QUDA 3DN3A 2I20A 5JJNA 1EHKB 1CVKA 1QKOA 2RAYX 1CWQA 3DDLA 1G1VA 1C6DA 1OWYA 5J7AA 1QTDA 254LA 4I7JA 231LA 1QT8A 1JTNA 157LA 3SB7A 1L87A 2NTWA 3QDCA 3C80A 3UZCA 145LA 4EKSA 1PQMA 1L46A 3PWHA 1TN5A 5AHZA 118LA 226LA 4W53A 1KY1A 2Q9DA 188LA 4IAPA 3RFMA 2AT9A 1L35A 3PBLA 1D3NA 1L48A 1I6SA 255LA 1QSQA 1L88A 3SB6A 1OYUA 1P7SA 4G7QB 1L96A 1L09A 1CU0A 1L40A 1L15A 1L66A 1P3NA 215LA 258LA 1L97A 1JTMA 3EMLA 1QTVA 4BEYA 2I1XA 3ZEVA 146LA 140LA 1PQIA 5KKHA 1JV6A 3CDQA 1B6IA 123LA 3CODA 1D3FA 257LA 150LA 2OE4X 2B6XA 142LA 130LA 3UTVA 1EPYA 3CDTA 4OO9A 246LA 1L93A 3OE9A 2HUMA 1D2YA 3CAPA 3HTDA 2OU8A 4N4WA 156LA 1DYCA 245LA 1E12A 127LA 4I7QA 1L82A 1XMEB 2LCBA 4X31A 2Z6BA 1R84A 4S0WA 1L06A 1DZEA 1C68A 1TN0A 243LA 2M3GA 3QBIA 141LA 3DMXA 1P56A 2YCXA 3EH4B 2F2QA 3DN0A 227LA 213LA 1LI6A 4IAQA 2RBRA 4I7NA 155LA 1FBBA 4AQNA 3HTGA 181LA 199LA 5G28A 3X3CA 5TGZA 110LA 1L60A 4XT3A 2BRDA 1L41A 1L72A 1CV1A 201LA 4XXJA 1M0LA 1CX6A 4YXAC 1QTZA 3QAKA 4BV0A 1DYBA 1JV7A 1UCQA 1OV5A 129LA 1L33A 1LYDA 1L39A 210LA 1CU5A 237LA 5H2MA 1CU3A 176LA 1L65A 4AMJA 2R4RA 3WQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BWBA 5FJGA 4H9AA 5E4PA 1FLUA 115LA 5KXRA 4LDOA 1L05A 5HNLA 4MQSA 4G70B 1IC5Y 1L63A 4G4HA 3HBEX 5J7CA 1P8HA 3OAXA 3HH6A 1IWTA 1LN6A 2BQGA 1LMCA 4HTNA 1L34A 4H9FA 162LA 207LA 1QTKA 1L11A 5HNCA 1QT3A 4TTDA 1LSPA 4K5YA 1B7PA 1G07A 2PC2A 1B5VA 3OE8A 109LA 1BVKC 2IHLA 4LYCA 1O0AA 2QB0B 4XYYA 3HARA 4JQ6A 1L03A 1LJIA 1M0KA 208LA 3C7YA 4MR1A 1L45A 1D6PA 1J1OY 206LA 1CKCA 4I7LA 4II8A 3V2YA 1G0MA 1G0LA 3VI0A 3ZPRA 1P46A 1LPYA 2MECA 4H91A 1C66A 1SSWA 4KPMA 1IP4A 1C6HA 1WQRA 3HH4A 5JJEA 4N8ZA 4HV2A 1IP5A 5LWEA 107LA 1JSFA 1UAZA 1GF9A 3NY8A 4B4IA 1L92A 1D0MA 3GUKA 4NG8A 1NBZC 1C08C 3HT8A 1PZYA 4J4QA 170LA 1GBSA 4Y9HA 3WVYA 1T8GA 1C63A 1L95A 2YDOA 4LGKA 1JPOA 1S8LA 4DYGA 2RAZX 196LA 5F9UA 1D3JA 1L00A 2WJLA 2MEAA 2BQOA 2XQOA 209LA 1IOQA 3W3EA 1GXV2 1IP7A 3QBGA 2KSYA 4M4OA 212LA 3W6CA 2DQJY 1IWVA 3HFMY 4FJRA 219LA 1L20A 1LJHA 1IO5A 3KAMA 1CKFA 1L69A 3GUJA 3B0KA 1GBXA 3HWLA 3B0OA 2HUKA 4GCFA 1NQIA 1LMPA 1U19A 1H68A 1EL1A 2RSCA 1CJ9A 4I7TA 3QNGA 4Z41A 167LA 3DN2A 1KGBA 4BEZA 4LYTA 1T8FA 3F6ZA 2FBBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2NTW A;  3QDC A;  3C80 A;  3UZC A;  145L A;  4EKS A;  1PQM A;  1L46 A;  3PWH A;  1TN5 A;  5AHZ A;  118L A;  226L A;  4W53 A;  1KY1 A;  2Q9D A;  188L A;  4IAP A;  3RFM A;  2AT9 A;  1L35 A;  3PBL A;  1D3N A;  1L48 A;  1I6S A;  255L A;  1QSQ A;  1L88 A;  3SB6 A;  1OYU A;  1P7S A;  4G7Q B;  1L96 A;  1L09 A;  1CU0 A;  1L40 A;  1L15 A;  1L66 A;  1P3N A;  215L A;  258L A;  1L97 A;  1JTM A;  3EML A;  1QTV A;  4BEY A;  2I1X A;  3ZEV A;  146L A;  140L A;  1PQI A;  5KKH A;  1JV6 A;  3CDQ A;  1B6I A;  123L A;  3COD A;  1D3F A;  257L A;  150L A;  2OE4 X;  2B6X A;  142L A;  130L A;  3UTV A;  1EPY A;  3CDT A;  4OO9 A;  246L A;  1L93 A;  3OE9 A;  2HUM A;  1D2Y A;  3CAP A;  3HTD A;  2OU8 A;  4N4W A;  156L A;  1DYC A;  245L A;  1E12 A;  127L A;  4I7Q A;  1L82 A;  1XME B;  2LCB A;  4X31 A;  2Z6B A;  1R84 A;  4S0W A;  1L06 A;  1DZE A;  1C68 A;  1TN0 A;  243L A;  2M3G A;  3QBI A;  141L A;  3DMX A;  1P56 A;  2YCX A;  3EH4 B;  2F2Q A;  3DN0 A;  227L A;  213L A;  1LI6 A;  4IAQ A;  2RBR A;  4I7N A;  155L A;  1FBB A;  4AQN A;  3HTG A;  181L A;  199L A;  5G28 A;  3X3C A;  5TGZ A;  110L A;  1L60 A;  4XT3 A;  2BRD A;  1L41 A;  1L72 A;  1CV1 A;  201L A;  4XXJ A;  1M0L A;  1CX6 A;  4YXA C;  1QTZ A;  3QAK A;  4BV0 A;  1DYB A;  1JV7 A;  1UCQ A;  1OV5 A;  129L A;  1L33 A;  1LYD A;  1L39 A;  210L A;  1CU5 A;  237L A;  5H2M A;  1CU3 A;  176L A;  1L65 A;  4AMJ A;  2R4R A;  3WQJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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